Propietats cid-base dels aminocids i peptids

El pH del medi en el que es troba laminocid s esencial per determinar les seves propietats cid-base, aspecte important del que depenen les propietats qumiques i la funcionalitat biolgica dels pptids i protenes que formen. Les propietats cid-base dun aminocid venen determinades pels grups protonables que tingui. Un aminocid pot actuar b com cid o com base (substncies amfteres), podent tenir fins tres grups amb carcter cid-base: el grup amino, el grup carboxil i, en alguns casos, el grup -R.

Lexcs de H+ a pH baixos protona els grups. El canvi de pH 2 a pH 7-pH10 saconsegueix per laddici duna base (OH-). Els OH- es combinen amb els H+ per formar H20 quedant el grup desprotonat.
PH PH

ESTAT DIONITZACI DUN AA EN FUNCI DEL pH

Cati I dipolar (zwiteri) Ani

Determinaci de la crrega neta dun aminocid a diversos pH

Exemple: aminocid no-polar pH= 1 H I NH3+ -C - COOH I H Crrega Neta: +1

Glicina
pH= 7,4 H I NH3+ -C - COOI H 0 pH= 10 H I NH2 -C COOI H -1

Qu passa a pH intermitjos?. Necessitarem saber els pK de cada grup ionitzable

En general sasumeixen les segents consideracions, per determinar el percentatge de protonaci dun grup ionitzable en un aminocid: Si el pH < pK1 (del COOH) el grup est al 100 % protonat Si el pH > pK2 (del NH3+) el grup est al 100 % desprotonat Si el pH = pK el grup est al 50 % protonat

Exemple: Glicina

pK1 (COOH)= 2 pK2(NH3+)= 9 3 -1 +1 0 4 -1 +1 0 5 -1 +1 0 6 -1 +1 0 7 -1 +1 0 8 -1 +1 0 9 -1 +0,5 -0,5 10 -1 0 -1

pH

2 -0,5 +1 +0,5

pK1- COOH=2 0 pK2-NH3+= 9 Crrega total +1 +1

1) A pH= 1, el pH s inferior en una unitat al pK del grupo COOH, el qual estar protonat al 100 %, aix doncs la seva crrega ser 0. Per altra banda, el grup-ami tamb estar protonat i en aquest cas la crrega del grup s +1. Crrega total: +1 2) A pH= 2, es produeix coincidncia del pH amb el pK del -COOH, pel que el 50 % estar protonat i el 50% desprotonat, aix la crrega ser -0,5 . Aquest pH s encara inferior al pk del grup ami (+1). La crrega total del ser + 0,5. 3) A pH= 3, sha superat en una unitat el pK del COOH, aix doncs estar desprotonat al 100 % i la seva crrega ser -1 per valors superiors de pH. El grup ami segueix estant protonat al 100 % (+1). La crrega total ser zero. 4) A pH= 9, es produeix coincidncia del pH amb el pK del NH3, pel que el 50 % estar desprotonat. Aix la crrega ser +0,5. La crrega total ser -0,5. 5) A pH= 10 , sha superat en una unitat el pK del NH3, aix doncs estar desprotonat al 100 % i la seva crrega ser 0 per valors superiors de pH. La crrega total ser -1.

Exemple : aminocid amb cadena lateral amb crrega

pK1 (COOH)= 2 pK2(NH3+)= 9 pKR= 4

cid Glutmic
pH= 1 COOH I CH2 I CH2 I NH3+ -C - COOH I H Crrega Neta: +1 pH= 7,4 COOI CH2 I CH2 I NH3+ -C COOI H -1 pH= 10 COOI CH2 I CH2 I NH2 -C COOI H -2

Ex: aminocid amb cadena lateral amb crrega

pK1 (COOH)= 2 pK2(NH3+)= 9 pKR= 4

cid Glutmic
pH pK1- COOH=2 pK-R=4 pK2-NH3+= 9 Crrega total 1 0 0 +1 +1 2 -0,5 0 +1 +0,5 3 -1 0 +1 0 4 -1 -0,5 +1 -0,5 5 -1 -1 +1 -1 6 -1 -1 +1 -1 7 -1 -1 +1 -1 8 -1 -1 +1 -1 9 -1 -1 +0,5 -1,5 10 -1 -1 0 -2

Migraci cap al ctode (Pol -)

Migraci cap a lanode (Pol +) No migraci. Crrega 0, Punt isoelctric= 3

Ex: aminocid amb cadena lateral amb crrega

Lisina
pH= 1 NH3+ I CH2 I CH2 I CH2 I CH2 I NH3+ -C - COOH I H Crrega neta +2 pH= 7,4 NH3+ I CH2 I CH2 I CH2 I CH2 I NH3+ -C COOI H +1 pH= 10

pK1 (COOH)= 2 pK2(NH3+)= 9 pKR= 10 pH= 12

NH2 NH3+ NH2 I I CH2 CH2 I I CH2 CH2 I I CH2 CH2 I I CH2 CH2 I I NH2 -C COO- NH2 -C COOI I H H -0,5 -1

Ex: aminocid amb cadena lateral amb crrega

pK1 (COOH)= 2 pK2(NH3+)= 9 pKR= 10

Lisina
pH pK1- COOH=2 pK-R=10 pK2-NH3+= 9 Crrega total 1 0 +1 +1 +2 2 -0,5 +1 +1 3 -1 +1 +1 4 -1 +1 +1 +1 5 -1 +1 +1 +1 6 -1 +1 +1 +1 7 -1 +1 +1 +1 8 -1 +1 +1 +1 9 -1 +1 +0,5 +0,5 9,5 -1 +1 0 0 10 -1 +0,5 0 -0,5

+1,5 +1

Migraci cap al ctode

Migraci cap a lanode

No migraci. Crrega 0, Punt isoelctric= 9,5

Pptid Gly-Glu-Gly
COOI Enlla CH2 Peptdic I Carboxiterminal Amino-terminal H CH2 H I I I NH3+ -C - CONH -C CO NH -C COOI I I H H H
pH=7,4 pH pK1- COOH=2 pK-R=4 pK2-NH3+= 9 Crrega total del pptid 1 0 0 +1 +1 2 -0,5 0 +1 +0,5 3 -1 0 +1 0 4 -1 -0,5 +1 -0,5 5 -1 -1 +1 -1 6 -1 -1 +1 -1 7 -1 -1 +1 -1 8 -1 -1 +1 -1 9 -1 -1 +0,5 -1,5 10 -1 -1 0 -2

A tenir en compte, -Tots els aminocids que tenen un grup R no ionitzable es comporten en les seves propietats cid-base de forma similar a la glicina (Tenen pK similars encara que no iguals) -Els aminocids amb un grup R ionitzable tenen comportaments ms complexes i 3 valors de pK.

Exercicis a practicar
-Indicar amb + els aminocids amb crrega positiva i amb els aminocids amb crrega negativa a pH= 2, 7 i 10 Asp Lys Ser Thr Ala Glu Phe

pH=2 pH=7 pH=10

-Inventeu un pptid de 5 residus aminoacdics i discutiu les seves propietats cid-base a diferents pH. ELS RESULTATS ELS COMENTAREM AL FORUM