12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..

Farmacevtska biokemija 2013

METABOLIZEM DUIKOVIH SPOJIN (PROTEINOV AMINOKISLIN (PROTEINOV, AMINOKISLIN, NUKLEOTIDOV IN DRUGIH)

Dr. Bojan Doljak, mag. farm. FARMACEVTSKA BIOKEMIJA 2012/2013

1. METABOLIZEM DUIKA 2. METABOLIZEM PROTEINOV - REAKCIJE PRENOSA AMINSKE SKUPINE - METABOLIZEM AMONIJAKA 3. BIOSINTEZA AMINOKISLIN 4. KATABOLIZEM AMINOKISLIN - CIKEL SENINE (UREE) 5. IZ AMINOKISLIN BIOSINTEZNO PRIDOBLJENE MOLEKULE
- HEM - KREATIN - GLUTATION - BIOLOKI AMINI (NEVROTRANSMITERJI) - DUIKOV OKSID

6. BIOSINTEZA IN RAZGRADNJA NUKLEOTIDOV

12_1

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

1. METABOLIZEM DUIKA
CIKEL DUIKA V NARAVI

SIMBIOTSKA FIKSACIJA DUIKA

12_2

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

FIKSACIJA DUIKA Z NITROGENAZNIM KOMPLEKSOM

2. METABOLIZEM PROTEINOV

12_3

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

PROTEOLITINI ENCIMI (PROTEAZE, PROTEINAZE, PEPTIDAZE)

12_4

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

PROTEASOM

Primer: AKTIVACIJA TRIPSINOGENA

12_5

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

Primer: AKTIVNO MESTO TRIPSINA

REAKCIJE PRENOSA AMINSKE SKUPINE TRANSAMINACIJA

12_6

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

OKSIDATIVNA DEAMINACIJA

PRIMER DEAMINACIJ:

OKSIDATIVNA DEAMINACIJA

HIDROLITINA DEAMINACIJA

TRANSAMINACIJA

ELIMINACIJSKA DEAMINACIJA

12_7

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

METABOLIZEM AMONIJAKA V JETRIH

1 4 2

transaminacija alanin transaminaza

oksidativna deaminacija aspartat transaminaza glutaminaza

hidrolitina deaminacija glutamat DH

20 STANDARDNIH AMINOKISLIN

12_8

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

3. BIOSINTEZA AMINOKISLIN

BIOSINTEZA AMINOKISLIN

12_9

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

BIOSINTEZNE AMINOKISLINSKE DRUINE GLEDE NA METABOLINI PREKURZOR

* esencialne aminokisline

12_10

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

ORNITIN -AMINOTRANSFERAZNA REAKCIJA

-ketoglutarat
glutaminska kislina

ORINTIN -AMINOTRANSFERAZA

ornitin

-semialdehid glutaminske kisline

1-pirolin-5-karboksilat

REGULACIJA BIOSINTEZE AMINOKISLIN IZ ASPARAGINSKE KISLINE PRI E. coli

12_11

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

REGULACIJA GLUTAMIN SINTETAZE 1. nivo: ALOSTERINA REGULACIJA:

2. nivo: KOVALENTNA MODIFIKACIJA GLUTAMIN SINTETAZE: ADENILACIJA

12_12

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

CIKEL SENINE (UREE)

4. KA ATABOLIZEM AM MINOKISLIN
KARBAMOILFOSFAT SINTAZA ORNITIN KARBAMOILTRANSFERAZA ARGININOSUKCINAT SINTAZA ARGININOSUKCINAT LIAZA ARGINAZA FUMARAT HIDRATAZA MALAT DEHIDROGENAZA GLUTAMAT DEHIDROGENAZA ASPARTAT TRANSAMINAZA

12_13

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

5. IZ AMINOKISLIN BIOSINTEZNO PRIDOBLJENE MOLEKULE

BIOSINTEZA HEMA
1. del: sinteza -aminolevulinske kisline sesalci in drugi viji evkarionti:

b kt ij rastline: bakterije, tli

BIOSINTEZA HEMA: sinteza hema iz -aminolevulinske kisline

12_14

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

NASTANEK BILIRUBINA IN RAZGRADNIH PRODUKTOV IZ HEMA

IZLOANJE BILIRUBINA

12_15

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

MOTNJE V SINTEZI HEMA - PORFIRIJE

Biosinteza KREATINA iz AK

FOSFOKREATIN

KREATIN

12_16

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

Bisinteza GLUTATIONA iz AK

GLUTATION (GSSG) oksidirana oblika

GLUTATION (GSH) reducirana oblika

Biosinteza BIOLOKIH AMINOV (NEVROTRANSMITERJEV) iz AK

TIROZIN

GLUTAMINSKA KISLINA

TRIPTOFAN DOPA
-AMINOMASLENA KISLINA (GABA)

DOPAMIN
5-HIDROKSITRIPTOFAN

NORADRENALIN

HISTAMIN

SEROTONIN

ADRENALIN

12_17

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

Biosinteza DUIKOVEGA OKSIDA iz ARGININA

Primer: Zdravljenje spalne bolezni (tripanosomiaze)

I: ORNITIN DEKARBOKSILAZNA REAKCIJA:

12_18

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

II: Inhibicija ornitin dekarboksilaze z DFMO (difluorometilornitin-om):

6. BIOSINTEZA IN RAZGRADNJA NUKLEOTIDOV

Izvor atomov v purinskem obrou:

12_19

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

BIOSINTEZA PURINSKIH NUKLEOTIDOV

1/3

2/3

12_20

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

Encimi, ki sodelujejo pri biosintezi purinskih nukleotidov

3/3

BIOSINTEZA PURINSKIH NUKLEOTIDOV

12_21

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

Biosinteza AMP in GMP iz IMP

REGULATORNI MEHANIZMI BIOSINTEZE PURINOV pri E. coli

12_22

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

BIOSINTEZA PIRIMIDINSKIH NUKLEOTIDOV Biosinteza UTP in CTP preko orotidilata:

1/3

2/3

12_23

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

3/3

Alosterina regulacija aspartat transkarbamoilaze s CTP in ATP

12_24

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

BIOSINTEZA PIRIMIDINSKIH NUKLEOTIDOV

BIOSINTEZA TIMIDILATA (dTMP)

12_25

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

Pretvorba dUMP v dTMP s timidilat sintazo in dihidrofolat reduktazo

Sinteza timidilata in metabolizem folata kot tari KEMOTERAPIJE

12_26

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

KEMOTERAPEVTIKI, ki delujejo na sintezo timidilata in metabolizem folata

REDUKCIJA RIBONUKLEOTIDOV V DEOKSIRIBONUKLEOTIDE z ribonukleotid reduktazo:

12_27

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

RIBONUKLEOTID REDUKTAZA REGULATORNA R MESTA

SUBSTRATSPECIFINO MESTO PRIMARNO REGULATORNO MESTO

ALOSTERINI EFEKTORJI SUBSTRAT TI

RADIKALSKI MEHANIZEM ribonukleotid reduktaze

AKTIVNO MESTO prosti tirozilni radikal generira prosti radikal v aktivnem mestu:

12_28

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

REGULACIJA ribonukleotid reduktaze z deoksinukleotid trifosfati

NA PRIMARNEM REGULATORNEM MESTU NA SUBSTRAT- SPECIFINEM MESTU

produkti

substrati

produkti

KATABOLIZEM PURINSKIH NUKLEOTIDOV

12_29

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

KONNI PURINSKI METABOLITI pri razlinih organizmih

HIPERURIKEMIJA

12_30

12. Duikove spojine (proteini, AK, nukleotidi, ..)

Farmacevtska biokemija 2013

KATABOLIZEM PIRIMIDINSKIH NUKLEOTIDOV

METABOLNA REGULACIJA: legenda oznak

TRANSKRIPCIJSKA KONTROLA: INDUKCIJA GENA

REPRESIJA/ UTIANJE GENA

MODULACIJA Z ENCIMSKIMI LIGANDI:

AKTIVACIJA ENCIMA

INHIBICIJA ENCIMA

Ostali simboli:

POVE O ANJE KONC.

+
X

ZMANJANJE KONC.

POPOLNA BLOKADA

STIMULACIJA

12_31