Professional Documents
Culture Documents
ביולוגיה1
ביולוגיה1
התא -היחידה הבסיסית של החיים ,וכאן הדגש לחשיבות הביולוגיה של התא לרפואה .רקמות בנויות
מתאים ,ותכונות הרקמות נגזרות מתכונותיהם של התאים מהן הן בנויות .באופן אנלוגי ,גם המולקולות
השונות בתוך התא משרתות את מטריותיו של התא .אורגניזמים רבים הם חד-תאיים ,וגם יצורים רב-
תאיים מתחילים מתא אחד יחיד (ביצית מופרית).
בין התאים מאפיינים שונים רבים (גודל ,צורה ,מיקום ,פעילויות וכו’) ,אבל רב המשותף ביניהם מאשר
המבדיל ,ומכאן שהלימוד עליהם הוא משותף .תאים נראים שונה ,אבל כאמור כל הדברים הנלמדים
בקורס משותפים לכל התאים.
מידור – .compartmentalization
באמצעות קרומים .ביחס לסביבה בחיצונית (קרום התא) – תוך התא ממודר ביחס לחוץ .ברמה התת-
תאית (אברונים – אורגנלות) הממדורים זה מזה ,על-ידי קרומים.
המידור מאפשר התמחות ,כך שבכל מדור מתקיימים התנאים האופטימליים המתאימים לפונקציית אותו
המדור .כמשל ,בדירה גדולה ,אנו ממדרים על-ידי בניית קירות ויצירת חדרים ,בכדי לסגור ולמדר
איזורים בהם מתבצעות פונקציות שונות (מטבח ,חדר שינה ,וכו’)
למשל בתא ישנו מדור בו התוך מאוד חומצי; אבל אם בחוץ תהיה דליפה של החומציות זה יהיה אסון.
נוהגים לחלק את היצורים בעולם החי לשתי קבוצות על-פי דרגת המידור התוך תאי .תאים שאין להם
מידור פנימי ,כולל מידור הגרעין (ללא גרעין) – פרוקריוטים – – Prokaryotesקריוס גרעין ,פרו
-טרום .לדוגמא ,חיידקים .אורגניזם חשובים ,הראשונים על-פני כדור הארץ ולהם אין גרעין .תאים בעלי
מידור פנימי ובעלי גרעין – אאוקריוטים – ( Eukaryotesאאו – אמיתי) – לדוגמא בעלי חיים ,צמחים
הממדים של התאים האאוקריוטים גדולים הרבה יותר ממידיהם של התאים הפרוקריוטים .למשל ,התאים
הפרוקריוטים הם דירה מאוד קטנה ,ולא יעיל לבנות בתוכה מחיצות.
המים הם התווך (המדיום) בו מתרחשים התאים ,והם מהווים 80%-70%מסביבת התא .הם מהווים את
התווך לרוב הריאקציות בתא ,והם גם משתתפים ברוב הריאקציות .בנוסף ,מבנה המים הוא כזה שיש לו
חום סגולי גבוה ,ולכן המים ממתנים שינויי טמפרטורה בתא .למשל אם מתקיימת ריאקציה כימית בתא
הפולטת אנרגיית חום ,התוצאה לא תהיה עליית טמפרטורה מיידית בתא ,אלא העברת החום למים
(המפרק קשרים במולקולת המים) .המים אינן נדיפים בקלות כלל (לעומת ,נאמר ,בנזין) ,והסיבה היא
הפולריות של המים .בגלל הפולריות של המים ,נוצרים קשרים בין מולקולות של מים ואלה קשרים
חזקים יחסית (לא כמו קשרים קוולנטים ,אך עדיין חזקים) וקשרים אלה נקראים קשרי מימן .זהו קשר
בין קוטב שלילי של מולקולת מים אחת ,לקוטב שהוא אטום מימן חיובי במולקולת מים אחרת .זהו אינו
גביש ,אך בכל זאת זוהי רשת של קשרים .בזכות קשרי המימן ,המולקולות נשארות “זו עם זו” והתוצאה
היא של טמפרטורת רתיחה גבוהה של המים ,וזו תכונה חשובה מאוד המאפשרת תופעת חיים בכדור
הארץ.
Van Der Waalsקשרי ואן-דר-ואלס הם קשרים הרבה פחות חזקים ,והם נוצרים בגלל שינויים
מקומיים ואקראיים .קשרים כאלה מתרחשים בעיקר בין מולקולות שאינן מולקולות טעונות.
המים מעצבים מבנים ביולוגיים – מולקולות המים משחקות תפקיד מעצב בין קרום התא ועד צורת
מולקולת החלבון .מה שמכתיב את המבנה המרחבי של מולקולת החלבון ,הן מולקולות המים מסביבה.
מולקולות המים עוברות אינטראקציה עם מולקולת החלבון ,והחלבון מתארגן כך “שיחיה” בצורה הטובה
ביותר עם המים ,כך שחלקים פולריים יותר שלו נמצאים כלפי חוץ ,ופחות פולריים כלפי פנים.
חומרים יכולים להיות מוגדרים על פי גישתם למים .חומרים “אוהבי-מים” הם חומרים הידרופיליים,
וחומרים “שונאי-מים” הם חומרים הידרופוביים .חומרים הידרופיליים נמסים במים ,מאחר והם פולריים
או יונים .חומרים הידרופוביים “לא מסתדרים” עם המים – לא נמסים במים .הם יוצרים קשרים חלשים
(ואן דר ואלס) זה עם זה .למשל ,בחלבון יכולים להיות איזורים הידרופיליים ואיזורים הידרופוביים.
החלבון מתארגן כך שהאיזורים ההידורפוביים מוצאים זה את זה ויוצרים קשרים זה עם זה ,והחלק
הפנימי יוחזק על-ידי קשרי ואן-דר-ואלס ביניהם ,וכלפי חוץ יפנה החלק ההידרופובי.
ישנם גם חומרים בעלי זהות כפולה המשחקים תפקיד משתנה.
ה pH-הוא מדד לריכוז יוני מימן ,כלומר מדד לחומציות .הגדרת הפי-אייצ’ היא מינוס לוג לפי בסיס עשר
של יוני מימן ,ולכן ככה שהפי-אייצ’ נמוך ,מקבלים חומר חומצי ,ופי-אייצ’ גבוה הוא חומר בסיסי .בין
הבסיס לחומצה נמצאים החומרים הניטרליים.
מרכיבי התא העיקריים
המרכיבים הכימיים העקריים בתא .המולקולות העיקריות בתא .המרכיבים האלה מרכיבים את המבנים
העקריים בתא .המרכיבים האלה יוצרים את המערכות המורכבות של התא.
•חלבונים
•שומנים
•פחמימות
•חומצות גרעין
•מים
•מלחים
הפחמן.
מולקלות החיים ,ברובן המכריע ,הן תרכובות פחמן .הייחוד בפחמן הוא הנייטרליות האלקטרונית שלו –
הוא מושך ומקבל אלקטרונים באותה המידה .הדבר נכון באותה המידה לאטום המימן .ייחודו של הפחמן
הוא האפשרות לייצור שלד פחמני ומבנים פחמניים ארוכים ויציבים .למשל – יהלום .שרשרות ארוכות
אלה יכולות להכיל מאוד רבות של אטומי פחמן .פולימרים הם דוגמא לחומר שלו שלד פחמני – למשל
בגדים .זהו הבסיס למבנים המפותחים הנמצאים בתא.
מקרומולקולות – אבני בניין (תת יחידות) המתקשרות זו לזו בקשר קוולנטי( .ראה שקף להגדרות
היחידות ,מהמונומר לפולימר) .היכולת של הפולימר היא היכולת להמשיך וליצור קשרים (צד ימין
מתאים בדיוק לצד שמאל וכו’) .ראה שקף נוסף על הרכבת המולקולות המורכבות בידי הסוגים הקטנים
יותר.
חלבונים.
חלבונים הן מולקולות החיים המופלאות ,ולהם תפקידים רבים .יכולת הפעולה שלהם היא בזכות
אפשרותם לתת מבנים מרחביים מגוונים מאוד ,היכולים להתאים את עצמם ויכולה להיות להם פעילות
כימית .נוהגים לייצג את המבנים החלבוניים בדיאגרמה המתארת את השלד של החלבון ,או לצייר את כל
האטומים ואיתם את החלבון .החלבונים הם מולקולות חכמות .יש להם תפקיד מבני בשלד התא –
החלבונים מחזיקים את התא בצורתו המתאימה באמצעות שלד פנימי הפנוי ממבנים פנימייים מורכבים
מאוד הבנויים מחלבון.
החלבונים הם זרזים (אנזימים) לריאקציות כימיות – אלה גורמים לביצוע ריאקציות כימיות – מחומר א’
לחומר ב’ ,במהירות וביעילות גבוהה.
תקשורת תוך-גופית מתבצעת על-ידי חלבונים; הקולטנים (רצפטורים) להם מבנה מרחבים לחלק האמור
להתחבר אליהם (הורמונים) .למשל אינסולין פועל דרך קישור לקולטן המתאים לו (הנמצא על קרום
התא) וכך התא קולט גלוקוז אל תוכו.
לחלבונים מרכיב מרכזי חומר החוץ-תאי.
עוד חלבונים רבים בעלי תפקידים מאוד חשובים .למשל הנוגדנים – מערכת ההגנה של הגוף מבוססת
כולה על חלבונים ,המכירים חיידקים ,ווירוסים ,ואם מערכת זו נפגעת גורמים עויינים פוגעים בקלות
באדם .כלי נשק עקרי במערכה נגד הגורמים העויינים הם הנוגדנים – שהם חלבונים .ישנו מגוון עצום של
חלבונים; כנגד כל גורם מזיק קיים נוגדן משלים ,שהוא חלבון ייחודי.
כל יכולות החלבונים היא הודות לגיוון המבני העצום של החלבונים.
ייצור החלבונים מוכתב על-ידי החומר הגנטית ,המתורגמת ליצירת חלבון .כלומר ,יש צורך בייצור של
פולימר של חומצות אמיניות לפי סדר מסויים .ישנם ( 20קצת יותר) חומצות אמינו שונות שיכולות
להתסדר ברצף שונה .סוג וסדר חומצות האמינו קובעות את החלבון הנוצר.
דוגמא – ההמוגלובין הוא חלבון שבאמצעו אטום ברזל .יחידת ההמוגלובין השלמה הוא יחידה המורכבת
מארבעה חלבונים – שני חלבוני המוגלובין אלפא ,ושני חלבוני המוגלובין בטא.
אניטראקציה בין חלבון למשהו נוסף (ליגנד או חלבון אחר) גורמת לשינוי בתכונת החלבון .למשל ,קולטן
משנה תכונתו אחרי שהוא קולט .ישנן גם אינטראקציות בין חלבון לחלבון .מרבית התרופות יודעות לטפל
במצבים של קליטת ליגנד בחלבון ,ומיעוטן במצבים של קשירת חלבון בחלבון .האתגר העתידי הוא
הטיפול במצב השני.
כיצד נבנה חלבון? חלבון בנוי מחומצות אמינו ,בעלות מבנה מודולרי עם חלק משותף (רק המבנה
בשקף) .לחומצות אמינו יש קבוצה חומצית וקבוצה אמינית – ומכאן שמן( .סי-או-או הוא חומצי ,ו-
אייצ’-שלוש-אן אמיני); האר הוא החלק השונה בין חומצה אמינית לראותה.
חומציות מתייחסת ליוני מימן .חומצות ביולוגיות מורכבות מסי-או-אייצ’ .היא תשחרר יון מימן ותהפוך
ל-סי-או-או-מינוס ותהפוף לחומצה.
הקשר שבונה את החלבון ,קשר של חומצה אמינית אחת לשניה ,נקרא קשר פפטידי .המושג פפטידי הוא
שם נרדף לחלבון .בחיבור בין חומצת אמינו אחת לשניה נפלטת מולקולת מים (ראה שקף) וכך נוצר קשר
פפטידי שהוא קשר קוולנטי .כך נוצר דו-פפטיד ,שבצידו האחד קצה קרבוקסילי (חומצי) ובצידו האחר
קצה אמיני.
מבנה ראשוני – סדר של חומצות האמינו בחלבון (ללא פיתולים במרחב) .מבנה שניוני – המבנה הנוצר
מהמבנה הראשוני והפיתולים במרחב עקב קשרי מימן .מבנה שלישוני – קשרים בין שיירים צדיים
(ארים) .מבנה רביעוני – צרוף של מספר חלבונים (למשל המוגלובין שהוא מבנה של שני המוגלובין
אלפא ושני המוגלובין בטא).
מבנה הדי-אן-איי.
הדי-אן-איי בנוי מידי נוקלאוטידים הנקשרים זה לזה ליצירת שרשרת של אלפי נוקלאוטידים (עשרות
אלפים ומאות אלפים) .הדי-אן-איי מאורגן בשתי שרשרות מתאימות ,היוצרות את המבנה הדו-גדילי (דו-
הליקסי) .בין שתי השרשרות ישנם קשרי מימן .מול איי תמיד יהיה טי בקשר כפול ומול ג’י יהיה סי
בקשר מימן משולש .הסיבה לכך היא כי סי יכול לתת שלושה קשרי מימן עם ג’י ,בעוד טי יכול לתת זוג
קשרי מימן לאיי .המרחק בין הנוקלאוטידים הוא תמיד קבוע ,תמיד פורין מול פירימידן ,ומכאן נוצר
המבנה הסדיר .לשרשראות הדי-אן-איי ישנו כיוון ,ושתי שרשראות מתייחסות זו לזו בכיוון אנטי-
מקבילי; כלומר השרשראות מקבילות זו לזו ,וכל אחת פונה לכיוון אחר.
הצופן הגנטי – בקצרה .קודון הוא רצף של שלושה נוקלאוטידים המקודד לחומצת אמינו אחת .גן הוא
קטע די-אן-איי המכיל מידע ליצירת חלבון .בדומה לצופן מורס ,ניתן לקודד בארבעה בסיסים חנקניים
בלבד (סוגי נוקלאוטידים) כיצד לייצר עשרים חומצות אמינו שונות .וכך ,כל צירוף מייצג חומצה אמינית
שונה .ישנם 64צירופים שונים בין ארבעת הנוקלאוטידים .ישנו קוד (צירוף) מיוחד לקוד התחלה,
שלושה קודוני טרמינציה ,והשאר מייצגים חומצות אמינו ,כאשר ישנן חומצות אמינו שלהן יותר מקוד
אחד.
RNA
האר-אן-איי דומה מאוד ל-די-אן-איי .מבנה האר-אן-איי הוא חד-גדילי .הוא מסוגל לתת מבנים שלישוניים
כמו בחלבונים ,אבל לא מבנים דו-גדיליים .באר-אן-איי קיימת התאמה חד-חד-ערכית לדי-אן-איי ,וגם בו
ארבעה נוקלאוטידים שונים ,אך ב-אר-אן-איי קיים יו במקום טי.
האר-אן-איי “מצלם ,חלק אחד מתוך הדי-אן-איי ובאמצעותו מגיע לתא ומעביר את הפקודות לייצור
החומרים .הסוכר היא ריבוז ,ולא דאוקסי ריבוז.
האר-אן-איי והדי-אן-איי נבדלים זה מזה בסוג הסוכר ,ובמבנה בסיס פירימידיני אחד .ההבדל בין
הדאואוקסיד לריבוז הוא שבריבוז חסר חמצן אחד.
מקרומולקולות בתמיסה.
יש לזכור כי כל החלבונים נמצאים בתמיסה מימית ( 80%-70%מחומר התא הוא מים) .המים משפיעים
על האינטראקציה ביניהם.
מקרומולקולות נפגשות כל הזמן ויכולות ליצור קשרים חלשים ולהפרד מאוחר יותר; או ליצור מבנה חזק
ולהתחיל יצירה של מבני-על.
הריבוזום – דוגמא למבנה-על ,הבנוי מעשרות חלבונים ומספר סיבי אר-אן-איי .סיבי האר-אן-איי עוזרים
לריבוזום להתארגן.
פחמימות – שם כולל לסוכרים המורכבים מפחמן ,מימן וחמצן – קרבוהידרטים (פחמן +מים) .על כל
פחמן שני מימנים וחמצן – כאילו מולקולת מים לכל פחמן .זהו המקור העיקרי לאנרגיה ,ויש לו גם תפקיד
מבני חשוב בצמחים (דופן תאי הצמח – התאית).
חד-סוכרים ,דו-סוכרים .שני סוכרים יכולים להתחבר יחד וליצור דו-סוכר .למשל גלוקוז ,סוכרוז.
רב-סוכרים – פולימרים של חד-סוכרים – תאית ,גליקוגן (אוגר אנרגיה) ,חומרי היכרות בין
תאים.קבוצות הדם נקבעות לפי הסוכרים – ההבדל בין קבוצות הדם הוא הבדל בין שרשראות סוכריות.
שומנים – בעלי תכולת אנרגיה גבוהה יותר מסוכר .מאחר והם הידרופוביים ,התקבצותם יחד יוצרת
בידוד .בנוסף הם מרכיב מרכזי בבניית קרומים .ישנם גם הורמונים שהם הידרופוביים והם בנויים
משומניים (למשל אסטרוגן ,טסטוטורון – הורמוני המין המשניים).
שומן = ליפיד
ליפידים – אינם מסיסים במים אך מסיסים בחומרים אורגניים .שרשראות ארוכות של חומצות שומן או
טבעות (סטרואידים) .פירוק ליפיד מפיק פי 2-6אנרגיה מפירוק סוכר.
פוספוליפידיים הם חומרים בעלתי התנהגות כפולה (אמפיפאטיים) – הם גם הידרופיליים בגלל הקצה של
החומצה הזרחתית ,וגם הירדופוביים בגלל הצד הליפידי (שומני).
המבנים השומניים הם לא מבנים פולריים ,מאחר והפחמן והמימן מחלקים ביניהם את האלקטרונים באופן
שווה ,ובקצותיהם קיימת הקבוצה הקרבוקסילים (חומצה).
בגוף נמצאים הליפידיים במבנים טרי-גליצרידים.
בפוספוליפידים קיים שייר טעון – שייר של חומצה זרחתית או מורכב יותר – וזהו מולקולה אמפיפאתיית.
הפוספוליפידיים הם הבסיסי למבנה הממברנות – הקרומים הביולוגיים.
מינרלים ,ויטמינים – ראה שקפים.