Professional Documents
Culture Documents
Vježba 12
Vježba 12
Vježba 12
Praktikum iz Biologije I
Populacija je skupina jedinki iste vrste koje ive na odreenom prostoru i aktivno
POPULACIJSKA GENETIKA
na razini pojedine jedinke (npr. ima li odreena jedinka graka uto ili zeleno zrno, te
kroz vrijeme pod utjecajem pet glavnih evolucijskih sila: prirodnog odabira (prirodne
mogu prouavati i na razini populacije (definicija pojma populacija slijedi dalje u tekstu).
selekcije), genetskog otklona (engl. genetic drift), mutacija, protoka gena (engl. gene
Uzmimo kao primjer daltonizam, nasljednu sljepou za boje, koju najee uzrokuju
mutacije gena na X kromosomu. Mogu nas zanimati odgovori na pitanja poput: koliki je
postotak oboljelih od daltonizma u ukupnoj populaciji neke zemlje; koliko je meu njima
Slika 1. Populacijski skup gena (engl. gene pool). Alel A ravna kosa; alel a kovrava kosa.
Vjeba br. 12
227
Vjeba br. 12
228
Praktikum iz Biologije I
Praktikum iz Biologije I
HARDY-WEINBERGOV ZAKON
prirodi ne postoji, odnosno prirodne populacije vie ili manje odstupaju od Hardy-
Weinbergovog zakona. Ipak, Hardy-Weinbergov zakon ima smisla iz dva razloga. Prvi je
ramnoavaju. Vrijedi za jedan autosomalni lokus koji ima (samo) dva alela. Hardy-
toga, ako u nekoj populaciji pratimo uestalosti alela kroz vrijeme i primijetimo da
vrijednosti odstupaju od onih koje bismo oekivali prema Hardy-Weinbergovom zakonu,
2.
A) Ako su ispitivani aleli u kodominantnom (Vjeba 10) ili bilo kojem drugom odnosu gdje
iz fenotipa moemo vidjeti genotip, uestalost alela se odredi tako da broj pojedinih
alela podijelimo s ukupnim brojem alela.
B) Ako su aleli u dominantno-recesivnom odnosu, pa jedino za recesivne homozigote
Svi lanovi populacije se mogu pariti, a odabir partnera je potpuno sluajan (svaki
lan populacije ima jednaku mogunost da se pari s bilo kojim drugim lanom
moemo prema fenotipu znati i genotip, uestalosti alela u populaciji moe se odrediti uz
pomo Hardy-Weinbergove jednadbe.
3.
4.
pronalazi partnericu, lake proizvede vei broj potomaka i lake prenese svoje gene
Za primjer moemo uzeti MN sustav krvnih grupa. Danas je poznat velik broj
za transfuziju krvi ABO i Rh sustav. MN sustav krvnih grupa odreen je dvama alelima
svog genotipa nema vei ili manji reproduktivni uspjeh (vei ili manji broj
potomaka).
Vjeba br. 12
229
Vjeba br. 12
230
Praktikum iz Biologije I
Praktikum iz Biologije I
Genotip
Broj osoba
Uestalosti genotipova
MM
22
MN
220
NN
488
Ukupno
730
1 (100 %)
Za Island:
Vano je uoiti da dvije razliite populacije iste vrste ne moraju imati iste
Ve smo napomenuli da MN sustav krvnih grupa ima dva razliita alela na
Slobodnim kombiniranjem gameta koje sadre te alele mogu nastati 3 razliita genotipa:
AA dominantni homozigoti,
Aa heterozigoti,
aa recesivni homozigoti.
(f(MM) + f(MN) + f(NN) = 0,03 + 0,30 + 0,67 = 1), kao i zbroj uestalosti svih razliitih
Ako u itavoj populaciji postoje samo ova dva alela na tom genskom lokusu onda
f(MM)
f(MN)
f(NN)
Grenland
0,83
0,16
0,01
Island
0,31
0,52
0,17
Naravno, vrijedi i
p = 1-q
q = 1-p
Ako je populacija u Hardy-Weinbergovoj ravnotei (vrijede sve pretpostavke:
neogranieno je velika, panmiksija, nema mutacija, migracija i prirodnog odabira), tri
f(AA) = (p x p) = p2
f(Aa) = (p x q) + (q x p) = 2pq
f(aa) = (q x q) = q2
Vjeba br. 12
231
Vjeba br. 12
232
Praktikum iz Biologije I
Praktikum iz Biologije I
biti homozigoti (p2) ili heterozigoti (2pq). U sljedeem primjeru e biti pokazano kako se
uz pomo Hardy-Weinbergove jednadbe moe izraunati uestalost razliitih
A
f(A) = p
a
f(a) = q
A
f(A) = p
a
f(a) = q
AA
Aa
f(AA) = p2
f(Aa) = pq
Aa
aa
f(Aa) = pq
f(aa) = q2
recesivnih homozigota (aa). U koi i kosi albino-osoba nedostaje tamni pigment melanin.
Albinizam se moe javiti kod svih etnikih skupina ljudi, kao i kod ivotinja. U Sjevernoj
Americi i Europi se javlja kod prosjeno 5 osoba na 100,000 stanovnika. Pomou HardyWeinbergove jednadbe moe se izraunati kolike su uestalosti pojedinih alela i
genotipova u populaciji.
U rjeavanju ovakvih problema uvijek se kree od recesivnih homozigota jer kod
njih na osnovu fenotipa znamo genotip. Prema Hardy-Weinbergovoj jednadbi uestalost
Vrijedi i:
recesivnih homozigota (aa), odnosno u naem sluaju albino-osoba, je q2. Lako se izrauna
(p + q)2 = 1
q = 0,00005 = 0,007
p2+ 2pq + q2 = 1
p = 1-q
p = 1 0,007 = 0,993
Uestalost dominantnog, normalnog alela (A) je 0,993 ili oko 99 alela na 100.
kodominantna alela tj. o sluaju kada se iz fenotipa vidi genotip. Meutim, kod
p2+ 2pq+ q2 = 1
0,986 = 98,6%
je uestalost recesivnih homozigota (q2). Jedinke koje imaju dominantni fenotip mogu
Vjeba br. 12
233
Vjeba br. 12
234
Praktikum iz Biologije I
Praktikum iz Biologije I
2pq
= uestalost heterozigota
0,014 = 1,4%
0,00005 = 0,005%
jedna osoba od 72). U populaciji ima otprilike 278 puta vie nosioca nego oboljelih. Ipak,
velika veina od 98,6% ljudi u Sjevernoj Americi i Europi su dominantni homozigoti i
nemaju recesivni alel za albinizam.
o
o
DOMINANTNO
RECESIVNO
Tamna kosa
Crvena kosa
Ravna kosa
Kovava kosa
Nemogunost savijanja
hiperekstenzibilnost)
palca
(distalna
Normalna usna
Zeja usna
Izraunajte iste parametre za slobodan ili vezan uni reanj (Tablica 2 i Slika 2)!
Dominantni homozigoti (TT) osjeaju jak, gorak okus, heterozigoti (Tt) osjeaju
lagano gorak okus, a recesivni homozigoti (tt) uope ne osjeaju okus PTC-a. Kratko
Pjegavost (izraena)
Odsustvo pjegavosti
Oi pigmentirane
Oi plave
Vjeba br. 12
235
od
etvrtog
Kaiprst krai
mukaraca
prsta
kod
Katarakt oiju
Zdrave oi
Normalan vid
Kratkovidnost
Sljepoa za boje
Normalna pigmentacija
Albinizam
Normalan metabolizam
Hemofilija
Vjeba br. 12
236
Praktikum iz Biologije I
a)
Praktikum iz Biologije I
b)
Pribor:
ravnalo
depno raunalo
tablice za odreivanje
kare
uestalosti razliitih
ljepilo
genotipova u sljedeoj
milimetarski papir
generaciji
Postupak:
Izreite 3 Tablice za odreivanje uestalosti razliitih genotipova u sljedeoj
generaciji i zalijepite ih u biljenicu.
Zadatak ete raditi sa crnim i bijelim kvadratiima, a svaki kvadrati predstavlja
jedan alel:
Vjeba br. 12
237
Vjeba br. 12
238
Praktikum iz Biologije I
Praktikum iz Biologije I
*Napomena: Kako imate kombinacije kvadratia (jedinke) sva tri razliita geotipa
RR, Rr i rr; nasuminim izvlaenjem kombinacija kvadratia (jedinki) moete dobiti
kvadratie.
2. Stavite preostalu populaciju od 48 jedinki (16 crno/crnih i 32 crno/bijele
kombinacije kvadratia) u kutiju.
4. Neka svaki roditeljski par ima etvero potomaka. Odredite njihove genotipove
cijeli broj, zaokruite ga na prvi cijeli broj, tako da ukupna veliina populacije
bude 64 jedinke.)
8. Na milimetarskom papiru nacrtajte graf kojem je na X osi vrijeme (Generacije 14), a na Y osi uestalost recesivnog alela r!
Zbroj jedinki sva tri genotipa bi trebao biti 64. (Ako mnoenjem ne dobijete
odnosno da na njih djeluje negativan prirodni odabir. Uklonit ete bijele/bijele (rr)
cijeli broj, zaokruite ga na prvi cijeli broj, tako da ukupna veliina populacije
bude 64.)
239
240
Praktikum iz Biologije I
Praktikum iz Biologije I
10. Ponovite korake 2. 9. ukupno tri puta da dobijete uestalosti genotipova i alela u
Zadatak 4: Amiloidoze.
protein transtiretin oteuje srce i/ili ivani sustav. Radi se o autosomalnoj recesivnoj
ostane jedan nespareni par kvadratia. Njega treba ukloniti iz populacije jer nema
dokazano da imaju jedan mutirani alel gena za transtiretin. Kolika je uestalost osoba
prenosioca, a kolika mutiranog alela u ovoj populaciji?
Pitanja i zadaci:
1. Usporedite grafove koji prikazuju uestalost alela r tijekom vremena za
Zadatak 5.
Od 2400 poroda u podrunoj bolnici umrlo je 6 beba ubrzo nakon roenja zbog
autosomalne recesivne letalne disfunkcije (opstrukcija debelog crijeva, genotip cc).
a)
b)
c)
Zadatak 3.
Zadatak 6.
Boju krzna make odreuje par kodominantnih X-vezanih alela koji daju sljedee
fenotipove:
uzorku od 900 ovaca naeno je 891 bijela i 9 crnih. Odredite frekvenciju alela B i b!
Zadatak 7.
Kod goveda rase Shorthorn (kratkorogo govedo) genotip CRCR ima crvenu dlaku,
CRCW arenu dlaku (mjeavina crvene i bijele) i CWCW bijelu dlaku. U jednom uzorku
kratkorogih goveda bilo je 108 crvenih, 48 bijelih i 144 arenih. Odredite uestalosti
Vjeba br. 12
Bijelu vunu ovaca odreuje dominantan alel B, a crnu vunu recesivni alel b. U
enke
554
14
108
676
mujaci
622
84
706
241
Vjeba br. 12
242
Praktikum iz Biologije I
Praktikum iz Biologije I
GENETSKA RAZNOLIKOST
Genetska raznolikost unutar populacije nastaje kao posljedica dva glavna procesa:
Prema shvaanju dananje znanosti, ivi svijet koji nastanjuje Zemlju nastao je
kao rezultat niza evolucijskih promjena tijekom posljednjih 3,5 milijardi godina.
(Mikro)evoluciju ivih bia moemo definirati kao proces promjene genetike strukture
jedinki u populaciji iz jedne u drugu generaciju to tijekom dugog vremenskog razdoblja
dovodi do nastanka novih vrsta (specijacije). Da bi ove evolucijske promjene bile mogue,
potrebno je da su zadovoljena tri osnovna imbenika:
1.
3.
2.
rekombinacija i mutacija.
(pojava da vie razliitih kodona kodira za istu aminokiselinu, pa razliite varijante gena
mogu nositi uputu za sintezu istog polipeptida; vidi Vjebu 7), ili se pojavljuju u
nekodirajuim regijama genoma. tetne mutacije smanjuju vjerojatnost preivljavanja
za jedinku koja ih nosi, i najee se s vremenom se izbacuju iz populacije. Primjerice,
jedinka koja ima neku letalnu mutaciju ugine, ne moe stvoriti potomke, te se ta tetna
mutacija gubi iz populacije (vidi Vjebu 11, Zadatak 1, Eksperiment 2). Osim tetnih i
neutralnih mutacija, ponekad (rijetko) se javljaju i korisne mutacije. Uestalost novih
alela nastalih korisnih mutacijama e se s vremenom poveavati unutar populacije.
Primjerice, paun s ljepim i veim repom e lake nai partnericu i imati e vie potomaka,
pa e alela koji odreuju ovo svojstvo s vremenom biti sve vie u populaciji.
Vjeba br. 12
243
Vjeba br. 12
244
Praktikum iz Biologije I
Praktikum iz Biologije I
2.
Protok gena ili genski tok predstavlja premjetanje pojedinih alela iz jedne u drugu
populaciju kao posljedica migracije jedinki. Krajnji rezultat toga je promjena uestalosti
Weinbergovog zakona koji kae da, ako je populacija u ravnotei, odnosno ne evoluira,
alela u populaciji.
3.
ali kroz duga vremenska razdoblja postaju pokretaka sila evolucije jer uzrokuju pojavu
Uzronici evolucijskih promjena su:
1.
novih alela.
4.
populacije. Drugim rijeima, genetski otklon je skup sluajnih dogaaja koji odreuju
koji e se aleli naslijediti, a koji ieznuti unutar jedne populacije (Slika 3).
homozigota.
5.
Odreeni fenotip ima vei reproduktivni uspjeh i stoga ima vee anse za prenoenje
svojih gena u sljedeu generaciju i njihova uestalost u populaciji raste (istovremeno,
uestalost drugih gena se smanjuje). Koji e fenotip biti uspjeniji ovisi o biotikim i
abiotikim uvjetima okolia. Uvjeti da bi se mogao odvijati prirodni odabir izmeu
ostalog ukljuuju brojnost i raznolikost populacije (fenotipske prednosti i nedostaci), te
razliit reproduktivni uspjeh razliitih jedinki. Za bilo koju osobinu koja se javlja u
rasponu razliitih vrijednosti (primjerice, tonovi boje krzna), prirodni odabir moe biti
Roditeljska
populacija
Preivjele
jedinke
Slijedea
generacija
(Slika 4):
a.
Slika 3. Shema genetskog otklona uinak uskog grla ili uinak katastrofe. Nakon npr. neke
prirodne katastrofe ili epidemije iz velike populacije nastaje mala populacija. S obzirom
da je to koje e jedinke preivjeti rezultat iste sluajnosti, nova populacija ne zadrava
iste uestalosti alela kao ishodina populacija.
Vjeba br. 12
245
Vjeba br. 12
246
Praktikum iz Biologije I
Praktikum iz Biologije I
b.
c.
uestalosti alela i genotipiva kroz dui vremenski period. Vrsta (lat. species) je osnovna
jedinica taksonomske podjele ivog svijeta i definira se kao skupina jedinki koja
drugih jedinki (primjerice konj i magarac su razliite vrste jer, iako se mogu meusobno
pariti, njihovi potomci su sterilni).
kukac
svijetlih krila
2. Distribucija
jedinki nakon
nekoliko
generacija
B) Usmjereni
prirodni odabir
C) Razdvajajui
prirodni odabir
kukac
tamnih krila
broj jedinki
1. Poetna
distribucija
jedinki
A) Stabilizirajui
prirodni odabir
okolia koji uzrokuju razliit prirodni odabir). Ako je vrijeme razdvojenosti dovoljno
dugo, iz te dvije populacije razvit e se dvije razliite vrste koje se vie ne mogu
meusobno razmnoavati ni kada se ponovo nalaze na istom geografskom podruju.
3. Distribucija
jedinki nakon puno
generacija
djelovanje
prirodnog odabira
Primjer alopatrijske specijacije, odnosno nastanak dvije razliite vrste kukaca prikazuje
Slika 5.
Vjeba br. 12
247
Vjeba br. 12
248
Praktikum iz Biologije I
Praktikum iz Biologije I
IZVORI SLIKA
Slika 1. Ana Bielen.
http://www.evotutor.org/EvoGen/EG1A.html
http://www.evotutor.org/Selection/Sl1A.html
http://biology.unm.edu/ccouncil/Biology_203/Summaries/PopGen.htm
Slika 4. Preuzeta sa stranice:
http://www.britannica.com/EBchecked/media/45468/Three-types-of-natural-
http://www.evotutor.org/Mutation/MT1A.html
selection-showing-the-effects-of-each
http://www.evotutor.org/GeneFlow/GF1A.html
http://evolution.berkeley.edu/evosite/evo101/VC1bAllopatric.shtml
Vjeba br. 12
249
Vjeba br. 12
250