Professional Documents
Culture Documents
10.sri Darmawati
10.sri Darmawati
10.sri Darmawati
Abstract
Sensitivity, specificity, and predictive value of Widal test were varied followed by the success
values of blood cultures by 40%-89%. The purpose of this study was to identify Gram-negative
bacillus bacteria in positive Widal blood cultures based on phenotypic. One hundred and thirty
six (136) samples were gathered from in and outpatients of 4 hospitals and 2 community health
centers in Semarang. Bact/Alert FAN, Mac Conkey, Rapid Test Kit API 20E, API 50CHB/E
were used Blood culture, isolation and characterizations. Sensitivity test to 6 types of antibiotics
were used for phenotypic characterization. The results were classified into four clusters. Cluster
I consisted of 5 isolates of Salmonella typhi (KD 30.4, SA 02.2, KD 30.3, NCTC 786, BA 07.4)
with similarity value of 91.8%-97.4%. Cluster II: Escherichia coli (BA 30.1 ; BA 30.2) and
Salmonella sp. BA 30.5 (88.2%-97.4%). Cluster III, Serratia marcescens KD 08.4 and KD 08.5
(94.7%). Cluster IV, Enterobacter cloacae BA 45.4.1, TG 03.5, KT 16, SA 02.1 and 1 isolate of
Klebsiella pneumoniae KD 58.4 (83.9%-94.7%) . The results of sensitivity test of 14 bacterial
isolates and one reference strain of S. typhi NCTC 786 showed that 93.3 % was sensitive to
chloramphenicol, 86.7 % to ciprofloxacin, 66.7 % to gentamicin, respectively to cefotaxime
(60%), trimethoprim-sulfametoksasol (60%), and ampicillin (53.3%).
Bacterial species diversity in blood caused sensitivity and specificity of Widal various. The
bacterial sensitivity to chloramphenicol was still high.
Keywords: Widal, Kultur darah, BacT/Alert FAN, API 20E, API 50 CHB/E
1. PENDAHULUAN
Demam tifoid adalah infeksi sistemik
oleh Salmonella typhi (S.typhi) ( WHO,
2003). Penyakit ini merupakan penyakit
endemis yang
tersebar luas di dunia,
termasuk di Indonesia
dan Negara
berkembang lainnya (Thong, et al,. 2000;
Husein et al., 2002; Vollaard et al., 2005). Di
Indonesia angka insiden demam tifoid
mencapai 358-810/100.000 penduduk/tahun
dengan angka kematian yang cukup tinggi,
yaitu 1-5 % dari penderita (Punjabi, 2004;
Vollaard et al., 2005). Demam tifoid di Kota
Semarang demam tifoid termasuk urutan ke
tiga setelah Demam Berdarah Dengue dan
Diare serta gastroenteritis dari 10 besar
penyakit (Anonim, 2008).
Diagnosis klinis demam tifoid harus
didukung dengan diagnosis laboratorium,
89
ISSN 2407-9189
90
Pertumbuhan
mikroorganisma
diamati
selama waktu inkubasi, yang ditandai dengan
perubahan warna sensor pada bagian dasar
botol menjadi kuning, kemudian dikultur
pada media Blood Agar Plate (BAP) dan
diinkubasi selama 24 jam atau semalam pada
suhu
37C,
selanjutnya
dilakukan
subkultur/isolasi bakteri.
Tahap isolasi/ subculture Setelah
dilakukan kultur pada medium BAP,
kemudian dilakukan pengamatan morfologi
koloni pada setiap 5 koloni terpilih meliputi:
warna koloni, bentuk, diameter, tepi, elevasi,
sifat berdasarkan kemampuannya untuk
menghemolisa sel darah merah (alfa, beta
atau gamma). Koloni bakteri terpilih
kemudian diisolasi secara bertingkat
beberapa kali sampai diperoleh kultur murni,
koloni bakteri dicat dengan pengecatan gram
dan ditanam pada medium BHI agar miring
serta BHI agar tegak untuk disimpan pada
suhu 4C sebagai stok.
Karakterisasi fenotipik Koloni terpilih
untuk bakteri batang, gram negatif enterik
dikultur pada media Mac Conkey Agar (MC,
OXOID) kemudian dilakukan karakterisasi
fenotipik. Karakter fenotipik yang digunakan
untuk identifikasi bakteri batang gram negatif
anggota familia Enterobacteriaceae meliputi
morfologi sel bakteri, morfologi koloni, sifat
biokimiawi menggunakan API 20E dan API
50CHB/E, serta uji sensitivitas terhadap
enam
macam
antibiotik
(ampisilin,
gentamisin,
sefotaksim,
siprofloksasin,
trimetoprim-sulfametoksasol, kloramfenikol)
menggunakan metode disk diffusion (KirbyBauer) pada medium Mueller-Hilton Agar
(MHA, OXOID).
Klasifikasi Numerik Fenetik
Koleksi Data. Ditentukan Operational
Taxonomical Units (OTU) yaitu 14 strain
bakteri batang gram negatif anggota familia
Enterobacteriaceae dengan 1 strain acuan S.
typhi NCTC 786 (n=15),
kemudian
ditentukan 76 unit karakter (t=76). Data
tersebut selanjutnya disusun dalam matriks n
x t dengan menggunakan program MS Excell
2007.
ISSN 2407-9189
Kode
Isolat
NCTC 786
BA 07.4
BA 30.1
BA 30.2
BA 30.5
BA 45.4.1
KD 30.3
KD 30.4
KD 08.4
KD 08.5
KD 58.4
SA 02.1
SA 02.2
TG 03.5
KT 16
Nama Isolat
S. typhi
S. typhi
E. coli
E. coli
Salmonella sp.
Ent. cloacae
S. typhi
S. typhi
Ser. marcescens
Ser. marcescens
K. pneumoniae sp.
Ent. cloacae
S. typhi
Ent. cloacae
Ent. cloacae
91
ISSN 2407-9189
Gambar 1. Dendrogram yang menunjukkan hubungan kemiripan antara 14 isolat bakteri batang gram
negatif (Kleb. pneumoniae KD 58.4; Ent. cloacae SA 02.1; Ent. cloacae KT 16; Ent. cloacae BA 45.4.1;
Ent. cloacae TG 03.5; Ser. marcescens KD 08.5; Ser. marcescens KD 08.4; E. coli BA 30.2; E. coli BA
30.1; Salmonella sp.BA 30.5; S. typhi BA 07.4; S. typhi SA 02.2; S. typhi KD 30.4; S. typhi KD 30.3)
hasil isolasi dari sampel darah Widal positif pada pasien gejala klinis demam tifoid dengan satu strain
acuan S. typhi NCTC 786 yang didasarkan atas analisis Simple Matching Coefficient (SSM) dan algoritma
UPGMA berdasarkan karakter fenotipik
Tabel 2. Analisis klaster 14 isolat bakteri batang
gram negatif anggota familia Enterobcteriaceae
dengan satu strain acuan S. typhi NCTC 786
didasarkan atas analisis Simple Matching
Coefficient (SSM) dan algoritma UPGMA
No
dus
92
Grup 1
1
2
3
KD 30.4
BA 30.1
KD 30.3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
Nodus 3
KD 08.4
TG 03.5
Nodus 4
Nodus 6
BA 30.5
Nodus 8
Nodus 10
Nodus 7
Nodus 12
Nodus 13
Grup 2
SA 02.2
BA 30.2
S. typhi
NCTC 786
Nodus 1
KD 08.5
BA 45.4.1
BA 07.4
KT 16
Nodus 2
SA 02.1
KD 58.4
Nodus 9
Nodus 5
Nodus 11
Simi
larit
as
(%)
97,4
97,4
96,1
95,4
94,7
93,4
91,8
91,4
88,2
85,5
83,9
80,0
70,4
67,5
objek
yang
bergab
ung
2
2
2
4
2
2
5
3
3
4
5
8
10
15
I
0
0
0
80
0
0
0
0
0
Klaster
II
III
66,7
100
33,3
50
66,7
100
33,3
0
0
0
100
0
100
0
0
100
0
0
IV
80
80
80
0
100
0
0
0
100
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
100
100
0
100
100
100
0
80
20
0
0
0
100
0
0
0
100
0
0
100
0
0
0
0
ISSN 2407-9189
93
ISSN 2407-9189
bakteri
terhadap
94
ISSN 2407-9189
95
ISSN 2407-9189
96