Penggunaan huruf e pepet atau dikenal juga sebagai huruf e bertanda di atas dalam ejaan lama (ejaan Rumi

Zaba). Tanda diakritik di atas e pepet () tidak digunakan lagi dalam ejaan Rumi sekarang. Contoh penggunaannya ialah:
Ejaan baru emak keledek menteri tempuh

Ejaan lama mak kledek mntri tmpoh

Huruf lama
ch dh dz
sh th

Huruf sekarang
c d z
sy s

Contoh
chacat cacat chari cari dharab darab dhari dari dzalim zalim dzat zat
sharat syarat mashhor masyur mithal misal ithnin isnin

Tanda koma di atas () dan (`) yang terdapat dalam sistem ejaan Rumi lama (sebelum tahun 1972) tidak digunakan lagi dalam sistem Rumi sekarang. Tanda-tanda koma tersebut digugurkan atau digantikan dengan huruf konsonan Rumi seperti yang berikut: Tanda koma di atas () yang sepadan dengan huruf jawi ain dihapuskan jika membuka suku kata. Contohnya: alam jadi alam Tanda koma di atas () yang sepadan dengan huruf jawi ain digantikan dengan huruf konsonan k jika menutup suku kata. Contohnya: mana jadi makna

Tanda koma di atas () yang sepadan dengan huruf jawi hamzah ( ) dihapuskan jika membuka suku kata. Contohnya: masaalah jadi masalah Tanda koma di atas () yang sepadan dengan huruf jawi hamzah ( ) digantikan dengan huruf konsonan k jika membuka suku kata. Contohnya: dato jadi datuk

Selain itu, tiga huruf yang diperkenalkan supaya digunakan secara tetap semenjak tahun 1972 ialah q, v dan x. Huruf q digunakan sebagai padanan kepada huruf Jawi qaf () untuk mengeja kata istilah agama atau kata yang mengenai agama yang berasal daripada bahasa Arab. Contohnya: qariah qunut Huruf v digunakan untuk mengeja kata serapan daripada bahasa Inggeris dan Bahasa-bahasa Eropah yang lain, di pangkal kata atau di pangkal suku kata, sebagaimana yang terdapat dalam ejaan bahasa sumber. Contohnya: versi subversif universiti Huruf x hanya digunakan pada pangkal kata istilah khusus yang tidak ditukar menjadi z. Contohnya: xelophone jadi xelofon

Dasar mengenai perubahan ini menetapkan supaya digunakan huruf vokal i atau u di suku kata akhir tertutup sekiranya digunakan huruf vokal a, e pepet, i atau u di suku kata praakhir.
Ejaan Rumi Lama Pola Ejaan a --- e taling a --- o e pepet ---e taling e pepet --- o i --- e taling i --- o u --- e taling u --- o Contoh aleh batok lbeh tmpoh pileh tidor usek untong Pola Ejaan a -- i au ei eu ii iu ui uu Ejaan Rumi Baru Contoh alih batuk lebih tempuh pilih tidur usik untung

tanda sempang pada awalan di dalam ejaan lama digugurkan dan awalan itu ditulis serangkai dengan kata dasar atau bentuk dasar yang ada selepasnya dalam ejaan sekarang.
Ejaan Lama di-makan di-pandang di-prkatakan Ejaan Sekarang dimakan dipandang diperkatakan

di-slideki

diselidiki

tanda sempang (-) pada awalan sa- dalam ejaan lama digugurkan dan awalan itu digugurkan dan awalan itu dieja se dan ditulis serangkai dengan kata dasar atau bentuk dasar yang ada selepasnya dalam ejaan sekarang. Contohnya:
Ejaan Sekarang sebagaimana sebelas seorang seseorang seumpamanya

Ejaan Lama sa-bagaimana sa-blas sa-orang sa-saorang sa-umpama-nya

Ejaan Lama ada-lah tolong-lah apa-kah

Ada empat jenis partikel dalam bahsa Melayu sekarang, iaitu lah, -kah, -tah dan pun. Partikel lah, -kah, dan tah yang menggunakan tanda sempang dalam ejaan Rumi lama ditulis serangkai dengan kata dasar atau bentuk dasar yang ada di depannya, tanpa tanda sempang, dalam ejaan Rumi sekarang. Contohnya:
Ejaan Sekarang adalah tolonglah apakah kenapakah

kenapa-kah

bila-tah

bilatah

Kata ulang (atau kata ganda) dalam sistem ejaan Rumi bahasa Melayu sekarang yang ditulis sepenuhnya dengan menggunakan tanda sempang (-) yang dibubuh di bahagian kata yang diulang. Angka dua (2) yang digunakan sebagai tanda ulangan dalam ejaan Rumi lama dihapuskan dalam ejaan Rumi sekarang. Contohnya : Ejaan Lama Ejaan Sekarang

ber-ulang2 berulang-ulang

di-paksa2kan
di-marah2i

dipaksa-paksakan
dimarah-marahi