MOLEKULSKA GENETIKA

nukleotidi

... POLINUKLEOTIDNA VERIGA

fosfodiestrske vezi

Osnovna zgradba polinukleotidne verige (ali kateregakoli lineranega polimera) 1

MOLEKULSKA GENETIKA

RNK (ribonukleinska kislina) ENOJNA VIJANICA del molekule, ki jo gradijo sladkorji in fosfati DNK (deoksiribonukleinska kislina) organska baza par organskih baz

DVOJNA VIJANICA

Enojna in dvojna vijanica 2

MOLEKULSKA GENETIKA
ENOOBROASTE ORGANSKE BAZE (pirimidinske)

NH2 C N C O N H
C citozin

O C C H H C N C H O N H
T timin

O C C CH3 H C N C H O N H
U uracil

C C

DVOOBROASTE ORGANSKE BAZE (purinske)

O H C N C N C N C N H
gvanin

NH2 C C H H N C N
A

C N C N H

C H

NH2

G
Organske baze

adenin

MOLEKULSKA GENETIKA

H HO 5C H O H
4

OH
1C H H 2C OH

H HO 5C H O H
4

OH

H 3C OH

1C H H H 3C 2C H OH

R riboza

deoksiriboza

Riboza in deoksiriboza 4

MOLEKULSKA GENETIKA

FOSFORJEVA KISLINA (H3PO4)

FOSFAT 3(PO4 )

OH O P OH OH O

O P O

O
-

s tem delom se molekula vee na sladkor

Ostanek fosforjeve kisline (fosfat) 5

MOLEKULSKA GENETIKA

fosfat

P
sladkor (pentoza)

baza

nukleozid nukleotid

S simboli prikazan nastanek nukleotida 6

MOLEKULSKA GENETIKA

fosforjeva kislina

ostanek fosforjeve kisline

OH O P OH OH
5 4

OH
OH
estrska vez

O
H2O H2O
kondenzacija
5

P O

OH

glikozidna vez

O
riboza
3 2 1

H20

O
4

N
1

OH

HN
del baze

+H20
hidroliza

riboza
3 2

del baze

OH

OH

OH

OH

RNKNUKLEOTID

Nastanek nukleotida prikazan z delno izrisanimi molekulami. Vidimo lahko, iz katerih delov se voda odcepi (kondenzacija) in kam se vrine pri razpadu nukleotida (hidroliza). 7

MOLEKULSKA GENETIKA

OH O P O
5 5

OH OH O P O O
baza estrska vez med obema nukleotidoma baza
4

OH
5

1. nukleotid

R
3 2

OH OH O P O
5

OH H 2O OH
estrska vez v nukleotidu
5

O O P O O

OH OH
fosfodiestrska vez (fosfat povezuje sladkorja dveh nukleotidov)

P
5

O
baza

2. nukleotid baza
4

R
3 2

OH

OH

OH

OH
8

dinukleotid

Nastanek dinukleotida

MOLEKULSKA GENETIKA
5 konec P

3 konec

sem se prikljui novi nukleotid

Osnovna zgradba polinukleotidne verige z oznaenima 3 in 5 koncem 9

MOLEKULSKA GENETIKA

verigi sladkorjev in fosfatov pari organskih baz

lestev

dvojna vijanica

Model DNK; levo oblika lestve, sredina zvijanje lestve, desno tridimenzionalni model DNK 10

MOLEKULSKA GENETIKA

Povezovanje komplementarnih baz (A = T, G = C) 11

MOLEKULSKA GENETIKA

polinukleotidna vodikove polinukleotidna vezi veriga veriga

5 P nukleotid

A
P

T
P

nukleotid

G
P

C
P

T
P

A
P

C
3
veriga sladkorjev in fosfatov

G
P

veriga pari komplementarnih sladkorjev in fosfatov baz

Antiparalelnost verig 12

MOLEKULSKA GENETIKA

A C G C

mesto, kamor se pripne aminokislina

zanka iz nekomplementarnih baz

komplementarne baze

antikodon

Prenaalna RNK; levo shematski prikaz v obliki triperesne deteljice, desno prostorska struktura 13

MOLEKULSKA GENETIKA

Podvajanje DNK 14

MOLEKULSKA GENETIKA

3 5 vodilna veriga 3 5 3 zastajajoa veriga 3 5 Okazakijev fragment 5 3 5

podvojevalne vilice

Nastajanje vodilne in zastajajoe verige ob podvojevalnih vilicah 15

MOLEKULSKA GENETIKA

Poskus, ki sta ga izvedla Meselson in Stahl doloanje mesta teke, lahke in vmesne DNK v centrifugirki. 16

MOLEKULSKA GENETIKA

Poskus, ki sta ga izvedla Meselson in Stahl dokaz za semikonzervativno podvajanje. 17

MOLEKULSKA GENETIKA

ive celice seva H (nepatogene)

ive celice seva G (patogene)

s toploto uniene celice seva G

ive s toploto celice uniene seva H celice seva G

iva mi

mrtva mi

iva mi

mrtva mi

Griffithov poskus s pnevmokoki 18

MOLEKULSKA GENETIKA

sev H

sev G

sev H

sev G

DNK

encim + DNK

+ transformacija

+ ni transformacije

Dokaz, da je DNK nosilka lastnosti. e so k bakterijam seva H dodali DNK seva G, je prilo do transformacije. Nekatere bakterije iz nepatogenega seva H so postale patogene. e pa so k bakterijam seva H dodali meanico encima za razgradnjo DNK in DNK iz seva G, do transformacije ni prilo. 19

MOLEKULSKA GENETIKA

Poskus z oznaenimi bakteriofagi 20

MOLEKULSKA GENETIKA

kromosom jedro s kromosomi gen 1 beljakovina 1

gen 2 gen 3

beljakovina 2 beljakovina 3

Na kromosomu so odseki, geni, ki nosijo zapis za nastanek beljakovine (proteina). 21

MOLEKULSKA GENETIKA

DNK mRNK

beljakovina
A

nekodogena veriga

T A A G A U GC GC AT

transkripcija

U G C U G G A C U A G U U U

A
U

gradbeni elementi

G
C

translacija
beljakovine encimi

kodogena veriga

GC UA

kataliza

ogljikovi hidrati lipidi

C
U

druge organske molekule aminokislina celini produkti

RNKnukleotid

DNK preko encimov nadzira nastanek organskih snovi v celici. 22

MOLEKULSKA GENETIKA

kodogen DNK 3' A C C 5'

mRNK

5'

U A

kodon G G

3'

C C antikodon

RNK

tRNK

5' 3' triptofan

Kodogen, kodon in antikodon 23

MOLEKULSKA GENETIKA

jedro

CITOPLAZMA

tRNK DNK transkripcija mRNK

aminokisline ribosom

translacija polipeptid

plazmalema

Sinteza beljakovin poteka v dveh korakih: prepisovanje (transkripcija) in prevajanje (translacija). 24

MOLEKULSKA GENETIKA

prepisovanje RNKpolimeraza kodogena veriga nekodogena veriga

DNK

3'

UA A U C G G UC C A UUGC A T T A GC C AGG T A ACG

A U C G G U A RNKnukleotidi

mRNK

5'

Prepisovanje ali transkripcija 25

MOLEKULSKA GENETIKA

gen

ekson 1 intron1

ekson 2 intron 2

ekson 3

kodogena veriga DNK

TRANSKRIPCIJA

ekson 1 izrezana introna

ekson 2

ekson 3

nezrela mRNK

ZORENJE mRNK (izrezovanje intronov)

ekson 1 ekson 2

ekson 3

zrela mRNK

Prepisovanje pri evkariontih 26

MOLEKULSKA GENETIKA

Le
Cys Leu
Le u

Pro

t Me

veja podenota

Gly

Val

A G A A C A U G G U U G U

A G A A C A U G G U U G U G U G U U A U U G U U G C C G U A A

mRNK

P manja podenota

Levo ribosom, desno polisom Na ribosomu sta oznaeni mesti A in P: na mesto A se vee tRNK, na mestu P se sintetizira beljakovina. 27

MOLEKULSKA GENETIKA

r Th

s Cy

Leu

u Pro Met Leu Le

polipeptid RIBOSOM
Met

Gly

Val

tRNK
A U C G A U C A U A G A A C A U G G U U G U G U G U U A U U G U U G C C G U A

3'

10.

9.

8.

7.

6.

5.

4.

3.

2.

5' mRNK 1. kodon

smer premikanja ribosoma

Prevajanje ali translacija 28

MOLEKULSKA GENETIKA

ribosom DNK mRNK

podvajanje DNK

beljakovina transkripcija RNK translacija beljakovina

Centralna genetska dogma 29

MOLEKULSKA GENETIKA

Za nastanek konnega produkta je obiajno potrebnih ve encimov. 30

MOLEKULSKA GENETIKA

Zgradba operona 31

MOLEKULSKA GENETIKA

Posledice delovanja razlinih vrst represorjev; zgoraj aktivni represor preprei prepisovanje, spodaj neaktivni represor omogoi prepisovanje 32

MOLEKULSKA GENETIKA

Regulacija izraanja genov; zgoraj efektor induktor (npr. laktoza) inaktivira aktivni represor in s tem sproi prepisovanje strukturnih genov, spodaj efektor korepresor (npr. triptofan) aktivira neaktivni represor in s tem preprei prepisovanje strukturnih genov. 33

MOLEKULSKA GENETIKA

Laktozni operoni; levo zgradba lac-operona, desno regulacija lac-operona 34

MOLEKULSKA GENETIKA

Triptofanski operon; zgoraj vkljuen trp-operon, spodaj izkljuen trp-operon 35

MOLEKULSKA GENETIKA

lomljenje kromatid

zamenjava kromatid

kromatidi

homologna kromosoma

rekombinirana kromosoma

Intrakromosomska (homologna) rekombinacija 36

MOLEKULSKA GENETIKA

TRANSPONIBILNI ELEMENT

123456789 123456789
gen za transpozazo

987654321 987654321

gostiteljska DNK

ATGCA TACGT
tarno zaporedje

ATGCA123456789 TACGT123456789
tarno zaporedje obrnjena ponovitev en ali ve genov, ki jih nosi TE

987654321ATGCA 987654321TACGT
obrnjena ponovitev tarno zaporedje

Transponibilni element (TE) ima na obeh koncih obrnjeni ponovitvi. Ko se vrine v DNK na t. i. tarno zaporedje, povzroi podvojitev tega mesta. Tarno zaporedje je obiajno dolgo od 5 do 9 baznih parov (bp). Na sliki je tarno zaporedje zgrajeno iz 5 baznih parov. TE ima na koncih obrnjeni ponovitvi iz zaporedja 9 baznih parov, ki so na skici oznaeni s tevilkami. tevilke od 1 do 9 predstavljajo doloeni bazni par. Podvojeni tarni zaporedji sta enosmerni, vsaki drugani in nista del TE. 37

MOLEKULSKA GENETIKA

INSERCIJSKO ZAPOREDJE

IS1
obrnjena obrnjena gen za transpozazo ponovitev ponovitev

TRANSPOZON

Tn1681

obrnjena obrnjena gen za transpozazo ponovitev ponovitev

drugi geni

obrnjena obrnjena gen za transpozazo ponovitev ponovitev

IS1

IS1

Vrste transponibilnih elementov; zgoraj insercijska zaporedja (IS), spodaj transpozon (Tn) 38

MOLEKULSKA GENETIKA

kroni kromosom

rekombinantni plazmid

gostiteljska celica

transformirana celica

Transformacija 39

MOLEKULSKA GENETIKA

profag izloitev profaga in dela bakterijskih genov iz gostiteljskega kromosoma

gostiteljska celica

nastanek in sprostitev novih virusov

okuba nove celice

gensko spremenjena gostiteljska celica

Transdukcija 40

MOLEKULSKA GENETIKA

kroni kromosom

plazmid F+ Fkonjugacijski mostiek F+ F+

Konjugacija 41

MOLEKULSKA GENETIKA

kroni kromosom

plazmid

kromosom z vgrajenim plazmidom

F - celica

F+ celica

Hfr celica

Oznake bakterij, ki sodelujejo pri konjugaciji. 42

MOLEKULSKA GENETIKA

mutacija somatske celice

tumor (mutacija se ne prenese na potomce)

telesna celica

mutacija spolne celice

spolna celica otrok z mutacijo v vseh telesnih celicah (mutacija se prenese na potomce)

Posledice somatskih in zarodnih mutacij 43

MOLEKULSKA GENETIKA

Genske, kromosomske in tevilne kromosomske mutacije 44

MOLEKULSKA GENETIKA

A T C T A A GG C T A G C C C
nemutirana DNK

AK1

AK2

AK3

AK4

AK5

beljakovina 1

zamenjava enega nukleotida (A T)

mutirana DNK

A T C T A T GG C T A G C C C AK1 AK6 AK3 AK4 AK5

beljakovina 2

vrinjenje enega nukleotida (T)

mutirana DNK

A T C T A A T G G C T A G C C C C AK1 AK2 AK7 AK8 AK9

beljakovina 3

izpad enega nukleotida (A)

A A T C T A G G C T A G C C C C
mutirana DNK

AK1

AK10

AK11

AK12

AK5

beljakovina 4

Vzroki za genske mutacije in njihove posledice 45

MOLEKULSKA GENETIKA

hem
veriga

globin

veriga hemoglobin podenota hemoglobina

Zgradba hemoglobina 46

MOLEKULSKA GENETIKA

Del nemutirane in mutirane -verige 47

MOLEKULSKA GENETIKA

A B C D E F
kromosom

geni

A B C

A B B C D

A C B D E F

K L M N O P R E F

delecija

E F

E F

duplikacija

inverzija

translokacija

Strukturne kromosomske mutacije 48

MOLEKULSKA GENETIKA

Prikaz monoploidne, poliploidne in anevploidne (monosomija, trisomija) celice 49

MOLEKULSKA GENETIKA

Shematski prikaz idiograma s triploidijo (3n) 50

MOLEKULSKA GENETIKA

10

11

12

13

14

15

16

17

18

19

20

21

22

XY

13 Patau sindrom

21 Downov sindrom

18 Edwardsov sindrom

Trisomije 51

MOLEKULSKA GENETIKA
podvojeni kromosom kromatida

centromer materinska celica

par homolognih kromosomov

*
gamete

*nepravilno razhajanje kromosomov med mejozo

zdruitev gamet

X
normalna haploidna gameta

X
normalna haploidna gameta

TRISOMIJA

MONOSOMIJA

Nepravilno razdvajanje kromosomov med mejozo 52

MOLEKULSKA GENETIKA

verjetnost, da se bo rodil otrok z Downovim sindromom (%)

starost matere (leta)

S starostjo matere naraa verjetnost, da bo rodila otroka z Downovim sindromom. 53