OPERACIONES SENCILLAS CON SECUENCIAS DE AMINOCIDOS

[Escriba el subttulo del documento]

Vanessa Rivera Barreiro

SEeccuencia ADN
ATGTGCGACCATACCAAGCTGAAAATACTGCATCCCGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGCTTAGGGCCCA GTCAGTAGTGCGGTGGGGGACCATGCGCGAACATTGTGGTGTTGCACTTATGTGCGACCATACCAAGCTG AAAATACTGCATCCCGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGCTTAGGGCCCAGTCAGTAGTGCGGTGGGGGAC CATGCGCGAACATTGTGGTGTTGCACTTATGTGCGACCATACCAAGCTGAAAATACTGCATCCCGTCTGA TCTGCACAGTCAAGCAGCTTAGGGCCCAGTCAGTAGTGCGGTGGGGGACCATGCGCGAACATTGTGGTGT TGCACTTATGTGCGACCATACCAAGCTGAAAATACTGCATCCCGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGCTTA GGGCCCAGTCAGTAGTGCGGTGGGGGACCATGCGCGAACATTGTGGTGTTGCACTT

a) Secuencia reversa (segundo a pauta de lectura 3'->5').

0001 TTCACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCA 0030 0031 GGGGGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTC 0060 0061 GACGAACTGACACGTCTAGTCTGCCCTACG 0090 0091 TCATAAAAGTCGAACCATACCAGCGTGTAT 0120 0121 TCACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCAG 0150 0151 GGGGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTCG 0180 0181 ACGAACTGACACGTCTAGTCTGCCCTACGT 0210 0211 CATAAAAGTCGAACCATACCAGCGTGTATT 0240 0241 CACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCAGG 0270 0271 GGGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTCGA 0300 0301 CGAACTGACACGTCTAGTCTGCCCTACGTC 0330 0331 ATAAAAGTCGAACCATACCAGCGTGTATTC 0360 0361 ACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCAGGG 0390 0391 GGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTCGAC 0420 0421 GAACTGACACGTCTAGTCTGCCCTACGTCA 0450 0451 TAAAAGTCGAACCATACCAGCGTGTA 0476

b) Secuencia complementaria.
0001 TACACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGAC 0030 0031 GTAGGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCG 0060 0061 AATCCCGGGTCAGTCATCACGCCACCCCCT 0090 0091 GGTACGCGCTTGTAACACCACAACGTGAAT 0120 0121 ACACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGACG 0150 0151 TAGGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCGA 0180 0181 ATCCCGGGTCAGTCATCACGCCACCCCCTG 0210 0211 GTACGCGCTTGTAACACCACAACGTGAATA 0240 0241 CACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGACGT 0270 0271 AGGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCGAA 0300 0301 TCCCGGGTCAGTCATCACGCCACCCCCTGG 0330 0331 TACGCGCTTGTAACACCACAACGTGAATAC 0360 0361 ACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGACGTA 0390 0391 GGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCGAAT 0420 451 GGGTCAGTCATCACGCCACCCCCTGGT 0450 0451 ACGCGCTTGTAACACCACAACGTGAA 0476 1

c) Trnscrito de ARN.
0001 AUGUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUG 0030 0031 CAUCCCGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGC 0060 0061 UUAGGGCCCAGUCAGUAGUGCGGUGGGGGA 0090 0091 CCAUGCGCGAACAUUGUGGUGUUGCACUUA 0120 0121 UGUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUGC 0150 0151 AUCCCGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGCU 0180 0181 UAGGGCCCAGUCAGUAGUGCGGUGGGGGAC 0210 0211 CAUGCGCGAACAUUGUGGUGUUGCACUUAU 0240 0241 GUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUGCA 0270 0271 UCCCGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGCUU 0300 0301 AGGGCCCAGUCAGUAGUGCGGUGGGGGACC 0330 0331 AUGCGCGAACAUUGUGGUGUUGCACUUAUG 0360 0361 UGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUGCAU 0390 0391 CCCGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGCUUA 0420 0421 GGGCCCAGUCAGUAGUGCGGUGGGGGACCA 0450 0451 UGCGCGAACAUUGUGGUGUUGCACUU 0476

d) Protena codificada (estructura primaria). Cantas solucins posibles hai pra a secuencia problema? Porque?
Hay tres posibles soluciones, se debe a que no sabemos si la secuencia de ASDN que tenemos nosotros empieza desde el primer nucletido, desde el segundo o el tercero, y por ello podemos leer tres fragmentos distintos de protenas Frame RF1 MCDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLHL CATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCTY VRPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVALM CDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLH Frame RF2 CATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCTY VRPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVALM CDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLHLC ATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCT Frame RF3 VRPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVALM CDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLHLC ATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCTYV RPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVAL

e) Estadstica da secuencias
e.1) Porcentaje de nucletidos. A: 112 nucletidos C: 120 nucletidos G: 136 nucletidos T: 108 nucletidos e.2) Porcentaje de dmeros (parejas de bases diferentes) AA: 24 dmeros 5.04% AC: 28 dmeros 5.88% AG: 32 dmeros 6.72% AT: 28 dmeros 5.88% CA: 48 dmeros 10.08% CC: 28 dmeros 5.88% CG: 20 dmeros 4.2% CT: 24 dmeros 5.04% GA: 20 dmeros 4.2% GC: 44 dmeros 9.24% GG: 32 dmeros 6.72% GT: 40 dmeros 8.4% TA: 19 dmeros 3.99% TC: 20 dmeros 4.2% TG: 52 dmeros 10.92% TT: 16 dmeros 3.36% e.3) Porcentaje de tripletes (codones) AAA: 8 tripletes 1.68% AAC: 4 tripletes 0.84% AAG: 8 tripletes 1.68% AAT: 4 tripletes 0.84% ACA: 8 tripletes 1.68% ACC: 12 tripletes 2.52% ACG: 0 tripletes 0% ACT: 8 tripletes 1.68% AGA: 0 tripletes 0% AGC: 12 tripletes 2.52% AGG: 4 tripletes 0.84% AGT: 16 tripletes 3.36% ATA: 8 tripletes 1.68% ATC: 8 tripletes 1.68% ATG: 8 tripletes 1.68% ATT: 4 tripletes 0.84% CAA: 8 tripletes 1.68% CAC: 8 tripletes 1.68% CAG: 16 tripletes 3.36% 3

CAT: CCA: CCC: CCG: CCT: CGA: CGC: CGG: CGT: CTA: CTC: CTG: CTT: GAA: GAC: GAG: GAT: GCA: GCC: GCG: GCT: GGA: GGC: GGG: GGT: GTA: GTC: GTG: GTT: TAA: TAC: TAG: TAT: TCA: TCC: TCG: TCT: TGA: TGC: TGG: TGT: TTA: TTC: TTG: TTT:

16 tripletes 16 tripletes 8 tripletes 4 tripletes 0 tripletes 8 tripletes 4 tripletes 4 tripletes 4 tripletes 0 tripletes 0 tripletes 16 tripletes 8 tripletes 8 tripletes 8 tripletes 0 tripletes 4 tripletes 16 tripletes 4 tripletes 16 tripletes 8 tripletes 4 tripletes 4 tripletes 16 tripletes 8 tripletes 4 tripletes 12 tripletes 20 tripletes 4 tripletes 0 tripletes 8 tripletes 8 tripletes 3 tripletes 8 tripletes 4 tripletes 0 tripletes 8 tripletes 8 tripletes 24 tripletes 8 tripletes 12 tripletes 7 tripletes 0 tripletes 8 tripletes 0 tripletes

3.36% 3.36% 1.68% 0.84% 0% 1.68% 0.84% 0.84% 0.84% 0% 0% 3.36% 1.68% 1.68% 1.68% 0% 0.84% 3.36% 0.84% 3.36% 1.68% 0.84% 0.84% 3.36% 1.68% 0.84% 2.52% 4.2% 0.84% 0% 1.68% 1.68% 0.63% 1.68% 0.84% 0% 1.68% 1.68% 5.04% 1.68% 2.52% 1.47% 0% 1.68% 0% 4

3) Indica o enderezo (ou enderezos) de internet que usaches para resolver o exercizo. - http://www.dnai.org/geneboy/