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PRINCIPIOS DE
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MICHAEL M. COX
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wixiv Indice de materias,
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Indice general
Prologo Vo
1 Fundamentos de bioquimica 1
| ESTRUCTURAY CATALISIS 45
2 Hagia 47
3 Aminodcidos, péptides y proteinas 75
4 Estructura tridimensional de las protefnas 116
‘5 Funcién de las proteinas. 187
8 Emimas 190
7 Glicidos y gucobiologia 238
8 Nucleétidos y dcidos nucleicos 273
9 Tocnologias de ia informacion basadas
fen el DNA. 306
10 Lipidos 343
‘11 Membranas blolégicas y transporte 369
42 Biosefalizacién 424
ENERGETICA Y METABOLISMO 481
Princpios de bioenergética 489
Glucdlisis, gluconeogéness y ruta
de las pentosasfosfato 521
Principios de regulacién metabéli
slucosa y glucdgeno 560
El ciclo del dcido ctico 601
Catabolismo de los Scidos grasos 631
Oxidacién de aminodcidos y produccién
de urea 656
Fosforilacin oxidativayfotofostorilacién 690
Biosintesis de glicidos en plantas
ybacterias 751
2A Biosintesis de lpidos 787
22 Biosintesis de aminodeidos, nuclestidos
_—_-ymoléculas relacionadas 833
| 23. Integraci y regulacién hormonal del
| metabolismo de los mamiferos. 881
| LAS RUTAS DE LA INFORMACION 921
24 Genes y cromosomas 923
_ 25 Metabolismo del DNA 948
26 Metabolismo del RNA 995
27 Metabolismo de as proteinas 1034
28 Regulacién de la expresién génica 1081
Apéndice A Abreviaturas comunes en I
cientifia bioqulmicaA-1
Apéndice 8 Soluciones abreviadas de los
problemas Sat
Glosario GA
Procedencia de las ilustraciones Plt
indice alfabstico 1-1
iteratura
1 Fundamentos de bioquimica 1
41.4 Fundamentos colulares. 3
Las células son las unidades estructurales y funcionales
de todos los organismos vivos 3
Las dimensiones celulares estn limitadas por la capacidiad
de difusién del oxigeno 4
Los seres vivos se clasifican en tres dominios 4
Escherichia coli es ia eélula procariética mejor estudiada 5
Las células eucarioticas poseen diversos orgnilos
memibranosos que pueden aislarse para su estudio 6
El citoplasma se organiza gracias al citoesqueleto
yesaltamente dindmico 9
Las células construyen estructuras supramoleculares 10
Los estudios in vitro podrian no detectar interacciones
importantes entre moléculas 11
41.2 Fundamentos quimicos 12
Tas biomoléculas son compuestos de carbono con una
diversidad de grupos funcionales 13
Las macromoléculas son los principales constituyentes
de las células 16
Recuadro 1-1 Peso molecular, masa molecular y las unidades
‘que deben utilizarse 15
La estructura tridimensional se deseribe en términos
de configuracién y conformacion 16
Recuadro 1-2 Louls Pasteur y la actividad dptica: in vino, veritas 19
Tas interacciones entre las biomoléculas
son esterevespecificas 20
13 Fundamentos fisicos 21
Los organismos vivos existen en un estado estacionario
dindmico y no se encuentran nunca en equilibrio
consuentomo 21
Los organismnos transforman energia y materia 22
Bl flujo de electrones proporciona energia
para los organismos 22
Crear y mantener e] orden requiere trabajo y energia 23
El acoplamiento energético conecta las reacciones
biologicas 23
Recuadro 1-3 Entropia: las ventajas do estar desorganizado 24
Keay AG? miden la tendencia de una reaccién
para transcurrir espontineamente 26
Los enzimas facilitan las secuencias de reacciones
quimicas 26
El metabolismo est regulado para conseguir equilibrio
yeconomia 27
1.4 Fundamentos genéticos 28
La continuidad genética reside en las moléculas de DNA 29
La estructura del DNA hace posible su replicacion,
y reparacion con fidelidad casi perfecta 29
La secuencia lineal del DNA codifica protefnas
‘con estructuras tridimensionales 29
1.5 Fundamentos evolutvos 31
Los cambios en las instrueciones hereditarias hacen posible
laevolucion 31
as primeras biomoléculas aparecieron por evoluci6n
quimiea 32
La evolucisn quimica puede simularse en el laboratorio 32
Los primeros genes y catalizadores podrian haber sido
moléculas de RNA 0 precursores relacionados 32.
La evoluciGn biologica empez6 hace mas de tres mil
quinientos millones de afios 34La primera célula fue probablemente quimioheterétrofa 34
Las células eucaridticas evolucionaron a partir
de las procaridticas a través de diversas fases 35
1a anatomfa molecular revela relaciones evolutivas 86
La gen6mica fincional permite declucir la correspondencia
entre genes y procesos celulares especificos 38
La comparacién de genomas tendré una importancia cada vez
mayor en la biologa y medicina humanas 38
| ESTRUCTURAY CATALISIS 45
2 Elagua 47
2.1 Interacciones débites en los sistemas acuosos 47
Los puentes de hidrégeno confieren al agua sus propiedades
extraordinarias 47
El agua forma puentes de hidrégeno con Jos solutos
olares 49
El agua interacciona electrostaticamente con los solutos,
cargados 50
Laentropia aumenta cuando se disuelve una sustancia,
cristalina 51
Los gases apolares se disuelven mal en el agua 52
Los compuestos apolares fuerzan cambios desfavorables
energéticamente en la estructura del agua 52
Las interacciones de van cler Waals son atracciones
interatémicas débiles 54
Las interacciones débiles son cruciales para la estructura
yfuncién de las macromoléculas 54
Los solutos afectan a las propledades coligativas
de las disoluciones acuosas 56
Recuadro 2-1 Respuesta tdctil en plantas: un fenémeno
osmético 59
2.2 lonizacién del agua, deldos débiles y bases déblles 60
El agua pura esté ligeramente ionizada 60
La ionizacién del agua se expresa mediante una constante
de equilibrio 61
La escala de pH representa las concentraciones de H*
yOu 61
Recuadro 2-2 El producto iénico del agua: dos problemas
itustrativos 62
Las ticidos y bases débiles tienen constantes de disociacién
caracteristicas 63
Las curvas de titulacién proporcionan el pk, de los dcidos
débiles 64
2.3, Tamponamientos contra cambios do pH on ls sistemas
blolégicos 65
Los tampones son mezclas de dcidos débiles y sus bases
conjugadas 66
Una expresién sencilla relaciona pH, pK; y coneentracién
de tampén 66
‘Los dcidos 0 bases débiles tarnponan céhulas y tejidos contra
cambios de pH 67
Recuadro 2-3 Resolucién de problemas con la ecuacién
de Henderson-Hasselbalch 67
Recuadro 2-4 Sangre, pulmones y tampén: el sistema tampén
del bicarbonato 69
2.4 El agua como reactvo 6
2.5 La adecuacin del ambiente acuoso a los organismos
vos 70
Indice de materias xv
3 Aminodcidos, péptidos y proteinas 75
3.1 Aminoéeidos. 75
Los aminodcitos tienen caractersticas estructurales
comunes 76
Los resichios aminodcidos de las proteinas son
estereoisimeros. 77
Los aminofcidos se pueden clasificar segtin su grupo R78
Los aminodcidos no esténdar tienen también importantes
funciones 80
Los aminofcidos pueden actuar como Scidos y bases. 81
Recuadro 3-1 Absorcién de Ia luz por las moléculas:
ley de LambortBeer 82
Los aminodeidos tienen curvas de titulacion caracteristicas 82
La curva de titulaci6n predice la carga eléctrica de los
aminodcidos 84
[Los aminoseidos difieren en sus propiedades éecido-base 84
3.2 Péptides y proteinas 85
Los péptidos son cadenas de aminodcidos 85
Los péptidos pueden distinguirse por su comportamiento
de ionizacion 86
Existen péptidos y polipéptidos biolégicamente actives
de uma gran variedad de tamafios 86
Los polipéptidos tienen una composicidn de aminodcidos
caracteristica 87
Algunas proteinas contienen grupos quiimicos diferentes
alos aminoécidos $8
Existen varios niveles de estructura de las proteinas 88
3.3 Tabajar con proteinas 99
Las protetnas se pueden separar y purificar 89
Las proteinas pueden separarse y caracterizarse
por electroforesis 92
Es posible cuantificar las protefnas no aisladas 94
3.4 Estructura covalente de las proteinas 96
La funcion de una protefna depende de su secuencia
de aminodeidos 96
Se ha determinado la secuencia de aminofcidos de millones
de proteinas 96
Los polipépticos cortos se secuencian utilizando
Procedimientos autorndticos 97
‘Las proteinas grandes deben secuerciarse a partir
de fragmentos més pequenios 99
Las secuencias de aminodcidos se pueden deducir también
mediante otros métodos 100
Recuadro 3-2 Investigacion de tas proteinas mediante
Inespectrometria de masas 102
Pueden sintetizarse quimicamente péptidos y protemas
‘pequefias 104
Ta secuencia de aminodcidos proporciona informacién
Dioquimica importante 106
3.5 Secuencias de proteinas y evolucién 106
Las secuencias de proteina permiten deducir la historia
dela vidaen la Tierra 107
4 Estructura tridimensional de las
proteinas 116
4.1 Vision goneral sobre ln estructura protelea_116
La conformacién de una proteina esta estabilizada
prineipalmente por interacciones débiles 117
Blenlace peptidico es plano rigido 118xvi Indice de materias
42 Estructura secundaria de las protoinas 120
La hélice a es una estructura secundaria habitual
en proteinas 120
La secuencia dle aminodcidos afecta a la estabilidad
dela hélice a 121
Recuadro 4-1 Cémo distingulr dextrégiro de lovigiro 122
La.conformacién B organiza las cadenas polipeptidicas
en forma de hoja 123
Los giros son frecuentes en las proteinas 123
Las estructuras secundarias comunes tienen angulos
de enlace y un contenido de aminodcidos
caracteristico 124
4.3 structures tereiaia y euatemaria de las proteinas 125
Tas proteinas fibrosas estan adaptadas a una funcién
estructural 126
Recuadro 4-2 La ondulacién permanente es un elemplo de
Ingenieria bioquimica 127
En las protesnas globulares la diversidad estructural refleja
la diversiad funcional 129
Recuadto 4-3 Razones para que los marineres, exploradores y
estudiantes universitarios consuman frutay verduras fescas 130,
La mioglobina proporeioné las primeras claves acerca de la
complejidad de las estructuras proteicas globulares 132
as proteinas globulares tienen estructuras terciarias
diversas 134
Recuadro 4-4 Métodos para determina la estructura tridimensional
dena proteina 136
Bl andlisis de numerosas protesnas globulares revela patrones
estructurales communes 139
‘Los motivos proteicos constituyen la base de la clasficacién
estructural de las protefnas 141
Las estructuras cuatemnarias de las protefnas comprenden
desde diimeros sencillos hasta grandes complejos 144
Bxisten limites al tamao de las proteinas 146
4.4 Desnaturalizacin y plegamiento de proteinas 147
La pérdida de la estructura conduce a la pérdida
de funcion 147
La secuencla de aminodcidos determina la estructura
terciaria 148,
Los polipéptidos se pliegan répidamente y segtin un proceso
de varias etapas 148
Recuadro 4-5 Muerte por un plegamiento incorrecte: las
enfermedades priénicas 150
‘Algunas proteinas sufren un plegamiento asistido 151
5 Funcién de las protefnas 157
5 Union reversible proteina-ligando: proteinas
de unién a oxigeno 158
EL oxigeno puede estar unido a un grupo prostético
hemo. 158
La mioglobina tiene un tinico sitio de fjacién para
eloxigeno 159
Las interacciones proteina-ligando se pueden deseribir
cuantitativamente 160
Laestructura proteica afecta al modo de union
del igando 162
Bl oxigeno es transportado en la sangre por la
rmioglobina 162,
Las subunidades de la hemoglobina son similares
estructuralmente alamioglobina 163
La hermoglobina experimenta un cambio estructural al unirse
aloxigeno 164
Lahemoglobina une oxigeno de manera cooperativa 164
La unién cooperativa de ligando puede ser deserita
cuantitativamente 167
Bxisten dos modelos que explican los mecanismos de la
‘unin cooperativa 167
Recuadro 5-1 Monéxido de carbono: un asesino silencioso 168
La hemoglobina tarmbién transporta H* y C03 170
La uni6n de oxigeno a la hemoglobina est regulada por el
2,-bisfosfoglicerato 171
La. anemia falciforme es una enfermedad molecular de la
hhemoglobina 172,
5.2 Interacclones complementaras entre protefnas y ligandos:
el sistema inmunitaro y las inmunoglobulinas 174
‘La respuesta inmunitaria es el resultado de Ia aecién
ide uma serie de eélulas y protefnas especializadas 175
Las células distinguen lo propio de lo ajeno exponiendo
péptidas en su superficie 176
Los anticuerpos poseen dos sitios idénticos de unién
antigen 178
Los anticuerpos se unen fuertemente al ant{geno de una
manera especifica 180
Las interacciones antigeno-anticuerpo son la base de diversos
pprocesos anatiticos importantes 180
‘5.3 Interacclones protelcas moduladas por energia quimica:
‘actina, miosina y motores moleculares 182
Las principales proteinas del mtisculo son Ja actina
ylamiosina 182
Otras proteinas adicionales organizan los filamentos delgado
y grueso en estructuras ordenadas 184
Los filamentos gruesos de miosina se deslizan a lo largo
de los flamentos delgados de actina 185
6 Enzimas 190
6.1 Introduccién a los enzimas 191
La mayorfa de enzimas son proteinas 191
Los enzimas se clasifican segtin las reacciones
que catalizan 192,
6.2 06mo funcionan los enzimas? 193
‘Los enaimas alteran las velocidades de reaccién
pero no los equilibrios 193
Las velocidades de reacciGn y lo equilibrios tienen
definiciones termodinamicas precisas 195
Unos pocos principios explican el poder catalitico
y la especificidad de los enzimas 196
Las interacciones débiles entre enzima y sustrato
‘son 6ptimas en el estado de transicion 197
Los enzimas ulilizan la energia de fijacién para proporeionar
especificidad de reaccion y catalisis 198
Grupos cataliticos especificos contribuyen
alacatilisis 200
6.3 La cinética enzimética como método para comprender el
mecanismo 202
La concentracién del sustrato afecta a la velocidad de las,
reacciones catalizadas por enaimas 202,
a relacion entre concentracidn de sustrato y velocidad de
reaccion se puede expresar de manera cuantitativa 204
Para comparat las actividades enzimdticas se wtilizan
los parametros cinéticos 205
Recuadro 6-1 Transformaciones de la ecuacién
de Michaelis-Menten: grfica de dobles reciprocos 206,
‘Muchos enzimas catalizan reacciones en las que intervienen
dos 0 mas sustratos 207
La cinética en el estado pre-estacionario puede aportar
pruebas sobre pasos especificos de la reaccin 208‘Los enzimas estén sujetos a inhibicién reversible
irreversible 209
Recuadro 6-2 Pruebas cinéticas para determinar los mecanismos
de inhibicién 210
El pH afectaa la actividad enzimética 212
6.4 Ejemplos de reacciones enuiméticas 213
En el mecanismo de la quimotripsina se produce la acilacion
¥ desacilacién de un residuo de Ser 213
En la hexoquinasa se produce un encaje inducido durante
laumion del sustrato 218
Elmecanismo de reaccién de la enolasa requiere la presencia
de iones metilicos 219
Recuadro 6-3 Pruebas de la complementariedad entre el enzima
yee estado de transiclén 220
Ellisozima utiliza dos reacciones de desplazamiento
nnucleofflico sueesivas 222
6.5 Enzimas reguladores 225
‘Los enaimas alostéricos experimentan cambios conformacio-
nales en respuesta a la union del modulador 225
En muchas rutas las etapas reguladoras estén catalizadas
por enzimas alostéricas 226
Las propiedades cinéticas de los enzimas alostéricos difleren
del comportamiento de Michaelis-Menten 227
Algunos enzimas reguladores experimentan modificaciones
covalentes reversibles 228
Los grupos fosforilo afectan a la estructura y la actividad
catalitica de las proteinas 228
Las fosforilaciones miltiples permaiten un exquisito control
dela regulacion 230
Algunos enzimas y otras proteinas son regulados mediante
la rotura proteolitica de un precursor ervimitico 231
Algunos enzimas reguladores utilizan varios mecanismos
de regulacién 232
7 Glicidos y glucobiologia 238
7A Monosacéridos y disacéridos 238
Las dos familias de monosacdiidos: aldosas y cetosas 239
‘Los monosacaridos tienen centros asimétricos 239
Los monosacéridos comunes tienen estructura ciclica 240
Los organismos contienen numerosos derivados de las
hhexosas 243
‘Los monosacaridos son agentes reductores 244
Los disacaridos contienen un enlace glucosfdico 245
7.2 Polisacéridos 247
Algunos homopolisacéridos son formas de almacenamiento
de combustible 247
Algunos polisacdridos tienen funcién estructural 248,
Factores estéricos y los puentes de hidrégeno contribuyen
al plegamiento de los homopolisacaridos 250
Las paredes celulares de algas y bacterias contienen
heteropolisacdridos estructurales 252
‘Los glucosaminoglucanos son heteropotisacaridos
de la matrig extracelular 253
7.3 Glucoconjugades: proteoglucanes, glucoproteinas
y dueolipides 255
‘Los proteoglucanos son macromoléculas de la superficie
celular y de la matriz extracelular que contienen
glucosaminoghicanos 256
Las glucoproteinas contienen oligosacaridos unidos
covalentemente 258
Los glucolipidos y los lipopolisacéridos son componentes
delamembrana 260
Indice de materias it
74 Los ghieidos como moléculas portadoras de informacién:
cel cédigo de los azicares 261
‘Las lectinas son proteinas que leen el c6digo de los azticares
€ intervienen en muchos procesos biol6gicos 262
Las interacciones lectina-glicido son muy fuertes y muy.
especifieas 264
7.5 Andlisis de ghicidos 267
8 Nucle6tidos y dcidos nucleicos 273
8.1 Algunos conceptos bésicos 273.
{Los nucleétidos y dcidos nucleicos estan formados por bases
ypentosas caracteristicas 273
Los mucleétidos sucesivos de os éeidas nucleicos estén,
lunidos por enlaces fosfodiéster 276
Las propiedades de las bases de los nuclestidos influyen en la
estructura tridimensional de los dcidos nucleicos. 278
8.2 Estructura de los deldos nucleloos. 279
ELDNA almacena informacién genética 280
Las moléculas de DNA tienen diferente composicién
de bases 281
ELDNA estuna doble hélice 282
ELDNA adopta diferentes formas tridimensionales 283
‘Algunas secuencins de DNA adoptan estructuras no
habituales 285
Los RNA mensajeres codifican las cadenas polipeptidicas 287
Muchos RNA tienen estructuras tridimensionales
complejas 288
8.3 Quimica de os éldos nucleices 291
ELDNA yel RNA de doble hélice pueden desnaturalizarse 291
Los dcidos nucleicos de especies diferentes pueden formar
‘brides. 292
Los nucleétidos y los écidos nucleicos experimentan
transformaciones no enzimaticas 293.
Algunas bases del DNA estén melladas 296
Bs posible determinar la secuencia de largas cadenas
de DNA 296
La sintesis quimica de DNA ha sido automatizada 298
8.4 Otrasfunciones de los nucestidas 300
‘Los nucleétidos transportan energia quimica
cen las células 300
‘Los nuclestidos de adenina forman parte de muchos