Fragmenty DNA pocite restryktaz mog by czone z innym odcinkiem DNA
(wektorem) trawionymi t sam restryktaz. Koce DNA badanego i wektora mog zosta poczone za pomoc ligazy. Wektory dzielimy na: Autonomiczne: replikuj si niezalenie od genomu gospodarza. Integracyjne: wczaj do jego DNA s bardziej stabilne, ale wystpuj w mniejszej liczbie kopii. Nale tu midzy innymi wektory retrowirusowe. Ekspresyjne: maj na celu zapewni efektywn ekspresj wszczepianego genu. Wektory wahadowe (bifunkcjonalne): mog wystpowa w co najmniej dwch rnych organizmach, przy czym mona je przenosi midzy komrkami prokariotycznymi i eukariotycznymi.
Dobr odpowiedniego typu wektora zaley od rodzaju komrki, w jakiej zamierzamy
klonowa dany fragment DNA. Najwaniejszym funkcjonalnym elementem wektora s sekwencje Ori, odpowiedzialne za inicjacj replikacji, ktre musz by odpowiednie dla wybranego organizmu. Istotn cech wektorw jest obecno w nich sekwencji markerowych, kodujcych np. konkretne cechy fenotypowe danego organizmu, ktre dadz si atwo zauway lub geny odpornoci na antybiotyki.
Do najwaniejszych wektorw uywanych w medycynie nale:
Plazmidy bakteryjne: pozachromosomowe czsteczki DNA, wielkoci kilku- kilkuset tysicy PZ, zdolne do samodzielnej replikacji u prokaryota i niektrych eucaryota. Plazmidy s przenoszone w procesie koniugacji midzy komrkami bakteryjnymi Wektory fagowe: s to wirusy infekujce bakterie przez aktywne wstrzyknicie swojego DNA do wntrza komrek. Ich namnaanie jest bardzo szybkie. Najlepiej poznanym jest fag, ktry moe by uywany jako wektor do infekowania E. Coli. DNA faga moe zosta zamienione miejscami z jakim odcinkiem bakteryjnego, wczajc si tym samym do genomu lub wnika do niego na zasadzie insercji. Z kolei fag M13 ma mniejszy plazmid (6tys pz) ale nie powoduje lizy komrki po namnoeniu. Kosmidy: uywane w klonowaniu duych odcinkw DNA (do 45 kpz). Skadaj si z sekwencji plazmidu z miejscem Ori, poczonych z sekwencj cos faga , koniecznej do upakowania DNA w kapsydy. Wektory drodowe: Sztuczne chromosomy drodowe: posiadaj sekwencje centromeru, telomeru i inicjacji replikacji, ktre czy si z plazmidami. S doskonae do badania ekspresji genw. Sztuczne chromosomy bakteryjne: s bardziej stabilne od drodowych i atwiej si nimi transformuje E.Coli, a take atwiej namnaa i izoluje. Wektory eukariotyczne ssakw: jednymi z pierwszych byy te oparte o wirusa SV40. zawieraj one fragmenty DNA wirusa z sekwencj ori, promotory genw kodujce wczesne biaka wirusa oraz sekwencje odpowiedzialne za inicjacj transkrypcji. Sztuczne chromosomy ssakw Noniki syntetyczne: praktyczne zastosowanie maj liposomy, czyli czsteczki lipidw o charakterze kationowym, zawierajce egzogenny DNA wprowadzony za pomoc plazmidu. Liposomy mog wprowadza odcinki DNA o rozmiarach do 150 kpz. Charakteryzuj si one nisk immunogennoci i du pojemnoci. Zmodyfikowane przez skompleksowanie z gangliozydem GM1 czyni je niewidzialnymi dla makrofagw. Innymi wektorami chemicznymi s polipeptydy kationowe.
Terapia genowa
Polega na wprowadzeniu prawidowego genu do komrki w ktrej wystpuje on w
formie uszkodzonej lub nie wystpuje w ogle. Terapia musi by poprzedzona testami In vivo oraz In vitro. Konieczne jest uycie odpowiednich wektorw. Wskanikiem sukcesu terapii jest pojawienie si ekspresji danego genu. Pacjenci poddani terapii genowej musze pozostawa pod cis kontrol w celu oceny efektw leczenia i wykrycia ewentualnych skutkw ubocznych. Obecnie jedyn dopuszczaln metod jest wprowadzanie wektorw do komrek somatycznych. Modyfikacja komrek linii pciowych jest ze wzgldw etycznych zabroniona.
Strategie terapii genowej:
Ex vivo: polega na pobraniu od chorego komrek do celowych i wprowadzeniu genu In vitro. Kolejnym etapem jest ponowne wprowadzenie komrek do organizmu. In vivo: polega na wprowadzeniu terapeutycznego genu bezporednio do tkanek.
Rodzaje terapii genowej
Dodawanie genw: gen uszkodzony pozstaje w swoim locus, a gen terapeutyczny jest wprowadzony w inne miejsce chromosomu. Zamiana genw: polega na wymianie genu zmutowanego na gen prawidowy w procesie somatycznej rekombinacji homologicznej. doskonalenie genomu: dodanie genu, ktry nie zastpuje adnego innego, ale koduje substancje, ktre fizjologicznie nie s produkowane przez komrk. Mog to by geny kodujce rybozymy, biaka wirusowe i interleukin 2. produkty genu wprowadzonego wpywaj na ekspresj innych.
Prby terapii genowej u ludzi
Do roku 2010 odbyy si 1644 prby kliniczne terapii genowe u ludzi, z czego ponad 900 przeprowadzono po roku 2000. najwicej z nich dotyczyo chorb nowotworowych, na drugim miejscu znalazy si choroby sercowo-naczyniowe.
Terapia genowa w niektrych chorobach
Mukowiscydoza: prby dotycz gwnie skorygowania defektu genetycznego komrek oskrzeli, gdy objawy pucne s w chorobie najgroniejsze. Najczstszymi wektorami s w tym przypadku adenowirusy, ostatnio te lentiwirusy. Transgen (CFTR) w odpowiednim wektorze wprowadza si drog wziewn. Gwnym problemem jest wprowadzenie wektora do komrek, gdy spotyka si on z odpowiedzi odpornociow. Z powodu wymiany komrek nabonka terapia musi by regularnie powtarzana. Do przywrcenia prawidowego stanu organizmu wystarczy 10% ekspresja CFTR. Choroby ukadu naczyniowego: prby koncentruj si na chorobie niedokrwiennej serca i koczyn. Z duym sukcesem prowadzi si prby wprowadzania genw kodujcych substancj wzmagajce angiogenez, np. VEGF czy jeszcze skuteczniejszy FGF-4. prace dotycz te ograniczenia restenozy (ponownego zwenia) po angioplastyce. Stosuje si tu geny kodujce rybozymy ograniczajce proliferacj mini gadkich, ktra w nadmiarze powoduje zwenie naczy. Wyniki bada w kierunku walki z miadyc s mniej obiecujce, co wynika z trudnoci w otrzymaniu odpowiedniej ekspresji czynnika angiogennego i jego utrzymania a do zajcia procesu. Innym podejciem jest wszczepianie naczy ylnych modyfikowanych ex vivo chorym na chorob zarostowo-zakrzepow. Hipocholesterolemia rodzinna: terapia przebiega ex vivo na pobranym fragmencie wtroby przy namnoeniu hepatocytw In vitro i wprowadzeniu do nich za pomoc retrowirusw genu kodujcego receptor dla LDL, a nastpnie ponownym wszczepieniu tych komrek do wtroby chorego poprzez y krezkow. Zabieg taki powtarza si trzykrotnie, ale skuteczno nie jest wysoka. Choroba Parkinsona: we wszystkich prbach wykorzystuje si wektory AAV. Pierwsze prby polegay na wprowadzeniu do jdra podwzgrza genu dekarboksylazy kwasu glutaminowego, ktrego produkt poredniczy w syntezie GABA. Inn metod jest wprowadzenie genu dla neuturyny, ktry ktra pobudza rnicowanie neuronw dopaminergicznych. Trzeci opcj jest terapia ciaa prkowanego genem dekarboksylazy L-aminokwasw aromatycznych. AIDS: prac postpuj w trzech kierunkach. Jednym z nich jest wprowadzenie do komrek hematopoetycznych transgenu powodujcego niewraliwo na infekcj wirusow HIV. Inn metod jest dostarczanie transgenu do limfocytw t CD 4i 8. trzeci metod ma by immunizacja antygenami wirusa HIV, ktra wywoa odporno na wirusa. Choroba Huntingtona: prace polegaj na uzyskaniu nadekspresji rzskowego czynnika neurotroficznego CNTF, redukujcego obumieranie prkowia. Do komory bocznej mzgu wstrzykuje si pprzepuszczaln kapsuk ze zmodyfikowanymi komrkami nerki chomika. Kapsuk wymienia si co 6 miesicy. W pierwszych badaniach klinicznych tej metody otrzymano zadowalajce efekty. W badaniach prowadzonych u naczelnych osignito cakowit korekcj fenotypu. Choroba Alzheimera: pierwsza prba, przeprowadzona w 2001 roku polegaa na wprowadzeniu do przodomzgowia komrek wykazujcych ekspresj czynnika wzrostu nerww NGF stymulujcego neurony cholinergiczne. Komrki implantowane to autologiczne fibroblasty.
Terapia genowa nowotworw
Immunoterapia: polega na uczynieniu Komorek nowotworowych widocznymi dla ukadu immunologicznego, przez zmodyfikowanie ich genami kodujcymi cytokin takie jak TNF. Prowadzi to do zwikszenia prezentacji antygenw przez komrki nowotworowe i w efekcie rekrutacji specyficznych limfocytw T i B. Wirusy onkolityczne: wektory tego typu wybirczo niszcz komrki nowotworowe, pozostajc nieszkodliwe dla prawidowych. Wirusy namnaaj si w komrkach nowotworowych i po jej rozpadzie atakuj kolejne. W pierwszej prbie wykorzystano zmodyfikowane wirusy, namnaajce si w komrkach pozbawionych biaka p53. innym wykorzystywanym wirusem jest zmodyfikowany Hermes simplex stosowany w raku piersi i trzustki. Kompensacja mutacji: polega na inhibicji funkcji onkogenu i przywrceniu funkcji genu supresorowego dziki: o Zatrzymaniu transkrypcji onkogenu przy pomocy antysensownych oligonukleotydw tworzcych struktur podwjnej helisy o Zatrzymania translacji mRNA okrelonego onkogenu przez zastosowanie jak wyej antysensownych sekwencji o Zablokowanie funkcji onkoprotein o Zastpienie zmutowanych form genw p53, czy RB1 niezmutowanymi. Terapia stosujca geny samobjcze: jest to przykad molekularnej chemioterapii. Prby kliniczne obejmuj: o Transfer genu kinazy tymidyniowej zwikszajcej podatno na aciklovir o Transfer genu deaminazy cytozynowej, powodujcy podatno na 5- fluorocytozyn o Transfer genu cytochromu P450 2B wzmacniajcy podatno na cyklofosfamid. Ogem geny samobjcze koduj produkty, ktre przeksztacaj podany do organizmu substancj (prolek) w trujce metabolity indukujce apoptoz. Produkty toksyczne mog te by niebezpieczne dla zdrowych komrek ssiednich. Dziki tej metodzie dokonano przeomu w walce z glejakiem mzgu.