1. Po prekidanju dormancije sjemena, postoji citav niz dogadjaja..

2. Epigenetičke adaptacije na svjetlost kroz morfogenezu ?

3. Razvoj aksilarnih meristema (2 teorije)
4. Gravitropizam ( nesto oko kretanja Ca)
Migracija kalcija ka gornjoj površini ćelija izdanka prethodi zakrivljenom rastu. Kalmodulin, Ca
vezujući protein, posreduje migraciju kalcijuma. Elongacija se dešava u zidovima koji imaju
najniže koncentracije kalcijuma. kretanje Ca2+ može pokrenuti signalnu transdukciju,
aktivirati auksin koji će promovisati diferencijalnu ekspanziju ćelija i kao krajnji produkt –
gravitropni odgovor
5. Tigmotropizam (opisati sta se desi kad dodirnes biljku)
Ćelije vitice koje se nalaze suprotno od strane na kojoj je ostvaren dodir (kontakt) sa čvrstom
podlogom počinju da se naglo izdužuju u odnosu na one koje su na mjestu kontakta.
6. Utjecaj tigmomorfogeneze na biljku
Biljke imaju kompaktan i robusniji rast kada su izložene mehaničkim stimulusima kao što su
vjetar, jake kiše i povremeni dodir od strane prolaznika
7. Variranje svjetlosti u 4 parametra
• kvaliteti (talasna dužina), • kvantitetu (fluks ili protok fotona po m2), • usmjerenju
(neusmjerena ili difuzna svjetlost) te • trajanju (fotoperiod ili dužina dana).
8. Građa fitohroma
Solubilni hromoprotein sastavljen od dvije komponente: proteinske (apoprotein)
komponente i hromofore. Apoprotein sadrži dvije strukturne domene: N kraj domena koja
nosi hromoforu i manju C-kraj domenu. N kraj domena uključujući hromoforu vrši
fotopercepciju, i R/FR reverzibilnost a C kraj domena dimerizaciju monomera i transdukciju
signal
9. Šta je fitohromski potpis (zaokruži)
R/FR reverzibilnost zabilježena je kod mnogih odgovora koji su posredovani fitohromom, što
je označeno kao „fitohromski potpis“
10. Odnos Pr i Pfr forme ?
(zaokruži 0,8)
11. odgovor na crvenu svjetlost(zaokruzi)
PhyB
12. Odgovori posredovani plavom svjetloscu
• fototropsko iskrivljenje kao odgovor na neusmjereno svjetlo, • de-etiolacijski odgovor
etioliranih klijanaca, • indukcija flavonoid sintetskih gena, • promocija otvaranja stoma
13. Tipovi fitohromskog odgovora
• HIR – High iradiance response – odgovor na visoku insolaciju, neophodno mu je dugoročno
izlaganje, nema suprotnog R/FR dejstva i nije FR reverzibilno
• LFR – low fluency response – odgovor na nizak protok protona, postoji suprotno R/FR
dejstvo i FR reverzibilnost
• VLFR – Very low fluency response - odgovor na veoma nizak protok protona, postoji
suprotno R/FR dejstvo i FR reverzibilnos
14. Fotoliaze ( zaokruzi)
15. Kontrolne tacke celijskog ciklusa, opisati
16. Nesto oko CYCB1 , ali ne znam tacno. Zaokruziti treba
B tip ciklina, isključivo kod monokotila
17. Objasniti proces polinacije
Polen iz prašnika dospijeva na njušku tučka (polinatori) Ukoliko je polen prepoznat
(kompatibilnost) dolazi do njegove rehidratacije Ekstenzija citoplazme polenovog zrna
(polenova cjevčica) prolazi kroz vrat tučka Kroz cjevčicu prolaze dvije spermalne stanic
18. Dva gena specificna za stigmu tucka
SLG – kodira ekstracelularni glikoprotein i SRK – kondira receptor kinazu lociranu na
plazmamembrani
19. Dugolancani lipidi ukljuceni u hidrataciju (zaokruzi)
20. Tkivo vrata tučka kako se zove i dvije vrste
Tkivo vrata tučka = transmisijsko tkivo (TT)
Dva tipa transmisijskog tkiva: Čvrsto Šuplje
21. Polenova cjevcica diferencirana na zone
Vršna domena (A) bogata golđi sekretornim vezikulama - okrenuta kupa
Subapikalna domena (B) bogata metabolički aktivnim organelama (mitohondrije,
diktiosomi, ER)
Nuklearna domena (C) sarži gotovo sve velike organele i mušku germinativnu ćeliju
Vakuolarna domena (D) sadrži veliku vakuolu koja se uvećava rastom cjevčic
22. Tipovi endosperm (opisi jedan od tipovA)
Nuklearni, Celularni i Helobijalni.
NUKLEARNI ENDOSPERM
Obično kod polipetalnih vrsta
Prve ćelijske diobe nisu popraćene formiranjem ćelijskog zida
Nukleusi koji se tad produkuju ostaju slobodni u citoplazmi embrionalne vreće
Kokos – vodenasti endosperm – pun slobodnih nukleusa

23. Locule number (zaokruzi)

kontroliše broj primordija karpela – mutacija uzrokuje pojavu više od dvije lokule – pojava
pljosnatog plod

24. SUN/ovate geni nesto da se zaokruzi

OVATE – reguliše izduživanje ploda – anizotropni rast, SUN – kontroliše elongaciju ploda u
većoj mjeri nego OVATE geni

25. Valve,replum, margine valve – zaokruzit

Valve (zidovi mahuna) se sastoji iz 6 slojeva ćelija:
Spoljašnji epidermis (egzokarp) – izdužene ćelije + stome
Tri sloja fotosintetskog tkiva (mezokarp)
Dva sloja ćelija endokarpa: Ena (unutrašnji epidermis) i Enb.
Replum je središnji greben između dvije valve - osnova za pričvršćivanje sjemena
Margine valvi su suženja između valvi i repluma a rezultat su ekspanzije tokom sazrijevanja
ploda i građene su od nekoliko redova uskih ćelija
Sa spoljašnje strane uočavaju se tri elementa: Valve Replum Margine valve

26. Geni identiteta cvjetnog meristema : LEAFY(LFY) i APETALA1( AP1) kod Arabidopsis-a,
Terminal flower1 (TFL1) specifiše identitet meristema cvati
27. Uloga E gena
Otkriće E gena (SEP geni) –proteini za specifikaciju petala, prašnika i karpela (SEP1, SEP2 i
SEP3), a SEP4 neophodan za identitet sepala i doprinosi razvoju i ostala tri tipa organ
28. Identitet ovula Arabidopsisa odredjen genima ???
• AG • SEEDSTICK (STK) • SHATERPROOF 1 i 2 (SHP1 i SHP2)
29. Biohemijski kvarterni model
30. Superman tip zaduzen za boju ?
NE
31. Ttransport antocijanina u formi glutation konjugata – zaokruzi
32. Tri mehanizma aktivacije fosforilacije
33. Zaokruzit extracelularne receptore
34. Gradja G protein udruzenih receptora
Heterotrimerni G-proteini su kompleksi tri zasebna proteina: Gα, Gβ i Gγ
35. Sekundarni glasnici – zaokruziti
Dva tipa sekundarnih glasnika: •Joni i jonski kanali i •Efektorski enzim
36. Solubilni receptor/endoplazmatski – napisati oznaku
37. Negativni regulatori giberelinskog odgovora zaokruziti
SHORT INTERNODES (SHI)
DELLA protein
38. Varijacija velicine genoma – zaookruziti
Varijacija u veličini genoma rezultat varijacije repetitivnih sekvenci uključujući: repetitivne
DNK sekvence, satelitnu DNK, jednostavna ponavljanja, transpozone (mobilne DNK sekvence)
i retroelemente

39. Koji su ponavljajuci elementi??

40. Opisati ulazak iz citoplazme u hloroplast
Tranzitni peptid asocira sa porom, kompletan protein ulazi u hloroplast te se uklanja signalni
tranzitni peptid i protein koji je ušao u stromu hloroplasta ima tri moguće sudbine.1. proteini
koji ostanu u stromi se motaju u finalnu konfiguraciju a često uključuju uvezivanje sa
hloroplast kodirajućim proteinima • 2. proteine koji će biti dio tilakoidne membrane
prepoznaju signal-prepoznavajuće partikule (SRP) na osnovu hidrofobne sekvence od 18
aminokiselina na proteinu te takav protein se veže za SRP receptor na membrani gdje će
dalje biti integrisan3. proteini koji će biti dio tilakoidnog lumena sadrže dodatni tranzicijski
peptid koji se otkriva otklanjanjem prvog peptida
Taj tilakoidni tranzitni peptid prepoznaje proteinski kompleks koji ga prebacuje kroz
membranu u lumen tilakoida. U lumenu tilakoida uklanja se tranzicijski peptid

41. Proteini kodirani nuklearnimm genomom

Proteini kodirani nuklearnim genomom: RNK polimeraza, Rubisco (ribulozo bisfosfat
karboksilaza-oksigenaza, F0F1 ATP sintetaza (sadrži podjedinice kodirane i plastidnim i
nuklearnim genomom
42. Proteini kodirani mitohondrijalnim genomom ?
43. Epigeneticka regulacija genske ekspresije/ 3 mehanizma
1. DNK metilaciju 2. Histonsku modifikaciju (PTMs) 3. RNK bazirane mehanizme
44. Met metilira – zaokruzi
CITOZINE
45. Modifikacija histona
Histonske posttranslacijske modifikacije?
• Acetilizacija • Metilacija • Ubikvitinizacija • Fosforilacija • Sumojilacija (SUMO - small
ubiquitin-like modifiers)
46. Paradoks C vrijednosti?
„Višak“ DNK u odnosu na potrebnu dužinu kodirajućeg dijela DNK
47. Između koja 2 C atoma dezoksiriboze se uspostavljaju fosfodiesterske veze?
3' C – 5'C
48. Retroelementi?
Retroelementi su najvjerovatnije rezultat reverzne transkripcije RNK, uključujući mRNK i
retroviruse, a često ove sekvence su mobilne u genomu i nazivaju se retrotranspozoni
49. Nukleosom?
S obzirom na ogromne veličine genoma neophodno je bilo „upakovati“ taj materijal u jedro
ćelije namotavanjem na strukturu nalik bačvi –nukleosom • Nukleosom (otkriven 1974.) se
sastoji od kompleksa malih baznih proteina – histona, odnosno po dvije molekule svakog od
histona: H2A, H2B, H3 i H4. • 150 bp namotano na svaki nukleosom, i 50 do 70 bp „linker“
DNK između dva nukleosoma (repeticijski niz od 200 do 220 bp) • Sa spoljašnje strane nalazi
se još jedna histonska molekula H1 koji drži nukleosome blizu jedan drugog.
50. Remodeliranje?
promjene u interakciji između histonskih proteina, struktura postaje labavija
51. Repozicioniranje?
klizanje ili iskakanje te kratki dijelovi DNK nisu povezani sa histonima
52. Ključni dio promotora?
Ključni dio promotora jese TATA box koje prepoznaje TATA-vezujući protein koji je dio
generalnog transkripcijskog faktora
53. Zaokruži-koliko se lanaca prepisuje kod hloroplasta
Oba lanca DNK u hloroplastima se prepisuju
54. Geni su organizovani u strukturu i ko ih čita?
Više gena se organizuje u strukture nazvane policistroni, hloroplasni ribosomi ne mogu čitati
policistronsku RNK te se geni moraju razdvojiti u pojedinačne da bi se izvršila sinteza proteina
55. Proteini ćelijskog zida kod biljaka?
Postoje tri klase proteina ćelijskog zida kod dikotiledonih biljaka: • hidroksiprolin-bogati
glikoproteini (HRGPs), • glicin-bogati proteini (GRPs) i • prolin ili hidroksiprolin-bogati
proteini (PRPs).
56. Proteini koji se nalaze u sjemenu?
glicin, legumin, vicilin, heliantinin, bfazeolin.
57. Kako se aktivira CDK ciklin kompleks?
Fosforilacija treoninskog ostatka na CDK (CAK) = potpuna aktivacija, Fosforilacija treoninskog
ostatka (Cdc25) = Aktivacija
58. CDK(specifične za biljke)?
CDKB1 (PPTALRE) i CDKB2 (PPTTLRE)
59. Stop kodoni?
UAA,UAG,UGA
60. Kako DNK polimeraza čita pravac?
3'-5'
61. Mitotički ciklini-zaokružiti
mitotički ciklini (Tip Ai Tip B), A tip ciklina - 3 podklase CYCA1, CYCA2 i CYCA3
B tip ciklina - 3 podklase CYCB1, CYCB2 i CYCB3

62. APC kompleks građa?

APC kompleks organizovan u 3 cjeline: Platforma (APC1, APC4, APC5 and APC15), Katalitička
srž (APC2, APC11 and APC10) i tetratrikopeptidni ponavljajući (TPR) režanj (APC8, APC6, APC3
and APC7) subkompleks 1

63. Ponovni ulazak u ćeliju- D tipom zaokružiti!

64. Inhibicija fosforilacija tirozinskog nečega?

Fosforilacija tirozinskog ostatka (Wee) = Inhibicija

65. Koji se enzim veže za ubikvitin?

Ubikvitin ligaza E3

66. Aktivni hromatin-modifikacije?

Aktivni hromatin kod biljaka pokazuje pojačanje H3 i H4 acetilizacije, trimetilaciju lizina 4 iz
histona H3 (H3K4me3) i DNK hipometilaciju

67. Utišani hromatin?

Transkripcijski utišani hromatin sadrži hipoacetilirani H3 i H4, metilirani lizin 27 (H3K27) i lizin
9 histona H3 (H3K9), i hipermetiliranu DNK
68. Sistemska stečena rezistencija, imunitet?
Sistemska stečena rezistencija odgovara pojačanom stanju odbrambenog odgovora nakon
percepcije patogena i asocirana je sa akumulacijom salicilne kiseline i patogen-ovisnih
proteina u otpornim tkivima. Ova rezistencija je obično stimulisana nakon korisnih patogena,
međutim priprema biljku za mogući napad patogen.

69. Drugi način kontrole ekspresije?

• Alternativna mjesta transkripcije – dvije forme glutation-Stransferaze • Alternativna mjesta
introna – primjer su geni kod Arabidopsis-a koji kodiraju serin • Alternativna poli-adenilna
mjesta koja rezultuju različitim neprepisanim dijelovima mRNK • Alternativna mjesta
translacije: npr. mitohondrijalna i hloroplasna verzija RNK polimeraze se može proizvesti iz
iste mRNK

70. Kontrola iRNK, alternativni put i način ekspresije gena?

Kontrola iRNK precesiranja – reguliše produkciju mRNK iz prekursorskih RNKs. Alternativna
obrada iRNK uključuje: alternativnu poliadenilizaciju i alternativno isjecanje (splajsing) što za
rezultat ima produkciju proteina kodiranih istim genom ali potpuno funkcionalno i strukturno
različitih (proteinske izoforme)
71. Ulazak proteina iz citosola u mitohondrije?
 Ulazak proteina kodiranih nuklearni genomom sličan je procesu ulaska proteina u hloroplast
• Nakon ulaska u matriks uklanja se pre-sekvenca (odgovorna za ulazak) te se protein mota u
finalni oblik. Proteini koji ulaze u sastav unutrašnje i vanjske membrane sadrže dodatnu pre-
sekvencu koja je bogata hidrofobnim aminokiselinama. • Ova druga sekvenca se uklanja u
intermembranskom prostoru kada se protein usidri u membranu.

72. Proteini kodirani hloroplastnim genomom u mitohondrijama?

Dva ribosomalna proteina mitohondrija su kodirana hloroplasnim genomom (geni za tri
ribozomalne RNK i geni za tRNK)

73. Objasni G proteini udruženi receptori?

Transmembranski; 7 hidrofobnih regija - 7 domena (alfa-helix).Domene povezane hidrofilnim
petljama. Hidrofobne domene stabilozovane ekstracelularnim intramolekularnim disulfidnim
vezama - ligand vezujući džep. Heterotrimeni G proteini su kompleksi 3 zasebna proteina: G-
alfa, G-beta, G- gama. G-alfa podjedinica se ponaša kao GTPaza, veže i hidrolizira GTP, G-
beta, G-gama podjedinice su članovi familije dimernih proteina i angažovani su u funkciji G-
alfa podjedinice. U neaktivnom stanju G-alfa podjedinica se veže za GDP i za G-beta-gama
dimer. Ovakav trimer se veže za membranu preko kratkih lipidnih lanaca.

74. RLKs kod biljaka?

S-domen RLK, leucin bogati-ponavljajući (LRR), CR4-klasa (TNFR), RLK- nalik faktor
epidermalnog rasta (EGF-LIKE), PR klasa, lektin receptor kinaza.

75. Familije Ca kanala?

1.Voltani kanali- otvaranje regulišu promjenom membranskog potencijala
2.Receptor i sekundarni mesendžer regulisani Ca kanali
3.Rastegljivi kanali koji detektuju tenziju plazmamembrane i otvaraju se pri promjeni tenzije

76. Receptor unutar? Endoplazmatski etilen (ETR)

77. Sekundarni glasnici zaokružiti?

Joni i jonski kanali i efektorski enzimi ili Ciklični AMP, Kalcijum , IP3

78. Iz čega nastaju auksini?

Produkuju se u izdanku iz triptofana i kreće se niz stabljiku gdje ima efekat na ciljna tkiva.

79. Iz čega nastaju brazinosteroidi?

80. Fosfo releji?

Bitan kod molekularnog mehanizma transdukcije hormonskih signala.Dvokomponentni
sistemi (fosfo - releji) npr: etilen i citokinin.

81. Negativni regulatori giberilenskog odgovora?

Negativni regulatori giberelinskog : signaliziranja : SHORT INTERNODES (SHI), DELLA
PROTEINI
 82. Giberelini kako utiču na auksin?
Ga igra značajnu ulogu u promociji biosintetskog puta auksina, te u prisustvu giberelina nivo
auksina raste.

83. Receptori i koje hormone ETY?

Etilenski receptori održavaju CTR1 u aktivnom stanju što služi za represiju etilenskog odg.
Vezivanje etilena inaktivira receptor i time inaktivira CTR1.

84. Familija gena auksini?

Familija gena čija je ekspresija regulisana auksinom: SAUR , Aux/IAA, GH3 familija - sve 3
familije sadrže aktivne elemente koje odg na auksin AuxRE.

85. Florigen uticaj?

Sinteza u listu - transport kroz floem ka vrhu izdanka - aktivacija florigen receptora u citoplazmi -
indukcija gena za formiranje cvjetnih pupova.

86.Ciklini max ekspresiju u S1 fazi ?

87. Strigolaktoni?

Imaju 3 biološke funkcije: indukcija klijanja sjemena kod parazitskih biljaka korijena, indukcija
hifalno grananje mikrozalnih gljiva te inhibiraju grananje izdanka kod biljaka. Vode porijeklo od
karotenoida, nastaju sekvencijskim oksaditivnim odcjepljivanjem i sukcesivnom oksidacijom.

88. Voltažni kanali čime su regulisani?

Njihovo otvaranje je regulisano promijenom membranskog potencijala.

90.Auksini se vežu sa AuxRe?

91. Solubilni receptori?

PYRA1 (Abscisinka kiselina)

92.Kako florigen reguliše prelazak iz veg. u reproduktivnu fazu?

93.Putevi signalne transdukcije kod giberelina?

Ca neovisni put - cGMP i nekoliko drugih komponenti - aktivacija F-box proteina SCF ubikvitin
ligaznog kompleksa. Aktivirani F-box protein - DELLA domenu - GAMYB gena. Represor se
degradira preko SCF ubikvitin ligaznog kompleksa. Degradacija represora aktivira ekspresiju
GAMYB gena i drugih gena GA odgovora. Novositetisani GAMYB protein ulazi u jedro i veže se
za promotor alfa amilaznog gena i dr gene koji kodiraju hidrolitičke enzime.

94. Šta je repozicioniranje nukleosoma?

Klizanje ili iskakanje te kratki dijelovi DNK nisu povezani sa histonima.

95.U šta se organizuje više gena u hloroplastima i ko čita takve strukture?

Više gena se organizuje u strukture nazvane policistroni. Hloroplasni ribosomi ne mogu čitati
policistronsku RNK te se geni moraju razdvojiti u pojedinačne da bi se izvršila sinteza.

96. Šta su tic i toc proteini?

Proteini koji grade eore poznati su kao tic i toc proteini.

97. 3 mehanizma epigenetičke regulacije genske ekspresije?

1. DNKmetilacija 2.Histonska modifikacija (PTMs) 3. RNK bazirani mehanizmi

98.Histonske postranslacijske modifikacije?

Acetilizacija, metilacija, ubikvitinizacija, fosforilacija, sumojilacija

99.Transkripcijski utišani hromatin sadrži?

Hipoacetilirani H3 I H4, metilirani lizin 27 i lizin 9, histona H3 i hipermetiliranu DNK.

100 .Objasni epigenetičku memoriju biljaka?

Vernalizacija -memorija zime (FLC GEN) , aklimacija abiotskog stresa - memorija abiotskog
stresa ( transpozoni,sredinski stres i epigenetička varijacija).

101 . Poveži receptore sa hormonima?

PYRA --- ABA ,
ETR --- Etilen,
AHK3 --- Citokini

102. Zaokruži intracelularne receptore?

Kalmodulin

103. Zaokruži Kinaze specifične samo za biljke?

CDKB (CDKB1 i CDKB2)

104. Poveži:

Auksin nastaje iz triptofana --- u triptofanskom putu

Auksin aktivni element zaokruži--- AuxRe
Do inhibicije dolazi fosforilacijom --- tirozinskog ostatka
U prisustvu GA nivo --- raste

105.Enzimi koji pomažu vezivanju ubikvitina?

E1 - ub-aktivirajući enzim , E2 - ub-konjugirajući , E3- ubikvitin ligaza