Termodinámica de la formación de dúplex ADN

Rivera Abel de Jesús 216140135, Riascos Miguel Ángel 217140205

Departamento De Química Facultad de Ciencias Exacta y Naturales
Universidad de Nariño

ABSTRACT

In the thermodynamic laboratory practice of the DNA formation of several DNA samples with
different concentration and later, the absorption of the samples at different temperatures is
measured in order to make a graph of temperature versus absorption, to then graph the first
derivatives of the previous graph to obtain 𝑇𝑚 , which is the temperature of DNA formation and
finally graph with the values 𝑇𝑚 and the natural logarithm of the DNA concentration and relate to
equation 1 to calculate ΔH and ΔS and ΔG.

Resultados y cálculos

Tabla 1

TEMPERATURA PRUEBAS
(℃) (VALORES DE ABSORBANCIA)
1 2 3 4 5 6
20 0.428 0.346 0.263 0.304 0.366 0.165
28 0.488 0.391 0.308 0.337 0.232 0.222
37 0.535 0.428 0.355 0.372 0.242 0.264
41 0.544 0.465 0.395 0.379 0.256 0.328
45 0.577 0.490 0.412 0.390 0.265 0.368
55 0.609 0.521 0.434 0.405 0.277 0.357
59 0.639 0.557 0.456 0.414 0.279 0.352
65 0.655 0.589 0.500 0.409 0.271 0.355
67 0.676 0.587 0.531 0.413 0.282 0.418

De la anterior tabla se obtiene la grafica

 1
700 2
650 3
4
600
5
550 6
500
ABSORBANCIA

450

400

350

300

250

200

150

20 30 40 50 60 70
0
TEMPERATURA ( C)

Cada prueba de prueba de ADN tenían las siguientes concentraciones:

PRUEBAS CONCENTRACIONES (𝑔⁄𝑚𝑙)

1 50
2 100
3 150
4 200
5 250
6 250

1 𝑅 (∆𝑆 0 − 𝑅𝐿𝑛4)
= 𝐿𝑛𝐶𝑡 +
𝑇𝑚 ∆𝐻0 ∆𝐻0

Ecuación 1: Ecuación que nos relaciona temperatura 𝑇𝑚 con la concentración de ADN 𝐶𝑡

DISCUSION DE RESULTADOS
Como se puede observar en los datos de la tabla 1 que por lo general la absorbancia de las
muestras de ADN aumenta la aumentar la temperatura esto es un claro caso de efecto
hipercromico que es un aumento de la intensidad de absorción, esto se debe que si un cromoforo
(grupos de átomos responsables de la absorción en las regiones ultravioleta y visible) y auxocromo
(que refuerzan la acción de un cromoforo) se encuentran en una misma molécula la absorción del
cromoforo se desplaza hacia longitudes más largas a la vez produce un aumento de la absorción.
Este efecto se atribuye normalmente a la posibilidad de que se den transiciones 𝑛 − 𝜋 ∗, donde n
son orbitales no enlazantes (Lucas Hernández Hernández, 2002). Además al aumentar la
temperatura ocurre que en las disoluciones de ADN comienza un proceso llamado
desnaturalización de la mitad de la doble cadena que se alcanza a la temperatura 𝑇𝑚
(temperatura de fusión) proceso que se puede seguir, midiendo el incremento de la absorbancia, a
medida que se van desapareando las bases (Teijon, 2006)