Nastavni program

Diplomski studij Ekologija i zaštita prirode

4321 D. VILIČIĆ MIKROBIOLOGIJA PELAGIJALA 0+0+0 2+2+0

NASTAVNI SADRŽAJ:

Metode istraživanja mikrobnih populacija u stupcu mora i u laboratoriju. Sastav i veličinska

struktura planktona. Tipovi prehrane (kemotrofija, autotrofija, miksotrofija, heterotrofija). Gustoća
populacija, biomasa, kompjutorska citomorfometrija i proracun mikrobne biomase. Brzina
produkcije, plankton u prostoru i vremenu. Kemijski, fizički i biološki regulatori razvoja planktona:
hranjive tvari, svjetlost, morske struje, frontalni sustavi, odnosi prehrane u mikrobnom krugu.
Uloga planktona u stvaranju, transformiranju i vertikalnom prijenosu organske i anorganske tvari.
Vertikalni transport organske tvari. Agregiranje čestica i mikrobni procesi. Primjeri iz svjetske
literature. Analiza i interpretacija podataka s terena.
PREREQUISITES FOR THE COURSE: Opća mikrobiologija, Biologija stanice
TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Redovitost pohađanja nastave
EXAMINATION METHODS: Aktivna zajednička rasprava, testiranje, pismeni ispit
REQUIRED LITERATURE:
Munn, C.B., 2004: Marine microbiology. Ecology and applications. Garland science/BIOS
Scientific Publishers, London. 214 pp. ISBN: 1 85996 288 2
Mann, K.H., Lazier, J.R.N., 1996: Dynamics of marine ecosystems. Biological-physical
interactions in the oceans. Blackwell Sci., Malden. ISBN: 0-86542-539-6
Viličić, D., 2003: Fitoplankton u ekološkom sustavu mora. Školska knjiga, Zagreb. ISBN: 953-0-
31130-3
Viličić, D.: Predavanja na cd (svake godine dopunjeno)
Recentna znanstvena literatura (iz ponude nastavnika)

4321 D. VILIČIĆ Pelagic Microbiology 0+0+0 2+2+0

COURSE CONTENT:

Methods in the filed and in laboratory. Composition and size structure of planktonic
microorganisms. Chemotrophy, autotrophy, mixotrophy, heterotrophy. Abundance, biomass,
computerised cytomorphometry and calculation microbial biomass. Production rate, spatial and
temporal distribution. Chemical, physical and biological regulators: nutrients, light, currents,
frontal systems, trophic relationships within microbial loop. Role of microorganisms in the
formation, transformation and vertical transport of organic and inorganic matter. Aggregation of
suspended particles and microbial processes. Examples from the world literature. Analysis and
interpretation of field data.

PREREQUISITES FOR THE COURSE: General microbiology, Cell biology

TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Regular attendance
EXAMINATION METHODS: Joint discussion, testing, written examination
REQUIRED LITERATURE:
Munn, C.B., 2004: Marine microbiology. Ecology and applications. Garland science/BIOS
Scientific Publishers, London. 214 pp. ISBN: 1 85996 288 2
Mann, K.H., Lazier, J.R.N., 1996: Dynamics of marine ecosystems. Biological-physical
interactions in the oceans. Blackwell Sci., Malden. ISBN: 0-86542-539-6
Viličić, D., 2003: Phytoplankton in the marine ecosystem (in Croatian). Školska knjiga, Zagreb.
ISBN: 953-0-31130-3
Viličić, D.: Lectures on cd (each year supplemented)
Recent scientific journal papers (offered by the lecturer)

4418 INVAZIVNE VRSTE 0+0+0 2+1+1

NASTAVNI SADRŽAJI:

Uvod, definicije (autohtone vrste, alohtone vrste, invazivne vrste, kriptogene vrste itd.). Povijesni
pregled i istraživanja invazivnih vrsta. Baze podataka o invazivnim vrstama. Putevi širenja.
Invazivni prokarioti i virusi. Invazivne vrste protista. Invazivne vrste beskralješnjaka. Invazivne
vrste kralješnjaka. Invazivne biljne vrste – problemi standardizacije terminologije i kriterija.
Invazivne vaskularne biljke. Učinci invazivnih vrsta (ekološki učinci, utjecaj na biološku
raznolikost, socio-ekonomski učinci, primjeri iz prakse). Mogućnosti gospodarenja invazivnim
vrstama, metode kontrole i prevencije. Zakonska regulativa (stanje u svijetu s posebnim osvrtom
na stanje u Hrvatskoj i okolnim zemljama). Upoznavanje izabranih invazivnih vrsta tijekom
jednodnevog terenskog izlaska na području grada Zagreba.
KOLEGIJI PRETHODNICI: Nema
UVJETI ZA POTPIS: Redovito pohađanje predavanja i praktične nastave, napisan i održan
seminar.
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Dva pismena kolokvija i seminar tijekom semestra ili završni
pismeni, a po potrebi usmeni, ispit.
OBAVEZNA LITERATURA: Leppäkoski, E., Gollasch, S., Olenin, S. (2003): Invasive aquatic
species of Europe. Distribution, impacts and management. Kluwer Academic Publishers,
Dordrecht, 583 str.
Pyšek, P., Prach, K., Rejmanek, M., Wade, M. (1995): Plant invasions. SPB Academic
Publishing, Amsterdam.

4418 INVASIVE SPECIES 0+0+0 2+1+1

COURSE CONTENT:
Introduction, definitions (autochthonous species, allochthonous species, invasive species,
cryptogenic species etc.). Invasion history invasive species research. Database on invasive
species. Vectors of spreading. Invasive prokaryotes and viruses. Invasive species of protists.
Invasive species of invertebrates. Invasive species of vertebrates. Invasive plants – problems of
standardization of terminology and criteria. Invasive vascular plants. Impacts of invasive species
(ecological impacts, impacts on biodiversity, socio-economic impacts, examples from practice).
Management possibilities, control methods and preventive treatment. Law regulations (global
overview with special reference to Croatia and adjacent states). Presentation of specific invasive
species in a day trip in Zagreb country side.
PREREQUISITES FOR THE COURSE: None
TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Regular attendance of the course, written and oral
presentation of seminar assignment.
EXAMINATION METHODS: Two written exams and seminar evaluation during semester or final
written (oral, if necessary) exam.
REQUIRED LITERATURE: Leppäkoski, E., Gollasch, S., Olenin, S. (2003): Invasive aquatic
species of Europe. Distribution, impacts and management. Kluwer Academic Publishers,
Dordrecht, 583 pp.
Pyšek, P., Prach, K., Rejmanek, M., Wade, M. (1995): Plant invasions. SPB Academic
Publishing, Amsterdam.

AKVAKULTURA 2+0+1 0+0+0

NASTAVNI SADRŽAJI:

Osnovni pojmovi i sadržaj akvakulture. Pod pojmom akvakultura podrazunjeva se kontrolirani

uzgoj vodenih organizama, prvenstveno riba. Prakticira se za različite svrhe a najvažnijje su:
proizvodnja ljudske hrane, poribljavanje otvorenih i zatvorenih voda, športski ribolov i za ukrasne
svrhe. Podjela akvakulture prema intenzitetu uzgoja. Osnove ekologije glavnih vrsta vodenih
organizama koje se uzgajaju. Osnovne biološke značajke o kojima ovisi uzgoj vodenih
organizama. Hranidba riba. Vrste hrane. Ribnjaci za uzgoj toplovodnih vrsta riba. Ribnjaci za
uzgoj hladnovodnih vrsta riba. Uzgoj riba u toplovodnim ribnjacima. Uzgoj riba u hladnovodnim
ribnjacima.

KOLEGIJI PRETHODNICI: položiti kolegij kralješnjaci

UVJETI ZA POTPIS: Prisustvovanje na svim oblicima nastave
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Usmeni ispit uz zajedničko komentiranje i raspravljanje teme
seminarskog rada.
OBAVEZNA LITERATURA:
Treer, T., Safner, R., Aničić, I., Lovrinov, M. (1995): Ribarstvo, Nakladni zavod Globus, Zagreb.
Shephard, J., Bromage, N. (1988): Intensive Fish farming. Oxford, London, Edinburgh, Boston,
Palo Lato, Melbourne.
Grupa autora (1982): Slatkovodno ribarstvo, Jugoslavenska medicinska naknada, Zagreb.
Billard, R. (1999): The Carp Biology and Culture. Aquaculture and Fisheries, Springer Praxis
Books.

4015 BAKTERIOLOGIJA ONEČIŠĆENIH VODA0+0+0 2+2+0

NASTAVNI SADRŽAJI:
Bakterije indikatori kvalitete vode (koliformi, termotolerantni koliformi, fekalni streptokoki,
sulfitreducirajuće klostridije). Intestinalni patogeni kao faktor zagađenja voda (hidričke infekcije,
ekologija intestinalnih bakterija u kopnenim vodama s naglaskom na preživljavanje i promjene
fizioloških i morfoloških svojstava u uvjetima vanjske sredine). Vrste i osobine otpadnih voda.
Uređaji za biološko pročišćavanje otpadnih voda. Uklanjanje ugljika, dušika, fosfora, sumpora i
teških metala u uređajima za pročišćavanje otpadnih voda. Uzroci pada učinkovitosti rada uređaja
za pročišćavanje otpadnih voda. Bioaugmentacija.

KOLEGIJI PRETHODNICI: Mikrobiologija

UVJETI ZA POTPIS: redovito pohađanje
NAČIN POLAGANJA ISPITA: usmeni

OBAVEZNA LITERATURA: Duraković S. i sur. (2005): Bakteriologija u biotehnologiji. Kugler,

Zagreb.

4015 BACTERIOLOGY OF WASTEWATER 0+0+0 2+2+0

COURSE CONTENT:

Bacteria indicators of water quality (coliforms, thermo-tolerant coliforms, faecal streptococci,

sulphite-reducing clostridia). Intestinal pathogens as a factor of water pollution (hydric infections,
ecology of intestinal bacteria in fresh waters with accent on the survival, changes of physiological
and morphological characteristics in conditions of outer environment). Types and characteristics
of wastewater. Biological wastewater treatment systems. Elimination of carbon, nitrogen,
phosphorus, sulphur and heavy metals in wastewater treatment systems. Factors causing upset
of wastewater treatment systems. Bioaugmentation.

PREREQUISITES FOR THE COURSE: Microbiology

TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Class attendance

EXAMINATION METHODS: oral

REQUIRED LITERATURE: Duraković S. i sur. (2005): Bakteriologija u biotehnologiji. Kugler,

Zagreb.

4316 BIOLOGIJA ONEČIŠĆENIH VODA 0+0+0 2+2+1

NASTAVNI SADRŽAJI:

Kruženje vode u biosferi, te raspored i potrebe za vodom.

Utjecaj čovjeka na kopnene vode (onečišćenja, crpljenje vode, hidroelektrane, poljoprivreda,
ribarstvo, rekreacija..). Vrste onečišćavanja kopnenih voda. Toksične tvari i djelovanje na živi
svijet. Organsko onečišćenje i utjecaj na ekološke sustave kopnenih voda. Termalno
onečišćenje i utjecaj na vodene ekološke sustave. Biološko onečišćenje i posljedice.
Makrozoobentos kao pokazatelj kakvoće voda. Biološke metode za određivanje kakvoće voda
(BI, P&B i dr). Metode pročišćavanja otpadnih voda. Ekološki inženjering-pojam i primjena.
Eutrofikacija - uzroci i posljedice. Metode za usporavanje procesa eutrofikacije ili smanjenja
stupnja trofije (mehaničke, kemijske, biološke). Primjeri primjene navedenih metoda (Butoniga,
Njivice, Ponikve i dr.). Regulacija i obnavljanje tekućica. Utjecaj pregradnje (brana) na tekućice te
problem biološkog minimuma (Drava, Cetina, Žrnovnica, Jadro i dr.).
Hrvatske norme i propisi, kategorizacija voda.

KOLEGIJI PRETHODNICI: Ekologija kopnenih voda

UVJETI ZA POTPIS: seminar, redovito pohađanje predavanja i vježbi
NAČIN POLAGANJA ISPITA: pismeno i usmeno
OBAVEZNA LITERATURA:
Cooke, G. D., Welch, E. B., Peterson, S. A., Newroth, P. R., 1993: Restoration and Management
of Lakes and Reservoirs. CRC Press LLC, 548.
Rosenberg, D. M., Resh, V. H. ed., 1993: Freshwater Biomenitoring and Benthic
Macroinvertebrates. Chapman & Hall, London, 488.
Mason, C. F., 1996: Biology of Freshwater Pollution, Longam, London, 356.
James, A., Evison, L. ed., 1979: Biological Indicators of Water Quality.John Wiley & Sons,
Chichester, 22-7; SI – 28.
Kerovec,M., Tavčar,V., Meštrov,M., 1989: Macrozoobenthos as an Indicator of the Level of
Trophy and Saprobity of Lake Jarun. Acta Hydrochimica et Hydrobiologica, Dresden, 17(1): 37-
45.
Bonacci, O., Kerovec, M., Mrakovčić, M., Roje-Bonacci, T. and Plenković-Moraj, A., 1998:
Ecologically acceptable flows definition for the Žrnovnica river (Croatia). Regulated rivers:
Research & Mangament 14: 245-256.

4316 BIOLOGY OF FRESHWATER POLLUTION0+0+0 2+2+1

COURSE CONTENT:
Hydrologic cycle. Water supply and use. Human impact on water resources (pollution, reservoirs
and dams, agriculture, fishery, sport and recreation..)
Types of pollutant. Toxic substances and biological effects of toxins. Effects of organic pollution
on fresh water ecosystems. Nuclear power plants and thermal pollution. Invasive species in
native ecosystems. Macrozoobenthos and water quality assessment.
Biological assessment of water qoulity (BI, P&B). Sewege treatment plants. Biomanipulation.
Eutrophication – restoration methods and techniques. Case studies (Butoniga, Njivice, Ponikve i
dr.).

Regulated rivers, case studies (Drava, Cetina, Žrnovnica, Jadro i dr.), restoration and recovery of
native ecosystems.
Croatian legislation.
PREREQUISITES FOR THE COURSE: ECOLOGY OF FRESH WATERS
TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Oral seminars, attending lectures and laboratory
work
EXAMINATION METHODS: Oral or written

REQUIRED LITERATURE:
Cooke, G. D., Welch, E. B., Peterson, S. A., Newroth, P. R., 1993: Restoration and Management
of Lakes and Reservoirs. CRC Press LLC, 548.
Rosenberg, D. M., Resh, V. H. ed., 1993: Freshwater Biomenitoring and Benthic
Macroinvertebrates. Chapman & Hall, London, 488.
Mason, C. F., 1996: Biology of Freshwater Pollution, Longam, London, 356.
James, A., Evison, L. ed., 1979: Biological Indicators of Water Quality.John Wiley & Sons,
Chichester, 22-7; SI – 28.
Kerovec,M., Tavčar,V., Meštrov,M., 1989: Macrozoobenthos as an Indicator of the Level of
Trophy and Saprobity of Lake Jarun. Acta Hydrochimica et Hydrobiologica, Dresden, 17(1): 37-
45.
Bonacci, O., Kerovec, M., Mrakovčić, M., Roje-Bonacci, T. and Plenković-Moraj, A., 1998:
Ecologically acceptable flows definition for the Žrnovnica river (Croatia). Regulated rivers:
Research & Mangament 14: 245-256.

4309 PRIMJENA GIS-a U BIOLOGIJI 0+0+0 2+2+0

NASTAVNI SADRŽAJI:

Uvod u GIS, definicije, kako GIS može pomoći u svakodnevnom radu biologa; osnovni koncepti
prostora i prostornih podataka, kartografske projekcije komponente GIS-a, GIS kao baza
podataka, programska podrška i drugi alati; tipovi i izvori podataka, pouzdanost, digitalizacija,
kreiranje karte, koncept tema i slojeva; rad s točkastim objektima, rad s linijskim objektima, rad s
poligonskim objektima, dodavanje tabličnih podataka, pretraživanje prostora; funkcije: «clip»,
«union», «intersect», «merge», «update», «edit»; uvod u daljinska promatranja, uporaba
satelitskih snimaka, ortofoto snimke, uloga u monitoringu; Primjeri: Izrada karata
rasprostranjenosti svojti i učestalosti (bioraznolikosti), unos GPS podataka; analiza orografskih
karakteristika prostora, DEM, povezanost s ostalim temama prostora; analiza vegetacije i
povezanost s pedologijom i geologijom; procjena utjecaja antropogenog zahvata u prostoru na
biološke resurse
KOLEGIJI PRETHODNICI:
UVJETI ZA POTPIS: Redovno prisutvo na praktikumskoj nastavi.
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Uspjeh na praktikumskoj nastavi, pismeni i/ili usmeni ispit.
OBAVEZNA LITERATURA:
1. Burrough, P.A., McDonnell, R.A., 1998. Principles of geographical information systems.
Oxford University Press, New York, ISBN 0-19-823365-5
2. Longley, P.A., Goodchild, M.F., Maguire, D.J., Rhind, D.W., 2008. Geographic information
systems and science, 2nd edition. John Wiley & Sons Ltd., ISBN 978-0470-87001-3
3. Hengl, T., Reuter, H.I., 2009. Geomorphometry, Concepts, Software, Applications
(Developments in Soil Science, Volume 33), Elsevier, ISBN 978-0-12-374345-9.
4. Jelaska, SD: On-line materijali (http://croatica.botanic.hr/~ekolbilj)
 4309 APPLICATION OF GIS IN BIOLOGY 0+0+0 2+2+0

COURSE CONTENT:

Introduction to GIS, definitions, how GIS could help in every day work; basic concepts in spatial
analysis, map projections; GIS components, GIS as database, software support and other tools;
types and sources of data, reliability, digitalisation, map creation, themes and layers concept;
point objects; line objects, polygons, adding attributes, spatial queries; functions: «clip», «union»,
«intersect», «merge», «update», «edit»; introduction to remote sensing technology, usage of
satellite images; Case studies and practice: creation of distribution maps, PGS data; analysis of
orographic characteristics of terrain, DEM, relation with other themes; analysis of vegetation and
relation to pedology and geology; assessment of anthropogenous influence on biological
resources.
PREREQUISITES FOR THE COURSE:
TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Regular attendance of laboratory work.
EXAMINATION METHODS: Success in laboratory work plus written and/or oral exam.
REQUIRED LITERATURE:
1. Burrough, P.A., McDonnell, R.A., 1998. Principles of geographical information systems.
Oxford University Press, New York, ISBN 0-19-823365-5
2. Longley, P.A., Goodchild, M.F., Maguire, D.J., Rhind, D.W., 2008. Geographic information
systems and science, 2nd edition. John Wiley & Sons Ltd., ISBN 978-0470-87001-3
3. Hengl, T., Reuter, H.I., 2009. Geomorphometry, Concepts, Software, Applications
(Developments in Soil Science, Volume 33), Elsevier, ISBN 978-0-12-374345-9.
4. Jelaska, SD: On-line materijali (http://croatica.botanic.hr/~ekolbilj)

4310 EKOLOGIJA BILJA 2+3+1 0+0+0

NASTAVNI SADRŽAJI:
Pojam i značaj poznavanja biljnog pokrova; Autekologija; ekologija stresa: abiotički čimbenici
(svijetlo; voda; temperatura; klima; tlo; soli; kiselost; teški metali; led; požari); biotički čimbenici
(bolesti; herbivori; mikorize; kompeticija). Strategije preživljavanja (CSR) i životni oblici biljaka.
Invazivne vrste; Sinekologija; povijest istraživanja vegetacije i tipovi klasifikacije; dinamika –
sukcesije; metode u istraživanju vegetacije – uzorkovanje, analiza (klasifikacija, ordinacija,
indeksi raznolikosti), kartiranje vegetacije. Značaj vegetacije: u ekologiji krajobraza; za Kyoto
protokol; u bioindikaciji. Pregled vegetacije Hrvatske.
KOLEGIJI PRETHODNICI:
UVJETI ZA POTPIS: Redovno prisutvo na praktikumskoj nastavi, uspješno odrađen seminar.
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Uspjeh u seminarskom radu, pismeni i/ili usmeni ispit.

OBAVEZNA LITERATURA:
5. Schulze, Beck, Müller-Hohenstein, 2005: Plant Ecology. Springer, ISBN 3-540-20833-X
6. Gurevitch, Scheiner, Fox, 2006. The Ecology of Plants. Sinauer Ass. ISBN 0-87893-294-1
7. Gračanin, M., Ilinanić, Lj., 1977: Uvod u ekologiju bilja. Školska knjiga, Zagreb.
8. Jelaska, SD: On-line materijali (http://croatica.botanic.hr/~ekolbilj)

4310 PLANT ECOLOGY 2+3+1 0+0+0

COURSE CONTENT:
Plant cover – meaning and importance; autecology; stress ecology: abiotic factors (light; water;
temperature; climate; soil; salinity; acidity; heavy metals; ice; fire); biotic factors (pathogens;
infectious; herbivores; mycorrhizae; competition). Life forms and survival strategies (CSR);
Invasive species; Synecology; history of vegetation research and different classifications;
dynamics-successions; research methods; sampling; analyses (classification; ordination; diversity
indices); vegetation mapping. Importance of vegetation in: Landscape ecology; Kyoto protocol;
bioindication. Review of Croatian vegetation.
PREREQUISITES FOR THE COURSE:
TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Regular attendance of laboratory work. Term
paper/presentation done.
EXAMINATION METHODS: Success on term paper plus written and/or oral exam.
REQUIRED LITERATURE:
5. Schulze, Beck, Müller-Hohenstein, 2005: Plant Ecology. Springer, ISBN 3-540-20833-X
6. Gurevitch, Scheiner, Fox, 2006. The Ecology of Plants. Sinauer Ass. ISBN 0-87893-294-1
7. Gračanin, M., Ilinanić, Lj., 1977: Uvod u ekologiju bilja. Školska knjiga, Zagreb.
8. Jelaska, SD: On-line materijali (http://croatica.botanic.hr/~ekolbilj)

UGROŽENOST I ZAŠTITA KOPNENIH

4419 0+0+0 2+0+2
STANIŠTA U HRVATSKOJ

NASTAVNI SADRŽAJI:

Pojam staništa i pregled postojećih klasifikacija; Staništa kao pokazatelj bioraznolikosti; Značaj
staništa u okvirima europske legislative zaštite prirode – NATURA2000; Značaj staništa za
kreiranje ekološke mreže; Uzroci ugroženosti kopnenih staništa; Rasprostranjenost staništa –
problem tematske i prostorne razlučivosti; Mjere zaštite i revitalizacija staništa; Praćenje zaštite i
revitalizacije staništa; Zaštićenost staništa u Hrvatskoj; Pregled ugroženih staništa Hrvatske.

KOLEGIJI PRETHODNICI:
UVJETI ZA POTPIS: Redovno prisutvo na nastavi, uspješno odrađen seminar.
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Uspjeh u seminarskom radu, pismeni i/ili usmeni ispit.
OBAVEZNA LITERATURA:
9. Topić, J., Ilijanić, Lj., Tvrtković, N., Nikolić, T., 2006: Staništa – Priručnik za inventarizaciju,
kartiranje i praćenje stanja. DZZP, Zagreb.
10. Antonić O, Kušan V, Bakran-Petricioli T, Alegro A, Gottstein-Matočec S, Peternel H, Tkalčec
Z, (2005) Klasifikacija staništa Republike Hrvatske. Drypis 1/1,2 (www.drypis.info)
11. Nikolić, T., Topić, J. (Ur.) 2005: Crvena knjiga vaskularne flore Hrvatske. Ministarstvo kulture,
DZZP, Zagreb.
12. Jelaska, SD: On-line materijali (http://croatica.botanic.hr/~ekolbilj)

THREATS AND PROTECTION OF

4419 0+0+0 2+0+2
TERRESTRIAL HABITATS IN CROATIA

COURSE CONTENT:

Habitat definition; review of habitat classifications; habitats as indicator of biodiversity; importance

for European nature protection – NATURA2000 and ecological network; threats; habitats
distribution – issue of spatial and thematic resolution; protection and restoration; monitoring;
protection of habitats in Croatia; Overview of threatened habitats in Croatia.

PREREQUISITES FOR THE COURSE:

TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Regular attendance lectures. Term
paper/presentation done.
EXAMINATION METHODS: Success on term paper plus written and/or oral exam.
REQUIRED LITERATURE:
9. Topić, J., Ilijanić, Lj., Tvrtković, N., Nikolić, T., 2006: Staništa – Priručnik za inventarizaciju,
kartiranje i praćenje stanja. DZZP, Zagreb.
10. Antonić O, Kušan V, Bakran-Petricioli T, Alegro A, Gottstein-Matočec S, Peternel H, Tkalčec
Z, (2005) Klasifikacija staništa Republike Hrvatske. Drypis 1/1,2 (www.drypis.info)
11. Nikolić, T., Topić, J. (Ur.) 2005: Crvena knjiga vaskularne flore Hrvatske. Ministarstvo kulture,
DZZP, Zagreb..
12. Jelaska, SD: On-line materijali (http://croatica.botanic.hr/~ekolbilj)

44564 EKOFIZIOLOGIJA BILJA 0+0+0 1+2+0

NASTAVNI SADRŽAJI:

Biotička invazija, homeostatski mehanizmi. Učinci stresnih uvjeta na biljke: abiotički i biotički
stres, adaptacija, aklimatizacija, učinci na ekspresiju gena, odgovori i otpornost na stres. Učinak
manjka vode u tlu na biljke i otpornost na sušu: učinci vodnog stresa; mehanizmi otpornosti,
mehanizam i regulacija zatvaranja puči, apscizinska kiselina. Učinak manjka kisika u tlu na biljke:
anaerobni stres - prilagodbe, aklimatizacija. Učinci smanjene i povećane koncentracija soli u tlu
na biljke: kisela i bazična tla, esencijalne mineralne tvari: primanje, uloga, simptomi nedostatka;
mikoriza, simbioza, parazitske biljke, halofiti i glikofiti; mehanizmi toleriranja povišenog saliniteta.
Učinci svjetlosnog i UV-stresa na biljke: fotoperiodizam, fotomorfogeneza, fitokromi, fotoinhibicija,
oksidacijska fotodestrukcija, mehanizmi zaštite i popravka oštećenog fotosintetskog aparata,
učinak na fotosintezu, mehanizmi fotoreaktivacije. Učinci niskih i visokih temperatura na biljke:
niske temperature - hlađenje i smrzavanje, biljke otporne na hladnoću, oštećenja izazvana
hladnoćom, dormancija; visoke temperature - toplotni stres i toplotni šok: simptomi, učinak na
fotosintezu, fotorespiracija, C4 i CAM metabolizam, proteini toplotnog šoka; utjecaj požara na
biljke i biljne zajednice. Učinak onečišćenja na biljke: sinergički učinak, kisela kiša, otpornost na
toksine, biljke hiperakumulatori. Učinak biogenog stresa na biljke. Obrambeni mehanizmi biljaka:
površinska zaštita i sekundarni metaboliti - terpenski i fenolni spojevi, tvari koje sadrže dušik:
sinteza, raspodjela u biljci, način djelovanja; ekološka uloga: kemijska obrana od herbivora,
primamljivanje oprašivača i rasprostranjivača plodova, alelopatija, stimulacija tvarima za
prepoznavanje.

KOLEGIJI PRETHODNICI: Fiziologija bilja

UVJETI ZA POTPIS: Redovito pohađanje nastave
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Usmeni ispit
OBAVEZNA LITERATURA:
1. Pevalek-Kozlina, B. (2003): Fiziologija bilja. Sveučilišni udžbenik. Profil International, Zagreb.
2. Mohr, H. and Schopfer, P. (1995): Plant Physiology. Springer Verlag, Berlin.
3. Taiz, L. and Zeiger, E. (2002): Plant Physiology. Sinnauer Ass. Inc. Sunderland,
Massachusetts.

44564 PLANT ECOPHYSIOLOGY 0+0+0 1+2+0

COURSE CONTENT:

Biotic invasion, mechanisms of homeostasis. Effects of different stress conditions on plants:

environmental and biogenic stress, adaptation, acclimatization, effects on gene expression,
stress tolerance. Effects of water deficit and drought resistance in plants: effects of water
stress, mechanisms of resistance, mechanisms and regulations of stomata closing, abscisic
acid. Effects of oxygen deficiency on plants: anaerobic stress - adaptations, acclimatization.
Effects of increased and decreased salt concentration on plants: acid and alkaline soils,
essential mineral nutrients: uptake, function, symptoms of deficiency; myccorhiza, symbiosis,
parasitic plants, halophytes and glycophytes; mechanisms of high salt concentration tolerance.
Effects of light and UV stress on plants: photoperiodism, photomorphogenesis, phytochromes,
photoinhibition, oxidative photodestruction; protection mechanisms against photooxidative
destruction of photosynthetic apparatus; effects on photosynthesis, photoreactivation
mechanisms. Effects of low and high temperatures on plants: low temperatures – chilling and
freezing: plants resistant to cold, injuries caused by low temperatures, dormancy; high
temperatures – heat stress and heat shock: symptoms, effects on photosynthesis,
photorespiration, C4 and CAM metabolism, heat shock proteins; effects of fire on plants and
plant communities. Effects of pollution on plants – synergistic effects, acid rain, toxin
resistance, hyperaccumulating plants. Effects of biogenic stress on plants. Plant defenses:
surface protection and secondary metabolites: terpenes, phenolic compounds, nitrogen-
containing metabolites: synthesis, distribution in plants, mode of action; ecological role:
chemical defense against herbivores, attractants for pollinators and seed-dispersing animals,
allelopathy, stimulation by recognition substances.

PREREQUISITES FOR THE COURSE: Plant physiology

TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Regular attending the course
EXAMINATION METHODS: Final exam in oral form
REQUIRED LITERATURE:
1. Pevalek-Kozlina, B. (2003): Fiziologija bilja. Sveučilišni udžbenik. Profil International, Zagreb.
2. Mohr, H. and Schopfer, P. (1995): Plant Physiology. Springer Verlag, Berlin.
3. Taiz, L. and Zeiger, E. (2002): Plant Physiology. Sinnauer Ass. Inc. Sunderland,
Massachusetts.

4417 EKOLOGIJA BAKTERIJA I VIRUSA 0+0+0 2+2+0

NASTAVNI SADRŽAJI:
Uvod u mikrobnu ekologiju. Metode istraživanja bakterija i virusa. Koncepti mikrobne ekologije.
Struktura, dinamika i ekologija bakterijskih populacija u tlu, vodi i atmosferi. Osobine virusa,
viroida i priona, te infekcije koje oni uzrokuju. Ekologija virusa kao specijaliziranih parazita
različitih tipova stanica: bakteriofagi, animalni, biljni virusi, virusi ostalih organizama. Taksonomija
virusa. Utjecaj virusa na biocenoze. AIDS. Interferon.

KOLEGIJI PRETHODNICI: Mikrobiologija

UVJETI ZA POTPIS: redovito pohađanje
NAČIN POLAGANJA ISPITA: usmeni

OBAVEZNA LITERATURA: Duraković S. i sur. (2005): Bakteriologija u biotehnologiji. Kugler,

Zagreb.
Presečki V i sur. (2003) Virologija. Medicinska naklada, Zagreb.
Juretić N (2002) Osnove biljne virologije. Školska knjiga, Zagreb.

4417 ECOLOGY OF BACTERIA AND VIRUSES0+0+0 2+2+0

COURSE CONTENT:

Introduction to microbial ecology. Methods of investigations of bacteria and viruses. Concepts of

microbial ecology. Structure, dynamics and ecology of bacterial populations in soil, water and
atmosphere. Characteristics of viruses, viroids and prions and infections they cause. Ecology of
viruses as specialised parasites of different cell types: bacteriophages, animal and plant viruses,
viruses of other organisms. Taxonomy of viruses. Influence of viruses on biosphere.AIDS.
Interferons.

PREREQUISITES FOR THE COURSE: Microbiology

TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Class attendance
EXAMINATION METHODS: oral
REQUIRED LITERATURE: Duraković S. i sur. (2005): Bakteriologija u biotehnologiji. Kugler,
Zagreb.
Presečki V i sur. (2003) Virologija. Medicinska naklada, Zagreb.
Juretić N (2002) Osnove biljne virologije. Školska knjiga, Zagreb.

4313 EKOLOGIJA KOPNENIH KRALJEŠNJAKA0+0+0 3+2+0

NASTAVNI SADRŽAJI:
Predavanja će obuhvatiti ekologiju i biologiju kopnenih kralješnjaka – vodozemaca, gmazova,
ptica i sisavaca; Mehanizmi i načini kretanja kod kopnenih kralješnjaka; Osnove ponašanja i
prilagodbe koje utječu na život kopnenih kralješnjaka; Korištenje prostora, teritorijalnost, životni
prostor, migracije, načini orijentacije; Populacijska dinamika –natalitet, mortalitet, gustoća i
starosna struktura populacija; Staništa i ekološke niše kopnenih kralješnjaka; Prilagodbe na
uvjete okoliša (hibernacija, estivacija, torpor), načini termoregulacije kod različitih skupina
kopnenih kralješnjaka; Razmnožavanje i reproduktivno ponašanje kopnenih kralješnjaka; Rast i
razvoj, različite strategije brige za mlade.
Osnovna obilježja ptica. Populacije i zajednice ptica. Gniježđenje. Ponašanje. Selidba. Ptice i
klimatske promjene. Zaštita ptica. Crvena knjiga.

KOLEGIJI PRETHODNICI: Opća zoologija (položen), Kralješnjaci (odslušan)

UVJETI ZA POTPIS: Prisutnost na predavanjima i praktikumima.
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Usmeni ispit.
OBAVEZNA LITERATURA:
1. Linzey, D., 2001: Vertebrate Biology, McGraw Hill Publishers, New York.
2. Pough, F. H., Janis, C. M., and Heiser, J. B. 2002: Vertebrate Life. 6th edition. Prentice-
Hall, 1-699
3. Gill, F. (2000) Ornithology, W. H. Freeman and Company, New York.
4. Perrins, C. M., Birkhead, T. R. (1983) Avian Ecology, Chapman and Hall, New York.

EKOLOGIJA ŠUMA 2+0+2 0+0+0

NASTAVNI SADRŽAJI:
Definicija pojma ekologija šuma. Uloga šume kao ekološkog uporišta u prostoru. Šuma u odnosu
prema drugim oblicima vegetacije. Izgradnja, rasprostranjenje i šumsko-uzgojno značenje važnijih
oblika šumskih ekosustava. Gospodarenje šumskim ekosustavima. Osnovni tipovi i struktura
šume. Šuma kao obnovljivi resurs. Diverzitet i stabilnost šumskih ekosustava. Odnos šume
prema posrednim ekološkim čimbenicima (klima, geološka podloga, tlo, reljef i biotski utjecaji).
Utjecaj neposrednih ekoloških čimbenika (svjetlost, toplina, voda, kemijski i mehanički čimbenici)
na šumu. Biomasa šumskih ekosustava. Dinamika razvoja nadzemnog i podzemnog dijela
šumskog drveća. Prašume, zaštićeni šumski ekosustavi i njihova uloga. Utjecaj promjene
kemijske klime na drveće i šumu. Šuma kao regulator vodnih odnosa. Opće korisne vrijednosti
šume.

KOLEGIJ PRETHODNICI: Opća ekologija

UVJETI ZA POTPIS: seminari, redovito pohađanje predavanja
NAČIN POLAGANJA ISPITA: pismeno i usmeno
OBAVEZNA LITERATURA:
Matić, S., Prpić, B., 1983: Pošumljavanje
Prpić, B., Seletković, Z.: Ekologija šuma, Skripta
Monografija Šume u Hrvatskoj, 1992.
Spurr, S.H., Barnes, B.V.: Forest Ecology, ISBN 0-471-04732-5, Third Edition
Šumarska enciklopedija, JLZ I, II, III

FOREST ECOLOGY 2+0+2 0+0+0

COURSE CONTENT:

Definition of Forest Ecology. The Role of Forest as an Ecological Foothold in Space. Forests in
Relation to Other Forms of Vegetation. Growth, Distribution and Silvicultural Significance of Some
More Important Forms of Forest Ecosystems. Forest Ecosystem Management. Basic Forest
Types ande Structures. Forest as a Renewable Resource. Diversity and Stability of Forest
Ecosystems. Interaction between Forests and Indirect Ecological Factors (Climate, Geological
Substrate, Soil, Relief and Biotic Impacts). Impacts of Direct Ecological Factors (Light,
Temperature, Water, Chemical and Mechanical Factors) on Forests. Biomass of Forest
Ecosystems. Developmental Dynamics of Aboveground and Belowground Parts of Forest Trees.
Virgin Forest, Protected Forest Ecosystems and their Role. Impacts of Changed Chemical
Climate on Trees and Forests. Forest as a Regulator of Water Relations. Multiple Forest
Functions.
PREREQUISITES FOR THE COURSE: General ecology
TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Attending lectures
EXAMINATION METHODS: Written and oral
REQUIRED LITERATURE
Matić, S., Prpić, B., 1983: Pošumljavanje
Prpić, B., Seletković, Z.: Forest ecology
Monograph Forests of Croatia, 1992.
Spurr, S.H., Barnes, B.V.: Forest Ecology, ISBN 0-471-04732-5, Third Edition
Šumarska enciklopedija, JLZ I, II, III, članci iz Ekologije šuma

4332 EKOLOGIJA ŽIVOTINJA 0+0+0 1+2+1

NASTAVNI SADRŽAJI:

Abiotički čimbenici važni za životinje: temperatura; ekologija termoregulacije.

Biotički odnosi - simbioza (ekološko značenje), teritorijalnost i kompeticija, teorija srodstvenog
prepoznavanja (odabira), altruizam i razvoj socijalnih zajednica, parazitizam i mutualizam.
Migracije – zašto i kako životinje migriraju, koje je njihovo ekološko značenje, koje ekološke
zahtjeve postavljaju pred jedinke i populacije. Predatorstvo – teorija optimalne prehrane.
Stabilnost zajednica – tipovi stabilnosti, predvidljivost (McArthur-Wilson teorija), zajednice
varijabilnog okoliša, hranidbene mreže i stabilnost, raznolikost i stabilnost. Ekologija voda na
kopnu – po čemu se slatkovodni ekološki sustavi bitno razlikuju od kopnenih? Podzemna staništa
– ekstremni okoliš? Ekotoni i problemi fragmentacije staništa.Ekologija životinja u zatočeništvu:
zaštita vrsta, problemi držanja, uzgoja i reintrodukcije.

KOLEGIJI PRETHODNICI: Opća ekologija

UVJETI ZA POTPIS: seminar, redovito pohađanje predavanja i vježbi
NAČIN POLAGANJA ISPITA: pismeno i usmeno
OBAVEZNA LITERATURA:
M. Begon, C. R. Townsend, J. L. Harper, 2006. Ecology From Individuals to Ecosystems. Oxford,
Blackwell Publishing Ltd.
Lampert, W., Sommer, U., 2007. Limnoecology. Ecology of Lakes and Streams. Oxford University
Press, New York.
Moss, B., 2010. Ecology of Fresh Waters. Blackwell Sc. Publ., Oxford, 557.

4314 EKOLOGIJA KOPNENIH VODA 2+2+1 0+0+0

NASTAVNI SADRŽAJI :

Fizikalni, kemijski i biološki uvjeti u kopnenim vodama.Obilježja tekućica jadranskog i

crnomorskog sliva. Struktura i dinamika zajednica kopnenih voda. Produkcija i trofička struktura u
kopnenim vodama. Zakonitosti ekoloških sustava voda stajaćica – fizička obilježja, struktura i
dinamika životnih zajednica. Jezera i lokve. Močvare. Zakonitosti i obilježja ekoloških sustava
voda tekućica. Krenobiologija. Potoci i rijeke. Ekologija podzemnih voda. Obilježja plaktonskih
zajednica, zajednica dna (bentos), obraštaja i nektona. Procesi i interakcije u ekološkim
sustavima kopnenih voda. Praćenje stanja kvalitete kopnenih voda. Principi konzervacijske
biologije kopnenih voda.

KOLEGIJI PRETHODNICI: Opća ekologija

UVJETI ZA POTPIS: 80% pohađanje predavanja i 90% pohađanje praktikuma, prolazna ocjena
na svim kolokvijima, napisan i usmeno izložen seminar
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Kolokviji, pismeni ispit, usmeni ispit
OBAVEZNA LITERATURA:

Gibert, J., Danielopol, D. L., Stanford, J. A. (ur.) 1994. Groundwater Ecology. Academic Press,
San Diego, str. 1-571.
Lampert, W., Sommer, U., 1997. Limnoecology. Ecology of Lakes and Streams. Oxford University
Press, New York.
Mitsch, W. J., 1994: Global wetlands-Old Worlds and New. Elsevier, Amsterdam, str. 1-967.
Moss, B., 1998: Ecology of Fresh Waters. Blackwell Sc. Publ., Oxford, str. 1-557.

4316 ECOLOGY OF FRESH WATERS 2+2+1 0+0+0

COURSE CONTENT :

Physical, chemical and biological conditions of inland waters. Natural features of streams in
Adriatic and Black sea drainage basin. Community structure and dynamic in inland waters.
Production and trofic state in inland water. Patterns of lentic ecosystems. Lakes and ponds.
Wetlands. Patterns of lotic ecosystems. Crenobiology. Streams and rivers. Groundwater ecology.
Characteristics of planktonic, benthic, periphytic and nekton communities.
Processes and interactions of inland water ecosystems
Ecological assessment of inland waters
Principles of conservation biology of inland waters

PREREQUISITES FOR THE COURSE: General ecology

TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: 80% lecture and 90% practical course attendance,
partial examines passed (all), written seminar presented orally

EXAMINATION METHODS: Partial examines, written and oral exames

REQUIRED LITERATURE:

Gibert, J., Danielopol, D. L., Stanford, J. A. (ur.) 1994. Groundwater Ecology. Academic Press,
San Diego, str. 1-571.
Lampert, W., Sommer, U., 1997. Limnoecology. Ecology of Lakes and Streams. Oxford University
Press, New York.
Mitsch, W. J., 1994: Global wetlands-Old Worlds and New. Elsevier, Amsterdam, str. 1-967.
Moss, B., 1998: Ecology of Fresh Waters. Blackwell Sc. Publ., Oxford, str. 1-557.
Obavezni predmet: EKOTOKSIKOLOGIJA
Naziv studija/studijskog programa: DIPLOMSKI STUDIJ EKOLOGIJA I ZAŠTITA PRIRODE
(magistar ekologije i zaštite prirode)
Godina studija: prva (1)
Semestar studija: prvi (1)
ECTS bodovi: 6
Predmetni nastavnik: Doc. dr. sc. Göran Igor Vinko Klobučar

44539 EKOTOKSIKOLOGIJA 2+1+1 0+0+0

NASTAVNI SADRŽAJI:

Temeljna načela i povijest toksikologije. Pregled glavnih vrsta toksikanata/onečišćivača i

mehanizama njihova toksičnog djelovanja, zakonodavstvom propisani toksikološki testovi.
Kvalitativni aspekti toksičnih učinaka. Biološka pretvorba/detoksikacija. Definicija i povijest
ekotoksikologije. Širenje toksikanata okolišem, paradigma razrjeđenja i bumerang paradigma.
Nakupljanje toksikanata u organizmima, abiotički i biotički faktori koji utječu na toksičnost.
Povezanost promjena uzrokovanih djelovanjem onečišćenja od molekularne i stanične razine
preko razine organizma pa sve do razine populacije, zajednice i ekosistema. Metode i načini
utvrđivanja i mjerenja utjecaja onečišćenja/toksikanata na okoliš: testovi toksičnosti-biotestovi,
biomonitoring, biomarkeri - definicija i podjela, ekotoksikogenomika. Učinci toksikanata na
populacije, zajednice i ekosustave. Promjene na razini populacije. Učinak tvari na zajednicu
(raznolikost vrsta). Promjene na razini ekosustava. Promjene uzrokovane djelovanjem
onečišćenja na molekularnoj i staničnoj razini i razini organizma. Endokrini modulatori. Globalne
promjene uzrokovane antropogenim djelovanjem, kisele kiše, učinak staklenika, perzistentni
organofosfatni spojevi (POP), kruženje otrova u biosferi. Biološko onečišćenje: širenje alohtonih
biljnih i životinjskih vrsta i posljedice. Procjena rizika od onečišćivača, procjena rizika za ljude i
procjena okolišnog/ekotoksikološkog rizika, procjena izloženosti.

KOLEGIJI PRETHODNICI: Nema.

UVJETI ZA POTPIS: Seminar. Redovno pohađanje vježbi.
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Pismeni i usmeni ispit.
OBAVEZNA LITERATURA:
1. Principles of ecotoxicology 2nd ed. (2001) Walker CH, Hopkin SP, Sibly RM, Peakall DB,
Taylor & Francis
2. Fundamentals of ecotoxicology (2001) Newman MC, Lewis Publishers

44539 ECOTOXICOLOGY 2+1+1 0+0+0

COURSE CONTENT:

Basic concepts in toxicology and history of toxicology. Review of major classes of pollutants
(anorganic, organic…) and their mechanisms of toxicity. Legislative on toxicology testing.
Qualitative aspects of toxic effects. Biological transformation/biotransformation. Definition and
history of ecotoxicology. Dispersal of toxic substances in the environment dilution paradigm and
boomerang paradigm. Accumulation of toxic substances by organisms, abiotic and biotic factors
influencing toxicity. Causal relationship of changes caused by the pollution from molecular and
cellular level over the level of the organism and to the level of populations, communities and
ecosystems. Methods of determing and measuring impact caused by the pollution/toxicant on the
environment: toxicity tests-bioassays, biomonitoring, biomarkers - definition and their
categorization, ecotoxicogenomics. Effects of pollutants on the populations, communities and
ecosystems. Different changes on the level of population. Effects of pollution on the community
level (species diversity/biodiversity). Changes on the ecosystem level. Changes caused by
toxicants on the molecular and cellular level and the level of the organism. Endocrine modulators.
Global changes caused by anthropogenic impact, acid rains, greenhouse effect, persistent
organic pollutants (POPs), cycling of the toxicants in the atmosphere. Biological pollution:
spreading of the alochthonous plant and animal species and its consequences. Risk assessment:
for humans and for the environment, hazardous concentrations.

PREREQUISITES FOR THE COURSE: None.

TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Seminar. Regular attendance of the practical work.
EXAMINATION METHODS: Written and oral exams.
REQUIRED LITERATURE:
1. Principles of ecotoxicology 2nd ed. (2001) Walker CH, Hopkin SP, Sibly RM, Peakall DB,
Taylor & Francis
2. Fundamentals of ecotoxicology (2001) Newman MC, Lewis Publishers

IHTIOLOGIJA I RIBARSTVO 2+1+1 0+0+0

NASTAVNI SADRŽAJI:

Što je ihtiologija? Trendovi u evolucija riba; Klasifikacija i sistematika riba; Osnove morfologije i
anatomija riba; Metode kretanja i načini plivanja; Plivaći mjehur i plovnost. Izmjena plinova i načini
disanja; Osmoregulacija i ravnoteža kod riba; Načini razmnožavanja i briga za mlade; Starost i
rast riba; Prilagodbe riba na raznolikost staništa; Dinamika ihtiopopulacija; Osnova upravljanja
ribljim populacijama; Ekologija riba, raznolikost i migracije; Slatkovodna ihtiofauna Hrvatske;
Principi racionalnog iskorištavanja ihtioloških resursa; Značajke i gospodarenje pastrvskim
vodama; Značajke i gospodarenje šaranskim vodama; Utjecaji čovjeka na ihtiopopulacije.
KOLEGIJI PRETHODNICI: Vertebrata (položen).
UVJETI ZA POTPIS: Prisutnost na predavanjima i praktikumu.
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Usmeni ispit
OBAVEZNA LITERATURA:
1. Helfman, G., Collete, B., Facey, D., 1997: The Diversity of Fishes. Malden, MA: Blackwell.
2. Bone, Q., Marshall, N.B. and Blaxter J.H.S. 1995: Biology of fishes. Chapman and Hall,
Glasgow, Scotland. 2nd Edition.
3. Moyle, P., J. Cech. 2000. Fishes: An Introduction to Ichthyology – fourth edition. Upper
Saddle River, NJ: Prentice-Hall.

4319 MARIKULTURA I UTJECAJ NA OKOLIŠ 2+0+2 0+0+0

NASTAVNI SADRŽAJI:

Globalni trendovi presudni za razvitak marikulture Glavne poveznice lovnog uzgojnog ribarstva.
Neriješena pitanja i razvojna usmjerenja mariculture. Dominantni tipovi (monokultura, polikultura,
integrirana marikultura), metode (ekstenzivni, poluintenzivni i intenzivni) i tehnike uzgoja (ribnjaci,
bazeni, protočni kanali, silosi, kavezi). Recirkulacijske tehnologije u marikulturi u odnosu na
sustav otvorenog optoka. Metode i tehnike poticane gametogeneze. Problemi proizvodnje mlađi
morskih organizama u mrijestilištima. Kriteriji za ocjenu povoljnosti vrsta. Marikultura temeljena na
ribolovu (tuna, jegulja…) Ekološki aspekti kaveznog i bazenskog uzgoja. Rizici eutrofikacije,
biotoksini, nosivi kapacitet okoliša. Mjesto i uloga fito bakterioplanktona u organski obogaćenom
morskom okolišu. Ekološki standardi u proizvodnji školjkaša. Zoniranje u kontekstu integralnog
planiranja obalnim prostorima, kriteriji za izbor lokacija. Strateška procjena utjecaja na okoliš;
Procjena utjecaja projekta marikulture na okoliš; Monitoring uzgajališta ribe i školjkaša.
Upravljanje rizicima u marikulturi.

KOLEGIJI PRETHODNICI: Opća ekologija

UVJETI ZA POTPIS: Redovito pohađanje nastave, seminari (opcijski)
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Usmeni ispit
OBAVEZNA LITERATURA:
Katavić, I. 2006. Ribogojstvo – Marikultura. Bogut, I. (ur), Udžbenik, Poljoprivredni fakultet, Osjek,
523 str.
Katavić i sur. 2005. Integrated coastal zone management plan – Guidelines to marine aquaculture
planning , integration and monitoring in Croatia. Ministry of Aquaculture, Fisheries and Rural
Development, Zagreb, 78 str.
Barnabe, G. 1994. Biological basis of fish culture. In: Aquaculture – biology and ecology of
cultured species, Barnabe, G. (ed), Rlis Horword Limited, str. 227-372.
Beveridge, M.C.M., 1996. cage culture. Fishing New Books, Blackwell, Oxford, 351 str.
Pillay, T.V.R. (1992). Aquaculture and environment. Oxford, Fishing New Books, Blackwell, 189
str.
Ottolenghi, F., Silvestri, C, Giordano, P., Lovatelli, A. New, M.B. 2004. Capture-based
aquaculture. The fattening of eels, groupers, tunas and yellowtails. Rome, FAO, 308 str.

4319 MARICULTURE AND IMPACT ON THE ENVIRONMENT 2+0+2 0+0+0

COURSE CONTENT:

Global trends of prime importance for mariculture development. The main inter-relations among
capture and cultured fisheries. Unsolved questions and future mariculture development trends.
Dominant types (monoculture, polyculture, integrated mariculture), methods (extensive,
semiintensive, intensive) and technique (ponds, tanks, raceways, silos and cages). Recirculating
technology in mariculture v.s. open flow systems. Methods and techniques of induced
gamethogenesis. Juvenile production problems in hatchery. Suitability criteria for species
selection. Fisheries based mariculture (bluefin tuna, eels….). Environmental aspects of
mariculture practiced in floating cages and landbased tanks. Eutrophication risks connected to
organic effluents, biotoksins, carring capacity. Mineralization of organic matter, place and role of
phytoplankton and bacterioplankton communities in organically enreached marine environment.
Ecological standards in shellfish production. Zoning for mariculture in the context of ICZMP.
Criteria for site selection. SEA, EIA, Monitoring of fish and shellfish farms. Risk management in
mariculture.

PREREQUISITES FOR THE COURSE: General Ecology

TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Class attendance, seminars (optional).
EXAMINATION METHODS: Final exam will be oral.
REQUIRED LITERATURE:

Katavić, I. 2006. Ribogojstvo – Marikultura. Bogut, I. (ur), Udžbenik, Poljoprivredni fakultet, Osjek,
523 p.
Katavić et al., 2005. Integrated coastal zone management plan – Guidelines to marine
aquaculture planning , integration and monitoring in Croatia. Ministry of Aquaculture, Fisheries
and Rural Development, Zagreb, 78p.
Barnabe, G. 1994. Biological basis of fish culture. In: Aquaculture – biology and ecology of
cultured species, Barnabe, G. (ed), Rlis Horword Limited, 227-372.
Beveridge, M.C.M., 1996. cage culture. Fishing New Books, Blackwell, Oxford, 351 p.
Pillay, T.V.R. (1992). Aquaculture and environment. Oxford, Fishing New Books, Blackwell, 189
p.
Ottolenghi, F., Silvestri, C, Giordano, P., Lovatelli, A. New, M.B. 2004. Capture-based
aquaculture. The fattening of eels, groupers, tunas and yellowtails. Rome, FAO, 308 p.

GOSPODARENJE MOREM I ZAŠTITA 3+0+0 0+0+0

NASTAVNI SADRŽAJI:

Zaštita, očuvanje i upravljanje ekosustavima mora. Upravljanje posebno zaštićenim područjem.

Praćenje stanja okoliša. Ekološke i socio-ekonomske posljedice osnivanja posebno zaštićenih
područja. Procjena stokova. ZRP EU. Principi nacionalne politike. Kavezni uzgoj tuna.
Marikultura. Monitoring u marikulturi. Međunarodni instrumenti zaštite. Balastne vode. Ekološki
učinci kaveznog uzgoja. Ekološki učinci bazenskog uzgoja.
KOLEGIJI PRETHODNICI: Opća ekologija
UVJETI ZA POTPIS: Redovito pohađanje nastave, seminari (opcijski)
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Usmeni ispit
OBAVEZNA LITERATURA:
Katavić, I. 2007. Gospodarenje morem i zaštita mora, Rukopis, 109 str.
Katavić, I. 2007. Morsko ribarstvo. Hrvatska opća enciklopedija, Svezak IX. Leksikografski zavod
Miroslav Krleža
Vidas, D., 2007. Zaštita Jadrana. Školska knjiga Zagreb, 274 str.
Sparre, P.J. and Willmann, R. 1992. Introduction to tropical fish stock assessment. Part 1-manual.
FAO Fish. Tech. Pap. (306.1) Rev. 1:376 str.
Gayanilo, F.C.jr, Sparre, P., Pauly, D., 2005. FAO-ICLARM Stock Assessment Tools II (FISAT II).
Revised version. User’s guide. FAO Computerized Information Series (Fisheries) No.8, FAO,
2005. 168 str..

MARINE MANAGEMENT AND PROTECTION OF THE SEA 3+0+0 0+0+0

COURSE CONTENT:
Protection, conservation and management of the marine ecosystems. Management of specially
protected areas. Monitoring of environmental conditions. Ecological and socio-economical
consequence of establishing of specially protected areas. Stock estimation. Ecological and
Fisheries Protection Zone (ZRP) and EU. Principles of national policies. Cage tuna farming.
Mariculture. Monitoring in mariculture. International instruments of protection. Balast waters.
Ecological effects of cage farming. Ecological effects of pool farming.

PREREQUISITES FOR THE COURSE: General Ecology

TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Class attendance, seminars (optional).
EXAMINATION METHODS: Final exam will be oral.
REQUIRED LITERATURE:
Katavić, I. 2007. Marine management and protection of the Sea, Manuscript, 109 p.
Katavić, I. 2007. Marine Fisheries. Hrvatska opća enciklopedija, Svezak IX. Leksikografski zavod
Miroslav Krleža
Vidas, D., 2007. Protection of the Adriatic. Školska knjiga Zagreb, 274 p.
Sparre, P.J. and Willmann, R. 1992. Introduction to tropical fish stock assessment. Part 1-manual.
FAO Fish. Tech. Pap. (306.1) Rev. 1:376 p.
Gayanilo, F.C.jr, Sparre, P., Pauly, D., 2005. FAO-ICLARM Stock Assessment Tools II (FISAT II).
Revised version. User’s guide. FAO Computerized Information Series (Fisheries) No.8, FAO,
2005. 168 p .

4412 PONAŠANJE ŽIVOTINJA 0+0+0 2+2+0

NASTAVNI SADRŽAJI:

Uvod i povijest proučavanja ponašanja životinja, geni i ponašanje, prirodna selekcija i ponašanje,
učenje, živčani sustav i ponašanje, hormoni i ponašanje, razvoj ponašanja, traženje hrane,
antipredatorsko ponašanje, razmnožavanje i obabir partnera, briga za potomstvo i sustavi
parenja, sebičnost i altruizam, društvenost u životinja, komunikacija među životinjama, ponašanje
čovjeka
KOLEGIJI PRETHODNICI: Završen preddiplomski studij
UVJETI ZA POTPIS: Uspješno završen praktikum
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Usmeno
OBAVEZNA LITERATURA:
J. Goodenough, B. McGuire, R. A. Wallace: "Perspectives on Animal Behavior" 2nd ed, J. Wiley &
Sons, Chichester, 2000
J. Alcock: "Animal Behavior: An Evolutionary Approach" 9th ed, Sinauer Associates, Sunderland,
2009
P. B. J Slater: "Essentials of Animal Behaviour", Cambridge University Press, Cambridge, 1999
Barnard C. "Animal Behaviour: Mechanism, Development, Function and Evolution",
Pearson/Prentice Hall, London, 2004
 4412 ANIMAL BEHAVIOUR 0+0+0 2+2+0

COURSE CONTENT:
Introduction and the history of study of animal behaviour; genes and behaviour: behavioural
genetics; natural selection and evolution of behaviour; learning and cognition in animals,
neuroethology: nervous systems and behaviour; hormones and behaviour; development of
behaviour; foraging; antipredatory behaviour; sex and sexual selection; parental care; mating
ystems; socail behaviour, selfishness and altruism; communication in animals; human behaviour
PREREQUISITES FOR THE COURSE: Finished undergraduate study (BSc degree)
TERMS FOR RECEIVING THE SIGNATURE: Successful accomplishment of Animal Behaviour
Laboratory
EXAMINATION METHODS: Oral
REQUIRED LITERATURE:
J. Goodenough, B. McGuire, R. A. Wallace: "Perspectives on Animal Behavior" 2nd ed, J. Wiley &
Sons, Chichester, 2000
J. Alcock: "Animal Behavior: An Evolutionary Approach" 9th ed, Sinauer Associates, Sunderland,
2009
P. B. J Slater: "Essentials of Animal Behaviour", Cambridge University Press, Cambridge, 1999
C. Barnard: "Animal Behaviour: Mechanism, Development, Function and Evolution",
Pearson/Prentice Hall, London, 2004

UPRAVLJANJE PRIRODNIM POPULACIJAMA 2+2+0 0+0+0

NASTAVNI SADRŽAJI:
Vrijednost prirodnih resursa i biološke raznolikosti, problem u očuvanju i zaštiti; Odgovornost za
prirodne resurse; Upravljanje zaštićenim područjima, obnavljanje i popravljanje kvalitete staništa,
uloga zaštićenih područja u zaštiti vrsta od posebnog interesa; Upravljanje zaštićenim vrstama u
zarobljeništvu; Utjecaj turizma na divlje životinje u zaštićenim područjima, kapacitet posjetitelja u
zaštićenim područjima; Invazivne vrste i biološka invazija, ostali sukobi između ljudskih utjecaja i
divljih organizama; Ekologija divljih populacija, socijalna organizacija i ponašanje; Monitoring
divljih populacija; Potreba za zaštitom i upravljanjem divljih populacija; Tehnike i problem u
upravljanju divljih populacija s naglaskom na upravljanje velikim predatorima; Lov, ribolov i
športski ribolov u modernom društvu; Odnos čovjeka i divljih životinja i kontrola njihove štete;
Vrste od komercijalnog, rekreativnog i edukativnog značaja za čovjeka; Životinje u gradovima i
urbanism sredinama; Utjecaj izgradnje autocesta i utjecaj požara na divlje populacije;
Iskorištavanje kralješnjaka i kralješnjaci kao nametnici.

KOLEGIJI PRETHODNICI: Vertebrata (odslušan), Opća ekologija (odslušan)

UVJETI ZA POTPIS: Prisustvovanje predavanjima i vježbama.
NAČIN POLAGANJA ISPITA: Seminari i usmeni ispit

OBAVEZNA LITERATURA:
1. Anderson, S. H. (2002): Managing our wildlife resources. Prentice Hall, Inc., Englewood
Cliffs, N. J. 554pp.
2. Bolen, E. G. and W. L. Robinson. (1999): Wildlife Ecology & Management. Prentice Hall,
Upper Saddle River, NJ. 605 pp.
3. Bookhout, T. A. (1996): Research and management techniques for wildlife and habitats.
The Wildlife Society, Bethesda, Maryland. 740 pp.