Download as pdf or txt
Download as pdf or txt
You are on page 1of 21

Biologi

i udvikling
Mikrobiologi

Frank Grønlund Jørgensen


Biologi i udvikling B-niveau
Mikrobiologi
© 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS

Kopiering fra denne bog må kun finde sted på institutioner eller virksom­heder
der har indgået aftale med Copydan Tekst & Node, og kun inden for de rammer,
der er nævnt i aftalen.

Forlagsredaktion: Marianne Frøsig


Billedredaktion: Frank Grønlund Jørgensen & Birthe Møller Nielsen
Illustrationer:
Henning Dalhoff: Figur 108, 111, 118, 124-126, 128.
Elin Steffensen, Griffle: Figur 106-107, 112, 115, 117, 119-123.
Frank Grønlund Jørgensen: Figur 127.
Omslag: Birthe Møller Nielsen, Frank Grønlund Jørgensen og Elin Steffensen.
Grafisk tilrettelægning: Elin Steffensen, Griffle.

1. udgave, 1. oplag 2017


ISBN 978-87-90363-94-9

Udgivet af Nucleus – Foreningen af Danske Biologers Forlag ApS


www.nucleus.dk

Trykt hos Specialtrykkeriet Arco A/S


Printed in Denmark 2017

Forfatter
Frank Grønlund Jørgensen
IKROBIOLOGI
Mikrobiologi er den gren af biologi a cc
der beskæftiger sig med mikroorganis-
mer altså de organismer der er for små
til at kunne ses med det blotte øje. Alle
prokaryoter er mikroorganismer, men
der findes også mange eukaryote mi-
kroorganismer som fx gærsvampe, se
figur 104.
b

Mikrobiologi Figur 104. Fotos af alminde-


– et historisk overblik lig bagegær (Saccharomyces
I og med at mikroorganismer ikke kan cerevisiae).
a. Gær købt i supermarked.
ses med det blotte øje, blev de først op-
b. Kolonier af gærceller på
daget relativt sent i forhold til man- YEPD-agar.
ge andre organismer. I 1674 lykkedes c. Enkelte gærceller set i lys­
det for Antonie van Leeuwenhoek ved mikroskop.
hjælp af et hjemmelavet mikroskop at
se og beskrive individuelle mikroorga-
nismer, se figur 105. I løbet af en tiårig
periode beskrev han bl.a. sædceller og
bakterier. ste afdeling blev tilset af lægestuderen-
de, mens den anden blev tilset af jor-
Barselsfeber og håndhygiejne demorstuderende.
Vi skal helt op til midten af 1800-tallet Semmelweis var optaget af at forstå år-
før bakteriers årsag til mange sygdom- sagerne til sygdommen, og han under-
me blev anerkendt. søgte bl.a. forskellen i dødelighed i de
Et af de store helbredsproblemer i den to forskellige klinikker på hospitalet i Linse
periode var den såkaldte barsels­feber Wien før og efter 1841, se figur 106 ­side
der hvert år kostede et stort antal mød- 98. Semmelweis beskriver en situa­tion
re livet. Risikoen for at dø af barselsfe- hvor en mandlig kollega dør af barsels-
ber var markant højere på flere fødeaf- feberlignende symptomer efter at ha-
delinger end den historisk havde været ve skåret sig i fingeren under en obduk­
ved hjemmefødsler, men man kendte tion. Denne episode leder ham til ide-
på daværende tidspunkt ikke årsagen en om at sygdommen må skyldes et
til den højere dødelighed. ukendt stof, der kan overføres fra dødt
Et indirekte, men vigtigt skridt på ve- væv til levende mennesker. Semmel-
jen til løsning af problemet kom fra weis kaldte det giftigt ligstof. I mod-
den ungarske læge Ignaz Semmelweis. sætning til de jordemorstuderende ud-
Semmelweis var ansat på et hospital i førte de lægestuderende også obdukti- Figur 105. Kopi af Leeuwen-
Wien fra 1846-1849. Hospitalet havde oner af lig. hoeks hjemmelavede mikro-
siden 1833 haft to forskellige fødeaf- skop. Mikroskopet er ganske
lille og håndholdt. Objektet
delinger. I starten blev de to fødeafde- Semmelweis’ hypotese var at de syg-
anbringes foran linsen, og
linger drevet på samme måde, men det domsfremkaldende partikler blev over- man ser gennem linsen fra
ændrede sig i 1841 hvorefter den før- ført via de lægestuderendes hænder fra den anden side.

© 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS Mikrobiologi 97


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
lig til de kvinder, de hjalp på fødeafde- bart derefter til et niveau svarende til
lingen. Derfor indførte Semmelweis i den anden fødeklinik på hospitalet, se
1847 en regel om at de lægestuderen- figur 107.
de altid skulle vaske deres hænder i en Semmelweis’ data ser ud til at vise en
klorkalk-opløsning før de tilså kvinder- sammenhæng mellem indførsel af bed-
ne på fødeafdelingen. Dødeligheden re håndhygiejne og risikoen for at kvin-
i den første fødeklinik faldt umiddel- der dør af barselsfeber, og data ser der-
for ud til at understøtte hans hypote-
Dødsfald af barselsfeber (%)
se. Semmelweis’ ideer passede dog ik-
18 Første klinik ke med tidens gængse forståelse af syg-
16 Anden klinik dom, og da han ikke kunne fremvise
det sygdomsfremkaldende stof og der-
14
for heller ikke redegøre tilfredsstillen-
12
de for en mulig årsagssammenhæng,
10 mødte hans ideer stor modstand blandt
8 hans kollegaer. Vigtigheden af hånd-
6 vask og hygiejne blev derfor ikke i før-
ste omgang alment accepteret.
4
2
I dag bruges forskellige desinfek-
0 tionsmidler rutinemæssigt på alle
1830 1832 1834 1836 1838 1840 1842 1844 1846 1848 År ­hospitaler, prøv eventuelt selv at un-
Figur 106. Antal dødsfald pga. barselsfeber i % af antal fødsler på de to forskel- dersøge effekten af håndsprit eller an-
lige fødeklinikker på hospitalet i Wien i perioden fra 1833 til 1847. Semmelweis dre desinfektionsmidler. Semmelweis
blev ansat i 1846. Fra 1841 blev den første klinik tilset af lægestuderende mens stoppede på hospitalet i marts 1849,
den anden klinik blev tilset af jordemorstuderende.
og først mange år senere, efter Sem-
melweis’ død i 1865, blev mikroorga-
Dødsfald af barselsfeber (%)
Figur 107. Antal dødsfald pga. barselsfeber
20 i % af antal fødsler på den første fødeklinik
18 på hospitalet i Wien i perioden fra januar
1845 til marts 1849. Semmelweis indførte
16 det nye reglement for håndvask i maj 1847.
14
12
10
8
6
4
2
0
J F M A M J J A S O N D J F M A M J J A S O N D J F M A M J J A S O N D J F M A M J J A S O N D J F M
1845 1846 1847 1848 1849
Måned og år

98 Mikrobiologi © 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
0 min. 10 min. 20 min. 30 min. 40 min. 50 min. 60 min.
Negativ
kontrol
Figur 108. Resultater fra kim-
nismers sygdomsfremkaldende rol- vikling af vacciner til bl.a. miltbrand faldsforsøg i et klasselokale. Er
le og hygiejnens vigtighed anerkendt og rabies (hundegalskab), læs mere om der en sammenhæng mellem
den tid agarpladen har været
af lægevidenskaben. Blandt de man- vacciner i kapitlet Immunsystemet si-
udsat for luften i lokalet og
ge videnskabsfolk der bidrog til den- de 53f. antallet af kolonier?
ne erkendelse, var især Robert Koch og
Louis Pasteur. Sygdomsfremkaldende bakterier
Robert Koch er ophavsmand til Kochs
Pasteurisering, postulater. De fire postulater lyder i en
kimfald og vaccination let moderniseret udgave:
Louis Pasteur var en af datidens største • Mikroorganismen skal findes i rige-
videnskabsmænd. Han var medvirken- lige mængder i alle organismer der
de til at afkræfte teorien om spontan lider af sygdommen, men ikke i ra-
genese ved at vise at bakterievækst i en ske organismer.
steriliseret væske kan opstå på grund af • Mikroorganismen skal kunne isole-
kimfald fra luften, se figur 108 og læs res fra den syge organisme og dyrkes
mere i Biologi i udvikling C-bog side i renkultur.
13. • Mikroorganismen fra den dyrke-
Pasteur arbejdede også med forskel- de renkultur bør forårsage sygdom
lige gæringsprocesser og opfandt en når den introduceres i en rask
metode til at behandle mad og drik- organisme.
kevarer så man mindsker risikoen for • Mikroorganismen skal kunne gen-
skadelig bakterievækst. Metoden kal- isoleres fra den syge testvært og væ-
des i dag for pasteurisering og består i re identisk med den originale mi-
at man opvarmer fødevaren, typisk til kroorganisme. Figur 109. Øl og mælk er
mellem 60 og 80 ˚C i kortere eller læn- eksempler på drikkevarer der
gere tid. Derved dræbes de fleste ska- Postulaterne forklarer hvordan man ofte er pasteuriseret.

delige mikroorganismer uden at føde- kan påvise en årsagssammenhæng


varens smag og ernæringsværdi for- mellem infektion med en mikroorga-
ringes, hvilket typisk vil være tilfæl- nisme og en bestemt sygdom. Vi ken-
det ved en kogning. Pasteurisering er der flere eksempler på infektionssyg-
en væsentlig årsag til at mange typer domme hvor et eller flere af postula-
mad og drikkevarer har en relativ lang terne ikke rigtigt passer, men hvor vi
holdbarhed, se figur 109. Pasteurs ar- alligevel accepterer at der er en årsags-
bejde var med til at fremme ideen om sammenhæng. I forhold til det første
at mikroorganismer er årsag til mange postulat ved vi, at man kan være bærer
forskellige sygdomme, og han var også af en mikroorganisme uden at denne
en af de første der arbejdede med ud- forårsager sygdom, mens mikroorga-

© 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS Mikrobiologi 99


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
Figur 110. Kolonier af den
kolerafremkaldende bakterie
(Vibrio cholerae) på henholds-
vis blodagar og TCBS-agar.

nismen i andre situationer vil resulte- art. Mange meget forskellige bakterier
re i sygdom. Der er også mange mikro- kan udveksle gener med hinanden fx
organismer vi ikke er i stand til at dyr- ved hjælp af plasmider, og artsbarrie-
ke i renkultur, og flere forskellige typer ren er derfor ikke på samme måde be-
af bakterier kender vi kun fordi vi har grænsende for genoverførsel som den
fundet deres DNA. Læs mere om hvor- er hos de fleste planter og dyr. Bakte-
dan man isolerer og dyrker bakterier i riearter er derfor i stedet typisk bestemt
renkultur på side 101f. ud fra genetisk lighed og fysiologiske
Udfordringerne til trods fungerer po- egenskaber.
stulaterne alligevel som vigtige over- Bakterier er ekstremt talrige på jorden.
ordnede principper inden for mikro- Der er på nuværende tidspunkt kun
biologi og infektionsbiologi. Kochs beskrevet ca. 13.000 forskellige arter,
laboratorie er også kendt for at have men vi ved at der er mange flere. Typisk
­udviklet faste dyrkningsmedier til bak- kræves det at man er i stand til at isole-
terier, og det er her de første agarba- re og dyrke en bakterie i en renkultur,
serede dyrkningsmedier bliver lavet, før man kan beskrive den på tilfreds-
se figur 110. Agarpladen blev hurtigt stillende vis. Der er mange bakterier vi
et vigtigt værktøj og var medvirken- endnu ikke har fundet ud af at dyrke i
de til at Robert Koch og hans kollega- renkultur, og derfor kender vi dem som
er kunne isolere og rendyrke de forskel- nævnt kun ud fra deres DNA. DNA-stu-
lige bakterier der forårsager miltbrand, dier af jordprøver har vist at der mulig-
tuberkulose og kolera, og demonstre- vis findes mellem få hundrede og flere
re deres sygdomsfremkaldende egen- hundrede tusinde forskellige bakterie-
skaber. arter pr. gram jord, men tallene er sta-
dig meget usikre.
Der er bakterier alle vegne
Da de fleste bakterier primært forme- Bakterier er vigtige for vores helbred
rer sig aseksuelt, er det biologiske arts- De fleste ved at bakterier kan medføre
begreb ikke særlig godt til at definere sygdom, men nogle bakterier er også
hvornår to bakterier tilhører samme gavnlige for vores helbred. En gennem-

100 Mikrobiologi © 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
snitlig menneskekrop indeholder ca. håbet om at bakterierne fra den raske
10 gange så mange bakterier som men- persons tarmsystem kan have en gavn-
neskeceller. Bakterierne findes normalt lig effekt på den syge. Flere forsøg har
på kroppens indre og ydre overflader, vist lovende resultater, men der er sta-
heraf langt de fleste i vores tarmsystem, dig mange uafklarede spørgsmål inden
men der findes også mange bakterier på for dette forskningsområde.
vores hud og slimhinder. Finder man
bakterier i blod eller væv er der tale om Identifikation af bakterier
en infektion, hvor bakterierne har gen- I dag benyttes DNA-undersøgelser of-
nembrudt kroppens ydre forsvarsbarri- te til at identificere bakterier, men det
ere, og dem vil immunforsvaret derfor fungerer bedst hvis den bakterie man
forsøge at bekæmpe. undersøger, allerede er kendt og be-
skrevet med mere traditionelle me-
Der forskes meget i hvordan bakteri- toder. Figur 111 viser en oversigt over
er påvirker vores helbred. Der findes hvordan en man kan identificere en
firmaer der tilbyder at lave DNA-ana- bestemt bakterie fra en prøve. Først
lyser af den bakterielle mangfoldig- isolerer og dyrker man den i renkul-
hed i ens afføring. De senere år er fle- tur, og derefter undersøger man bak-
re begyndt at eksperimentere med at terierne og bakteriekoloniens form og
lave fæcestransplantationer. Ved en farve. Desuden undersøger man den
fæcestransplantation overføres tarm- med en række biokemiske tests og en
bakterier fra en rask til en syg person i række forskellige farveteknikker.

Figur 111. Bakterier kan dyrkes


i renkultur og kan derefter
identificeres ud fra forskellige
diagnostiske tests.

Indsamling Udspredning af Bakteriekoloni Udspredning af


af prøve prøven på et udvælges til udvalgt bakterie
eller flere forskellige videre analyse på ny agarplade
medier så der kan dannes
renkulturer

Bakterie X

De enkelte kolonier Biokemiske analyser Identifikation


er genetisk identiske, og undersøgelser af af bakterie
og bakterier derfra bakterier i mikroskop
kan nu bruges til
forskellige analyser

© 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS Mikrobiologi 101


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
Figur 112. Bakteriekoloniers
form er et vigtigt kendetegn.
Desuden er farve og tør eller
fugtig overflade også vigtige Konveks Flad Konkav Udflydende
karakteristika.

Cirkulær Uregelmæssig Trådet

Renkulturer og vækstmedier de enkelte kolonier. Hver koloni består


Et af de vigtigste redskaber inden for ofte af millioner af identiske bakteri-
mikrobiologi er isolering og dyrkning er, også kaldet kloner, der er skabt ved
af renkulturer. Ved hjælp af pladeud- hjælp af ukønnet formering. Hvis man
spredningsmetoden som er vist i figur vælger en af kolonierne og udspreder
111 side 101, kan man sprede en prø- bakterierne derfra på en ny plade, kan
ve med bakterier ud over en agarplade. man skabe en renkultur på den pågæl-
Efter opformering i en passende peri- dende plade. Hvis prøven indeholder
ode kan man se og arbejde videre med for mange bakterier til at man får indi-
viduelle kolonier på pladen, kan man
med fordel fortynde prøven før ud-
spredning, læs mere på side 109ff om
seriefortyndinger og bestemmelse af
Figur 113. E. coli-bakterier får bakteriekoncentration i prøver.
et karakteristisk udseende
udstrøget på EMB-agar. Den- Koloniernes størrelse, form, farve og
ne agar selekterer for gram­
overflade kan bruges til at adskille for-
negative bakterier, heriblandt
E. coli.
skellige typer bakterier fra hinanden.
Figur 112 viser eksempler på de mest
almindelige kendetegn ved kolonier.
Ved at dyrke renkulturer på forskellige
næringsmedier kan man også adskil-
Figur 114. To forskellige le mange bakterier fra hinanden. Det
bakterier udstrøget på en kan fx være næringsmedier der inde-
agar­plade med MacConkey- holder antibiotika eller andre stoffer,
agar. MacConkey-agar kan
som man ved at nogle, men ikke alle
bruges til at skelne mellem
bakterier der kan fermentere bakterier kan vokse i nærheden af, se
laktose, og dem der ikke kan. ­figur 113. Det kan også være nærings-
I det første tilfælde fremstår medier der mangler et eller flere næ-
mediet rødligt, og i det andet ringsstoffer, som gør at kun nogle bak-
tilfælde fremstår det gulbrunt. terier kan vokse på mediet. Sidst, men
Farven skyldes en pH-indikator
ikke mindst, kan det være nærings-
i mediet.
medier hvor bestemte bakterier dan-

102 Mikrobiologi © 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
Figur 115. Ved mikroskopering
af bakterier kan deres form
og organisering undersøges
Kokker Diplokokker Streptokokker Stafylokokker nærmere.

Stavformede Stavformede Kæder


baciller med flageller af baciller Skrueformede Seglformede

ner meget genkendelige kolonier eller Forskellige farveteknikker er også brug-


skaber en særlig farvereaktion i mediet, bare til at adskille bakteriearter fra hin-
fordi de enten kan eller ikke kan om- anden. En af disse metoder kaldes for
danne et af næringsstofferne i medi- gramfarvning. Gramfarvning er en
et, se figur 114. metode til at adskille bakterier på bag-
grund af den overordnede opbygning
Mikroskopi af bakterier af deres cellevæg, så de enten fremstår
Ser man på bakterierne i et lysmikro- lilla (grampositive) eller røde (gram-
skop ved stor forstørrelse, eller ved negative), når man ser på dem i et lys-
hjælp af et elektronmikroskop som mikroskop.
kan lave endnu større forstørrelse, så
kan man se bakteriernes grundlæggen- Biokemiske forskelle på bakterier
de form og hvordan de organiserer sig. Bakteriearter er tilpasset forskellige ni-
De fleste bakterier er enten kuglefor- cher i naturen og er derfor i stand til at
mede (kokker), stavformede (baciller) el- udføre forskellige biokemiske reaktio-
ler har forskellige former for buet eller ner. Det afgørende er ofte om bakteri-
snoet form. Kokker og baciller indde- erne danner et bestemt enzym i et be-
les ydermere efter hvordan de organi- stemt miljø eller ej, og dette kan udnyt-
serer sig. Figur 115 viser de mest almin- tes til at adskille forskellige bakterier
delige former og organisationsformer, fra hinanden. Nogle bakterier er fx ob-
mens figur 116 viser elektronmikrosko- ligat aerobe og kan altså ikke leve uden
pifotos af udvalgte bakterier. oxygen, mens andre er obligat anaerobe
og kan kun leve og dyrkes i oxygenfrie

a b
Figur 116. Farvede elektron­
mikroskopifotos af henholds-
vis E. coli-bakterie og sporer
fra miltbrandbakterier.

© 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS Mikrobiologi 103


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
Bakterie

Escherichia coli Bacillus cereus Staphylococcus epidermis

Mikroskopi og farvning

Bakterieform og lejring Enkeltstående stavformede (bacille) Enkeltstående eller korte Grupper af kokker
kæder af stavformede (bacille)
Bevægelighed Bevægelig Bevægelig Ikke bevægelig

Gramfarvning Negativ (rød) Positiv (lilla) Positiv (lilla)

Flagel Ja Ja Nej

Enzymtest

Katalaseaktivitet Positiv Positiv Positiv

Oxidaseaktivitet Negativ Negativ Negativ

Substratspecificitet

Fermentering af laktose Positiv Negativ Positiv

Fermentering af manitol Positiv Negativ Negativ

Figur 117. Udvalgte karak-


teristika for tre forskellige miljøer. Mange bakterier er fakultativt ligne og adskille selv meget fjernt be-
bakterier der kan bruges til anaerobe og kan derfor både leve med slægtede bakteriers DNA fra hinan-
identifikation. Koloniernes
og uden oxygen, men de udfører typisk den. Man kan udvinde og opformere
form afhænger af agartypen.
Det er ikke vist her, selvom det forskellige biokemiske processer i de to DNA fra fx en vandprøve eller jordprø-
også bruges i identifikation. miljøer. På grund af bakteriernes evne ve og se hvor mange forskellige bakte-
til at danne forskellige enzymer kan de riers 16sRNA man kan finde. Denne
omdanne forskellige substrater, og det- type DNA-prøve kaldes også for ­eDNA,
te bruges også til at adskille bakterier- det står for environmental DNA. Når
ne. Figur 117 viser et eksempel på hvor- man analyserer eDNA-prøver, finder
dan en kombination af de forskellige man selvfølgelig 16sRNA fra mange
metoder kan benyttes til at identifice- kendte bakterier, og disse er nemme
re menneskelige tarmbakterier. at identificere, men man finder også
16sRNA fra ukendte bakterier, så dis-
PCR-baserede metoder se bakteriearter kendes på nuværen-
Ved hjælp af PCR-teknikken kan man de tidspunkt alene ud fra deres DNA
opformere 16sRNA-genet fra bakterier i miljøet.
– læs om teknikken i Biologi i udvik-
ling C-bog side 203 ff. Dette gen koder Mikrobiel vækst
for en del af ribosomets opbygning, De fleste mikroorganismer er i stand til
og på grund af dets afgørende betyd- at formere sig ved ukønnet formering.
ning for organismernes livsfunktioner For bakterier betyder det at en bakte-
udvikler genet sig tilpas langsomt til rie under de rette omstændigheder kan
at man kan bruge det til at sammen- dele sig og blive til to genetisk identi-

104 Mikrobiologi © 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
ske bakterier, der så hver især igen kan Optagelseshastigheden af næringsstof-
dele sig. Denne type formering min- fer og hastigheden af cellens biokemi-
der overfladisk lidt om mitotiske celle- ske reaktioner afhænger direkte af tem-
delinger hos eukaryoter. Der er dog fle- peraturen. Ved højere temperaturer be-
re væsentlige forskelle. En af dem er at væger molekyler sig hurtigere, og der-
eukaryote celler normalt er diploide og for sker diffusionen også hurtigere. Ha-
har flere stavformede kromosomer der stigheden på enzymatiske ­reaktioner
først skal kopieres ved DNA-replikati- afhænger bl.a. af hvor hurtigt substrat
on og dernæst fordeles korrekt mellem og enzym binder til hinanden, og den-
de to datterceller, læs mere om mitosen ne hastighed er ligeledes afhængig af
i Biologi i udvikling C-bog side 174ff. molekylernes bevægelseshastighed.
Bakterier er normalt haploide og har Dvs. at mikroorganismernes vækst
et enkelt cirkulært kromosom. Kromo- også stiger med øget temperatur, dog
somet kopieres med start i det såkald- kun til et punkt. Alle mikroorganismer
te replikationsstartsted. Når kromoso- har et temperaturoptimum hvor deres
met er blevet kopieret, adskilles de to væksthastighed er højst mulig, ved
identiske kromosomer i hver sin ende højere temperatur denaturerer mikro­
af cellen der så deles på midten og dan-
ner to nye bakterier, se figur 118.
Figur 118. Bakterier deler sig
Vækstfaktorer og væksthastighed ved en proces hvor bakterie-
Hvor hurtigt en mikroorganisme kan kromosomet kopieres og cel-
len vokser og deler sig i to.
dele sig, afhænger af mange forskelli-
Bakterie med ringformet kromosom
ge faktorer som fx temperatur, pH og
koncentrationen af nødvendige næ-
ringsstoffer. Forskellige mikroorganis-
mer har ved optimale vækstbetingelser
meget forskellige væksthastigheder der
Kromosomet er kopieret og
bl.a. afhænger af deres evne til at pro-
delingsprocessen er begyndt
ducere nødvendige enzymer og opta-
ge næringsstoffer fra mediet. Da opta-
gelsen af næringsstoffer normalt fore-
går ved diffusion, så har størrelsen af
cellerne også stor betydning. Mindre
celler har normalt en større overflade i
forhold til deres volumen end store cel-
ler, men formen er også vigtig. Jo større
overflade/volumen-forholdet er, jo me-
re effektiv er diffusionen igennem cel-
lemembranen. Det er en af flere grunde
til at bakterier som Escherichia coli nor-
malt har væsentlig højere vækstrater
end fx gærceller, der er meget større.
Delingsprocessen er afsluttet

© 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS Mikrobiologi 105


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
organismernes enzymer nemlig, og et temperaturoptimum ved 37 ˚C eller
derved dør mikroorganismerne. For- lidt derover, og de dyrkes derfor også
skellige mikroorganismer er tilpasset bedst i et varmeskab ved ca. 37 grader.
livet i forskellige miljøer og dermed og- Figur 119 viser hvordan væksthastig-
så forskellige temperaturer. Mikroorga- heden af forskellige bakteriegrupper
nismer der er tilknyttet os, har typisk afhænger af temperaturen.

Vækstrate Fødevaresikkerhed
Temperaturoptimum
Mad og drikkevarer er hyppige kilder
til bakterielle infektioner og dermed
Mesofile bakterier
til sygdom hos mennesker. Derfor er
Termofile bakterier det vigtigt at vi kender til god køkken-
hygiejne og behandler og opbevarer
fødevarer på hensigtsmæssige måder.
Der er bakterier alle vegne, også på vo-
res hænder, og det er meget let at kom-
me til at overføre bakterier til en mad-
Temperatur- vare under tilberedning. Hvis denne
minimum Temperatur- madvare derefter giver bakterien gode
maksimum
vækstbetingelser – fx hvis den opbeva-
0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 res for varmt – så kan få bakterier i lø-
Temperatur (°C) bet af nogle timer bliver til mange og
Figur 119. Bakteriers vækst afhænger af temperaturen og deres genetiske dis- forårsage alvorlig sygdom.
positioner. Bakterier der lever bedst omkring vores kropstemperatur, kaldes for
mesofile bakterier. Termofile bakterier lever bedst ved højere temperaturer. Bakteriers afhængighed af tempera-
tur forklarer hvorfor vi skal opbevare
mange typer fødevarer på køl, da det
Antal registrerede tilfælde pr. år begrænser væksten af uønskede bak-
terier. Ligeledes finder vi her forklarin-
5.000
gen på hvorfor det er vigtigt at fx fersk
kyllingekød skal opvarmes tilstrække-
4.000 ligt hele vejen igennem under tilbered-
ning. De høje temperaturer vil dræbe
3.000 mange patogene bakterier som fx Sal-
monella og Campylobacter hvis de skul-
le være til stede, se figur 120.
2.000

Eksponentiel vækst
1.000 Under de rette omstændigheder kan en
Campylobacter
Salmonella bakterie som E. coli dele sig ca. hvert ty-
0 vende minut. Det betyder, at antallet
2000 2005 2010 2015 År af bakterier i en prøve potentielt kan
Figur 120. Bakterier i madvarer. Antal danskere diagnosticeret med salmonella- fordobles hvert tyvende minut. Selv-
eller campylobacter-infektion i perioden fra 2001-2016. om man kun starter med en enkelt bak-

106 Mikrobiologi © 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
terie, kan der i løbet af 7-8 timer en- Ved at sammenligne ovennævnte to
de med at være flere millioner. Denne ligninger med hinanden kan man ved
type udvikling hvor antallet af indivi- hjælp af en potensregneregel vise at
der ændres med en fast faktor i en gi- fremskrivningsfaktoren a i ligning (1)
ven tidsperiode, kaldes for eksponen- er lig med ek i ligning (2).
tiel udvikling eller eksponentiel vækst.
Generelt kan en eksponentiel udvik- Antal bakterier fordobles
ling være både aftagende og voksende, i hver generation
men i forhold til bakteriel vækst er det Hvis vi kender generationstiden for
primært relevant at tale om voksende en bakterie og antager at alle bakteri-
eksponentielle udviklinger. Eksponen- er deler sig samtidigt, kan vi omskri-
tiel vækst af bakterier kan kun fortsæt- ve udtrykket i ligning (1) til et udtryk
te indtil en abiotisk eller biotisk faktor som funktion af antal generationer.
begrænser væksten. For bakterier vil Ved ubegrænset vækst deler bakterier-
det typisk ske efter nogle timer eller da- ne sig med en konstant rate, og derfor
ge, afhængigt af omstændighederne. fordobles antallet af bakterier i hver ge-
neration. Derfor må fremskrivnings- Generation Antal bakterier
Eksponentiel vækst hos bakterier kan faktoren a være 2, når vi regner tiden i
0 1
beskrives med det matematisk udtryk antal generationer. Hvis vi kalder an-
1 2
der er vist i ligning (1): tallet af bakterier i første generation
N0 og antal generationer siden start 2 4
(1) y = b ∙ ax
for t, så kan antallet af bakterier efter 3 8
I dette udtryk er y antallet af bakteri- et bestemt antal generationer (Nt) iføl- 4 16
er til tidspunktet x. Begyndelsesvær- ge den eksponentielle vækstmodel be-
5 32
dien b er antal bakterier fra start (x = stemmes til at være:
6 64
0), og a er en konstant der kaldes for
(3) Nt = N0 ∙ 2t
7 128
fremskrivningsfaktoren. Fremskriv-
ningsfaktoren viser hvor mange gan- I dette tilfælde er det klart at fordob- 8 256
ge y stiger, hvis x stiger med 1. Frem- lingstiden er præcis en generation, da 9 512
skrivningsfaktoren a kan også skrives det jo var præmissen for udledningen
10 1.024
som a = 1 + r, hvor r kaldes for funkti- af dette funktionsudtryk. Tabellen i fi-
onens vækstrate. Vækstraten r angiver gur 121 viser hvordan antallet af bak- 11 2.048
hvor stor en procentdel y vokser med, terier stiger i løbet af 20 generationer, 12 4.096
hvis x stiger med 1. Bemærk at fordi vi hvis man starter med en enkelt bakte- 13 8.192
her taler om et voksende antal bakte- rie i generation 0.
14 16.384
rier, er b > 0 og a > 1.
15 32.768

Nogle gange ser man ligninger for eks- 16 65.536


ponentiel vækst på formen vist i lig- 17 131.072
ning (2): 18 262.144
(2) y = b ∙ ek ∙ x 19 524.288
Figur 121. Antallet af bakterier fordobles for
hver generation ved ubegrænset vækst. 20 1.048.576

© 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS Mikrobiologi 107


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
a Bakteriers generationstid
Koncentration af E. coli (x 1.000 bakterier/L) Hvis vi ønsker at bestemme en bakte-
ries generationstid ud fra forsøgsda-
350
ta, kan det gøres med eksponentiel re-
gression. Figur 122 viser et eksempel på
300
regression udført på data fra et forsøg
y = 2.464e0,0202x med E. coli-bakterier. Vi starter med at
250
R2 = 0,9830 beregne fremskrivningsfaktoren a, ud
fra regressionsligningen.
200
a = ek = e0,0202 = 1,020405
150
Vi beregner nu vækstraten r.
r = a - 1 = 1,020405-1 = 0,020405 ≈ 2 %
100

Hvilket vil sige, at antallet af E. coli-


50
bakterier i dette forsøg i gennemsnit
0
er steget ca. 2 % pr. minut.
0 50 100 150 200 250
Tid (minutter) En bakteries generationstid er det sam-
me som fordoblingstiden, og fra mate-
b
matik ved vi at man kan finde fordob-
Residual (x 1.000 bakterier/L)
lingstiden (T2) for en eksponentiel ud-
10
vikling vha. følgende udtryk:

log(2)
5 (4) T2 =
log(a)

0 Generationstiden måles i den enhed


50 100 150 200 250 der er brugt i data, så i dette eksempel
Tid (bakterier/L) måles den i minutter, og vi får altså at
-5
generationstiden for E. coli-bakterier-
ne i det viste forsøg er:
-10
log(2)
T2 = ≈ 34,3 minutter
log(1,020405)
-15
som svarer til 34 minutter og 18 sekun-
der.
-20

Som nævnt kan eksponentiel vækst


-25
ikke fortsætte evigt, og væksten af en-
hver population vil på et tidspunkt bli-
Figur 122. Data fra et vækstforsøg med E. coli-bakterier med eksponentiel ve begrænset. Bakterier følger derfor
regression og tilknyttet residualplot. Kan der være en biologisk forklaring på typisk et bestemt mønster når de ko-
at sidste målepunkt ser ud til at ligge væsentligt under den eksponentielle loniserer et nyt miljø. Dette mønster
model?
kaldes for den mikrobielle vækstkurve.

Illustration 18 fgm

elin@griffle.dk Bognavn Biologi i udvikling b


108 Mikrobiologi ©tlf.2017 Frank Grønlund Jørgensen
40520989 Kunde og Nucleus
Nucleus Forlag ApS
forlag
Tegner ∙ ISBN
Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau Elin Steffensen
978-87-90363-94-9
Den mikrobielle vækstkurve Antal bakterier i prøven
Det generelle forløb af den mikrobielle
Nølefase Eksponentiel Stationær fase Dødsfase Få celler
vækstkurve er vist i figur 123. Den første fase Levende
fase kaldes for nølefasen og er en perio- celler
de hvor bakterierne danner de nødven- Døde celler
dige enzymer og tilpasser deres livspro-
cesser til det givne miljø. Denne perio-
de kan vare kortere eller længere tid og
er generelt kendetegnet ved at antallet
af bakterier er nogenlunde konstant.
På et tidspunkt begynder bakterierne
Tid fra start
at vokse i antal, og populationen be- Figur 123. Den mikrobielle
finder sig nu i den eksponentielle fase. stand til at gå i en slags dvaletilstand i vækstkurves fire faser.
stedet for at dø og kan forblive i denne
I den eksponentielle fase deler bakteri- tilstand i meget lang tid indtil miljøfor-
erne sig hurtigere, og der dannes flere holdene eventuelt igen bliver gunstige.
nye bakterier end der dør med en no-
genlunde konstant vækstrate. Antallet Afhængigt af dyrkningsforholdene kan
af bakterier følger derfor i denne perio- man påvirke hvor længe bakterierne
de en eksponentiel vækstfunktion ind- vil befinde sig i de forskellige faser.
til væksten bliver begrænset. Væksten Hvis man ser på kolonier på en agarpla-
begrænses typisk af mangel på ressour- de, gennemgår hver koloni den mikro-
cer eller plads. bielle vækstkurve, og ved at tage bak-
terier fra en koloni og udplade dem på
Den efterfølgende fase kaldes for den nye agar­plader kan man genstarte en
stationære fase og er kendetegnet ved at ny nølefase efterfulgt af de andre fa-
populationsstørrelsen forbliver nogen- ser. Ved dyrkning af bakterier i særlige
lunde konstant, da antallet af nydanne- gæringstanke er det muligt løbende at
de bakterier svarer til antallet af bakte- regulere på de abiotiske faktorer, fx ved
rier der dør. I denne fase opbruger bak- at tilføre næringsstoffer og fjerne af-
terierne typisk de sidste næringsstoffer faldsstoffer fra næringsmediet. Derved
og udskiller forskellige affaldsstoffer. På kan man opretholde en population af
et tidspunkt er forholdene ikke længe- mikroorganismer i en stationær fase
re gode nok til at bakterierne kan op- i meget lang tid. Dette kan være nyt-
retholde deres nødvendige livsproces- tigt hvis mikroorganismen i denne fase
ser, og populationen bevæger sig deref- producerer stoffer, man ønsker, som fx
ter over i den sidste fase hvor populati- enzymer eller hormonet insulin.
onen falder i størrelse.
Koncentrationsbestemmelse
Den sidste fase kaldes for dødsfasen og af bakterier
er karakteriseret ved at antallet af bak- Man kan bestemme koncentrationen
terier der dør, overstiger antallet af af bakterier i en prøve på flere forskel-
nye, og derved falder antallet af leven- lige måder. I flere af metoderne er det
de bakterier. Nogle typer bakterier er i en fordel først at lave en seriel fortyn-

© 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS Mikrobiologi 109


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
1 mL 1 mL 1 mL 1 mL 1 mL Optælling i tællekammer
Et tællekammer er egentlig blot et ob-
jektglas til mikroskopi hvorpå der er
indridset et meget præcist optællings-
net med felter med en kendt volumen.
Tællekammeret tilføres en prøve, og
derefter tæller man antallet af bakteri-
er i et antal felter. Hvis der er for mange
Prøve eller få bakterier i tællekammeret til at
man kan få et præcist mål, må man væl-
Fortyndings ge en anden fortynding af prøven. Ud
-faktor: 1:10 1:100 1:1000 1:10.000 1:100.000 fra antal bakterier, den samlede volu-
men af de undersøgte felter og fortyn-
Figur 124. En faktor 10 dingsrække af en prøve. Princippet i en dingsfaktoren kan den samlede kon-
fortyndingsrække laves ved fortyndingsrække er vist i figur 124. Tre centration af bakterier i prøven bereg-
hele tiden at overføre 1 mL af nyttige, men meget forskellige meto- nes, se figur 125. Typisk laves flere for-
en opblandet prøve til 9 mL
der til koncentrationsbestemmelse er skellige tællinger hvorefter man bereg-
væske.
beskrevet i de efterfølgende afsnit. ner et gennemsnit af målingerne.

Figur 125. Et tællekammer


kan bruges til at beregne
koncentrationen af bakterier
i en prøve.
0,25 mm

0,05 mm

0,025 mm
40 X
1 2 3 4

Koncentrationsberegning
Felterne har en højde på 0,1 mm.
8 7 6 5
Felt 5 har derfor en volumen på:
V = 0,1 mm · (0,25 mm)² = 0,00625 mm³

9 10 11 12 Der er 22 bakterier i felt 5.


Bakteriekoncentrationen bliver derfor:
22 bakterier bakterier
Konc. = = 3.520
16 15 14 13 0,00625mm3 mm3
1 mm
Der går 1000 mm³ på 1 mL, det giver:
bakterier bakterier
3.520.000 = 3,52 ⋅ 106
10 X mL mL

110 Mikrobiologi © 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
Antal kolonier ved pladeudspredning ger et gennemsnit af målingerne. Pla-
Ved pladeudspredningsmetoden la- deudspredningsmetoden kan kun give
ver man en pladeudspredning af fle- brugbare målinger hvis man er i stand
re forskellige fortyndinger af prøven til at dyrke bakterierne på det valgte
indtil man finder en fortynding, der gi- medie.
ver et passende antal kolonier der er let
at tælle. Der må dog ikke være så få at Absorptions- og turbiditetsmålinger
det giver for stor usikkerhed på målin- Hvis man ønsker at følge væksten i en
gen. Hver koloni stammer fra en bak- flydende kultur af mikroorganismer,
terie fra den påførte prøve, og når man kan man enten benytte et spektrofo-
kender den tilførte volumen af prøven tometer eller en turbiditetsmåler. Det
og fortyndingsfaktoren kan man deref- grundlæggende princip i de to me-
ter regne sig frem til, hvor mange bak- toder er meget ens, men apparaterne
terier der er i prøven, se figur 126. Som der benyttes, er lidt forskellige og må-
med tællekammermetoden laves der ler lidt forskellige ting.
typisk flere målinger hvorefter man ta-

1 mL 1 mL 1 mL 1 mL 1 mL
Figur 126. Pladeudspredning
af en seriel fortyndingsrække
kan bruges til at beregne
koncentrationen af bakterier i
en prøve.

Prøve

1 mL 1 mL 1 mL 1 mL 1 mL

Fortyndingsfaktor: 1:10 1:100 1:1000 1:10.000 1:100.000

Koncentrationsbestemmelse
For det mest præcise resultat vælges normalt en plade med mellem 30 og 300 kolonier. Her
opnås dette ved fortyndingsfaktoren 1:10.000, hvor der er 38 synlige kolonier.

Husk at en koloni stammer fra en bakterie i den oprindelige prøve. Koncentrationen findes
ved at dividere antallet af kolonier med fortyndingsfaktoren.
38 bakterier bakterier
Koncentration = = 380.000
1 mL
mL
10.000

© 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS Mikrobiologi 111


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
Apparatet isolerer Prøven absorberer
Figur 127. Et spektrofotometer
en bestemt noget af lyset
måler absorbans af lys ved en bølgelængde
bestemt bølgelængde. Flere
mikroorganismer i prøven
giver en større absorbans.

Forskellige bølge-
længder spredes

Lyskilde

Prøvens absorbansniveau vises

Et spektrofotometer måler absorban- få præcise målinger, og også her er det


sen af lys ved en bestemt bølgelængde. ofte en god idé at lave flere parallelle
Da der er en sammenhæng mellem an- forsøg og så tage et gennemsnit.
tallet af mikroorganismer i prøven og
hvor meget lys der bliver absorberet, Industriel anvendelse
kan man løbende måle på væksten i en af mikroorganismer
flydende kultur ved at udtage prøver, Mikroorganismer benyttes til mange
se figur 127. For at kalibrere målinger- ting i industrien. Som nævnt i kapit-
ne benyttes typisk pladeudspredning let Anvendt bioteknologi kan de bl.a.
eller tællekammermetoden på enkel- bruges til produktion af alkohol, me-
te målinger. jeriprodukter og antibiotika. Mange
forskellige enzymer produceres og ud-
Turbiditetsmålinger måler ikke absor- vindes fra gæringstanke med mikro-
bansen af lys, men derimod sprednin- organismer. I nogle tilfælde er det en-
gen af det lys der sendes ind i prøven. zymer som mikroorganismen natur-
Jo flere mikroorganismer i prøven ly- ligt producerer. Man har typisk foræd-
set kan ramme, jo mere spredes lyset, let mikroorganismen så den produce-
og ved at måle hvor meget lys der ram- rer større mængder end normalt. I an-
mer en detektor, fås et mål der korrele- dre tilfælde er mikroorganismen blevet
rer med antallet af mikroorganismer gensplejset og har fået indsat et gen
i prøven. Som ved spektrofotometer- der gør, at den laver et ønsket produkt
metoden er det nødvendigt at kalibre- som fx et enzym. Dette kan fx gøres
re målingerne med fx pladeudspred- ved hjælp af plasmid-transformation
ning eller tællekammermetoden hvis med rekombinante plasmider der in-
man ønsker en absolut koncentration deholder det ønskede gen, se figur 128.
og ikke blot relative målinger. I begge Efter man har gensplejset bakterien til
metoder kan det være hensigtsmæssigt at producere det ønskede produkt, vil
at benytte en fortyndingsrække for at man typisk optimere produktionspro-

112 Mikrobiologi © 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
cesserne på forskellig vis. Det kan bl.a. Kromosom Gen klippet
Ønsket gen ud med
være ved at optimere på temperatur, restriktionsenzym
pH og næringsmediet. Bakterier mute-
rer og der vil derfor opstå variation i en
population af bakterier. Nogle bakteri- Plasmid åbnes
er vil over tid miste evnen til at produ- med samme
restriktionsenzym
cere det ønskede produkt på grund af
mutationer, mens andre bakterier må- Organisme med ønsket
ske ved et tilfælde får en øget produkti- donor-gen der skal
overføres til bakterie
on. Ved løbende at screene og udvæl-
ge de bedst egnede bakterier kan man
DNA-ligase samler
over tid forædle sin produktionsstam-
plasmid og donor-gen
me og optimere produktionen.

Da der er flere forskelle på pro- og euka-


Renkultur med den bakterie Rekombinant
ryoters generelle genstruktur og pro- man ønsker at gensplejse plasmid
teinsyntese, er det nogle gange en for-
del at producere de ønskede stoffer i en
eukaryot organisme som fx gær. Hor-
monet insulin er et eksempel på det-
te. Folk der lider af diabetes 1, kan ik-
ke selv producere det livsnødvendige Bakterier tilføres en egnet Plasmider tilføres
hormon insulin i tilstrækkelige mæng- transformationsvæske glasset med bakterier
der og skal derfor have det tilført ude-
fra. Da menneskets immunforsvar rea-
gerer på fremmede proteiner, er det ik-
ke uproblematisk at tilføre insulin fra
fx svin eller køer som man ellers gjorde
for mange år siden. I dag kan man pro-
ducere human insulin i gensplejsede
gærceller hvilket bl.a. sker på den dan-
ske virksomhed Novo Nordisk.

Isbad

Transformeret
bakterie

De transformerede bakterier
Figur 128. Plasmid-transformation af Væsken opvarmes så producerer det ønskede produkt
bakterie. bakterierne udsættes for via proteinsyntese. Produktet kan
varmechokbehandling udvindes og benyttes industrielt

© 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS Mikrobiologi 113


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9
Billedliste
Forside: Shutterstock.com: T-hjælpercelle og HIV partikler,
Kateryna Kon; Coloradobille, Ivaschenko Roman.
S. 97 figur 104, Shutterstock.com: a, nulinukas,
b. Theeraphop, c. Choksawatdikorn.
S. 97 figur 105, Christopher Allen Kirby.
S. 99 figur 109, Shutterstock.com: a, Danny Smythe,
b. Somchai Som.
S. 100 figur 110, Chansom Pantip/Shutterstock.com.
S. 102 figur 113, grebcha/Shutterstock.com.
S. 102 figur 114, Public domain, Medimicro/Wikipedia.
S. 103 figur 116, Everett Historical/Shutterstock.com.
S. 112 figur 127, Shutterstock.com: Apparater, extender_01;
Bakterier, Designua.

114 Mikrobiologi © 2017 Frank Grønlund Jørgensen og Nucleus Forlag ApS


Mikrobiologi ∙ Biologi i udvikling B-niveau ∙ ISBN 978-87-90363-94-9

You might also like