Organizmy wykształciły szczególne cechy metabolizmu np. zdolność do uzyskiwania energii z rozkładu substancji.

Tę właściwość wykorzystuje się przy: oczyszczaniu ścieków, oczyszczaniu powietrza,

przetwarzaniu odpadów komunalnych, produkcji tworzyw biodegradowalnych. Nieruchome złoże zawierające: kamienie, żużel, koks, kształtki z tworzyw sztucznych i ceramicznych. Materiał biologiczny
czyli bakterie, grzyby, protisty, larwy owadów, złoże to nazywamy złożem biologicznym. Osad czynny – zawiesina w której znajdują się organizmy ich rozwój następuje w warunkach intensywnego
natlenowania. Do oczyszczania powietrza stosuje się biofiltry, które rozkładają zanieczyszczenia do związków prostych, eliminują one też nieprzyjemny zapach. Biofiltr składa się z warstwy materiału
porowatego zasiedlonego przez mikroorganizmy. W celu utylizacji stosuje się kompostowanie i fermentację metanową. Kompostowanie polega na rozkładaniu resztek roślinnych przez bakterie i grzyby
oddychające tlenowo. Powstaje tlenek węgla (IV), woda, azotany, siarczany, fosforany, inne związki proste oraz kompost. Fermentacja metanowa to proces rozkładania związków oranicznych przez
mikroorganizmy oddychające beztlenowo. W jej wyniku postaje biogaz. Tworzywa biodegradowalne produkuje się z sacharozy zawartej burakach cukrowych, kukurydzy i ryżu. Mikroorganizmy rozkładają
je w kilka miesięcy do tlenu węgla (IV), wody i substancji stosowanej jako nawóz organiczny. Biologiczne zwalczanie szkodników polega na ograniczeniu szkód w uprawach roślin za pomocą wybranych
organizmów lub wytworzonych przez nie substancji. Ocena stanu zanieczyszczenia. Tradycyjne metody polegają na badaniu obecności osobników należących do gatunku wskaźnikowego – bioindykatora.
Metody biotechnologiczne polegają na stosowaniu testów, w których wykorzystuje organizmy wrażliwe na stężenie toksycznych związków. Produkca energii. Spalanie resztek roślinnych np. drewna,
słomy. Uwolnioną w wyniku spalania energię można wykorzystać jako źródło ciepła. Źródłem energii są również: biogaz oraz paliwo płynne otrzymywane z olejów roślinnych lub tłuszczy zwierzęcych.