Professional Documents
Culture Documents
סיכום תגובות בכימיה אורגנית
סיכום תגובות בכימיה אורגנית
סיכום תגובות בכימיה אורגנית
אנליזת שריפה:
נתונה דוגמה של חומר אורגני כלשהות כאשר המטרה היא לקבוע את נוסחתו
האמפירית .שורפים את החומר ,ומקבלים מים ופחמן דו-חמצני כתוצרים:
CXHYOZ CO2 + O2
מחשבים משקל פחמן ומימן בדוגמה על ידי יחס משקלים מולקולרים של
המרכיבים ואחוזים מתוך משקל החומר ההתחלתי שאת משקלו מדדנו .מקבלים
אחוזים של מימן ופחמן ,והאחוזים ה"חסרים" יושלמו על ידי החמצן .מחלקים את
האחוזים שנתקבלו במשקל המולקולרי של כל יסוד ויסוד .ומקבלים יחסים
לנוסחה אמפירית.
אלקנים )(ALKANES
נומנקלטורה ספציפית )מיוחדת( .ללא קשרים כפולים.
קונפורמציות:
צורות מרחביות שונות של אלקנים מתאפשרות הודות לקשר ) σסיגמא(
שבין אטומי הפחמן ,המאפשר תנועה וסיבוב חופשיים.
ישנם שני מצבים עיקריים -
- ECLIPSEחפיפה :קרבה מקסימלית של אטומי המימן או המתילים בבוטאן.
- STAGGEREDמצב מרחק מקסימלי בין מימנים/מתילים .זהו המצב האופטימלי
כיוון שהדחייה בין ענני האלקטרונים תהיה מינימלית ,וכן גם האנרגיה.
קונפורמציות של ציקלו-אלקנים:
בטבעת ציקלופרופאן יש עוות חריף של הזווית האופטימלית המביא ליציבות
נמוכה .קיים מתח טבעתי )כתוצאה מהעיוות( ומתקבל מבנה עקום.
מבנה הציקלוהקסאן הוא היציב ביותר .הזווית שבין האטומים קרובה מאד לזו של
מבנה טטרהדר אופטימלי .טבעות אלו קיימות בצורת "כסא" וניתן לעבור מתצורה
לתצורה על ידי "סירה" .הבדלי המצבים מתייחס למצב המימנים בטבעת -
אקווטוריאלים )במישור הטבעת( או אקסיאלים )ניצבים לטבעת( .בטמפרטורות
החדר יש כל הזמן היפוך של המצבים הללו.
.1גז כרומטוגרף :מעבירים דוגמת חומר נבדק עם גז דרך צינור קפילרי ארוך
ומסולסל באורך של 100-200מטר בתוך תנור .בקצה הצינור ישלו גלאי הרושם
איזה חומר וכמה ממנו הגיע .זה תלוי ביכולת ובאופן התקשרותם של באטומים
בחומר הנבדק עם החומר שבו מצופה הצינור .כך מתקבלת הפרדה של חומרים
וניתן לאפיין את הדוגמה .החסרון הוא ששיטה זו טובה אך ורק לאפיון של חומרים
נדיפים וגזים.
.2מס ספקטרומטר :מכניסים חומר נבדק לתוך המכשיר בוואקום .יורים עליו קרן
אלקטרונים הגורמת לחומר לאבד אלקטרון אחד ולהיות טעון חיובית .מריצים את
החומר בשדה חשמלי לכוון פלטה טעונה שלילית .החומר נע בצורת קשת,
ומסלולו נקבע על ידי עוצמת השדה והמסה של החומר .מכוונים את הפרמטרים
כך שהחומר יעבור דרך חריר מיוחד .המכשיר מתרגם את עוצמת השדה החשמלי
לערך של המסה של החומר הנבדק.
.3ספקטרוסקופיה אינפרה-אדום :בתוך מולקולות חומר קיימות באופן קבוע
תנודות של אטומים .שתי תנודות עיקריות של אטומים הינן תנודות מתיחה
ותנודות כיפוף בתוך המולקולה .התנודות האופייניות למתיחות וכיפופים בקשרים
כימיים נמצאות בתחום ה .IR-מולקולה יכולה לבלוע קרן IRבתדירות הזהה לזו
הדרושה לעורר אותה .כאשר היא תחזור ממצב מעורר למצב יסוד ,היא תשחרר
אנרגיה בצורת חום .על ידי הפעלת גלים על חומר נבדק ובדיקת התדירות
הנקלטת ניתן לקבוע איזה קבוצות פונקציונליות יש במולקולה .לכל קבוצה
פונקציונלית קיימים גם תתי חלוקות שאומרות לנו באיזה סוג בדיוק )של קבוצה
פונקציונלית( מדובר .מתאפיין על ידי "טביעת האצבע" )בצידו הימני של הגרף(.
.4עמודת כרומטוגרפיה :לתוך קולונה מזכוכית מכניסים חומר סופח בצורת
אבקה עדינה וממס כלשהו .בקצה העליון של הקולונה מוסיפים תמיסה מרוכזת
של התערובת שרוצים להפריד .חומרי התערובת נספחים אל הסופח .מזרימים
מים דרך הקולונה אל תוך מבחנות ,כאשר המבחנות מוחלות כל כמה זמן .קצב
ירידת חומרי התערובת תלוי בזיקת התקשרותם לסופח .באופן אידיאלי נוצרות
שכבות של החומרים השונים בתערובת.
: NMR.5הגרעין ,בהיותו חלקיק טעון ,יוצר שדה מגנטי בסיבובו סביב עצמו .ציר
השדה הגרעיני זהה לציר הסחרור .כל גרעין בו מדפר הספין שונה מאפס הינו
בעל מומנט מגנטי .Nהגרעין יכול להסתדר בכל כוון אקראי .על ידי הפעלת שדה
מגנטי חיצוני יסתדר הגרעין או עם כוון השדה או נגדו .המצב בו כוון הגרעין הוא
נגד השדה המגנטי הוא בעל אנרגיה גבוהה יותר.
הגרעין יכול לעבור ממצב אנרגטי 1Eל 2E -ע"י בליעת כמות אנרגיה מתאימה.
ניתן למדוד את המעבר מרמה אחת לרמה שניה הודות לעובדה שמספר
האלקטרוני בשתי רמות אלו שונה במקצת.
התהודה של פרוטון מושפעת מהסביבה המקיפה וממסכת אותו -לאילו אטומים
הוא קשור .פרוטונים הקשורים לסביבות שונות ממוסכים באופן שונה וכתוצאה
מכך התהודות שלהם מתפזרות בספקטרום של תדירויות .מיקום אות התהודה
הוא ההיסט הכימי.
ישנה תדירות יחס של מולקולת TMSיחידות ההיסט נמדדות ב.PPM-
כדי לבצע מדידה יש להמיס את החומר הנבדק בממס מתאים אשר אינו מכיל
מימנים ,כגון דאוטריום.
))ALKENES אלקנים
איזומריה גיאומטרית:
בגלל קשרי ה π -אין סיבוב אפשרי של המולקולה בצורת רוטמר ,אלא על ידי
שבירה מוחלטת שלה .ישנם שני מצבי איזומריה מרכזיים:
ריאקציות של אלקנים
הידרוגנציה קטליטית :סיפוח מימנים .שלב ראשון שימוש בקטליזטור. .1
כתוצאה מהחלשת קשרי המימן בנוכחות אלקנים ,המימנים יתקפו את הקשר
הכפול מאותו הצד ,ויתקבל סיפוח ציס .הקשר הכפול ישבר ונקבל אלקן .ALKANE
סיפוח אלקטרופילי :מולקולת HXמתקרבת לענן האלקטרונים של הקשר .2
הכפול .המימן שלו ,בעל דיפול חיובי ,הופך ליון H +ונקשר לקשר הכפול .נוצר
קרבוקטיון = יון קרבוניום .על מנת להתייצב מסופח נוקלאופיל X-על מנת
להשלים אלקטרונים ,להתייצב ולהתאזן .החלוקה על פי חוק מרקובניקובX :
לפחמן המותמר יותר H ,לפחמן הפחות מותמר )היכן שיש יותר מימנים (.כך
מושגת יציבות גדולה יותר כתוצאה מהתמרה מוגדלת.
סיפוח אלקטרופילי :2Xבמצב זה בשלב הראשון המולקולה מתפצלת .3
לשניים .אטום אחד שלה יתקוף את הקשר הכפול מצד אחד ,והאטום השני יתקוף
מצד שני .ייווצר סיפוח טראנס.
סיפוח רדיקלי )בניגוד לכלל מרקובניקוב( X :רדיקלי יסתפח דווקא .4
לפחמן פחות מותמר על מנת ליצור רדיקל מותמר יותר ולכן יציב יותר .האלקטרון
שעל ה X-רדיקל יצטרף לפחמן שאליו לא נקשר ה .X-בשלב שני ,ע"י תגובה עם
HXיכנס ה H-היכן שהיה הרדיקל וישאר לנו רדיקל בחוץ.
הידרוקסילציה :סיפוח שני חמצנים שמקורם ב .KMnO4 .שניהם יתרכבו של .5
פחמני הקשר הכפול יוצרו תוצא סיפוח ביניים בלתי יציב .עי ידי הכנסה למים ,שני
אטומי Hיתפסו על החמצנים ליצירת שתי קבוצות OHכהליות .זהו סיפוח ציס.
אפוקסידציה :אטום חמצן מתקשר לשני פחמנים של הקשר הכפול ליצירת .6
טבעת הטרוציקלית משולשת .בדרך כלל יהיה זה חמצן של חומצה פרוקסית.
אלקטרוני של הקשר הכפול תוקפים את החמצן ומנתקים אותו מהמולקולה
המקורית שלו .הקשר המשולש ומתקבל דיאול שקבוצות ה OHשלו במצב טראנס
זה לזה.
אוזונוליזה :פיצוח קשר כפול על ידי שימוש במולקולת אוזון ) .(3Oבשלב .7
הראשון נוצרת טבעת של 3חמצנים בצד אחד של הקשר הכפול .זהו שלב ביניים
לא יציב .בשלב שני הם מופרדים למצן בודד מצד אחד ושניים בצד השני .ניתק
הקשר בין שני הפחמנים .באמצעות תגובה נוספת נקבל שתי מולקולות נפרדות -
קטונים ,אלדהידים או חומצות )תלוי בתנאי הפירוק/קישור(
פחמנים קירלים:
השלכת פישר -שלד אטומי הפחמן ירשם מלמעלה למטה ויכלול את הפחמן
הקירלי .הקבוצות הקשורות אליו ורשומות למעלה ולמטה יהיו נוטות מעבר
למישור הדף ,ואילו אלו שרשומות מימינו ומשמאלו יהיו רשומות מעל למישור
הדף.
רזוננס:
.1אלקטרונים שיוצרים רזוננס הנם אלקטרוני או non bondingבלבד.
.2צורות מרובות רזוננס תהינה יציבות יחסית וכלל שמספר הרזוננסים יגדל,
תגדל יציבותן.
.3מצבי רזוננס לא חייבים להיות שווים בשכיחותם ובתרומתם היחסית ,אבל
למרות זאת כולם קיימים בטבע.
.4חשוב להקפיד על שמירת כלל האוקטט עבור כל אטום.
X תגובות :SN1מתרחש רק עבור קרבוקטיון שלישוני .בשלב ראשון קבוצה עוזבת
ונוצר קרבוקטיון שלישוני .בשלב שני נוקלאופיל תוקף ונוצר קשר עם
הנוקלאופיל .זו ריאקציה רק עבור קרבוקטיון שלישוני כי הוא היחיד שיציב מספיק
לביצוע התגובה .ככל שהוא יציב יותר ,הרמה האנרגטית של מצב המעבר נמוכה
יותר ,ולכן רבים סיכויי התגובה להתרחש .מהירות הריאקציה תלויה בכמות המגיב
בלבד.
תגובת :E1בשלב ראשון חלה יוניזציה של הקשר R-X, -Xיוצא החוצה וכתוצאה
מכך נפלט ,H+ואלקטרוני הקשר של הפחמן שהיו מחוברים למימן יצרו קשר
כפול .בסופו של דבר ,יפלטו החוצה X-ו H+שיתחברו ליצירת ה HX-ונקבל קשר
כפול .הכוח המניע לתהליך הוא הנטייה להפוך קרבוקטיון פחות יציב ליותר יציב.
תגובת :E2ליצירת התגובה נדרשת גיאומטריה מרחבית וכן ש Xו Hיהיו בשני
מישורים שונים .בשלב הראשון מתרחש קטיפה של H+על ידי בסיס ,אלקטרוני
הקשר של המולקולה המקורית עוברים ליצירת קשר כפול ,ונפלט החוצה X-
שיוצר עם ה H+מולקולת .HX
תרכובות ארומטיות:
מולקולת הבנזן יציבה מאד הודות למצבי הרזוננס שלה ,ולמבנה הפלנארי שלה.
נומנקלטורה:
בנזיל ,ארן ,ארין TOLUENE PHENYLטולואן פניל
CH3 CH2
CH3
CHCH2CH2CH3 CH2Cl
לדוגמה:
תגובות כימיות:
.1התמרה אלקטרופילית :בשלב הראשון יתבצע כמו בהתמרה נוקלאופילית
באלקנים X+ .יתרכב על אחד הפחמנים וישאר X-שלא יתרכב .בגלל היציבות
הגדולה של המבנה הרזונטיבי של הטבעת הארומטית השלב השני יהיה
שחרור של H+מהטבעת על מנת למנוע פירוק של אחד הקשרים הכפוליםH .
+
כהלים:
מאופיינים על ידי נוכחות קבוצה הידרוקסילית .OH
נומנקלטורה -פנול :קבוצת OHהקשורה לפחמן ארומטי.
הכנת כהלים
H .1הידרטציה :סיפוח מים לאלקנים .קבוצת OHהולכת לפחמן המותמר יותר,
ילך להשלים פחמנים שחסרים כתוצאה משבירת הקשר הכפול) .דומה לחוק
מרקובניקוב(
.2הידרוליזה של אלקיל הלידים :על פי עקרון ההתמרה הנוקלאופילית
SN1/SN2 , OHיכול לשמש כנוקלאופיל ולהחליף קבוצה עוזבת כלשהי.
.3סיפוח מגיבי גריניאר לתרכובות) :קרבוניליות ,אלדהידים ,קטונים ,וכו'(
הקבוצה היונית קרבונילית תסתפח לפחמן שעליו יושב חמצן עם קשר כול
)הדיפול שלו גורם לו להיות חיובי( .הקשר עם Oיהפוך ל OHויתווספו מימנים
היכן שחסר.
.4חיזור קרבונילים :על ידי הכנסת מימנים לתרכובת קרבונילית קשר Oהופך
ל OHונוספים מימנים להשלמת חוסרים.
תגובות של כהלים:
.1דה-הידרטציה :הפוך מיצירת הכהלים מאלקנים .על ידי הוספת Hקבוצה
+
אתרים:
קבוצה הבנויה מתצורה .RORהנומנקלטורה מתבססת על אפיון שתי הקבוצות
שמצידי החמצן והוספת השם אתר לסוף.
.1שיטת ויליאמסון :קבלת אתרים עם שתי קבוצות קצה שונות .מבוסס על תגובה
בין יוני אלקאוקסיד ובין אלקיל הלידים) .סובסטיטוציה(
.2 .2טיפול בחומצה חזקה :משמש לקבלת אתרים עם שתי קבוצות קצה שונות.
בשלב הראשון מוסר H+מהקבוצה הכוהלית ומתקבלת קבוצה של יון
אוקסוניום .בשלב השני מולקולת כהל אחרת תוקפת פחמן שהיה קשור ל OH
חומצה חזקה
2XCH3CH2OH CH3CH2OCH2CH3 + H2O
140
ונכנס Oבין הקבוצות הפחמניות .נפלטים מים החוצה ואחר כך +י שהיה קשור
לקבוצת OHשתקפה שניה .לדוגמה:
קרבונילים:
תגובות קרבונילים:
תקיפה נוקלאופילית :א .היות וקשר C=Oפולארי בו החמצן שלילי .1
והפחמן חיובי תתרחש תקיפה נוקלאופילית על הפחמן .בשלב הביניים ייווצר לנו
מצב של O-עקב שבירת הקשר הכפול שלו .בשלב שני ,על ידי הכנסה למים
יסתפח H+ל O-לתת קבוצת .OHב .באמצעות ריאגנט גריניאר -באופן דומה רק
שהפעם התוקף הוא קרבוניל נוקלאופילי התוקף את הפחמן הקשור לחמצן.
בנוכחות מים ייווצר גם כאן קבוצת .OH
תגובות עם אמוניה לסוגיה :מסוג .R-NH2שני האלקטרונים non bonding .2
של האמוניה הופכים אותה לבעלת תכונות נוקלאופיליות .בשלב ראשון
מתרחשת תגובה ותקיפה נוקלאופילית רגילה ומצב ביניים זהה למצב הקודם.
שלב הביניים שונה מהקודם בכך שעל ידי תוספת H+או בלעדיה )תלוי איזה
אמין התרכב עם הפחמן הקרבונילי(נוצרת מולקולת מים מהחמצן הקרבונילי ו H
שנוסף או זה של המימן המקורי בלבד .המים נפלטים החוצה .נוצר קשר כפול
עם התוקף הנוקלאופילי בגלל איבוד ה Oהחוצה בצורת מים.
תגובה ליצירת אציטל/המיאציטל :ניתן ליזום תגובה זו על ידי .3
בסיס/חומצה .אתייחס למקרה של חומצה בלבד .החומצה תורמת H+לקרבוניל,
מתפרק הקשר הכפול ונוצרת קבוצת .OHהפחמן במרכז הופך ליון חיובי .תוקפים
)את הפחמן החיובי( עם קבוצה כוהלית .נוצר קשר בין החמצן של הכוהל לפחמן.
בשלב נוסף יוצא H+החוצה )ע"י בסיס( ונשארים עם המי אציטל .לקבלת
אציטל ממשיכים בתגובה ,וזה אפשרי בנוכחות חומצה בלבד .בדומה לתהליך
הראשון -רק שכאן H+מהחומצה מתווסף ל OHלקבלת יון האוקסוניום
המתאים .נפלטים מים החוצה ומקבלים יון קרבוניום אותו תוקפים עם קבוצה
כוהלית O .מתרכב עם הפחמן היוני החיובי .בשלב האחרון מוסרים את הH+
מהחמצן על ידי בסיס ש"קוטף" אותו ,כך שנותרת מולקולה עם שתי קבוצות OR
שקשורות לפחמן )זהו אציטל(.
חומצות קרבוקסיליות:
החומצות הקרבוקסיליות מצויות במצב מוצק ונוזלי בצורת דימרים טבעתיים בהם
שתי מולקולות של חומצה נקשרות בינן על ידי קשרי/גשרי מימן.
האפקט האנדוקטיבי -ניתן לחזק חומצה על ידי פיזור המטען על האניון
שהחומצה מייצרת אחרי פליטת .H+פיזור מטען עליו על ידי קבוצה תורמת
אלקטרונים יביא להיותה חומצה חזקה יותר )תורמת H+ביתר קלות מכיוון
שהאניון שלה יותר יציב( .ניתן לבצע הליך זה באמצעות הלוגנים ,מושכי
אלקטרונים .ריבוי התמרות הלוגניות יביא לחיזוק החומצה .הרחקת ההלוגן
מהחומצה בתוך המולקולה לביא בצורה הפוכה להחלשת החומצה.
H2O
CH3CH2-MgBr + O=C=O CH3CH2C-O-MgBr+ CH3CH2COOH
לקטונים :תוצרי תגובה בין חומצה קרבוקסילית וקבוצה כוהלית הנמצאים
יחדיו אותה המולקולה .מולקולה המכילה 2קבוצות פונקציונליות כאלה נקראת
הידרוקסיחומצה .יתקבל בתגובה זו אסטר פנימי .מצב זה יתכן בעיקר כשיש
Oובין הקבוצה הכוהלית .יתכן גם יצירת תיול קרבה בין הקבוצה החומצית
O
OHמשתתף תיול R-SH אסטר כאשר במקום קבוצת
-H2O
אנהידריד
OHOH משתי חומצות קרבוקסיליות מקבלים
ואלקיל הליד Oקרבוקסילית מקבוצה
נוצר מספחים Naבמקום .H
+ +
מקבלים אסטר .תחילה
מלח .מגיבים עם אלקיל הליד.
מחומצה קרבוקסילית וכל מקבלים גם אסטר.
מחומצה קרבוקסילית וכהל באותה מולקולה מקבלים לקטון.
התמרה בעמדת :
הוא הופך לנוקלאופיל ותוקף מולקולת אלדהיד שכנה לו .החמצן הקרבונילי של
מולקולת האלדהיד שנתקפה הופך O-ובנוכחות מים מקבל מהם H+והופך לקבוצת
.OH
זה נותן לנו -הידרוקסי-קטון L:קבוצה הידרוקסילית בעמדת פחמן לקרבוניל.
סינטזה מלונית -יצירת התמרה לפחמן לחומצה בשני שלבים:
.1 .1הורדת מימן על ידי בסיס לפחמן לחומצה קרבוקסילית
.2יצירת התמרה מסוג SN2על ידי אלקיל הליד.
מעגל קרבס:
שלב :1דחיסה שנוצרת מאצטיל קו אנזים Aשפחמן ה α -שלו תוקף חומצה.
ישנו תהליך דחיסה בו נוצר קשר פחמן-פחמן .קשר כפול על אטום חמצן הופך ל
OHויוצאת החוצה קבוצת האצטיל קו אנזים .מתקבלת חומצה טריקרבוקסילית
שלב :2תהליך דהידרטציה -הוצאת מים לאחר מכן הכנסת מים
שלב :3חמצון קבוצת OHעל ידי הוצאת Hוהפיכתה לקרבוניל .במקביל
מתרחשת עזיבה של קבוצת CO2מהחומצה המרכזית על ידי חימום/אנזים.
שלב : 4יציאה של )CO2דהקרבוקסילציה( מה-α -קטו חומצה .במקומה נכנס
אצטיל קו אנזים Aעם גופרית שנותן קבוצת תיו-אסטר.
שלב :5הדרוליזה -הכנסת OHכקבוצה המחליפה את התיו-אסטר .נוצרת
מולקולה עם שתי חומצות.
שלב :6תהליך חמצון -הוצאת ) H2אחד מכל חומצה( ,ויצירת קשר כפול .זוהי
חומצה לא רוויה.
שלב :7הידרטציה -הכנסת מים .שבירת קשר כפול ויצירת קבוצה הידרוקסית
על אחת החומצות.
שלב :8חמצון ההדרוקסיל -הוצאת .Hנוצר קשר כפול פחמן-חמצן ,המביא
אותנו לתחילת המעגל.
אמינים:
אמוניה NH3: נומנקלטורה:
: אמינו NH2
אחד הדברים החשובים בתגובות האמינים הוא העובדה שיש לו שני •
אלקטרונים חופשיים .זה ישפיע על כך שאין לו מבנה טטרהדראלי מבחינת הזווית
של הקשרים שלו.
עקרונית ,אמינים שלישוניים )מותמרים בשלוש קבוצות שונות לצורך •
העניין( צריכים היון להיות קיימים בצורת איזומרים אופטיים .למעשה מצב זה לא
קיים בשל העובדה שקיימים היפוכי חנקן מהירים מאד של שתי הצורות דרך מצב
מעבר מישורי.
האמינים הנם הבסיסים האורגנים הנפוצים ביותר) .ויש להם ריח מגעיל…( •
הכנת אמינים:
.1אמיניזציה של אלקיל הלידים :אמוניה יכולה לשמש כנוקלאופיל ולהחליף את
ההלוגן באלקיל הלידים .התגובה מתרחשת באופן דומה באמינים ראשוניים,
שניוניים ושלישוניים.
.2חזור תגובות ניטרו/ניטרילים:
R-NO2 RNH2
פנולים:
קבוצה שלה קבוצת OHעל טבעת ארומטית .זהו חומר המתאפיין בהיותו לוכד
רדיקלים .הוא מסוגל להתחבר לרדיקל מסוים ולשחרר רדיקל שלו החוצה.
פחמימנים:
חומר מרכזי בטבע -מאבות המזון .נוצר בטבע בתהליכי פוטוסינטזה בתגובה בין
פחמן דו חמצני ומים .כולל קבוצות הידרוקסיליות כהליות וקבוצות קרבוניליות
פחמן אנומרי -פחמן שעליו יושבת קבוצת ההמיאציטל .נבדלים מעצמם על ידי
מיקום קבוצת ה .OHכאשר היא אקסיאלית -מצב ,וכאשר היא אקווטוריאלית -
מצב.
החשיבות היא בעובדה שקבוצת ה OHיוצרת קשרים בין מולקולות שכנות של
גלוקוז .הגוף שלנו יכול לפרק קשרי בלבד ,בהם ה OHפונה "למטה".
חשובות נוספת של הפחמימנים היא היותם סממני זיהוי של דופן תאים .התאים
יודעים לזהות זה את זה ע"פ היחידות השונות שיושבות על הסוכרים.
גם במבנה של RNA/DNAישנם סוכרים .בהתאם לקבוצה האמינית היושבת על
הסוכר משתנה סוגה ואופייה .קיימים 4סוגים שחולקים הצמדים .A-T, G-C
חומצות אמינו:
חומצות אמינו מרכיבות חלבונים שהם אבני הבניין של הגוף .הן תרכובות
המכילות ביחידה הבסיסית שלהן קבוצה קרבוקסילית וקבוצה אמינית קשר
קשורה אל פחמן לחומצה.
הקשרים בין שתי יחידות של חומצת אמינו נעשים בין הקבוצה הקרבוקסילית של
יחידה אחת לקבוצה אמינית של יחידה שניה .קשרים בין יחידות אלו הנם קשרים
פפטידים.
הפחמן הקשור לקבוצות האמינו הוא קירלי .כל החומצות אמינו בגוף מוגדרות
כבעלות קונפיגורצית L=Sפרט ל Glyane-שלו קונפוגורצית .D=R
פפטידים :מספר קבוצות של חומצות אמינו הקשורות בינן נותנות פפטיד .זהו קשר
בין קבוצה קרבוקסילית ואמינים של חומצות אמינו סמוכות .מכיוון שעל החנקן יש
שני אלקטרונים חופשיים ייתכנו מספר מצבים רזונטיביים ע"י נדידה של
אלקטרונים אלו בין מקומות שונים במולקולה .מעניק יציבות וחוזק לפפטיד.