Professional Documents
Culture Documents
Primarna Struktura Proteina
Primarna Struktura Proteina
Primarna Struktura Proteina
-sekvenca AA
-odredjuje vise strukture(topivost, stabilnost molekula i funkciju), ali veliki broj varijacija
-Peptidna veza (C(O)NH), metastabilna, parcijalno dvostruka, rez. en. 83,6 KJ/mol, polarna, cis, trans
-β-sheet (3 tipa, peptidni lanci blago zavijeni na a-C, par. lanci medjusobno kom.H vezama, paralelna i
antiparalelna, ugao od 25o, prolin).
-helix(više h.s.,stab. se H vezama, L helix, svakih 5,4 segmenta duz osovine, okret 3,6 ostatake, 36 AA za 10
okreta, ravni pept. veza gotovo paralelne osovini lanca, bocni lanc okrenuti vani, usmjereni prema NH2 kraju.
Za L-AA zavoj u lijevo manje povoljan, u desno energetski povoljniji. Zavijanje L-helixa: u glob. pr. vecina alfa h.
str. je zakrivljano ili deformisano, sto ovisi o: prisustvu drugih strukturalnih elemenata, prisustva prolina, uticaja
rastvaraca).
Tercijarna struktura:
-tako βsheet moze biti zasticen sa obe strane helixima (pol. str. helixa se usmjeravaju prema vodi, a
nepolarne ostvaruju veze sa βsheetom.)
-ako dvije mol. imaju istu primarnu strukturu, moze se govoriti i o homologiji visih struktura
-fibrilarni i globularni
-Fibrilarni: (peptidni lanac je arantian unutar jednog strukturalnog elementa; keratin vune, fibroin svile,
kolagen; str. je stabilizirana elektrostatskim interakcijama i disulfidnim vezama, dominiraju hidrofobne
interakcijei H povezivanje)
Denaturacija proteina
-Bilo kakva promjena matrixa ce prisiliti molekulu da prihvati novo ravnotezno stanje.
-Denaturacija-Rev. i irev. promjene prirodne konf. proteina, bez cijepanja kov. veza pr. str. (sem
disulfidnih)
-Nastaje kao rez. djelovanja fiz.(T,P) i hem. agenasa(pH, rastvarac, niskomol. aditivi, detergenti)
-Na amb. temp., povecanje P rezultira denaturacijom kod vecine proteina.Proteini su flex. mol.
podlozne kompresiji: pros. volumen prot. molekule je oko 0,74 ml/g. Ako se globularni protein potpuno
odvije usljed povecanog P, promjena volumena je oko 2%.Vecina ovakvih den. je ireverzbilna.
-Hem. agensi i denaturacija-Vecina proteina je stabilna pri neutralnom pH. Ekstremno pov. ili
smanjenje pH izaziva elektrostatsko odbijanje(privlacenje)izmedju bocnih lanaca, sto moze uticati na
savijanje ili odmotavanje molekule. Denaturacija izazvana promjenom pH je najcesce
reverzibilna(izuzetci)
-Org. rastv i denaturacija: org. r, djelju na razlicite nacine na hidrofobne interakcije, H veze,
elektrostatske interakcije. Posto su nepolarni bocni lanci topivi u org. rastv., organski rastvaraci
smanjuju hidrofobne interakcije. Koliki ce biti efekat ovisi o str. pr. molekule.
-Detergenti i denaturacija:detergenti su izrazito jaki agensi denaturacije. Natrij dodeci sulfat u konc 3-
8mM denaturise gotovo sve glob. pr. Cesto reverzibilna.
Soli i denaturacija: soli djeluju na dva nacina: u malim kon. ulaze u elektrostatske interakcije-vrse
elektrostatsku neutralizaciju. ; U velikim konc. imaju specificne ionske efekte sto utice na strukturnu
stabilnost molekule. Veci efekat pokazuju anioni od kationa.
Hidratacija proteina
-kapacitet proteina za vezanje vode: ph, ionska sila, tipovi soli, temperatura, konmformacija
proteina(pH9-10; pri malim konc. soli povecava se WBC; sa pov. T se smanjuje;)
-sposobnost zadrzavanja vode: spos. rotetina da zadrzi vodu suprotno djelovanju sila gravitacije
unutar proteinskog matrixa. To je zahvacena voda. Teksturu pekarskih proizvoda i gelova.
-Ionizacija amino grupa (+) karboksilne(-) i bocnih grupa. Neke grupe su uvijek ionizirane.
-IE tacka: pH u kojem postoje cwitter ioni. Broj poz. jednak je broju negativnih naboja ukljucujuci i sve
ostale vezane ione iz matrixa; svi su u ionskoj formi. Ukupan naboj rastvora=0
-II tacka-broj poz. naboja jednak broju negativnih naboja, bez prisustva drugih iona.
-Da se odredi II tacka radi se potpuna dijaliza proteinskog rastvora, da se odstrane svi ioni.
-II tacka je konstantna velicina za jedan protein, IE tacka varira ovisno o pH sredine
Topivost proteina
-Dodatkom org. rastv. smanjuje interakcije protein-voda. Povecavaju se intra i intermolekularne sile.
Talozenje.
-Pivo, kolači
-Ovo svojstvo ovisi o rsti proteina i veoma varira (npr. bjelance jajeta: formiranje pjene omogucava
globlin, ovomucin je stabilizira, a albumini i koalbuini je fiksiraju tokom termalnog postupka)
-Proteini stabiliziraju pjenu stvaranjem fleksibilnog, kohezionog filma oko mjehurica. To se postize
denaturacijom proteina.
-Sto mlolekule proteina brze difundiraju u medjuprostore mjehurica i sto se lakse denaturise, lakse
formira pjenu.
-Djelimična povrsinska denaturacije proteina opcenito, oslobadja dodatne bocne lance AA , koji
takodjer stupaju u intermolekularne interakcije. Sto je jace povezivanje, film je stabilniji.
-Male promjene u naboju molekula proteina mogu izazvati udruzivanje molekula, pa se mora odrzavati
odgovarajuci pH.
-Da se formira pjena neophodno je: dvije tecne faze koje se ne mijesaju, vazduh, ulje, voda, energija,
surfaktanti.
-Idealni pr. za stv. pjene: male mol. mase, velika hidrofobna povrsina, dobra topivost, laka
denaturabilnost, mala vrijednost cistog naboja
-Pjenu unistava prisustvo lipida i organskih rastvaraca, jer zamjenjuju proteine svojim hidrofilnim
povrsinama (i malo prisustvo zumanjceta u jajetu nece dozvoliti stvaranje pjene)
3. Umrežavanje-lizin + glutamin
4. Fosforilacija?
-hem. modifikacija, prenos fosfata sa ATP na Ser, Thr djelovanjem kinaza. Sa OH grupama
Ser i Thr. Negativnost proteina, hidrofobnost.Fosfoproteini.
-u hrani cesto, kolaci, pivo. Koloidni rastvor gasa u tecnosti. O vrsti prot. Bjelance jajeta.
Medjusobno spajanje mjehurica gasa. Formiranje fleksibilnog filma izmedju mjehurica.
Denaturacija. Male promjene u naboju mogu izazvati udruzivanje molekula-pH. Dvije tecnosti
koje se ne spajaju, voda, ulje, vazduh, energija, surfaktanti. Idealan protein (mala M, velika
hidrofob. povrsina, dobra topivost, laka denaturacija, mala vrijednost cistog naboja. Lipidi.
Modifikacije proteina.
6. Umjereno zagrijavanje?
-60-90oC, 1 sat. Denaturacija (ireverzibilna, smanjena topivost, talozenje, svarljivost prot.
i raspolozivost es. AA), inaktivacija enzima(oksidaza i hidrolaza, nekad praceno negativnim
promjenama) Inakt. antinutritivnih faktora (leguminoze, uljarice) i inhibicija proteinskih toksina
(botulinum, 100oC)
7. Racemizacija?
-iz jednog enantiomera u drugi ili smjesu enantiomera (Laa u Daa). Alkalni pH i T iznad
200. Znacajan uticaj matrixa molekule. Smanjena varljivost, nutritivne vrijednosti. Smanjenje
es.AA, prolin.
8. Oksidirajuci agensi?
9. Denaturacija
-pH: ako je iznad ili ispod IE tacke, protein nosi naboj, sto rezultira odbijanjem i
hidratacijom-pov. se topivost. Najmanja u IE, kada protein ima dovoljno hidrofob. podrucja,
dolazi do gregacije-IE talozenje. Topivost veceg br. pr. raste sa porastom T.