Sinteza proteina

Udžbenik: Biologija 4, Alfa: str. 20. – 25.

 Extracting Dinosaur DNA from Amber Fossils
Impossible, Scientists Say

http://www.sci-news.com/paleontology/science-dinosaur-dna-amber-01383.html
Proteini izgrađuju sve organizme
Koje sve proteine poznajemo?

https://cdn.rcsb.org/pdb101/molecular-machinery/
Proteini izgrađuju sve organizme
KOSA I NOKTI
keratin
perje, vuna, pandže, ljuske itd.

MIŠIĆI MOZAK I ŽIVCI

aktin i miozin proteinski
kanali i pumpe

HORMONI
inzulin, hormon ENZIMI
rasta, oksitocin, pepsin, amilaza
ADH

KRV
ANTITIJELA
hemoglobin
 Građa proteina

aminokiselina aminokiselina dipeptid voda

Amino Karboksilna
skupina skupina
Struktura proteina (1. razred)

aminokiselina primarna struktura proteina sekundarna struktura proteina

Struktura proteina (1. razred)

tercijarna struktura proteina kvartarna struktura proteina

Središnja dogma molekularne
biologije
 Sinteza proteina
Faze:
REPLIKACIJA
1. Transkripcija ili prepisivanje
2. Translacija ili prevođenje TRANSKRIPCIJA
• u eukariotskoj stanici vremenski i
prostorno razdvojene
• u prokariotskoj se odvijaju
JEZGRA
istovremeno
TRANSLACIJA

PROTEIN

CITOPLAZMA
1. Transkripcija
Što je sve potrebno? • DNA
Mjesto radnje? • RNA nukleotidi
• RNA polimeraza
BioTube

https://www.youtube.com/watch?v=8_f-8ISZ164
1. Transkripcija

DNA RNA POLIMERAZA

mRNA
1. Transkripcija
RNA nukleotidi
RNA
POLIMERAZA

A T C C A A
3 5
C
3

C A U C C A
5 3
T A G G T T

5 SMJER TRANSKRIPCIJE
DNA KALUP

mRNA
1. Transkripcija
• odvija se u jezgri eukariota i u citoplazmi prokariota
• prepisivanjem genetičke upute pohranjene u DNA
nastaje glasnička RNA ili mRNA
• enzim: RNA polimeraza
• prepisuje se uputa s nekodirajućeg lanca (3´- 5´)
1. Transkripcija
RNA DNA
5´ 3´
A U

dodavanje
nukleotida

3´ 5´
 1. Transkripcija

5´ C G G A T G A A A G C G T G G T T T T A A 3´
3´ G C C T A C T T T C G C A C C A A A A T T 5´

5´ C G G A U G A A A G C G U G G U U U U A A 3´
1. b. mRNA – izrezivanje U čemu je razlika
između eksona i
introna introna?

dio DNA koji će se prepisati

DNA

transkripcija

pre-
mRNA

izrezuje se izrezuje se

i – introni
mRNA e - eksoni
Geni koji kodiraju proteine!
2. Translacija
• mRNA
Što je sve potrebno? • ribosomi
Mjesto radnje? • tRNA
• aminokiseline
2. Translacija
• mRNA prenosi uputu za sintezu proteina iz jezgre u
citoplazmu
DNA
lanac 3 5 DNA
A C C A A A C C G A G T

T G G T T T G G C T C A
3 Gen 1
5
TRANSKRIPCIJA
Gen 2
U G G U U U G G C U C A
mRNA 5 3
KODON
TRANSLACIJA

PROTEIN Trp Phe Gly Ser

Gen 3
aminokiselina
2. Translacija
• tipovi RNA

1. mRNA
aminokiselina
ribosom

2. tRNA 3. rRNA
2. Translacija
• glasnička RNA (mRNA):
• građena od kodona – slijedovi od tri nukleotida mRna
koji kodiraju jednu aminokiselinu
mRNA
AUG CCG UUA GGC
Met Pro Leu Gly

1 kodon = 1 aminokiselina

Zašto baš
3 nukleotida?

kodon kodon
43 = 64 Druga dušična baza

Treća dušična baza

Prva dušična baza
2. Translacija
• start i stop kodoni

START – AUG
STOP – UAA
UAG
UGA
2. Translacija
• ribosomska RNA (rRNA):
• zajedno s proteinima izgrađuje ribosome
• ribozim – katalizira reakciju povezivanja aminokiselina
peptidnom vezom
• eukariotski ribosom (80S)
• prokariotski ribosom (70S)
2. Translacija
• transportna RNA (tRNA):
• donosi aminokiseline do ribosoma
u sintezi proteina vodikove veze
• ANTIKODON :
slijed od 3 nukleotida koji je
komplementaran slijedu
nukleotida u kodonu mRNA
• aminokiselina je vezana na 3´ tRNA
nukleotidi

antikodon
2. Translacija

aminokseline
polipeptid

tRNA

ribosom

tRNA
C
G antikodon
U G G U U U G G C

5 kodoni
3
mRNA
2. Translacija
• odvija se u citoplazmi, na ribosomima

peptidilno
mjesto
aminoacilno
izlazno mjesto
mjesto
(Exit)
E P A velika
podjedinica

mala
podjedinica
 Gotovi
Mjesto translacije Rastući
polipeptidi
polipeptidi
• poliribosomi

početak
kraj
mRNA
mRNA
(5)
(a) (3)

ribosomi
mRNA

(b)
0.1 m
2. Translacija

Prema receptu sintetiziraj protein!

5´ C G G A U G A A A G C G U G G U U U U A A 3´
BioTube

https://www.youtube.com/watch?v=SMtWvDbfHLo https://www.youtube.com/watch?v=TfYf_rPWUdY

DNA Transcription (Advanced) mRNA Translation (Advanced)

Razlike u sintezi proteina kod prokariota i
eukariota
 DNA
TRANSKRIPCIJA

RNA
5 RNA
transcript POLIMERAZA
OBRADA RNA EKSON
pre-mRNA
primarni transkript
INTRON

JEZGRA

AMINOKISELINA
AKTIVACIJA tRNA
CITOPLAZMA tRNA

mRNA RASTUĆI
POLIPEPTID
3
A
AKTIVIRANA
P
RIBOSOMSKE AMINOKISELINA
E
PODJEDINICE

5
TRANSLACIJA

E A
ANTIKODON

KODON

RIBOSOM
Vizualni sažetak!
DNA
transkripcija lanac DNA
jezgra
kodon kodon kodon

mRNA
translacija mRNA
citoplazma

alanin arginin leucin

protein
aminokiseline
polipeptida
Zadatak 1: Oksitocin i ADH
1. Koju ulogu imaju hormoni oksitocin i ADH?
2. Koje žlijezde ih proizvode?
3. Odredi slijedove u tRNA, mRNA, nekodirajućem i
kodirajućem lancu ako je slijed aminokiselina:

4. Usporedi aminokiseline oba hormona. Koliko se aminokiselina razlikuje?

5. Kako se sličnost u građi odražava na ulogu koja ta dva hormona obavljaju?
Oksitocin:
CYIQNCPLG
Oksitocin:
CYIQNCPLG
Cys Tyr Ile Gln Asn Cys Pro Leu Gly

mRNA 5´UGU UAU AUA CAA AAU UGC CCU CUU GGG 3´

tRNA ACA AUA UAU GUU UUA ACG GGA GAA CCC

DNA 5´ TGT TAT ATA CAA AAT TGC CCT CTT GGG 3´
3´ ACA ATA TAT GTT TTA ACG GGA GAA CCC 5´
ADH:
CYFQNCPRG
Zadatak 2.
Zadan je niz dušičnih baza u kodirajućem lancu
molekule DNA:

5´ ATG GTG GCG ACA AAG TCT TGA 3´

a) Napiši niz dušičnih baza na nekodirajućem lancu DNA.

b) Napiši niz dušičnih baza na mRNA koja nastaje
prepisivanjem lanca DNA iz prethodnog zadatka.
c) Napiši antikodone na tRNA koje će donijeti na ribosom
određene aminokiseline.
d) Odredi primarnu strukturu proteina.
Zadatak 2.

D
Zadatak 3.

DNA: 3’ – – 5’

mRNA: 5’ – A A A A U G C G G U A C U A C G G U – 3’

tRNA:

Polipeptid:
4. Određeni gen sadrži kod za protein koji se sastoji od 160
aminokiselina. Koliko otprilike nukleotida sadrži mRNA
koja prenosi uputu za taj protein?
a) 30 b) 40
c) 360 d) 480

5. Ako se u molekuli mRNA dugoj 33 nukleotida izostavi 19.

nukleotid koliko će aminokiselina u proteinu ostati
nepromijenjeno?

a) 10 b) 6 c) 1
d) 8 e) niti jedan odgovor
nije točan
6. Geni eukariotskih organizama nose u sebi umetnute regije koje ne kodiraju za
protein. Kodirajući dijelovi gena označeni su na slici slovom (E), a umetnuti
nekodirajući nizovi slovom (I). Ovako se može grafički prikazati neki gen:

Prilikom sinteze proteina, primarni RNA transkript se mora obraditi tako da se iz

njega izrežu svi nekodirajući dijelovi i tek tada se dobije funkcionalna mRNA.
Zamisli da si dobio/la na analizu neki gen čiji redoslijed baza u DNA lancu glasi:
TACTAACCGGCGCTGAACCAAAACTGACT
te da imaš protein koji je na temelju transkripcije i translacije tog lanca (gena)
nastao i glasi:
Met-Ile-Thr-Trp-Asp
Tvoj zadatak je:
A. otkriti nekodirajući dio u tom genu i podcrtati ga(ih)
B. ispisati primarni RNA transkript
C. ispisati funkcionalnu mRNA