Professional Documents
Culture Documents
Türkiye'deki Toprak Kazıcı Arılarla (Colletidae, Andrenidae, Halictidae Ve Anthophorini) İlişkili Nmatodların Tespiti
Türkiye'deki Toprak Kazıcı Arılarla (Colletidae, Andrenidae, Halictidae Ve Anthophorini) İlişkili Nmatodların Tespiti
CANAN ÇOBANOĞLU
Hacettepe Üniversitesi
Fen Bilimleri Enstitüsü Yönetmenliğinin
BİYOLOJİ Anabilim Dalı İçin Öngördüğü
YÜKSEK LİSANS TEZİ
Olarak Hazırlanmıştır.
2006
Fen Bilimleri Enstitüsü Müdürlüğü'ne,
Bu çalışma jürimiz tarafından BİYOLOJİ ANABİLİM DALI 'nda YÜKSEK LİSANS TEZİ
olarak kabul edilmiştir.
Üye :.….............................
Prof. Dr. Figen Erkoç
Üye :…..............................
Doç. Dr. Nurdan Özer
Üye :….............................
Yrd. Doç. Dr. Osman Sert
Üye :…............................
Yrd. Doç. Dr. A. Murat Aytekin
ONAY
Bu tez, ..... /..... / ....... tarihinde Enstitü Yönetim Kurulunca kabul edilmiştir.
2
Bana Ayaklarımın Üstünde
Durmayı Öğreten Sevgili
Annem’e ve Babam’a
3
TÜRKİYE’DEKİ TOPRAK KAZICI ARILARLA (Coletidae, Andrenidae, Halictidae
ve Anthophorini) İLİŞKİLİ NEMATODLARIN TESPİTİ
Canan Çobanoğlu
ÖZ
Danışman: Prof. Dr. Nevin KESKİN, Hacettepe Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji
Bölümü, Uygulamalı Biyoloji Anabilim Dalı
I
DETERMINATION OF THE NEMATODES ASSOCIATED WITH SOIL-DWELLING
BEES (Colletidae, Andrenidae, Halictidae and Anthophorini) IN TURKEY
Canan Çobanoğlu
ABSTRACT
It was determined that all isolated nematodes associated with soil-dwelling bees of
family Halictidae and Andrenidae had a phoretic relationship. Most of the data
obtained from this study are new record for Turkey.
II
BU TEZ ÇALIŞMASI, Doç. Dr. SELÇUK HAZIR
DESTEKLENMİŞTİR.
III
TEŞEKKÜR
Arazi ve laboratuvar çalışmalarımda her zaman yanımda olan, iyi bir çalışma
arkadaşı ve iyi bir dost olan Sayın Barış Gülcü’ye,
Nematodlardan DNA izolasyonun büyük bir kısmını gerçekleştiren Doç. Dr. Hatice
Mergen’e,
IV
Nematodların morfometrik analizlerinde ve kültürasyonunda yardımcı olan Barbara J.
Center’a,
Tez çalışmamda emeği geçen Ahmet Burak Yasan, Erdal Aytekin, Ayhan Korkmaz,
Havva Şakar, Nazlı Özbek, Özlem Aksoy, Sevil Arslan, Kıvılcım Çaktu, Gülümser
Çobanoğlu, Ayşegül Öztürk, Hasan Yeşil, Mahir İmamoğlu ve Gencer Türkmen’e,
V
İÇİNDEKİLER DİZİNİ
Sayfa
ÖZ....................................................................................................................... i
ABSTRACT .......................................................................................................... ii
TEŞEKKÜR .......................................................................................................iv
İÇİNDEKİLER DİZİNİ .......................................................................................... vi
ŞEKİLLER DİZİNİ ............................................................................................ viii
ÇİZELGELER DİZİNİ .........................................................................................ix
1. GİRİŞ ............................................................................................................... 1
2. GENEL BİLGİLER............................................................................................ 4
2.1. Nematodların Genel Özellikleri ......................................................................4
2. 2. Nematodlarda Tür Teşhisi ....................................................................................6
2. 2.1. Morfometrik Yöntemler ......................................................................................6
2. 2.2. Moleküler Yöntemler..........................................................................................6
2. 3. Arıların Genel Özellikleri.......................................................................................8
2. 4. Arıların Sınıflandırılması.....................................................................................11
2. 4. 1. Colletidae..........................................................................................................11
2. 4. 2. Andrenidae............................................................................................................12
2. 4.3. Halictidae ............................................................................................................ 13
2.4. 4. Apidae...............................................................................................................14
2. 4 .4. 1. Anthophorini ................................................................................................14
2. 5. Nematodlar ile Böcekler Arasındaki İlişki ..................................................15
2. 5. 1. Kommensalizm .......................................................................................15
2. 5. 2. Mutualizm ................................................................................................. 17
2. 5. 3. Parazitizm ................................................................................................. 18
2. 6. Toprak Kazıcı Arılarla İlişkili Nematodlar....................................................18
2. 6. 1. Toprak Kazıcı Arılarla İlişkili Nematodların Sınıflandırılması ................20
2. 6. 2. Aphelenchida Ordosu Nematodların Genel Özellikleri ...................... 21
2. 6. 3. Rhabditida Ordosu Nematodların Genel Özellikleri...............................22
2. 6. 4. Colletidae Familyası Arılarla İlişkili Nematodlar .....................................23
2. 6. 5. Andrenidae Familyası Arılarla İlişkili Nematodlar ..................................23
2. 6. 6. Halictidae Familyası Arılarla İlişkili Nematodlar .....................................24
VI
İÇİNDEKİLER DİZİNİ (Devamı)
Sayfa
2. 6. 7. Anthophorini Tribusu Arılarla İlişkili Nematodlar......................................26
2.7. Toprak Kazıcı Arılarla İlişkili Nematodların
Fungal ve Bakteriyal Konakları..................................................................27
3. YÖNTEM VE GEREÇLER................................................................................29
3.1. Arazi Çalışmaları .........................................................................................29
3.1.1. Arı Örneklerinin Toplanması .......................................................................29
3.2. Laboratuvar Çalışmaları...............................................................................29
3.2.1. Arıların Diseksiyonu ve Nematodların İzolasyonu ......................................29
3.2.2. Morfometrik Analizler.....................................................................................30
3.2.3. Moleküler Analizler..................................................................................30
3.2.3.1. Nematod Örneklerinden DNA izolasyonu ......................................30
3.2.3.2.Özgül Gen Bölgelerinin
Polimeraz Zincir Reaksiyonuyla (PCR) Amplifikasyonu .............31
3.2.4. Nematodların İn Vitro Koşullarda Kültürasyonu ........................................34
3.2.4.1. Çalışmada Kullanılan Kimyasallar ve Organizmalar .............................35
3.2.4.1.1. Çalışmada Kullanılan Kimyasallar .......................................................35
3.2.4.1.2. Çalışmada Kullanılan Organizmalar ....................................................35
3.2.5. Arı Teşhisleri ve Saklanması ......................................................................35
4. SONUÇLAR ................................................................................................... 37
4.1. Toprak Kazıcı Arılarla İlişkili Nematodların
Türkiye’deki Varlığı ve Dağılımı.............................................................................. 37
4.2.Toprak Kazıcı Arılardan Elde Edilen Nematod İzolatları ......................................42
4.3. Nematod İzole Edilen Arı Türleri ve Arı Vücut Bölgeleri...................................49
4.4. In vitro Kültür Yöntemleri ...................................................................................54
4.5. Filogenetik Ağaçlar ve Belirlenen Nematod Türleri .............................................55
4.6. Morfolojik Analizler................................................................................................63
5. TARTIŞMA ..................................................................................................... 66
6. KAYNAKLAR .............................................................................................. 78
7. ÖZGEÇMİŞ ......................................................................................................87
VII
ŞEKİLLER DİZİNİ
Sayfa
Şekil 2.1. Ökaryotik ribozomal RNA gen ailesi..................................................8
Şekil 4.1. Toprak kazıcı arı örneklemi alınan iller ...........................................38
Şekil 4.2. Toplanan arı örnek sayılarının bölgelere göre dağılımları...............39
Şekil 4.3. Toplanan arı örneklerinin bölgelere göre dağılım oranları (%) ........39
Şekil 4.4. Pozitif örneklerin bölgelere göre dağılım oranları (%) . ...................40
Şekil 4.5. Toprak kazıcı arılarla ilişkili nematod izole edilen iller.....................41
Şekil 4.6. Medyan oviduktta saptanmış dauer evre bir nematod (4X).............51
Şekil 4.7. Andrena pilipes (Andrenidae) dişisine ait abdominal bezler (a),
tek bir abdominal bez (b), izole edilen yeni tür Diplogasterid
nematod daueri (c), Andrena pilipes dişisi (d)....................................51
Şekil 4.8. Halictidae familyası arılarda nematod belirlenen vücut bölgeleri. ...52
Şekil 4.9. Farklı büyütmelerde ve farklı tür arılardan (Halictidae)
elde edilmiş dauer evre nematod içeren zehir keseleri. .....................53
Şekil 4.10. Mitokondriyal sitokrom oksidaz I (mtCOI) MP Bayesian analizi ....56
Şekil 4.11. Lasioglossum (Halictidae) türlerinden elde edilen nematodların
Ribozomal RNA (rRNA) D2D3 LSU Bayesian analizi. .......................58
Şekil 4.12. Diplogasteridae familyasına ait nematodların Ribozomal RNA
(rRNA) D2D3 LSU Bayesian analizi.................................................60
Şekil 4.13. Bursaphelenchus cinsine ait nematodların
Mitokondriyal sitokrom oksidaz I (mtCOI) MP Bayesian analizi. ......61
Şekil 4.14. Bursaphelenchus cinsine ait nematodların Ribozomal RNA
(rRNA) D2D3 LSU Bayesian analizi.................................................62
Şekil 4.15. AY-13 izolatına ait (Bursaphelenchus anatolius) erkek bireylerin
mikroskobik görüntüsü (10 X) ..........................................................64
Şekil 4.16. AY-13 izolatı (Bursaphelenchus anatolius) erkek bireylerine
ait spikül ve kuyruk yapısının mikroskobik görüntüsü (40 X) ...........64
Şekil 4.17. AY-13 izolatı (Bursaphelenchus anatolius) erkek bireylere ait
özafagus ve stylet yapılarının mikroskobik görüntüsü (63 X)...........65
Şekil 4.18. AY-13 izolatı (Bursaphelenchus anatolius) dişi bireylerine ait
vulva yapısının mikroskobik görüntüsü (40 X) .................................65
VIII
ÇİZELGELER DİZİNİ
Sayfa
Çizelge 4.1. Arı örneklem sayısının coğrafik bölgelere göre dağılımı ............37
Çizelge 4.2. Arı örneklem sayısının, nematod varlığı yönünden
pozitif olan familyalara ve coğrafik bölgelere
göre dağılımı ve oranları................................................................40
Çizelge 4.3. Nematod varlığı açısından pozitif çıkan tüm örnekler .................42
Çizelge 4.4. Arı türüne, cinsiyetine ve familyasına göre elde edilen
nematod izolat sayıları ve nematod izole edilen
arı vücut bölgeleri........................................................................ 49
Çizelge 4.5. Zehir kesesinde ölü birey belirlenen nematod izolatları
ve ilişkili olduğu arı türleri...............................................................53
Çizelge 4.6. In vitro üretilebilen nematod izolatları,
bunlarla ilişkili arıların toplandığı coğrafik bölgeler,
arı türleri ve nematod elde edilen arı vücut bölgeleri ....................54
IX
1. GİRİŞ
Biyolojik çeşitlilik, canlı organizmalar ve onların oluşturduğu ekolojik kompleksler
arasındaki çeşitlilik ve değişkenliği ifade eder (Boyle, 1994). Başka bir ifadeyle, belirli
bir zamanda belirli bir yerdeki toplam tür sayısı ve nisbi tür yoğunluğudur (Hubbell,
2001). Biyolojik çeşitlilik kavramı, hem genetik çeşitliliği, hem de ekolojik çeşitliliği
içermektedir (Kence, 1988; Başkent, 1999).
Genetik çeşitlilik, bir türün gen havuzundaki kalıtsal bilginin çeşitliliği ve zenginliği
olarak tanımlanabilir. Canlı türünün değişen çevre koşullarına uyum sağlayabilmesi
için genetik çeşitlilik şarttır (Kence, 1988).
Ekolojik çeşitlilik ise, belirli bir bölgedeki farklı ekosistemler, tür toplulukları ve bu
toplulukların içindeki tür sayıları olarak tanımlanabilir (Kence, 1988).
Gerek genetik çeşitlilik, gerekse ekolojik çeşitlilik olarak biyolojik çeşitlilik, bir ülkenin
en temel doğal kaynaklarını oluşturur (Kence, 1988). Genel olarak, bir ülkedeki tüm
bitki ve hayvan türleri, bunlar arasında özellikle tarım, ormancılık, hayvancılık, tıp-
eczacılık ve sanayi alanlarında kullanılan türler, hem o ülkenin, hem dünyanın
biyolojik zenginliklerinden sayılır (Kışlalıoğlu ve Berkes, 1993).
Dünyada, bir milyonun üzerinde tanımlanmış böcek türü bulunmaktadır. Bunların pek
çoğu hayat evrelerinin büyük bölümünü ya da bir kısmını nematodların geliştiği ve
ürediği ortamlarda geçirir. Aslında böcekler nematodlar için potansiyel bir besin
kaynağı ve iyi birer sığınaktır. Nematodlar suya ve neme ihtiyaç duyan organizmalar
olduğundan, karasal böcek konaklarına nazaran sınırlı yayılım gücüne sahiptir.
Böceklerle ilişki kurabilenler, onlarla birlikte dağılımlarını sağlarken bu sayede
gereksinim duydukları besine de bol miktarda ulaşırlar (Giblin-Davis et al., 2003a).
2
Günümüzde nematodlarla toprak kazıcı arılar arasındaki ilişki hakkında çok az şey
bilinmektedir. Yapılan araştırmalar nematodların, Halictidae, Anthophoridae,
Colletidae ve Andrenidae familyalarına ait toprak kazıcı arılarla yakın ilişki içinde
olduğunu göstermiştir. Bu tür çalışmaların çoğu Amerika ve Avrupa ülkelerinde
gerçekleştirilmiştir (Giblin et al.,1984; Giblin and Kaya, 1984a; Giblin-Davis et al.,
1990; Giblin-Davis et al., 1993).
3
2. GENEL BİLGİLER
2.1. Nematodların Genel Özellikleri
Nematodlar (Şube: Nematoda) segmentsiz, genellikle silindirik ve uzamış
vücutlarından dolayı halkasal veya iplikkurdu olarak bilinen, boyları 0.1 mm ile birkaç
metre arasında değişen omurgasız hayvanlardır (Kaya and Koppenhöfer, 1999;
Koppenhöfer, 2000). İlk kayıt M.Ö. 1550 yıllarından kalma papirüslerde belirlenen
insan barsak paraziti Ascaris lumbricoides ve doku paraziti Dracunculus
medinensis’e aittir (Poinar, 1983).
4
bulunmaktadır. Bu iki sistem de yalnızca nematodlarda bulunur. Enine bağlantılardan
ya da sol koldan bir kanal çıkarak vücut yüzeyine ulaşır. Boşaltım sistemi, azotlu
atıkların atılmasının sağlanması yanında ozmoregülatör özelliğiyle vücut boşluğunun
turgor basıncını ayarlar. Nematodlar azotlu atıklarını, amonyum, üre veya ürik asit
formunda dışarı atarlar. Azotlu atıklar nemli bir ortamda amonyum formunda çevreye
atılır (Poinar, 1983; Viglierchio, 1991; Şimşek, 2003).
Sinir sistemi, düz olup beyin fonksiyonu gösteren anterior bir ganglion kitlesine
sahiptir. Bu ganglion kitlesi vücudu anterior ve posterior olarak saran sinir kordlarıyla
bağlantılıdır. Merkezi ganglion kitlesi çoğunlukla ön barsağı çepeçevre saran sinir
halkası olarak bilinir (Poinar, 1983; Hazır, 2002).
Nematodlar, birey sayısı bakımından dünyadaki en fazla sayıya sahip çok hücreli
hayvanlardır. Yaklaşık % 50’si denizde yaşar, tüm okyanuslarda intertidial zonlardan
yüzlerce metre derinliğe kadar çok sayıda bulunurlar. %15’i omurgalı ve omurgasız
hayvanlarda (insan dahil) parazittir. Bitki paraziti olan nematodlar tüm nematodların
% 10’luk kısmını; serbest yaşayanlar ise %25’lik kısmını oluşturur (Viglierchio, 1991).
Serbest yaşayanlar bakteri, fungus, protozoa ve diğer nematodlar üzerinden beslenir.
Tüm nematodlar sucul veya nemli ortamlar içerisinde yaşar, çünkü ancak bu
habitatlarda aktiftirler (Felix, 2004; Yeates and Boag, 2004).
5
Nematodların 26.000’den fazla türü bulunmaktadır. Bunların büyük kısmı tarım,
medikal ve veterinerlik açısından önemli olan türlerdir (Chilton et al., 2003). Buna
karşın dünya üzerinde en azından 500.000 tür nematod olduğu tahmin edilmektedir
(Poinar, 1983). Nematodların diğer organizmalarla ilişki kurması sıkça rastlanan bir
durumdur. Bitki ve hayvan tür çeşitliliği, bunlarla ilişkili nematod çeşitliliğini de
doğrudan etkiler. Nematodların çeşitliliği hakkında etkili ve test edilebilen hipotezler
kurabilmek için nematodlardaki türleşme mekanizmalarının ve modellerinin
anlaşılması gerekir. Bu nedenle ana sorulardan birisi nematodların diğer
organizmalarla olan ilişkilerinin önemidir (Giblin-Davis et al., 2003b).
6
Nematodların tür tanısında ve filogenetik ilişkilerini anlamada ribozomal ve
mitokondriyal genoma ait genetik markırlar kullanılmaktadır (Chilton et al., 2003).
Ökaryotlarda rRNA’nın büyük alt ünitesini oluşturan 5.8 S ve 28S genleri ribozom
fonksiyonu için gerekli olduğu düşünülen ve nispeten korunmuş diziler ile 12 tane çok
değişken bölge içerir. Bunlar “divergent domains” (farklılaşmış bölgeler- D) veya
expansion segments (genişleme segmentleri) olarak isimlendirilmiştir. Günümüzde
evrimsel olayların çözümünde D bölgeleri arasındaki dizi farklılıklarından oldukça
faydalanılmaktadır. (Chilton et al., 2003). Bu nedenle nematodların tür ayrımında da
nükleer rRNA’nın özellikle 28S alt ünitesinin D2/D3 segmentleri ile ITS bölgeleri
kullanılmaktadır (Nadler and Hudspeth, 1998; Stock et al., 2001; Giblin-Davis et al.,
2003b).
7
D2-D3
Hymenoptera ordosunda erkekler tipik olarak haploit, dişiler ise diploitir. Sosyal
yaşayanlarda kraliçeler bir ya da daha fazla erkekten aldığı spermleri
8
spermatekasında depolar. Kraliçeler yavruların cinsiyetini mükemmel bir şekilde
kontrol eder. Dişi oluşturmak için spermatekadan ovidukta bırakılan sperm yumurtayı
dölleyerek diploid yumurtayı meydana getirir. Gelişen larva çevresel koşullara bağlı
olarak verimli kraliçeyi ya da kısır işçi arıyı oluşturur. Erkek birey için kraliçe, ovidukta
sperm akışını engeller, yumurta haploid olarak gelişir (Gadagkar, 2004).
Arılar hayat döngüsü içerisinde yumurta, larva, pupa ve ergin dönemler geçirir. Bir
dişinin oluşturabileceği yumurta sayısı arı gruplarına göre değişir. Bazı soliter türler
için bu sayı 8 ya da daha az iken; eusosyal arılardan bazıları bir milyondan fazla
yumurta bırakabilir. Yumurtalar genellikle yuvaya depolanan besin üzerine bırakılır,
larva çıktığında bu besini kullanır. Larva 4 evre geçirir. Son larval döneme prepupa
denir. Pupalar oldukça narindir, uzun elverişsiz koşullara dayanıksızdır ve gelişim
süreci çok hızlıdır (Michener, 2000).
Genel olarak “arı” denildiğinde birçok insan için balarısı akla gelmekte ise de,
yeryüzünde yaklaşık 20.000 arı türü mevcuttur (Özbek ve Yıldırım, 1996; Michener,
2000). Arı türlerinin % 10’u sosyal, % 75’i soliter ve % 5’i ise diğer arı türleri üzerinde
parazit olarak yaşamaktadır (Özbek, 1995). Ilıman iklimlerde soliter arıların yaklaşık
%70’i yuvalarını toprağa, geri kalan türler ise böceklerin ağaç gövdelerinde oluşturup,
terkettiği oyuklara yapar.
Toprak kazıcı arıların çoğu, çıplak ya da seyrek bitki örtülü, kumlu, küçük partiküllü,
kuru ve düşük humus içerikli toprakları tercih eder. Seyrek bitki örtülü alanların tercih
edilmesinin nedeni güneşten yüksek oranda faydalanmak ve bitki köklerinin yuva
içerisinde gelişimini engellemektir (Calabuig, 2000). Ülkemizin iklim koşulları ve
topoğrafik yapısı, bitki örtüsünü zengin kıldığı gibi, arı türlerinin de çok sayıda
olmasına olanak sağlamıştır. Ülkemizde arı türlerinin sayısı 1000’i geçmektedir
(Özbek, 1995; Çalmaşur ve Özbek, 1999).
Bazı arılar soliter bazıları ise koloni halinde yaşar. Soliter yaşamda dişi birey, arı
yuvasını yapar ve yavruları için besin sağlar. Diğer arılara yardım etmez, genellikle
yavrular erginleşmeden önce kendisi ölür ya da yuvadan ayrılır. Koloni yaşamı süren
arılarda ise, bir yuvada iki ya da daha fazla dişi birey bulunur. Genellikle bu dişiler
arasında bir ayrım vardır. Bir dişi kraliçedir, çiftleşmiştir ve yumurta bırakır. Diğer
9
dişi/dişiler yiyecek sağlar, yuva bakımıyla ilgilenir, yuvayı korur ve genelde
çiftleşmemiştir. Bazı türlerde kraliçe arılar işçilerden daha büyüktür. Bal arıları gibi
kraliçe ile işçiler arasında büyük morfolojik farklar bulunan, kraliçenin tek başına
yaşayamadığı, işçilerin yalnız varlığını sürdüremediği, çiftleşemediği dolayısıyla yeni
döl veremediği kolonilere yüksek sosyal koloniler denir (Michener, 2000).
Arılar, sadece kültür bitkilerinde tozlaşma yaparak ürünün nicelik ve nitelik yönünden
artmasını sağlamakla kalmayıp, doğadaki yabani bitkilerde de tozlaşmayı
10
gerçekleştirerek bu bitkilerin çoğalıp yayılmalarına, yaban hayatının gelişmesine, bitki
ve hayvanlarda çeşitliliğin artmasına olanak sağlamaktadır (Çalmaşur ve Özbek,
1999). Doğadaki arı tozlaşmasına muhtaç olan çiçekli bitkilerin, soylarını devam
ettirebilmeleri tamamen arı faaliyetine bağlı olmaktadır. Arı ve çiçek arasındaki
karşılıklı yararlanmaya dayanan ilişki nedeniyle, arıların yeterli sayıda olmaması
durumunda birçok bitki tehdit altında kalabilmekte, hatta yok olma durumuyla karşı
karşıya kalmaktadır (Özbek, 1995).
Regnum: Animalia
Phylum: Arthropoda
Classis: Insecta
Ordo: Hymenoptera
Subordo: Apocrita
Superfamilia: Apoidea
Familia : Stenotritidae
Familia : Colletidae
Familia : Andrenidae
Familia : Halictidae
Familia : Melittidae
Familia : Megachilidae
Familia : Apidae
2.4.1. Colletidae
Yaklaşık 3.000 türü bulunan familyanın tüm üyeleri soliter yaşar (McGavin, 2001).
Arıların oldukça primitif bir grubunu oluşturur (Borror and Delong, 1964). Colletinae,
Diphaglossinae, Xeromelissinae, Hylaeinae ve Euryglossinae olmak üzere 5 alt
familyaya ayrılır (Michener, 2000).
Hemen hemen tüm familya üyeleri sahip oldukları glossal özellikleri sayesinde diğer
arı gruplarından ayrılır. Glossa kısa, genellikle uzunluğundan daha geniş, çentikli
(biloblu) ya da ucu kesikli (truncate)’dir (Özbek, 1977; Michener, 2000).
11
Bu familya üyeleri dünyada geniş alana yayılmışlardır. Avustralya’nın ve Güney
Amerika’nın ılıman bölgelerinde çok sayıda ve çeşitlilikte bulunurlar. Holoarktik
bölgede en sık rastlanılan iki cinsi Colletes ve Hylaeus’dur. Buna karşın
Avustralya’da çok farklı cinsler yaşamaktadır. Nemli tropik bölgelerde bu familya
üyelerine nadir olarak rastlanır (Michener, 2000).
2.4.2. Andrenidae
Andrenidae familyasına mensup arılar, küçük ve orta büyüklükte olup ön kanatlar 2-3
submarginal hücreye sahiptir (Özbek, 1975). Andrenidae’nin en önemli ayırt edici
karakteri; her anten bazalinden ventrale doğru 2 subantenal suturun bulunmasıdır
(Borror and Delong, 1964; Özbek, 1975; Michener, 2000). Diğer familya karakterleri;
kısadan uzuna kadar değişebilen, noktalı ve bazen flabellumla sonlanan
glossalarının varlığıdır. Seri şeklindeki kılları büyük ya da orta büyüklükte olabileceği
gibi bazen de hiç olmayabilir. Halkasal kıllar noktalı, dallanmamış ve genelikle incedir
(Michener, 2000).
12
Andrenidae familyası, Alocandreninae, Andreninae, Oxaeninae ve Panurginae alt
familyalarına ayrılır. Avustralya ve Asya’nın tropikal bölgeleri hariç tüm kıtalarda
bulunur (Michener, 2000).
Andrenidae familyasının tüm üyeleri yuvalarını toprağa yapar. Her bir lateral tünelin
sonuna bir tane veya kısa seriler halinde hücreler ve tüneller yapılır. Hücreler parlak
bir salgıyla sıvanır (Borror and Delong, 1964; Michener, 2000).
2.4.3. Halictidae
Halictidae familyasının 5.000’den fazla türü bulunmaktadır (Pesenko et al., 2000).
Bazı üyeleri, dünyanın birçok ılıman bölgesinde birey sayısı bakımından diğer
arılardan (Apis hariç) fazladır (Michener, 2000). Küçük ile orta büyüklükte olabilen
bazılarımetalik renkli arılardır (Borror and Delong, 1964).
Glossanın sivri ve kısa olması, lacinianın küçük olması, labiomaksillar tüpün anterior
yüzeyinin kıllı loblu oluşu, her antennal sokette bir subantenal suturun varlığı,
labrumun genişliğinin boyundan fazla oluşu, stigmanın iyi gelişmiş olması, önemli bir
kısmında ön kanadın bazal damarının dışbükey bir kavis teşkil etmesi, arolianın iyi
gelişmiş olması familyanın karakteristik anahtar özelliklerindendir (Özbek, 1979;
Michener, 2000).
Birçok halictid, toprak altında küçük koloniler halinde yaşar. Yuvaları homomorfiktir.
Yani toprağın kazılmasıyla veya diğer maddelerin yapılandırılmasıyla (ağaç kökleri
gibi) oluşan, birbirine benzer gözlerden meydana gelir (Michener, 2000). Yuva, tek bir
boyuna oyuk ve buna bağlı lateral tünellerden oluşur (McGavin, 2001).
13
2.4.4. Apidae
Apidae, çok çeşitlilik gösteren, diğer familyalara göre daha fazla sayıda tribus içeren
bir familyadır. Michener (2000) Apidae familyasını 3 altfamilyaya ayırır: Xylocopinae,
Nomadinae ve Apinae.
Vücutları çok sık tüylüdür, bu tüyler bazen bir kürk gibi görünür (Demirsoy, 2001).
Kültürel evrimin başlangıcından beri insanlara en yakın ve en ilginç gelen çok önemli
ve yararlı böceklerdir (Aytekin and Çağatay, 1999).
2.4.4.1. Anthophorini
Apoidea üstfamilyasının en gelişmiş gruplarından birisidir (Özbek and Banaszak,
1985). Apidae familyasında, Apinae altfamilyasında yer alır (Michener, 2000).
Vücutları çok kıllıdır. Nokta gözler üçgen şeklinde konumlanmıştır. Bazılarında glossa
22 mm’ye ulaşır. Nektarı derinlerde olan çiçeklerden başarıyla beslenebilirler. Arka
tibialarındaki sık kılların arasında kuru polenleri taşıyabilirler (Demirsoy, 2001).
Yuvalarını toprağa yaparlar. Yalnızca Anthophora Latreille, 1803’ün Clisodon alt cinsi
yuvasını ağaç köklerine veya gövdelerine yapar. Suyla veya nektarla hafifçe ıslatılmış
toprak, arının yuva yapmasını kolaylaştırır. Dufour bezi sekresyonuyla ıslatılmış
toprak partikülleriyle büyük bir oyuk şeklinde kuluçka hücreleri yapılandırılır. Hücreler,
dufour bezinden salgılanan, trigliserit bakımından zengin bir salgıyla astarlanır. Bu
madde depo besindeki tükrük salgısının içinde bulunan ve digliserit bakımından
zengin salgıyla temas edince katılaşır. Böylece hücrenin iç kısmı mum benzeri bir
14
astara sahip olur. Bu astar, hücreyi su geçirmez hale dönüştürür. Daha sonra bu
tabaka büyüyen larva tarafından yenir. Depolamış olduğu besin maddeleri viskoz
veya tamamen sıvıdır. Depo besin madde içeriğinde polen, nektar, dufour bezi ve
tükürük bezi ürünleri bulunur. Bu besin erzağı kendine özgü bir maya kokusuna
sahiptir (Michener, 2000).
Hücreye besin depo edilip üzerine yumurta bırakıldıktan sonra hücre çamur ya da killi
toprak ile helezon şeklinde sarmal oluşturularak kapatılır. Helezonun ortasında küçük
bir boşluk kalır. Arı dilini sokarak astarlamada kullandığı materyali iç kısma sürer,
böylece boşluğun iç kısmını da kapatmış olur (Michener, 2000).
Bazı kaynaklar bu grubu Anthophoridae adı altında ayrı bir familya olarak kabul eder
(Borror and Delong, 1964; Özbek and Banaszak, 1985).
2.5.1. Kommensalizm
Kommensalizm tipi ilişkide birlikte yaşayan iki türden birinin diğerinden yaralanması,
diğerinin ise bu ilişkiden yarar veya zarar görmemesi durumu söz konusudur (Saygı,
1999). Bu yararlanma ya diğer türün artık maddelerinden yararlanma ya da vücuduna
zarar vermeden çeşitli amaçlar için kullanma şeklinde olur (Demirsoy, 1998). Bazı
nematod türleri konakçısı olduğu böceklerle zorunlu kommensal ilişkiler içine girer
(Kaya and Koppenhöfer, 1999). Eğer dauer juvenil fazdaki bir nematod, sağlıklı bir
15
konak üzerinde bulunursa nematod ile böcek arasındaki ilişkinin kommensal olduğu
farz edilebilir (Giblin, 1987).
Böcekler ile nematodlar arasındaki kommensal ilişki forezis şeklindedir (Giblin, 1987).
Burada böcek, nematodu sadece bir yerden başka bir yere taşınmaktadır. Genellikle
aynı habitatı paylaşan nematod ile böcek arasında gerçekleşir. Nematodlar sınırlı
yayılım gücüne sahip hayvanlardır. Böceklerle foretik ilişki kurarak yeni habitatlara
yayılımlarını sağlar, yeni ve bol kaynaklara ulaşırlar. Foretik ilişki kuran nematodlar,
böcekte yayılımlarını dauer juvenil formunda gerçekleştirir (Poinar, 1983; Giblin,
1987). Bir nematodun açlığa, kurumaya ve kimyasallara karşı dirençli, özel bir
morfolojiye ve enerji metabolizmasına sahip, beslenmeyen, uzun süre hayatta kalma
özellikleriyle donatılmış juvenillerine dauer juvenil denir. Dauer juvenillerin oluşumu
feromonlar ve çevresel uyarılarla düzenlenmektedir (Giblin, 1987; Riddle, 1988).
Forezis eksternal (dış) veya internal (iç) olabilir (Poinar, 1983). Dauer formdaki
nematodlar sıklıkla konakçısının elitrasının altında, segmentler arası katlantılarında
veya bacakları üzerinde taşınır. Bazı foretik nematodlar ise böceklerin barsak ve
buna bağlı bezler içinde ya da üreme sistemi, trakeal sistem gibi iç yapılarında
taşınabilir. Bu nedenle kolaylıkla parazitlerle karıştırılabilir (Giblin, 1987). Eksternal
forezise örnek olarak Rhabditis coarctata (Ordo: Rhabditida) verilebilir. Bu nematod
türü büyükbaş hayvanların gübresinde bulunan bakterilerle beslenir. Habitat
kuruduğunda dayanıklı fazı olan dauerler meydana gelir. Aynı ortamda beslendiği
arthropodun yüzeyine tutunur. Özellikle Aphodius cinsi böceklerin başına, toraksına,
elitrasına ya da bacaklarına tutunarak kendini taşıtır. İnternal forezise örnek olarak
Caenorhabditis dolichura (Ordo: Rhabditida), Diploscapter coronata (Ordo:
Rhabditida), Eudiplogaster historphorus (Ordo: Rhabditida) ve Pristionchus lheritieri
(Ordo: Rhabditida) türü nematodlar gösterilebilir. Bu nematodlar karıncaların
yuvasında yaşar. Dauer fazındayken karıncaların başlarında yer alan bezlerin içine
girer. Bez içinde gelişmeyen nematodlar tekrar toprağa döndüğünde beslenmeye ve
gelişmeye başlar (Poinar, 1983).
16
2. Omurgasız canlı ile nematod arasında beslenmeye dayalı bir ilişki söz konusu
değildir.
3. Nematoda kazandırdığı en büyük yarar onun hayatta kalmasını ve dağılımını
sağlamaktır (Poinar, 1983).
2.5.2. Mutualizm
Mutualizm, türler arasında karşılıklı yararlanmanın esas olduğu bir ilişkidir (Bronstein,
2001). Bu yararlanma evrimsel olarak bir zaman sonra o denli sıkı ilişkilere döner ki,
artık bireyler birbirinden bağımsız olarak yaşayamaz (Demirsoy, 1998). Nematodlar
ve böcekler arasında bildirilen tek mutualizm örneği Fergusobia (Tylenchida:
Neotylenchidae: Fergusobiinae) cinsi nematodlar ile Fergusonina (Diptera:
Fergusoninidae) cinsi sinekler arasındadır. Bu ilişki sonucunda Eucalyptus,
Corymbia, Angophora, Melaleuca ve Syzygium gibi bitkilerin genç meristematik ve
apikal dokularında gal meydana gelir. Sinek, nematodun yayılımından ve
beslemesinden, nematod ise sinek larvasının beslendiği ve korunduğu gal
oluşumundan sorumludur (Giblin-Davis et al., 2003b).
17
2.5.3. Parazitizm
Birlikte yaşayan farklı türlerden iki canlıdan birinin diğerine (konak) bağımlı olarak ve
onun zararına yaşamını sürdürmesine parazitlik denir (Saygı, 1999). Giblin (1987),
nematodları böceklerle kurdukları parazitik ilişkilere göre 3 kategoriye ayırır. Birincisi,
mutualistik komplekslerle oluşturulan parazitlik; ikincisi, iki evreli (dicyclic) parazitlik;
üçüncüsü ise zorunlu parazitliktir. Mutualistik komplekslerle oluşturulan parazitliğe
örnek olarak Steinernematidae ve Heterorhabditidae (Ordo: Rhabditida) familyasına
mensup entomopatojen nematodlar verilebilir. Bu nematodlar mutualistik ilişki
içerisinde oldukları Enterobacteriaceae familyasına ait Xenorhabdus
(Steinernematidler’de) ve Photorhabdus (Heterorhabditler’de) bakterileri sayesinde
böcek konaklarını 48 saat içerisinde öldürme yeteneğine sahiptir (Burnell and Stock,
2000; Hazır, 2002).
Zorunlu parazitlik ise bir parazitin hayat döngüsünü tamamlamak için mutlak bir
konağa ihtiyaç duyması şeklinde tanımlanabilir. Mermithidae, Tetradonematidae,
Allanonematidae, Sphaerulariidae, Entaphelenchidae, Parasitodiplogasteridae,
Oxyuridae, Rhabditidae, Carabonematidae, Aphelenchoididae ve Syrphonematidae
nematod familyalarında bu tip ilişkiye rastlanılmaktadır (Giblin, 1987). Kaya ve
Koppenhöfer (1999), zorunlu parazitlik yanında fakültatif parazitlikten de bahseder.
Fakültatif ilişkilerde nematod, hayatının belirli bir dönemini konakçısı olan böcekten
bağımsız olarak geçirir. Ne zamanki çevresinde konakçısı böcekle karşılaşır, o
zaman parazitik yaşam döngüsü başlar. Ancak, zorunlu ilişkilerde nematod, konakçı
böceğin yokluğunda yaşayamaz .
18
Dorylaimida: Longidoridae) arasında değişir. Her türlü toprakta bol (milyon/m2) ve
çeşitli (30 taksondan fazla) sayıda bulunurlar (Yeates and Bongers, 1999). Tipik
olarak 100 gram toprak örneğinde 3.000 civarında nematod bulunur (Bongers and
Bongers, 1998). Bunlar toprak organizmaları üzerinden beslenirler. Hareketleri
topraktaki partiküller üzerinde bulunan su filminin devamlılığına bağlıdır. Aktiviteleri,
toprağın biyolojik ve fiziksel koşullarıyla kontrol edilir. Morfolojik açıdan en belirgin
değişiklik baş yapılarında görülür. Bu farklılık ise beslenme habitatlarına bağlıdır
(Yeates and Bongers, 1999).
Omurgasız canlılarla ve arılarla ilişkili ilk parazitik nematod varlığı 1742 yılında
Fransız doğa bilimi uzmanı Reaumur tarafından bildirilmiştir. Reaumur, Bombus
arıları üzerine yaptığı araştırma sırasında kraliçe arıların vücut boşluğunda
nematodlara rastlamıştır. O an için ne olduğunu anlayamadığı nematodları tuhaf
yapılar olarak kaydetmiş ve çizmiştir. Daha sonra bu nematod Sphaerularia bombi
olarak tanımlanmıştır (Poinar, 1983). Arılarla ilişkili nematodlar hakkında Türkiye’den
bildirilen ilk ve tek kayıt da yine bir Bombus arısına aittir. Ankara’dan toplanan
Megabombus sylvarum citrinofasciatus kraliçelerinden, türü saptanamamış
Allantonematidae (Tylenchida) familyasına ait parazitik bir nematod izole edilmiştir
(Aytekin et al., 2002).
Toprak kazıcı arılarla ilişkili parazitik olmayan nematod varlığı ilk defa Altenkirch
(1962) tarafından bildirilmiştir. Almanya’nın çeşitli bölgelerinden toplanan Andrenidae
familyası toprak kazıcı arılardan Andrena vaga Panzer, Andrena fulva Schrank ve
Andrena albicans Muller dişilerinin abdominal bezlerinde Diplogasteridae familyasına
ait dauer juvenil nematodlara rastlanılmıştır. Abdominal bezler dışında arının scopa
kıllarında, yuvadaki polen topu üzerinde ve yuva duvarı etrafında da nematod
bulunmuştur (Altenkirch, 1962).
19
Rhabditida) cinsine ait nematodların Halictidae, Koerneria (Ordo: Rhabditida) cinsine
ait bazı türlerin Andrenidae ve Colletidae familyası arılarla foretik ilişkili olduğunu
ortaya koymuştur (Giblin and Kaya, 1983a; Giblin and Kaya, 1983b; Giblin and Kaya,
1984a; Giblin and Kaya, 1984b; Giblin and Kaya, 1984c; Giblin et al., 1984; Giblin-
Davis et al., 1990; Giblin-Davis et al., 1993; Giblin-Davis et al., 2005; McFrederick
and Roulston, 2005).
Bu nematodlar, konakçı olan ergin arının vücudunda seyahat eder, larvalar arının
besin erzağı üzerinde gelişen bakteri ya da funguslar üzerinden beslenir
(McFrederick and Roulston, 2005). Nematod yayılım gücünü artırırken, arı bu
ilişkiden ne yarar ne de zarar görür (Giblin, 1985). Nematodların hayat döngüsü ile
arıların hayat döngüsü senkronize olarak ilerler (Giblin-Davis et al., 1990).
Phylum: Nematoda
Classis: Secernentea
Ordo: Aphelenchida
Subordo: Aphelenchina
Superfamilia: Aphelenchoidoidea
Familia: Parasitaphelenchidae
Genus: Bursaphelenchus
(Hunt, 1993)
Phylum: Nematoda
Classis: Secernentea
Ordo: Rhabditida
Subordo: Rhabditina
Superfamilia: Diplogasteroidea
Familia: Diplogasteridae
Genus: Aduncospiculum
(Baldwin et al., 1997; Blaxter et al., 1998)
20
Phylum: Nematoda
Classis: Secernentea
Ordo: Rhabditida
Subordo: Rhabditina
Superfamilia: Diplogasteroidea
Familia: Diplogasteridae
Genus: Koerneria
(Goodey, 1963; Ebsary, 1986)
Çok sayıda tür, Scolytidae (Ordo: Coleoptera) familyası böceklerin açtığı tünellerde
bulunur. Onların atıklarında gelişen funguslar üzerinden beslenir. Böcekleri
kullanarak bir ağaçtan diğerine taşınımını sağlar. Dauer juvenil evre nematod,
böceğin elitra altına, tergitlerin segmental arası katlantılarına ve sternitlerine tutunur.
Bu şekilde tek bir böcek yüzlerce daueri taşıyabilir. Bu ilişki bir ektoforezis örneğidir.
Ektoforetik nematodlar fungusla beslenir ve konakçı böceği sadece taşıma aracı
olarak kullanır. Aphelenchida ordosunda bu duruma en iyi örnek Bursaphelenchus
üyeleridir (Giblin, 1985; Hunt, 1993).
21
ölü ya da ölmek üzere olan konifer ağaçlarla ilişkilidir (Ryss et al., 2005). Çoğunlukla
ektoforetik ilişki kurdukları böcekleri yeni çevrelere taşınmak için kullanırlar (Braasch,
2001). Başlıca vektörleri Coleoptera ordosundan Scolytidae, Cerambycidae,
Curculionidae ve Buprestidae familyasına ait böceklerdir (Ryss et al., 2005). Nadir
olarak endoforetik İlişkiler de kurabilir. Toprak kazıcı arılardan Halictidae ve
Anthophorini familyalarına ait türlerle endoforetik ilişki kurduğu belirlenmiştir (Giblin-
Davis et al., 1990; Giblin-Davis et al., 1993; Giblin-Davis et al., 2005). Önceleri
Bursaphelenchus türlerinin belli bir ekonomik öneme sahip olmadığı düşünüldüğü için
sadece akademisyenler tarafından çalışılmıştır. Ancak 1969 yılında bir
Bursaphelenchus türünün (B. xylophilus) çam ağaçlarında patojen etkiye sahip
olduğunun anlaşılmasıyla bu gruba olan ilgi artmıştır (Braasch, 2001). Bilinen türlerin
yaklaşık %70’i Pinus türleriyle ilişkilidir (Ryss et al., 2005).
22
beslenirler. Microbotrophic nematodların kendileri de diğer omurgasız hayvanlar
tarafından besin olarak kullanılırlar (Poinar, 1983).
23
Nematodlar, arı yuvalarına abdominal bezlerin sekresyonu sırasında taşınmaktadır.
Abdominal bez salgıları feromon değildir, ancak fonksiyonu hakkında yeterli bilgi
yoktur (Giblin-Davis et al., 1990).
İzole edilen Koerneria sp. Colletes thoracicus’dan elde edilen izolatla morfolojik
benzerlikler taşımasına rağmen bu nematodun erginlerinin ve dauer juvenillerinin
daha kısa boylu olduğu bildirilmiştir. Şimdiye kadar her iki izolatın da tür tayini
yapılmamıştır. Bu konuyla ilgili en yeni referans 1990 yılına aittir (Giblin-Davis et al.,
1990).
24
Nematodun dauer juvenil evresi konakçı halictid arısının vücudunda (internal) foretik
olarak taşınır. Arı, ovulasyon, hücre yapımı ve/veya besin depolama esnasında
topraktaki yeni yuvasına juvenilleri aktarır. Nematod dauerleri, yuva duvarlarında ve
arı besininin içinde gelişmiş olan fungusları yiyerek gelişir ve üretken ergin faza
geçer. Çevresel koşullar kötüleştiğinde dauer juvenil formlar yaygınlaşır ve yeni çıkan
dişi arıların vücuduna girer (Giblin-Davis et al., 2005).
Bursaphelenchus kevini ise ilk kez 1980 yılında Amerika Birleşik Devletleri’nde
toplanan Halictus farinosus türü toprak kazıcı arıların dişilerinin üreme sisteminden
izole edilmiştir (Giblin et al., 1984). Daha sonra yapılan çalışmalarda Halictus
farinosus ve Halictus ligatus dişi arıların bursa kopulatriks ve oviduktundan elde
edilmiştir. Ayrıca, Halictus farinosus türü erkek arıların kopulasyon organında
Bursaphelenchus kevini tespit edilmiştir (Giblin and Kaya, 1984c; Giblin et al., 1984).
25
Bunun dışında diğer Halictidae üyesi arılardan Augochlora pura mosieri ve
Augochlorella gratiosa dişilerinin dufour bezlerinden, erkeklerinin ise genital
kapsülünden Aduncospiculum halicti dauer juvenilleri izole edilmiştir (Giblin-Davis et
al., 1990).
Aduncospiculum halicti’nin dauer juvenilleri, dişi arının dufour bezinde kışlar (Giblin
and Kaya, 1984b; Giblin and Kaya, 1984c; Giblin-Davis et al., 1990). İlkbahar
geldiğinde kraliçe arı, dufour bezinde kışlayan dauer formundaki nematodları hücre
yapımı sırasında kuluçka hücresine depolar. Dauerler, arı hücresindeki kontaminant
mayalar üzerinden beslenerek erginleşir ve üretken faza ulaşır. Daha sonra, arının
pupal safhasıyla eş zamanlı olarak dauer juveniller yeniden meydana getirilir. Bu
evredeki nematodlar ergin dişi ve erkek arının üreme sistemine göç eder (Giblin and
Kaya, 1984b).
26
juvenil evredeki nematodlar arının üreme sistemine göç eder. Dauerler, yumurta
bırakımı esnasında dişi arılar tarafından arı yuvasına depo edilir (Giblin and Kaya,
1983b; Giblin and Kaya, 1984a).
Potato Dekstroz Agar (PDA) birçok fungus için iyi bir besin ortamıdır. Mycophagus
(fungus yiyen) nematodların ksenik kültürlerinde rutin olarak kullanılır. Monilinia
fructicola, Botrytis cinerea ya da Candida membranaefaciens gibi funguslar PDA
ortamında bir hafta ya da daha fazla sürede üretilir. Bu ortam mycophagus
nematodlar için iyi bir besin kaynağı oluşturur (Giblin, 1987). Bakteriyel gelişimi inhibe
etmek için 1000 ml PDA ortamına 2 ml % 25’lik DL-laktik asit ilave edilir. Ayrıca
ortama % 5-10 oranında gliserol eklendiğinde nematodun yaşam süresi uzar (Giblin,
1987; Giblin-Davis et al., 2005). Gliserol ve oleik asit eklenen kültür ortamlarında
nematod üretkenliği, bu maddelerin ilave edilmediği ortamlardan daha fazladır
(Hotchkin and Giblin, 1984; Giblin and Kaya, 1984a).
27
Anthophora bomboides stanfordiana’nın yuvasından ve erginlerinden izole edilen 8
fungus türü, Bursaphelenchus seani’ın gelişimi ve üremesi açısından konak teşkil
edip etmediği test edilmiştir. Patojen bitki funguslarından Monilinia fructicola, Botrytis
cinerea ve Botrytis allii, ayrıca böcek patojen funguslardan Beauveria bassiana ve
Ascosphaera apis ortamlarında nematod gelişiminin diğer ortamlara nazaran daha
verimli olduğu saptanmıştır. Ceratocystis allanospora, Metarrhizium anisopliae,
Trichoderma sp. ve Graphium penicilloides fungus ortamlarında ve Escherichia coli
bakteri ortamında ise Bursaphelenchus seani’ın üremesi ya çok zayıf oranda
gerçekleşmiş ya da hiç gözlenmemiştir (Giblin and Kaya, 1984a).
28
3. YÖNTEM VE GEREÇLER
3.1. Arazi Çalışmaları
29
bağlı olmak koşuluyla, bir kısmı DNA izolasyonu için, bir kısmı da yapay besi
ortamında üretilmek için kullanılmıştır.
30
Tüplere alınan 5-10 nematod örneğine aşağıdaki basamaklar uygulanarak DNA izole
edilmiştir.
31
b) Primerlerin bağlanması (Annealing): Çoğaltmak istediğimiz bölgeye spesifik primer
adını verdiğimiz oligonükleotidler DNA tek sarmalı üzerinde komplementer oldukları
bölgelere bağlanır.
28S büyük alt biriminin D2D3 gen bölgesinin çoğaltılması için kullanılan primer seti şu
şekildedir:
COI-FI 5’-CCTACTATGATTGGTGGTTTTGGTAATTG-3’
COI-R2 5’- GTAGCAGCAGTAAAATAAGCACG-3’
32
Polimeraz zincir reaksiyonu ( PCR ) için, aşağıdaki karışım hazırlanır:
Yukarıdaki karışıma 10 µl DNA eklenip karıştırıldıktan sonra tüp, termal döngü aletine
yerleştirilmiş ve 95oC'de 4 dakikalık denatürasyon programı başlatılmıştır. Bu ilk
denatürasyonun iki amacı vardır. Birinci amaç, kalıp DNA'nın tamamen denatüre
edilmesi; ikinci amaç ise reaksiyon tüpünde bulunabilecek muhtemel proteinlerin
denatüre edilerek reaksiyona engel teşkil etmemelerini sağlamaktır. Denatürasyon
bittikten sonra, hot start reaksiyonu için sıcaklık 85oC'de iken tüpe 25 ünite Taq DNA
polimeraz eklenmiş ve 30 döngüden oluşan PCR programı başlatılmıştır:
95oC'de 1 dakika
64oC'de 1 dakika
72oC'de 1 dakika.
72oC'de 7 dakika.
Polimeraz zincir reaksiyonundan elde edilen ürünler agaroz jel elektroforezi ile kontrol
edilmiş ve daha sonraki aşamada otomatik dizi analizi yöntemiyle örneğe ait DNA
dizisi belirlenmiştir.
33
DNA örneklerinin tür teşhislerinde kullanılan otomatik DNA sekans analizi yöntemi
Amerika Birleşik Devletleri, Florida Üniversitesinde Prof. Dr. Robin Giblin-Davis ve
Dr. Weimin Ye tarafından yapılmıştır. Bu amaçla amplifikasyon işlemleri tamamlanan
örnekler Florida Üniversitesine gönderilmiştir. Nematodların moleküler analizinde
rRNA 28S büyük alt biriminin D2D3 gen bölgesi sekans analizi ve mitokondriyal
sitokrom oksidaz I dizi analizleri kullanılmıştır (Giblin-Davis et al., 2005; Ye et al.,
2006). Giblin-Davis, Davies, Ye and Thomas (Yayımlanmamış veri) tarafından daha
önce Avustralya, Florida, Costa Rica ve Panama’dan elde edilen arılar, incir arıları,
sinekler, böcekler, palmiye ve şeker kamışı zararlılarından elde edilen D2D3 dizileri
ve tüm sonuç analizlerinde olası kardeş ve dış grupların belirlenmesi amacıyla
Clustal W kullanılmıştır. Filogenetik/ kladistik ağaç oluşturmak ve verilerdeki hataları
en aza indirerek en iyi ağacı elde etmek için Maksimum Parsimony (MP) analizi ile
kladistik veya fenetik olmayan metod olan Neighbor Joining (NJ) analizi
uygulanmıştır. Ağaçlar arasında bir çatışma olup olmadığını görmek için bu iki analiz
yöntemi kullanılmıştır.
34
Rhabditida mensubu mikroorganizma yiyici nematodlar için agar ilaveli Tryptic Soy
Broth (TSB) ve Candida membranaefaciens mayası inoküle edilmiş % 5 gliserol
ilaveli Potato Dekstroz Agar (GPDA) besiyerleri kullanılmıştır (Giblin-Davis et al.,
1990).
Ringer’s solüsyonu: (9 g NaCl, 0.4 g KCl, 0.4 g CaCl2, 0.2 g NaH2CO3, 1 litre distile
su)
Her iki fungus da Amerika Birleşik Devletleri Florida Üniversitesi Fort Lauderdale
Research and Education Center’dan Prof. Dr. Robin M. Giblin-Davis’den
sağlanmıştır.
35
türlerin teşhisi ise bu konuda uzman Andreas Werner Ebmer’la birlikte Avusturya Linz
Biyoloji Müzesinde gerçekleştirilmiştir. Teşhis edilen örnekler Hacettepe Üniversitesi
Biyoloji Bölümü Zooloji Müzesinde saklanmaktadır.
36
4. SONUÇLAR
4.1. Toprak Kazıcı Arılarla İlişkili Nematodların Türkiye’deki Varlığı ve Dağılımı
İç Anadolu, Akdeniz, Ege, Karadeniz, Doğu Anadolu ve Güneydoğu Anadolu
bölgelerimizi kapsayan oldukça geniş bir alanda 2 yıl boyunca örnekleme işlemi
gerçekleştirilmiştir. Bu arazi çalışmaları sonucunda Türkiye’nin 6 farklı bölgesinden
toplanan 8280 toprak kazıcı arıda nematod varlığı araştırılmıştır (Çizelge 4.1).
Örneklem alınan iller harita üzerinde gösterilmiştir (Şekil 4.1).
Toplanan farklı familyalara ait 8280 polinatör arının disekte edilmesiyle 190 nematod
örneği izole edilmiştir. İzolatların 172 tanesinin Halictidae, 18 tanesinin ise
Andrenidae familyasına ait olduğu belirlenmiştir (Çizelge 4.2). Karadeniz bölgesinden
63 (%33.2), İç Anadolu bölgesinden 58 (%30.5), Akdeniz bölgesinden 35 (%18.4),
Ege bölgesinden 24 (%12.6), Doğu Anadolu bölgesinden 6 (%3.2) ve Güneydoğu
Anadolu bölgesinden 4 (%2.1) adet nematod izolatı elde edilmiştir (Şekil 4.4).
Nematod açısından pozitif örnekler (190) toplam arı örneğinin (8280) %2.3’lük
bölümünü teşkil etmiştir. Bu orana bölgeler açısından bakıldığında, Akdeniz bölgesi
için %4.6, Doğu Anadolu bölgesi için %4.2, Ege bölgesi için %4.2, Karadeniz bölgesi
için %3.3, İç Anadolu bölgesi için %1.3 ve Güneydoğu Anadolu bölgesi için %0.9
elde edilen değerler olmuştur (Çizelge 4.2). Nematod tespit edilen iller harita
üzerinde gösterilmiştir (Şekil 4.5)
37
Sinop
Bartın Kastamonu
Zonguldak Artvin
Karabük Samsun Rize
Trabzon
Bolu Çankırı Amasya Ordu
Çorum Tokat Gümüşhane
Bayburt
Erzurum
Ankara
Eskişehir Kırıkkale Yozgat Sivas Erzincan
Kırşehir
Afyonkarahisar
Nevşehir
İzmir
Aksaray
Konya Diyarbakır
Denizli Isparta
Aydın
İçel
144 416
Karadeniz
1886
4494
İç Anadolu
578
Ege 762
Akdeniz
Güneydoğu Anadolu
Doğu Anadolu
n=416
n=144
%1.8 %5.0
Karadeniz
n=1886
%22.8
%54.3
İç Anadolu
%6.9 n=4494
Ege %9.2
n=578
Akdeniz
n=762
Şekil 4.3. Toplanan arı örneklerinin bölgelere göre dağılım oranları (%)
COĞRAFİK ARI POZİTİF ARI FAMİLYALARI POZİTİF POZİTİF ÖRNEK
BÖLGELER ÖRNEKLEM VE İZOLAT SAYILARI SAYI SAYISININ
SAYISI TOPLAM ARI
ÖRNEKLEM
Halictidae Andrenidae
SAYISINA ORANI
(%)
Çizelge 4.2. Arı örneklem sayısının, nematod varlığı yönünden pozitif olan
familyalara ve coğrafik bölgelere göre dağılımı ve oranları
*Toplam arı örneğinde nematod içeren pozitif yüzde oranı
Güneydoğu Anadolu
Doğu Anadolu n=4
n=6
%2.1
%3.2
İç Anadolu
n=58
%30.5
%33.2
Karadeniz
n=63
%18.4
%12.6
Akdeniz
n=35
Ege
n=24
40
Bartın Kastamonu
n=5 n=7 Artvin
Zonguldak Samsun n=9
n=10 n=21 Trabzon
Bolu Çankırı n=7
n=1 n=1 Çorum
n=2 Bayburt
n=3 Erzurum
Ankara n=6
n=50 Sivas
n=1
Kırşehir
n=3
Afyonkarahisar
n=1
Konya
n=1
Denizli
Aydın n=3
n=19 Adana
n=24 Şanlıurfa
Muğla Gaziantep n=3
n=1 n=1
İçel
n=11
Şekil 4.5. Toprak kazıcı arılarla ilişkili nematod izole edilen iller
41
4.2. Toprak Kazıcı Arılardan Elde Edilen Nematod İzolatları
Nematod varlığı açısından pozitif olan örnekler çizelge-4.3’de ayrıntılı olarak
gösterilmiştir.
Nematod Coğrafik Arı Arı Arı Arı Vücut Nematod Kültür
İzolat Kodu Bölge Familyası Türü Cinsiyeti Bölgesi Sayısı Ortamı
Halictus
AA-3 Akdeniz Halictidae resurgens Dişi Zehir kesesi 50 M.f.
Halictus
AB-70 İç Anadolu Halictidae cochlearitarsis Dişi Belirlenemedi 15 M.f.
Halictus
AB-84 İç Anadolu Halictidae brunnescens Dişi Zehir kesesi 30 M.f.
Halictus
AB-139 İç Anadolu Halictidae brunnescens Dişi Ovidukt 5 M.f.
Halictus
AB-146 İç Anadolu Halictidae brunnescens Dişi Zehir kesesi 60 M.f.
Halictus
AB-152 İç Anadolu Halictidae resurgens Dişi Ovidukt 23 M.f.
Halictus
AB-312 İç Anadolu Halictidae resurgens Dişi Dufour bezi 9 M.f.
Halictus
AB-347 İç Anadolu Halictidae resurgens Dişi Dufour bezi 6 M.f.
Halictus
AB-349 İç Anadolu Halictidae brunnescens Dişi Ovidukt 3 M.f.
Halictus
AB-392 İç Anadolu Halictidae cochlearitarsis Dişi Belirlenemedi 6 -
Halictus -
AB-411 İç Anadolu Halictidae resurgens Dişi Belirlenemedi 10
Andrena
AB-422 İç Anadolu Andrenidae thoracica Dişi Abdominal bezler 100+ C.m.
Andrena
AB-429 İç Anadolu Andrenidae thoracica Dişi Abdominal bezler 100+ C.m.
Andrena
AB-449 İç Anadolu Andrenidae thoracica Dişi Abdominal bezler 100+ -
Halictus
Aby-4 İç Anadolu Halictidae resurgens Dişi Zehir kesesi 23 M.f.
Halictus -
Aby-5 İç Anadolu Halictidae resurgens Dişi Dufour bezi 6
Halictus -
Aby-7 İç Anadolu Halictidae resurgens Dişi Dufour bezi 1
Halictus
Aby-68 İç Anadolu Halictidae resurgens Dişi Dufour bezi 29 M.f.
Halictus
Aby-86 İç Anadolu Halictidae resurgens Dişi Belirlenemedi 22 M.f.
Halictus -
Aby-87 İç Anadolu Halictidae brunnescens Dişi Dufour bezi 12
Andrena Abdominal
Açk-35 İç Anadolu Andrenidae thoracica Dişi bezler 400+ TSB
Andrena
ADN-1 Akdeniz Andrenidae limata Dişi 1 Abdominal bez 2 -
Halictus -
ADN-2 Akdeniz Halictidae resurgens Dişi Dufour bezi 5
Halictus -
ADN-3 Akdeniz Halictidae resurgens Dişi Ovidukt 2
Halictus -
ADN-5 Akdeniz Halictidae resurgens Dişi Belirlenemedi 3
Halictus -
ADN-6 Akdeniz Halictidae resurgens Dişi Ovidukt 4
Halictus
ADN-8 Akdeniz Halictidae resurgens Dişi Ovidukt 26 M.f.
Halictus -
ADN-11 Akdeniz Halictidae resurgens Dişi Zehir kesesi 4
43
Çizelge 4.3.’ün Devamı (2)
44
Çizelge 4.3.’ün Devamı (3)
45
Çizelge 4.3.’ün Devamı (4)
46
Çizelge 4.3.’ün Devamı (5)
47
Çizelge 4.3.’ün Devamı (6)
M.f. : Monilinia fructicola fungus besiyeri TSB: Tryptic Soy Broth Agar
C.m.: Candida membranaefaciens fungus besiyeri + : fazla sayı - : kültürasyona alınmadı
48
4.3. Nematod İzole Edilen Arı Türleri ve Arı Vücut Bölgeleri
Arı Arı Arı Nematod İzole Nematod
Familyası Türü Cinsiyeti Edilen Arı Vücut İzolat Sayısı
Bölgeleri
Andrena flavipes Dişi Abdominal bezler 3
(Pozitif sayı: 18)
ANDRENIDAE
bezi, Ovidukt,
HALICTIDAE
Çizelge 4.4. Arı türüne, cinsiyetine ve familyasına göre elde edilen nematod izolat
sayıları ve nematod izole edilen arı vücut bölgeleri.
49
*Halictus sp. ve Lasioglossum sp. olarak gösterilmiş arılar diseksiyon sırasında
vücutlarında meydana gelen deformasyonlara bağlı olarak teşhisi yapılamayan
bireylerdir.
Arıların hem dişi hem de erkek bireylerinde nematod varlığı saptanmıştır. 22 adet
erkek, 169 adet dişi bireyden nematod elde edilmiştir. Erkek bireylerin Halictidae
familyasından Halictus patellatus, Halictus resurgens ve Halictus sexcinctus
albohispidus türlerine ait olduğu belirlenmiştir. Dişi bireylerin ise, Halictidae
familyasından Halictus ve Lasioglossum ile Andrenidae familyasından Andrena
cinsine ait türler olduğu tespit edilmiştir. En fazla nematod izole edilen tür Halictus
resurgens olmuştur. Bu türe ait 82 dişi, 19 erkek birey olmak üzere toplam 101
bireyden nematod elde edilmiştir. Andrena paucisquama, Andrena pilipes, Halictus
graecus, Halictus patellatus, Lasioglossum nigripes 1 izolat sayısıyla en nadir olarak
nematod izole edilen türler olmuştur (Çizelge 4.4).
Arının cinsiyetine ve familyasına bağlı olarak nematod izole edilen vücut bölgesi de
değişkenlik göstermiştir. Halictidae familyası dişi arılardan nematod elde edilen vücut
bölgeleri zehir kesesi, dufour bezi, ovidukt, bursa kopulatriks, ovipositor ve abdomen
boşluğu olmuştur. Bununla beraber abdomen boşluğu, sadece Lasioglossum
türlerinde nematod elde edilen vücut bölgesi olmuştur. Andrenidae familyası dişilerde
nematodlar sadece abdominal bezlerde saptanmıştır (Şekil 4.7). Sadece Halictidae
familyasına ait arı türlerinin erkek bireylerinde, genital kapsül çevresinde nematod
belirlenmiştir (Çizelge 4.3, Çizelge 4.4). Halictidae familyası arılarda nematod
belirlenen vücut bölgeleri şematize edilerek Şekil 4.8’de gösterilmiştir.
50
Şekil 4.6. Medyan oviduktta saptanmış dauer evre bir nematod (4X)
a b
3.2 x 8x
c d
10 x 1x
Şekil 4.7. Andrena pilipes (Andrenidae) dişisine ait abdominal bezler (a), tek bir
abdominal bez (b), izole edilen yeni tür Diplogasterid nematod daueri (c), Andrena
pilipes dişisi (d).
51
Bursa
Ovipositor kopulatriks
Zehir kesesi en sık nematod tespit edilen, abdomen boşluğu ise en fazla sayıda
nematod bireyinin elde edildiği bölgeler olmuştur. Ovipositor ve bursa kopulatriks en
nadir nematod tespit edilen ve en az bireyin elde edildiği arı vücut bölgeleri olmuştur
(Çizelge 4.3, Şekil 4.9).
52
4x 4x
11.5 x 4x
Şekil 4.9. Farklı büyütmelerde ve farklı tür arılardan (Halictidae) elde edilmiş dauer
evre nematod içeren zehir keseleri
Çizelge 4.5. Zehir kesesinde ölü birey belirlenen nematod izolatları ve ilişkili olduğu
arı türleri
53
4.4. In vitro Kültür Yöntemleri
Türkiye’nin farklı bölgelerinden toplanan, Halictidae familyasına ait farklı arı
türlerinden elde edilen 21 adet nematod izolatı Monilinia fructicola kültüründe
üretilmiştir (Çizelge 4.6). Tryptic Soy Broth (TSB) Agar ve Candida
membranaefaciens mayası inoküle edilmiş Potato Dekstroz Agar (GPDA)
besiyerlerinde üreme gerçekleşmemiştir.
Nematod İzolat Coğrafik Arı Türü Arı Vücut Nematod Besiyeri
Kodu Bölge Bölgesi Sayısı
Monilinia
AB-146 İç Anadolu Halictus brunnescens Zehir Kesesi 60 fructicola
Monilinia
AB-312 İç Anadolu Halictus resurgens Dufour Bezi 9 fructicola
Monilinia
ABY-86 İç Anadolu Halictus resurgens Belirlenemedi 22 fructicola
Monilinia
ADN-8 Akdeniz Halictus resurgens Ovidukt 26 fructicola
Monilinia
ADN-15 Akdeniz Halictus resurgens Ovidukt 44 fructicola
Halictus Monilinia
ADN-23 Akdeniz tetrazoniaellus Zehir Kesesi 36 fructicola
Halictus Monilinia
ADN-230 Akdeniz tetrazoniaellus Dufour Bezi 85 fructicola
Monilinia
AE-185 İç Anadolu Halictus resurgens Belirlenemedi 8 fructicola
Monilinia
AY-7 Ege Halictus resurgens Zehir Kesesi 42 fructicola
Monilinia
AY-8 Ege Halictus resurgens Dufour Bezi 45 fructicola
Monilinia
AY-9 Ege Halictus resurgens Ovidukt 29 fructicola
Monilinia
AY-12 Ege Halictus resurgens Ovidukt 7 fructicola
Monilinia
AY-13 Ege Halictus resurgens Ovidukt 5 fructicola
Halictus Zehir Kesesi ve Monilinia
ÇOR-3 İç Anadolu quadricinctus Ovidukt 28 fructicola
Monilinia
DNZ-8 Ege Halictus resurgens Zehir Kesesi 27 fructicola
Monilinia
KST-88 Karadeniz Halictus resurgens Zehir Kesesi 38 fructicola
Monilinia
KST-163 Karadeniz Halictus resurgens Belirlenemedi 6 fructicola
Monilinia
MER-26 Akdeniz Halictus resurgens Dufour Bezi 150 fructicola
Monilinia
MER-30 Akdeniz Halictus resurgens Dufour Bezi 45 fructicola
Monilinia
SAM-2 Karadeniz Halictus simplex Zehir Kesesi 8 fructicola
Monilinia
SAM-259 Karadeniz Halictus resurgens Dufour Bezi 36 fructicola
Çizelge 4.6. In vitro üretilebilen nematod izolatları, bunlarla ilişkili arıların toplandığı
coğrafik bölgeler, arı türleri ve nematod elde edilen arı vücut bölgeleri
54
4.5. Filogenetik Ağaçlar ve Belirlenen Nematod Türleri
Şekli 4.10’daki ağaçta gösterilmiş mtCOI verileri incelendiğinde, farklı coğrafik
bölgelerden toplanmış 4 farklı Halictus türünden 22 Bursaphelenchus izolatının elde
edildiği görülmektedir. Burada turuncu renkli olarak Bursaphelencus dalının bir
kısmını gösteren sadece %71’lik bir bootstrap desteği mevcuttur ve hepsinden
önemlisi yeşil renkle gösterilen Bursaphelenchus kevini dalı (%99 bootstrap) ve
benzer spikül morfolojisi ve konak olarak Halictidler’i paylaşan oldukça yakın bir
gruplaşma vardır. %97 bootstrap desteği ile 3 farklı Halictus türünden izole edilmiş
olan B. anatolius olarak kabul edilen 19 izolat (pembe renk) monofiletik şekilde bir
dalı oluşturmaktadır ve diğer 3 izolat (ABY 87, URF1 ve AB 146) diğer bir monofiletik
dalı oluşturmakta olup AB-146’nın yeni bir tür olduğu, tür içi farklılığı ortaya koyan
COI analiziyle açıkça desteklenmektedir. Tüm bu nematodların Aphelenchida takımı
ve Aphelenchoidoidea (kırmızı) üstfamilyası içerinde oldukları açıktır.
5 farklı izolat ile temsil edilen nematodlar (koyu pembe) iki farklı Lasioglossum
türünden izole edilmişlerdir. Bu nematodlar, adı bilinmeyen (belki bilinen ancak gen
bankasında mevcut olmayan) bir cinse aittir ve Tylenchida takımı, Allantonematinae
altfamilyası içerisinde yeni bir türü temsil etmektedirler.
AY-165 izolatı Andrena’dan izole edilmiş olan Koerneria cinsine ait yeni bir türdür ve
diğer 3 izolat (açık mavi ile boyalı) Mononchoides’e yakın bir cinse ait muhtemelen
yeni türlerdir. Bunlar daha önce tespit edilmemiş nematod türleri olduğundan ağaç
üzerinde, izolat numaraları ve izole edildikleri arıların isimleri ile toplandıkları yerlerin
isimleri verilmiştir.
55
KST 88 Daday Kastamonu Halictidae H. resurgens
COI MP Bayesian t
MER 28 Silifke Mut Mersin Halictidae H. resurgens
DNZ 8 Pamukkale Denizli Halictidae H. resurgens
MER 30 Silifke Mut Mersin Halictidae H. resurgens
74
AY 7 Aydin Halictidae H. resurgens
170 Bursaphelenchus anatolius Ankara Turkey Halictus Onopordum turcicum
Bursaphelenchus
MER 27 Silifke Mut Mersin Halictidae H. resurgens
anatolius clade
KON 1 Cihanbeyli Eskil Konya Halictidae H. resurgens
61
53 ADN 15 Cukobirlik Adana Halictidae H. resurgens
97
6 MER 24 Silifke Mut Mersin Halictidae H. resurgens
70 4
ADN 14 Cukobirlik Adana Halictidae H. resurgens
56
Şekil 4.11’de gösterilmiş D2D3 LSU rDNA sekansının Bayesian analizi birinci
sayfadaki COI ağacı ile uyumlu çıkmıştır. Filogenetik ağaçta açıkca belirtilmiş olan
(kahverengi kare içinde gösterilen) TRA-1, ZNG-48, BAR-1, BAR-70, BAR-71, BAR-
72, ERZU-6 ve SAM14-B kod numaralı nematodlar 4. dal olan Tylenchida takımında
yer almışlardır. Yani bu nematodlar bilinmeyen bir cinse aittirler (genus belki
tanımlanmıştır ancak gen bankasında mevcut değildir) ve Tylenchida takımı,
Allantonematinae alt familyasında yer alan yeni bir türü temsil etmektedirler. Bu
izolatlar Halictidae familyasına ait Lasioglossum malachurum ve Lasioglossum
nigripes türlerinden izole edilmişlerdir.
Diplogasteridae familyasıyla ilgili bilgilerimizden dolayı (Ye et al., 2006) bu gruba ait
nematodların tür teşhislerinde 28S rRNA D2D3 sekansları kullanılmıştır.
Avustralyadaki incir arılarıdan (Hymenoptera: Agaonidae) izole edilmiş iki predatör
Mononchoides spp. (Rhabditida: Diplogasteridae) izolatı (Mono 307 ve 447 olarak
kodlanmış), şeker kamışı zararlısı Matamasius hemipterus’un (Coleoptera:
Curculionidae) iki coğrafik izolatından elde edilmiş olan tanımlanmamış
Diplogasteridler (Diplo 197 ve 198 olarak kodlanmış), bir başka tanımlanmamış
Displogasterid nematod (Diplo 243 olarak kodlanmış), palmiyelerde zararlı olan
Rhynchophorus palmarum‘dan (Coleoptera: Curculionidae) izole edilmiş
tanımlanmamış Acrostichus’un (Rhabditida: Diplogasteridae) iki coğrafik izolatı (Diplo
193 ve 194 olarak kodlanmış), halictidlerle ilişkili Aduncospiculum halicti (Rhabditida:
Diplogasteridae) ve kuzey Amerika’dan bir başka tanımlanmamış tür (Adunco 94 ve
95 olarak kodlanmış), kuzey Amerika ve Panama’daki incir arılarından izole edilen
Agoinidae familyasına ait iki Parasitodiplogaster türü (Para 235 ve 237 olarak
kodlanmış) ve New York Saranac gölü bölgesinden yakalanmış olan Andrena
allegheniesis’in (Hymenoptera: Andrenidae) abdominal bezlerinden izole edilen
Koerneria (Rhabditida: Diplogasteridae) cinsine ait tanımlanmamış bir tür (Koern 228
olarak kodlanmış), ayrıca gen bankasından alınan Anisakis (Ascaridida: Anisakidae)
(Ani AY821759 olarak kodlanmış) dış grup olarak kullanılmıştır.
57
218 Mesocricronema sp. Bermudagrass Florida
Sam14B Bayesian t 10
118 Belonolaimus longicaudatus Bermudagrass Florida
58
Şekil 4.12’de D2D3 sekans analizleri kullanılarak Diplogasteridae familyasına ait olan
nematodların Bayesian analizi gösterilmektedir. Tüm diplogasterid nematodlar
Andrenidae familyasından Andrena cinsine ait farklı tür dişi arılardan izole edilmiştir.
Burada gösterilen (mavi renkli) 7 izolat (kültüre alınamamış ancak elimizde
morfolojilerini gösteren resimleri bulunan) Mononchoides (predatör nematodlar)
cinsine yakın bir cins içerisinde bulunan potansiyel olarak 5 yeni nematod türünü
temsil etmektedir. Bunlar elimizdeki veritabanında yer alan iki Mononchoides türü ile
grup oluşturmuşlardır (%100 bootstrap).
Türkiye’deki Andrena cinsi arılardan izole edilen AY-165 nematod izolatı New York’ta
yakalanan Andrena allegheniensis’ten izole edilen Koerneria cinsine bağlı olduğu
bilinen ancak tanımlanmamış tür ile kardeş taksa içerisinde yer almıştır. AY-165
izolatı farklılık derecesine bakıldığında (yeşil renkli dal) yeni bir tür olarak
görünmektedir.
59
Majority rule
BeeSomeD23Bayesia
n
60
Majority rule
Bursaphelenchus
Bursaphelenchus kevini 355 CA USA
Bee COI Bayesian kevini clade
AY 12 Cine Cayi Aydin Halictidae H. resurgens
AB 312 Beytepe Ankara Halictidae H. resurgensBursaphelenchus
52 AY 9 Cine Cayi Aydin Halictidae H. resurgens anatolius clade
95 AY 59 Sultanhisar Aydin Halictidae H. resurgens
54 AE 185 Eryaman Ankara Halictidae H. resurgens
94
96 99 AY 13 Cine Cayi Aydin Halictidae H. resurgens
AY 8 Cine Cayi Aydin Halictidae H. resurgens
65 AY 7 Bence Aydin Halictidae H. resurgens
62
Bursaphelenchus anatolius 170 Ankara Turkey Halictus Onopordum turcicum
SAM 2 Tekkekoy Samsun Halictidae H. simplex
AB 146 Beytepe Ankara Halictidae H. brunnescens
99 Bursaphelenchus tusciae 183 Italy
Bursaphelenchus eggersi 146 Caputh Germany
96 Bursaphelenchus xylophilus 186 Japan
93 Bursaphelenchus xylophilus 187 Canada
100 Bursaphelenchus xylophilus 188 Canada
Bursaphelenchus xylophilus 185 Canada
66 85 Bursaphelenchus mucronatus 165 Finland
99 Bursaphelenchus mucronatus 166 Germany
Bursaphelenchus mucronatus 164 Norway
93
99 Bursaphelenchus mucronatus 168 Germany
99 99 Bursaphelenchus mucronatus 163 Japan
Bursaphelenchus mucronatus 167 Germany
78 96 Bursaphelenchus fraudulentus 150 Russia
100 Bursaphelenchus fraudulentus 151 Germany
92 Bursaphelenchus fraudulentus 148 Hungary
Bursaphelenchus fraudulentus 147 Germany
Bursaphelenchus gerberae 169 Trinidad
Bursaphelenchus platzeri 171 California USA
87 Bursaphelenchus seani 176 California USA
99
62 Bursaphelenchus seani 174 California USA
97
Bursaphelenchus seani 175 California USA
Bursaphelenchus fungivorus 153 Dresden Germany
100 Bursaphelenchus sexdentati 178 Greece
Bursaphelenchus sexdentati 177 Greece
Bursaphelenchus poligraphi 173 Germany
55 Bursaphelenchus hofmanni 155 Germany
97 Bursaphelenchus sexdentati 180 Italy
Bursaphelenchus sexdentati 179 Greece
Bursaphelenchus borealis 138 Eggesin Germany
Bursaphelenchus paracorneolus 172 Germany
100 Bursaphelenchus abietinus 137 Austria
Bursaphelenchus hellenicus 154 Greece
51 Bursaphelenchus hylobianum 160 Asian Russia
Bursaphelenchus cocophilus 144 Honduras
Bursaphelenchus abruptus 136 Maryland USA
Aphelenchoides besseyi 99 Ohio USA
61
Majority rule
87 Bursaphelenchus seani 176 California USA
Bee D23 Bayesian 99 Bursaphelenchus seani 174 California USA
99 Bursaphelenchus seani 175 California USA
93
Bursaphelenchus fungivorus 153 Dresden Germany
Bursaphelenchus platzeri 171 California USA
99 Bursaphelenchus abietinus 137 Austria
82 Bursaphelenchus hellenicus 154 Greece
Bursaphelenchus abruptus 136 Maryland USA
98
99 Bursaphelenchus sexdentati 177 Greece
99 Bursaphelenchus sexdentati 178 Greece
100 Bursaphelenchus sexdentati 179 Greece
99
Bursaphelenchus sexdentati 180 Italy
97 97 Bursaphelenchus poligraphi 173 Germany
77
Bursaphelenchus borealis 138 Eggesin Germany
87 99 Bursaphelenchus paracorneolus 172 Germany
Bursaphelenchus hylobianum 160 Asian Russia
100 Bursaphelenchus tusciae 183 Italy
Bursaphelenchus eggersi 146 Caputh Germany
51 Bursaphelenchus gerberae 169 Trinidad
Bursaphelenchus hofmanni 155 Germany
60 Bursaphelenchus mucronatus 167 Germany
71 Bursaphelenchus mucronatus 165 Finland
Bursaphelenchus mucronatus 164 Norway
Bursaphelenchus mucronatus 166 Germany
99 99 Bursaphelenchus mucronatus 168 Germany
Bursaphelenchus mucronatus 163 Japan
92 Bursaphelenchus xylophilus 185 Canada
99 Bursaphelenchus xylophilus 186 Japan
99
78 Bursaphelenchus xylophilus 187 Canada
Bursaphelenchus xylophilus 188 Canada
Bursaphelenchus fraudulentus 148 Hungary
99
Bursaphelenchus fraudulentus 150 Russia
Bursaphelenchus fraudulentus 151 Germany
100 Bursaphelenchus cocophilus 144 Honduras
Bursaphelenchus cocophilus 140 Costa Rica
Bursaphelenchus Bursaphelenchus anatolius 170 Ankara Turkey Halictus Onopordum turcicum
anatolius clade
73 AE 185 Eryaman Ankara Halictidae H. resurgens
Paraphyletic when
AY 12 Cine Cayi Aydin Halictidae H. resurgens
Compared with COI
SAM 7 Terme Samsun Halictidae Lasioglossum malachurum
tree
99 84 AY 59 Sultanhisar Aydin Halictidae H. resurgens
AY 13 Cine Cayi Aydin Halictidae H. resurgens
50 91
AY 8 Cine Cayi Aydin Halictidae H. resurgens
Bursaphelenchus AY 9 Cine Cayi Aydin Halictidae H. resurgens
kevini clade AY 7 Bence Aydin Halictidae H. resurgens
99
SAM 2 Tekkekoy Samsun Halictidae H. simplex
AB 312 Beytepe Ankara Halictidae H. resurgens
99 AB 146 Beytepe Ankara Halictidae H. brunnescens
Bursaphelenchus kevini 355 CA USA
Aphelenchoides besseyi 99 Ohio USA
Şekil 4.14. Bursaphelenchus cinsine ait nematodların Ribozomal RNA (rRNA) D2D3
LSU Bayesian analizi
62
4.6. Morfolojik Analizler
İn vitro kültür ortamında üreyen nematod izolatlarının geçici preparatları hazırlanarak
dişi ve erkek bireylerin morfometrik ölçümleri yapılmıştır.
Ayrıca nematodların tür teşhislerinde önemli olan erkek bireylerin spikül, özafagus
ve stylet yapıları ile dişi bireylerin vulva yapısı AY-13 izolatına ait bireylerde
gösterilmiştir (Şekil 4.15, 4.16, 4.17, 4.18).
63
Şekil 4.15. AY-13 izolatına ait (Bursaphelenchus anatolius) erkek bireylerin
mikroskobik görüntüsü (10 X)
Şekil 4.16. AY-13 izolatı (Bursaphelenchus anatolius) erkek bireylerine ait spikül ve
kuyruk yapısının mikroskobik görüntüsü (40 X)
64
Şekil 4.17. AY-13 izolatı (Bursaphelenchus anatolius) erkek bireylere ait özafagus ve
stylet yapılarının mikroskobik görüntüsü (63 X)
Şekil 4.18. AY-13 izolatı (Bursaphelenchus anatolius) dişi bireylerine ait vulva
yapısının mikroskobik görüntüsü (40 X)
65
5. TARTIŞMA
Bu çalışma, Türkiye’deki toprak kazıcı arılarla ilişkili nematodların biyolojik
çeşitliliğiyle ilgili ilk faunistik çalışmadır. Türkiye, toprak kazıcı arıların oldukça fazla
çeşitlilik gösterdiği düşünülen bir bölgedir. Araştırma, iki yıl boyunca bahar ve yaz
dönemlerinde Türkiye’nin farklı coğrafik bölgelerinden örnekler alarak yeni nematod
türlerinin tespit edilebileceği fikri üzerine kurulmuştur. Toplanan arılar disekte edilmiş
ve elde edilen nematodlar üzerinde moleküler analizler gerçekleştirilmiştir.
Nematodların bir kısmı yapay ortamlarda üretilmeye çalışılmıştır.
Ülkemizin 6 farklı bölgesinden (İç Anadolu, Akdeniz, Ege, Karadeniz, Doğu Anadolu
ve Güneydoğu Anadolu bölgeleri) toprak kazıcı arılarla ilişkili nematodlar elde
edilmiştir. Dünya’da daha önce bu kadar kapsamlı bir çalışma yapılmadığından elde
edilen verilerin çoğu hem Türkiye hem de dünya için pek çok yeni bilgi içermektedir.
En fazla sayıda nematod izolatı Karadeniz (63) ve İç Anadolu bölgesinden (58) elde
edilmiştir.
66
Türlerin devamı, içinde bulundukları habitatın sağlıklı bir şekilde kalmasına bağlıdır.
Türler ancak çevreleriyle birlikte korunabilir (Kışlalıoğlu ve Berkes, 1993). Doğu
Karadeniz bölgesi pestisitlerin en az kullanıldığı bölgelerin başında geldiğinden,
pestisit yönünden Türkiye’nin en temiz yörelerindendir. Fazla pestisit kullanımı,
toprak verimliliğini artırmada önemli rol oynayan mikroorganizmaların kısmen veya
tamamen yok olmasına sebep olmaktadır (Çevre ve Orman Bakanlığı, 2004a).
İç Anadolu bölgesi İran-Turan bölgesinde yer alır. İran-Turan floristik bölgesi, karasal
iklim özelliği taşır, yıl ve aylar içindeki sıcaklık değişikliği çok fazladır. İç Anadolu’da
uzun, sıcak ve kurak bir yaz mevsimi, soğuk ve karlı bir kış mevcuttur. Yıllık yağış
miktarı 300-350 mm’yi geçmez. Denizden yüksekliği 800-1600 m arasında değişen
geniş bir platodur. Ova kesiminde genellikle kurakçıl bitkilerin egemen olduğu bir flora
yaygındır (Çetik, 1985).
İç Anadolu bölgesi karasal iklime bağlı olarak kurak ve savan özelliklere sahiptir. İran-
Turan fitocoğrafik bölgesinde yer alma, bu alanları flora açısından oldukça zengin
kılar. Büyük bir olasılıkla bu bitki zenginliği ve kurak toprak yapısının yuva için
67
elverişli olması toprak kazıcı arılarda çeşitliliği doğrudan etkilemiş olabilir.
Muhtemelen arı türlerinin fazlalığı, farklı yaşam şekillerini de beraberinde getirmiş ve
arıların diğer canlılarla olan ilişkilerinde de artışa yol açmıştır. Bu durumun arılarla
ilişkili nematod çeşitliliğini de dolaylı olarak etkilediği düşünülmektedir.
Giblin-Davis et al. (1990), nematod belirlenen Andrenidae familyasına ait arı tür
sayısını 1 olarak bildirilmiştir (Andrena alleghaniensis). Ülkemizde Andrenidae
68
familyasına ait 6 farklı arı türü nematodlarla ilişkili bulunmuştur. Bunlar; Andrena
flavipes, Andrena limata, Andrena parviceps, Andrena paucisquama, Andrena
pilipes ve Andrena thoracica’dır (Çizelge 4.4).
Daha önce konuyla ilgili yapılan çalışmalar, arılarla ilişkili nematodların konakçı tür
özgünlüğü göstermediğini ortaya koymuştur. Aphelenchida ordosunda yer alan
Bursaphelenchus kevini nematodu Halictus farinosus ve Halictus ligatus arı türleriyle;
Rhabditida ordosunda yer alan Aduncospiculum halicti nematodu Halictus farinosus,
Halictus ligatus ve Halictus rubicundus arı türleriyle ilişkili bulunmuştur (Giblin and
Kaya, 1984b; Giblin and Kaya, 1984c; Giblin et al., 1984; Giblin-Davis et al., 1990).
Andrenidae familyası arılarla ilişkili tek nematod türü belirlendiği için (Koerneria sp.)
konakçı özgünlüğü gösterip göstermediği anlaşılamamıştır (Giblin-Davis et al., 1990).
Bu çalışmayla elde edilen veriler de daha önceki araştırmalarla benzerlikler
taşımaktadır. Aphelenchida ordosunda yer alan Bursaphelenchus anatolius
nematodu Halictus resurgens, Halictus simplex, Halictus cochlearitarsis ve Halictus
tetrazoniaellus arı türleriyle ilişkili bulunmuştur (Şekil 4.10). Tylenchida takımı,
Allantonematinae alt familyasında yer alan yeni bir tür olduğu düşünülen nematod
Halictidae familyasına ait Lasioglossum malachurum ve Lasioglossum nigripes
türlerinden izole edilmişlerdir (Şekil 4.11). Diplogasteridae familyasına ait yeni tür
oldukları düşünülen nematodlar Andrenidae familyasına ait Andrena flavipes,
Andrena limata, Andrena parviceps ve Andrena thoracica türleriyle ilişkili bulunmuştur
(Şekil 4.12).
Şimdiye kadar toprak kazıcı dişi arıların dufour bezi, zehir kesesi, bursa kopulatriks,
ovidukt, ovipozitor kesesi ve abdominal bez (sadece Andrena cinsinde) gibi vücut
yapılarında foretik nematod varlığı bildirilmiştir (Altenkirch, 1962; Giblin and Kaya,
1983b; Giblin and Kaya,1984b; Giblin and Kaya,1984c; Giblin et al., 1984; Giblin-
Davis et al., 1990; Giblin-Davis et al., 1993; Giblin-Davis et al., 2005). Erkek arıların
ise kopulasyon organı ve genital kapsüle ait yapılarında nematod gözlenmiştir (Giblin
and Kaya, 1983b; Giblin and Kaya, 1984b; Giblin and Kaya, 1984c; Giblin et al.,
1984; Giblin-Davis et al., 1990; Giblin-Davis et al., 1993). Bu tez çalışmasında elde
edilen veriler bu bilgilerle örtüşmektedir. Halictidae familyası dişi arıların dufour bezi,
zehir kesesi, bursa kopulatriks, ovidukt, ovipositor kesesinden; Andrenidae familyası
69
dişi arıların abdominal bezlerinden nematod izole edilmiştir (Çizelge 4.3 ve Çizelge
4.4).
Halictidae familyası arılarla ilişkili nematodların, arı türüne bağlı olmaksızın dişi
arıların farklı vücut bölgelerinde taşınabilmesi yer bakımından belli bir özgünlüğün
olmadığını ortaya koymaktadır. Bununla beraber, Andrenidae familyası dişi arılarla
ilişkili nematodların konaklamak için sadece abdominal bezleri tercih etmesi bu
konuda bir özgünlüğün olabileceğini düşündürmektedir. Bugüne kadar Andrenidae
familyası dişi arılarla ilişkili nematodlar arıların sadece abdominal bezlerinden izole
edilirken; erkek bireylerde hiçbir nematod varlığına rastlanılmamıştır (Giblin-Davis et
al., 1990). Bu çalışmadan elde edilen sonuçlar önceki çalışmalarla paralellik
göstermektedir.
70
oldukça küçük alanlardır. Abdomen boşluğunda foretik nematod varlığı da ilk defa bu
çalışmayla belirlenmiştir (Çizelge 4.3).
Nematodların canlı kalabilmesinde nem, temel faktördür (Kaya, 1990). Toprak nemi
nematod hareketini ve dolayısıyla nematod varlığını etkileyebilen bir faktördür
(Koppenhöfer et al., 1995). Otsu ve bol bitkili alanlarda nem oranı %100’e ulaşmadığı
sürece nematodlar genelde canlılıklarını sürdürürler. Ayrıca kuraklığın olumsuz
etkisinden korunmak için nematodlar bulundukları konak içerisinde nem koşulları
düzelinceye kadar bekleyebilirler (Brown and Gaugler 1997; Koppenhöfer et al.,
1997). Bu nedenle nematodların arı vücudunda hareketlerini ve gaz alışverişlerini
sağlayacakları sıvı bulunan organları (zehir kesesi, dufour bezi gibi) tercih etmeleri
olağan karşılanabilir.
Nematodların özellikle dufour bezi ve ovidukt gibi organlarda tespit edilmeleri tesadüf
değildir. Bu bölgeler nematodların dışarıya kolaylıkla çıkışını sağlayacak işlevlere
sahiptir. Dişi arı, ovulasyon (yumurta bırakımı), hücre yapımı ve/veya besin depolama
esnasında juvenil nematodları topraktaki yuvasına aktarır (Giblin and Kaya, 1983b;
Giblin and Kaya, 1984a; Giblin and Kaya, 1984b; Giblin and Kaya, 1984c; Giblin-
Davis et al., 1990; Giblin-Davis et al., 1993; Giblin-Davis et al., 2005). Medyan ve
lateral ovidukttaki nematodlar dişi arının yumurta bırakımı sırasında, dufour bezindeki
71
nematodlar ise yuva yapımı için salgılanan trigliserit sekresyonu sırasında arı
hücresine aktarılır (Giblin-Davis et al., 1990; Giblin-Davis et al., 1993).
Dufour bezi, İlk kez 1841 yılında Dufour tarafından balarılarında tanımlanmıştır.
Dufour bezi Hymenoptera ordosu böceklerde var olan, iğne yapısına bağlı bir
abdominal bezdir (Katzav-Gozansky et al., 2002). İlkbahar geldiğinde kraliçe arı,
dufour bezinde kışlayan dauer formundaki nematodları hücre yapımı sırasında yavru
gözeneklerine aktarır. Dauerler, yavru gözeneğindeki kontaminant mayalar üzerinden
beslenerek erginleşir ve üretken faza ulaşır. Daha sonra, arının pupal safhasıyla eş
zamanlı olarak dauer juveniller yeniden meydana getirilir. Bu evredeki nematodlar
ergin dişi ve erkek arının üreme sistemine göç eder (Giblin and Kaya, 1984b).
Faklı zamanlarda yapılan çalışmalar sırasında 7 türe ait erkek arının (Halictus
farinosus, Halictus rubicundus, Halictus ligatus, Augochlora pura mosieri,
Augochlorella gratiosa, Anthophora abrupta, Anthophora bomboides stanfordiana)
kopulasyon organı ve genital kapsüle ait yapılarında nematod gözlenmiştir (Giblin
and Kaya, 1983b; Giblin and Kaya, 1984b; Giblin and Kaya, 1984c; Giblin et al.,
1984; Giblin-Davis et al., 1990; Giblin-Davis et al., 1993). Gerçekleştirilen bu
çalışmada 3 türe ait (Halictus patellatus, Halictus resurgens, Halictus sexcinctus
albohispidus) erkek arı genital kapsülünde nematod varlığı tespit edilmiştir (Çizelge
4.4). Nematodların, tüm arı türlerinde genital kapsül çevresinde belirlenmiş olması tür
özgünlüğü göstermediği ancak organ özgünlüğü gösterdiğini düşündürmektedir.
72
Nematodların en çok dişi arılarla foretik ilişki kurmaları yaşam döngülerini
tamamlayacak imkana sahip olmaları açısından oldukça normal kabul edilebilir.
Ancak kendisini bir erkek bireyin vücudunda taşıtmayı tercih eden bir nematodla ilgili
akla gelen ilk soru yaşam döngüsünü nasıl tamamlayacağıdır. Nematod bulunduran
erkek arıların bu ilişkideki rolü henüz açığa kavuşmamıştır (Giblin et al., 1981).
Foretik konakları arasında nematodların veneral (çiftleşme esnasında) bulaşımı
olabileceği düşünülmüş ancak deneysel olarak gösterilememiştir (Giblin et al., 1981;
Giblin, 1985). Erkekte taşınan nematodlar çiftleşme sırasında dişi bireye
aktarılabilirse nematodun hayatta kalması garantilenir. Aksi takdirde, erkek bireyler
nematodun hayatının sonlandığı bir konak olur (Giblin and Kaya, 1983b). Luong et
al., (2000), Gryllodes sigillatus (Orthoptera: Gryllidae) böceğinin sindirim kanalında
yaşayan, ancak juvenilleri genital bölgede bulunan endoparazitik Mehdinema alii
(Diplogasterida) nematodunun kopulasyon esnasında erkek genitalyasından dişi
bireylere aktarıldığını deneysel olarak göstermiştir. Ayrıca “dynastid beetles” (Oryctes
monoceros Olivier, 1789 (Coleoptera: Scarabaeidae) gibi) dişilerinin bursa
kopulatriksinde parazitik olarak yaşayan Oryctonema (Oryctonema genitalis
(Rhabditida) gibi) cinsi nematodların çiftleşme yoluyla erkek bireylere bulaştığı
bildirilmiştir (Poinar, 1983; Luong et al., 2000). Arılar arasında da nematodların
kopulasyon esnasında erkekten dişiye aktarılma ihtimalinin olabileceği öne
sürülmüştür (Giblin et al., 1981).
Halictidae familyası üyeleri genellikle sosyal yaşayan arılardır. Familya içinde sosyal
organizasyon derecesi de değişir. İlkel sosyal yaşam bu grupta yaygın olarak görülen
sosyal yaşam formudur (Paxton et al., 2002).
73
Andrena cinsine ait 6 tür arıda nematod varlığı saptanmıştır (Çizelge 4.4). Halictidae
familyasıyla karşılaştırıldığında soliter yaşam tarzı elde edilen nematod sayısının
azlığında etken olabilir. Belirlenen 18 izolatın 9 tanesi İç Anadolu bölgesine aittir. Bu
bölgeden elde edilen nematod sayı fazlalığı dışında, nematodla ilişkili Andrena tür
sayısında da diğer bölgelere nazaran bir fazlalık mevcuttur. İç Anadolu bölgesinde 4
farklı Andrena türünde nematod belirlenmiştir. Bu verilere dayanarak Andrena türü
arılar ile bunlarla ilişkili nematod çeşitliliğinin en fazla İç Anadolu bölgesine ait olduğu
söylenebilir. İç Anadolu bölgesini, 3 farklı Andrena türünden nematod izole edilmiş
olması nedeniyle Ege bölgesi takip etmektedir.
74
Filogenetik ağaçlara bakıldığında KIR-1, KST-33, AY-167, ADN-1, AB-422, AB-429
ve AY-165 kodlu nematod izolatları açık bir şekilde 5. kol olan Diplogasteridae
gurubuna yerleşmiştir (Şekil 4.12). Bu örneklerinin hepsi farklı Andrena cinsi arıların
abdominal bezlerinden izole edilmiş olup nematodların yapay ortamda kültürasyonları
yapılamamıştır. Arılardan elde edilen nematodların hepsi dauer evre olduklarından
tanımlanmaları takım ve familya seviyesinde yapılabilmiştir.
KIR-1 ile KST-33’ün yeni bir tür olma olasılığı yüksektir ve AB-422, AB-429, AY-167
ile ADN-1 ise bir diğer yeni türü temsil ediyor olabilir. Bu analiz, bu izolatların predatör
olan Mononchoides’le %100 aynı monofiletik dal üzerinde kardeş grup
oluşturduklarını gösterse de bu sonuç nematodların predatör olduklarını ya da
Mononchoides cinsine ait olduklarını kanıtlamaz. Ancak veriler bu nematodların en
yakın olduğu cinsin Mononchoides olduğunu kuvvetle desteklemektedir ve bizlere
taksonomik çalışmalar için bu nematodların kültürlerini yapabilme stratejisi hakkında
bilgi vermiştir. Örneğin, başka nematodların var olduğu bir ortamda ya da bakterilerin
yanı sıra (daha önceki başarısız denemelerde kullanılan ortam) başka besin
ortamlarının bulunduğu kültürlerde başarılı kültürasyon yapılabileceği düşünülebilir.
AY-165 kodlu izolatın Kuzey Amerika’da (Koern 228 olarak kodlanmış) Andrena
allegheniesis’in abdominal bezleriden izole edilen tanımlanmamış bir Koerneria
türüyle aynı dal üzerinde ilişkili olduğunu hem MP hem de NJ olağan üstü bootstrap
(%100) vererek desteklemiştir (Şekil 4.12). AY-165’in Koerneria’nın yeni bir türü
olması muhtemeldir. Daha önce Altenkirch (1962) ve Erteld (1994) Avrupa (Berlin,
Almanya) daki Andrena cinsine ait arıların abdominal bezlerinde Koerneria olduğunu
bildirmiştir. Bu çalışmayla, Türkiye’deki arılardan elde edilen ve kültürleri
yapılamayan nematodların Diplogasteridae familyasına ait 6 yeni (5 tanesi
75
Mononchoides’e yakın ve bir tanesi Koerneria cinsine ait) tür olabileceği saptanmış
olup daha sonra yapılacak çalışmalarla bu nematodlar adlandırılacaktır.
Özet olarak Halictidae familyasına ait 4417, Andrenidae familyasına ait 3279,
Colletidae familyasına ait 262 ve Anthophorini’ye ait 322 olmak üzere toplam 8280
toprak kazıcı arının disekte edilip incelenmesi ve moleküler analizler ile kültürasyon
işlemleri sonucu muhtemelen 9 yeni nematod türü tespit edilmiştir. Bunlara ek olarak
Türkiye’deki toprak kazıcı arılarla ilişkili yeni bir nematod cinsinin elde edilmiş olma
ihtimali oldukça yüksektir. Andrenid türlerinin abdominal bezlerinden elde edilen
olası 5 yeni nematod türü, bir predatör Diplogasterid cinsi olan Mononchoides’e yakın
bulunmuştur. Bu nematodlar abdominal bezler içerisinde çok sayıda bulunmaları ve
oldukça uzun yapılı olmaları nedeniyle sıra dışıdır (Şekil 4.7c). Gelecekte yapılacak
çalışmalarda bu nematodların kültür ortamına özgü fungus, farklı nematodlar veya
besin olarak diğer organizmalar konularak beslenme şekilleri belirlenebilir ve in vitro
kültürleri de yapılabilir.
Andrena cinsine bağlı arının abdominal bezinden Koerneria cinsine ait yeni bir
nematod bulunmuş olması oldukça mantıklıdır. Çünkü bu cins, Avrupa’daki Andrena
türlerinden yakın zamanda elde edilip tanımlanmıştır (Erteld, 1994).
Sadece Bursaphelenchus kevini türü bulunmuş olan Kuzey Amerika’yla (Giblin et al.,
1984) karşılaştırıldığında, Halictidlerle ilişkili olan Bursaphelenchus’ların Türkiye’de
daha fazla çeşitliliğe sahip oldukları görülmektedir. Kuzey Amerika’da Halictidlerle
ilişkili olan nematodların çoğu Aduncospiculum cinsine aittir (Giblin and Kaya, 1984a;
Giblin and Kaya, 1984b) ancak Türkiye’de yapılan bu kapsamlı çalışmada bu cinse
ait hiçbir nematoda rastlanılmamıştır.
76
Halictidlerin Lasioglossum cinsine ait arılardan muhtemelen Allontonematidae’ye ait
daha önce tanımlanmamış yeni bir Tylenchid türü de elde edilmiştir. Bu bulgu,
bugüne kadar Lasioglossum cinsi arılardan izole edilen bu gruba ait ilk nematod
kaydıdır. Daha önce sadece Lasioglossum zephyrum’dan yeni bir tür olarak
Hexamermis sp. (Mermithida) izole edilmiştir (Batra, 1965)
77
6. KAYNAKLAR
Aytekin A.M., Çağatay N. and Hazır, S. 2002. Floral Choices, Parasites and Micro-
organisms in Natural Populations of Bumblebees (Apidae: Hymenoptera) in
Ankara Province. Turkish Journal of Zoology. 26: 149-155.
Baldwin, J.G., Giblin-Davis, R.M., Eddleman, C.D., Williams, D.S., Vida, J.T. and
Thomas, W.K. 1997. Buccal capsule of Aduncospiculum halicti (Nemata:
Diplogasterina): an ultrastructural and molecular phylogenetic study.
Canadian Journal of Zoology. 75: 407-423.
Blaxter, M.L., De Ley, P., Garey, J.R., Liu, L.X., Scheldeman, P., Vierstraete, A.,
Vanfleteren, J.R., Mackey, L.Y., Dorris, M.L., Frisse, M.J., Vida, T and
Kelley, W. 1998. A molecular evolutionary framework for the phylum
Nematoda. Nature. 392: 71-75.
Blouin, M.S., Yowell, C.A., Courtney, C.H., and Dame, J.B. 1998. Substitution Bias,
Rapid Saturation, and The Use of mtDNA for Nematode Systematics. Mol.
Biol. Evol. 15(12): 1719-1727.
Borror, D.J. and Delong, D.M. 1964. An Introduction to the Study of Insects. Revised
Edition. Holt, Rinehart and Wiston Inc. USA. 819p.
78
Braasch, H. 2001. Bursaphelenchus species in conifers in Europe: Distribution and
Morphological Relationships. EPPO Bulletin. 31: 127-142.
Bronstein, J.L. 2001. The Cost of Mutualism. American Zoologist. 41(1): 825-839.
Brown, I.M and Gaugler, R. 1997. Temperature and humidity influence emergence
and survival of entomopathogenic nematodes. Nematologica. 43: 363-375.
Burnell, A.M and Stock, S.P. 2000. Heterorhabditis, Steinernema and their bacterial
symbionts- lethal pathogens of insects. Nematology. 2(1): 31-42.
Chilton, N.B., Huby-Chilton, F. and Gasser, R.B. 2003. First complete large subunit
ribosomal RNA sequence and secondary structure for a parasitic
nematode: phylogenetic and diagnostic implications. Molecular and
Cellular Probes 17: 33-39.
79
Demirsoy, A. 1998. Yaşamın Temel Kuralları, Genel Biyoloji-Genel Zooloji, Cilt 1,
Kısım 2, Meteksan A.Ş. Ankara. 447s.
Ebsary, B.A. 1986. Monochoides andersoni n. sp. and two new species of Koerneria
(Nematoda: Diplogasteridae). Canadian Journal of Zoology, 64: 2012-
2020.
Erteld, V.C. 1994. Über die Bindung von Diplogaster spec. (Nematoda) an
Sandbienen (Andrena spp.). Sber. Ges. Naturf. Freunde (N. F.), 33: 143-
155.
Giblin, R.M. 1987. Culture of Nematodes Associates and Parasites of Insects. Vistas
on Nematology, Chapter 54. Veech, J.A. and Dickson, D.W. (eds.). Society
of Nematologists, Hyattsville, USA. pp. 408-413.
Giblin, R.M. and Kaya, H.K. 1984a. Associations of Halictid bees with nematodes,
Aduncospiculum halicti (Diplogasterida: Diplogasteroididae) and
Bursaphelenchus kevini (Aphelenchida: Aphelenchoididae). Journal of The
Kansas Entomological Society. 57(1): 92-99.
Giblin, R.M. and Kaya, H.K. 1984b. Aduncospiculum halicti n. gen. n. sp.
(Diplogasterida : Diplogasteroididae), an associate of bees in the genus
Halictus (Hymenoptera : Halictidae). Revue de Nématologie. 7(2): 189-197.
Giblin, R.M and Kaya, H.K. 1984c. Host, temperature and media additive effects on
the growth of Bursaphelenchus seani. Revue de Nématologie. 7(1): 13-17.
80
Giblin, R.M. and Kaya, H.K. 1983b. Field observations on the association of
Anthophora bomboides stanfordiana (Hymenoptera: Anthophoridae) with
the nematode Bursaphelenchus seani (Aphelenchida: Aphelenchoididae).
Annals of the Entomological Society of America. 76(2): 228-231.
Giblin, R.M., Swan, J.L. and Kaya, H.K. 1984. Bursaphelenchus kevini n. sp.
(Aphelenchida: Aphelenchoididae), an associate of bees in the genus
Halictus (Hymenoptera: Halictidae). Revue de Nématologie. 7(2): 177-187.
Giblin, R.M., Kaya, H.K. and Brooks, R.W. 1981. Occurrence of Huntaphelenchoides
sp. (Ashelenchoididae) and Acrostichus sp. (Diplogasteridae) in the
reproductive tracts of soil nesting bees (Phoresis) (Hymenoptera:
Apoidea). Nematologica. 27(1): 20-27.
Giblin-Davis, R.M. 1993. Interactions of nematodes with insects. In: W. Khan, ed.
Nematode Interactions. Chapman & Hall, London. 377p.
Giblin-Davis, R.M., Hazir, S., Center, J.B., Ye, W., Keskin, N., Thorp, R.W. and
Thomas, W.K. 2005. Bursaphelenchus anatolius n. sp. (Nematoda:
Parasitaphelenchidae), an associate of bees in the genus Halictus. Journal
of Nematology. 37(3): 336-342.
Giblin-Davis, R.M., Davies, K.A., Morris, K. and Thomas, W.K. 2003a. Evolution of
Parasitism in Insect-Transmitted Plant Nematodes. Journal of
Nematology. 35( 2 ): 133-141.
Giblin-Davis, R.M., Davies, K.A., Taylor, G.S., and Thomas, W.K. 2003b.
Entomophilic Nematode Models for Studying Biodiversity and
Cospeciation. Nematology, Advances and Perspectives. Chen, Z.X., Chen
S.Y. and Dickson, D.W. (eds.), Tsinghua University Press/CABI Publishing.
New York., USA. pp 492-538.
Giblin-Davis, R.M., Mundo-Ocampo, M., Baldwin, J.G., Norden, B.B. and Batra,
S.W.T. 1993. Description of Bursaphelenchus abruptus n. sp.
(Nemata:Aphelenchoididae), an associate of digger bee. Journal of
Nematology. 25(2): 161-172.
Giblin-Davis, R.M., Norden, B.B., Batra, S.W.T. and Eickwort, G.C. 1990.
Commensal Nematodes in the Glands, Genitalia, and Brood Cells of Bees
(Apoidea). Journal of Nematology. 22(2): 150-161.
Goodey, T. 1963. Soil and Freshwater Nematodes. 2nd ed., Revised and rewritten by
J.B. Goodey. John Wiley and Sons, Inc. New York, USA. 544 pp.
81
Hazır, S. 2002. Türkiye’deki Entomopatojenik Nematodlar (Steinernematidae ve
Heterorhabditidae) Üzerine Faunistik Çalışmalar. Doktora Tezi. Hacettepe
Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Ankara. 158s.
Hillis, D.M. and Davis, S.K. 1986. Evolution of ribosomal DNA: Fifty million years of
recorded history in the frog genus Rana. Evolution. 40(6): 1275-1288.
Hillis, D.M. and Dixon, M.T. 1991. Ribosomal DNA: Molecular evolution and
phylogenetic inference. Quarterly Review of Biology. 66(4): 411–453.
Hominick, W.M., Briscoe, B.R., Del-Pino, F.G., Heng, J., Hunt, D.J, Kozodoy, E.,
Mracek, Z., Nguyen, K.B., Reid, A.P., Spiridonov, S., Stock, P., Sturhan,
D., Waturu, C and Yoshida, M. 1997. Biosystematics of entomopathogenic
nematodes: current status, protocols and definitions. Journal of
Helminthology. 71: 271-298.
Hubbell, S.P. 2001. The Unified Neutral Theory of Biodiversity and Biogeography.
Princeton University Press. Princeton, New Jersey, USA. 375 p.
Kanzaki, N. and Futai, K. 2002. A PCR primer set for determination of phylogenetic
relationships of Bursaphelenchus species within xylophilus group.
Nematology. 4(1): 35-41.
Kaya, H.K. and Koppenhöfer, A.M. 1999. Biology and Ecology of Insecticidal
nematodes. Optimal Use of Insecticidal Nematodes in Pest Management.
Sridhar Polavarapu (ed.). New Brunswick. New Jersey. USA.1-8 pp.
Kaya, H.K and Stock, S.P. 1997. Techniques in Insect Nematology. Manual of
Techniques in Insect Pathology. L. Lacey, (ed.). Academic Pres, San
Diego, CA. 281-324 pp.
82
Kışlalıoğlu, M. ve Berkes, F. 1993. Çeşitler ve Türler. Çevre ve Ekoloji. Remzi
Kitabevi. İstanbul. 178-199 s.
Koppenhöfer, A.M., Baur, M.E., Stock, S.P., Choo, H.Y., Chinnasri, B. and Kaya,
H.K. 1997. Survival of entomopathogenic nematodes within host
cadavers in dry soil. Applied Soil Ecology. 6: 231-240.
Luong, L.T., Platzer, E.G., Zuk, M. and Giblin-Davis, R.M. 2000. Venereal Worms:
Sexually transmitted nematodes in the decorated cricket. Journal of
Parasitology. 86(3): 471-477.
McFrederick, Q.S. and Roulston, T.H. 2005. Ecology and Evolution of Phoretic
Relationships: Bees and Nematodes. The 20th Annual Department of
Environmental Sciences Student Research Symposium. 18 January 2005.
(Poster Abstract).
Michener, C.D. 2000. The Bees of The World. The Johns Hopkins University Press,
Baltimore, Maryland, USA. 913p.
Mullis, K., Faloona, F., Scharf, S., Saiki, R., Horn, G. and Erlich, H. 1986. Spesific
enzymatic amplification of DNA in vitro- the polymerase chain reaction.
Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. 51: 263-273.
Nadler, S. and Hudspeth, D.S.S. 1998. Ribosomal DNA and phylogeny of the
Ascaridoidea (Nemata: Secernentea): Implications for morphological
evolution and classification. Molecular Phylogenetics and Evolution. 10 (2):
221-236.
Nguyen, K.B. and Smart, G.C. 1998. Morphology of the life stages of three
Heterorhabditis spp. from the infective juvenile to the hermaphrodite. Soil
Crop Sci Soc. 57: 101-107.
83
Nickle, W.R. 1970. A taxonomic review of the genera of the Aphelenchoidea (Fuchs,
1937) Thorne, 1949 (Nematoda: Tylenchida). Journal of Nematology. 2:
375-392.
Paxton, R.J., Ayasse, M., Field, J. and Soro, A. 2002. Complex sociogenetic
organization and reproductive skew in a primitively eusocial sweat bee,
Lasioglossum malachurum, as revealed by microsatellites. Molecular
Ecology. 11: 2405-2416.
Pesenko Yu. A., Banaszak J., Radchenko V. G., Cierzniak T. 2000. Bees of the
family Halictidae (excluding Sphecodes) of Poland: taxonomy, ecology,
bionomics. Bydgoszcz Press, Bydgoszczy, Poland. 1-348 pp.
84
Poinar, G.O. Jr. 1983. The Natural History of Nematodes. Prentice-Hall, Inc.
Englewood Cliffs, New Jersey. 323 p.
Riddle, D.L. 1988. The Dauer Larva. The Nematode Caenorahabditis elegans. Wood
W. B (ed.). Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York. USA. 393-
412 pp.
Ryss, A., Vieira, P., Mota, M. and Kulinich, O. 2005. A Synopsis of the genus
Bursaphelenchus Fuchs, 1937 (Aphelenchida: Parasitaphelenchidae) with
keys to species. Nematology. 7(3): 393-458.
Saiki, R.K., Gelfand, D.H., Stoffel, S., Scharf, S.J., Higuchi, R., Horn, G.T., Mullis,
K.B. and Erlich, H.A. 1988. Primer directed enzymatic amplification of DNA
with a thermostable DNA polymerase. Science. 239: 487-491.
Soucy, S.L. and Danforth, B.N. 2002. Phylogeography of the socially polymorphic
sweat bee Halictus rubicundus (Hymenoptera: Halictidae). Evolution. 56(2):
330-341.
Stock, S.P., Gardner, S.L., Wu, F.F. and Kaya, H.K. 1995. Characterization of two
Steinernema scapterisci populations (Nemata: Steinernematidae) using
morphology and random amplified polymorphic DNA markers. Journal of
the Helminthological Society of Washington. 62: 242-249.
Vieira, P., Valadas, V., Akbulut, S., Mota, M. and Ryss, A. 2004. First Report of
Bursaphelenchus mucronatus from Turkey, associated with Pinus nigra.
XXVIII ESN International Symposium, Rome, 14-18 June 2004.112.
(Abstract).
Wright, D.J. and Perry, R.N. 2002. Physiology and Biochemistry. Entomopathogenic
Nematolgy. Randy Gaugler (ed.). CABI Publishing, New York, USA. 145-
169 pp.
85
Yeates, G.W. and Boag, B. 2004. Background for Nematode Ecology in the 21st
Century. Nematode morphology, physiology and ecology. Chen, Z.X.,
Chen, S.Y. and Dickson, D.W. (eds.). CABI Publishing, Cambridge, USA.
406-429 pp.
Ye, W., Giblin-Davis, R.M., Braasch, H., Morris, K. and Thomas, W. K. 2006.
Phylogenetic relationships among Bursaphelenchus species
(Nematoda:Parasitaphelenchidae) inferred from nuclear ribosomal and
mitochondrial DNA sequence data. Molecular Phylogenetics and Evolution.
(In press).
Yen, M.Y., Yen, T.C., Pang, C.Y., Liu, J.H. and Wei, Y.H. 1992. Mitochondrial DNA
mutation in Leber's hereditary optic neuropathy. Investigative
Ophthalmology & Visual Science. 33(8):2561-2566.
86
ÖZGEÇMİŞ
2004-
87