DEADLINE: ​Midnight 12/06/2020 - Trễ deadline = Kick - No excuse :) 

 
MAI NHI  
1.  Glycolysis  is  an  almost  universal  pathway  for  extraction  of  the  energy 
available  from  carbohydrates,  shared  among  prokaryotes  and  eukaryotes, 
aerobes  and  anaerobes  alike.  Base  on  what  you  have  learnt  and  your  best 
understanding  towards  the  mentioned  process,  investigate  the  direct  and 
indirect glycolysis as well as give concrete examples, where possible.  
● Glycolysis  is  an  energy  conversion-breaking  down  glucose  to  form  ATP  (1 
glucose molecule is split to 2 pyruvate molecules, about 5% amount of energy 
stored  in  2  ATPs  molecules  and  NADH  molecule).  Glycolysis  location  is  in 
the cytosol of all cells. 
● Glycolysis  is  an  almost  universal  pathway  for  extraction  of  the  energy 
available  from  carbohydrates,  shared  among  prokaryotes  (cells  have  no 
organelles)  and  eukaryotes  (cells  process  a  true  nucleus),  aerobes  (an 
organism  that  grows  in  the  presence  of  molecular  oxygen)  and  anaerobes  (an 
organism that grows in the absence of molecular oxygen) alike. 
● In  anaerobes,  glycolysis  is  the  only  significant  source  of  energy  from 
carbohydrates.  It  is  an  ATP  production  and  can  recycle  NADH  by  making 
lactate. 
● In  aerobic  organisms,  the  function  of  glycolysis  is  to  convert  glucose  to 
pyruvate  and  ATP.  Pyruvate  can be burned for energy (TCA) or converted to 
fat (fatty acid synthesis). 
● Glycolysis  produces energy in the form of ATP and NADH. The intermediate 
products of glycolysis can be used for other pathways. 
● The  pathway  of  glycolysis  consists  of  2  phases:  first  5  steps  are  energy 
investment  phase  in  which  1  molecule  of  glucose  is  converted  into  2 
molecules  of  glyceraldehyde-3-phosphate  (2  ATPs  are  used),  the  last  5  steps 
are  energy  payoff  phase  in  which  2  molecules  of  glyceraldehyde-3-phosphate 
are converted into pyruvate or lactate (4 ATPs and 2 NADHs are produced). 
● Glycogen  in  the  liver  is  synthesized  from  glucose-6-phosphate  via 
glucose-l-phosphate  and  UDP-glucose.  Glucose-6-phosphate can be formed in 
the  liver  either  by  the  direct  phosphorylation  of  glucose  or  via 
gluconeogenesis  from  three-carbon  intermediates  (C3).  Recently  however, 
Katz  and  McGarry  and  Katz  et  al.  postulate  that  liver  cannot  utilize  glucose 
efficiently,  and  that  postprandial  glycogen  replenishment  is  mostly  brought 
about  through  the  operation  of  an  indirect  pathway  that  requires  prior 
degradation  of  glucose  to  compounds  located  at  the  level of triose phosphates 
or  lowers  down  the  glycolytic  pathway.  The  carbon  from  these  intermediates 
of  glycolysis  is  then  converted  via  gluconeogenesis  to  glucose-6-phosphate, 
 glucose-  1  -phosphate,  and  ultimately  ends  up  in  the  glucosyl  units  of  newly 
synthesized  glycogen.  This metabolic route for hepatic glycogen synthesis has 
been  termed  the  "indirect  pathway"  to  distinguish  it  from  the  more 
conventional  "direct  pathway".  Further,  the  futile  breaking  down  of  glucosyl 
units followed by their resynthesis from the indirect pathway has been cited as 
evidence  for  either  intracellular  compartmentation  of  pathways  or  functional 
"zonation" of the liver. 
 
 
2.  Show  your  understanding  upon  glycolysis  and  summarily  figure  the outcome 
of the glycolysis.  
Understanding upon glycolysis: 
● Glycolysis is a series of reactions that extract energy from glucose by splitting 
it  into two three-carbon molecules called pyruvates. Glycolysis is found in the 
great majority of organisms alive today. 
● In  organisms  that  perform  cellular  respiration,  glycolysis  is  the  first  stage  of 
this  process.  However,  glycolysis  doesn’t  require  oxygen,  and  many 
anaerobic  organisms—organisms  that  do  not  use  oxygen—also  have  this 
pathway. 
● Over  the  course  of  glycolysis'  nine  steps,  the  6-carbon  molecule  glucose  is 
broken  down  to  two  3-carbon  pyruvate  molecules.  The  reaction  does  not 
occur  spontaneously:  2  ATP  molecules  must  be  broken  down  to  drive  the 
splitting  of  glucose  into  the  2  pyruvates.  However,  in  the  course  of  the 
breakdown  of  glucose,  the  glycolysis  reaction  produces  four  ATP,  resulting 
in  a  net  gain  of  two  ATP  for  the  entire process. Glycolysis also results in the 
production  of  2  NADH molecules, which eventually play an important role in 
the  production  of  additional  ATP  in  the  electron  transport  chain.  Glycolysis 
itself  is  an  anaerobic  process.  After  a  cell  has  completed  glycolysis  and 
depending  on  the  circumstances  in  which  the  cell  finds  itself,  that  cell  can 
either  move  into  the  process  of  aerobic  respiration  and  commence  the  citric 
acid  cycle  or  continue  with  less  efficient  anaerobic  respiration  in  a  process 
called fermentation. 
Summarily figure the outcome of the glycolysis: 
● Glycolysis  starts  with  one  molecule  of  glucose  and  ends  with  two  pyruvate 
(pyruvic  acid)  molecules,  a  total  of  four  ATP  molecules,  and  two  molecules 
of  NADH.  Two  ATP  molecules  were  used  in  the  first  half  of  the  pathway to 
prepare  the  six-carbon  ring  for  cleavage,  so  the  cell  has  a  net  gain  of  two 
ATP  molecules  and  2 NADH molecules for its use. If the cell cannot catalyze 
the  pyruvate  molecules  further  (via  the  citric  acid  cycle  or  Krebs  cycle),  it 
will harvest only two ATP molecules from one molecule of glucose. 
 ● Mature  mammalian  red  blood  cells  do  not  have  mitochondria  and  are  not 
capable  of  aerobic respiration, the process in which organisms convert energy 
in  the  presence  of  oxygen.  Instead,  glycolysis  is  their  sole  source  of  ATP. 
Therefore,  if  glycolysis  is  interrupted,  the  red  blood  cells  lose their ability to 
maintain  their  sodium-potassium  pumps,  which  require  ATP  to  function,  and 
eventually,  they  die.  For  example,  since  the  second  half  of  glycolysis (which 
produces  the  energy  molecules)  slows  or  stops  in  the  absence  of  NAD+, 
when  NAD+  is  unavailable,  red  blood  cells  will  be  unable  to  produce  a 
sufficient amount of ATP in order to survive. 
● Additionally,  the  last  step  in  glycolysis  will  not  occur  if  pyruvate  kinase,  the 
enzyme  that  catalyzes  the  formation  of  pyruvate,  is  not  available in sufficient 
quantities.  In  this  situation,  the  entire  glycolysis  pathway  will  continue  to 
proceed, but only two ATP molecules will be made in the second half (instead 
of  the  usual  four  ATP  molecules).  Thus,  pyruvate  kinase  is  a  rate-limiting 
enzyme for glycolysis. 
 
3.  When  an  inadequate  amount  of  carbohydrate  source  from  the  daily  diet  is 
met,  how  does  human  body  mobilize  needed  fuel  source  of  glycolysis  for  the 
demand of the entire activity of human body, especially the brain. 
Glycogen  stores  can  be  depleted  such  that  they  no  longer  supply  glucose  to  the 
blood.  In  this  case,  glucose  can  be  produced  by  protein  catabolism  and  further 
catabolism  of  glucogenic  amino  acids.  On  the  other  hand,  in  the  absence  of 
carbohydrates  in  the diet, the brain switches to the use of ketone bodies as an energy 
source. 
● When  you  stop  eating  carbs  for  several  hours,  liver glycogen is broken down 
into  glucose  and  released  into  the  bloodstream  to  prevent  blood glucose from 
dropping  too  low.  Although  far  more  glycogen is stored in your muscles than 
in  your  liver,  it  remains  in  the muscles to meet their energy needs and cannot 
be released into the bloodstream to raise blood glucose. 
● After  going  24-48  hours  without  any  carbs,  glycogen  levels  become  depleted 
and insulin levels decrease.  
● At  this  point,  the  liver  steps  up  its  production  of  water-soluble  compounds 
known  as  ketones,  created  by  the  breakdown  of  fatty  acids.  The  source  of 
ketones  comes  from  either  the  fat  you  eat  or  the  mobilization  of  body  fat out 
of  your  fat  stores.  The  resulting  ketones  can  cross  the  blood-brain  barrier  to 
provide the brain with an additional source of energy. 
➔ This  means  that  there’s  another  fuel  source  available  for  the  brain  when  the 
body runs low on stored carbohydrates. 
 
 
DIỆU HUYỀN 
4.  Why  does  human  body  require  a  certain  amount  of  carbohydrates  in  daily 
diet? Exemplify case by case.  
Carbohydrate​s  are  all  about  energy  and  are  found  in  foods  like  fruits,  vegetables, 
bread,  pasta,  and  dairy  products.  Carbohydrates  are  the  body's  main  source  of 
energy.  In  their  absence,  your  body  will  use  protein  and  fat  for  energy.  It may also 
be  hard  to  get  enough  fiber,  which  is  important  for  long-term  health.  Healthy 
sources  of  carbohydrates,  such  as  higher  fiber  starchy  foods,  vegetables,  fruit  and 
legumes,  are  also  an  important  source  of  nutrients,  such  as  calcium,  iron  and  B 
vitamins. 
 
In the case of cutting out carbohydrates, it leads to 3 results that harm health : 
a.  Muscles  rely  on  carbohydrates  as  their  main  source  of  fuel  when  you 
exercise.  A  diet  that  is  low  in  carbohydrates  can  lead  to  a  lack  of  energy  during 
exercise, early fatigue and delayed recovery. 
b.  Replacing  carbohydrates  with  fats  and  higher  fat  sources  of  protein  could 
increase  your  intake  of  saturated  fat,  which  can  raise  the  amount  of  cholesterol  in 
your blood – a risk factor for heart disease. 
c.  When  you're  low  on  glucose,  the  body  breaks  down  stored  fat  to  convert  it 
into  energy.  This  process  causes  a  build-up  of  ketones  in  the  blood,  resulting  in 
ketosis.  This  can  cause  headaches,  weakness,  feeling  sick,  dehydration,  dizziness 
and irritability. 
 
5.  The  citric  acid  cycle  is  a  central  metabolic  pathway  that  completes  the 
oxidative  degradation  of  fatty  acids,  amino  acids,  and  monosaccharides.  Base 
on your understanding, clarify the above statement.  
-  Citric  acid  cycle,  or  TCA  cycle  (tricarboxylic  acid  cycle)  or the Krebs cycle ​– is a 
series  of  chemical  reactions  used  by  all  ​aerobic  organisms  to  release  stored  energy 
through  the  ​oxidation  of  acetyl-CoA  derived  from  carbohydrates, fats, and proteins, 
into ATP and carbon dioxide​. 
-  ​Fatty  acid  degradation:  process  in  which  fatty  acids  are  broken  down  into  their 
metabolites,  in  the  end  generating  ​acetyl-CoA  which then enters the citric acid cycle 
to produce ATP. 
● In  many  tissues  (especially  the  heart  and  skeletal  muscle),  fatty  acids  are 
broken  down  through  a  process  known  as  ​beta-oxidation​,  results  in  the 
production  of  mitochondrial  ​acetyl-CoA​,  which  can  be  used  in  the  citric  acid 
cycle. 
● Acetyl-CoA is the only fuel to enter the citric acid cycle. With each turn of the 
cycle,  one  molecule  of  ​acetyl-CoA  is  consumed  for  every  molecule  of 
oxaloacetate​ in the mitochondrial matrix and is never regenerated. 
- Amino acid degradation is breaking down th​e amino acids.  
● Oxidative  deamination  is  the  first  step  in  this  process.  The  amino  group  is 
removed.  The  remaining  amino  acid  is  oxidized  to  alpha-​keto  acid​,  which 
then  proceeds  into  the  TCA  cycle  → produce energy. The acid can also enter 
glycolysis  to  make  ​pyruvate  which  is  then  converted  into ​acetyl-CoA to enter 
the TCA cycle  
● Transamination  has  the  same  end  result  as  deamination:  the  remaining  acid 
will  undergo  either  glycolysis  or  the  TCA  cycle  to  produce  energy  that  the 
organism's body will use for various purposes. 
● In  addition,  TCA  cycle  provides  precursors of certain amino acids, as well as 
the reducing agent NADH, that are used in numerous other reactions 
 
→  The  citric  acid  cycle  is  the  ​final  common  pathway  for  the  oxidation  of  ​amino 
acids,  fatty  acids,  and  monosaccharides.  They  are  degraded  in  cells  to  yield  acetyl 
CoA which is oxidized in the citric acid cycle and release energy
 
6.  Show  your  understanding  and  figuring  out  the  oxidative  phosphorylation  of 
utilizing  the  chemical  energy  of  those  reduced  molecules  from  glycolysis  and 
Citric Acid Cycle to produce ATP. 
Oxidative  phosphorylation  happens  in  the  mitochondrion,  which  is  the  process  in 
which  electrons  from  the  reduced  cofactors  NADH  and  ubiquinol  are  funned  in  a 
stepwise  manner  to  oxygen.  Electrons  flow  much  like  electricity  through  the 
concomitant  formation  of  a  proton  gradient.  In  the  end,  the  investment  of  reduced 
cofactors results in the production of ATP. 
Reduced  electron  carries  NADH  and  ubiquinol  are  produced  during  glycolysis  and 
citric  acid  cycle,  as  well  as  oxidation  pathway.  During  the  cellular  process  of 
respiration  oxidative  phosphorylation  utilize  the  chemical  energy  of  these  reduced 
molecules to produce ATP. 
  
NGỌC TÚ 
7.  Show  your  understanding  and  exemplifying  the  roles  of  NADPH  in  the  all 
related issues of concern. 
 

-  One  of  the  functions  of  NADPH  in  the  cell  is  to  prevent oxidative areas. NADPH 
plays  an  important  role  in  biological  processes  (energy  metabolism,  immune system 
function, cell aging, cell death). 
-  3  main  functions:  contributes  to  antioxidant  systems  and  is  used  during  reactions 
(acting  as  a  substrate)  of  a  NADPH  oxidase  to  make  reactive  oxygen  species 
(NADPH oxidase) 

- Positive effects of NADPH: Increases antioxidants, helps prevent Anemia. 

- Negative effects of NADPH: Contributes to cancer growth, rheumatoid arthritis. 

-  In  cancer  cells:  NADPH  is  essential  for  scavenging  of  reactive  oxygen  species 
mainly  derived  from  oxidative  phosphorylation  required  for  ATP  generation.  Thus, 
metabolic  reprogramming  of  NADPH  homeostasis  is  an  important  step  in  cancer 
progression as well as in combinational therapeutic approaches. 

-  In  diabetes  mellitus  type  II.  Regeneration  of  Glutathione  by  Glutathione  – 
reductase,  so  it  detoxifies  the  hydro  peroxide  that  diffuses  from  the mitochondria to 
the  cytosol  converting  it  into  water  and  molecular  oxygen.  This  process  will  help 
lower the rate having type 2 diabetes.  

 
8.  Briefly  summarize  (both  texts and figures) the interrelation between PPP and 
diabetes mellitus diseases, then give examples where possible  
Pentose Phosphate Pathway and diabetes mellitus diseases: 

-  ​Pentose  phosphate  pathway  (PPP),  also  known  as the hexose monophosphate 

shunt  or  the  phosphor-gluconate  pathway,  is  the  set  of  reactions  that  produce 
NADPH and ribose-5-phosphate (R5P) form glucose-6-phosphate. 

-  ​Diabetes  mellitus  disease  is  a  set  of  related  disease  in  which  the  body  cannot 
regulate the amount of sugar (specifically glucose) in the blood. These are 2 main 
types of diabetes mellitus: Type 1 and type 2 diabetes. 

The interrelation between PPP and diabetes mellitus disease: 

-  ​The  pentose  phosphate  produces  glucose,  then  it  is  released  into  the 

bloodstream.  In  a  healthy  person,  the  blood  glucose  level  is regulated by several 

hormones,  primarily insulin, which is produced by the pancreas. In a person who 
have  diabetes  mellitus  diseases, pancreas do not produce enough insulin, then the 
cells  cannot  use  glucose  for  energy  =>  the blood glucose levels remain high > 
diabetes 

Figures: 
   

 
 
 
9.  Briefly  summarize  (both  texts and figures) the interrelation between PPP and 
cancerous diseases, then give examples where possible  

The Pentose Phosphate Pathway and cancerous diseases 

-  ​PPP,  also  known  as  the  hexose  monophosphate  shunt  or  the 

phosphor-gluconate  pathway,  is  the  set  of  reactions  that  produce  NADPH  and 
ribose-5-phosphate (R5P) from glucose-6-phosphate. 

-  ​Characteristic of cancer cells: In most of tumors found in humans and other 

animal,  their  cancerous  cells  grow  under  hypoxic  conditions.  So,  in  order  to 
make  the  same  amount  of  ATP,  glucose  uptake  and  glycolysis  proceed  in 
cancerous cells about 10 times faster than in non-cancerous cells. 

The interrelation between PPP and cancerous diseases 

PPP’s main role is anabolism with 2 key products 

- NADPH: used in biosynthesis, detoxification, etc. 

- Pentose sugar (5-carbon sugar): make up DNA & RNA 

-> cell need both Glycolysis and PPP to survive 

-> glucose-6-phosphate fate mainly depends on these 2 processes 

In  addition,  glucose-6-phosphate  is  one  of  the  most  important  material  in  glycolysis 
to generate ATP for cancer cells. 

--> ​PPP  as  well  as  glycolysis  under  the  cancerous  condition are overactive in order 
to produce enough material for the cell growth proliferation in tumor tissues.   

 
 
QUỐC TÍNH 
10.Show  your  understanding  upon  the  glycogen  metabolism  and  exemplify 
where possible.  
Glycogen metabolism is divided into 2 main processes: synthesis and degradation  
• Glycogen degradation:​ consists of three steps 
(1) the release of glucose 1-phosphate from glycogen 
(2)  the  remodeling  of  the  glycogen  substrate  to  permit  further 
degradation 
(3)  the  conversation  of  glucose  1-phosphate  into  glucose  6-phosphate 
for further metabolism.  
- The  glucose  6-phosphate  derived  from  the  breakdown  of 
glycogen have 3 fates:  
(1) It is the initial substrate for glycolysis. 
(2)  It  can  be  processed  by  the  pentose  phosphate  pathway  to  NADPH 
& ribose derivatives. 
(3)  It  can  be  converted  into  free  glucose  for  release  into  the 
bloodstream  
-  This  conversion  takes  place  mainly  in  the  liver  and  to  a lesser extent 
in the intestines and kidneys.  
• Glycogen synthesis: 
+  Glucose  6-phosphate  is  converted  to  glucose  1-phosphate  in  a 
reversible reaction catalyzed by phosphoglucomutase  
+  Glucose  1-phosphate  +  UTP  ->  UDP-glucose  +  pyrophosphate 
catalyzed by UDP-glucose pyrophosphorylase 
+  Glycogen  synthase  catalyzes  the  transfer  of  glucose  from 
UDP-glucose to glycogen with the formation of an alpha 1-> 4 link. 
 +  Branch  points  are  formed  by  glycogen  branching  enzyme  (amylo 
1-4 -> 1-6 transglucosylase). 
 
11.Describe  how  regulation  of  glycogen  metabolism  involves  the 
phosphorylation status of glycogen synthase and glycogen phosphorylase  
Glycogen  metabolism  is  regulated  by  the  activities  of  glycogen  synthase  and 
glycogen phosphorylase. 
Phosphorylation  by  protein  kinases  activates  glycogen  phosphorylase and inactivates 
glycogen synthase. 
The phosphorylation is reversed by phosphoprotein phosphatase activity. 
Glucagon  and  epinephrine  increase  glycogen  breakdown  by  activating  adenylate 
cyclase. This produces 3’5’-cyclic AMP which activates protein kinase A. 
 
 
Regulation by glycogen phosphate  

 
  
Glycogen  phosphorylase  catalyses  sequential  removal  of  glucose  units  of  glycogen 
by the addition of orthophosphate to form glucose 1 phosphate. 
Glycogen  phosphorylase  is  present  in  two  forms  a  and  b.  Form a is active form and 
b  is  the  inactive  form.  Glycogen  phosphorylase  is  activated  by  binding  of 
epinephrine  and  glucagon  to  7  -transmembrane  receptors.  This  binding  leads  to  the 
activation  of  adenylate  cyclase  by  the  alpha  subunit  of  G  protein.  Activated 
adenylate  cyclase  produces  CAMP.  Then,  CAMP  activates  protein  kinase  A. 
Further,  protein  kinase  A  activates  Phosphorylase  kinase  by  phosphorylation.  Then 
phosphorylase  kinase  phosphorylase  glycogen  phosphorylase  b  form  active  form of 
glycogen.  phosphorylase  a.  Phosphate  groups  are  added  to  serine  and  threonine 
amino acids. 
 
Regulation by glycogen synthase 
  
  
Glycogen  synthase  catalyses  the  addition  of  UDP  glucose  on  the  growing  end  of 
glycogen. 
During  glycogen  breaks  down  protein  Kinase-A  activated  by  binding  of  glucagon 
and  epinephrine,  inhibited  glycogen  synthase  enzyme  by  the  addition  of  phosphate 
group.  Along  with  protein  kinase-A,  other  enzyme  called  glycogen  synthase  kinase 
also inhibit glycogen synthase by phosphorylation 
 
 
12.  Describe  and  exemplify  the  functions  of  the  pentose  phosphate  pathway  as 
in detailed notes as possible.  
The  Pentose  Phosphate  Pathway  is  primarily  catabolic  and  serves  as  an  alternative 
glucose  oxidizing  pathway  for  the  generation  of  NADPH  that  is  required  for 
reductive  biosynthesis  reactions  such  as  those  of  cholesterol  biosynthesis,  bile  acid 
synthesis, steroid hormone biosynthesis, and fatty acid synthesis. 
 
The  PPP  can  also  function  as  an  anabolic  pathway  that  utilizes  the  six-carbon  of 
glucose  to  generate  five-carbon  sugars.  particularly  ribose-5-phosphate  (R5P) that is 
required  for  purine  and  pyrimidine  nucleotide  biosynthesis.  The  PPP  can,  under 
certain  conditions,  completely  oxidize  glucose  to  CO2  and  water.  The  primary 
function of this pathway.  
 
To  generate reducing equivalents, in the form of NADPH, for reductive biosynthesis 
reactions within cells. 
To  provide  the  cell  with  ribose-5-phosphate  for  the  synthesis  of  the  nucleotides  and 
nucleic acids. 
Although  not  a  significant  function  of  the  PPP  it  can  operate  to  metabolism  dietary 
pentose  sugar  delivered  from the digestion of nucleic acid as well as to rearrange the 
carbon skeleton of dietary carbohydrates into glycolysis and gluconeogenesis  
  
-------------------------------------------------------------------------------------------------------- 
Viết như trên hoặc có thể viết ntn  

 
  
 
BẢO KHUYÊN 
13.  Show  your  understanding  and discussing all about the known functionalities 
of fatty acids in the human body.  
Fatty acids 
- Building blocks for triglycerides and phospholipids 
- Contain  a  chain  of  carbon  and  hydrogen  atoms  with  a  carboxyl  group  at  the 
alpha end and a methyl group at the omega end. 
Important roles of fatty acids:  
1) signal-transduction pathway  
- Fatty acids act as second messengers in the pathway: 
+ Because  their  concentration  can  change  very  fast  in order to react with 
the binding ​of specific agonists to plasma membrane receptors. 
+ Can  replace  the  classical  ​second  messengers  of  the  inositol 
phospholipid and the cyclic AMP signal transduction pathways. 
- Fatty  acids  are  modulators  because  they  act  in  a  reversible  process  at  a 
precise  intracellular  location  for  a  very  short  time  to  amplify,  attenuate  or 
deviate a signal. 
2) cellular fuel sources 
  
3) the composition of lipids 
- Lipids: ​Building blocks for triglycerides and phospholipids 
+ Triglycerides: are formed when 3 fatty acids attach to glycerol backbone 
+  Phospholipids:  are  modified  form  of  triglycerides  where  1  fatty  acid  is  replaced 
by a phosphate group 
 
4) ​formation of cholesterol in liver 
Cholesterols  in  our  body  help  to  produce  sex  hormones  like  ​testosterone  and 
estrogen,  help in production of vitamin D which ​are needed to keep ​bones​, teeth and 
muscles  healthy​,  and  produce  bile  acids  which  help  the  body  digest  fat more easily. 
So the formation of cholesterols is very important. 
 
14.Discuss and exemplify roles of amino acid catabolism. 
- Amino  acid  catabolism  helps  the  body  to  remove  the  toxins  (such  as 
ammonia,  urea,  etc.) via urine through deamination which occurs in the liver. 
Sometimes,  the  toxins  (particularly  in  the  muscle)  can  be  transported  to  the 
liver for removal via blood in the form of alanine. 
- Forms  glutamate,  a  very  important  neurotransmitter.  Glutamate  plays  a 
crucial  role  in  sending signals between nerve cells, and supporting in learning 
and memory improvement. 
- Break  down  the  carbon  skeletons  of  glucogenic  amino  acids  to  form  glucose 
for  energy  or  convert  the  glucogenic  amino  acids  into glycogen or fatty acids 
for energy storage. 
 
 
15.  Where  does  the  deamination  occur?  Show  the  general  outline  chemistry  of 
deamination.  What  would  happen  to  the  liver  and  human  health  if  the 
deamination process is somehow disordered in a certain period.  
Deamination occurs in the liver. 
Outline chemistry of deamination: 
- Amino  acid  is  deaminated  into  ammonia  and  organic  compounds  which  are 
used for respiration. 
- The  ammonia,  which  is  very  toxic,  is  then  reacts  with  CO2  to  form  urea 
(H2NCONH2) 
- The  urea  H2NCONH2  will  be  transported to kidney and then be removed out 
of the body via urine (excretion) 
Disorder of deamination process 
Deamination  is  the  removal  of  nitrogen  from  amino  acids,  the  aa carbon skeleton in 
the  deamination  process  have  several  roles  that  both  precursors  for  Krebs  cycle and 
gluconeogenesis and be recycled or oxidized for energy. 
Nitrogen is toxic for the human body and it must be removed. Since the deamination 
helps the body to eliminate the ammonia, if the process is disordered, the removal of 
amino acid and formation of urea will be interrupted and may lead to ​toxic 
accumulation of ammonia. Therefore, ammonia is still kept in the body. ​The high 
amounts of ammonia can cause brain damage, coma and eventually death. This 
matter is called Urea Cycle Disorder. 
Some symptoms of Urea Cycle Disorder 
- Often feel tired and don’t want to eat, especially meat. 
- Nausea and vomiting 
- Metal weakness, easy to get angry and stress. 
 
 
 
MINH THU 
16.  Showing  and  understanding  upon  the  roles  of  lipids  in  the  human  body  as 
well as the required conditions for the entire lipid digestion and absorption.  
The role of lipids in the human body: 
● Structural function in biomembranes. 
● Major energy source. 
● Provide  essential  fat-soluble  vitamin,  fatty  acid  prostanoids,  leukotrienes  and 
steroid hormones. 
● Insulators: thermal (adipose) and electrical (myelinated nerves). 
● Form  second  messengers  (PI)  -  (PI  or  phosphatidylinositol,  a  minor 
component  of  membrane  lipids).  This  molecule  serves  as  a  source  of  the 
second messenger compounds. 
 ● Defects in lipid metabolism lead to major clinical problems. 
The required conditions for the entire lipid digestion and absorption 
Lipid  is  a  fat-like  molecule  that  does  not  have  the  ability  to  dissolve  in  water 
(hydrophobic).  The enzymes that are necessary for lipid digestion and absorption are 
called lipase. There are three types of lipase: 
● Lingual lipase (from the tongue). 
● Gastric lipase (from the stomach). 
● Pancreatic lipase (from the pancreas). 
 
17.  Show  your  understanding  and  exemplifying  the  important  biomolecules  in 
Biochemistry  

Biomolecules  are  organic  molecules,  not  fundamentally  different  from  other.  They 
are  the  same types of molecules, react in the same ways, and obey the same physical 
laws. 

The  four  main  classes  of  biomolecules  in  biochemistry  are  carbohydrates,  lipids, 
proteins,  and  nucleic  acids.  Many  biological  molecules  are  polymers:  in  this 
terminology,  monomers  are  relatively  small  micromolecules  that  are linked together 
to  create  large  macromolecules, which are known as polymers. When monomers are 
linked  together  to  synthesize  a  biological  polymer,  they  undergo  a  process  called 
dehydration synthesis. 

Carbohydrates 

Carbohydrates  are  chemically  defined  as  polyhydroxy  aldehydes  or  ketones  or 
compounds  which  produce  them  on  hydrolysis.  In  layman’s  terms, we acknowledge 
carbohydrates  as  sugars  or  substances  that  taste  sweet.  They  are  collectively  called 
saccharides.  Depending  on  the  number  of  constituting  sugar  units  obtained  upon 
hydrolysis,  they  are  classified  as  monosaccharides  (1  unit),  oligosaccharides  (2-10 
units),  and  polysaccharides  (more  than  10  units).  They  have  multiple  functions  viz. 
they’re  the  most  abundant  dietary  source  of  energy;  they  are  structurally  very 
important  for  many  living  organisms  as  they  form  a  major  structural  component, 
e.g. cellulose is an important structural fiber for plants. 

Proteins 

Proteins  are  another  class  of  indispensable  biomolecules  that  make  up  around  50% 
of  the  cellular  dry  weight.  Proteins  are  polymers  of  amino  acids  arranged  in  the 
form  of  polypeptide  chains.  The  structure  of  proteins  is  classified  as  primary, 
secondary,  tertiary,  and  quaternary  in  some cases. These structures are based on the 
level  of  complexity  of  the  folding  of  a  polypeptide  chain.  Proteins  play  both 
structural and dynamic roles. Most enzymes are proteinaceous in nature. 

Nucleic Acids 

Nucleic  acids  refer  to  the  genetic  material  found  in  the  cell  that  carries  all  the 
hereditary  information from parents to progeny. There are two types of nucleic acids 
namely,  deoxyribonucleic  acid  (DNA)  and  ribonucleic  acid  (RNA).  The  main 
function  of  nucleic  acid  is  the  transfer  of  genetic  information  and  synthesis  of 
proteins  by  processes  known as translation and transcription. The monomeric unit of 
nucleic  acids  is  known  as  nucleotide and is composed of a nitrogenous base, pentose 
sugar,  and  phosphate.  The  nucleotides  are  linked  by  a  3’  and  5’  phosphodiester 
bond.  The  nitrogen  base  attached  to  the  pentose sugar makes the nucleotide distinct. 
There  are  4 major nitrogenous bases found in DNA: adenine, guanine, cytosine, and 
thymine. In RNA, thymine is replaced by uracil. 

Lipids 

Lipids  are organic substances that are insoluble in water, soluble in organic solvents, 
are  related  to  fatty  acids,  and  are  utilized  by  the  living  cell.  They  include  fats, 
waxes,  sterols,  fat-soluble  vitamins,  mono-,  di-  or  triglycerides,  phospholipids,  etc. 
Unlike  carbohydrates,  proteins,  and  nucleic  acids,  lipids  are  not  polymeric 
molecules.  Lipids  play  a  great  role  in  the  cellular  structure  and  are  the  chief source 
of energy. 

18.  How  would  you  evaluate the roles of lipids in general and cholesterol for the 

human health and human diseases, in general?  
The roles of cholesterol for human health and human diseases: 
HDL cholesterol 
- HDL  stands  for  high-density  lipoproteins,  which  is  known  as  the  “good” 
cholesterol. 
- HDL  cholesterol  carries  the  cholesterol  away  from  arteries  into  the  liver, 
thereby preventing heart disease. 
- A  high  HDL  level  helps  to  preserve  brain  cell  function  and  prevent  mental 
decline in the elderly. 
- High  levels  of  HDL  are  also  used  as  a  tool  for  diagnosing  metabolic 
syndrome, thereby preventing heart attack. 
- HDL  contains  antioxidant  molecules  that  may  prevent  LDL  from  being 
changed into a lipoprotein, which helps prevent heart disease. 
LDL cholesterol 
 - LDL  stands  for  low-density  lipoprotein  which  is  also  known  as  the  “bad” 
cholesterol for human health. 
- High  levels  of  LDL  in  the  bloodstream  deposit  the  cholesterol  into  arteries, 
which can cause blockage and lead to a heart attack. 
- LDL  cholesterol  adds  to  the  buildup  of  plaque  in arteries and increase risk of 
getting coronary heart disease. 
The roles of lipid for human health and human diseases: 
● Lipids  are  insoluble  molecules  and  therefore  make  good  energy  storage 
molecules. 
● They  are  also  used  for  insulation  and  protection  organs,  in  steroid  hormones 
and in cell membranes. 
● Omega-3 polyunsaturated fatty acids reduce the risk of heart disease. 
● Polyunsaturated fats may lower levels of LDL cholesterol. 
● Excess lipids in the diet can cause negative health effects. 
 
 
VÂN ANH 
19.  Briefly  show  your  understanding  upon  the  essential  roles  of  food  lipids  in 
the human health and the commonly known human diseases.  
 
20.  Briefly  show  your  understanding  upon  the  main  causes  of  diabetes  in 
relation  of  carbohydrate metabolism. In addition, should a diabetic patient fully 
stop having any source of carbohydrates? 
 
21.  Show  your  understanding  upon  the  lipids  digestion and lipids absorption by 
figuring out the main steps and necessarily involved enzymes.