Pemeriksaan virologis dilakukan dengan pemeriksaan DNA HIV dan RNA HIV.

Saat ini pemeriksaan DNA

HIV secara kualitatif di Indonesia lebih banyak digunakan untuk diagnosis HIV pada bayi. Pada daerah
yang tidak memiliki sarana pemeriksaan DNA HIV, untuk menegakkan diagnosis dapat menggunakan
pemeriksaan RNA HIV yang bersifat kuantitatif atau merujuk ke tempat yang mempunyai sarana
pemeriksaan DNA HIV dengan menggunakan tetes darah kering (dried blood spot [DBS]).