Professional Documents
Culture Documents
Bioenergetika
Bioenergetika
Bioenergetika
1
Žive ćelije i organizmi moraju da rade, sintetišu, kako bi živeli i reprodukovali se. Sintetski
procesi, kao i svaki proizvodni procesi u fabrici, zahtevaju određenu energije. Energija je
pored toga potrebana i za druge radnje kao što je kretanje, svetlenje (svitci), elekrično
pražnjenje (kod raže), zagrevanje (da bi se održala temperatura tela). Potom, čuvanje
informacija kao i njihovo prepisivanje zahteva energiju bez koje bi informacioni molekuli bili
neorganizovani i bez smisla.
Tokom evolucije, ćelije su razvile vrlo efikasne sisteme za dobijanje energije iz sunčeve
svetlosti i goriva (hranljivih materija). Jedan od ciljeva biohemije je da razume, u
kvantitativnom i hemijskom smislu, način na koji se energija dobija, kanališe i troši u živim
ćelijama. Živi organizmi se nalaze neprekidno u dinamičkoj ravnoteži, procesi sinteze i
degradacije se neprekidno odvijaju, tako da se karakteristični sastav nekog organizma vrlo
malo menja tokom vremena. Na primer, hranu koju pojedemo za ručak neposredno posle
obroka počinje da se vari i glukoza koja se oslobodi cirkuliše kroz krvotok. Do kraja dana ta
glukoza će se transformisati u nešto drugo, energiju, CO2 ili možda lipide, ali ćemo mi do
kraja dana ponovo jesti tako da će novi molekuli glukoze stići u krv. Zbog toga je
koncentracija glukoze u krvi tokom čitavog dana manje više konstantna.
Živi organizmi predstavlja jedan otvoren sistem*, što znači da razmenjuje energiju i materiju
sa okolinom sredinom. Živi organizmi dobijaju energiju iz okoline na dva načina: (1)
uzimaju hemijska goriva (kao što je glukoza) i iz njih dobijaju energiju oksidujući ih, ili (2)
absorbuju sunčevu energiju.
2
Bioenergetika je naučna oblast koja proučava transformacije energije u živim organizmima.
Iz prethodnog primera može se uočiti da se energija se u biološkim sistemima može dobiti i
transformisati iz jednog oblika u drugi na sledeći način:
Prvi zakon termodinamike opisuje princip konverzije energije i kaže da: u bilo kojoj fizičkoj
ili hemijskoj promeni, ukupna količina energije u univerzumu (sistem + okolina) ostaje
konstantna, mada se oblik energije može menjati.
Prvi zakon termodinamike definiše promenu unutrašnje energije sistema preko rada i toplote i
glasi: Ako neki sistem primi određenu količinu toplotne energije (Q) i pri tome izvrši neki rad
(W) onda promena unutrašnje energije sistema predstavlja razliku ove dve veličine (Q-W).
3
Promena unutrašnje energije sistema ne zavisi od načina na koji je ova transformacija
izvršena već zavisi samo od početnog i krajnjeg stanja.
Primer:
2) u zatvorenom sudu bez dobijanja električnog ili nekog drugog rada, samo se oslobađa
toplota
Ako se rad vrši pri konstantnom pritisku, tako da sistem koji apsorbuje toplotu iz okoline pri
konstantnom pritisku (Qp) povećava zapreminu koja vrši rad, pa je rad , odnosno
Promena toplotne energije pri konstantnom pritisku zove se toplotni sadržaj sistema ili
entalpija H:
4
endotermna reakcija, rastvaranje kuhinjske soli u vodi, topljenje leda
U prirodi se neki procesi odvijaju spontano (sami od sebe), a neki ne. Prelazak toplote sa
vrućeg na hladno telo, na primer. To važi i za sve biohemijske reakcije, neke teku spontano,
neke su povratne (reverzibilne), neke su nepovratne (ireverzibilne). U kom smeru će teći
određeni procesi ne može da nam kaže I zakon termodinamike. Spontani procesi se mogu
odvijati i kad je promena entalpija veća i manja od nule, kao što se iz primera vidi.
Drugi zakon termodinamike bavi se smerom prirodnih promena, odnosno govori u kom
smeru se procesi odvijaju spontano. Prema ovom zakonu praćenje spontanih procesa ostvarije
se preko praćenja neuređenosti sistema. Veličina koja je mera neuređenosti sistema zove se
entropija i obelažava sa S. Svaka promena u uređenosti sistema izražava se kao promena
entropije sistema. Dakle, što je sistem neuređeniji, to entropija ima veću vrednost i obrnuto.
Prilikom odvijanja hemijskih reakcija sistem može da povećava ili smanjuje svoju uređenost,
pa i sama entropija raste ili se smanjuje.
5
Prema tome, kada se određuje smer prirodne promene mora se uzeti u obzir promena
entropije samog sistema i njegove okoline. Zbog toga, II zakon termodinamike glasi: ukupna
entropija univerzuma raste ako se proces odvija spontano.
Univerzum čine sistem i okolina tako da je ukupna promena entropije jednaka zbiru promene
entropije okoline i promene entropije sistema:
promena entropije u okolini koja prati hemijsku reakciju može se izračunati iz promene
entalpije reakcije, jer se entropija termodinamički definiše kao energija koja se u obliku
toplota prenese pri temepraturi T, a ta toplota koju okolina primi može se izračunati iz
promene entalpije sistema:
Ukupna energija, koja se oslobađa (ili apsorbuje) kao toplota pri konstantnom pritisku
(entalpija, ΔH) sastoji se od slobodne hemijske energije, tj slobodne entalpije koja se može
iskoristiti za vršenje rada i vezane energije odnosno entalpije koja se nikako ne može
iskoristit za vršenje rada. Deo entalpije odnosno energije koji se maksimalno može pretvoriti
u rad je Gibsova slobodna energija ili hemijski potencijal. Jedinica je J/mol ili cal/mol.
Gibsova slobodna energija (kao i entalpija i entropija), je funkcije stanja, tj zavisi samo od
početnog i krajnjeg stanja, a ne načina na koji je promena izvršena, i koristi se kao kriterijum
za procenu mogućnosti sponatnog odigravanja hemijskih reakcija.
Ako je ΔG < 0 reakcija teče spontano, uz gubitak slobodne energije, tj. reakcija je egzergona.
Ako je promena ove energije velika, onda je reakcija ireverzibilna.
S druge strane, ako je ΔG > 0, onda reakcija teče samo uz dodatak slobodne energije,
odnosno ona je endergona. Ukoliko je veličina ove promene jako velika, sistem je stabilan,
sa malom ili nikakvom tendencijom da se reakcija desi.
Ako je ΔG = 0 sistem je u ravnoteži, sumarno gledano nema promena.
6
Termodinamički kriterijumi spontanog odigravanja reakcije:
1) ako je reakcija egzotermna, ΔH < 0 i ΔS > 0 onda je ΔG < 0 na svim temperaturama
2) ako je reakcija egzotermna, ΔH < 0 i ΔS < 0 onda je ΔG < 0 na temperaturama T
<ΔH/ΔS
3) ako je reakcija endotermna, ΔH > 0 i ΔS > 0 onda je ΔG < 0 na temperaturama T
>ΔH/ΔS
4) ako je reakcija endotermna, ΔH > 0 i ΔS < 0 onda je ΔG < 0 ni na jednoj tempereaturi
Primer:
7
2) Za bilo koju reverzibilnu hemijsku reakciju tipa:
8
korisnog rada. Za spontane procese ΔG je jednako maksimalnom električnom radu koji se
može dobiti od sistema.
Za procese koji nisu spontani ΔG predstavalje minimalni rad koji mora biti dat sistemu da bi
se promena desila.
U biosistemima, veliki broj reakcija su redoks reakcije. Ove reakcije podrazumevaju gubitak
elektrona jednog jedinjenja, za koje kažemo da se oksiduje i primanje elektrona od strane
drugog jedinjenja, za koje kažemo da se redukuje. Kretanje elektrona u oksido-redukcionim
procesima je odgovorno, direktno ili indirektno, za sav rad koji vrše živi organizmi. Svaki
put kada koristimo motor, električnu sijalicu ili varnicu kako bi upalili benzin u kolima, mi
koristimo kretanje elektrona kako bi ovo obavili. U strujnom kolu koje pokreće motor, izvor
elektrona može biti baterija koja sadrži dva hemijska jedinjenja koja se razlikuju u afinitetu
prema elektronima. Električne žice omogućavaju da elektroni putuju od jedinjenja koje se
nalazi na jednom polu baterija, kroz motor, do jedinjenja koje se nalazi na drugom polu
baterije. Pošto dva hemijska jedinjenja imaju različit afinitet prema elektronima, elektroni
spontano putuju kroz strujno kolo, vođeni silom proporcionalnoj razlici u elektronskom
afinitetu, koja se naziva elektromotorna sila. Ta sila može da izvrši rad ako je odgovarajući
konvertor, u ovom slučaju motor, povezan u strujno kolo. Motor dalje može biti povezan sa
nizom mehaničkih uređaja koji mogu obaviti koristan rad.
Žive ćelije poseduju analogno biološko “strujno kolo”, u kome je kao izvor elektrona
redukovano jedinjenje kao što je glukoza. Tokom oksidacije glukoza otpušta elektrone koji
spontano, preko niza intermedijernih nosača elektrona, putuju do akceptora elektrona, kao što
je molekulski kiseonik. Ovaj tok elektrona je egzergon, jer molekulski kiseonik ima veći
afinitet prema elektronu nego što ga imaju intermedijerni nosači elektrona. Rezultujuća
elektromotorna sila omogućava velikom broju molekularnih energetskih konvertora (kao što
su enzimi i proteini) da obavljaju biološki rad.
9
U ćeliji se zajedno sa elektronima često prenose i protoni, ili protoni bivaju otpušteni, zbog
čega se elektroni mogu preneti sa jednog molekula na drugi molekul na četri različita načina:
1) direktno kao elektron,
2citohrom a3 (Fe2+)+ 1/2O2→ 2citohrom a3 (Fe3+) + O2-
2) kao jedan elektron e- i jedan proton (H+), što odgovara atomu vodonika, H (vodonikov
atom se sastoji od 1 protona i 1 elektrona) ili kao 2e- i 2H+, što odgovara molekulskom
vodoniku.
Oksidovani i redukovani oblik nekog jedinjenja zajedno čini redoks par ili redoks-sistem.
Mera za tendenciju oksidovanog oblika redoks para da primi elektron i smanji svoj
oksidacioni broje naziva se standardni redoks potencijal, Eº. Što je viši standardni redoks
potencijal to je veća tendencija oksidovanog oblika redoks para da primi elektron i pređe u
svoj redukovani oblik i obrnuto.
10
Kada se dva redoks para nađu zajedno u rastvoru, tada prelazak elektrona sa redukovanog
oblika jednog redoks para na oksidovani oblik drugog redoks para može teći spontano.
Spontano teku one redoks reakcije kod kojih je oksidans oksidovani oblik redoks para čiji je
strandardni redoks potencijal viši, dok je reducens redukovani oblik redoks para čija je
vrednost standardnog redoks potencijala niža.
Primer:
Redoks par nikotinamid-adenin-dinukleotid (NAD+/NADH) ima negativniji potencijal od
redoks para flavin-adenin-dinukleotid (FAD/FADH2)
11
Ova vrednost predstavlja promenu redoks potencijala za oksido-redukcione reakcije pri pH 7.
kada su svi reaktanti prisutni u koncentracijama 1mol/dm3, odnosno kada se reakcija odvija u
standardnim uslovima. U biološkim sistemima, koncentracije reaktanata nisu u jediničnim
koncentracijama, pa ni promena redoks potencijala nije standaradna, već se izračunava
primenom Nerstove jednačine:
Kako je:
Ako uzmemo gornji primer redukcije FAD u prisustvu NADH, dobijamo da je ΔGº za ovu
redoks reakciju:
12
Visokoenergetska (makroergična) jedinjenja
Faza metabolizma u kojoj se organski molekuli bogati energijom (kao što su ugljeni hidrati,
proteini ili lipidi) transformišu u jednostavnije i manje proizvode (kao što su CO2, NH3 ili
mlečna kiselina) naziva se katabolizam. Kod kataboličkih procesa oslobađa se energija koja
se u ćeliji koristi za sintezu jedinjenja koja predstavljaju skladišta oslobođene energije (koja
se nazivaju visokoenergetska jedinjenja) i za regeneraciju nosača elektrona u metaboličkim
procesima (glavni predstavnici su NADH, NADPH i FADH2). Ostatak oslobođene energije
13
se gubi u vidu toplote. Nasuprot katabolizmu, faza metabolizma u kojoj dolazi do biosinteze,
odnosno nastajanja složenih biomolekula od malih molekula, naziva se anabolizam.
Anaboličke reakcije zahtevaju utrošak energije. U ćeliji potrebna energija za sintetičke
procese dobija se od makroergičnih jedinjenja uz korišćenje NADH, NADPH i FADH2 kao
redukcionih sredstava.
Mnoga visoko energetska jednjenja sadrže fosforil grupu (osim acetil-CoA) zbog čega se
nazivaju i viskoenergetski fosfati. Dele se u nekoliko grupa: pirofosfati, enolfosfati,
acilfosfati, guanidinfosfati i tioestri.
Pirofosfati
ATP je složen molekul kod koga je adenozin (nukleozid nastao povezivanjem adenina i riboze)
preko estarske veze povezan sa tri fosforil grupe. Međutim, veze između fosforil grupa su vrlo
nestabilne anhidridne veze. Glavni razlog njihove nestabilnosti je prisustvo jakog negativnog
naelektrisanja na kiseonikovim atomima sve tri fosforil grupe, zbog čega se ovi atomi
međusobno odbijaju. Hidrolizom jedne fosforil grupe dolazi do delimičnog smanjenja
repulzivnih sila u molekulu ATP-a, nastajanjem adenozindifosfat i fosfatnog anjon koji su bolje
14
stabilizovani (rezonancijom (Pi), jonizacijom (ADP) i hidratacijom) od ATP-a. Svi ovi faktori
omogućavaju da je promena hemijskog potencijala hidrolize ATP negativna sa dosta visokom
vrednošću od – 30.5 kJ/mol pod standardnim uslovima. Ipak, i ako je hidroliza ATP-a izrazito
egzergona, molekul ATP je stabilan u fiziološkim uslovima jer je energija aktivacije hidrolize
ATP-a visoka. Naime, molekul ATP nije sam već predstavlja koenzim koji je preko Mg2+ jona
povezan za proteinski deo enzima, čime je odbijanje kiseonikovih atoma delimično
neutralisano.
15
Molekula ADP takođe može da se hidrolizuje u AMP i Pi uz oslobađanje velike količine
energije (u standardnim uslovima -32.8kJ/mol). Hidroliza AMP u adenozin i fosfat, s
obzirom da se radi o estarskoj vezi koja nije opterećena prisustvom jakih repulzivnih sila
između kiseonikovih atoma kao što su anhidridne veze ADP-a ili ATP-a, oslobađa se duplo
manje energije nego pri hidrolizi ATP-a ili ADP-a (-14.2kJ/mol), zbog čega ovo jedinjenje ne
spada u visokoenergetska jedinjenja.
Pored ATP-a, ADP-a postoje i drugi nukleozid trifofati, kao što su: GTP (guanozintrifosfat),
CTP (citidintrifosfat) i UTP (uridintrifosfat) i dezoksinukleozid trifofati (dATP, dGTP, dTTP,
dCTP) koji su energetski ekvivalenti ATP-u.
16
NH2
O O O O N
O- P O P O P O CH 2
O- O- O-
O
Citidin-trifosfat (CTP)
OH OH
O
H N
O O O O N
O- P O P O P O CH2
O- O- O-
O
Uridin-trifosfat (UTP)
OH OH O
H N N
H2 N N N
O O O
-P O P O P O
O CH2
O- O- O-
O
Guanozin-trifosfat (GTP)
OH OH
Enolfosfati
Enolofosfati su jedinjenja kod kojih je fosforil gupa vezana za OH grupu C atom koji je sa
drugim C atomom povezan dvostukom vezom. Na primer, fosfoenolpiruvat je jedinjenje koje
ima ključnu ulogu u metabolizmu ugljenih hidrata. U svom molekulu sadrži fosfoestarsku
vezu čijim se cepanjem oslobađa velika količina energije. Velika količina energija koja se
oslobađa tokom hidrolize posledica je spontane tautomerizacije proizvoda, piruvata, što čini
proizvod hidrolize stabilnijim od reaktanta.
17
Acilfosfati su jedinjenja opšte strukture:
O O
R C O P OH
OH
Nastaju kada karboksilna grupa reaguje sa fosfatnom grupom. U ovu grupi jedinjenja spadaju
1,3-difosfoglicerat. Ovo jedinjenje kao i PEP ima važnu ulogu u metabolizmu ugljenih
hidrata. Kod 1,3-difosfoglicerata, proizvod hidrolize, 3-fosfoglicerat je stabilizovan najpre
jonizacijom, pa rezonancionim strukturama što ga čini stabilnijim od 1,3-difosfoglicerata.
Kod obe navedene reakcije oslobođeni fosfatni anjon je takođe stabilizovan rezonantnim
strukturama što dodatno doprinosi visokoj negativnoj vrednosti promene Gibsove slobodne
energije.
18
Nastaju kada guanidino grupa reaguje sa fosfatatnom grupom. Karakterističan predstavnik
ove grupe jedinjenja je fosfokreatin ili kreatinfosfat. Hidrolizom N-P veze dolazi do
oslobađanja kreatina koji je stabilizovan formiranjem rezonantnog hibrida. Drugi proizvod je
fosfatni anjon, takođe stabilizovan rezonantnim strukturama. (Ovo jedinjenje se najviše nalazi
u mišićim, gde se koristi za regeneraciju ATP-a, neophodnog pri mišićnoj kontrakciji).
Tioestri su jedinjenja kod kojih je uobičajen kiseonikov atom u estarskoj vezi zamenjen
atomom sumpora. Acetil-koenzim A (acetil-CoA) je jedan od tipičnih predstavnika tioestara
vrlo važnih za metabolizam ćelije. Tioestri su nestabilniji od estara sa kiseonikovim atomom
zbog smanjene rezonantne stabilizacije molekula, pa je hidrolizom ovih tioestarskih veza
promena gibsove slobodne energije veća nego kod hidrolize odgovarajućih “kiseoničnih”
estara.
19
Prema ovoj podeli, ATP sa ΔGº hidrolize od -30.5kJ/mol spada u visokoenergetska
jedinjanja, dok glukoza 6-fosfat spada u niskoenergetsko jedinjenje. Biohemičari su često
koristili izraz “makroergična veza” ili “visokoenergetska veza” da bi označili P-O vezu koja
se cepa tokom hidrolize odgovarajućeg jedinjanja. Međutim ovaj naziv nije sasvim korektan,
jer sugeriše da se radi o nekoj posebnoj kovaletnoj vezi koja sama po sebi poseduje energiju.
Cepanje svake kovalentne veze zahteva utrošak energije, pa samim tim i hidroliza P-O
kovaletne veze u visokoenergetskim jednjenjima. Oslobođena velika količina energije nakon
hidrolize ovih veza nije posledica specifične veze, već je rezultat velike razlike u vrednosti
Gibsove slobodne energije reaktanta i proizvoda. Proizvodi hidrolize poseduju nisku vrednost
Gibsove slobodne energije zbog jednog ili više sledećih razloga:
20
Prema tabeli prikazanoj malopre, evidentno je da se svako fosforilovano jedinjenje može
sintetisati ukoliko se reakcija njegovog nastajanja spregne sa reakcijom hidrolize drugog
fosforilovanog jedinjenja sa negativnijom vrednošću promene gibsove energije hidrolize. Na
primer, pošto se hidrolizom PEP oslobađa daleko više energije, nego što je potrebno za
sintezu ATP-a iz ADP-a i Pi, onda je transfer fosforil grupe sa PEP na ADP termodinamički
moguće:
Zahvaljujući srednjoj poziciji molekula ATP-a među jedinjenjima koja poseduju potencijal
prenosa grupa (vidi tabelu za ΔGº hidrolize fosforilovanih jedinjanja i tioestara), molekul
ATP može prenosti energiju sa visokoenergetskih jedinjanja koja su nastala tokom
katabolizma na niskoenergetska jedinjenja kao što je glukoza, prevodeći ih u mnogo
reaktivnija jedinjenja.
21
Osim toga, molekul ATP-a može prenositi, pored fosforil grupe (PO32-), pirofosforil grupu
(na pr. prilikom sinteze nukleotida) i adenilil grupu (na pr. prilikom oksidacije masnih
kiselina, sinteze lipida, aktiviranja aminokiselina kod biosinteze proteina). Na slici je
prikazan transfer svih pomenutih grupa na molekul nukleofila, u ovom slučaju alkohola.
22
transformacije supstrata. Postoji samo par biohemijskih procesa u kojima upotreba ATP-a
nije preko spregnutih reakcija, kao na primer prilikom kontrakcije mišića (molekul ATP-a se
direktno hidrolizuje kako bi se obezbedila potrebna energija) ili proizvodnje svetlosti kod
svitca.
23