Neri Magallanes Héctor Daniel 219290298

Diseño de oligos
Secuencias de DNA …..

a)  Sequence 1
ATGGAATCTATCCGTCTGTCCAACGCTGCAGGCACGATCTCGAATGACATCCTGGCCCAGGTCACTTTTG
CGAACGAAGCTATCTACCCTCTCTTAGAAAAGCGACGCGCCGAAATTGAAAATGTGACTCGCAAGACGTT
TCGGTACGGTGCTCTCCCCGGCAGCGAGATGGACGTTTACTACCCTTCTTCCACACCGTCCGGAAAGGCC
CCTGTCCTAGCTTTTGTCCACGGCGGAGCCT ATGTACACGGATCGAAAACCCACCCTCCTCCTGGTGACC
TGATCTACAAGAACGTCGGGGCATTCTACGCCTCACAAGGCTTCGTCACCGTCATACCCGACTACCGCAA
GCTCCCAGGCATGAAATGGCCCGACGCGCCTTCGGACATCGCCTCGGCCCTCACCTTCCTCGTCGCCCAC
TCCTCCGACGTGAACGCCTCAGCGCCCACAGCAGCCGACGTGCAAAACATCTTTCTCGTCGGACATTCAG
CGGGCGGGGCCATCGCATCCGACGTGCTTCTCGCACCGGGACTCCTCCCGGCGAACGTGCGGCGGAGTGT
ACGCGGGCTCATCGTCTTCGGGGGGATGATGCACTATCGCGGCCTCGAGTACCCTATCCCGCCGTTCGTG
CTGCCGGGATACTACGGCACAGACGAAGACGTGCGCGCACACGAACCGTTGGGGCTTCTCGAGTCCGCCT
CGGATGAGATCGTGCGTGGCCTCCCTGACGTGCTCATGGTCCTGAGCGAGCACGATGTCGCGGCAATGCG
CGCAGCTGTGACCGATTTTCGCTCTGCTCTCGCGGAGCGAACGGGCAAAGATGTGCCGCTCCTCGTAGCG
CAGGGACACAACCACATTAGCCCGCACTATGCGCTGTCTTCGGGCGAGGGCGAGGAGTGGGGACACGACG
TGATACGGTGGATGAGAGCAAAGTTGGCATCTGGCAATGGCGTACCAGCGACGGAATAG

Forward:5’ ATGTACACGGATCGAAAACCC 3’ 21 NT Y T°m: 62 C°

Reverse:5’ TTGCGGTAGTCGGGTATGACG 3’ 21 NT y T°m: 66°C

b) Sequence 2
atgactgaatataaacttgtggtagttggagctggtggcgtaggcaagagtgccttgacgatacagctaattcagaatcat
tttgtggacgaatatgatccaacaatagaggattcctacaggaagcaagtagtaattgatggagaaacctgtctcttggat
attctcgacacagcaggtcaagaggagtacagtgcaatgagggaccagtacatgaggactggggagggctttctttgtgta
tttgccataaataatactaaatcatttgaagatattcaccattatagagaacaaattaaaagagttaaggactctgaagat
gtacctatggtcctagtaggaaataaatgtgatttgccttctagaacagtagacacaaaacaggctcaggacttagcaaga
agttatggaattccttttattgaaacatcagcaaagacaagacagggtgttgatgatgccttctatacattagttcgagaa
attcgaaaacataaagaaaagatgagcaaagatggtaaaaagaagaaaaagaagtcaaagacaaagtgtgtaattatgtaa

Forward:5’ ataaacttgtggtagttggagc 3’ 22 NT Y T°m: 62 C°

Reverse:5’ atccaagagacaggtttctcc 3’ 21 NT y T°m: 62 C°

c) Sequence3
AAATGGTTCTTGGAAAAACTGGCTGGGTAAGTTTGGGTCCGTATGCTCGTGAAGCAGCTCATGGAAACAA
TGACACGTGAGTTTCCTTCGACCGGGTAGGTAACCCATTCCCATACTGCTCAGCTCATGGTTTAATCTGC
CGCCCTGCCCTTCCTGCCTGTGCGTGCACAATGCGACATTATATGACTGCCTCGGGGAAACTTGTTCTCG
TTTCTCCGATATCGCGTCTTAGACGAAACCACAAGCGTGATTTGCGTCTAGGCGTCGAAAGATGGACCCG
ATGTTTGACCGAGCTGCGAATGTGCTGGGTATACCCTTTTCTCCGCATCCCATCAGGTTCTGGGTGTATA
ATTCGGATGAATCGAAGTCCTGTGATCAGGGCAGGAAGTTAGGCCAATACTTGGGGCTCCAGCACCGATG
ACTTTCCGGCTCCCTTGACGGATTTTCACCGGAGACTTCACAGCTGAATCCTTGTGACCTCTATGCAACT
CGTAGCTATAAAATGAACGGGAAGCTTTGGGAATGTCTCGGGGGTTCTGCCATCCTTCTCTTGAACCAAT
GTTCAAATTCGCTGCTCTACTAGCTTTGGCTTCGCTCGTCCCAGGCTTTGTCCAGGCTCAGTCACCTGTA
TGGGGTCAATGCGGTGGTAATGGCTGGAGTAAGTGGTGACACAGGAAGGGAATTTATCTCACCTGTGTTT
CATATGATAGCTGGCCCGACAACCTGCGCTTCGGGCTCAACCTGCGTGAAGCAGAATGATTTCTATTCTC
AGTGCCTGTACGTATATACTTTATGTCGAAGCAACCACAGAGATCAAACAAAACGTAGTCCCAACAATCA
AGCTCCTCCTTCCACAACTACACAGCCTGGCACCACACCCCCCGCCACCACCACTTCCGGCGGCACAGGG
CCTACTTCAGGTGCTGGAAACCCTTATACCGGTAAAACGGTACTGGATTACTTGTCACCTCTTTGCCAAC
ATTTTCATCTTTCTAACAGGTCTGGCTGTCACCGTTCTATGCCGACGAGGTCGCGCAAGCGGCCGCTGAT
ATATCCAATCCTAGTTTGGCAACCAAGGCTGCTTCGGTTGCTAAAATCCCTACCTTCGTTTGGTTTGATA
CGGTTGCCAAGGTTCCCGACCTCGGTGGCTACCTTGCCGATGCCCGGTCCAAGAACCAGCTCGTTCAAAT
TGTTGTCTACGATCTGCCCGACCGTGACTGCGCCGCCCTCGCCTCTAACGGAGAGTTCTCTCTCGCCAAT
GATGGCCTCAACAAGTATAAGAACTATGTTGACCAGATTGCGGCCCAGATTAAGCGTACGGTTTCTGCAT
TCCGTCATGTTTCCGAACGCTAACTTGGAATTTTCAGAGTTCCCTGACGTATCCGTCGTGGCTGTCATTG
AGCCTGACTCGCTCGCTAATTTGGTCACAAATTTGAACGTCCAAAAATGTGCTAACGCCCAAAGCGCTTA
CAAGGAGGGTGTCATTTACGCTGTCCAAAAACTTAACGCAGTTGGTGTTACCATGTACATCGATGCTGGC
CATGCTGGATGGTTGGGCTGGCCTGCTAATCTGTCCCCTGCCGCCCAACTCTTTGCCCAAATCTACAGAG
ACGCTGGCTCGCCCAGAAACCTTCGTGGTATCGCCACGAACGTTGCCAACTTCAACGCCCTTAGAGCTTC
CTCTCCCGATCCTATCACTCAGGGCAACAGTAATTATGACGAAATACACTACATTGAAGTCAGTTGCGGC
ATTTGCTATGATCACTGTTGTTGGGTGCTAATATCAATTACAGGCTCTTGCTCCCATGCTCAGTAATGCT
GGTTTCCCTGCTCACTTCATCGTCGACCAAGGTCGCTCGGGTGTTCAGAATATCAGAGACCAGTGGGGCG
ACTGGTGCAACGTCAAGGGTGCTGGCTTCGGTCAACGACCGACAACAAATACTGGCTCCTCGCTCATCGA
TGCTATTGTCTGGGTCAAGCCAGGTGGCGAATGCGACGGTACCTCAGACAATTCATCCCCTCGGTTCGAC
TCGCATTGCTCTCTTAGGTGAGTATATCACCTTCAATTTTTTGGGTCTATTGCTAACGAAACTTCGCAGC
GACGCTCATCAACCCGCTCCTGAGGCTGGTACCTGGTTCCAAGCTTACTTTGAGACCTTGGTTGCGAATG
CCAACCCTGCCCTTTAAAAGCTGATTAACTGCCTAGCATGTAGTTGTATTTATTATTTTGCAATACACTT
TTTGTGTCTCATGCCCTGGCTGATCATCGTAATCGTCCTCTGCAAGTGAAGAAACACATAAAGAGAGATG
AAAAACCGAAGGAGAGTACTACCCGTAAAGGTACACGCCACGGTTAAGTCTCGGACTAAACTAGGACTCA
TGATGGAGACAAGTAAATTATCCAATGGGGTGGATGTCGACCTTGTGGGCTGAGGACCTGAGGTGC

Forward:5’ ATTGCGGCCCAGATTAAGCG 3’ 20 NT Y T°m: 62 C°

Reverse:5’ ATTGTCTGAGGTACCGTCGC 3’ 20 NT y T°m: 62 C°

d)Sequence 4
ATGGCCCCGTGGATGCATCTCCTCACCGTGCTGGCCCTGCTGGCCCTCTGGGGACCCAACTCTGTTCAGGCCTATTCCAGC
CAGCACCTGTGCGGCTCCAACCTAGTGGAGGCACTGTACATGACATGTGGACGGAGTGGCTTCTATAGACCCCACGACCGC
CGAGAGCTGGAGGACCTCCAGGTGGAGCAGGCAGAACTGGGTCTGGAGGCAGGCGGCCTGCAGCCTTCGGCCCTGGAGATA
TTCTGCAGAAGCGCGGCATTGTGGATCAGTGCTGTAATAACATTTGCACATTTAACCAGCTGCAGAACTACTGCAATGTCC
CTTAG

Forward:5’ AACTCTGTTCAGGCCTATTCC 3’ 21 NT Y T°m: 64 C°

Reverse:5’ TTGCAGTAGTTCTGCAGCTGG 3’ 21 NT y T°m: 62 C°

e) Sequence 5
atgaattatttgataatgtttagtttggcacttctactcgtgataggtgtggagagtggacgtgatggttatattgtcgat
tccaagaactgtgtataccattgttatccaccatgcgacggtttatgtaagaaaaacggtgctaaaagtggctcttgcggt
tttttagttccatccggacttgcctgctggtgtaacgacttgcccgaaaacgtaccgattaaagatccgtcagatgattgt
cataagagataa

Forward:5’ ataggtgtggagagtggacg 3’ 20 NT Y T°m: 62 C°

Reverse:5’ tgacggatctttaatcggtacg3’ 22 NT y T°m: 64 C°

f) Sequence 6
AACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGATGAAGTCCCTTCGGGGATGGATTAGCGGCGGACGGGT
GAGTAACACGTGGGCAACCTGCCTCAAAGTGGGGGATAGCCCTCCGAAAGGAGGATTAATACCGCATAACATTAG
TTTTCCGCATGAAAAACTAATCAAAGGAGTAATCGCTTTGAGATGGGCCCGCGGTGCATTAGCTAGTTGGTGAGG
TAACAGCTCACCAAGGCCACGATGCATAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGAACTGAGACACGGTCC
AGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGGGTG
ATGAAGGTCTTCGGATTGTAAAACCCTGTCTTCTGGGACGATAATGACGGTACCAGAGGAGGAAGCCACGGCTAA
CTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCGAGCGTTGTCCGGATTTACTGGGCGTAAAGGATGCGTAGG
CGGGCATTTAAGTGAGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACTTGGGGGCTGCATTTGAAACTGGGTGCCTAGAGTGCA
GGAGAGGTAAGTGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATTAGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGAC
TTACTGGACTGTAACTGACGCTGAGGCATGAAAGCGTGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGC
CGTAAACGATGAATACTAGGTGTAGGAGGTATCGACCCCTTCTGTGCCGCAGTTAACACAATAAGTATTCCGCCT
GGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGCGGANATGTGGTTTAAT
TCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCTAGACTTGACATCCCCTGAATTACTCGTAACGGAGGAAGCCCTTCGGGGC
AGGGAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAAC
CCTTATCATTAGTTGCTACCATTAAGTTGAGCACTCTAATGAGACTGCCCGGGTTAACCGGGAGGAAGGTGGGGA
TGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTCTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGTGAGTACAGAGAGATGCAAGA
CCGCAAGGTGGAGCTAAACTCAAAAACTCATCCCAGTTCGGATTGTAGGCTGAAACTCGCCTACATGAAGCCGGA
GTTGCTAGTAATCGCGAATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCAT
GAGAGTTGGCAACACCCGAAGTCCGTGAGGTAACCGTAAGGAGCCAGCG

Forward:5’ AGTAACACGTGGGCAACCTGC 3’ 21 NT Y T°m: 66 C°

Reverse:5’ TAAATGCCCGCCTACGCATCC 3’ 21 NT y T°m: 66 C°

g) Sequence 7

atggcaacgcagtttggcaaaatctacaatggaacacaaaaaacatgtgttcttcccaat
gtttcaaaaacccagaatcccaaacatgttccttttgtttcattcaaatcaaatctcaat
ggaaagacaagttcttggggtttggttgtgaagaacaatgggaaatttggttcaataaag
gttcggtctttgaaggtttctgcttcaacagcaacagctgagaaaccatctagagcttca
gagattgtgcttcaaccaattaatgaaatttcgggtactgttaagttacctgggtctaaa
tcattgtctaatcggatcctgctcttagctgctttatctgagggaactactgtggttgaa
aatttgttgaacagtgatgatgttcatcacatgcttgttgctttgggtaaacttggtctg
tatgtgaaacatgacagtgaaaagaaacaagccattgttgaaggttgtggtggtcagttt
ccagtcggaaaaggtgaaggtcaagaaatcgagcttttccttgggaatgctggaaccgca
atgcgaccacttactgccgctattacagccgccggtggcaattcgagctacgtacttgat
ggcgtaccccgaatgagagagaggccgatcggggacttagttaccggtcttaagcagctc
ggtgctgatgttgattgtactcttggcacgaattgtccccctgttcgtatagaaggaaag
ggtggtcttcccggtggaaaggtgaaactctctgggtctattagtagtcaatacttgaca
gctttactcatggcggctccgttggctcttggggatgtggaaattgagataattgataaa
cttatttccatcccatatgttgaaatgacaataaagttgatggaaaggtttggggtcact
gtggagcacacggatagctgggatcgattctttatccgaggaggtcaaaagtatatgtct
cccggaaatgcttacgttgaaggtgatgcttcgagtgccagttacttccttgcgggtgca
gcagtcacgggtgggactgtcacggtagaaggatgcggaacaagtagtttacagggtgat
gtaaaatttgccgaggttcttgagatgatgggtgctaaagtcacctggaccaagaatagt
gtaactgtcaccggacccccaagaaatccctcagggaggaaacacttgcgtgctattgat
gtcaacagtcgaagaagggccggatttttgcgtgatcacaccaccagagaaattaaacgt
gacagcaatcgatacttacgatga

Forward:5’ agctgagaaaccatctagagc 3’ 21 NT Y T°m: 62 C°

Reverse:5’ taagtatcgattgctgtcacg 3’ 22 NT y T°m: 64 C°