Bovine growth hormone gene, complete cds

GenBank: M57764.1

ORIGIN
1 gtactggggt gggttgcctt tctcttctcc aggggattta tctgacccag ggattgaacc
61 tgagtctcct gcatttgcag ctagattctt tacggctgag ccacctggga agcccattcg
121 cttctgctgc tgctgctgct gctaagttgc ttcagtcgtg tccgacctgt gcgacgccat
181 agacagcagc ccaccaggtc cccgtccctg ggattctcca ggcaagaaca ttggagtggg
241 ttgccatttc ctcctccaat gcatgaaagt gaaaagtgaa agtgaagtca ctcagttgtg
301 tccgaccctc agcgacccca tggactgcag ccttccagaa tggggtgcca ttgccttctc
361 ctcgcttctg ctacctcccc tttaaaaaga aaacctatgg ggtgggctct caagctgaga
421 ccctgtgtgc acagccctct ggctggtggc agtggagacg ggatgatgac aagcctgggg
481 gacatgaccc cagagaagga acgggaacag gatgagtgag aggaggttct aaattatcca
541 ttagcacagg ctgccagtgg tccttgcata aatgtataga gcacacaggt ggggggaaag
601 ggagagagag aagaagccag ggtataaaaa tggcccagca gggaccaatt ccaggatccc
661 aggacccagt tcaccagacg actcagggtc ctgtggacag ctcaccagct atgatggctg
721 caggtaagct cgctaaaatc ccctccattc gcgtgtccta aaggggtaat gcggggggcc
781 ctgccgatgg atgtgttcag agctttgggc tttagggctt ccgaatgtga acataggtat
841 ctacacccag acatttggcc aagtttgaaa tgttctcagt ccctggaggg aagggtaggt
901 ggggctggca ggagatcagg cgtctagctc cctggggccc tccgtcgcgg ccctcctggt
961 ctctccctag gcccccggac ctccctgctc ctggctttcg ccctgctctg cctgccctgg
1021 actcaggtgg tgggcgcctt cccagccatg tccttgtccg gcctgtttgc caacgctgtg
1081 ctccgggctc agcacctgca tcagctggct gctgacacct tcaaagagtt tgtaagctcc
1141 cgagggatgc gtcctagggg tggggaggca ggaaggggtg aatccacacc ccctccacac
1201 agtgggagga aactgaggag ttcagccgta ttttatccaa gtagggatgt ggttagggga
1261 gcagaaacgg gggtgtgtgg ggtggggagg gttccgaata aggcggggag gggaaccgcg
1321 caccagctta gacctgggtg ggtgtgttct tcccccagga gcgcacctac atcccggagg
1381 gacagagata ctccatccag aacacccagg ttgccttctg cttctctgaa accatcccgg
1441 cccccacggg caagaatgag gcccagcaga aatcagtgag tggcaacctc ggaccgagga
1501 gcaggggacc tccttcatcc taagtaggct gccccagctc ccgcaccggc ctggggcggc
1561 cttctccccg aggtggcgga ggttgttgga tggcagtgga ggatgatggt gggcggtggt
1621 ggcaggaggt cctcgggcag aggccgacct tgcagggctg ccccagaccc gcggcaccca
1681 ccgaccaccc acctgccagc aggacttgga gctgcttcgc atctcactgc tcctcatcca
1741 gtcgtggctt gggcccctgc agttcctcag cagagtcttc accaacagct tggtgtttgg
1801 cacctcggac cgtgtctatg agaagctgaa ggacctggag gaaggcatcc tggccctgat
1861 gcgggtgggg atggcgttgt gggtcccttc catgtggggg ccatgcccgc cctctcctgg
1921 cttagccagg agaatgcacg tgggcttggg gagacagatc cctgctctct ccctctttct
1981 agcagtccag ccttgaccca ggggaaacct tttccccttt tgaaacctcc ttcctcgccc
2041 ttctccaagc ctgtagggga gggtggaaaa tggagcgggc aggagggagc tgctcctgag
2101 ggcccttcgg cctctctgtc tctccctccc ttggcaggag ctggaagatg gcaccccccg
2161 ggctgggcag atcctcaagc agacctatga caaatttgac acaaacatgc gcagtgacga
2221 cgcgctgctc aagaactacg gtctgctctc ctgcttccgg aaggacctgc ataagacgga
2281 gacgtacctg agggtcatga agtgccgccg cttcggggag gccagctgtg ccttctagtt
2341 gccagccatc tgttgtttgc ccctcccccg tgccttcctt gaccctggaa ggtgccactc
2401 ccactgtcct ttcctaataa aatgaggaaa ttgcatcgca ttgtctgagt aggtgtcatt
2461 ctattctggg gggtggggtg gggcaggaca gcaaggggga ggattgggaa gacaatagca
2521 ggcatgctgg ggatgcggtg ggctctatgg gtacccaggt gctgaagaat tgacccggtt
2581 cctcctgggc cagaaagaag caggcacatc cccttctctg tgacacaccc tgtccacgcc
2641 cctggttctt agttccagcc ccactcatag gacactcata gctcaggagg gctccgcctt
2701 caatcccacc cgctaaagta cttggagcgg tctctccctc cctcatcagc ccaccaaacc
2761 aaacctagcc tccaagagtg ggaagaaatt aaagcaagat aggctattaa gtgcagaggg
2821 agagaaaatg cctccaacat gtgaggaagt aatgag
GTACTGGGGT GGGTTGCCTT TCTCTTCTCC AGGGGATTTA TCTGACCCAG GGATTGAACC
TGAGTCTCCT GCATTTGCAG CTAGATTCTT TACGGCTGAG CCACCTGGGA AGCCCATTCG
CTTCTGCTGC TGCTGCTGCT GCTAAGTTGC TTCAGTCGTG TCCGACCTGT GCGACGCCAT
AGACAGCAGC CCACCAGGTC CCCGTCCCTG GGATTCTCCA GGCAAGAACA TTGGAGTGGG
TTGCCATTTC CTCCTCCAAT GCATGAAAGT GAAAAGTGAA AGTGAAGTCA CTCAGTTGTG
TCCGACCCTC AGCGACCCCA TGGACTGCAG CCTTCCAGAA TGGGGTGCCA TTGCCTTCTC
CTCGCTTCTG CTACCTCCCC TTTAAAAAGA AAACCTATGG GGTGGGCTCT CAAGCTGAGA
CCCTGTGTGC ACAGCCCTCT GGCTGGTGGC AGTGGAGACG GGATGATGAC AAGCCTGGGG
GACATGACCC CAGAGAAGGA ACGGGAACAG GATGAGTGAG AGGAGGTTCT AAATTATCCA
TTAGCACAGG CTGCCAGTGG TCCTTGCATA AATGTATAGA GCACACAGGT GGGGGGAAAG
GGAGAGAGAG AAGAAGCCAG GGTATAAAAA TGGCCCAGCA GGGACCAATT CCAGGATCCC
AGGACCCAGT TCACCAGACG ACTCAGGGTC CTGTGGACAG CTCACCAGCT ATGATGGCTG
CAGGTAAGCT CGCTAAAATC CCCTCCATTC GCGTGTCCTA AAGGGGTAAT GCGGGGGGCC
CTGCCGATGG ATGTGTTCAG AGCTTTGGGC TTTAGGGCTT CCGAATGTGA ACATAGGTAT
CTACACCCAG ACATTTGGCC AAGTTTGAAA TGTTCTCAGT CCCTGGAGGG AAGGGTAGGT
GGGGCTGGCA GGAGATCAGG CGTCTAGCTC CCTGGGGCCC TCCGTCGCGG CCCTCCTGGT
CTCTCCCTAG GCCCCCGGAC CTCCCTGCTC CTGGCTTTCG CCCTGCTCTG CCTGCCCTGG
ACTCAGGTGG TGGGCGCCTT CCCAGCCATG TCCTTGTCCG GCCTGTTTGC CAACGCTGTG
CTCCGGGCTC AGCACCTGCA TCAGCTGGCT GCTGACACCT TCAAAGAGTT TGTAAGCTCC
CGAGGGATGC GTCCTAGGGG TGGGGAGGCA GGAAGGGGTG AATCCACACC CCCTCCACAC
AGTGGGAGGA AACTGAGGAG TTCAGCCGTA TTTTATCCAA GTAGGGATGT GGTTAGGGGA
GCAGAAACGG GGGTGTGTGG GGTGGGGAGG GTTCCGAATA AGGCGGGGAG GGGAACCGCG
CACCAGCTTA GACCTGGGTG GGTGTGTTCT TCCCCCAGGA GCGCACCTAC ATCCCGGAGG
GACAGAGATA CTCCATCCAG AACACCCAGG TTGCCTTCTG CTTCTCTGAA ACCATCCCGG
CCCCCACGGG CAAGAATGAG GCCCAGCAGA AATCAGTGAG TGGCAACCTC GGACCGAGGA
GCAGGGGACC TCCTTCATCC TAAGTAGGCT GCCCCAGCTC CCGCACCGGC CTGGGGCGGC
CTTCTCCCCG AGGTGGCGGA GGTTGTTGGA TGGCAGTGGA GGATGATGGT GGGCGGTGGT
GGCAGGAGGT CCTCGGGCAG AGGCCGACCT TGCAGGGCTG CCCCAGACCC GCGGCACCCA
CCGACCACCC ACCTGCCAGC AGGACTTGGA GCTGCTTCGC ATCTCACTGC TCCTCATCCA
GTCGTGGCTT GGGCCCCTGC AGTTCCTCAG CAGAGTCTTC ACCAACAGCT TGGTGTTTGG
CACCTCGGAC CGTGTCTATG AGAAGCTGAA GGACCTGGAG GAAGGCATCC TGGCCCTGAT
GCGGGTGGGG ATGGCGTTGT GGGTCCCTTC CATGTGGGGG CCATGCCCGC CCTCTCCTGG
CTTAGCCAGG AGAATGCACG TGGGCTTGGG GAGACAGATC CCTGCTCTCT CCCTCTTTCT
AGCAGTCCAG CCTTGACCCA GGGGAAACCT TTTCCCCTTT TGAAACCTCC TTCCTCGCCC
TTCTCCAAGC CTGTAGGGGA GGGTGGAAAA TGGAGCGGGC AGGAGGGAGC TGCTCCTGAG
GGCCCTTCGG CCTCTCTGTC TCTCCCTCCC TTGGCAGGAG CTGGAAGATG GCACCCCCCG
GGCTGGGCAG ATCCTCAAGC AGACCTATGA CAAATTTGAC ACAAACATGC GCAGTGACGA
CGCGCTGCTC AAGAACTACG GTCTGCTCTC CTGCTTCCGG AAGGACCTGC ATAAGACGGA
GACGTACCTG AGGGTCATGA AGTGCCGCCG CTTCGGGGAG GCCAGCTGTG CCTTCTAGTT
GCCAGCCATC TGTTGTTTGC CCCTCCCCCG TGCCTTCCTT GACCCTGGAA GGTGCCACTC
CCACTGTCCT TTCCTAATAA AATGAGGAAA TTGCATCGCA TTGTCTGAGT AGGTGTCATT
CTATTCTGGG GGGTGGGGTG GGGCAGGACA GCAAGGGGGA GGATTGGGAA GACAATAGCA
GGCATGCTGG GGATGCGGTG GGCTCTATGG GTACCCAGGT GCTGAAGAAT TGACCCGGTT
CCTCCTGGGC CAGAAAGAAG CAGGCACATC CCCTTCTCTG TGACACACCC TGTCCACGCC
CCTGGTTCTT AGTTCCAGCC CCACTCATAG GACACTCATA GCTCAGGAGG GCTCCGCCTT
CAATCCCACC CGCTAAAGTA CTTGGAGCGG TCTCTCCCTC CCTCATCAGC CCACCAAACC
AAACCTAGCC TCCAAGAGTG GGAAGAAATT AAAGCAAGAT AGGCTATTAA GTGCAGAGGG
AGAGAAAATG CCTCCAACAT GTGAGGAAGT AATGAG

EXON=
5’UTR
TTCCAGGATC CCAGGACCCA GTTCACCAGA CGACTCAGGG TCCTGTGGAC AGCTCACCAG
CTATGATGGC TGCAGGCCCC CGGACCTCCC TGCTCCTGGC TTTCGCCCTG CTCTGCCTGC
CCTGGACTCA GGTGGTGGGC GCCTTCCCAG CCATGTCCTT GTCCGGCCTG TTTGCCAACG
CTGTGCTCCG GGCTCAGCAC CTGCATCAGC TGGCTGCTGA CACCTTCAAA GAGTTTGAGC
GCACCTACAT CCCGGAGGGA CAGAGATACT CCATCCAGAA CACCCAGGTT GCCTTCTGCT
TCTCTGAAAC CATCCCGGCC CCCACGGGCA AGAATGAGGC CCAGCAGAAA TCAGACTTGG
AGCTGCTTCG CATCTCACTG CTCCTCATCC AGTCGTGGCT TGGGCCCCTG CAGTTCCTCA
GCAGAGTCTT CACCAACAGC TTGGTGTTTG GCACCTCGGA CCGTGTCTAT GAGAAGCTGA
AGGACCTGGA GGAAGGCATC CTGGCCCTGA TGCGGGAGCT GGAAGATGGC ACCCCCCGGG
CTGGGCAGAT CCTCAAGCAG ACCTATGACA AATTTGACAC AAACATGCGC AGTGACGACG
CGCTGCTCAA GAACTACGGT CTGCTCTCCT GCTTCCGGAA GGACCTGCAT AAGACGGAGA
CGTACCTGAG GGTCATGAAG TGCCGCCGCT TCGGGGAGGC CAGCTGTGCC TTCTAGTTGC
CAGCCATCTG TTGTTTGCCC CTCCCCCGTG CCTTCCTTGA CCCTGGAAGG TGCCACTCCC
ACTGTCCTTT CCTAATAAAA TGAGGAAATT GCATCGC

ATG:Start codon
TAG:Stop codon
Aaa : CDS

INTRON=
CAGGTAAGCT CGCTAAAATC CCCTCCATTC GCGTGTCCTA AAGGGGTAAT GCGGGGGGCC
CTGCCGATGG ATGTGTTCAG AGCTTTGGGC TTTAGGGCTT CCGAATGTGA ACATAGGTAT
CTACACCCAG ACATTTGGCC AAGTTTGAAA TGTTCTCAGT CCCTGGAGGG AAGGGTAGGT
GGGGCTGGCA GGAGATCAGG CGTCTAGCTC CCTGGGGCCC TCCGTCGCGG CCCTCCTGGT
CTCTCCCTAG GTAAGCTCCC GAGGGATGCG TCCTAGGGGT GGGGAGGCAG GAAGGGGTGA
ATCCACACCC CCTCCACACA GTGGGAGGAA ACTGAGGAGT TCAGCCGTAT TTTATCCAAG
TAGGGATGTG GTTAGGGGAG CAGAAACGGG GGTGTGTGGG GTGGGGAGGG TTCCGAATAA
GGCGGGGAGG GGAACCGCGC ACCAGCTTAG ACCTGGGTGG GTGTGTTCTT CCCCCAGGTG
AGTGGCAACC TCGGACCGAG GAGCAGGGGA CCTCCTTCAT CCTAAGTAGG CTGCCCCAGC
TCCCGCACCG GCCTGGGGCG GCCTTCTCCC CGAGGTGGCG GAGGTTGTTG GATGGCAGTG
GAGGATGATG GTGGGCGGTG GTGGCAGGAG GTCCTCGGGC AGAGGCCGAC CTTGCAGGGC
TGCCCCAGAC CCGCGGCACC CACCGACCAC CCACCTGCCA GCAGGTGGGG ATGGCGTTGT
GGGTCCCTTC CATGTGGGGG CCATGCCCGC CCTCTCCTGG CTTAGCCAGG AGAATGCACG
TGGGCTTGGG GAGACAGATC CCTGCTCTCT CCCTCTTTCT AGCAGTCCAG CCTTGACCCA
GGGGAAACCT TTTCCCCTTT TGAAACCTCC TTCCTCGCCC TTCTCCAAGC CTGTAGGGGA
GGGTGGAAAA TGGAGCGGGC AGGAGGGAGC TGCTCCTGAG GGCCCTTCGG CCTCTCTGTC
TCTCCCTCCC TTGGCAG

EKSON + INTRON = 1.790

1. Carilah sekuen promotor dari M57764.1
613 663 1.00 GAAGCCAGGGTATAAAAATGGCCCAGCAGGGACCAATTCC AGGATCCCAG

Sebutkan situs yang digunakan

https://www.fruitfly.org/cgi-bin/seq_tools/promoter.pl

Apa ciri-ciri sekuen promotor

1. Tempat awal pelekatan enzim RNA polimerase
2. Memiliki sekuen consensus 5’-TATAAA-3’ dan berada pada posisi -75 pada banyak gen
tetapi juga ditemukan pada lokasi berbeda

2. Carilah sekuen Open Reading Frame

Sebutkan situs yang digunakan

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/

Apa ciri-ciri sekuen ORF

1. Kodon inisiasi (start codon) yaitu ATG pada DNA atau AUG pada mRNA
2. Terdapat serangkaian urutan basa nukleotida yang menyusun tiap ORF yang ditemukan
3. Kodon terminasi (stop codon) yaitu TAA, TAG, TGA pada DNA atau UAA, UAG,
UGA pada RNA.