QÜESTIONARI

Què és un ritme circadià?

És un programa biològic endògen que en condicions estables actua lliurement (per tant no
depèn de condicions externes) en un període d’aproximadament 24 hores i té
característiques com: el ritme està compensat per la temperatura, s’ajusta a un cicle
ambiental com pot ser el de llum/foscor i

Per quina raó es creia en un principi que els procariotes no podien tenir ritmes
circadians?

Perquè els seus ritmes de divisió eren menors a 24 hores en la majoria de procariotes i
llavors pensaven que no seria gaire efectiu.

De quina forma es va poder demostrar l'existència de un ritme circadià en

cianobacteris? Els articles ho expliquen però no entren en molts detalls. Si vols una
descripció a fons de l'enfoc experimental et recomano que consultis la referencia 4
(Kondo et al 1993 PNAS) de l'article nº 1. La pots trobar a la web del PNAS
(http://www.pnas.org/).

Un segment sense promotor dels gens estructurals de la luciferasa de Vibrio harveyi (luxAB)
es va introduir en un promotor del gen psbAI de Synechococcus sp. (que és un
cianobacteri). Aleshores es va recombinar al cromosoma de Synechococcus i es va
monitoritzar la bioluminiscència. El resultat va ser el que s’esperava dels ritmes circadians,
ja que coincidia amb totes les característiques d’aquests: persistència en condicions
constants, reseteig de fases segons les condicions de llum i foscor i una compensació de la
temperatura.

Quina utilitat pot tenir un rellotge circadià per a un cianobacteri?

Per temporitzar quan comencen i acaben alguns processos que poden ser incompatibles i
per tant inactivar els mecanismes d’un o l’altre depenent quin procés s’estigui duent a terme
per tal de maximitzar la seva productivitat.

Quines dues tasques metabòliques dels cianobacteris incompatibles entre elles són
separades en el temps gràcies al rellotge circadià?

La fotosíntesi i la fixació del nitrogen, perquè la nitrogenasa s’inactiva en presència d’oxigen.

De quina forma demostren els autors que l'existència d'un ritme circadià constitueix
un avantatge selectiu pels microorganismes que el tenen?

Tenen un grup de cianobacteris modificat que té un cicle de 22h aproximadament, un grup

de 25h aproximadament i finalment un de 30h aproximadament. Quan es posen els tres en
un cultiu han de competir i al fer-ho, depenen del temps que duri el seu cicle de llum i
foscor. En el cas de posar-los en un cicle de 22h, els cianobacteris del primer grup es
desenvolupen més que els altres, i en canvi, si fem que el cicle sigui de 30h, guanyen els
del tercer grup. Això ens indica que el fet de tenir un rellotge circadià d’un determinat temps
suposa un avantatge respecte els que tenen un rellotge circadià més allunyat del període
real de l’entorn.

Quina periodicitat té el rellotge circadià que s'ha descrit en cianobacteris?

Aproximadament 24 hores.

Posa exemples d'alguns processos fisiològics que estiguin sotmesos a regulació

circadiana.

Cicles de divisió cel·lular, fixació del nitrogen i consum d’aminoàcids.

Per què la caracterització molecular del rellotge circadià dels cianobacteris s'ha fet en
Synechococcus elongatus i no en altres especies de cianobacteris?

Perquè ja es coneixia molt el genoma d’aquesta espècie i hi havia eines per modificar-lo al
nostre gust i poder experimentar.

Quines són les principals proteïnes implicades en la regulació circadiana en

Synechococcus elongatus?

KaiA, KaiB, KaiC, CikA i SasA.

Aquestes tipus de proteïnes, són úniques de Synechococcus elongatus o es troben

també en altres microorganismes?

Es troben també en altres cianobacteris, no només a S. elongatus.

Quina estructura multimèrica participa en el procés? Per quina proteïna està

formada?
El periodosoma format per les proteïnes KaiA, KaiB, KaiC i SasA.

En diferents parts dels articles es fa referència a proteina kinases d'histidina

(histidine protein kinases ó HPKs). Hauries de cercar informació en altres articles
(pots fer una cerca a PUBMED http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi) per
explicar què són i quina funció realitzen.

Són proteïnes transmembranals de la classe transferasa amb diverses funcions que tenen
una importància clau en els processos de transducció de senyal a través de la membrana.
La majoria tenen funció autokinasa, fosfotransferasa i fosfatasa.

Què és el "periodosoma"? Per què creus que els autors utilitzen aquest terme?

És el conjunt de proteïnes que duen a terme la funció del cicle circadià que es pot imaginar
com si fos un orgànul que s’encarrega dels períodes, d’aquí ve el nom de periodosoma.

En un dels treballs, els autors parlen del del rellotge circadià com una "caixa negra"
de la qual estan intentant descobrir el funcionament. Descriu de forma breu quin és
pels autors de l’article l’estat dels coneixements sobre aquesta caixa negra.

Diu que ja no és negra sinó que està plena de bioluminescència i que és atractiva, tot i que
esbrinar quins són els components d’aquest rellotge circadià i col·locar-los en ordre no és
una tasca fàcil