Professional Documents
Culture Documents
נושא 7 - ציטוקינים
נושא 7 - ציטוקינים
Cytokines: Introduction
תא מציג אנטיגן ותא שרואה אותו מאפשר תקשורת ביניהם:
זה ביצה-ותרנגולת
כשיש אינטרקציה שגורמת להפרשת ציטוקינים -קשירת ציטוקינים משפעלים את התא -כלומר זה אחד מוביל לשני..
אם נקשרים לרצפטור בתא שהפריש אותם זה אוטו-קריני ואם אחר משהו??
שוני מהורמונים
לציטוקינים זמן מחצית חיים קצר הרבה יותר משל הורמונים -בקרת פעילות
אפשרות ב'
ציטוין יקשר לרצפטור -יעבור אינטרליזציה עם הרצפטור לתוך התא -יתפרקו ,רצפטור יעבור דגרדציה וציטוקין יעביר
סיגנל בתוך התא
בד"כ ציטוקין שנקשר לרצטור ולא מסגנל זה די-קוי רצפטור -כזה שנועד לאסוף עודפים (לא רצפטור אמיתי)
כנ"ל כימו-קיניים?
עובד בד"כ ע"י פוספורילציה (זרחון) -לרצפטור (=קולטן) יש קצה מזרחן תוך תאי
התא יורד מרמת הפעילות כי יהיו בו פחות רצפטורים (תופעה מרכזית ברגולציית פעילות חיסונית)
אם יש ( 2שזה יותר מ 1-שהוא מסכן לבד ולא מספיק) -זה גורם להם לצימוד
כאשר יש צימוד של 2שרשראות יש זרחון בחלק תוך תאי של הרצפטור (פוספורילציה)
אם יש 3שרשראות
שרשרת שלישית לרוב מייצבת את הקישור (נדבר על זה ?) -מגדילה אפיניות של ליגנד לרצפטור וזה נקשר טוב יותר
(איכותית)
המולק' שעוברת זרחון מתחברת לעוד מולק' מאותה קבוצה -נוצר דימר בתוך התא
הדימר יכול להפעיל מולק' אחרות או לנדוד לגרעין
בגרעין = פקטור שעתוק o
2מולק' סטאט מזורחנות נצמדות אחת לשניה -ואז מסוגלות לשפעל מולק' אחרות או לנדוד לגרעין
שאלה פילוסופית:
ברגע שהתא מקבל סיגנל לשפעול -הוא נכנס לדיליי של 24-48שעות בה הוא מסתנתז מספיק מולק' סטט לעבוד ברצף -ואז
הוא מתחיל לעבוד
MAPקינאזות
כאן הפקטור שנודד לגרעין הוא לא טרנסקריפשן פקטור -אלא נקשר לחלבון אחר שיודע להפעיל גנים כשמזרחנים אותו (הוא
הטרנסקריפשן פקטור)
גם כאן לא חוסכים כלום -הפעולה של הגנים איטית ותלויה בסינתזת פקטורים -שמתחילה באמת רק כשיש גירוי של
התא
מערכת גאק חייבת שיהיה זרחון חלק תוך תאי של רצפטור בקשירת ליגנד
מערכת מאפ קינאז לא חייבת את זה -צריך חלבון שיעבור אינטרליציה ופנים יקשר לפקטורים ויפעיל מערכות (מערכת
משלימה)
כשיש נניח סכנה -איפאפשר שתא דנדריטי שמקבל אותו תסכה במשך 12-24שעות רק יסנתז ואז יתחיל לפעול -לא היינו
שורדים -לא היה שיעור וכל הבקטריות במים היו מאושרות
- NFkB
בתא דנדריטי שנוצר -נוצר פקטור השעתוק NFkBבעודף עצום לפני שיש גירוי כלשהו
כשהתא מקבל גירוי מבחוץ -הגירוי מפעיל את מע' היוביקוויטין שהורסת את - i-NFkBכשהוא עובר דגרדציה הNFkB -
החופשי מהווה טרנסקריפשן פקטור לפעילות נגד מיקרובים (פקטור שעתוק שנכנס לגרעין ומפעיל גנים חיסוניים)
מי שפענח את הנושא לראשונה זה מייקל קרין -שניהם עם אותו שם משפחה ונולדו בת"א -אבל השני מוצלח יותר?
וירוס מחלת הנשיקה () -מתחמק ממע' החיסון כי מתערב במע' הסיגנלים הזו ומונע דגרדציה של i-NFkB
תכונות שנתי רוצה מציטוקינים
זה נכון לבערך 50מכל אחד -שיש להם רצפטורים שונים והביולוגיה שלהם מסובכת -כי מורכבת מתחרויות על קישורים
לרצפטורים -בהם יש מקרים שאותו ציטוקין נקשר לאותו רצפטור על תאים שונים ומעביר סיגנלים שונים
והם מתחרים -לפעמים ציטוקין אחד מפריע לציטוקין אחר -כי הוא נקשר לשרשרת משותפת
בגלל המורכבות הגדירו כמה הגדרות פשוןטות שאנחנו לצערנו צריכים להכיר..
- Pleotropismפלאו-טרופיזם
אותו ציטוקין יכול להיקשר לאותו רצפטור על תאים שונים ולהפעיל מערכות סיגנל שונות
מחקרית :היו לוקחים רצפטור של ציטוקין -מבטאים ביר בתאים סרטניים של שחלת האוגר (צאו סל) ועליהם לומדים,
מפרסמים מאמר וסבבה
אבל אין קשר בין מה שהם עשו למציאות האמיתית -כי למה שתא סרטני של אוגר סיני יהיה עם אותו סיגנל של תא אימונולוגי
נתון?
- Redundancyעודפים
ברדנדסי יש הבדל בין להפריע למערכת בתהליך ביולוגי ולבין דפקט גנטי
- 2Iהוא הדלק של כל מערכת החיסון ( - ILאינטר-לוקין) -הכי חשוב מכולם -בעיקר תאי Tיוצרים אותו
אם ניקח אדם ונזריק לו נוגדנים ל - 2IL-כל מערכת החיסון שלו תפעל על הפנים..
** זה כול להיות תרופה שימושית בהשתלות לבוריד תגובה חיסונית עד שיקלט השתל
אבל אם ניקח עכבר ונעשה נוק-אאוט גהנטי ל - 2I-הא יתפקד רגיל לחלוטין
Synergy
- 9=2+2תוספת סינרגיטית
- 4=2+2תוספת אדפטיבית
//בד"כ בביולוגיה זה כך שאחד מרכזי ואחד מועט -וביחד שניהם מוגברים ונונים בומבה של תגובה
למה זה חשוב -כי יש תרופות ביולוגיות שמונעות - TNFלכן יהיה גם מחיר כי פחות פעילות של INF
Antagonism
הנחת עבודה שבכל קבוצה היה רצפטוק קדום באיזו נמטודבה או ווט אבר -שלאורך אבולוציה עבר הכפלות ומוטציות
והשתמרו התוצרים עד שהפכו לקבוצה -בעצם היה אבא משותף והם אחים
למה זה חשוב?
ביולוגיה חישובית -רצפטורים ידועים לנו ומנסים לנחש מה עוד קיים ולא גילינו..
קבוצה I
דמיון ברצף ח' אמינו ביניהם קרוב יותר מאחד לשני בינם לבין אחרים
שימור אזורים בעלי חשיבות בפעילות הביולוגית בכולם
לדוג' כמה רצפי -X( WSXWSמשתנה בין רצפטורים) שהם אזורים שמורים וקיימים רק בקבוצה I o
- IL 2,4,7,9,15יש לא רק דמיון קרוב ביניהם -אלא גם שרשר רצפטור משותפת וזהה לחלוטין -שרשרת גמא
שאם יש בעיה גנטית אין מע' חיסון כי כל ה 5-האלו יהיו דפוקים לגמרי..
קבוצה II
קבוצה IV
קבוצת רצפטורים שאין קשר ביניהם -אבל לכולם יש רצפים שדומים להבי-צ'יין של אימונו-גלובולין
קבוצה V
התגלו ע"י לבקוביץ' -שחקר משהו משהו שנלמד איפשהו בקורס אחר?
יש וירוסים (יותר נ )1-שמשתמשים ברצפטור וביכולת אינטרליזציה כדי לחדור לגוף שלנו
לא יודעים מי יותר חשוב משניהם -אבל מינחים שהחשוב מביניהם הוא 5CCR
ההוכחה לזה -חולה טימוטי בראון ווט אבר ..היה גם חולה איידס וגם לוקמיה
יש אנשים 2%מאוכ' העולם הכללי (וכ 10%מאוכ' דנמרק צפונה) שעמידים לחלוטין לאיידס -כי חסרים להם 32ח' אמינו ב-
- 5CCRדלתא 32כל מי שיש לו את המוטציה הזו עמיד לאיידס (וגם הם מפתחים פחות מחלות משו?)
אז טימוטי בראון היה לו לוקמיה ואיידס -נהשתילו לו מח עצם מאדם בריא עם דלתא 32טימוטי הבריא מ 2-המחלות -
קוללל!!
Cytokine Nomenclature
הגרה -פקטורים שמופרשים ממע' החיסון ופועלים על מע' החיסון להשפיע על ביולוגיה שלהם
אז גילו את 2ILואז את 1ILוהלאה ..יש כ 40-50-כאלו..
בהולנד התחליטו לתת שמות לפי סדר גילוי -יוצאי דופן זה 1ו 2-שהתגלו לפני ההחלטה
יש קבוצות אחרות שלא נקראו אינטרלוקינים בגלל פעילות ביולוגית שלהם ששונה
טומור נקרוזיס פקטור אלפא -גילו אותו בתאים סרטניים שעושה להם אפופטוזיס
כמוקיניים -מאוד דומים אחד לשני ובעלי מבנה שונה משאר ציטוקיניים
גילו אותם פעם ע"י תאים שעברו שפעול מחוץ לגוף ןבעזרת - HPLCמכשיר הפרדת חלבונים -בידדו חלבונים ובדקו אותם
בתרביות
מדענים לקחו את הציטוקינים הידועים -חילקו לתתי משפחות (לפי דמיון ביניהם) -ואז בנו אלוגריתם -הנחת עבודה
שכל תת משפחה של טייפ ן II ,וכו' מאב דקמון שעבר הכפלות והמחשב מחפש ציטוקינים תיאורטיים
עושים PCRורואים מי אמיתי באמת ממה שהמחשב מציע ע"י ניסיון להגביר גנים שהמחשב הציע
ככה גילו את ציטוקין 27ILואחריו התגלו עוד הרבה בשיטה הזו
הרצאה 28/11/21 - 8
הקדמה
לוקחים נוגדנים מתגובה חיסונית ראשונה ושלישית ועושים השוואה ביןניהם
עושים סיקוונס ורואים כמה מוטציות קורות בין חיסון לחיסון ביצירת אפיני מוטוריישן בחיסונים -מראה שאחרי 3-4חיסונים
כבר בקושי קורות מוטציות
חיסון שלישי כבר פחות דועך (בהנחה והוירוס לא עובר שינוי/מוטציה שגורמת לחיסון לא להיות אפקטיבי נגדו).
Cytokine Nomenclature
בתוך ציטוקינים -ועדה ב ?1979-שהחליטו לקרוא להם לפי סדר גילוי (חוץ מ 1-ו 2-שהוחלפו בסדר)
היו שהתנגדו לזה והגדירו כמה לפי אופי ביולוגי ולא בשיטה רצה:
- Interferonsמשפחה שונה ברצף החלבונים בא ,לא אותה קבוצה כמו השאר -ואלפא שונה מבטא שונה מגמא בתוכה
אינטרפרון אלפא ובטא מעלה MHCקלאס Iבתאים שנדבקו בוירוס (לא תורמים לקלאס )2
הוספה שלהם לתאי ג'ורקד? -זה הרג אותם -אפופטוזיס (בהתחלה קראו לו נקרוזיס פקטור אבל זה לא באמת נכון וזה
אופופטוזיס)
TNFבטא -
כציטוקין -מדכא פעילות עודפת של מע' החיסון -ציטוקין רגולטורי o
כהורמון -בשיקום פצעים נחשב ל( GH-פקטור גדילה) o
גדילת כלי דם שמאפשר יצירת עור חדש (דומה לגיו-גנזה)
הפרשת פיברין -חומר שיוצר את כיסוי העור שלא ימשיך להזדהם (ברמה נאותה זה טוב ובעודף זה גרוע)
פיברין -
למנשה יש דלקת ריאות חיידקית כרונית (חיידק יושב בריאות וטוב לו)
אחרי תקופה מע' החיסון מרימה ידיים -לא מצליח לנקות את החיידק
אפשרויות:
TGF-beta
מנשה יכול להמשיך לחיות ויופי-טופי -אבל לזכור שתמיד בריאה שלו יש צלקת ובה מאקרופאג'ים ובהם חיידקים חיים
כשהגוף ייחלש הצלקת יכולה להתפרק והחיידק יצא לחופשי ובאיזשהי נקודה בחיים זה יתקוף אותו ובאסה לו
בד"כ במחלות של השתלה לא מוצלחת -השתל תוקף את הגוף ונוצר פיברוזיס רב-מערכתי -זה מחלת סקלרו-דרמה ולא
הצליחו עם נוגדנים נגד זה..
השתל דוחה את הגוף -דחייה מאוד אלימה וזה מוביל לפיברוזיס
לקחו ציטוקינים מאדם (דוגמת דם) לתרבית תאים -גירו אותם להתחלק בתרבית מחוץ לגוף (הוספת BCGשגורם לתגובה
של מאקרופוג'ים)
מאקרופאגים יבלעו אותם ויציגו לתאי Tשיש בדם ויגרמו להם להתחלק o
תאי זיכרון בתרבית מתחילים להתחלק (תאי )T
** חצי מתאי Tבדם זה תאי זיכרון -חלקם הגדול נגד שחפת -כי יש חיידקים באוויר שמעוררים אותם (לא אלימים)
אם כן מסמנים את החלבון (כמו לדוג' פלואורצנסיה ,רדיו-אקטיב )..ומנסים לבודד את הרצפטור שלו בגוף
לקחו את כל 22בציטוקינים שהיו ידועים ובנו לוגריתם (נוסחאות מתמטיות) -הנחת עבודה שאותם 21-22ציטוקונים שהיו
מוכרים מורכבים ממשפחות שבכל אחת אב קדמון שיצר את "הבנים" שהם מוטציות שונות שלו
זו הנחה שידועה לרוב הגנים המוכרים בעולם -לדוג' המוגלובין זה כך -זה מוטציות של אב קדמון
אנילינג
לקחת את ה 3-שדומים אחד לשני -לשים אותם אחד מעל השני
חיפוש אזורים שמורים שדומים בכולם
בד"כ אזורים שמורים חשובים לפונקציה הביולוגית של תוצר הגן
דוגמה