Professional Documents
Culture Documents
ביולוגיה של התא - זרימת המידע בתא
ביולוגיה של התא - זרימת המידע בתא
ביולוגיה של התא - זרימת המידע בתא
הדנא ארוז בגרעין בתערובת של אאוכרומטין (מידע גנטי נגיש) והטרוכרומטין (אין מידע נגיש). ●
הדנא נמצא במספר מוגבל של עותקים בתא ,כך שמכל גן קיימים 2עותקים (כיוון שסליל הדנא הוא דו ●
גדילי).
כדי לשמור ולהגן על הדנא ,יש סינון לגישה למידע הגנטי -כך שנוצרים עותקים למקטעים ספציפים ,זה ●
הרנא.
כל מקטע רנא שמקודד מהדנא הוא גן .חשוב לציין שלא כל הגנים מקודדים לחלבונים. ●
גן -כל מקטע במולקולת הדנא שאפשר להעתיק לרנא. ●
האנזים שמעתיק את המקטעים החשובים מתוך הדנא החוצה ,הוא הרנא פולימראז .לפעולת ההעתקה ●
קוראים שעתוק\תעתוק.
מולקולת הרנא
מולקולת הרנא דומה מאוד למולקולת הדנא. ●
מורכבת מנוקלאוטידים בעלי ●
קבוצת סוכר -ריבוז (לעומת דיאוקסיריבוז שבדנא) ○
קבוצת פוספט ○
בסיס חנקני -כמו הבסיסים החנקיים של הדנא ,אבל במקום תימין ( )Tיש ○
בסיס יורסיל (.)U
הנוקלאוטידים של הרנא הם ריבונוקלאוטידים טרי פוספט. ●
רנא פולימראז
אנזים שיודע לקחת נוקלאוטידים ולחבר אותם יחד בקשרים פוספודיאסטרים. ●
תהליך השעתוק שמתבצע ע"י הרנא פולימראז ,מזכיר את תהליך השכפול ●
מולקולת הדנא היא התבנית. ○
התבנית נוצרת ע"י שבירת קשרי המימן בין גדילי הדנא ויצירת בועית שעתוק. ○
רנא פולימראז בונה בבועית השעתוק ע"ב אחד מגדילי הדנא גדיל משלים ע"ב נוקלאוטידים ○
ריבונוקלאוטידים (כאמור ,עם סוכר ריבוז) .rNTP -
לרנא פולימראז אין צורך בפיימר ,הוא יכול להתחיל מנוקלאוטיד חופשי. ●
בכל מקום בדנא שמופיע , Tנקבל בתוצר המתועתק (הרנא) .U ●
האנזים מאריך את קצה '3של הרנא. ●
הרנא פולימראז משכפל רק מקטעים מוגדים וקצרים ממולקולת הדנא. ●
רנא פולימראז צריך הגדרות ברורות לאיפה להתחיל ולסיים את השעתוק ,והמידע נמצא במולקולת הדנא. ●
בתאים שונים ובמצבים שונים הוא "יבחר" לשעתק גן מסוים ולא גן אחר ,בהתאם לנגישות של הגן (אם הוא ●
אאוכרומטין או הטרוכרומטין) ,ולאחר תהליך שמביא את הרנ"א פולימראז לתחילת אתר השעתוק .לכן
התאים שלנו שונים זה מזה ,למרות שבכל אחד מהם יש את אותו מידע גנטי.
תהליך השעתוק מחולק לשלושה שלבים עקריים - ●
התחלה -כיוון הרנא פולימראז לבועית השעתוק שקרובה לנקודה שבה הוא יצטרך להתחיל את ○
התעתוק.
אלוגציה -חיבור ריבונוקלאוטידים על סמך תבנית ○
טרמינציה -שלב הסיום ,הגדרת מיקום סיום השעתוק. ○
מיכל פרידמן
.1בתהליך שכפול החומר תהליך שכפול החומר התורשתי איפה נפגוש אותו
התורשתי כפרימאז (ע"מ בחלוקת התא
ליצור פרימר לדנא
פולימראז)
.2בתהליך שעתוק
יצירת קשרים פוספודיאסטרים בין יצירת קשרים פוספודיאסטרים בין פעולה עקרית
נוקלאוטידים נוקלאוטידים
לא צריך פריימר ,יכול להתחיל את חייב פריימר ע"מ לשכפל את הגדיל פריימר
השעתוק מנוקלאוטיד חופשי
טאטא בוקס -רצף ספציפי של רצף שמושך לעברו פקטורי שעתוק כללים. ●
כל הפונקציות האלו חשובות כדי שיהיה סינון בגנים שיבואו לידי ביטוי. ●
הנגישות של האאוכרומטין בשילוב עם פקטור שעתוק ספציפי שנמצא בגרעין ויכול להקשר לפרומוטור הם ●
אלו שיקבעו את הביטוי של גן ספציפי.
לכל גן יש פרומוטור ,ולכל פרומוטור יש פקטורי שעתוק ספציפים. ●
יש מספר גנים שמזוהים ע"י אותו פקטור שעתוק ספציפי. ○
שלב ההתחלה-
השלב הראשון בתהליך השעתוק הוא פרימה מקומית של הדנא כדי להגיע ●
למידע הרצוי.
בתהליך זה שרשרת הנוקלאוזומים נפרמת ואזור הליקנר גדל. ○
התהליך דורש אנרגייה ,והוא נעשה ע"י כרומטין רימודלינג קומפלקס. ○
לאחר יצירת הגישה במולקלת הדנא ,נגלה הפרוטומור שנמצא קצת לפני ●
הנקודה ממנה מתחילים לשעתק את הגן.
בשלב הבא ,נוצרת בועית באותו אזור שצריך לשעתק ,ומגיעים אלמנטים ●
שמכינים את הקרקע לשעתוק.
החלבונים שנקשרים בצורה ישירה לפרומוטור הם פקטורי השעתוק הספציפים, ●
שמשמשים כמגנט לפקטורי השעתוק הכללים.
פקטורי השעתוק הכללים מתמקמים על הפרומוטור ,פורמים את קשרי ○
המימן בדנא ,מייצבים אותו בצורה החד גדילית ומביאים את הרנא
פולימראז.
חלק מפקטורי השעתוק הם אליקזות ,חלבוני קישור דנא שיוצרים בועיות. ●
בשלב זה יוגדר איזה משני הגדילים יהיה התבנית ע"י פקטורי השעתוק הספציפים ●
הפרומוטור הוא רצף עם כיווניות .כשפקטור השעתוק נקשר לפרומוטור ,הוא נקשר עם כיווניות ○
מסויימת בהתאם לרצף; כלומר הפקטור ייקשר רק לכיוון אחר ולא לאחר.
זה מה שמכתיב לרנא פולימראז באיזה גדיל להשתמש כתבנית. ○
כל פרומוטור מכווין לשעתוק של גן מסוים אחד בלבד. ○
הרנא פולימראז בונה את המולקולה מקצה '5לקצה '3ע"י חיבור נוקלאוטידים בקשרים פוספודיאסטרים ●
(מאריך את קצה .)'3
הגדיל שמשמש כתבנית הוא זה שעליו נבנית מולקולת הרנא ,והגדיל השני נקרא הגדיל המקודד - ●
המולקולה של רנ"א שתצא בסוף ,תכיל את אותו מידע גנטי כמוהו.
שלב האלוגציה-
הרנא מתקדם עם הבועית ומשעתק. ●
הרנא פולימראז קולט נוקלאוטידים ריבונוקלאוטידים ומתאים אותם לתבנית ●
ההפוכה מזו של הגדיל אותו הוא מעתיק.
הרנא פולימראז מחבר את הריבונוקלאוטידים בקשרים פוספודיאסטרים לקצה ●
'3של המולקולה.
נקודת התחלת השעתוק נקבעת ע"י הפרומוטור והרצפים הנלווים אליו ,ויש לו ●
נקודת סיום שמגדירה את סיום השעתוק.
נקודות אלו קבועות עבור כל גן -כל פעם שהגן ישועתק הוא יתחיל ויסתיים באותה נקודה. ○
מיכל פרידמן
ממולקולת הרנא שנוצרה אפשר לקודד לחלבונים או לדברים אחרים ,לדוגמא למולקולת דנא שהופכת ●
לתבנית בעצמה.
רצף הסיום של השעתוק מורה לרנא פולימראז להפסיק לשעתק מספר בסיסים אחריו ,והוא נקרא ●
"cleavage and poly A signal".
קיימים 3רנא פולימראז בתא אאוקריוטי אנימלי ●
רנא פולימראז - 2האנזים שמשעתק את כל מולקולות הדנא שמקודדות לחלבונים .משעתק גם ○
גנים שלא מקודדים לחלבונים.
רנא פולימראז - 3 ,1משעתקים גנים שלא מקודדים לחלבונים. ○
גם פה ,החלבונים "קופצים" על הרנא מהזנב ועוצרים את תהליך השעתוק. ●
תפקיד החלבונים הוא ביקוע קשר פוספודיראסטרי ברנא וקיום תהליך הפוליאטינצליה ●
בהתאמה.
שבירת הקשר הפוספודיאסטרי תהיה קצת לאחר ה ,cleavage and poly A signalוזו ●
תהיה נקודת הסיום של התעתיק.
נוצרו 2קטעים -רצף הדנא מקצה '5עד לרצף המבוקע ○
רנא שהמשיך להווצר ע"י רנא פולימראז שהמשיך הלאה מכוח האינרציה עד ○
שנופל ומפסיק את תהליך השעתוק.
משערים שהקצה שנוצר בשבר של המולקולה ,שהוא ,"5לא מוגן ■
ב cap-ולכן אקסונוקלאזות מפרקות מהר את המולקולה ומנתקות את
הפולימראז.
עוד השערה היא מכנית יותר ,וטוענת שעם החיתוך הרנ"א ■
פולימראז מאבד שיווי משקל ונופל ממולקולת ה.DNA-
לאחר ביקוע הרנא ושחרור מולקולת הרנא מהרנא פולימראז ,נוצר קצה '3חופשי ●
שחשוף לעיכול של ריבונוקלאזות.
כדי להגן על הרנא מהן ,מתווסף חלבון שלישי בשם פולי איי פולימראז (סוג של ●
רנא פולימראז) בעל סוכר ריבוז.
הפוליאיי פולימראז מוסיף לקצה '3נוקלאוטידים מסוג .A ●
הוא מסוגל לעשות זאת ללא תבנית ,והוא מוסיף לקצה המולקולה מאות ○
בסיסי .A
לזנב שנוצר קוראים זנב פולי Aשל המולקולה. ○
הזנב שנוצר מושך אליו חלבוני פולי אי ביו פרוטאינס ●
ייתרונות הזנב - ●
החלבונים שהצטרפו מגינים על הרנא מפני נוקלאזות ○
הוספת בסיסי Aמסמנים לנו את קצה המולקולה כקצה ולא כשבר. ○
החלבונים שנקשרים לקצה הפולי Aמהווים נקודת תקשורת לאתרים שונים בתא ,ויכולים לסייע ○
בתהליך הייצוא של מולקולת ה.mRNA
כל מולקולה ש RNA-פולימראז 2מייצר ,תהיה בעלת capו .A poly-הפולימראזות האחרות לא נושאות את ●
זנב הקומפלקסים הזה ,ולכן מולקולות RNAאחרות שהם מייצרים לא יוכלו להפוך לחלבונים.