Professional Documents
Culture Documents
8-Herencia Quantitativa 2023
8-Herencia Quantitativa 2023
Color de la Pell
Classes de característiques quantitatives: Quantitatives típiques
Exemples:
alçada en humans, proporció de color lila en flors, gamma de colors del pebrot
Exemples:
Nombre d’ous en la posta d’una gallina o descendents en la ventrada en ratolins
Els fenotips dels caràcters Merístics no varien de forma contínua, ja que es mesuren en
nombres naturals, però, tot i així, es consideren caràcters quantitatius perquè tenen
possibilitat de molts fenotips entre el valor més gran i el més petit, i patrons d’herència
semblants als anteriors, on pot haver influència de l’ambient sobre el fenotip de l’individu
Classes de característiques quantitatives: Llindar
Exemples: llavi leporí, alguns casos de bessonada
En els caràcters Llindar només hi trobarem 2 fenotips (característica present o absent). Se’ls
considera quantitatius, perquè també tenen un patró d’herència semblant als anteriors i
l’ambient pot incidir sobre el fenotip de l’individu. L’expressió de la característica depèn
d’una susceptibilitat de base (denominada propensió o risc) que varia de manera contínua.
Quan la susceptibilitat supera el valor llindar s’expressa la característica específica.
Llindar
Susceptibilitat
Herència Quantitativa
Conclusions
Conclusions
Línies consanguínies Dins d’una mateixa línia consanguínia, es
van triar llavors de cada extrem (per
intentar nous experiments de selecció).
Els descendents per autofecundació dels
individus nascuts de la llavor gran o de la
petita mantenien la distribució de mides
(mitjana i distribució de fenotips)
característica de la línia.
Dins una línia consanguínia NO hi havia
resposta a la selecció.
Tot i que els fenotips de les llavors dins
d’una línia fossin variables a l’encreuar-se
individus de la mateixa línia, presentaven
una mitjana (i distribució de fenotips)
constant al llarg de totes les generacions.
Fills de Pares Fills de Pares
d’un extrem = d’un extrem =
No hi havia varietat genètica dins les línies
Fills de Pares Fills de Pares de consanguínies: eren homozigòtiques
de l’altre extrem l’altre extrem
Johannsen va concloure encertadament que la variació fenotípica contínua dins d’una línia pura no té base
genètica sinó una base ambiental.
Experiment d’East amb Nicotiana longiflora (1916)
Les diferències en la mitjana de les 2 línies es genètica, però com que són línies homozigòtiques, dins de
cada línia a on tots els individus presentaran el mateix genotip, les variacions fenotípiques entre els individus
només poden ser causades per efectes ambientals (E).
E E
A la F1, les plantes presenten una corol·la de mida intermèdia a les línies parentals i una variància similar a
la dels progenitors.
Totes les plantes de la F1 presentaran el mateix genotip heterozigot!! (resultat esperat d’encreuar 2 línies
homozigòtiques).
La variació fenotípica de la F1 només pot ser causada per efectes ambientals (E)
Experiment d’East amb Nicotiana longiflora (1916)
Conclusions
(ara veurem només l’anàlisi lògica, l’estadística es veurà més endavant)
E E
G + E
A la F2 la mida mitjana es manté igual que la F1, però la variància s’amplia. Per què? A la F2 NO tots els
individus presenten el mateix genotip, ja que ara veiem la segregació dels al·lels de la F1 (si fos un locus
la F1 seria Aa i a la F2 esperaríem ¼ AA, ½ Aa i ¼ aa). Hi ha efectes genotípics (G).
I a la F2 hi ha efectes ambientals? Sí, però la variància més gran observada en relació a la F1 és el
resultat de la diversitat de genotips presents.
Es pot comprovar que els individus F2 tenen diferents genotips? Sí, analitzant la F3 dels individus F2...
Experiment d’East amb Nicotiana longiflora (1916)
Conclusions
(ara veurem només l’anàlisi lògica, l’estadística es veurà més endavant)
Nilsson-Ehle va estudiar el color del gra de blat que presenta una variació
contínua de tonalitats de més blanc a més porpra. Va realitzar diversos
experiments encreuant línies pures que tenien diferent color de la llavor.
Analitzarem l’encreuament de la línia productora de la llavor més blanca i la
productora de la porpra més fosca.
X
Gens i caràcters quantitatius:
Experiment de Nilsson-Ehle (1909)
P
... podríem pensar que es tracta d’un
A la F1, la tonalitat obtinguda va F1 locus amb 2 al·lels i amb herència
ser intermèdia a les Parentals ... intermèdia. Llavors, què esperaria
trobar a la F2?
En aquesta F2, 1/64 presentaven el fenotip extrem d’una de les línies Parentals (completament
blanc) i un altre 1/64 presentava el fenotip extrem de l’altra Parental (porpra fosc).
Aquests fenotips extrems estan relacionats amb un sol genotip (homozigot com un dels
Parentals o bé com l’altre).
1/16
Aquesta és la proporció de
l’experiment de Nilsson-Ehle, per tant
les diferències entre les dues 1/64
varietats de l’experiment estan
controlades per tres loci (A, B i C)
On “n” és el nombre de
loci implicats en la 1/1024
determinació del caràcter
Aquesta manera d’estimar els loci implica que TOTS ELS AL·LELS QUE AFECTEN EL
CARÀCTER TENEN ELS MATEIXOS EFECTES ADDITIUS I ELS LOCI NO ESTAN LLIGATS.
Gens i caràcters quantitatius:
Experiment de Nilsson-Ehle (1909)
Conclusions
3 loci controlen el caràcter: A, La línia blanca té 6 dosis
B i C. Els respectius al·lels A’, d’al·lels que no donen color, la
B’ i C’ no aporten dosi de línia porpra més fosca té 6
color, els al·lels A, B i C dosis d’al·lels que donen
aporten cadascun d’ells la pigment porpra. La F1 és un
mateixa dosi de pigment trihíbrid, amb només 3 dosis
porpra d’al·lels que aporten pigment
porpra (= fenotip intermedi)
Els individus de la F1
produeixen 8 tipus de
gàmetes resultat de la
segregació al·lèlica a 3 loci.
Aquests tipus gamètics tenen
0, 1, 2 o 3 dosis d’al·lels que
produeixen pigment porpra
A La F2 tenim individus on el
seu genotip té 0, 1, 2 ,3, 4, 5
o 6 dosis d’al·lels que aporten
pigment porpra. Això
produeix una gamma
cromàtica contínua del blanc
al porpra més fosc.
Els individus amb 1 dosi d’al·lel que aporta pigment porpra tenen el mateix fenotip independentment del
locus A, B o C on tenen la dosi. El mateix succeeix pels que tenen 2 dosis, el fenotip és el mateix tant si les
dues dosis es troben en el mateix locus (per exemple A’A’B’B’CC) com si tenen 2 loci amb una sola dosi
(per exemple A’A’B’BC’C). Raonaments semblants es poden fer pels de 3, 4 o 5 dosi. Només estem segurs
del genotip dels extrems: triple homozigot blanc, triple homozigot porpra.
Gens i caràcters quantitatius:
Atenció: els caràcters quantitatius tenen una herència poligènica i els fenotips
d’aquests caràcters poden estar influenciats per factors ambientals. Però en aquests
caràcters també és possible veure substancials salts fenotípics produïts per un únic
locus (aquest locus sovint s’anomena gen major).
Per exemple la diversitat fenotípica en l’alçada dels individus en una població resulta
de herència poligènica i factors ambientals. Però alguns individus són nans, com a
resultat de canvis gènics en un únic gen, com per exemple el de l’acondroplàsia.
Mètodes Estadístics per analitzar
caràcters quantitatius:
Molts caràcters quantitatius mostren, per la distribució dels fenotips, una corba
simètrica en forma de campana característica de la distribució normal o gaussiana
Variància
Distribucions aporta informació sobre la variabilitat i grau de
dispersió de la distribució respecte de la seva mitjana
Nombre d’individus d’una
determinada classe fenotípica
Classes fenotípiques
Mitjana
aporta informació sobre el centre de la distribució de les classes fenotípiques, pel seu càlcul
es considera tant el valor de la classe com els individus de la classe.
Mètodes Estadístics per analitzar
caràcters quantitatius:
El fenotip d’un individu esta determinat pel seu genotip i l’ambient: P = G + E. Les diferències entre els
fenotips dels individus d’una població o variació fenotípica (VP) de la població està causada per factors
genètics i ambientals
0
VP = VG + VE + VGE
Variància Genètica: diferències entre els Variància Ambiental: diferències Variància de la interacció genotip-
genotips dels individus de la població pel entre els fenotips dels individus ambient: sorgeix quan l’efecte d’un gen
caràcter estudiat. causades per factors ambientals. depèn de l’ambient específic en el que
es troba. Les normes de reacció dels
diferents genotips no tenen patrons
semblants. Per simplificar es pot
considerar que és molt baixa:
VGE → 0. Però no sempre és veritat.
VP = VG + VE + VGE
La VG es pot subdividir en: VA + VD + VI
0 0
VP = VA + VD + VI + VE + VGE
Variància Variància Variància Variància Variància
Fenotípica Genètica Genètica Ambiental Interacció
Additiva No-additiva Genotip-Ambient
ATENCIÓ: en la simbologia dels components de variància s’ha fet servir l’anglesa: VP = Phenotypic variance; VG =
Genotypic variance; VA = Additive genètic variance; VD = Dominance genètic variance; VI = Interaction variance; VE
= Environmental variance; VGE = Genotype by environment Interaction variance.
En els llibre en castellà o català la simbologia pot ser diferent, particularment a: VF per referir-se a la Variància
fenotípica; VA per la Variància ambiental i VAD = Variància additiva. Si us plau manteniu durant el curs la
simbologia proposada pels professors.
Mètodes Estadístics per analitzar
caràcters quantitatius:
On es veuen aquestes components de variància fenotípica
I a la F1?
VE
Tampoc!!! Tots els individus
tindran el mateix genotip
heterozigot, per tant, la
VG + VE variació fenotípica observada
serà causada per VE.
I a la F2?
Continuarem tenint VE, però ara sí que tindrem VG, ja que tindrem genotips diferents.
Aquesta VG es pot subdividir en VA + VD + VI, però podem considerar que VI és sovint 0, i a més la F1 i la F2 tenen una
mitjana semblant al valor mig de les dues línies parentals pel que sembla que no hi ha efectes dominants (VD = 0) en
aquest cas.
Efectes additius i efectes dominants
La VA és el resultat dels efectes additius dels al·lels del loci i la VD la dels efectes dominants, però
què és l’efecte additiu i què l’efecte dominant?
L’efecte additiu és el valor fenotípic que es guanya o perd al canviar un al·lel per un altre diferent en un
dels loci que controlen el caràcter (queda consolidat, és heretable)
L’efecte dominant és quant desviat està el fenotip de l’individu heterozigot respecte del valor mig dels dos
homozigots (no queda consolidat, no és heretable)
Per exemple, suposem un locus amb dos al·lels a i A, on l’homozigot aa té el valor fenotípic baix i l’homozigot AA el valor
fenotípic alt (la terminologia a i A no indica dominància o recessivitat, sinó que informa sobre el valor fenotípic baix i alt),
poden posicionar els fenotips d’aquests genotips sobre el rang de valors fenotípics del caràcter
aa aA AA
Rang de valor dels fenotips
suposem una herència poligènica on els al·lels en majúscula de tots els loci tenen un efecte additiu igual
de +A (i els minúscula de –A). Quina relació hi ha entre els canvis genotípics i els fenotípics dels
individus?
aa +A Aa +A AA
Hauria guanyat +A +A = 2A
Efectes additius
suposem una herència poligènica on els al·lels en majúscula de tots els loci tenen un efecte additiu igual
de +A (i els minúscula de –A). Quina relació hi ha entre els canvis genotípics i els fenotípics dels
individus?
aa +A Aa +A AA
aabbcc
+
aabbCc Altres... Altres... AABbCC AABBCC
+A +A +A +A +A +A
AoBoC AoBoC AoBoC AoBoC AoBoC AoBoC
DOMINÀNCIA
Aa
La F1 té un
fenotip igual al F1
valor mig de les
2 varietats
Aa
SUPERDOMINÀNCIA
P x
aa AA
Fenotips Parentals x x+2+2
F1 Aa
Fenotips F1 i mitjana: Tots són heterozigots tenen un al·lel A, el seu fenotip és x+2 i la mitjana és x + 2
P x
aa AA
Fenotips Parentals x x+2+2
Aa Hi ha efecte dominant
F1 x+2+2
Mitjana F1: Tots són heterozigots tenen un al·lel A, el seu fenotip és x+2+2 i la mitjana és x + 4
En sentit ampli: És la proporció de la variància fenotípica total (VP) causada per la variància
genètica total (VG): H2 = VG/VP
En sentit estricte: És la proporció de la variància fenotípica total (VP) causada per només la
variància genètica additiva (VA): h2 = VA/VP
Limitacions de l’heretabilitat
L’heretabilitat és un valor
estadístic basat en les
variàncies genètiques i
fenotípiques detectades en un
grup d’individus (població). És
impossible calcular la d’un
individu
Limitacions de l’heretabilitat
Per una característica, NO existeix l’heretabilitat universal.
L’heretabilitat és un valor específic per a una població determinada
perquè la VG depèn de quins al·lels estan presents en aquella
població. A més, com que VE també intervé (forma part de VP), les
diferències ambientals també afecten els càlculs d’heretabilitat. És
important no extrapolar–la d’una població a una altra.
Experiments de selecció
Encreuament de línies pures
VE VE
VE
VP = VG + VE VA + VD + VE = VP
A partir de l’anàlisi lògica sobre les components genètiques i ambientals que causen la
variació fenotípica en un encreuament entre línies pures (semblant al d’East amb la flor de
Nicotiana) ...
... i sabent que la variació entre els fenotips en cada línia i generació la puc estimar com
la variància estadística del grup ( ), ens poden plantejar les següents equacions...
encreuaments de línies pures:
Causes de variació fenotípica
Però si fem els retroencreuaments (backcrossings) de la F1 amb la Línia 1 (BL1) i de la F1 amb la Linia
2 (BL2) obtindríem més equacions per calcular els diferents agents causals de la variància fenotípica
total del caràcter que es manifesta a la F2. Tindrem 6 equacions amb només 3 incògnites (VE, VA i VD).
Podrem saber VA i calcular h2
BL1 S2BL1 ½ VA + VD + VE
BL2 S2BL2 ½ VA + VD + VE
Exemple:
En un experiment, podem criar individus homozigots per un caràcter en un ambient
definit i mesurar la seva variància estadística entre els fenotips de la línia (S2) que és
una estimació de la VE. Després podem criar un grup d’individus variables des del punt
de vista genètic, sota les mateixes condicions ambientals que els anteriors (esperem
tenir la mateixa VE). En aquest grup heterogeni la variància estadística entre els
fenotips (S2) és una estimació de la VP del caràcter i és la suma de VG i VE. Podrem
calcular la VG per calcular la H2:
Si VP = VG + VE , la VG = VP - VE = 573-340 = 233
Els fills s’assemblen als pares perquè aquests els hi donen els al·lels del seu genotip. La
diversitat d’al·lels en un grup de pares és responsable de la diversitat genotípica (i fenotípica)
entre els seus fills. Hi ha una variació comuna (covariància) entre els dos grups. Les anàlisis
de la regressió estadística entre els valors de pares i fills permet estimar
l’heretabilitat en sentit estricte: h2 (VA/VP).
... al gràfic b) el coeficient de regressió és alt, l’heretabilitat és alta i els fenotips dels fills s’assemblen molt
al dels seus pares. Si tingués b=1=h2, la mitjana del fenotip de cada descendència serà igual a la dels seus
progenitors i, en aquest cas, totes les diferències fenotípiques del caràcter són causades només pels efectes
additius dels gens que determinen el caràcter.
Semblança entre parents:
comparació de la semblança fenotípica entre pares i fills
Coeficient de regressió
h2 = 0.98
La covariància estadistica (cov) dels valors entre grups de parents ens estima la VA
(excepte entre germans on també tenim VD). El coeficient de regressió (b) (quan un
grup de parents comparats és directament responsable dels al·lels que té l’altre grup) o
el coeficient de correlació (t) (quan els grups de parents comparats només deriven
d’ancestres comuns) ens estimen l’heretabilitat en sentit estricte del caràcter h2
Semblança entre parents:
Estudis de Bessons
𝑥̅
La resposta a la selecció (R) depèn de la VA
del caràcter a la població d’on van extreure
els pares, i es pot calcular com:
R = 𝑥̅ - 𝑥̅