B104

History
Of
Microbiology

Muntadhar Asaad
-The branch of biology which dealing with the study of micro organisms, or
microbes.
.‫هو فرع من علم االحياء يهتم بدراسة االحياء المجهرية و الميكروبات‬

-Microbes Are Diverse groups of minute, simple life forms that include Bacteria,
Archaea, Algae, Fungi, Protozoa, and Viruses.
‫الميكروبات هي مجاميع متنوعة من اشكال الحياة الدقيقة و البسيطة تشمل البكتريا و الطحالب و‬
.‫الفطريات و االوليات و الفايروسات‬

-The field is also concerned with the structure, function and classification of such
organisms and with ways of both exploiting and controlling their activities.
‫المجال ايضا يهتم في تركيب و وظائف و تصنيف الكائنات و مع طرق استغاللها و التحكم‬
.‫بنشاطها‬
-Microbes, or micro organisms are very small that are usually can not be seen with
the naked eye.
.‫الميكروبات صغيرة جدا و بالعادة ال يمكن رؤيتها بالعين المجردة‬

-Most of them are harmless (99%) or even helpful, but some are pathogenic (1%)
which can effect human, animals, plants and other micro organisms.
‫اغلبها غير مضر وقد تكون مفيدة و لكن بعضها ممرضة تؤثر على االنسان و الحيوان و النبات او‬
.‫على احياء مجهرية اخرى‬

-Germ : Refers to a rapidly growing cell.

.‫الجرثومة مصطلح الى الخلية التي تنمو بسرعة‬
-Decompose organic waste. (recycle nutrient)
.)‫تحليل المخلفات العضوية (اعادة تدوير المغذيات‬

-Producer in the ecosystem (Algae and some bacteria capture the energy from sun
light and convert it to food, forming the basis of food chain by photosynthesis ).
‫منتجة في النظام البيئي (الطحالب و بعض البكتريا تلتقط ضوء الشمس و تحوله الى غذاء لتشكل اساس‬
.)‫السلسلة الغذائية بالبناء الضوئي‬

-Food industry: Produce fermented foods such as vinegar, cheese, yogurt and bread.
.‫ انتاج االغذية المخمرة مثل الخل و الجبن و اللبن والخبز‬:‫الصناعات الغذائية‬

-Other Industries: Produce industrial chemicals such as ethyl alcohol and acetone.
.‫ انتاج مواد كيميائية صناعية مثل اثيل الكحول و االسيتون‬:‫صناعات اخرى‬
Nitrogen fixation: Some Bacteria can take the nitrogen from air and incorporate it
into soil. (NH4 / NO3)
.‫ بعض البكتريا تستطيع اخذ النيتروجين من الهواء و تثبيته في التربة‬:‫تثبيت النيتروجين‬

-Medicine and medical research: Many Antibiotic and other drugs are naturally
synthesized by microbes (penicillin made by molds).
.)‫ الكثير من المضادات الحيوية و ادوية اخرى تنتج طبيعيا من الميكروبات (البنسلين فطريات‬:‫الطب‬

-Digestion: Humans and animals are have micro organisms in their digestive tract
that are essential for digestion.
‫ االنسان و الحيوانات تحتوي على احياء مجهرية في اجهزتها الهضمية وهي اساسية في‬:‫الهضم‬
.‫الهضم‬
-Understand how they effect our lives and how we can exploit them.
.‫فهم كيفية تأثيريها على حياتنا و كيفية استغاللها‬

-Allows humans to prevent microbial disease and food spoilage.

.‫تسمح للبشر منع االمراض الميكروبية وتلف الغذاء‬

-Aseptic techniques to prevent contamination in medicine, food industry and in the

microbiology labs.
.‫تقنيات التعقيم لمنع تلوث االدوية و الصناعات الغذائية و مختبرات االحياء المجهرية‬
-The early Greeks believed that living things could originate from nonliving matter
[Biogenesis].
.)‫االغريق القدامى اعتقدوا ان الكائنات الحية تنشأ من مادة غير حية (التولد التلقائي‬

-Aristotle discarded this notion, but he still held that animals could arise
spontaneously from dissimilar organisms or from soil [spontaneous generation].
‫ لكنه ال يزال يعتقد أن الحيوانات يمكن أن تنشأ بشكل تلقائي من كائنات‬، ‫تجاهل أرسطو هذه الفكرة‬
)‫ (االجناس التلقائية‬.‫متباينة أو من التربة‬

-In 1665, Robert Hooke reported that living things were composed of little boxes or
cells using a microscope (Was the first to use a microscope to observe living things).
‫ أبلغ روبرت هوك أن الكائنات الحية كانت تتكون من مربعات صغيرة أو خاليا‬، 1665 ‫في عام‬
.)‫مستخدما ً المجهر (كان أول من استخدم المجهر لمراقبة الكائنات الحية‬
-Antoine Van Leeuwenhoek (1632-1723) (Dutch)
1. Microbiology essentially began with the development of the microscope.
Antoine Van Leeuwenhoek was one of the first people to observe micro organisms
using a microscope of his own design.
.‫علم األحياء الدقيقة بدأت أساسا مع تطور المجهر‬
.‫كان ليفانهوك من أوائل األشخاص الذين راقبوا الكائنات الدقيقة باستخدام مجهر من تصميمه الخاص‬

2. Described protozoa, basic types of bacteria, yeasts and algae.

.‫وصف االوليات و االنواع االساسية من االبكتريا و الخمائر و الطحالب‬

3. Observed and described live micro organisms in teeth scrapings, rain water,
peppercorn infusions and he called it Animalcules.
‫الحظ و وصف االحياء المجهرية في بقايا االسنان و ماء المطر ومستخلص الفلفل و سماها الحيوانات‬
.‫المجردة‬
-Francesco Redi (1626 – 1697) (Italian)
1. Performed an experiment to disprove spontaneous generation.
.‫اجرى تجربة لدحض نظرية االجناس التلقائية‬

2. He showed that the maggots would not arise from decaying meat, when it is
covered. (filled 2 Jars with decaying meat, sealed one and left the other open.
The result was only the open Jar developed maggots).
‫ (ملئ اناءان باللحم المتحلل اغلق‬.‫اظهر ان اليرقات ال تنشأ من تحلل اللحم عندما يكون مغطى‬
.)‫واحد و ترك االخر مفتوح النتيجة كانت فقط االناء المفتوح ظهرت به يرقات‬

3- Proved that the flies had to come in contact with the meat and lay their eggs
on it, maggots didn’t arise spontaneously.
.‫اثبت ان الذباب يأتي ويضع بيوضه على اللحم المتحلل اذن اليرقات لم تنشأ من تلقاء نفسها‬

-Rudolf Virchow (German) : presented biogenesis, living cells can arise only
from preexisting cells.
‫ الخاليا الحية تنشأ من خاليا سابقة فقط‬: ‫رودولف فيرجو قدم نظرية النشوء التلقائي‬
 :‫االجناس التلقائية‬
Spontaneous Generation: ‫الكائنات الحية تنشأ‬
Living organisms arise .‫من مادة غير حية‬
from non living matter.

Biogenesis:
:‫النشوء التلقائي‬
‫الكائنات الحية تنشأ‬ The living organisms
.‫من خاليا سابقة‬ arise from preexisting
life.
-Louis Pasteur (Father of Medical Bacteriology) (1861)
Demonstrated that micro organisms are present in the air.
.‫اثبت ان االحياء المجهرية موجودة في الهواء‬
-Pasture's S-shaped flask kept microbes out but let air in. These
experiments from the basis of aseptic technique.
‫( يسمح بدخول الهواء و لكن ال يسمح بدخول الميكروبات‬S) ‫الدورق ذو الشكل‬
‫و يعتبر من اساسيات تقنيات التعقيم‬

Nutrient broth placed in flask,

heated, not sealed Microbial Growth
‫مغذي سائل موضوع في دورق و مسخن و‬ ‫نمو ميكروبي‬
‫غير مغلق‬
Nutrient broth placed in flask,
heated, then sealed
No Microbial Growth
‫مغذي سائل موضوع في دورق و مسخن و‬
‫مغلق‬ ‫ال يوجد نمو ميكروبي‬
 (1857-1914)

-Beginning with Pasture's work and Discoveries included the relationship

between microbes and disease, immunity and antimicrobial drugs.
‫بداية من اعمال باستور واالكتشافات شملت العالقة بين الميكروبات واألمراض والمناعة‬
.‫والعقاقير المضادة للميكروبات‬

-Pasture showed that microbes are responsible for fermentation.

.‫اظهر باستور ان الميكروبات مسؤولة عن التخمر‬

-Fermentation: is the conversion of sugar to alcohol to make beer and wine.

.‫ هو عملية تحويل السكر الى كحول لصنع البيرة و النبيذ‬:‫التخمر‬

-Microbial growth is also responsible for spoilage of food.

.‫النمو الميكروبي ايضا مسؤؤول عن تلف الغذاء‬

-Bacteria spoil wine by turning it to vinegar (acetic acid).

.)‫البكتريا تتلف النبيذ بتحويله الى خل (حامض االستيك‬
-Pasteur demonstrated that spoilage bacteria could be killed by
heat (62.8 C)
That was not hot enough to evaporate the alcohol in wine.
)‫ مئوية‬62.8( ‫أثبت باستور أن بكتيريا التلف يمكن أن تقتل عن طريق الحرارة‬
.‫حارا بدرجة كافية لتبخر الكحول في النبيذ‬
ً ‫لم يكن ذلك‬

-Pasteurization : Application of a high heat for a short time

(30min) to kill the microbes.
‫ دقيقة) لقتل‬30( ‫ هي تطبيق حرارة عالية لفترة زمنية قصيرة‬: ‫البسترة‬
.‫الميكروبات‬
-He coined the term “Microbiology”.
.‫صاغ مصطلح االحياء المجهرية‬

-He disproved the spontaneous generation theory.

.‫دحض نظرية االجناس التلقائية‬

-He Demonstrated that anthrax was caused by bacteria.

.‫برهن ان مرض الجمرة الخبيثة سببه بكتريا‬

-He invented the process of pasteurization and fermentation.

.‫اخترع عملية البسترة و التخمير‬

-The development of effective vaccine (rabies and anthrax).

.‫تطوير لقاح فعّال لمرض داء الكلب و الجمرة الخبيثة‬

-Works along with subsequent observations by Lister, Koch and others

established the germ theory of disease.
‫ كوخ وغيرهم و انشأوا النظرية‬، ‫عمل جنبا إلى جنب مع المالحظات الالحقة من قبل ليستر‬
.‫الجرثومية للمرض‬
1835: Agostino Bassi Showed a silkworm disease caused by a fungus.
.‫اغوستينو باسي اظهر ان مرض دودة القز سببه فطر‬

1865: Pasteur Believed that another silkworm disease was caused by protozoan.
.‫باستور اعتقد ان هناك مرض اخر في دودة القز سببه كائن من االوليات‬

1840s: Ignaz Semmelwise Advocated washing hands to stop the spread of disease.
.‫ايغناز سيميلويس دعا لغسل اليدين أليقاف انتشار المرض‬

1860s: Joseph Lister used chemical disinfectant to prevent surgical wound

infections after looking at Pasteur’s work showing microbes are in the air.
‫جوزيف ليستر استخدم مطهرات كيميائية لحماية الجروح من العدوى بعد رؤيته لعمل باستور الذي‬
.‫يظهر ان هناك ميكروبات في الهواء‬

1876: Robert Koch provided proof that a bacterium causes anthrax and provided
the experimental steps.
.‫روبرت هوك قدم دليل على ان مرض الجمرة الخبيثة سببه بكتريا و قدم خطوات تجريبية‬
1892: Dmitri Iosifivich Ivanovski Discovered viruses.
.‫ديمتري يوسيفيتش ايفانوفيسكي اكتشف الفيروسات‬

1796: Edward Jenner Inoculated a person with cowpox

virus. The person was then protected from smallpox. The
protection called immunity.
‫ادوارد جنير لقح شخص بفيروس جدري البقر فتمت حمايته من مرض‬
.‫ الحماية هذه سميت المناعة‬.‫الجدري‬
-Produced from a virulent microbial strains.
.‫ينتج من السالالت الميكروبية السامة‬

-Produced from live viruses.

.‫ينتج من الفيروسات الحية‬

-Produced form viral particles

.‫ينتج من الجسيمات الفيروسية‬
‫‪-Chemotherapeutic agents used to treat infectious disease can be‬‬
‫‪synthetic drugs or antibiotics.‬‬
‫العوامل العالجية المستخدمة لعالج األمراض المعدية يمكن أن تكون عقاقير ‪-‬‬
‫صناعية أو مضادات حيوية‪.‬‬

‫‪-Antibiotics are chemicals produced by bacteria and fungi that inhibit‬‬

‫‪or kill other microbes.‬‬
‫المضادات الحيوية هي مواد كيميائية تنتجها البكتيريا والفطريات التي تمنع أو تقتل‬
‫الميكروبات األخرى‪.‬‬

‫‪-Quinine from tree bark was long used to treat malaria.‬‬

‫الكينين من لحاء الشجر كان يستخدم طويال في عالج المالريا‪.‬‬
1910: Paul Ehrlich developed a synthetic arsenic drugs,
salvarsan to treat syphilis.
‫ سلفارسان لعالج مرض‬، ‫طور بول إرليخ عقاقير الزرنيخ االصطناعية‬
.‫الزهري‬

1928: Alexander Fleming discovered the first antibiotic. He

observed that Penicillium fungus made an antibiotic, penicillin
that killed Staphylococcus aureus.
‫اكتشف الكسندر فليمنغ اول مضاد حيوي الحظ ان فطر البنسليوم ينتج‬
.‫البنسلين الذي يقتل البكتريا‬

1940s: Penicillin was tested clinically and mass produced.

.‫اختبر البنسلين سريريا و انتج بكمية كبيرة‬
 Classification
Muntadhar Asaad
-organizing, classifying and naming living things according to specific
criteria.
.‫تنظيم و تصنيف و تسمية الكائنات الحية وفق معايير محددة‬

-Consist of three part : Classification, Identification and nomenclature.

.‫ التماثل و التسمية‬، ‫ التصنيف‬: ‫يتألف من ثالث افرع‬

-Formal system originated by Carl Von Linne (1701-1778).

.‫نشأ النظام الرسمي بواسطة كارل فون لين‬
 Phylogenetic Phenetic
Groups reflect : Groups are based on:

Genetic Similarity and Convenient or Observable

Evolutionary relatedness. characteristics.

:‫المجاميع تعكس‬ :‫المجاميع تعتمد على‬

‫التشابه الجيني و العالقة‬ ‫التوافق او الصفات التي يمكن‬

‫التطورية‬ ‫مالحظتها‬

Modern Taxonomy based on genetic sequence information.

.‫التصنيف الحديث يعتمد على معلومات التسلسل الجيني‬
-Many similarities among living organisms:

1. Made up of cells surrounded by plasma membrane.

.‫تتكون من خاليا يحيط بها غشاء البالزما‬
2. Use ATP as energy source.
.‫ كمصدر للطاقة‬ATP ‫تستعمل‬
3. Store genetic information as DNA.
.DNA ‫تخزن المعلومات الجينية على هيئة‬
4. Ribosomes are the site of protein synthesis.
.‫الرايبوسومات هي موقع تخليق البروتين‬

-Both Differences and similarities among organisms are caused by

Natural Selection (Darwin 1858).
. )1858 ‫االختالفات و التشابهات بين الكائنات سببها االنتقاء الطبيعي (دارون‬
-Ancient Greeks Classified all living organisms into two groups:
1. Kingdom Plantae.
2. Kingdom Animalia.
.‫االغريق القدامى صنفوا جميع الكائنات في مجموعتين مملكة النبات و مملكة الحيوان‬

-In 1850s Bacteria and fungi were incorrectly placed in the Plant
Kingdom.
.‫في الخمسينات وضعت البكتيريا والفطريات بشكل غير صحيح في المملكة النباتية‬

-In 1960s Kingdom Protista was proposed to include bacteria, fungi,

algae and protozoa.
‫في الستينات تم اقتراح مملكة الطليعيات لتشمل البكتريا و الفطريات و الطحالب و‬
.‫االوليات‬

-In 1937 The term Prokaryote was introduced.

.‫ تم تقديم مصطلح بروكاريوت‬1937 ‫في عام‬

-In 1959 Kingdom Fungi was established.

.‫ تأسست المملكة الفطريات‬1959 ‫في عام‬
-In 1961 the current definition of the term Prokaryote was
established.
.‫ تم وضع التعريف الحالي لمصطلح بروكاريوت‬1961 ‫في عام‬

-In 1968 Kingdom Prokaryote was accepted by biologists.

.‫ تم قبول مملكة بروكاريوت من قبل علماء األحياء‬1968 ‫في عام‬

-In 1969 Robert Whitaker proposed a Five-Kingdom System Of

Biological Classification for all living organisms.
‫ اقترح روبرت ويتكر نظام التصنيف البيولوجي ذو الخمس‬، 1969 ‫في عام‬
.‫الممالك لجميع الكائنات الحية‬
1. Kingdom Prokaryote : Lack a nucleus and membrane bound organelles
.‫تفتقر الى النواة و الغشاء و العضيات‬

2. Kingdom Protista : Mostly unicellular, lack tissue organization. Most

have flagella during life.
.‫اغلبها احادية الخلية تفتقر للنسيج و اغلبها تحتوي على اسواط‬

3. Kingdom Fungi : Maybe Unicellular or Multicellular

.‫قد تكون احادية او متعددة الخاليا‬

4. Kingdom Plantae : Multicellular, Photosynthetic.

.‫متعددة الخاليا و ذاتية التغذية‬

5. Kingdom Animalia : Multicellular, Heterotrophs that ingest food

through a mouth or oval cavity.
.‫ غير ذاتي التغذية يتغذى على الطعام عن طريق الفم أو تجويف الفم‬، ‫متعدد الخاليا‬
 Differences Prokaryotes Eukaryotes
Cell Size
‫حجم الخلية‬
0.2-2 um 10-100 um

Nucleus
‫النواة‬
Absent Present

Membranous Organelles Absent Present

‫العضيات الغشائية‬
Cell Wall
Chemically Complex When present, Simple
‫جدار الخلية‬
Ribosome
‫الرايبوسومات‬
Smaller (70S) Larger (80S)

DNA
‫الحمض النووي‬
Single Circular Multiple Linear

Cell Division Binary Fission Mitosis or Meiosis

‫انقسام الخلية‬ ‫االنشطار الثنائي‬ ‫الخيطي و االختزالي‬
Respiration
‫التنفس‬
Plasma Membrane Mitochondria
There Are Three Domains Based on the following distinguishing
criteria:
-:‫يعتمد النظام على المعايير المميزة التالية‬

1. Cell wall composition.

.‫تكوين جدار الخلية‬
2. Membrane lipids.
.‫الدهون الغشائية‬
3. RNA sequence.
. RNA‫تسلسل الـ‬
4. Protein synthesis.
.‫تخليق البروتين‬
5. Antibiotic sensitivity.
.‫حساسية المضاد الحيوي‬
There are two types of prokaryotic cells based on differences in
their Ribosomes, Cell Walls and Metabolism.

1. Eubacteria “True Bacteria”

-Cell wall contains peptidoglycan.
.‫جدار الخلية يحتوي على ببتيدوكاليكان‬
-Sensitive to antibiotics.
.‫حساس للمضاد الحيوي‬

2. Archaea bacteria “Ancient Bacteria”

-Cell wall lack peptidoglycan.
.‫جدار الخلية ال يحتوي على ببتيدوكاليكان‬
-Resistant to antibiotics and live in Extreme environments.
.‫مقاومة للمضادات الحيوية و تعيش في بيئات قاسية‬
-Three kingdoms:
a. Methanogens
b. Extreme Halophiles
c. Thermoacidophiles
Binomial nomenclature: Each organism has two part name. Names are
either italicized or underlined.
.‫ االسماء العلمية يجب ان تكون بخط مائل او تحتها خط‬.‫كل كائن له جزءان في االسم‬

Genus name: Always capitalized, always a noun. May use initial.

.‫دائما ً احرف كبيرة دائما ً اسم يمكن اختصاره‬
Species name: Always lower case, usually an adjective.
.‫دائما احرف صغيرة احيانا صفات‬

Species : A specific or defined type of organism, defined by similarity with

known species.
.‫ محدد بالتشابه مع األنواع المعروفة‬، ‫نوع محدد من الكائنات الحية‬
Strain : Genetic Variation Within a species.
‫هو تباين وراثي داخل االنواع‬
Bacterial Species: Population of cells with similar characteristics.
.‫هي مجموعة من الخاليا تتشابه بالصفات‬

Bacterial Strain : A subgroup of bacterial species that has

distinguishing characteristics.
.‫مجموعة فرعية لنوع البكتريا التي لها صفات مميزة‬

Escherichia coli Strain that causes bloody diarrhea.

.‫تسبب االسهال الدموي‬