Tema 1

RELACIÓ ESTRUCTURA-FUNCIÓ
DE LES BIOMOLÈCULES
Glúcids i lípids: diversitat i distribució.

Estructura de les proteïnes. Dominis proteics.

Àcids Nucleics: DNA i RNA

Manteniment de la informació gènica: la replicació del DNA

Donat el caràcter i la finalitat exclusivament docent i eminentment il·lustrativa de

les explicacions a classe d'aquesta presentació, l’autor s’acull a l’article 32 de la
Llei de propietat intel·lectual vigent respecte de l'ús parcial d'obres alienes com ara
imatges, gràfics o altre material contingudes en les diferents diapositives

Facultat de Biologia
 CLASSIFICACIÓ DELS GLÚCIDS
MONOSACÀRIDS D-glucosa, D-fructosa, D-galactosa
D-ribosa, D-desoxiribosa
Derivats:
D-glucosamina, N-acetilglucosamina
àcid acetilmuràmic, àcids siàlics

OLIGOSACÀRIDS maltosa, cel.lobiosa, sacarosa, lactosa

POLISACÀRIDS HOMOPOLISACÀRIDS
- reserva midó, glicogen
- estructurals cel.lulosa, quitina
HETEROPOLISACÀRIDS

ASSOCIATS A ALTRES MOLÈCULES

HETERÒSIDS
digitalina, tannosids, antibiòtics, nucleòtids
PEPTIDOGLICANS
mureïna (paret bacteriana)
PROTEOGLICANS
estructurals
de secreció
GLICOPROTEÏNES
mucines secreció
de la sang
hormones gonadotròpiques
RNAses (algunes)
membranes cel.lulars
GLICOLÍPIDS
cerebròsids
gangliòsids
 D-MONOSACÀRIDS
(els més comuns ténen n= 3, 5 ó 6)
6 CH2 OH 6 CH2 OH

H 5
O H H 5
O OH
4
H (CH2O)n 4
H
1
1
OH H OH H
Forma lineal OH
OH 3 2 OH 3 2 H
FISCHER
H OH H OH
D-glucosa D-glucosa
Forma anular o cíclica a Forma anular o cíclica b
HAWORTH HAWORTH

1 6 1 OH
2 5 2 5

3 4 3 4 CH2 OH
6

Forma anular o cíclica a Forma anular o cíclica b

HAWORTH HAWORTH
 D-MONOSACÀRIDS
(els més comuns ténen n= 3, 5 ó 6)

CH2 OH CH2 OH
OH HOH2 C O CH2 OH
H O H O H
H H
OH H OH H H HO
H OH
OH OH H OH
H OH H OH OH H
D-glucosa D-galactosa D-fructosa
HOH2 C OH HOH2 C OH
O O
H H H H
H H H H
OH OH OH H
D-ribosa D-desoxiribosa
 6 CH2 OH 6 CH2 OH

H 5 H H 5 O H
O
4 H 4
H
1 1
OH H OH H
OH 3 2 OH OH 3 2 OH
H OH H OH
D-glucosa D-glucosa

ENLLAÇ GLUCOSÍDIC H2O

CH2 OH CH2 OH
H O H H O H
H H
OH H a(1→4) OH H
O
OH OH
H Maltosa
OH Glucosa H OH
+ Glucosa

CH2 OH CH2 OH
CH2 OH OH
HOH2 C H O H O H
H O H O H H
H OH H O OH H
OH H a(1→2) H HO
O H H b(1→4) OH
OH CH2 OH
H OH H OH
H OH OH H
Sacarosa Lactosa
Glucosa + Fructosa DISACÀRIDS Galactosa + Glucosa
 POLISACÀRIDS
CH2OH
O

...O OH

amilosa O a(1→6)
OH
Midó CH2OH CH2 Glicogen
O O
OH OH
...O O O...
OH OH
a(1→4)
amilopectina

Grànul de
glicogen

Midó

Glicogen
 POLISACÀRIDS
CH2OH
CH2OH
O O
...O
OH O OH O...

Cel·lulosa OH OH

b(1→4)
FUNCIONS GENERALS DELS GLÚCIDS

ENERGÈTICA
ESTRUCTURAL
ALTRES Antibiòtic (estreptomicina)
Vitamina (Vitamina C)
Anticoagulant (Heparina)
Hormonal (H. gonadotropes)
Enzimàtica (RNAsa)
Immunològica (glicoproteïnes=antígens)
Senyalització Cel·lular (reconeixement i
interaccions entre cèl·lules)

FUNCIONS GENERALS DELS LÍPIDS

ENERGÈTICA
ESTRUCTURAL
SENYALITZACIÓ CEL·LULAR (Hormones i Missatgers intracel·lulars)
 LÍPIDS
ÀCIDS GRASSOS
CH3 CH2 CH2 CH2 CH2 CH2 CH2 CH2
CH2 CH2 CH2 CH2 CH2 CH2 CH2 COOH

COOH
àcid esteàric

àcid oleic
COOH
O
C-O

COOH
palmitat d'hexadecanil àcid esteàric

CERES COOH
àcid oleic

O
C-O

palmitat d'hexadecanil
 LÍPIDS
TRIACILGLICEROLS
O
CH 2 O C
O
trioleïna
CHO C
O
CH 2 O C

O
CH 2 O O
C
CH 2 O O
C
fosfatidilcolina
O
CHO C
trioleïna
CHO O
C
+
CH 2 O PO O - CH 2 - CH 2 - N - (CH 3 ) 3
FOSFOLÍPIDS
CH 2 O OH
C

O
CH 2 O C
O
fosfatidilcolina
CHO C
O
+
CH 2 O P O - CH 2 - CH 2 - N - (CH 3 ) 3
OH
Fosfatidilcolina
 LÍPIDS
Fosfolípids Glucolípids
GLUCOLÍPIDS exterior

OH – CH – CH = CH - (CH2)12 - CH3
O

=
CH – NH – C – (CH2)22 – CH3
glucocerebròsid
Colesterol
CH2 – O – D-glucosa

ESTEROLS

interior

OH

HO

colesterol
O

testosterona
 L-AMINOÀCIDS
Grups R apolars (hidrofòbics) COOH COOH COOH

COOH COOH NH2 - C - H NH2 - C - H NH2 - C - H

COOH
COOH NH2 - C - H NH2 - C - H CH2 CH2 CH2
HN CH
COOH NH2 - C - H CH2 H - C - CH 3 CH2
NH2 - C - H H2C CH2
CH CH CH2 S
CH2 N
CH3 H3C CH3 H3C CH3 CH3 H CH3
ALANINA VALINA LEUCINA ISOLEUCINA PROLINA FENILALANINA TRIPTÒFAN METIONINA
(Ala, A) (Val, V) (Leu, L) (Ile, I) (Pro, P) (Phe, F) (Trp, W) (Met, M)

Grups R polars (hidrofílics) COOH

COOH
NH2 - C - H
sense càrrega o neutres COOH NH2 - C - H
COOH CH2
NH2 - C - H CH2
COOH COOH COOH NH2 - C - H
CH2 CH2
NH2 - C - H NH2 - C - H NH2 - C - H H - C - OH
C C
H CH2SH H2N O H2N O CH2OH CH3
GLICINA CISTEÏNA ASPARAGINA GLUTAMINA SERINA TREONINA OH
(Gly, G) (Cys, C) (Asn, N) (Gln, Q) (Ser, S) (Thr, T)
TIROSINA
(Tyr, Y)

amb càrrega + o bàsics COOH amb càrrega - o àcids

COOH
NH2 - C - H
COOH NH2 - C - H COOH
CH2
NH2 - C - H CH2 COOH NH2 - C - H
CH2
CH2 CH2 NH2 - C - H CH2
CH2
C CH2 CH2
NH CH2
HC NH
C
CH2 -
COOH -
COOH
+ HN CH H2N NH
+
2
NH
H+ 23 ASPARTAT GLUTAMAT
HISTIDINA ARGININA LISINA (Asp, D) (Glu, E)
(His, H) (Arg, R) (Lys, K)
 ENLLAÇ PEPTÍDIC
R H O
H
C O N C
H
N
a AA 1 + AA2 H
C H
C O
H a
O H H R

H O H

R H H O
C N C
H a
N C C O H
H a
O H R
DIPÈPTID

H CH2OH
extrem a extrem
N-terminal NH2 - CH - CO - NH - CH - CO - NH - CH - COOH C-terminal
a a
CH3
Gly Ala Ser

enllaç enllaç
peptídic peptídic

ESTRUCTURA PRIMÀRIA PROTEÏNA

H2 N- AA1 AA2 AA3 AA4 AAn -COOH
 ESTRUCTURA SECUNDÀRIA PROTEÏNA
HÈLIX ALFA

Permeten Ala Leu Val

AA1 AA2 AA 3 AA4 AA5 Phe Tyr Trp
Cys Met His
H H R2 O H H R4 O H O Asn Gln
H2 N - C a1 - C - N - C a2 - C - N - C a3 - C - N - C a4 - C - N - C a5 - C - ... Inestabilitzen Ser Thr Ile
Gly Asp Glu
R1 O H H R3 O H H R5 Lys Arg

pont d'hidrogen Trenquen Pro

R R
R R
5,6 Å
1,5 Å
3,6 AA R R

pont R R
d'H R

5Å

1,5 Å = distància linial entre Ca

5,6 Å = pas de rosca
3,6 AA = residus per pas de rosca
 ESTRUCTURA SECUNDÀRIA PROTEÏNA
CONFORMACIÓ BETA

H O
N C
R - Ca - H H - Ca - R
C N O N C N C N N N N N N
H O H
N C
H - Ca - R R - Ca - H
3,5 Å N
C H O
O H
N C
R - Ca - H H - Ca - R C N C N C C C C C C
C N O antiparal.lela paral.lela
H O H
N C
H - Ca - R R - Ca - H
C N
O H

Afavoreixen Ala Gly Met

Val Ile Leu
Cys Phe Tyr
Trp Gln Thr

Inestabilitzen Glu Pro

Arg Asn His
Ser Lys Asp
 ESTRUCTURA TERCIÀRIA PROTEÏNA
pont
disulfuro hèlix a
conformació Proteïna AA hèlix a conf. b
enrotllada
mioglobina 153 78 0
citocrom c 104 39 0
lisozim 129 40 12
ribonucleasa 124 26 35
N quimotripsina 247 14 45

gir b
C
conformació b

cadenes
glucídiques domini
extracel.lular
ext

int
domini
domini intracel.lular
transmembrana
 ESTRUCTURA QUATERNÀRIA PROTEÏNA
Estructura
Proteïna PM nº subunitats
primària
hexoquinasa 102.000 2
lactat deshidrogenasa 140.000 4
hemoglobina 64.500 4
glutamat deshidrogenasa 320.000 6
aspartat transcarbamilasa 310.000 12
glutamna sintetasa 600.000 12
piruvato deshidrogenasa 4.600.000 72

= estructura Estructura
 estructura  estructura
secundària
= funció = funció lactat DH  funció
hemoglobines M4
Hb A1 = a2b 2 M3H
Hb A2 = a22 M2H 2
Hb F = a22 MH3
H4
P-glucoisomerasa
Asp transcarbamilasa

regió variable Estructura

terciària

regió constant

cadenes cadenes
pesades lleugeres
Estructura
quaternària

INMUNOGLOBULINA G
CLASSIFICACIONS I FUNCIONS DE LES PROTEÏNES
COMPOSICIÓ

Holoproteïnes
Heteroproteïnes
Glucoproteïnes
Lipoproteïnes
Nucleoproteïnes
Fosfoproteïnes
Metal.loproteïnes
Flavoproteïnes

NOMBRE DE SUBUNIDATS

Monomèriques
Oligomèriques

ESTRUCTURA

Fibroses
Globulars
De membrana

FUNCIÓ BIOLÒGICA

Catalítiques enzims
Transport
circulants hemoglobina, albúmina
de membrana transportadors, canals
Estructurals queratines, col.làgena, elastina
Contràctils actina, miosina, tubulina
Reserva caseïna, ferritina, ovoalbúmina
Defensa immunoglobulines, trombina
Reguladores hormones, receptors
 Formació d’enllaços

Glucosídic (Glúcids)
Peptídic (Proteïnes)
Fosfodièster (Àcids Nucleics)
 NUCLEÒSIDS I NUCLEÒTIDS
PURINES PIR IMIDINES

BASE NUCLEÒSID BASE NUCLEÒSID

NH2 NH2
N N
N
Adenina Adenosina Citosina Citidina
N N O N
H N1 6 N H N3
4
5
5 7
8
2 4 9 2 1 6
3
O N N O N
H N H
N N CH3 Uracil Uridina
Guanina Guanosina
(Timina) (Timidina)
NH2 N N O N
H H

NUCLEÒSID: base nitrogenada (púrica o pirimidínica)

+ pentosa (D-ribosa o 2’-desoxirribosa)

NUCLEÒTID: nucleòsid + 1 o més grups ortofosfat

McKee 2003, 1ª ed.

 FORMACIÓ DE L’ENLLAÇ FOSFODIESTER

Stryer, 3ª ed.
ENLLAÇ FOSFODIESTER COMPLEMENTARIETAT DE BASES

McKee 2003, 1ª ed.

Mathews 2002, 3ª ed.

ESTRUCTURA DOBLE-HELICOIDAL DEL DNA

Lehninger 2003, 3ª ed.

 DIFRACCIÓ DE RAIGS X

Stryer 2003, 5ª ed.

DNA: https://www.youtube.com/watch?v=wdhL-T6tQco
 NIVELLS D’ESTRUCTURACIÓ
DEL DNA

CROMOSOMA

CROMATINA

NUCLEOSOMA

DNA

McKee 2003, 1ª ed.

 TIPUS DE RNA I ABUNDÀNCIA RELATIVA

Small Nuclear RNA (snRNA)

Stryer 2003, 5ª ed.

ESTRUCTURA DEL RNA DE TRANSFERÈNCIA

McKee 2003, 1ª ed.