Doktorski studij Biomedicina i zdravstvo

4. semestar
Predmet: Statistička analiza podataka u medicini 1
Voditelj predmeta: prof. dr.sc. Z. Sonicki
Predmet odslušan: ak. god. 2021./2022.
Zadaća napisana: svibanj 2023. godine
Polaznica

Analiza znanstvenog rada

Analizirani rad:

Ukratko što se radilo u studiji: Na odjelu ortopedije na kojem se inače artroskopija gležnja radi uz
pomoć blijede staze (engl. = torniquet) na način da se pacijentu na bedro stavi manžeta tlakomjera i
napuše se (sa svrhom bolje vidljivosti i manje krvarenja), autori rada su odlučili pokušati artroskopiju
bez blijede staze s obzirom na postojeće objavljene radove koji ukazuju da blijeda staza ipak nosi
neke poteškoće (parestezije u nozi pacijenta nakon zahvata, određene operativne komplikacije). Zato
su proveli RCT tj. usporedili ishode u grupi pacijenata kojima je artroskopija rađena sa blijedom
stazom (Torniquet ili T grupa) sa grupom pacijenata kojima je artroskopija rađena bez blijede staze
(Non-Torniquet ili NT grupa) s ciljem vidjeti postoje li razlike u vizualizaciji, dužini trajanja operacije,
postoperativnom krvarenju, postoperativnoj boli (VAS skala), te funkcionalnim skorovima.

Dizajn studije: Randomizirana kontrolirana studija (RCT), non-inferiority trial.

Sample size: Autori navode da je sample size izračunat u programu NCSS/PASS. Da bi se izračunao
sample size, bile su potrebne informacije o tome je li već objavljen neki sličan rad i koliki je tamo bio
sample size (jest, nisu naveli sample size, ali jesu citirali rad), kolika je potrebna snaga studije (1 –
type II error odnosno 1-beta) te alfa (odnosno type I error). Alfa vrijednost je 0.05, a snaga 80%. Na
bazi navedenog, određeno je da po grupi potrebno imati 22 pacijenta. Autori su u svaku grupu
uključili po 25 pacijenata.

Uključenje pacijenata, drop out: U fig.1 prikazan je CONSORT flowchart. Inicijalno je pregledano 104
pacijenata, no kriterije uključenja je zadovoljilo 50 pacijenata (54 pacijenta su imali komorbidete,
manje od 16 godina ili više od 55 godina, anamnezu operacije na istom gležnju). Na prvoj kontroli (6
mjeseci), nije bilo drop-outa. Na drugoj kontroli (6 mjeseci), u NT grupi, 1 pacijent je ispao iz studije
zbog smrti u saobraćaju. Tako je analizirano 49 pacijenata.
Randomizacija: Pacijenti su randomizirani simple randomizacijom što znači da je svaki pacijent imao
jednaku šansu za biti raspodijeljen u grupu. Randomizacija je rađena na stranici randomization.com.

Blinding: Operater je zaslijepljen na način da je svakom pacijentu na bedro stavljena manžeta

tlakomjera, tad je operater izašao iz sale. Potom je jedan od autora rada nazvao statističara koji bi
rekao je li pacijent randomiziran u T ili NT grupu. Nakon toga bi se operater vratio u salu.

Statistička analiza: Normalnost distribucije testirana je Kolmogorov-Smirnov i Shapiro-Wilk testovima.

Tako tablica 1 pregledno prikazuje koje kontinuirane varijable su normalno distribuirane (dob, BMI,
trajanje operacije), koje ne-normalno (volumen korištene fiziološke otopine, postoperativno
krvarenje), te prikazuje nominalne varijable (spol, operirana strana, vodeće dijagnoze tj. indikaciju za
operaciju). Sve varijable koje su normalne distribucije, analizirane su t-testom što je prikladno ako
uzmemo u obzir koje je istraživačko pitanje (postoji li razlika), tip varijabli (kontinuirana) i distribuciju
(normalna). Ne-normalno distribuirane varijable analizirane su neparametrijskim Mann-Whitney
testom što je također ispravno ako uzmemo u obzir istraživačko pitanje (postoji li razlika), tip varijabli
(kontinuirana) i distribuciju (ne-normalna). S obzirom na mali broj ispitanika, možda su se sve
varijable mogle ispitati neparametrijom, no onda bi ostalo prostora za pitanje bi li ipak parametrijski
test negdje otkrio razliku koja ipak postoji, ali je neparametrijski test nije otkrio.

Nominalne varijable analizirane su hi kvadrat testom, a kod varijable vidljivost operativnog polja
korištena je Yaetsova korekcija hi kvadrata s obzirom na mali broj ispitanika sa ocjenom „dobra
vidljivost“ (prikazano u tablici ispod):

Tablica varijable vidljivost koja objašnjava zašto nije korišten hi kvadrat test (tablica nije iz citiranog
rada).

Vidljivost NT grupa T grupa

Odlična 19 25
Dobra 5 0
S obzirom na brojeve 5 i 0, ne bi bilo ispravno primijeniti hi kvadrat test već ili Fisherov test ili
Yatesovu korekciju hi kvadrata.

U tablici 1 citiranog rada vidimo da su varijable s normalnom distribucijom prikazane kao mean i
standardna devijacija (SD) što je ispravno. Npr. varijabla dob. U NT grupi srednja vrijednost dobi
(kada zbrojimo sve dobi svih ispitanika u toj grupi i podijelimo s brojem ispitanika u grupi) je 32.3. SD
je 12 što znači da je 68% ispitanika u toj grupi bilo u rasponu dobi od 20 godina (32.3-12) do 44 (32.3
+ 12). Varijable s ne-normalnom distribucijom su prikazane kao medijan i interkvartilni raspon (IQR).
Npr. varijabla količina korištene fiziološke. Medijan tj. centralna vrijednost lijevo i desno od koje
imamo isti broj ispitanika ako ih poredamo od najmanje mililitraže fiziološke do najveće u T grupi je
6.254 l, a IQR je od 3 do 12 litara što znači da je središnjih 50% pacijenata dobilo fiziološke u rasponu
od 3-12 litara, 25% pacijenata je dobilo <3 litre, a 25% >12 litara. Figure 3 rada prikazuje jedan linijski
grafikon rezultata VAS skale. Odabirom linijskog grafikona, jasno je da je VAS smatrana
kontinuiranom varijablom, iako bi trebala biti smatrana ordinalnom. No, u medicini se skorovi često
tretiraju kao kontinuirane varijable.

Rezultati: Statistički testovi nisu našli statistički značajnu razliku u baseline karakteristikama
pacijenata između T i NT grupe (dob p=0.930, BMI p=0.865, spol p=0.254, operirana strana p=0.771),
osim u varijabli AOFAS skor (funkcionalni skor koji govori kakva je fukncija gležnja, težimo skoru 100).
Baseline je postojala razlika, pacijenti u NT grupi imali su bolji skor (p=0.057 – može se uzeti kao
marhginalno značajno), skorovi vidljivi na fig 4 koji prikazuje Box and whiskers plotove AOFAS skora
prije operacije, 3 mjeseca nakon operacije te 6 mjeseci nakon operacije. Skorovi se pomiču prema
gore nakon operacije što je dobro, no i dalje se vidi razlika u medijanima između T i NT grupe. 6
mjeseci nakon operacije, 50% pacijenata u NT grupi je doseglo skor 100.

U tekstu je opisano da razlika zaista jest bila stat. značajna (p=0.006 3 mjeseca nakon operacije te
p=0.007 6 mjeseci nakon operacije) u korist NT grupe. No, s obzirom na razliku koja bila prisutna i na
baseline-u, uzet je u obzir postotak poboljšanja te tada nije nađena stat.značajna razlika nakon 3
mjeseca (p=0.712) te 6 mjeseci (p=0.794). Što se VAS-a tiče, nije bilo stat.značajne razlike, osim u
postop. danima 5, 6, 7, 10 i 13 u korist NT grupe (dan 5 P = .047), dan 6 P = .028), dan 7 P = .026), dan
10 P = .029), dan 13 P = .016).

Zaključak rada: Autori rada (ispravno) zaključuju da nema razlike između T i NT grupe obzirom na
vizualizaciju, vrijeme trajanja operacije, postop.krvarenje te funkcionalne skorove.

Završni komentar: Smatram da je odabran ispravan dizajn studije obzirom na istraživačko pitanje te
da su korišteni ispravni statistički testovi, kao i grafički prikazi rezultata.