M1 Biologie Santé 2023-2024

UE Les bases de l’Immunologie

Cytokines et Signalisation
Rami Bechara

Université Paris-Saclay, Faculté de Médecine

Inserm UMR1184, IMVA-HB

rami.bechara@universite-paris-saclay.fr

1
Médiateurs de l’inflammation
2
Plan
• Cytokines: cibles thérapeutiques
• Aperçu de la superfamille des cytokines
• Type de signalisation
• JAK-STAT
• NF-kB
• MAPK
• G-protein
• Les cytokines qui activent NF-kB/MAPK : TNF/IL-1/IL-17
• Chimiokines
• Régulation négative de la signalisation des cytokines
3
Dorothy
Crowfoot
Hodgkin

4
1-Les cytokines de l’inflammation comme cibles
thérapeutiques

5
 1-Les cytokines de l’inflammation comme cibles
thérapeutiques

The chart shows strong clinical efficacy of inhibition of each cytokine confirmed in randomized clinical trials of various chronic
inflammatory diseases (CIDs) (or several independent observational studies in case of low prevalence diseases) (dark green),
preliminary data on clinical efficacy (light green), no or mild clinical efficacy or no data on efficacy (gray) and disease-
aggravating effect (red) upon cytokine inhibition of similar cytokine dependence (dashed blue squares) 6
 2-Famille des récepteurs de cytokines et leurs
ligands

Cytokine TNF Toll, IL-1

IL-17 Receptor TGF-b Chemokine
receptor (I, II) receptor receptor
receptor tyrosine receptor receptor
kinase
IL-2 family TNF/LT family TLRs1-11 IL-17A-F EGF TGFs chemokines
IL-6/12 family CD40, ICOS IL-1-related IL-25 (17E) PDGF BMPs
IFN/IL-10 family Fas IL-33 Insulin
IL-3/5/GMCSF NGF IL-18 Etc.
EPO, GF, PRL IL-1F family
7
 2-Les différentes voies de signalisations

Cytokine TNF Toll, IL-1

IL-17 Receptor TGF-b Chemokine
receptor (I, II) receptor receptor
receptor tyrosine receptor receptor
kinase
JAK-STAT
NF-kB NF-kB NF-kB MAPK SMADS Ras-Raf
MAPK
MAPK MAPK MAPK PI3K/mTOR G-proteins
PI3K

8
 3-Les différentes voies de signalisations

Cytokine TNF Toll, IL-1

IL-17 Receptor TGF-b Chemokine
receptor (I, II) receptor receptor
receptor tyrosine receptor receptor
kinase
JAK-STAT
NF-kB NF-kB NF-kB MAPK SMADS Ras-Raf
MAPK
MAPK MAPK MAPK PI3K/mTOR G-proteins
PI3K

9
3- JAK-STAT

Cytokine
receptor (I, II)

IL-2 family
IL-6/12 family
IFN/IL-10 family
IL-3/5/GMCSF
EPO, GF, PRL
10
Plantanais et al. Nature Rev Immunol 2005
 4-Les différentes voies de signalisations

Cytokine TNF Toll, IL-1

IL-17 Receptor TGF-b Chemokine
receptor (I, II) receptor receptor
receptor tyrosine receptor receptor
kinase
JAK-STAT
NF-kB NF-kB NF-kB MAPK SMADS Ras-Raf
MAPK
MAPK MAPK MAPK PI3K/mTOR G-proteins
PI3K

11
 4) La signalisation NF-kB

12
Taniguchi, Nat Rev Immunol 2018
4) La signalisation MAPK

13
Arthur and Ley, Nature Rev Immunol 2013
Lien entre NF-kB et MAPK

Sun, Fronteirs Immunol 2018 14

A) TNF superfamily

A superfamily of TNF proteins consisting of 19 members that

signal through 29 receptors 15
Aggrawal, Nat. Rev. Immunol 2003
A) TNF Superfamily Signaling

16
Aggrawal, Nat. Rev. Immunol 2003
 B) IL-1 Superfamily

17
Jensen, Science Signaling 2017
B) IL-1 family processing

• Unlike most cytokines, IL-1

cytokines do not have a
classical signal sequence to
drive their secretion

• Requires extra step of

processing/secretion

• Inflammasome à Caspase-
dependent

• Other proteases – e.g.,

cathepsins
18
Dinarello, Nat. Rev. rheumato 2019
 C) IL-17 family

Gaffen, Nat Rev Immunol. 2014 19

 C) IL-17 Signaling

20
Li, Gaffen et al. Nature Immunol 2019
Synergie entre les différentes cytokines

21
Gaffen, McGeachy labs, unpublished
La régulation postrancriptionnelle: mécanisme de synergie

IL-17RA
IL-17RC

Act1
TRANSCRIPTION
FACTORS

IkBz

New Gene
Transcription
Gaffen, Nat Rev Immunol. 2014
22
La régulation postrancriptionnelle: mécanisme de synergie

IL-17RA
IL-17RC

Act1
TRANSCRIPTION RNA BINDING
FACTORS PROTEINS

A A
IkBz AA
TR
3 ’U Regnase-1

New Gene
Transcription Regulation
Gaffen, Nat Rev Immunol. 2014 of mRNA
23
 5-Les différentes voies de signalisations

Cytokine TNF Toll, IL-1

IL-17 Receptor TGF-b Chemokine
receptor (I, II) receptor receptor
receptor tyrosine receptor receptor
kinase
JAK-STAT
NF-kB NF-kB NF-kB MAPK SMADS Ras-Raf
MAPK
MAPK MAPK MAPK PI3K/mTOR G-proteins
PI3K

24
5) Chimiokines

25
Tran, Nature Neuroscience, 2003
5) Chimiokines

Kohli et al, Cancer gene therapy,

26 2021
 5) La signalisation des Chimiokines

27
New & Wong, 2003
6) Pourquoi la régulation négative est importante ?

• La désactivation d'un signal peut être tout

aussi importante que son activation
• Inflammation non-contrôlée
• Infections virales/bactériennes
• Auto-immunité
• Signalisation exacerbée (TNF, IL-1, IL-17, etc)
• Maladies Immunoprolifératives
• Lymphomes, leucémies

28
 A) Turning JAK-STAT Off:
Suppressors of Cytokine Signaling (SOCS)

• Discovered in 1997 (Nature Vol

387)
• Screen for genes that:
• inhibit IL-6
• Bind to JAK proteins
• screen for proteins with regions
similar to STAT3 SH2 domains Yoshimura, Nature Rev Immunol 2007

29
B) Deubiquitination and control of signaling

30
Wertz & Dixit, Cold Spring Harb Perspect Biol., 2010
A20/TNFAIP3, a canonical NF-kB inhibitor

31
Ma and Malynn, NRI 2012
C) Inhibiting MAPK- Dual Specificity Protein Phosphatases
(DUSPs)

• Also known as MKPs

• Dephosphorylate the
active site in the MAPK
kinase domain
• Often induced early
after receptor
activation, serving as
part of a negative
feedback loop

32
Arthur and Ley, Nature Rev Immunol 2013
D) Negative regulation by Soluble receptors – IL-1 family

33
But not all soluble receptors are inhibitory!
“Trans-signaling”

34
E) Regulation of RNA Stability

• Some mRNAs are intrinsically

unstable
• Especially true for cytokines
• Evidenced by an “AU-rich element”
in the 3’ untranslated region (UTR)
• Rendered unstable by specific RNA
binding proteins (often Zinc finger
family proteins)
Fu & Blackshear, NRI 2017
• Tristetraprolin (TTP) is canonical
RNA binding protein (RBP) in the
immune system
35
 TTP – Tristetraprolin (gene=zfp36)
• Zinc finger protein, binds to the ARE element in various genes, especially
the Tnfa gene
• TTP-ko mice- severe arthritis, dermatitis, cachexia; alleviated with anti-TNF
Abs
• TNF induces TTP à feedback inhibition
• TTP De-stabilizes mRNA by:
• Binding to mRNA decapping enzymes
• Facilitating deadenylation

36
Refs: Paul Anderson, NRI 2010; Fu & Blackshear, NRI 2017
Loss of tristetraprolin increases the severity of imiquimod-
induced skin lesions

Andrianne et al. JCI insight 2017

37
 RNA processing

Initial Activate transcription

stimulus
RBP polysomes A
A AA
AA

Stor
Cytokine, Chemokine

e
age/

on s
Txn factors, etc. A
AA

resp
stab
ili

id
A
AA A

ty
Rapid

Rap
AA A
Decay AA A
RBP AA
A
AA
A
AA
AA
A Processing (P) bodies
A
AA
Targeted for degradation
Stalled transcription Cytoplasmic stress granules

38
Comment doser les cytokines en pratique ?

39
• Les cytokines sont des petites molécules permettant la communication entre les cellules de
l’organisme
• Classification reste difficile:
• Classification selon des identités de structure: le groupe des hématopoiétines (IL-2, IL6),
le groupe des interférons, le groupe du TNF-α, la famille de l’IL-1 et les chemokines...
Certaines cytokines comme les TGF-β‚ ne rentrent dans aucun de ces sous-groups
• Classification selon le récepteur cible et les voies induites (Jak-STAT, MAPK, NF-kB)
• Les cytokines exercent leur action en se fixant à des récepteurs membranaires ou à des récepteurs solubles
• Une même cytokine peut être produite par différentes cellules et exercer des effets différents sur des
cibles variées (effet pléiotropie)
• Chimiokines: petite protéine chimio-attractante qui stimule la migration et l’activation de cellules,
notamment de phagocytes et de lymphocytes, et joue un rôle central dans les réponses inflammatoires
• Les cytokines peuvent avoir une action autocrine ou paracrine
• Redondance, Synergie, Antagonisme
• Des cytokines différentes peuvent exercer la même action biologique (redondance) : APRIL et BAFF
• Synergie : IL-17, TNFa
• effets antagonistes : c’est le cas de l’IFN-γqui bloque l’effet de l’IL-4.
• L’ELISA et la cytométrie en flux permettent le dosage des cytokines
• Une cytokine peut avoir des effets « anormaux » (pathogènes) dans différentes circonstances :
• si la cytokine est produite en excès (e.g., polymorphisme génétique ou une stimulation chronique ou si le système
de rétrocontrôle est déficitaire.
• Signature IFN et IL-17 dans les maladies auto-immunes
• Anticorps thérapeutiques 40
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UE Les bases de l’Immunologie

Merci !

rami.bechara@universite-paris-saclay.fr

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