Professional Documents
Culture Documents
Giao Trinh Biochemistry - A Short Course - 3rd - Sec 1.en - VI
Giao Trinh Biochemistry - A Short Course - 3rd - Sec 1.en - VI
Giao Trinh Biochemistry - A Short Course - 3rd - Sec 1.en - VI
com
Hóa sinh
Một khóa học rút ngắn
Ấn bản thứ ba
John L. Tymoczko
Jeremy M. Berg
Lubert Stryer
Bản xuất nhà: Kate Ahr Parker
Minh họa: Jeremy Berg, Gregory Gatto, Adam Steinberg và Đồ họa mạng
ISBN-10: 1-4641-2613-5
ISBN-13: 978-1-4641-2613-0
WH Freeman và Công ty 41
Đại lộ Madison
New York, NY 10010
www.whfreeman.com
Gửi các thành viên của chúng tôi
và sinh viên
Giới thiệu về tác giả
John L. Tymoczkolà Giáo sư Sinh học Towsley tại Cao Sinh học từ năm 2011 đến năm 2013. Ông là thành viên
đẳng Carleton, nơi ông đã giảng dạy từ năm 1976. Ông của Hiệp hội vì sự tiến bộ của khoa học Hoa Kỳ và là thành
hiện đang giảng dạy Hóa sinh, Phòng thí nghiệm Hóa sinh, viên của Viện Y học thuộc Viện Hàn lâm Khoa học Quốc gia.
Gen gây ung thư và Sinh học phân tử của ung thư, Hóa Ông là người nhận thưởng Hiệp hội Hóa học Hoa Kỳ về Hóa
sinh thể giáo dục và đồng giảng dạy khóa học giới thiệu, học thuần túy (1994), Giải thưởng Eli Lilly cho Nghiên cứu
Dòng năng lượng trong hệ thống sinh học. Giáo sư Cơ bản về Hóa học Sinh học (1995), Giải thưởng Harrison
Tymoczko nhận bằng Cử nhân của Đại học Chicago năm Howe (1997) và Thưởng Dịch Công Howard Schachman
1970 và bằng Tiến sĩ. về Hóa sinh tại Đại học Chicago với (2011), được vinh danh là Nhà khoa học trẻ xuất sắc của
Shutsung Liao tại Viện Nghiên cứu Ung thư Ben May. Sau Maryland (1995) và nhận các giải thưởng dịch vụ công từ
đó, anh đảm nhận vị trí sau tiến sĩ với Hewson Swift thuộc Hiệp hội Vật lý sinh học, Hiệp hội Hóa sinh và Sinh học
Khoa Sinh học tại Đại học Chicago. Trọng tâm nghiên cứu phân tử Hoa Kỳ, Hiệp hội Hóa học Hoa Kỳ và Hiệp hội Sinh
của ông là các loại thụ thể steroid, các hạt học Tế bào khỏe Hoa Kỳ. Ông cũng đã nhận được nhiều
ribonucleoprotein và các enzyme xử lý phân giải protein. giải thưởng giảng dạy, trong đó có giải
Giải thưởng Giảng dạy W. Barry Wood (do sinh viên y khoa số
Jeremy M. Bergnhận bằng Cử nhân và Thạc sĩ Hóa lựa chọn), Giải thưởng Giảng dạy dành cho Sinh viên Sau đại học
học tại Stanford (nơi ông đã nghiên cứu với Keith và Giải Giảng dạy của Giáo sư về Khoa học Tiền lâm sàng. Ông là
Hodgson và Lubert Stryer) và bằng Tiến sĩ. về Hóa học đồng tác giả với Stephen J. Lippard của cuốn sách giáo khoa
từ Harvard với Richard Holm. Sau đó, anh hoàn thành Nguyên lý hóa học vô cơ học.
chương trình nghiên cứu sau tiến sĩ với Carl Pabo về Vật
lý sinh học tại Trường Y thuộc Đại học Johns Hopkins. Lubert Stryerlà Giáo sư danh dự về Sinh học tế bào của
Ông là Trợ lý Giáo sư tại Khoa Hóa học tại Johns Hopkins Winzer, thuộc Trường Y và Giáo sư danh dự về Sinh học thần
từ năm 1986 đến năm 1990. Sau đó, ông chuyển đến kinh, tại Đại học Stanford, nơi ông làm giảng viên từ năm 1976.
Trường Y thuộc Đại học Johns Hopkins với tư cách là Ông nhận bằng MD của Trường Y Harvard. Giáo sư Stryer đã
Giáo sư và Giám đốc Khoa Lý sinh và Hóa lý sinh, nơi nhận được nhiều giải thưởng cho nghiên cứu của ông về sự
ông làm việc cho đến năm 2003. Từ năm 2003 đến năm tương tác giữa ánh sáng và sự sống, bao gồm Giải thưởng Eli
2003 Năm 2011, ông giữ chức vụ Giám đốc Viện Khoa Lilly cho Nghiên cứu Cơ bản về Hóa học Sinh học, Giải thưởng
học Y khoa Tổng hợp Quốc gia tại Viện Y tế Quốc gia. Nhà phát minh Xuất sắc của Hiệp hội Chủ sở hữu Sở hữu Trí
Năm 2011, ông chuyển đến Đại học Pittsburgh, nơi ông tuệ và được bầu vào Viện Hàn lâm Khoa học Quốc gia và Hiệp
hiện là Giáo sư Sinh học Hệ thống và Tính toán, đồng hội Triết học Hoa Kỳ. Ông đã được trao Huân Chương Khoa
thời là Giáo sư của Quỹ Pittsburgh và Giám đốc Viện Y học Quốc gia năm 2006. Việc xuất bản ấn bản đầu tiên của ông
học Cá nhân hóa. Ông từng là Chủ tịch Hiệp hội Hóa vềHóa sinhvào năm 1975 đã thay đổi công việc giảng dạy môn
sinh và Phân tử Hoa Kỳ hóa sinh.
iv
Lời nói đầu
MỘT
Là con người, họ là những người thư giãn học tập huấn luyện. Rất lâu trước khi
bé biết rằng mình có thể thay đổi một tờ báo bằng cách xé nát nó, bé đã tiếp
tục thu được một lượng thông tin lớn. Quá trình học tập này tiếp tục diễn ra
trong suốt cuộc đời theo vô số cách: học cách đi xe đạp và học cách tiếp tục thu thập tín
hiệu xã hội từ bạn bè; học lái xe và cân đối sổ; học cách giải phương trình hai và diễn giải
một tác phẩm nghệ thuật.
Tất nhiên, phần lớn công việc học là cần thiết để sinh tồn, và ngay cả những sinh vật đơn
giản nhất cũng học cách tránh nguy hiểm và nhận thức thức ăn. Tuy nhiên, con người đặc biệt
có năng khiếu ở chỗ chúng tôi vẫn có những kỹ năng và kiến thức để làm nên cuộc sống
phong phú và có ý nghĩa hơn của mình. Nhiều sinh viên sẽ đồng ý rằng việc đọc tiểu thuyết và
xem phim sẽ nâng cao chất lượng cuộc sống của chúng ta bởi vì chúng ta có thể mở rộng tầm
nhìn của mình bằng cách gián đoạn trong những vấn đề mà chúng ta chưa bao giờ trải qua,
phản ứng thông cảm hoặc không thông cảm với những nhân vật chúng ta nhớ đến chính mình
hoặc rất khác biệt với bất kỳ ai mà chúng ta từng gặp. đã từng biết. Kỳ lạ thay, ít nhất là đối với
chúng tôi, với tư cách là những giáo sư khoa học, các khóa học khoa học hiếm khi được cho là
mang lại sự phong phú hoặc hiểu biết sâu sắc về cơ thể con người. Larry Gould, cựu chủ tịch
của trường Cao đẳng Carleton, cũng là một nhà địa chất và một nhà nguy hiểm Bắc Cực. Là một
nhà khoa học, giáo viên và nhà quản lý, ông rất quan tâm đến giáo dục khoa học, đặc biệt vì nó
liên quan đến các chuyên ngành khác. Trong bài phát biểu chức năng khi trở thành tổng thống,
ông nói: “Khoa học là một phần của tổng thể giống như học và các lĩnh vực học tập khác. Chúng
không phải là những loại nguyên tắc trừ khi chúng độc lập và chồng chéo nhau.” Mục tiêu của
chúng tôi là viết một cuốn sách khuyến học sinh đánh giá cao hóa sinh theo nghĩa rộng hơn thế
này, như một cách để làm phong phú thêm hiểu biết của các em về thế giới.
v
viLời nói đầu
• MỘTMỚIphần: “Đột biến gen mã hóa các tiểu đơn vị huyết sắc tố có thể gây
bệnh tật” (Chương 9)
• 17 hiểu biết về lâm sàng mới, chứng minh sự liên quan của hóa sinh với sức khỏe
và bệnh tật của con người.
Các tính năng làm nổi khía cạnh sinh lý của hóa sinh đã được mở rộng
và bao gồm:
MỚINghiên cứu điển hìnhlà một tập hợp các từ điển nghiên cứu về hóa sinh trực tuyến
có thể chuyển nhượng và đánh giá được. Được viết bởi Justin Hines, Trợ lý Giáo sư Hóa học tại
Cao đẳng Lafayette, mỗi nghiên cứu điển hình giúp sinh viên thực hành cách làm việc với dữ
liệu, phát triển kỹ năng tư duy Phản biện, kết nối các chủ đề và ứng dụng áp dụng kiến thức
vào thực tế các vấn đề. Chúng tôi cũng cung cấp hướng dẫn giảng dạy cho từng nghiên cứu
điển hình (với các mẹo về cách sử dụng nghiên cứu điển hình trong lớp học) và các câu hỏi đánh
giá phù hợp cho các câu đố và bài kiểm tra.
MỚICâu hỏi nhấp chuộtđược sắp xếp phù hợp với các khái niệm chính và quan niệm sai sót trong mỗi
chương trình để học viên có thể đánh giá mức độ hiểu bài của sinh viên trong thời gian thực hiện các bài luận.
• Vấn đề giải thích dữ liệuluyện tập sinh phân tích dữ liệu và đưa ra kết
luận khoa học.
• Hợp nhất chương trìnhrút ra mối liên hệ giữa các khái niệm trong các
chương.
• Vắc đề thường gặpyêu cầu tính toán, hiểu biết về cấu trúc hóa học
và các khái niệm khác là phương thức đối với hầu hết học sinh.
Lời giải ngắn gọn cho tất cả các bài toán cuối cùng được cung cấp trong phần
“Trả lời các bài toán” ở cuối sách giáo khoa. Chúng tôi cũng vui mừng cung cấp các
giải pháp mở rộng trong phần đi kèmđồng hành động học sinh, của Frank Deis,
Nancy Counts Gerber, Richard Gumport và Roger Koeppe. (Để biết thêm chi tiết về
phần bổ sung này, xem trang x.)
• Mục tiêu học tậpđược sử dụng theo nhiều cách khác nhau trong lớp học. Để giúp củng cố
các khái niệm chính trong khi học sinh đọc chương trình này, chúng tôi đã chỉ sử dụng một-và
đánh số và tích hợp chúng ở cấp độ chương trình cũng như trong phần giới thiệu. Chúng tôi
cũng gắn liền với các chương trình vấn đề cuối cùng để hỗ trợ sinh viên phát triển kỹ năng giải
quyết vấn đề và người hướng dẫn đánh giá mức độ hiểu biết của sinh viên về một số khái niệm
chính trong mỗi chương trình.
6,4Enzyme tạo điều kiện cho thành phần của quá trình chuyển đổi - 2. thích mối quan hệ giữa giải thích trạng
thái chuyển tiếp và trung tâm hoạt động của
Status enzyme và liệt kê các đặc điểm của trung tâm
hoạt động.
Sự chênh lệch năng lượng tự nhiên giữa các chất phản ứng và sản phẩm tạo nên trạng thái cân bằng
của phản ứng, nhưng tốc độ tăng tốc của enzym đạt được trạng thái cân bằng này nhanh chóng như
thế nào. Làm thế nào chúng ta có thể giải quyết được sự tăng cường tốc độ về mặt nhiệt động lực
học? Để làm như vậy, chúng ta phải xem xét không phải các điểm cuối của phản ứng mà là con đường
hóa học giữa các điểm cuối.
Một phản ứng hóa học của cơ chất S để tạo ra sản phẩm P trải qua một lần
chuyển tiếp trạng tháiX‡có năng lực tự động cao hơn S hoặc P. Con dao găm kép
biểu thị trạng thái chuyển tiếp. Trạng thái chuyển tiếp là một cấu trúc phân tử
thoáng qua, không còn là chất nền nhưng chưa phải là sản phẩm. Trạng thái
chuyển tiếp là trạng thái gần ổn định nhất và hiếm khi xảy ra nhất trong quá trình
phản ứng vì nó là trạng thái có năng lượng tự động cao nhất.
• Câu hỏi nhanhmô phỏng khoảnh khắc khắc phục trong bài giải khi một giáo sư
? Đốt nhanhgiải thích tại sao người
thiếu trypsinogen sẽ gặp khó khăn về hỏi, “Bạn hiểu chưa?” Những câu hỏi này cho phép học sinh kiểm tra độ hiểu tài liệu
tiêu hóa hơn người thiếu hầu hết các
zymogen khác. khi đọc để có thể đánh giá giá ngay xem liệu họ có cần xem lại cuộc thảo luận hay
có thể chuyển sang chủ đề tiếp theo hay không. Lời giải được đưa ra ở cuối mỗi
chương.
ồ ồ
• Cấu hình đầu mụcđưa ra lời nhắc nhở nhanh chóng
C CoA C CoA về một phân tử hoặc nhóm mà sinh viên có thể tìm thấy
R S H3C S
Acyl CoA Acetyl CoA
trước đó trong cuốn sách hoặc trong một khóa học khác.
Điều này cho phép sinh viên hiểu chủ đề hiện tại mà không
ồ ồ–
C R9 C R9 cần phải đào tạo nghiên cứu cấu trúc cơ sở hoặc nguyên lý
+
R ồ R ồ
hóa học hữu cơ ở một nơi khác.
ồ ồ–
C R9 C + R9
R S R S
Este oxy được ổn định bằng hiệu ứng cộng đồng
cấu hình không có sẵn cho thioesters.
Tất cả các tài nguyên truyền thông mới choHóa sinh: Một khóa học ngắn hạncó sẵn trong sản phẩm mới của
chúng tôi system.
www.macmillanhighered.com/launchpad/tymoczko3e
Zoomlà một môi trường học tập năng động, vẽ đầy đủ, tập hợp tất cả các tài
nguyên giảng dạy và học tập của chúng tôi vào một nơi. Nó bao gồm các công cụ
theo dõi và chấm điểm giá mạnh mẽ, dễ sử dụng, lịch được cá nhân hóa, trung tâm
thông báo và các công cụ giao tiếp để giúp bạn quản lý khóa học của mình. Hệ
thống học tập này cũng chứa đầy đủ tính chất tương táclist điện tử và các tài
nguyên mới được cập nhật khác dành riêng cho sinh viên và người hướng dẫn, bao
gồm:
• Nghiên cứu điển hìnhlà một tập hợp các từ điển nghiên cứu về hóa sinh trực tuyến có thể
chuyển nhượng và đánh giá được. Được viết bởi Justin Hines, Trợ lý Giáo sư Hóa học tại Cao đẳng
Lafayette, mỗi nghiên cứu điển hình giúp sinh viên thực hành cách làm việc với dữ liệu, phát triển
kỹ năng tư duy Phản biện, kết nối các chủ đề và ứng dụng áp dụng kiến thức vào thực tế các vấn
đề.
• list điện tửcho phép sinh viên đọc phiên bản trực tuyến của sách giáo khoa,
kết hợp nội dung của sách, công cụ học tập điện tử và tiện ích bổ sung đầy đủ dành
cho người dùng sinh viên được tạo riêng để hỗ trợ văn bản.
• Trắc chấm điểm hàng trămcho phép học sinh kiểm tra sự hiểu biết của mình về các
khái niệm được giải thích thích hợp trong văn bản với phản hồi ngay lập tức.
• Trao đổi bản đồgiúp sinh viên hiểu các nguyên tắc và ứng dụng của các cốt lõi trao
đổi đường truyền. Học sinh có thể làm việc thông qua các hướng dẫn hướng dẫn với các
câu hỏi được đánh giá được nhúng hoặc tự mình khám phá Bản đồ trao đổi chất bằng
cách sử dụng chức năng kéo và thu phóng của bản đồ.
• Video giải quyết vấn đề, do Scott Ensign của Đại học Bang Utah tạo ra, cung cấp trợ giúp giải
quyết vấn đề trực tuyến 24/7 cho sinh viên. Thông qua cách tiếp theo bao gồm hai phần, mỗi video
dài 10 phút bao gồm một vấn đề quan trọng trong sách giáo khoa đại diện cho một chủ đề mà học
sinh thường gặp khó khăn để nắm chắc. Trước đó, Tiến sĩ Ensign mô tả một chiến lược giải quyết vấn
đề đã được chứng minh và sau đó áp dụng chiến lược đó cho vấn đề hiện tại theo các cách rõ ràng,
ngắn gọn. Học sinh có thể dễ dàng tạm dừng, tua lại và xem lại bất kỳ bước nào họ muốn cho đến khi
nắm chắc không chỉ giải pháp mà còn cả lý do đằng sau nó. Việc giải quyết vấn đề theo cách này được
thiết kế để giúp học sinh giỏi hơn và tự động hơn trong việc áp dụng các chiến lược chính khi giải các
bài toán trong sách giáo khoa và bài kiểm tra khác.
• nhân vật sốngcho phép học sinh xem trực tuyến các hình minh họa trong sách giáo
khoa về cấu trúc protein ở dạng 3-D tương tác bằng cách sử dụng Jmol. Học sinh có thể phóng
to và xoay 54 cấu trúc “ống” để hiểu rõ hơn về bản chất ba chiều của chúng và có thể thử
nghiệm các kiểu hiển thị khác nhau (lấp đầy khoảng trống, bóng và viết, ruy băng, khung life)
bằng giao diện thân thiện với người dùng. giao diện.
• giá tự động của công cụcho phép học sinh kiểm tra sự hiểu biết của mình bằng cách làm bài
kiểm tra trắc nghiệm trực tuyến được cung cấp cho mỗi chương trình, cũng như bài kiểm tra tổng
hợp học.
• Kỹ thuật hoạt hìnhminh họa các thí nghiệm kỹ thuật được mô tả trong văn bản.
xTrưởng phòng
Đường cong học tậplà một công cụ đánh giá tự động giúp các chuyên
gia đánh giá tiến bộ của họ. Học sinh có thể kiểm tra mức độ hiểu biết
của mình bằng cách làm bài kiểm tra trắc nghiệm trực tuyến được cung
cấp cho mỗi chương trình, cũng như bài kiểm tra hóa học tổng quát.
Giảng viên
các tính năng được liệt kê ở trên cho cộng đồng sinh viên:
list điện tửGiáo viên dạy Sách điện tử có thể giao cho cô ấy toàn bộ
sách khoa học hoặc một phiên bản tùy chỉnh bao gồm các chương trình
tương thích với chương trình giáo dục của họ. Họ có thể chọn thêm ghi chú
vào bất kỳ trang nào của Sách điện tử và chia sẻ những ghi chú này với học
sinh của mình. Những ghi chú này có thể bao gồm văn bản, hình ảnh động
hoặc hình ảnh.
• Câu hỏi nhấp chuộtđược sắp xếp phù hợp với các khái niệm chính và quan niệm sai sót trong mỗi
chương trình để học viên có thể đánh giá mức độ hiểu bài của sinh viên trong thời gian thực hiện các bài luận.
• Bài giảng PowerPoint mới đã được cập nhậtđã được phát triển để giảm thiểu thời gian chuẩn bị cho
người mới sử dụng cuốn sách. Những tập tin này cung cấp các bài giải khuyên mẹo bao gồm các minh họa và
tóm tắt chính mà người hướng dẫn có thể điều chỉnh cho phù hợp với phong cách học tập của họ.
• Update hình ảnh và bảng sách giáo khoađược cung cấp dưới dạng JPEG tệp có độ phân giải
cao. Đặc biệt, JPEG cũng được cung cấp trong các tệp PowerPoint đặc biệt.
• Ngân hàng đề thi, của Harvey Nikkel thuộc Đại học Bang Grand Valley, Susan Knock
thuộc Đại học Texas A&M tại Galveston và Joseph Provost của Đại học Bang Minnesota
Moorhead, cung cấp hơn 1500 câu hỏi ở dạng Word có thể chỉnh sửa.
• Mục tiêu và tóm tắt chương trình học của chương trình
• Bài toán tự đánh giá, bao gồm các câu hỏi trắc nghiệm, câu trả lời
ngắn, câu hỏi kết nối, bài toán thử thách và câu trả lời của họ
• Giải thích mở rộng các chương trình bài toán cuối cùng trong sách giáo khoa
Lời nói đầu xi
NHỮNG CHI TIẾT LÂM SÀNG Biểu tượng này báo hiệu sự bắt đầu của Thông tin chi tiết về lâm sàng sẵn có trong văn bản.
Những thảo dược trong chức năng của các cơ quan có thể dẫn đến bệnh tật (tr. 14) Đường 6 cacbon được phân tách thành hai đường 3 cacbon
Tình trạng bệnh lý sẽ xảy ra nếu lượng protein ăn vào không đủ mảnh vỡ (tr. 287)
chưa đủ (tr. 44) Tiêu thụ quá nhiều fructose có thể dẫn đến bệnh lý
Sự hiền lành trong cấu trúc collagen dẫn đến bệnh lý điều kiện (tr. 295)
điều kiện (tr. 57) Nhiều người không được tải sữa vì thiếu chất
Sự gấp rút và tập hợp protein có liên quan đến một số lactase (tr. 297)
bệnh thần kinh (tr. 63) Galactose có độc tính cao nếu thiếu transferase (tr. 298) Quá trình glycolysis là
Các biến có thể trongKMcó thể gây ra hậu quả sinh học (tr. 114) một đặc tính của các tế bào đang phát triển nhanh chóng (tr. 304) Ung thư và
Giảm kiểm soát dịch lập có thể dẫn đến bệnh tật luyện tập thể dục ảnh hưởng đến quá trình glycolysis cách tương tự
điều kiện (tr. 123) thời trang (tr. 305)
Penicillin vô hiệu hóa một loại enzyme quan trọng trong vi khuẩn Insulin không thể ức chế quá trình tạo glucose ở bệnh tiểu đường loại 2 (tr. 323)
tổng hợp thành tế bào (tr. 138) Chu kỳ chất hóa học đại tín hiệu trao đổi chất (tr. 323)
Hình ảnh cộng hưởng từ các chức năng của các vùng được tìm thấy Tinh hòa hòa bình của pyruvate dehydrogenase dẫn đến axit lactic
không xử lý thông tin cảm giác giác giác (tr. 152) Ái lực nhiễm toàn (tr. 338)
oxy của Hemoglobin được điều chỉnh để đáp ứng Hoạt tính pyruvate dehydrogenase kinase được tăng cường tạo điều kiện thuận lợi cho
nhu cầu môi trường (tr. 154) sự phát triển của bệnh ung thư (tr. 339)
Bệnh thiếu máu hồng cầu liềm là bệnh do đột biến gen Sự gián đoạn trong quá trình chuyển hóa pyruvate là nguyên nhân gây ra
huyết sắc tố (tr. 157) bệnh beriberi (tr. 339)
Bệnh thalassemia xảy ra do mất cân bằng sản phẩm Những thảo dược trong chu trình axit citric góp phần vào sự phát triển của bệnh
chuỗi hemoglobin (tr. 159) ung thư (tr. 354)
Glucose là đường khử (tr. 171) Mất cụm sắt-lưu huỳnh dẫn đến chứng mất điều hòa Friedreich (tr. 371)
Hormon erythropoietin là một glycoprotein (tr. 178) Proteoglycan là ATP synthase có thể được điều hòa (tr. 395)
thành phần quan trọng của miếng thịt (tr. 179) Chất nhớt là thành Quá trình oxy hóa phosphoryl có thể bị ức chế ở nhiều mức độ
phần glycoprotein của chất nhầy (tr. 180) giai đoạn (tr. 398)
Thiếu glycosyl hóa có thể dẫn đến tình trạng bệnh lý (tr. 182) Bệnh nhân có thể được phát hiện ngày càng nhiều
Lectin tạo điều kiện cho Nhà phát triển (tr. 183) số (tr. 399)
Vi-rút cúm liên kết với dư lượng axit sialic (tr. 183) Lão hóa sớm Bệnh của cô là thiếu phosphorylase (tr. 453) Đái
có thể là kết quả của việc gắn thiết bị sai cách. tháo đường là thiếu insulin và
nhóm kỵ nước thành protein (tr. 199) dư thừa glucagon (tr. 466)
Các lipid túi có thể được hình thành từ phospholipid (tr. Một sự hiểu biết sinh hóa về các bệnh lưu trữ glycogen là
207) Sự kết hợp của prostaglandin H2synthase-1 với có thể (tr. 467)
yên giải thích cho hoạt động của aspirin (tr. 211) Tình Con đường pentose phosphate cần thiết cho tế bào nhanh chóng
trạng kháng đa thuốc làm nổi bật dòng máy bay êm ái trưởng trưởng (tr. 481)
với ATP liên kết miền (tr. 214) Thiếu glucose 6-phosphate dehydrogenase gây ra tình trạng nghiện-
Bệnh Harlequin ichthyosis là hậu quả nghiêm trọng của một biến thể đột biến ở một Thiếu máu giãn huyết gây ra (tr. 481) Triacylglycerol được thủy
Protein vận hành ABC (tr. 214) phân bởi sự kích thích của hormone
Digitalis ức chế Na+–K+bằng cách chặn nó lipase (tr. 490)
khử photpho (tr. 215) Tình trạng bệnh xảy ra nếu axit béo không thể xâm nhập vào cơ thể
Biến đổi protein kinase A có thể gây bệnh Cushing ty thể (tr. 493)
chứng chỉ (tr. 230) Chế độ ăn ketogen có thể có đặc tính chữa bệnh (tr. 498) Bệnh tiểu
Bệnh tật và ho gà là do G-protein biến đổi đường có thể dẫn đến trạng thái dư thừa xeton trong cơ khí sạch sẽ
hoạt động (tr. 231) sản lượng (tr. 499)
Một số có thể chứa các tyrosine kinase miền bên trong chúng Thể ketone là nguồn nguyên liệu quan trọng trong quá trình
cấu hình cộng giá trị (tr. 235) chết đói (tr. 500)
Sự chuyển đổi proto-oncogenes thành oncogenes làm gián đoạn Một số axit béo có thể góp phần vào sự phát triển của
điều hòa sự phát triển của tế bào (tr. 239) tình trạng bệnh lý (tr. 501)
Protein kinase ức chế có thể chống lại hiệu ứng thư Quá trình chuyển hóa axit béo được thay đổi trong tế bào khối u (tr.
ma túy (tr. 240) 513) Một axit béo nhỏ gây ra vấn đề lớn (tr. 513) Aspirin phát huy tác
Quá trình tiêu hóa protein bắt đầu trong dạ dày (tr. 248) Bệnh Celiac dụng của nó bằng cách biến đổi cộng hóa trị một khóa
là kết quả công việc không thể tiêu hóa đúng cách enzyme (tr. 515)
một số protein định nghĩa tối đa (tr. 251) Phosphatidylcholine là một loại phospholipid dồi dào (tr.
Tập tin phụ thuộc vào nhiều cách khác nhau để tạo ra ATP (tr. 265) Missing 526) Ganglioside đóng vai trò là nơi liên kết của mầm bệnh
pantothenate được kích hoạt dẫn đến rối loạn thần kinh. (tr. 527) Chuyển hóa lipid bị gián đoạn dẫn đến suy hô hấp
vấn đề (tr. 271) chứng chỉ và bệnh Tay–Sachs (tr. 528)
xiiLời nói đầu
Sự vắng mặt của LDL có thể dẫn đến bệnh lý gia đình Việc phân tách các chuỗi DNA Yêu cầu các công cụ helicase và
tăng cholesterol huyết và lúa mạch mạch (tr. 536) Vòng tuần Thủy phân ATP (tr. 630)
hoàn của thể thức ăn LDL được điều hòa (tr. 537) HDL phải như Topoisomerase của vi khuẩn là mục tiêu điều trị (tr. 632) Telomere
bảo vệ chống lại chứng hoa cỏ mạch (tr. 537) Việc quản lý lâm được sao chép bởi telomerase, một enzyme chuyên biệt
sàng cholesterol có thể được thực hiện Polymerase mang mẫu RNA của chính nó (tr. 639) Một số bệnh
được hiểu ở mức độ sinh hóa (tr. 538) Muối tạo điều kiện hấp di truyền gây ra bởi sự mở rộng các lần lặp lại của
thụ lipid (tr. 539) Vitamin D cần thiết cho sự phát triển của ba nucleotide (tr. 644)
xương (tr. 541) Androgen có thể được sử dụng để tăng cường Nhiều bệnh ung thư là do sự chữa lành của
thể chất tăng cường một cách nhân tạo ADN (tr. 650)
performance (tr. 542) Nhiều chất gây ung thư có thể được phát hiện bằng khả năng gây đột biến của chúng
aminotransferase không có tốc độ trong máu phục vụ mong đợi hành động đối với vi khuẩn (tr. 650)
chức năng (tr. 553) Một số ký sinh ức chế phiên mã (tr. 667)
Chuyển hóa trong bối cảnh: Giảm tốc độ truyền tải của nguyên nhân chu trình urê Nhiều tế bào vi khuẩn giải phóng các tín hiệu hóa học điều hòa hòa gen
tăng amoni huyết (tr. 558) biểu hiện ở các tế bào khác (tr. 670) Sử dụng chất tăng cường
Lỗi sinh học xảy ra trong quá trình trao đổi chất có thể làm hỏng axit amin không phù hợp có thể gây ung thư (tr. 680) Tế bào gốc đa năng cảm
suy suy thoái (tr. 565) ứng có thể được tạo ra bằng cách
Xác định cơ sở dữ liệu của chứng chỉ kinh nghiệm đưa ra bao yếu tố phiên mã vào tế bào đã đặc biệt
phenylketon đào là một lĩnh vực nghiên cứu tích cực (tr. 566) hóa (tr. 680)
Tetrahydrofolate mang các đơn vị một carbon hoạt hóa (tr. 576) Mức Các loại hormone steroid được nuôi dưỡng là mục tiêu của thuốc
homocysteine cao tương quan với bệnh mạch máu (tr. 578) Con (tr. 683) tàn phá ảnh hưởng đến sự kết hợp tiền mRNA gây bệnh
đường hồi tái mode bazơ pyrimidine (tr. 589) (trang 696)
Một số loại thuốc chống ung thư có giá trị ngăn chặn tổng hợp Hầu hết các pre-mRNA của con người có thể được tổng hợp theo nhiều cách khác nhau để
thymidylat (tr. 595) Mang lại các loại protein khác nhau (tr. 697)
Deoxyribonucleotide tổng hợp được điều khiển bởi truyền ở yếu tố khởi đầu thứ 2 của sinh vật nhân chuẩn gây tò mò
điều hòa ribonucleotide reductase (tr. 597) Việc mất hoạt động tình trạng bệnh lý (tr. 730)
của adenosine deaminase dẫn đến hậu quả nghiêm trọng Một số loại kháng sinh ức chế tổng hợp protein (tr. 730) Độc tố bạch hầu ngăn
suy giảm kết hợp dịch thuật (tr. 598) chặn quá trình tổng hợp protein ở sinh vật nhân chuẩn bằng cách
Bệnh gây ra bởi nồng độ urat trong huyết thanh cao (tr. redirect mode (tr. 731)
599) Hội chứng Lesch–Nyhan là hậu quả nghiêm trọng của Ricin biến đổi RNA ribosome gây tử vong 28S (tr. 732) Các phương
đột biến trong enzyme con đường nghiên cánh (tr. 600) pháp giải mã hệ thống tiếp theo cho phép xử lý nhanh chóng
Thiếu axit folic cung cấp các dị tật bẩm sinh như cột sống xác định trình tự bộ gen hoàn chỉnh (tr. 753) PCR là
bifida (tr. 600) một kỹ thuật mạnh mẽ trong mong đợi y tế, pháp y,
DNA gây tổn thương có thể ức chế sự phát triển của tế bào ung thư (tr. 622) và nghiên cứu về tiến hóa phân tử (tr. 756)
NHỮNG HIỂU BIẾT SINH HỌC Biểu tượng này báo hiệu sự bắt đầu của sự hiểu biết sâu sắc về sinh học trong văn bản.
Sự thích ứng của huyết sắc tố cho phép vận hành oxy ở cực cao Một dịch vụ phun núi lửa có thể ảnh hưởng đến quá trình quang hợp trên toàn thế giới
Glucosinolate bảo vệ thực vật và tăng thêm hương vị cho chế độ ăn uống Tại sao bánh mì trở nên ôi thiu: vai trò của tinh bột (tr. 434) Sự
của chúng ta (tr. 173) Nhóm máu dựa trên mô hình glycosyl hóa protein (tr. suy giảm glycogen đồng thời điểm bắt đầu mệt mỏi
181) Mạng vi khuẩn tồn cực trị được xây dựng từ lipid ether với (trang 455)
phân nhánh chuỗi (tr. 197) Sự thiếu hụt glucose 6-phosphate dehydrogenase sẽ gây ra
Độc lập sử dụng các kênh ion để tạo ra nhiệt độ lợi thế tiến hóa trong một số trường hợp hợp (tr. 483)Ngủ
hình ảnh (tr. 216) đông gây ra các vấn đề về xử lý trâu (tr. 558) Urê không phải là
Rắn tiêu hóa từ trong ra ngoài (tr. 254) Quá trình tăng phương tiện duy nhất để xử lý lượng dư thừa
cường cung cấp năng lượng hữu ích khi không có đến (tr. 559)
oxy (tr. 294) Các enzyme của purine tổng hợp có liên quan đến
Ty thể là kết quả của một sự kiện nội cộng sinh (tr. 365) lẫn nhau trong cơ sở sống (tr. 592)
Zone death: hô hấp quá nhiều (tr. 377) Nhiều tế bào vi khuẩn giải phóng các tín hiệu hóa học điều hòa hòa gen
Sự chia cặp được điều hòa sẽ dẫn đến sự sinh nhiệt (tr. 396) Lục biểu thức trong các ô khác (tr. 670)
lạp, giống như ty thể, phát sinh từ cơ chế nội cộng sinh Chỉnh sửa RNA bằng cách thay đổi các protein được mã hóa bởi mRNA (tr. 698) Các
sự kiện (tr. 409) phương pháp giải mã hệ thống tiếp theo được phép thực hiện nhanh chóng
Chất diệp lục trong khoai tây cho thấy hiện tượng độc tố (tr. 413) Nhiều loại xác định trình tự bộ gen hoàn chỉnh (tr. 753) PCR là
thuốc diệt cỏ ức chế phản ứng nhẹ nhàng của một kỹ thuật mạnh mẽ trong mong đợi y tế, pháp y,
quang hợp (tr. 421) và nghiên cứu về tiến hóa phân tử (tr. 756)
Lời nói đầu xiii
Đã nhận được
Chúng tôi xin gửi lời cảm ơn tới các học viên và giáo sư đã xem lại các chương trình của cuốn sách này. Đôi
mắt sắc sâu và những hiểu biết sâu sắc của họ đã ảnh hưởng mạnh mẽ đến chúng tôi khi chúng tôi viết và
định hình các bản thảo khác nhau của từng chương để tạo nên tác phẩm hoàn thiện điều này.
Nhà khoa học, nhà văn và chính khách Đức Johann Wolfgang von Goethe đã từng nhận xét:
“Suy nghĩ thì dễ, hành động thì khó, và biến suy nghĩ của mình thành hành động là điều khó
khăn nhất trên thế giới”. Mặc dù chúng tôi có thể không đồng ý khẳng định của Goethe rằng
suy nghĩ rất dễ dàng nhưng chúng tôi hoàn toàn đồng ý với phần còn lại của trích dẫn. Nghĩ về
hóa sinh và sau đó viết những suy nghĩ đó vào một cuốn sách rõ ràng, chào đón, kích thích và
đầy thử thách, nếu không muốn nói là điều khó khăn nhất trên thế giới, thì vẫn rất phong phú
khe. Nhiệm vụ này sẽ hoàn toàn không thể thực hiện được nếu chúng tôi không có những đồng
nghiệp tuyệt vời tại WH Freeman. Họ là những người thông minh, tận tâm, chug, đã dạy chúng
tôi nhiều về cách trình bày khoa học cho học sinh và trong quá trình đó đã phát huy những điều
tốt nhất trong chúng tôi. Mặc dù chúng tôi rất hân hạnh được làm việc với các cộng tác viên của
mình tại WH Freeman trong một số dự án, nhưng chúng tôi đánh giá cao và biết ơn những nỗ
lực và hướng dẫn của họ giờ đây vẫn chân thành như khi chúng tôi vẫn là những tác giả thiếu
kinh nghiệm. Trải nghiệm của chúng tôi với phiên bản này cũng thú vị và bổ sung như các dự
án trước đây của chúng tôi. Chúng tôi cần phải cảm ơn nhiều người vì trải nghiệm này, một số
người trong số họ đã từng làm việc giống chúng tôi trước đây và một số người mới bắt đầu nỗ
lực. Đầu tiên, chúng tôi xin ghi nhận sự kích động, sự chiến đấu, lời khuyên tuyệt vời và sự hài
hước của Nhà xuất bản Kate Ahr Parker. Kate có thể gợi ý những thử thách khó khăn một cách
duyên dáng và bình tĩnh đến mức chúng sẵn sàng chấp nhận thử thách. Người mới trong danh
sách nhóm của chúng tôi là Biên thành viên cao cấp về Mua lại, Lauren Schultz. Tình trạng nhiệt
độ không ngừng nghỉ của cô là nguồn hỗ trợ và tiếp tục bổ sung năng lượng cho hoạt động
nhóm. Người mới trong nhóm xuất bản sách của chúng tôi cho ấn bản này là Heidi Bamatter,
Biên tập viên Phát triển của chúng tôi. Heidi là một trong những biên tập viên phát triển sản
xuất sắc nét mà chúng tôi rất vui được làm việc cùng tại Freeman. Sự sáng suốt, chiến đấu và sự
hướng dẫn của cô đã nỗ lực này thành công và thú vị. Elizabeth Geller, Biên tập viên Dự án Cấp
cao, đã quản lý tiến trình của dự án với hiệu quả đáng ngưỡng mộ. Teresa Wilson, Biên tập viên
thảo luận của chúng tôi, đã nâng cao tính tính nhất về mặt văn học và sự rõ ràng của văn bản.
Vicki Tomaselli, Giám đốc thiết kế, đã tạo ra một thiết kế và bố trí cuốn sách trở nên thân thiện
và dễ tiếp cận.Christine Buese và Jacquelyn Wong, Biên tập viên Ảnh và Nhà nghiên cứu Ảnh,
lần lượt tìm thấy những bức ảnh giúp đạt được một trong những mục tiêu chính của chúng tôi
—liên kết hóa sinh với thế giới hàng ngày của học sinh đồng thời biến văn bản trở thành một
tác phẩm trực quan. Janice Donnola, Điều phối viên Minh họa, đã khéo léo chỉ đạo việc thể hiện
các hình minh họa mới. Paul Rohloff, Giám đốc sản xuất, đảm bảo rằng những khó khăn trong
việc lên lịch, sáng tác và sản xuất đều dễ dàng được khắc phục. Chúng tôi đánh giá cao sự hỗ
trợ nhiệt tình của đội ngũ nhân viên bán hàng tại WH Freeman hơn những gì chúng tôi có thể
diễn tả bằng lời. Nếu không có lực lượng bán hàng nỗ lực thuyết phục các giáo sư xem xét cuốn
sách của chúng tôi thì tất cả sự phấn khích và nhiệt tình của chúng tôi đối với cuốn sách này sẽ
trở nên vô nghĩa. Chúng tôi cũng cảm ơn Susan Winslow.
Cũng xin gửi lời cảm ơn đến nhiều đồng nghiệp tại các tổ chức của chúng tôi cũng như trên khắp
đất nước, những người đã kiên nhẫn trả lời các câu hỏi của chúng tôi và khuyến khích chúng tôi thực
hiện nhiệm vụ của mình. Cuối cùng, chúng ta nợ một lời cảm ơn tới gia đình mình. Nếu không có sự hỗ
trợ, an ủi và thông cảm của họ, dự án này sẽ không bao giờ có thể được thực hiện chứ đừng nói đến
việc hoàn thành thành công.
Nội dung tóm tắt
xv
Nội dung
PHẦN I PHẦN 2
Thiết kế phân tử của cuộc sống Thành phần và cấu trúc protein 35
xvi
Nội dung xvii
4.5 Trình tự axit amin của protein quyết định 6.4 Enzyme tạo điều kiện cho sự hình thành
cấu trúc ba chiều của nó 60 trạng thái chuyển tiếp 103
Protein gấp lại bằng sự ổn định lũy tiến của Sự hình thành phức hợp enzyme-cơ chất là
Trung gian thay vì tìm kiếm ngẫu nhiên 61 Bước đầu tiên trong xúc tác enzyme 103
Một số protein vốn không có cấu trúc và có thể Các vị trí hoạt động của enzyme có một số đặc điểm chung 104
Tồn tại ở nhiều dạng 62 Năng lượng liên kết giữa enzyme và cơ chất là
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngSự sai lệch và tổng hợp Quan trọng đối với xúc tác 105
protein có liên quan đến một số bệnh thần kinh 63 Các chất tương tự trạng thái chuyển tiếp là chất ức chế enzyme mạnh 106
Chương 5 Kỹ thuật hóa sinh protein 69
Chương 7 Động học và sự điều hòa 111
5.1 Proteome là đại diện chức năng của bộ gen
7.1 Động học là nghiên cứu về tốc độ phản ứng 112
70
7.2 Mô hình Michaelis–Menten mô tả động
5.2 Tinh chế protein là bước đầu tiên để hiểu
học của nhiều loại enzyme 113
chức năng của nó 70
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngCác biến thể trongK
Protein có thể được tinh chế dựa trên sự khác biệt về
MCó thể có hậu quả sinh lý 114
Tính chất hóa học của chúng 71
KMVàV.tối đaGiá trị có thể được xác định bằng một số phương 115
Protein phải được loại bỏ khỏi tế bào để được tinh chế 71
tiện KMVàV.tối đaGiá trị là đặc điểm quan trọng của enzyme k 115
Protein có thể được tinh chế theo độ hòa tan, kích thước,
Tính phí và mối quan hệ ràng buộc 72 con mèo /KMLà thước đo hiệu quả xúc tác 116
Protein có thể được phân tách bằng điện di trên gel và Hầu hết các phản ứng sinh hóa bao gồm nhiều cơ chất 117
Hiển thị 74 7.3 Enzyme dị lập thể là chất xúc tác và cảm biến thông
Một kế hoạch thanh lọc có thể được đánh giá định lượng 77 tin 118
5.3 Kỹ thuật miễn dịch học được sử dụng để tinh chế và Enzim dị lập thể được điều hòa bởi các sản phẩm của
xác định đặc tính của protein 78 Con Đường Dưới Sự Kiểm Soát Của Họ 120
Ly tâm là một phương tiện tách protein 78 Các enzyme được điều hòa theo phương pháp đồng không thể phù hợp với
Ly tâm gradient cung cấp một xét nghiệm cho Động học Michaelis–Menten 121
Phức hợp thụ thể Estradiol 79 Enzyme dị lập thể phụ thuộc vào sự thay đổi trong bậc bốn
Có thể tạo ra kháng thể đối với các protein cụ thể 80 Kết cấu 121
Kháng thể đơn dòng với hầu hết mọi loại kháng thể mong muốn Phân tử điều chỉnh Điều chỉnh R tôiCân bằng T 122
Tính đặc hiệu có thể được chuẩn bị sẵn sàng 81 Mô hình tuần tự cũng có thể giải thích
Thụ thể estrogen có thể được tinh chế bằng cách Hiệu ứng dị lập thể 123
Giảm miễn dịch 83 Cái nhìn sâu sắc lâm sàngMất kiểm soát dị lập thể
Protein có thể được phát hiện và định lượng bằng có thể dẫn đến tình trạng bệnh lý 123
việc sử dụng xét nghiệm hấp thụ miễn dịch liên kết với enzyme 84 7.4 Có thể nghiên cứu từng phân tử một enzyme 123
Western Blotting cho phép phát hiện protein
Phân tách bằng điện di gel 84 Chương 8 Cơ chế và chất ức chế 131
5.4 Xác định cấu trúc bậc một giúp hiểu biết về 8.1 Một số chiến lược xúc tác cơ bản được nhiều
chức năng của protein 86 enzyme sử dụng 131
Phép đo khối phổ có thể được sử dụng để xác định một 8.2 Hoạt động của enzyme có thể được điều chỉnh bởi
Khối lượng, bản sắc và trình tự của protein 88 nhiệt độ, độ pH và các phân tử ức chế 132
Axit amin là nguồn của nhiều loại hiểu biết sâu sắc 90 Nhiệt độ tăng cường tốc độ xúc tác của enzyme
phản ứng 132
PHẦN 3
Hầu hết các enzyme đều có độ pH tối ưu. Các enzyme có thể bị ức 133
Các khái niệm cơ bản và động học của enzyme 95
chế bởi các phân tử cụ thể. Các chất ức chế thuận nghịch có thể 134
Chương 6 Khái niệm cơ bản về hoạt động của enzyme 97 phân biệt được về mặt động học 135
6.1 Enzyme là chất xúc tác mạnh mẽ và có tính đặc hiệu cao 97 Các chất ức chế không thể đảo ngược có thể được sử dụng để lập bản đồ
Enzyme phân giải protein minh họa phạm vi của enzyme Trang web đang hoạt động 137
Tính đặc hiệu 98 Cái nhìn sâu sắc lâm sàngPenicillin làm bất hoạt một loại enzyme quan trọng trong quá
Có sáu loại enzyme chính 98 trình tổng hợp thành tế bào vi khuẩn một cách không thể đảo ngược 138
6.2 Nhiều enzyme cần có đồng yếu tố để hoạt động 99 8.3 Chymotrypsin minh họa các nguyên tắc cơ bản
6.3 Năng lượng tự do Gibbs là một hàm nhiệt của xúc tác và ức chế 140
động hữu ích để tìm hiểu về enzyme 100 Serine 195 là cần thiết cho hoạt động Chymotrypsin 140
Sự thay đổi năng lượng tự do cung cấp thông tin về Hoạt động của Chymotrypsin tiến hành theo hai bước được liên kết bởi một
tính tự phát nhưng không phải tốc độ phản ứng 100 Chất trung gian liên kết cộng hóa trị 141
Sự thay đổi năng lượng tự do tiêu chuẩn của một phản ứng là Vai trò xúc tác của Histidine 57 được chứng minh bằng
Liên quan đến hằng số cân bằng 101 Ghi nhãn mối quan hệ 142
Enzyme làm thay đổi tốc độ phản ứng nhưng không làm thay đổi phản ứng Serine là một phần của bộ ba xúc tác bao gồm
Cân bằng 102 Histidine và axit aspartic 142
xviiiNội dung
Chương 9 Hemoglobin, một loại protein dị lập thể 149 Cái nhìn sâu sắc sinh họcNhóm máu dựa trên
9.1 Hemoglobin thể hiện hành vi hợp tác 150 mô hình glycosyl hóa protein 181
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngThiếu glycosyl hóa có thể
9.2 Myoglobin và Hemoglobin liên kết với oxy trong
dẫn đến tình trạng bệnh lý 182
nhóm Heme 150
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngHình ảnh cộng hưởng 10,4 Lectin là các protein liên kết carbohydrate
từ chức năng tiết lộ các vùng của não xử lý thông cụ thể 182
tin cảm giác 152 Lectin thúc đẩy sự tương tác giữa các tế bào 183
9.3 Hemoglobin liên kết với oxy một cách hợp tác 152 Cái nhìn sâu sắc lâm sàngLectin tạo điều kiện
phát triển phôi 183
9.4 Chất điều hòa dị lập thể xác định ái
lực oxy của Hemoglobin 154 Cái nhìn sâu sắc lâm sàngVirus cúm liên kết với
dư lượng axit sialic 183
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngÁi lực oxy của Hemoglobin được
điều chỉnh để đáp ứng nhu cầu môi trường 154
Chương 11 Lipid 189
Cái nhìn sâu sắc sinh họcSự thích ứng với huyết sắc tố cho phép
vận chuyển oxy trong môi trường khắc nghiệt 155 11.1 Axit béo là nguồn nhiên liệu chính 190
Axit béo khác nhau về chiều dài chuỗi và mức độ
9.5 Ion hydro và carbon dioxide thúc đẩy giải
Không bão hòa 191
phóng oxy 155
Mức độ và loại không bão hòa là quan trọng
9.6 Đột biến gen mã hóa tiểu đơn vị huyết sắc
tới sức khỏe 192
tố có thể gây bệnh 156
11.2 Triacylglycerol là dạng dự trữ của axit
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngThiếu máu hồng cầu hình
liềm là bệnh do đột biến huyết sắc tố 157
béo 193
Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚIBệnh thalassemia là 11.3 Có ba loại lipid màng phổ biến
do sản xuất chuỗi huyết sắc tố mất cân bằng 159 194
Phospholipid là lớp chính của
PHẦN 4 Lipid màng 194
Carbohydrate và Lipid 165 Lipid màng có thể bao gồm carbohydrate 196
Chương 10 Carbohydrate 167 Steroid là lipid có nhiều vai trò khác nhau 196
Cái nhìn sâu sắc sinh họcMàng của vi khuẩn ưa cực trị được
10.1 Monosaccharide là carbohydrate đơn giản nhất 168
xây dựng từ các lipit Ether với các chuỗi phân nhánh 197
Nhiều loại đường phổ biến tồn tại ở dạng tuần hoàn 169
Lipid màng chứa chất ưa nước và
MỚIVòng Pyranose và Furanose có thể giả sử một nửa kỵ nước 197
Cấu hình khác nhau 171
Một số protein được biến đổi bởi cộng hóa trị
Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚIGlucose là đường khử 171 Sự gắn kết của các nhóm kỵ nước 198
Monosaccharid được kết hợp với rượu và
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngLão hóa sớm có thể xảy ra do
Amin thông qua liên kết glycosid 172 sự gắn kết không đúng cách của nhóm kỵ nước với
Cái nhìn sâu sắc sinh họcGlucosinolates bảo vệ thực vật và thêm protein 199
hương vị cho chế độ ăn của chúng ta 173
10.2 Monosacarit được liên kết để tạo thành PHẦN 5
carbohydrate phức tạp 173
Màng tế bào, kênh, máy bơm và thụ thể
Các enzyme cụ thể chịu trách nhiệm về Oligosacarit
Cuộc họp 173
203
Sucrose, Lactose và Maltose là phổ biến
Disaccharide 174
Chương 12 Cấu trúc và chức năng
Glycogen và tinh bột là dạng dự trữ Glucose 175 màng 205
Cellulose, một thành phần cấu trúc của thực vật, là 12.1 Phospholipid và Glycolipid tạo thành tấm
Được tạo thành từ chuỗi Glucose 175 lưỡng phân tử 206
10.3 Carbohydrate được gắn vào protein để tạo Cái nhìn sâu sắc lâm sàngCác túi lipid có thể được hình
13.1 Sự truyền tín hiệu phụ thuộc vào mạch Tiền chất 248
phân tử 225 14.2 Protease tiêu hóa protein thành axit amin và
13.2 Protein thụ thể truyền thông tin vào tế bào peptide 248
227 Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚIQuá trình tiêu hóa protein bắt đầu
13.4 Chuyển hóa trong bối cảnh: Tín hiệu Insulin điều chỉnh sự cân bằng của các phản ứng kết hợp 261
quá trình trao đổi chất 236 Tiềm năng chuyển hóa Phosphoryl cao của
Cơ quan thụ cảm insulin là một dimer đóng xung quanh ATP là kết quả của sự khác biệt về cấu trúc giữa ATP và
một phân tử Insulin liên kết 236 các sản phẩm thủy phân của nó 263
xxNội dung
Khả năng chuyển hóa Phosphoryl là một dạng quan trọng của Cái nhìn sâu sắc lâm sàngGalactose có độc tính cao
Chuyển đổi năng lượng tế bào 264 nếu thiếu transferase 298
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngTập thể dục phụ thuộc vào nhiều 16.4 Con đường Glycolytic được kiểm soát chặt chẽ 299
phương tiện tạo ATP khác nhau 265 Quá trình đường phân trong cơ được điều chỉnh bằng phản hồi
Phốt phát đóng vai trò nổi bật trong Sự ức chế để đáp ứng nhu cầu ATP 299
Quá trình sinh hóa 266 Điều hòa quá trình đường phân ở gan
15.4 Quá trình oxy hóa nhiên liệu carbon là Tương ứng với tính linh hoạt sinh hóa của
nguồn năng lượng tế bào quan trọng 266 gan 300
Quá trình oxy hóa carbon được kết hợp với sự khử 266 Một nhóm chất vận chuyển cho phép Glucose đi vào và
Các hợp chất có khả năng chuyển Phosphoryl cao Để lại tế bào động vật 303
Có thể kết hợp quá trình oxy hóa carbon với quá trình tổng hợp ATP 267 Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚIGlycolysis hiếu khí là một đặc
tính của các tế bào phát triển nhanh chóng 304
15.5 Con đường trao đổi chất chứa nhiều họa tiết lặp đi lặp
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngUng thư và tập thể dục ảnh hưởng đến quá
lại 268
trình đường phân theo cách tương tự 305
Các nhà cung cấp dịch vụ được kích hoạt minh họa cho thiết kế mô-đun và
16.5 Trao đổi chất trong bối cảnh: Quá trình đường phân giúp tế
Nền kinh tế trao đổi chất 268
bào Beta tuyến tụy cảm nhận được glucose 305
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngThiếu Pantothenate được kích
hoạt dẫn đến các vấn đề về thần kinh 271 Chương 17 Tân tạo glucose 313
Nhiều chất mang được kích hoạt có nguồn gốc từ vitamin 271 17.1 Glucose có thể được tổng hợp từ tiền
15.6 Quá trình trao đổi chất được điều hòa chất không chứa carbohydrate 314
theo ba cách chính 273 Quá trình tạo glucose không phải là sự đảo ngược hoàn toàn của
Lượng enzyme được kiểm soát Hoạt động 274 Đường phân 314
xúc tác được điều chỉnh 274 Sự chuyển đổi Pyruvate thành Phosphoenolpyruvate
Khả năng tiếp cận của chất nền được quy định 275 Bắt đầu với sự hình thành Oxaloacetate 316
Oxaloacetate được đưa vào tế bào chất và
PHẦN 7 Chuyển hóa thành Phosphoenolpyruvate 317
Đường phân và tân tạo glucose 281 Sự chuyển đổi Fructose 1,6-bisphosphate thành
Fructose 6-phosphate và Orthophosphate là một bước không
Chương 16 Đường phân 283 thể đảo ngược 318
16.1 Đường phân là con đường chuyển hóa năng lượng 284 Việc tạo ra Glucose tự do là một điều quan trọng
Hexokinase bẫy glucose trong tế bào và Điểm kiểm soát 319
Bắt đầu quá trình đường phân 284 Sáu nhóm Phosphoryl có khả năng chuyển giao cao là
Fructose 1,6-bisphosphate được tạo ra từ Glucose Dùng để tổng hợp Glucose từ Pyruvate 319
6-photphat 286 17.2 Quá trình tạo glucose và quá trình đường phân
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngĐường sáu cacbon được được điều hòa qua lại 320
tách thành hai mảnh ba cacbon 287 Năng lượng tích lũy quyết định liệu đường phân hay
Sự oxy hóa của một Aldehyd tăng cường sự hình thành Quá trình tạo glucose sẽ tích cực hơn 320
của hợp chất có khả năng chuyển Phosphoryl Sự cân bằng giữa quá trình đường phân và quá trình tạo glucose
cao 288 trong gan nhạy cảm với nồng độ glucose
ATP được hình thành nhờ sự vận chuyển Phosphoryl từ trong máu 321
1,3-Bisphosphoglycerate 289 Cái nhìn sâu sắc lâm sàngInsulin không ức chế được quá
ATP bổ sung được tạo ra cùng với quá trình hình thành trình tạo glucose ở bệnh tiểu đường tuýp 2 323
của Pyruvat 290 Cái nhìn sâu sắc lâm sàngChu trình cơ chất khuếch đại
Hai phân tử ATP được hình thành trong quá trình chuyển đổi tín hiệu trao đổi chất 323
chuyển Glucose thành Pyruvate 291 17.3 Trao đổi chất trong bối cảnh: Tiền chất được hình thành bởi
16.2 NAD+Được tái sinh từ quá trình trao đổi chất của cơ bắp được các cơ quan khác sử dụng 324
Pyruvate 291
MỤC 8
Lên men là một phương tiện oxy hóa NADH 292
Chu trình axit citric 329
Cái nhìn sâu sắc sinh họcQuá trình lên men cung cấp năng
lượng có thể sử dụng khi không có oxy 294 Chương 18 Chuẩn bị cho chu kỳ 331
16.3 Fructose và Galactose được chuyển hóa thành chất 18.1 Pyruvate Dehydrogenase tạo thành
trung gian Glycolytic 294 Acetyl Coenzym A từ Pyruvate 332
MỚIFructose được chuyển hóa thành chất trung gian Glycolytic Tổng hợp Acetyl Coenzym A từ
bởi Fructokinase 295 Pyruvate yêu cầu ba enzyme và năm
Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚITiêu thụ quá nhiều coenzym 333
fructose có thể dẫn đến tình trạng bệnh lý 295 Liên kết linh hoạt cho phép Lipoamide di chuyển giữa
NE WGalactose được chuyển đổi thành Glucose 6-phosphate 296 Các trang web hoạt động khác nhau 335
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngNhiều người lớn không 18.2 Phức hợp Pyruvate Dehydrogenase
dung nạp sữa vì thiếu Lactase 297 được điều hòa bởi hai cơ chế 337
Nội dung xx
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngSự điều hòa khiếm khuyết của Chuỗi vận chuyển điện tử là một chuỗi các
Pyruvate Dehydrogenase dẫn đến nhiễm toan lactic 338 Phản ứng oxy hóa-khử kết hợp 368
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngTăng cường hoạt động của Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚIMất cụm sắt-lưu huỳnh dẫn
Pyruvate Dehydrogenase Kinase tạo điều kiện cho bệnh ung đến chứng mất điều hòa Friedreich 371
thư phát triển 339
20.3 Chuỗi hô hấp bao gồm bơm proton và
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngSự gián đoạn quá trình trao đổi
liên kết vật lý với chu trình axit citric
chất pyruvate là nguyên nhân gây bệnh Beriberi 339
371
Các electron thế năng cao của NADH đi vào
Chương 19 Thu hoạch electron từ chu Chuỗi hô hấp tại NADH-Q Oxidoreductase 371
trình 343 Ubiquinol là điểm vào cho các electron từ
19.1 Chu trình axit citric gồm hai giai đoạn 344 FADH2của Flavoprotein 373
19.2 Giai đoạn một oxy hóa hai nguyên tử cacbon để thu Dòng điện tử từ Ubiquinol đến Cytochromec
thập các electron giàu năng lượng 344 Thông qua Q-CytochromecOxidoreductase 373
Citrate Synthase tạo thành Citrate từ Oxaloacetate và Chu trình Q chuyển các electron từ hai electron
Acetyl Coenzym A 344 Chất mang đến chất mang một điện tử và bơm proton 374
Cơ chế ngăn chặn Citrate Synthase CytochromecOxidase xúc tác quá trình khử
Phản ứng không mong muốn 345 Oxy phân tử thành nước 375
Citrate được đồng phân hóa thành Isocitrate 346 Cái nhìn sâu sắc sinh họcVùng chết: Hô hấp
Isocitrate bị oxy hóa và khử carboxyl thành quá nhiều 377
Alpha-Ketoglutarate 346 Các dẫn xuất độc hại của oxy phân tử như Superoxide
Succinyl Coenzym A được hình thành bởi quá trình oxy hóa Các gốc tự do bị loại bỏ bởi các enzyme bảo vệ 377
Khử carboxyl của Alpha-Ketoglutarate 347
19.3 Giai đoạn hai tái tạo Oxaloacetate và thu được
Chương 21 Lực đẩy proton 383
các electron giàu năng lượng 347
21.1 Một gradient proton hỗ trợ quá trình tổng hợp ATP 384
Một hợp chất có khả năng chuyển Phosphoryl cao
Tiềm năng được tạo ra từ Succinyl Coenzym A 347 ATP Synthase được cấu tạo từ chất dẫn proton
Đơn vị và Đơn vị xúc tác 385
Succinyl Coenzym A Synthetase biến đổi
Các loại năng lượng sinh hóa 348 Dòng proton qua ATP Synthase dẫn đến
Oxaloacetate được tái sinh bằng quá trình oxy hóa
Giải phóng ATP bị ràng buộc chặt chẽ 386
Succinate 349 Xúc tác quay là nhỏ nhất thế giới
Chu trình axit citric tạo ra tiềm năng chuyển giao cao Động cơ phân tử 387
Electron, ATP và Carbon Dioxide 349 Dòng proton xung quanh vòng c tạo năng lượng cho ATP
19.4 Chu trình axit citric được điều hòa 352 tổng hợp 388
Chu trình axit citric được kiểm soát ở một số điểm 352 21.2 Con thoi cho phép di chuyển qua
Chu trình axit citric là nguồn sinh tổng hợp màng ty thể 390
Tiền chất 353 Các electron từ NADH tế bào chất đi vào
Chu trình axit citric phải có khả năng diễn ra nhanh chóng Ti thể bằng tàu con thoi 390
Đã bổ sung 353 Sự xâm nhập của ADP vào ty thể gắn liền với
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngKhiếm khuyết trong chu sự ra đi của ATP 392
trình axit citric góp phần phát triển bệnh ung thư 354 Vận chuyển ty thể cho phép trao đổi chất trao đổi chất
19.5 Chu trình Glyoxylate cho phép thực vật và vi khuẩn Giữa tế bào chất và ty thể 393
chuyển đổi chất béo thành carbohydrate 355 21.3 Hô hấp tế bào được điều hòa bởi
nhu cầu ATP 393
PHẦN 9 Quá trình oxy hóa hoàn toàn sản lượng glucose
Oxy hóa phosphoryl 361 30 phân tử ATP 393
Tốc độ phosphoryl hóa oxy hóa được xác định
Chương 20 Chuỗi vận chuyển điện tử 363 do nhu cầu ATP 395
20.1 Quá trình phosphoryl hóa oxy hóa ở sinh
Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚIATP Synthase có thể được
vật nhân chuẩn diễn ra ở ty thể 364
điều chỉnh 395
Ty thể được giới hạn bởi một màng đôi 364
Cái nhìn sâu sắc sinh họcTy thể là kết quả Cái nhìn sâu sắc sinh họcViệc tách rời theo quy định
của một sự kiện nội cộng sinh 365 dẫn đến sinh nhiệt 396
20.2 Phosphoryl hóa oxy hóa phụ thuộc vào sự chuyển Cái nhìn sâu sắc lâm sàngQuá trình phosphoryl hóa oxy hóa có thể bị
Các phản ứng ánh sáng của quang hợp và chu trình Calvin 435
chu trình Calvin 405 Rubisco cũng xúc tác phản ứng oxyase lãng phí 436
C4Con đường tăng tốc của thực vật nhiệt đới
Chương 22 Phản ứng ánh sáng 407 Quang hợp bằng cách tập trung Carbon Dioxide 436
22.1 Quá trình quang hợp diễn ra ở lục lạp 408 Chuyển hóa axit Crassulacean cho phép tăng trưởng ở vùng khô cằn
Cái nhìn sâu sắc sinh họcLục lạp, giống như ty thể, phát Hệ sinh thái 438
sinh từ một sự kiện nội cộng sinh 409
PHẦN 11
22.2 Quang hợp chuyển đổi năng lượng ánh sáng thành năng
Chuyển hóa Glycogen và con đường
lượng hóa học 409
Pentose Phosphate 443
Chất diệp lục là thụ thể chính ở hầu hết
Hệ thống quang hợp 410 Chương 24 Sự thoái hóa Glycogen 445
Tổ hợp thu hoạch nhẹ nâng cao hiệu quả
24.1 Sự phân hủy Glycogen cần một số enzyme 446
của quang hợp 411
Phosphorylase phân cắt Glycogen để giải phóng Glucose
Cái nhìn sâu sắc sinh họcChất diệp lục trong khoai tây
1-photphat 446
cho thấy sự hiện diện của chất độc 413
Một enzyme phân nhánh cũng cần thiết cho
22.3 Hai hệ thống ảnh tạo ra gradient sự phân hủy của glycogen 447
proton và NADPH 413
Phosphoglucomutase chuyển hóa Glucose 1-phosphate
Hệ thống ảnh tôi sử dụng năng lượng ánh sáng để tạo ra sự khử thành Glucose 6-phosphate 448
Ferredoxin, một chất khử mạnh 414
Gan Chứa Glucose 6-phosphatase,
Hệ thống ảnh II chuyển electron sang một enzyme thủy phân không có trong cơ 448
Hệ thống ảnh I và tạo ra một dải proton 415
24.2 Phosphorylase được điều hòa bởi tương tác dị lập
Cytochromeb6fLiên kết hệ thống ảnh II với
thể và quá trình phosphoryl hóa thuận nghịch 449
Hệ thống ảnh I 416
Phosphorylase gan sản xuất glucose để sử dụng
Quá trình oxy hóa của nước đạt được quá trình oxy hóa-khử
Các mô khác 449
Cân bằng và đóng góp proton vào gradient
Phosphorylase cơ được điều hòa bởi
proton 416
phí năng lượng nội bào 450
22.4 Một gradient proton điều khiển quá trình tổng hợp ATP 418
Đặc điểm sinh hóa của các loại sợi cơ khác nhau 451
ATP Synthase của lục lạp rất giống nhau
MỚIPhosphoryl hóa thúc đẩy sự chuyển đổi của
Của ty thể 418
Phosphorylasebthành PhosphorylaseMột 451
MỚIHoạt động của ATP Synthase lục lạp là
Phosphorylase Kinase được kích hoạt bởi
quy định 419
Phosphoryl hóa và ion canxi 452
Dòng điện tử tuần hoàn qua hệ thống ảnh I dẫn
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngBệnh của cô ấy là do
để sản xuất ATP thay vì NADPH 419
thiếu hụt Phosphorylase 453
Sự hấp thụ 8 photon mang lại 1 O2,
24.3 Epinephrine và Glucagon báo hiệu sự
Hai NADPH và ba phân tử ATP 420
cần thiết phải phân hủy Glycogen 453
Các thành phần của quang hợp là
Có tính tổ chức cao 421 Protein G truyền tín hiệu khởi đầu
sự phân hủy glycogen 453
Cái nhìn sâu sắc sinh họcNhiều loại thuốc diệt cỏ ức
Sự phân hủy glycogen phải được chuyển hóa nhanh chóng
chế phản ứng ánh sáng của quang hợp 421
Tắt khi cần thiết 455
Chương 23 Chu trình Calvin 427 Cái nhìn sâu sắc sinh họcSự suy giảm glycogen trùng hợp với
sự khởi đầu của mệt mỏi 455
23.1 Chu trình Calvin tổng hợp hexose từ CO2
và nước 428 Chương 25 Tổng hợp Glycogen 459
Carbon Dioxide phản ứng với Ribulose
25.1 Glycogen được tổng hợp và phân hủy theo các con
1,5-bisphosphate để tạo thành hai phân tử 3-
đường khác nhau 459
Phosphoglycerate 429
UDP-Glucose là một dạng Glucose được kích hoạt 460
Hexose Phosphate được làm từ
Phosphoglycerate và Ribulose 1,5-bisphosphate Glycogen Synthase xúc tác chuyển hóa
được tái sinh 430 Glucose từ UDP-Glucose đến chuỗi phát triển 460
Ba phân tử ATP và hai phân tử Một enzyme phân nhánh tạo thành liên kết Alpha-1,6 461
NADPH được sử dụng để đưa CO2 lên mức Glycogen Synthase là enzyme điều hòa quan trọng
Hexose 430 trong quá trình tổng hợp glycogen 461
Cái nhìn sâu sắc sinh họcMột vụ phun trào núi lửa có thể ảnh hưởng đến Glycogen là một dạng lưu trữ hiệu quả của Glucose 462
quá trình quang hợp trên toàn thế giới 432 25.2 Trao đổi chất trong bối cảnh: Sự phân hủy và
Tinh bột và Sucrose là carbohydrate chính tổng hợp Glycogen được điều hòa qua lại 462
Cửa hàng trong nhà máy 433 Protein Phosphatase 1 đảo ngược quy định
Cái nhìn sâu sắc sinh họcTại sao bánh mì trở nên cũ: Tác dụng của Kinase đối với quá trình chuyển hóa Glycogen 462
Vai trò của tinh bột 434 Insulin kích thích tổng hợp Glycogen bằng cách làm bất hoạt
23.2 Chu trình Calvin được điều hòa bởi môi trường 434 Glycogen tổng hợp Kinase 464
Nội dung xxiii
Điều hòa chuyển hóa Glycogen ở gan Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚIChế độ ăn ketogen có
Nồng độ Glucose trong máu 465 thể có đặc tính trị liệu 498
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngBệnh tiểu đường do Động vật không thể chuyển đổi axit béo thành glucose 498
thiếu insulin và dư thừa Glucagon 466 27.4 Chuyển hóa trong bối cảnh: Chuyển hóa axit béo là
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngCó thể hiểu được về nguồn hiểu biết sâu sắc về nhiều loại
sinh hóa các bệnh dự trữ glycogen 467 Trạng thái sinh lý 499
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngBệnh tiểu đường có thể dẫn đến tình trạng
Chương 26 Con đường Pentose
cơ thể sản xuất quá nhiều ketone đe dọa tính mạng 499
Phosphate 473
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngCơ thể ketone là nguồn nhiên
26.1 Con đường Pentose Phosphate tạo ra liệu quan trọng trong quá trình đói 500
NADPH và đường 5 cacbon 474
Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚIMột số axit béo có thể
Hai phân tử NADPH được tạo ra trong góp phần phát triển các tình trạng bệnh lý 501
Sự chuyển đổi Glucose 6-phosphate thành
Ribulose 5-phosphate 474
Con đường Pentose Phosphate và Glycolysis Chương 28 Tổng hợp axit béo 507
Được liên kết bởi Transketolase và Transaldolase 474 28.1 Quá trình tổng hợp axit béo diễn ra theo ba giai đoạn 507
26.2 Trao đổi chất trong bối cảnh: Quá trình đường Citrate vận chuyển nhóm axetyl từ ty thể
phân và con đường Pentose Phosphate đến tế bào chất 508
được kiểm soát phối hợp 478 Một số nguồn cung cấp NADPH cho quá trình tổng hợp axit béo 508
Tốc độ của con đường Pentose Phosphate là Sự hình thành của Malonyl CoA là sự cam kết
Được kiểm soát bởi mức độ NADP+ 478 Bước tổng hợp axit béo 509
Số phận của Glucose 6-phosphate phụ thuộc vào Tổng hợp axit béo bao gồm một loạt các
Nhu cầu về NADPH, Ribose 5-phosphate và ATP 478 Phản ứng ngưng tụ, khử, khử nước và
Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚICon đường Pentose Phosphate khử 510
cần thiết cho sự tăng trưởng tế bào nhanh chóng 481 Sự tổng hợp Palmitate cần 8 phân tử
26.3 Glucose 6-phosphate Dehydrogenase làm Acetyl CoA, 14 phân tử NADPH và 7
phân tử ATP 512
giảm căng thẳng oxy hóa 481
Axit béo được tổng hợp bằng cơ chế đa chức năng
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngThiếu hụt Glucose 6-
Phức hợp enzyme ở động vật 512
phosphate Dehydrogenase gây ra thiếu máu tán huyết
do thuốc 481 Cái nhìn sâu sắc lâm sàngChuyển hóa axit béo bị thay đổi trong
tế bào khối u 513
Cái nhìn sâu sắc sinh họcSự thiếu hụt Glucose 6-
phosphate Dehydrogenase mang lại lợi thế tiến Cái nhìn sâu sắc lâm sàngMột axit béo nhỏ nhưng gây
hóa trong một số trường hợp 483 ra vấn đề lớn 513
28.2 Các enzyme bổ sung làm dài và khử bão hòa
PHẦN 12 axit béo 514
Chuyển hóa axit béo và lipid 487 Enzyme gắn màng tạo ra chất không bão hòa
Axit béo 514
Chương 27 Sự thoái hóa axit béo 489
Nội tiết tố Eicosanoid có nguồn gốc từ
27.1 Axit béo được xử lý theo ba giai đoạn 489 Axit béo không bão hòa đa 514
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngTriacylglycerol bị thủy phân bởi Cái nhìn sâu sắc lâm sàngAspirin phát huy tác dụng bằng
lipase được kích thích bởi hormone 490 cách biến đổi cộng hóa trị một enzyme chủ chốt 515
MỚIAxit béo tự do và Glycerol được giải phóng vào 28.3 Acetyl CoA Carboxylase là chất điều hòa chính của quá
máu 491 trình chuyển hóa axit béo 516
Axit béo được liên kết với Coenzym A trước đó
Acetyl CoA Carboxylase được điều hòa bởi các điều kiện
Chúng bị oxy hóa 491 trong tế bào 516
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngTình trạng bệnh lý sẽ
Acetyl CoA Carboxylase được điều hòa bởi nhiều loại
xảy ra nếu axit béo không thể vào ty thể 493 nội tiết tố 516
Acetyl CoA, NADH và FADH2Được tạo bởi
28.4 Chuyển hóa trong bối cảnh: Ethanol làm thay đổi quá trình
Quá trình oxy hóa axit béo 493
chuyển hóa năng lượng ở gan 517
Quá trình oxy hóa hoàn toàn sản lượng Palmitate
106 Phân Tử ATP 495
27.2 Sự phân hủy của axit béo chuỗi lẻ và không bão Chương 29 Tổng hợp lipid: Lưu trữ lipid,
hòa cần có các bước bổ sung 495 photpholipid và cholesterol 523
Cần có một isomerase và một reductase để 29.1 Phosphatidate là tiền chất của lipid dự
Quá trình oxy hóa axit béo không bão hòa 495 trữ và nhiều lipid màng 523
Axit béo chuỗi lẻ tạo ra Propionyl CoA trong Triacylglycerol được tổng hợp từ Phosphatidate trong
Bước thiolysis cuối cùng 497 Hai bước 524
27.3 Thể Ketone là một nguồn nhiên liệu khác có nguồn Tổng hợp Phospholipid yêu cầu tiền chất được kích hoạt 524
gốc từ chất béo 497 Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚIPhosphatidylcholine là một
Sự tổng hợp xeton-cơ thể diễn ra ở gan 497 loại Phospholipid dồi dào 526
xxivNội dung
Sphingolipids được tổng hợp từ Ceramide 526 30,2 Ion amoni được chuyển đổi thành urê ở hầu hết các động vật
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngGanglioside đóng vai trò là nơi có xương sống trên cạn 555
gắn kết các mầm bệnh 527 MỚICarbamoyl Phosphate Synthetase là chìa khóa
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngRối loạn chuyển hóa Enzyme điều hòa tổng hợp urê 556
lipid dẫn đến Hội chứng suy hô hấp và bệnh MỚICarbamoyl Phosphate phản ứng với Ornithine để bắt đầu quá trình
Tay-Sachs 528 Chu trình urê 556
Phosphatidic Acid Phosphatase là chìa khóa Chu trình urê được liên kết với quá trình tạo glucose 557
Enzyme điều hòa chuyển hóa lipid 529 Cái nhìn sâu sắc lâm sàngTrao đổi chất trong bối cảnh: Các
29.2 Cholesterol được tổng hợp từ Acetyl khiếm khuyết di truyền của chu trình urê gây ra tình trạng
Coenzym A qua ba giai đoạn 529 tăng amoniac máu 558
Sự tổng hợp Mevalonate bắt đầu quá trình tổng hợp Cái nhìn sâu sắc sinh họcNgủ đông trình bày vấn
Cholesterol 530 đề xử lý nitơ 558
Squalene (C30) Được tổng hợp từ sáu phân tử của Cái nhìn sâu sắc sinh họcUrê không phải là phương tiện duy
Isopentenyl Pyrophosphate (C5) 530 nhất để xử lý lượng nitơ dư thừa 559
Squalene chuyển hóa thành cholesterol 532 30.3 Nguyên tử cacbon của axit amin bị phân hủy xuất hiện
29.3 Quá trình điều hòa tổng hợp dưới dạng chất trung gian trao đổi chất chính 559
cholesterol diễn ra ở nhiều cấp độ 532 Pyruvate là một điểm tham gia vào quá trình trao đổi chất 560
29.4 Lipoprotein vận chuyển Cholesterol và Oxaloacetate là một điểm xâm nhập khác
Triacylglycerol đi khắp cơ thể 534 Sự trao đổi chất 561
Lipoprotein mật độ thấp đóng vai trò trung tâm trong Alpha-Ketoglutarate là một điểm khác để thâm nhập
Chuyển hóa cholesterol 535 Sự trao đổi chất 561
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngSự vắng mặt của thụ thể LDL dẫn Succinyl Coenzym A là điểm đầu vào của
đến tăng cholesterol máu mang tính chất gia đình và xơ vữa Một số axit amin không phân cực 562
động mạch 536 Các axit amin chuỗi nhánh tạo ra axetyl
Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚIChu kỳ của thụ thể LDL Coenzym A, Acetoacetate hoặc Succinyl Coenzym A 562
được điều chỉnh 537 Oxygenase cần thiết cho sự thoái hóa của
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngHDL dường như bảo vệ chống Axit amin thơm 563
xơ vữa động mạch 537 Methionine bị phân hủy thành Succinyl Coenzym A 565
Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚIViệc quản lý lâm Cái nhìn sâu sắc lâm sàngCác lỗi chuyển hóa bẩm sinh có thể
sàng mức cholesterol có thể được hiểu ở cấp độ làm gián đoạn quá trình thoái hóa axit amin 565
sinh hóa 538 Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚIXác định cơ sở của các triệu
29.5 Cholesterol là tiền thân của hormone chứng thần kinh của bệnh Phenylketon niệu
steroid 539 Là một lĩnh vực nghiên cứu tích cực 566
Cái nhìn sâu sắc lâm sàng MỚIMuối mật tạo điều kiện
hấp thu lipid 539 Chương 31 Tổng hợp axit amin 571
Hormon steroid là các phân tử tín hiệu quan trọng 539 31.1 Phức hợp Nitrogenase cố định Nitơ 572
Vitamin D có nguồn gốc từ cholesterol bởi Đồng yếu tố Molypden-Sắt của Nitrogenase
năng lượng của ánh sáng mặt trời 540 Liên kết và giảm nitơ khí quyển 573
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngVitamin D cần thiết cho sự phát Ion amoni được kết hợp thành một Amino
triển của xương 541 Axit thông qua Glutamate và Glutamine 573
Cái nhìn sâu sắc lâm sàngAndrogen có thể được sử dụng 31.2 Axit amin được tạo thành từ các chất trung gian của các
để nâng cao hiệu suất thể thao một cách nhân tạo 542 con đường chính 574
Nguyên tử oxy được thêm vào steroid bằng cách
Con người có thể tổng hợp một số axit amin
Cytochrome P450 Monooxygenase 542 nhưng phải có được những thứ khác từ chế độ ăn kiêng 574
Chuyển hóa trong bối cảnh: Ethanol cũng được xử lý bởi
Một số axit amin có thể được tạo ra bằng cách đơn giản
Hệ thống Cytochrome P450 543 Phản ứng chuyển hóa 575
PHẦN 13 Serine, Cysteine và Glycine được hình thành từ
được phát hiện bằng hành động gây đột biến của chúng trên vi hợp có thể gây ung thư 680
khuẩn 650 Nhiều yếu tố phiên mã tương tác với sinh vật nhân chuẩn
35.3 Tái tổ hợp DNA đóng vai trò quan trọng trong việc Chất xúc tiến và chất tăng cường 680
sao chép và sửa chữa 651 Cái nhìn sâu sắc lâm sàngTế bào gốc đa năng cảm ứng có
Vết đứt đôi có thể được sửa chữa bằng cách thể được tạo ra bằng cách đưa bốn yếu tố phiên mã vào
tái hợp 652 các tế bào đã biệt hóa 680
Tái tổ hợp DNA rất quan trọng trong nhiều loại 37.3 Biểu hiện gen được điều hòa bởi hormone 681
Quy trình sinh học 652 Các thụ thể hormone hạt nhân có miền tương tự
cấu trúc 681
Các cơ quan tiếp nhận nội tiết tố hạt nhân tuyển dụng các cơ quan hợp tác và
Mục tiêu cuối cùng của mọi nỗ lực khoa học là phát triển sự hiểu biết sâu sắc
hơn, phong phú hơn về bản thân chúng ta và thế giới chúng ta đang sống.
Hóa sinh d và sẽ tiếp tục có vai trò sâu rộng trong việc giúp chúng ta phát
triển hiểu biết.Hóa sinh, việc nghiên cứu các sinh vật sống ở cấp độ phân tử
đã cho chúng ta thấy nhiều chi tiết về các quá trình cơ bản nhất của
Ví dụ, hóa sinh đã cho chúng ta thấy thông tin truyền từ gen đến các
phân tử có khả năng hoạt động như thế nào. Trong những năm gần đây, hóa
sinh cũng đã làm sáng tỏ một số bí ẩn về máy tạo phân tử cung cấp năng lượng
cho các sinh vật sống. Sự nhận thức mà chúng ta có thể hiểu được
Chương 1
Hóa sinh và các quá trình sống thiết yếu có ý nghĩa triết học quan trọng. Về mặt
Sự thống nhất của cuộc sống sinh hóa, là con người nghĩa là gì? Sự khác biệt sinh hóa giữa con
người, tinh tinh, chuột và ruồi giấm là gì? Chúng ta có khác biệt hơn
không?
Sự hiểu biết đạt được thông qua hóa sinh có ảnh hưởng lớn đến điện tử và
các lĩnh vực khác. Mặc dù chúng ta có thể không quen nghĩ đến bệnh tật
trên các phân tử, nhưng bệnh tật cuối cùng là một loại trục trặc nào đó ở các
tổn thương phân tử phân tử gây ra bệnh thiếu máu hồng cầu hình liềm, bệnh
xơ nang, bệnh máu khó đông và nhiều bệnh di truyền khác đã được làm sáng tỏ ở
cấp độ sinh hóa. Hóa sinh cũng đóng góp rất nhiều cho chẩn đoán lâm sàng. Ví dụ,
nồng độ men tim trong máu tăng cao cho biết bệnh nhân gần đây có bị nhồi máu cơ
Chương 2
Nước, liên kết yếu và tạo tim hay không (đau tim). Nông nghiệp cũng đang sử dụng hóa sinh để phát triển các
ra trật tự từ hỗn loạn loại thuốc diệt cỏ và thuốc trừ sâu hiệu quả hơn, an toàn hơn với môi trường và để
tạo ra các loại cây biến đổi gen có khả năng kháng côn trùng cao hơn.
1
Trong phần này, chúng ta sẽ tìm hiểu một số khái niệm chính cấu trúc nên
việc nghiên cứu hóa sinh. Chúng tôi bắt đầu bằng phần giới thiệu về các phân
tử của hóa sinh, sau đó là phần tổng quan về đơn vị cơ bản của hóa sinh và bản
thân sự sống—tế bào. Cuối cùng, chúng tôi kiểm tra các liên kết thuận nghịch
yếu cho phép hình thành các cấu trúc sinh học và cho phép sự tương tác giữa
các phân tử tạo nên sự sống.
- 1 Hãy mô tả các loại phân tử sinh học chính và phân biệt chúng.
- 3 Nêu những đặc điểm cơ bản giúp phân biệt tế bào nhân thực với tế
bào nhân sơ.
- 4 Mô tả tính chất hóa học của nước và giải thích nước ảnh hưởng như thế
nào đến các tương tác sinh hóa.
- 5. Mô tả các loại tương tác không cộng hóa trị, thuận nghịch và giải thích tại
sao tương tác thuận nghịch lại quan trọng trong sinh hóa.
- 6 Xác định độ pH và giải thích tại sao sự thay đổi độ pH có thể ảnh hưởng đến hệ thống sinh
hóa.
2
C h A p T er 1
hóa học và
loại cuộc sống
MỘT
Mục tiêu chính của hóa sinh, một mục tiêu đã đạt được thành công đáng kinh
ngạc, là hiểu được ý nghĩa của sự sống ở cấp độ phân tử. Một mục tiêu khác là mở
rộng sự hiểu biết này đến cấp độ sinh vật - nghĩa là hiểu được tác động của các
thao tác phân tử đối với sự sống mà sinh vật đó hướng tới. Ví dụ, việc hiểu cách thức hoạt
động của hormone insulin ở cấp độ phân tử sẽ làm sáng tỏ cách cơ thể kiểm soát mức độ
nhiên liệu thông thường—glucose và chất béo—trong máu. Thông thường, sự hiểu biết
như vậy tạo điều kiện thuận lợi cho sự hiểu biết về các tình trạng bệnh, chẳng hạn như
bệnh tiểu đường, dẫn đến việc tín hiệu insulin bị sai lệch. Đổi lại, kiến thức này có thể là
một nguồn hiểu biết sâu sắc về cách điều trị bệnh.
Hóa sinh là một lĩnh vực nghiên cứu tích cực trong hơn một thế kỷ. Người ta đã
thu được nhiều kiến thức về cách nhiều loại sinh vật điều khiển năng lượng và
thông tin. Tuy nhiên, một trong những kết quả thú vị nhất của nghiên cứu sinh hóa
là nhận ra rằng tất cả các sinh vật đều có nhiều điểm chung về mặt sinh hóa.Các
sinh vật có tính đồng nhất đáng kể ở cấp độ phân tử. Quan sát này thường được gọi
làsự thống nhất của hóa sinh,nhưng trên thực tế, nó minh họa sự thống nhất của
cuộc sống. Nhà hóa sinh người Pháp Jacques Monod đã gói gọn ý tưởng này vào
năm 1954 bằng cụm từ “Bất cứ điều gì được cho là đúng về [vi khuẩn]
E coliđối với voi cũng phải như vậy.” Tính đồng nhất này tiết lộ rằng tất cả các sinh vật trên
Trái đất đều phát sinh từ một tổ tiên chung. Cốt lõi của các quá trình sinh hóa thiết yếu,
chung cho mọi sinh vật, xuất hiện sớm trong quá trình tiến hóa của sự sống. Các
3
41 Hóa sinh và sự thống nhất của sự sống
sự đa dạng của cuộc sống trong thế giới hiện đại đã được tạo ra bởi các quá trình tiến hóa
tác động lên các quá trình cốt lõi này trong hàng triệu, thậm chí hàng tỷ năm.
Chúng tôi bắt đầu nghiên cứu về hóa sinh bằng cách xem xét những điểm tương
đồng. Chúng ta sẽ xem xét các phân tử và thành phần phân tử được mọi dạng sống sử
dụng và sau đó sẽ xem xét các quy tắc chi phối cách truy cập thông tin sinh hóa và cách
nó được truyền từ thế hệ này sang thế hệ tiếp theo. Cuối cùng, chúng ta sẽ có cái nhìn
tổng quan về đơn vị cơ bản của sự sống – tế bào. Điều này chỉ là khởi đầu. Tất cả các phân
tử và cấu trúc mà chúng ta thấy trong chương này sẽ gặp lại nhiều lần khi chúng ta khám
phá cơ sở hóa học của sự sống.
1.1 Hệ thống sống yêu cầu một số lượng hạn chế các
nguyên tử và phân tử
Chín mươi nguyên tố xuất hiện tự nhiên đã được xác định, nhưng chỉ có ba nguyên tố
oxy, hydro và carbon—chiếm tới 98% số nguyên tử trong cơ thể sinh vật. Hơn nữa, độ
phong phú của ba nguyên tố này trong sự sống khác rất nhiều so với độ phong phú của
chúng trong vỏ Trái đất (Bảng 1.1). Điều gì có thể giải thích cho sự khác biệt giữa những
gì sẵn có và những sinh vật được tạo thành từ đâu?
Một lý do khiến oxy và hydro rất phổ biến là do sự có mặt khắp nơi của nước, hay “ma trận sự
sống”, như nhà hóa sinh Albert Szent-Györgi đã gọi nó. Phân tử nhỏ bé này—chỉ bao gồm ba nguyên
tử—làm cho sự sống trên Trái đất trở nên khả thi. Thật vậy, niềm tin hiện nay là mọi sự sống đều cần
có nước, đó là lý do tại sao trong những thập kỷ gần đây đã có rất nhiều nỗ lực được thực hiện để xác
định xem sao Hỏa có nước trong quá khứ hay không và liệu nó có còn nước hay không. Tầm quan
trọng của nước đối với sự sống quan trọng đến mức sự hiện diện của nó tương đương với việc nói
rằng sự sống có thể hiện diện. Chúng ta sẽ xem xét các tính chất của nước và những đặc tính này hỗ
trợ quá trình sinh hóa như thế nào trong Chương 2.
Sau oxy và hydro, nguyên tố phổ biến tiếp theo trong cơ thể sống là
carbon. Hầu hết các phân tử lớn trong hệ thống sống được tạo thành chủ yếu
từ carbon. Các phân tử nhiên liệu được tạo thành hoàn toàn từ cacbon, hydro,
Bảng 1.1Thành phần hóa học tính theo phần trăm trên tổng số nguyên tử
Yếu tố Loài người (%) Nước biển (%) Vỏ trái đất (%)
Hydro 63 66 0,22
Ôxy 25,5 33 47
Carbon 9,5 0,0014 0,19
Nitơ 1.4 <0,1 <0,1
canxi 0,31 0,006 3,5
Phốt pho 0,22 <0,1 <0,1
clorua 0,03 0,33 <0,1
Kali 0,06 0,006 2,5
lưu huỳnh 0,05 0,017 <0,1
Natri 0,03 0,28 2,5
Magie 0,01 0,003 2.2
Silicon <0,1 <0,1 28
Nhôm <0,1 <0,1 7,9
Sắt <0,1 <0,1 4,5
Titan <0,1 <0,1 0,46
Tất cả những người khác <0,1 <0,1 <0,1
Lưu ý: Do làm tròn nên tổng tỷ lệ phần trăm không bằng 100%.
Nguồn: Dữ liệu từ E. Frieden, Các nguyên tố hóa học của sự sống,Khoa học. Là. 227(1), 1972, tr. 54.
1.2 Có bốn loại phân tử sinh học chính5
và oxy. Nhiên liệu sinh học, giống như nhiên liệu cung cấp năng lượng cho máy móc,
phản ứng với oxy để tạo ra carbon dioxide và nước. Đối với nhiên liệu sinh học, phản ứng
này được gọi là quá trình đốt cháy, cung cấp năng lượng cho tế bào. Để hiểu tại sao
carbon lại đặc biệt phù hợp với sự sống, chúng ta hãy so sánh nó với silicon, nguyên tố họ
hàng gần nhất của nó. Silicon dồi dào hơn nhiều so với carbon trong lớp vỏ Trái đất (Bảng
1.1), và, giống như carbon, có thể tạo thành bốn liên kết cộng hóa trị - một tính chất quan
trọng để hình thành các phân tử lớn. Tuy nhiên, liên kết carbon với carbon mạnh hơn liên
kết silicon với silicon. Sự khác biệt về độ bền liên kết này có hai hệ quả quan trọng. Đầu
tiên, các phân tử lớn có thể được tạo ra bằng cách sử dụng liên kết cacbon-cacbon làm
xương sống vì tính ổn định của các liên kết này. Thứ hai, nhiều năng lượng được giải
phóng khi liên kết carbon-carbon trải qua quá trình đốt cháy hơn là khi silicon phản ứng
với oxy. Do đó, các phân tử gốc cacbon là vật liệu xây dựng bền hơn và là nhiên liệu tốt
hơn các phân tử gốc silicon. Carbon thậm chí còn có lợi thế hơn silicon sau khi nó trải qua
quá trình đốt cháy. Carbon dioxide dễ hòa tan trong nước và có thể tồn tại dưới dạng khí;
do đó, nó vẫn ở trong vòng tuần hoàn sinh hóa, do một mô hoặc sinh vật tiết ra để được
mô hoặc sinh vật khác sử dụng. Ngược lại, silicon về cơ bản là không hòa tan sau khi phản
ứng với oxy. Sau khi kết hợp với oxy, nó vĩnh viễn không được lưu thông. Thạch anh là
một dạng phổ biến của silicon dioxide.
Các nguyên tố khác có vai trò thiết yếu trong hệ thống sống, đặc biệt là nitơ, phốt
pho và lưu huỳnh. Hơn nữa, một số nguyên tố vi lượng, mặc dù hiện diện với số lượng rất
nhỏ so với oxy, hydro và carbon, nhưng lại cực kỳ quan trọng đối với một số quá trình
sống. Chúng ta sẽ thấy những ứng dụng cụ thể của những nguyên tố này khi chúng ta
tiến hành nghiên cứu về hóa sinh.
1.2 Có bốn loại phân tử sinh học chính - 1 Hãy mô tả các loại phân tử
sinh học chính và phân biệt
Các hệ thống sống chứa một lượng lớn các phân tử sinh học. Tuy nhiên, những phân chúng.
tử sinh học này có thể được chia thành bốn loại: protein, axit nucleic, lipid và
carbohydrate.
Phần lớn nghiên cứu về hóa sinh của chúng ta sẽ xoay quanh protein.Proteinđược cấu tạo
từ 20 khối xây dựng, được gọi là axit amin, được liên kết bằng liên kết peptide để tạo
thành các polyme dài không phân nhánh (Hình 1.1). Các polyme này gấp lại thành các cấu
trúc ba chiều chính xác tạo điều kiện thuận lợi cho một loạt các chức năng sinh hóa.
Protein đóng vai trò là phân tử tín hiệu (ví dụ, hormone insulin báo hiệu nhiên liệu có
trong máu) và là cơ quan tiếp nhận các phân tử tín hiệu. Các cơ quan thụ cảm truyền đến
tế bào rằng tín hiệu đã được nhận và bắt đầu phản ứng của tế bào. Vì vậy, ví dụ, insulin
liên kết với thụ thể đặc biệt của nó, được gọi là thụ thể insulin, và bắt đầu phản ứng sinh
học với sự hiện diện của nhiên liệu trong máu. Protein cũng đóng vai trò cấu trúc, cho
phép di chuyển và cung cấp khả năng phòng vệ chống lại môi trường.
1 2 3
Hình 1.1Gấp protein.Cấu trúc ba chiều của protein được quyết định bởi trình tự các axit
amin cấu thành nên protein.
6 1 Hóa sinh và sự thống nhất của sự sống
NH2 những nguy hiểm. Có lẽ vai trò nổi bật nhất của protein làchất
2– ồ – – N xúc tác—các tác nhân làm tăng tốc độ phản ứng hóa học mà
ồ ồ
bản thân chúng không bị ảnh hưởng vĩnh viễn. Chất xúc tác
H2 N
P P P N protein được gọi làenzim. Mọi quá trình diễn ra trong hệ thống
ồ C
ồ ồ ồ ồ
ồ N sống đều phụ thuộc vào enzyme.
ồ ồ
RNA là một dạng axit nucleic chuỗi đơn. Một số vùng DNA được sao chép
dưới dạng một lớp phân tử RNA đặc biệt gọi là RNA thông tin (mRNA). mARN là
khuôn mẫu để tổng hợp protein. Không giống như DNA, mRNA thường xuyên
bị phân hủy sau khi sử dụng. RNA có thành phần tương tự như DNA ngoại trừ
hai ngoại lệ: bazơ thymine (T) được thay thế bằng bazơ uracil (U) và thành phần
đường của ribonucleotide chứa một nhóm hydroxyl (-OH) bổ sung.
Lipid là một dạng lưu trữ nhiên liệu và đóng vai trò như một rào cản
Trong số các phân tử sinh học quan trọng,chất béonhỏ hơn nhiều so với protein hoặc axit
nucleic. Trong khi protein và axit nucleic có thể có trọng lượng phân tử từ hàng nghìn đến
hàng triệu thì lipid thông thường có trọng lượng phân tử là 1300 g mol.−1. Hơn nữa, lipid
không phải là polyme được tạo thành từ các đơn vị lặp lại, giống như protein và axit
nucleic. Một đặc tính quan trọng của nhiều lipid quan trọng về mặt sinh hóa là bản chất
hóa học kép của chúng: một phần của phân tửưa nước,nghĩa là nó có thể hòa tan trong
nước, trong khi phần còn lại, được tạo thành từ một hoặc nhiều chuỗi hydrocarbon, thì kỵ
nướcvà không tan trong nước (Hình 1.4). Bản chất kép này cho phép lipid hình thành các
rào cản phân định tế bào với môi trường của nó và thiết lập các ngăn nội bào. Nói cách
khác, lipid cho phép phát triển “bên trong” và “bên ngoài” ở cấp độ sinh hóa. Các chuỗi
hydrocarbon không thể tương tác với nước mà thay vào đó tương tác với các chuỗi lipid
khác để tạo thành một rào cản hoặc màng, trong khi các thành phần hòa tan trong nước
tương tác với môi trường nước ở hai bên màng. Lipid cũng là một dạng dự trữ năng
lượng quan trọng. Như chúng ta sẽ thấy, thành phần kỵ nước của lipid có thể trải qua quá
trình đốt cháy để cung cấp một lượng lớn năng lượng cho tế bào. Lipid cũng là các phân
tử tín hiệu quan trọng.
1.3 Giáo điều trung tâm mô tả các nguyên tắc cơ bản của chuyển giao thông tin sinh học7
(MỘT) (B)
Đuôi kỵ nước
đầu ưa nước
Hình 1.4Tính chất kép của lipid.(A) Một phần của phân tử lipid có tính ưa nước; phần còn lại
là kỵ nước. (B) Trong nước, lipid có thể tạo thành một lớp kép, tạo thành một hàng rào ngăn
cách hai ngăn chứa nước.
?
nhau. Nhiều thành phần bên ngoài tế bào được trang trí bằng nhiều loại carbohydrate khác Câu đố nhanh 1Kể tên 4 loại phân
nhau có thể được xác định bởi các tế bào khác và đóng vai trò là nơi tương tác giữa tế bào với tế tử sinh học và nêu chức năng quan
bào. trọng của mỗi loại.
1.3 Giáo điều trung tâm mô tả các nguyên tắc cơ bản của việc - 2Liệt kê các bước của giáo lý
trung tâm.
chuyển giao thông tin sinh học
Việc xử lý thông tin trong tất cả các tế bào khá phức tạp. Nó trở nên phức tạp hơn
khi tế bào trở thành bộ phận của mô và khi mô trở thành thành phần của sinh vật.
Sơ đồ làm nền tảng cho việc xử lý thông tin ở cấp độ biểu hiện gen được Francis
Crick đề xuất lần đầu tiên vào năm 1958.
Nhân rộng
Crick gọi kế hoạch này làgiáo điều trung tâm:thông tin truyền từ DNA đến RNA và sau đó đến
protein. Hơn nữa, DNA có thể được sao chép. Các nguyên lý cơ bản của giáo điều này là đúng,
nhưng, như chúng ta sẽ thấy sau, sơ đồ này không đơn giản như được mô tả.
số 81 Hóa sinh và sự thống nhất của sự sống
DNA cấu thành nên thông tin di truyền -bộ gen. Thông tin này được đóng
G
DNA polymerase gói thành các đơn vị riêng biệt gọi làgen. Chính tập hợp gen này quyết định bản
C
A
chất vật lý của sinh vật. Khi một tế bào nhân đôi, DNA sẽ được sao chép và các
T
G
Mới bộ gen giống hệt nhau sẽ xuất hiện trong các tế bào con mới hình thành. Quá
C C
tổng hợp CATTC trình sao chép bộ gen được gọi lànhân rộng.Một nhóm enzym được gọi chung
sợi
GTAAG làDNA polymerase,xúc tác quá trình sao chép (Hình 1.6).
G Bản thân các gen là vô dụng. Thông tin phải được hiển thị có thể truy cập
G
được. Khả năng tiếp cận này đạt được trong quá trìnhphiên mãqua đó một
C
A
dạng axit nucleic, DNA, được phiên mã thành dạng khác, RNA. enzymARN
C T
G
polymerasexúc tác quá trình này (Hình 1.7). Những gen nào được phiên mã,
cũng như thời gian và địa điểm chúng được phiên mã, có vai trò quyết định đến
Hình 1.6Sao chép DNA.Khi mà số phận của tế bào. Ví dụ, mặc dù mỗi tế bào trong cơ thể con người đều có
Hai chuỗi của phân tử DNA được tách ra, mỗi
thông tin DNA mã hóa các hướng dẫn để tạo ra tất cả các mô, thông tin này
chuỗi có thể đóng vai trò là khuôn mẫu để tổng
hợp chuỗi đối tác mới. DNA polymerase xúc tác
được chia thành từng phần. Các gen biểu hiện ở gan khác với các gen biểu hiện
cho sự sao chép. ở cơ và não.Thật vậy, chính biểu hiện chọn lọc này xác định chức năng của tế
bào hoặc mô.
Một khía cạnh quan trọng của sự biểu hiện có chọn lọc thông tin di truyền
Bạn có biết không? là sự phiên mã gen thành mRNA. Thông tin được mã hóa trong mRNA được
Như được định nghĩa trong Từ điển tiếng Anh hiện thực hóa trong quá trìnhdịchbởi vì thông tin được dịch theo nghĩa đen từ
Oxford, phiên âm có nghĩa là tạo một bản sao dạng hóa học này (axit nucleic) sang dạng khác (protein). Protein đã được mô tả
của (cái gì đó) bằng văn bản; sao chép từ bản như là con ngựa thồ của tế bào, vàdịch mã biến thông tin di truyền thành dạng
gốc; để viết (một bản sao).
chức năng. Quá trình dịch mã diễn ra trên các phức hợp phân tử lớn gọi là
ribosome,gồm ARN và protein (Hình 1.8).
Bây giờ bạn đã được giới thiệu về các phân tử sinh học quan trọng và đã xem xét
ngắn gọn giáo lý trung tâm của việc truyền thông tin, chúng ta hãy xem xét nền tảng của
tế bào – nơi chứa và điều phối các quá trình sinh hóa cần thiết cho sự sống.
ARN polymerase
AA1
AA2
AA3
AA4
Chuỗi polypeptide mới
lai RNA-DNA
mới sinh
ARN đường xoắn ốc
Sự chuyển động
Hình 1.7Sự phiên mã của RNA.Phiên mã, xúc tác Hình 1.8Quá trình dịch mã diễn ra trên ribosome.
bởi rNA polymerase, tạo ra một bản sao rNA của một trong các chuỗi Ribosome giải mã thông tin trong mrNA và chuyển nó thành
DNA. chuỗi axit amin của protein.
- 3Xác định những đặc điểm chính 1.4 Màng xác định tế bào và thực hiện các
giúp phân biệt tế bào nhân thực với
chức năng của tế bào
tế bào nhân sơ.
Tế bào là đơn vị cơ bản của sự sống. Các tế bào phát triển, tái tạo và tương tác
với môi trường của chúng. Các sinh vật sống có thể đơn giản như một tế bào
hoặc phức tạp như cơ thể con người, bao gồm khoảng 100 nghìn tỷ tế bào. Mỗi
tế bào được phân định bởi một màng ngăn cách bên trong tế bào với môi
trường của nó. MỘTmànglà mộtlớp lipid kép:hai lớp lipid được tổ chức với các
chuỗi kỵ nước tương tác với nhau và các nhóm đầu ưa nước
1.4 Màng xác định tế bào và thực hiện các chức năng của tế bào9
(MỘT) Màng kép (B)
Nhân tế bào
Không gian ngoại chất
và vách tế bào
phức hợp Golgi
Lysosome
hạt nhân
ti thể
ti thể
Nhân tế bào
Lysosome
Màng trong (plasma)
Thành tế bào
Không gian ngoại chất
Màng ngoài
Thô
nội chất
mạng lưới Túi tiết
Hình 1.10Tế bào nhân sơ và tế bào nhân chuẩn.tế bào nhân chuẩn hiển thị nhiều cấu trúc bên trong hơn tế
bào nhân sơ. Các thành phần bên trong tế bào nhân chuẩn, đáng chú ý nhất là nhân, được xác định bởi màng.
[Ảnh vi mô: (A) ©Bức ảnh sinh học/Nguồn khoa học; (B) từ trang. C. Cross và KL Mercer,Siêu cấu trúc mô tế bào:
Một góc nhìn chức năng(W. h. Freeman và Công ty, 1993), tr. 199. Sơ đồ: (A và B) Thông tin từ h. Lodish và cộng
sự,Sinh học tế bào phân tử, tái bản lần thứ 6. (W. h. Freeman và Company, 2008), tr. 3.]
101 Hóa sinh và sự thống nhất của sự sống
vi khuẩnEscherichia coli, có cấu trúc tương đối đơn giản. Chúng được bao quanh bởi hai màng
ngăn cách bởi không gian chu chất. Mặc dù con người được tạo thành từ 100 nghìn tỷ tế bào,
nhưng chúng ta mang theo số lượng vi khuẩn nhiều gấp 10 lần con số đó trong người và trên
người. Phần lớn, thái độ của chúng ta đối với các đồng nghiệp prokaryote của mình là “sống và
để sống”. Ví dụ, các sinh vật nhân sơ sống trong ruột của chúng ta hỗ trợ chúng ta trong quá
trình tiêu hóa. Prokaryote chịu trách nhiệm làm cho cuộc sống của chúng ta phong phú hơn
theo những cách khác. Nhiều sinh vật nhân sơ khác nhau cung cấp cho chúng ta sữa bơ, sữa
chua và pho mát. Tuy nhiên, prokaryote cũng gây ra một loạt bệnh tật.
Bất kể loại tế bào nào—nhân thực hay nhân sơ, thực vật hay động vật—
hai đặc điểm sinh hóa tối thiểu tạo nên một tế bào: phải có (1) một rào cản
ngăn cách tế bào với môi trường của nó và (2) một phần bên trong khác
biệt về mặt hóa học với môi trường và phù hợp với quá trình sinh hóa của
sự sống. Rào cản được gọi làmàng sinh chất,và vật chất nội bào cơ bản
được gọi làtế bào chất.
Màng sinh chấtMàng sinh chất ngăn cách bên trong tế bào với bên
ngoài, tế bào này với tế bào khác. Màng này không thấm nước
đối với hầu hết các chất, thậm chí đối với các chất như nhiên liệu, khối xây
dựng và phân tử tín hiệu phải đi vào tế bào. Do đó, chức năng rào cản của
màng phải được giảm thiểu để cho phép các phân tử và thông tin ra vào.
Nói cách khác, màng phải được xử lý bán thấm nhưng theo một cách rất
chọn lọc. Cái nàysự thẩm thấu có chọn lựalà công việc của các protein
được gắn vào màng sinh chất hoặc liên kết với nó (Hình 1.11). Những
protein này tạo điều kiện thuận lợi cho sự xâm nhập của các nhiên liệu,
chẳng hạn như glucose và các khối xây dựng, chẳng hạn như axit amin,
đồng thời chúng truyền tải thông tin - ví dụ: insulin có trong dòng máu.
Vách tế bào thực vậtMàng sinh chất của thực vật được bao quanh bởi
Hình 1.11Protein màng.protein,
được nhúng (màu vàng) vào màng và gắn (màu thành tế bào (Hình 1.12). Thành tế bào được cấu tạo chủ yếu từ cellulose, một
xanh) vào chúng, cho phép trao đổi vật chất và loại polymer dài, tuyến tính của các phân tử glucose. Các phân tử cellulose
thông tin với môi trường. tương tác với nhau cũng như với các thành phần khác của thành tế bào để tạo
thành một bức tường bảo vệ vững chắc cho tế bào.
mạng lưới
phức hợp Golgi
ti thể
lục lạp
Màng huyết tương
Vách tế bào
lục lạp
Hình 1.12Một tế bào thực vật.(A) ảnh hiển vi của tế bào lá. (B) Sơ đồ một tế bào thực vật điển hình. [(A)
Hiệp hội ảnh sinh học/Nguồn khoa học.]
1.4 Màng xác định tế bào và thực hiện các chức năng của tế bào11
riboxom
Thô
nội chất Hình 1.13Bộ xương tế bào.
mạng lưới Các sợi Actin, các sợi trung gian và vi ống là
các thành phần của bộ khung tế bào, tạo nên
vi ống hình dạng tế bào và góp phần vào sự di
chuyển của tế bào. Các thành phần này di
Sợi actin
chuyển khắp tế bào chất, liên kết với tất cả
các bào quan tế bào khác. [Thông tin từ WK
Trung cấp
ti thể purves et al.,Mạng sống, tái bản lần thứ 7.
dây tóc
(W. h. Freeman và Company, 2004), tr. 80.]
Màng huyết tương
Tế bào chấtChất bên trong của tế bào, chất được bao quanh bởi màng sinh
chất, được gọi là tế bào chất.Tế bào chất là nơi diễn ra nhiều quá trình sinh hóa,
bao gồm giai đoạn đầu của quá trình chuyển hóa glucose, tổng hợp axit béo và
tổng hợp protein. Trước đây, tế bào chất được cho là “súp” gồm các phân tử
sinh học quan trọng, nhưng ngày càng rõ ràng rằng quá trình sinh hóa của tế
bào chất được tổ chức chặt chẽ bởi một mạng lưới các sợi cấu trúc được gọi là
bộ xương tế bào. Ở nhiều sinh vật nhân chuẩn,bộ khung tế bào là một mạng
lưới gồm ba loại sợi protein—sợi Actin, sợi trung gian và vi ống—hỗ trợ cấu trúc
của tế bào, giúp định vị một số hoạt động sinh hóa nhất định và thậm chí đóng
vai trò là “đường cao tốc phân tử” mà qua đó các phân tử có thể được di chuyển
xung quanh tế bào (Hình 1.13).
Chức năng sinh hóa được cô lập trong các ngăn tế bào
Sự khác biệt chính giữa tế bào nhân chuẩn và tế bào nhân sơ
là sự hiện diện của một dãy phức tạp các ngăn nội bào, có
màng bao bọc gọi làbào quanở sinh vật nhân chuẩn (Hình
1.10B). Bây giờ chúng ta sẽ đi tham quan tế bào để nghiên
cứu các bào quan nổi bật mà chúng ta sẽ thấy nhiều lần trong
nghiên cứu về hóa sinh.
Hình 1.15Ty thể.Ma trận ty thể được thể hiện bằng màu xanh nhạt trong phần B. [(A) Keith r.
porter/Nguồn khoa học.]
carbon monoxide gây chết người chính xác vì chúng làm ngừng hoạt động
của ty thể. Khi nghiên cứu chi tiết về sinh hóa của cơ quan này, chúng ta sẽ
thấy rằng cấu trúc của ty thể đóng một vai trò mật thiết trong hoạt động
sinh hóa của nó.
lục lạpMột cơ quan có màng đôi khác rất quan trọng đối với mọi sự sống nhưng chỉ
tìm thấy ở tế bào thực vật làlục lạp(Hình 1.12). Lục lạp cung cấp năng lượng cho tế bào
thực vật, thực vật và phần còn lại của thế giới sống. Lục lạp là nơi diễn ra một kỳ tích sinh
hóa đáng chú ý: chuyển đổi ánh sáng mặt trời thành năng lượng hóa học, một quá trình
được gọi làquang hợp. Mỗi bữa ăn mà chúng ta tiêu thụ, có thể là món salad hoặc một
miếng bít tết ngon ngọt, đều tồn tại nhờ quá trình quang hợp. Nếu quá trình quang hợp
dừng lại, sự sống trên Trái đất sẽ chấm dứt sau khoảng 25 năm. Sự tuyệt chủng hàng loạt
vào kỷ Phấn trắng (65,1 triệu năm trước), trong đó loài khủng long gặp phải cái chết,
được cho là do một vụ va chạm thiên thạch lớn gây ra, đẩy quá nhiều mảnh vụn vào khí
quyển đến mức ánh sáng mặt trời không thể xuyên qua và quá trình quang hợp ngừng
lại.
Một số bào quan Xử lý, phân loại protein và trao đổi vật chất với môi
trường
Chúng ta hãy xem xét ngắn gọn các bào quan nhân chuẩn khác (Hình 1.10B) trong bối cảnh
chúng hợp tác với nhau như thế nào để thực hiện các nhiệm vụ sinh hóa quan trọng.
Nhân tế bào
Lưới nội chấtCácmạng lưới nội chấtlà một loạt các túi màng. Nhiều
phản ứng sinh hóa diễn ra trên bề mặt tế bào chất của các túi này cũng
như bên trong lòng của chúng. Lưới nội chất có hai loại:lưới nội chất
trơn(mịn ER, hoặc SER) vàlưới nội tiết thô(ER thô, hoặc RER), như được
minh họa trong Hình 1.16(cũng như Hình 1.10). Mạng lưới nội chất trơn
có nhiều vai trò khác nhau, nhưng vai trò đặc biệt đáng chú ý là xử lý
các hóa chất ngoại sinh (hóa chất có nguồn gốc bên ngoài tế bào) như
thuốc. Cơ thể càng tiêu thụ nhiều ma túy, kể cả rượu, thì số lượng mạng
Ribosome lưới nội chất trơn trong gan càng lớn.
Lumen
Tế bào chất Mạng lưới nội chất thô có vẻ xù xì vì ribosome được gắn vào phía tế
bào chất (Hình 1.14). Ribosome tự do trong tế bào chất tham gia vào
quá trình tổng hợp protein để sử dụng bên trong tế bào. Ribosome gắn
Hình 1.16Nội chất
lưới (ER).Mượt mà thiếu ribosome. thô có
vào lưới nội chất thô tổng hợp các protein sẽ được đưa vào màng tế bào
ribosome gắn vào nó. [Thông tin từ D. Sadava hoặc được tiết ra khỏi tế bào.
và cộng sự,Mạng sống, tái bản lần thứ 8. (W. h. Các protein được tổng hợp trên mạng lưới nội chất thô được vận
Freeman và Company, 2008), tr. 77.] chuyển vào lòng của mạng lưới nội chất trong quá trình dịch mã.
1.4 Màng xác định tế bào và mang O
Bên trong lòng của mạng lưới nội chất thô, một protein gấp nếp thành cấu trúc
ba chiều cuối cùng của nó, với sự hỗ trợ của các protein khác gọi làngười đi
kèm,và thường được biến đổi, ví dụ, bằng cách gắn carbohydrate. Sau đó,
protein bị biến đổi, gấp nếp sẽ được cô lập thành các vùng của mạng lưới nội
chất thô thiếu ribosome. Những vùng này hình thành nên mạng lưới nội chất
thô nhưtúi vận chuyển.
Khu phức hợp GolgiCác túi vận chuyển từ mạng lưới nội chất thô được vận
chuyển đếnphức hợp Golgi—một loạt các màng xếp chồng lên nhau—và hợp nhất
với nó (Hình 1.17). Quá trình xử lý tiếp theo các protein có trong các túi vận chuyển 0,5µtôi
diễn ra trong khu phức hợp Golgi. Đặc biệt, một nhóm carbohydrate khác được
thêm vào. Các protein có số phận khác nhau được sắp xếp trong khu phức hợp Hình 1.17Phức hợp Golgi.
Golgi. [Được phép của L. Andrew Staehelin, Đại học
Colorado.]
Hạt bài tiếtMỘThạt bài tiết,hoặc hạt zymogen, được hình thành khi
một túi chứa đầy protein dành cho việc tiết ra các chồi từ phức hợp
Golgi. Hạt hướng về phía màng tế bào. Khi nhận được tín hiệu thích
hợp, hạt bài tiết sẽ kết hợp với màng tế bào và thải hàng hóa của nóProtein
ra được tiết ra
môi trường ngoại bào, một quá trình được gọi làxuất bào(Hình 1.18).
Nội bàoVật chất được đưa vào tế bào khi màng sinh chất xâm lấn và
nảy chồi để hình thànhnội bào(không được hiển thị trong Hình 1.10B). Quá
trình này được gọi lànhập bào,đó là điều trái ngược với exocytosis.
Túi tiết
Endocytosis được sử dụng để đưa các chất sinh hóa quan trọng như ion
sắt, vitamin B12và cholesterol vào tế bào. Quá trình nội bào diễn ra thông phức hợp Golgi
qua các vùng nhỏ của màng, chẳng hạn như khi protein được đưa vào tế
túi vận chuyển
bào (Hình 1.19). Ngoài ra, một lượng lớn vật liệu cũng có thể được đưa vào
tế bào. Khi một lượng lớn vật chất được đưa vào tế bào, quá trình này được
Thô
gọi làsự thực bào.Hình 1.20cho thấy một tế bào của hệ thống miễn dịch, nội chất Nhân tế bào
được gọi là đại thực bào, vi khuẩn thực bào. Đại thực bào thực bào vi mạng lưới
khuẩn như một phương tiện bảo vệ sinh vật khỏi bị nhiễm trùng. Số phận
của các túi được hình thành do quá trình nhập bào hoặc thực bào là gì?
Màng tế bào
ngoại bào
vật liệu
Tế bào chất
Thời gian
Hình 1.19Nhập bào. Hình 1.20Thực bào.Vi khuẩn (được biểu thị bằng mũi tên) bị thực
bào bởi đại thực bào. [Được phép của Tiến sĩ Stanley Falkow.]
141 B
Tuy nhiên, ysosome không chỉ phân hủy vật liệu ngoại bào. Một vai trò khác là
tiêu hóa các bào quan nội bào bị tổn thương (Hình 1.21).
Không bào thực vậtMột cơ quan khác chỉ có ở tế bào thực vật, ngoài tế
bào lục lạp, là một không bào lớn. Ở một số tế bào thực vật, rganelle giới hạn
bằng màng đơn này có thể chiếm tới 80% thể tích tế bào (Hình 1.12). Những
M
acuole này lưu trữ nước, ion và các chất dinh dưỡng khác nhau. Ví dụ, không
bào của quả trus rất giàu axit xitric, chất này tạo ra vị chua của loại quả này.
Protein vận chuyển các phân tử qua màng không bào.
? CÂU HỎI NHANH 2Kể tên ba bào quan quả của chức năng lysosome không phù hợp. Chúng ta sẽ xem xét lại những rối loạn
hoặc cấu trúc có ở tế bào thực vật này và kiểm tra nhiều rối loạn khác khi chúng ta tiến bộ trong nghiên cứu về hóa sinh.
nhưng không có ở tế bào động vật.
Tổ chức tế bào chứng thực hàm lượng thông tin cao của tế bào. Nhưng phần
tổng quan ngắn gọn này mới chỉ chạm đến bề mặt của quá trình xử lý thông tin cần
phải diễn ra để tạo nên một thứ phức tạp như tế bào. Trong phần còn lại của cuốn
sách này, chúng ta sẽ xem xét các con đường thông tin và năng lượng sinh hóa xây
dựng và duy trì các hệ thống sống.
1.3 Giáo điều trung tâm mô tả các nguyên tắc cơ bản của việc chuyển
giao thông tin sinh học
Giáo điều trung tâm của sinh học nói rằng DNA được sao chép để tạo thành các
phân tử DNA mới. DNA cũng có thể được phiên mã để tạo thành RNA. Một số
thông tin ở dạng RNA, được gọi là RNA thông tin, có thể được dịch thành protein.
1.4 Màng xác định tế bào và thực hiện các chức năng của tế bào
Màng, được hình thành từ các lớp lipid kép, rất quan trọng trong việc thiết
lập ranh giới giữa các tế bào và môi trường của chúng cũng như để thiết
lập ranh giới trong các vùng bên trong của nhiều tế bào. Có hai loại tế bào
có cấu trúc riêng biệt: tế bào nhân chuẩn và tế bào nhân sơ. Tế bào nhân
chuẩn được đặc trưng bởi một dãy phức tạp gồm các ngăn có màng nội
bào bao bọc gọi là bào quan. Nhân là cơ quan lớn nhất và
các vấn đề15
chứa thông tin di truyền của tế bào. Các bào quan khác đóng vai trò chuyển
hóa năng lượng, xử lý và bài tiết protein cũng như tiêu hóa. Ngược lại, tế
bào nhân sơ nhỏ hơn, ít phức tạp hơn và chúng thiếu các ngăn có màng
bao bọc.
sự thống nhất của protein sinh phiên âm (trang 8) lục lạp (trang 12)
hóa (tr. 3) (tr. 5) bản dịch (trang 8) lưới nội chất (ER) (tr. 12) Phức
axit nucleic (trang 6) màng (trang 8) hợp Golgi (tr. 13)
nucleotide (trang 6) lớp lipid kép (tr. 8) sinh hạt bài tiết (zymogen) (tr. 13)
axit deoxyribonucleic (DNA) (trang 6) vật nhân chuẩn (tr. 9) xuất bào (tr. 13)
axit ribonucleic (RNA) (trang 6) lipid sinh vật nhân sơ (tr. 9) nội nhũ (trang 13)
(trang 6) màng sinh chất (tr. 10) tế nhập bào (tr. 13)
carbohydrate (trang 7) bào chất (tr. 10) thực bào (trang 13)
glycogen (trang 7) bộ xương tế bào (tr. 11) lysosome (trang 13)
giáo điều trung tâm (tr. hạt nhân (tr. 11)
7) nhân rộng (tr. 8) ty thể (trang 11)
CÁC VẤN ĐỀ
1.E. coli và voi. Cụm từ “sự thống nhất của hóa sinh” (a) Mạng lưới nội chất 1. Vị trí của phần lớn DNA
có nghĩa là gì? Ý nghĩa của sự thống nhất của hóa ___________ của tế bào
sinh là gì? (b) Nội chất trơn 2. Vị trí oxy hóa nhiên liệu
2.Tương tự, nhưng không giống nhau.Trình bày sự khác mạng lưới __________
3. Tách phần bên trong
nhau về cấu trúc giữa ADN và ARN.-1 (c) Nội chất thô tế bào ra khỏi
3.Polyme.Phân biệt protein và glycogen theo cấu mạng lưới __________ ngoài
trúc polyme của chúng.-1 (d) Phức hợp Golgi ______ 4. Mang theo những điều quan trọng
Các bài đọc chọn lọc cho chương này có thể được tìm thấy trực tuyến tại www.whfreeman.com/tymoczko3e.
Trang này còn cố tình để trống
chương C 2
ter, Trái phiếu yếu và
Tạo ra trật tự
t của sự hỗn loạn
C
ells, như được trình bày trong Chương 1, thể hiện một cách đáng chú ý về trật
tự chức năng. Hàng triệu phân tử riêng lẻ là các khối xây dựng của tế bào,
bao gồm bốn phân tử sinh học quan trọng của sự sống—protein, axit nucleic,
lipid và carbohydrate. Phần lớn các phân tử này ổn định vì chúng được cấu tạo bằng
liên kết cộng hóa trị mạnh – liên kết trong đó các electron được chia sẻ bởi các
nguyên tử tham gia. Tuy nhiên, cấu trúc và chức năng đáng chú ý của bản thân tế
bào được ổn định nhờ các tương tác yếu chỉ bằng một phần sức mạnh của liên kết
cộng hóa trị.
Hai câu hỏi ngay lập tức hiện lên trong đầu tôi: Làm sao có thể ổn định
được như vậy? Và tại sao nó lại có lợi? Câu trả lời cho câu hỏi đầu tiên là có sự
ổn định về số lượng. Nhiều liên kết yếu có thể tạo ra các cấu trúc ổn định lớn.
Câu trả lời cho câu hỏi thứ hai là liên kết yếu cho phép tương tác nhất thời. Cơ
chất có thể liên kết với enzyme và sản phẩm có thể rời khỏi enzyme. Một
hormone có thể liên kết với thụ thể của nó và sau đó tách ra khỏi thụ thể sau
khi nhận được tín hiệu. Liên kết yếu cho phép tương tác năng động và cho phép
17
182 Nước, mối liên kết yếu và sự hình thành trật tự từ sự hỗn loạn
năng lượng và thông tin để di chuyển trong tế bào và cơ thể.Các tương tác hóa học
nhất thời tạo thành nền tảng của hóa sinh và sự sống.
Nước là dung môi của sự sống và ảnh hưởng lớn đến các liên kết yếu, làm cho một số liên
kết yếu đi và tạo năng lượng cho sự hình thành của các liên kết khác. Ví dụ, các phân tử kỵ
nước, chẳng hạn như chất béo, hoàn toàn không thể tương tác với nước. Tuy nhiên, ác cảm hóa
học này lại được đưa vào sử dụng. Sự hình thành màng và cấu trúc ba chiều phức tạp của các
phân tử sinh học, đáng chú ý nhất là protein, được hỗ trợ bởi một giải pháp năng lượng nhằm
giải quyết sự đối lập hóa học giữa nước và các phân tử kỵ nước.
Bạn có biết không? Trải nghiệm cuộc sống của chúng ta diễn ra ở khoảng cách 4 angstrom (4 Å, hay 0,4
nm), độ dài điển hình của liên kết không cộng hóa trị. Áp lực của một bàn tay đang nắm,
Một angstrom (Å) = 0,1 nanomet (nm) = 1×10
cảm giác của một nụ hôn, việc đọc các từ trên trang này—tất cả những cảm giác này là
−10mét (m). Nó được đặt theo tên của nhà vật
lý người Thụy Điển Anders Jonas Ångström kết quả của các phân tử lớn, có liên kết cộng hóa trị, tương tác không cộng hóa trị với một
(1814–1874), người đã biểu thị bước sóng là loạt các phân tử lớn khác hoặc với các ion natri, photon, hoặc một tập hợp các phân tử tín
bội số của 1×10−10 hiệu khác, tất cả đều ở khoảng cách xấp xỉ 4 Å.
mét. chiều dài đó sau đó được đặt Trong chương này, chúng ta sẽ tập trung vào các tương tác nhất thời giữa các tương
tên là angstrom. tác yếu, thuận nghịch nhưng thiết yếu của các phân tử. Chúng ta sẽ xem các phân tử phải
gặp nhau như thế nào trước khi chúng có thể tương tác và sau đó sẽ kiểm tra cơ sở hóa
học của các tương tác yếu khác nhau. Cuối cùng, chúng ta sẽ xem xét các tương tác yếu,
thuận nghịch đặc biệt nổi bật—sự ion hóa nước và axit yếu.
2.1 Chuyển động nhiệt Năng lượng Tương tác sinh học
Năm 1827, nhà thực vật học người Anh Robert Brown đã quan sát dưới kính hiển vi
các hạt phấn hoa lơ lửng trong nước. Ông lưu ý rằng các hạt phóng đi một cách
ngẫu nhiên và nghĩ rằng ông đang quan sát sinh lực vốn có trong các hạt phấn hoa.
Ông bác bỏ ý kiến đó khi quan sát hành vi tương tự với các hạt thuốc nhuộm trong
nước hoặc các hạt bụi trong không khí. Chuyển động mà ông quan sát được, sau
này được gọi làchuyển động Brown,là nguồn năng lượng thiết yếu cho sự sống.
Chuyển động của các hạt mà Brown quan sát được là do sự dao động ngẫu nhiên
của hàm lượng năng lượng trong môi trường – nhiễu nhiệt. Các phân tử nước và khí
của môi trường nảy lên ngẫu nhiên với tốc độ chỉ được xác định bởi nhiệt độ. Khi các
phân tử này va chạm với các hạt phấn hoa hoặc các hạt bụi, các hạt này sẽ tự chuyển
động ngẫu nhiên.
Chuyển động Brown chịu trách nhiệm khởi đầu nhiều tương tác sinh hóa. Trong
bối cảnh tế bào, nước là môi trường phổ biến nhất tạo ra nhiễu nhiệt của chuyển
động Brown. Nước là chất bôi trơn tạo điều kiện thuận lợi cho dòng năng lượng và
biến đổi thông tin thông qua chuyển động Brown. Enzyme tìm thấy cơ chất của
chúng; nhiên liệu có thể được biến đổi dần dần để tạo ra năng lượng và các phân tử
tín hiệu có thể khuếch tán từ vị trí ban đầu đến vị trí tác động, tất cả đều thông qua
chuyển động Brown.
Chắc chắn là môi trường bên trong tế bào không đơn giản như ta tưởng. Tế bào
không chỉ đơn giản là những túi chứa đầy nước với các phân tử sinh học nảy lên. Như đã
mô tả trong Chương 1, rất nhiều tổ chức tạo điều kiện thuận lợi cho việc trao đổi các chất
chuyển hóa và phân tử tín hiệu theo chuyển động Brown. Những ví dụ về tổ chức này sẽ
xuất hiện nhiều lần trong quá trình nghiên cứu hóa sinh của chúng ta.
Nước là môi trường trong đó chuyển động Brown cung cấp động lực cho các
tương tác sinh hóa. Những đặc tính nào của nước khiến nó trở thành môi trường
hoàn hảo cho sự sống?
- 4 Mô tả tính chất hóa học của nước và 2.2 Tương tác sinh hóa diễn ra trong dung
giải thích nước ảnh hưởng như thế nào đến
các tương tác sinh hóa.
dịch nước
Nước là dung môi của sự sống. Con người có 65% là nước, cà chua có 90% là nước, và một tế
bào thông thường có khoảng 70% là nước. Thật vậy, hầu hết các sinh vật chủ yếu là nước,
2.2 Các tương tác sinh hóa diễn ra trong dung dịch nước19
chúng là vi khuẩn, xương rồng, cá voi hoặc voi. Nhiều phân tử hữu cơ cần thiết cho quá
trình sinh hóa của hệ thống sống hòa tan trong nước. Về bản chất, nước làm cho các
phân tử trở nên di động và cho phép các tương tác được hỗ trợ bởi chuyển động Brown
giữa các phân tử. Cơ sở hóa học của khả năng hòa tan nhiều phân tử sinh học của nước là
gì? d-
Nước là một phân tử đơn giản, bao gồm hai nguyên tử hydro liên kết với nhau ồ
bằng liên kết cộng hóa trị với một nguyên tử oxy. Các tính chất quan trọng của nước H H
d+ d+
là do oxy là một nguyên tử có độ âm điện. Nghĩa là, mặc dù các liên kết nối các
nguyên tử hydro với nguyên tử oxy là cộng hóa trị, nhưng các electron của liên kết
dành nhiều thời gian hơn ở gần nguyên tử oxy. Do sự phân bố điện tích không đồng
đều nên phân tử nước được cho làvùng cực. Nguyên tử oxy mang điện tích âm nhẹ
(được gọi làd−) và các nguyên tử hydro tương ứng mang điện tích dương nhẹ (d+).
Sự phân cực này có sự phân nhánh hóa học quan trọng. Các nguyên tử hydro
tích điện dương một phần của một phân tử nước có thể tương tác với các nguyên tử
oxy tích điện âm một phần của một phân tử nước khác. Sự tương tác này được gọi là
tương tácliên kết hydro(Hình 2.1). Như chúng ta sẽ thấy, liên kết hydro không chỉ có
ở các phân tử nước mà trên thực tế là liên kết yếu phổ biến trong các phân tử sinh
học. Nước lỏng có cấu trúc có trật tự một phần, trong đó các cụm phân tử liên kết
hydro liên tục hình thành và tách ra, với mỗi phân tử nước liên kết hydro với trung
bình 3,4 phân tử lân cận. Do đó, nước có tính kết dính. Tính phân cực của nước và
khả năng hình thành liên kết hydro khiến nó trở thành dung môi cho bất kỳ phân tử
tích điện hoặc phân cực nào.
Hình 2.1Liên kết hydro trong nước.liên kết hydro (được hiển thị dưới dạng đường nét đứt màu xanh lá
cây) được hình thành giữa các phân tử nước để tạo ra cấu trúc mở và có trật tự cao.
Những cây khổng lồ trong rừng gỗ đỏ—những cây có thể cao hàng trăm
feet—là một minh chứng đáng chú ý về sức mạnh gắn kết của nước được tạo ra
bởi các liên kết hydro. Nước dâng lên ngọn cây bằng sự thoát hơi nước, sự bốc
hơi nước từ những chiếc lá trên cùng. Sự thoát hơi nước kéo nước từ rễ lên. Cột
nước này được duy trì nhờ liên kết hydro giữa các phân tử nước. Thật vậy, độ
bền của liên kết hydro có thể đóng vai trò hạn chế chiều cao tối đa mà cây gỗ
đỏ đạt được. Khi các liên kết bị đứt, tắc mạch (bong bóng khí) hình thành, ngăn
không cho nước tiếp tục chảy lên ngọn cây (Hình 2.2).
Mặc dù khả năng hòa tan nhiều chất sinh hóa của nước là cực kỳ quan trọng,
nhưng thực tế là nước không thể hòa tan một số hợp chất cũng quan trọng không
Hình 2.2Rừng gỗ đỏ.hydro
kém. Một loại phân tử nhất định được gọi làkhông phân cực,hoặckỵ nước,không tan liên kết cho phép nước di chuyển từ rễ đến các
được trong nước. Những phân tử này, khi có mặt nước, hoạt động giống hệt như lá trên cùng của cây gỗ đỏ khổng lồ. [Jorg
dầu trong nước sốt trộn salad dầu và giấm: chúng tự cô lập khỏi hackemann/Shutterstock.]
202 Nước, mối liên kết yếu và sự hình thành trật tự từ sự hỗn loạn
nước, một quá trình được gọi là hiệu ứng kỵ nước (tr. 23). Tuy nhiên, các hệ
thống sống tận dụng lợi thế lớn của sự thù địch hóa học này để tạo ra nhiều cấu
trúc phức tạp cần thiết cho sự tồn tại liên tục của chúng. Thật vậy, màng tế bào
và màng cơ quan hình thành do hiệu ứng kỵ nước.
- 5 Mô tả các loại tương tác không cộng hóa trị, 2.3 Tương tác yếu là đặc tính sinh hóa quan trọng
tương tác thuận nghịch và giải thích tại sao tương
tác thuận nghịch Các tương tác phân tử không cộng hóa trị, dễ thuận nghịch là những tương tác thiết
tương tác rất quan trọng yếu trong dòng năng lượng và thông tin. Các lực yếu, không cộng hóa trị này đóng
trong sinh hóa. vai trò trong việc sao chép chính xác DNA, gấp protein thành các dạng ba chiều
phức tạp, nhận biết đặc hiệu các chất phản ứng bằng enzyme và phát hiện các tín
hiệu phân tử.Ba liên kết không cộng hóa trị cơ bản là (1) liên kết ion hoặc tương tác
tĩnh điện; (2) liên kết hydro; và (3) tương tác van der Waals.Chúng khác nhau về hình
học, sức mạnh và tính đặc hiệu. Hơn nữa, các liên kết này bị ảnh hưởng rất nhiều
theo những cách khác nhau bởi sự hiện diện của nước. Chúng ta hãy xem xét đặc
điểm của từng loại.
Ở đâuElà lực lượng,q1Vàq2là điện tích của hai nguyên tử (tính theo đơn vị
điện tích),rlà khoảng cách giữa hai nguyên tử (tính bằng angstrom),Dlà
hằng số điện môi (có tính đến ảnh
hưởng của môi trường can thiệp) vàk
là hằng số tỷ lệ. Do đó, tương tác tĩnh
điện giữa hai nguyên tử mang điện
H2ồ Na1
Na1 tích trái dấu thay đổi tỉ lệ nghịch với
bình phương khoảng cách giữa
chúng cũng như với bản chất của môi
Cl2 trường can thiệp. Tương tác tĩnh điện
mạnh nhất trong chân không, ở đóD=
1. Khoảng cách để độ bền liên kết tối
đa là khoảng 3 Å. Do đặc tính phân
cực của nó, nước (có hằng số điện
Cl2 môi bằng 80) làm suy yếu tương tác
tĩnh điện. Ngược lại, tương tác tĩnh
điện được tối đa hóa trong môi
trường không tích điện. Ví dụ, tĩnh
điện trong
Tương tác giữa hai ion mang điện tích trái dấu cách nhau 3 Å trong nước có
NaCl
năng lượng −5,8 kJ mol−1(-1,4 kcal mol−1), trong khi đó giữa hai ion giống
Hình 2.3Natri clorua hòa tan trong nhau cách nhau 3 Å trong dung môi không phân cực như hexane (có hằng
Nước.khi các ion natri phân tán, điện tích số điện môi là 2) có năng lượng −231 kJ mol−1(−55 kcal mol−1). (Lưu ý: Một
dương của chúng bị trung hòa bởi điện tích kilojoule, viết tắt là kJ, tương đương với 0,239 kilocalorie, viết tắt là kcal.)
âm một phần của các nguyên tử oxy trong
nước. các ion clorua được bao quanh bởi các
Tại sao nước làm suy yếu tương tác tĩnh điện? Hãy xem điều gì xảy
điện tích dương một phần trên các nguyên tử
hydro. [Thông tin từ DL Nelson và MM Cox,
ra khi cho một hạt muối NaCl vào nước. Ngay cả ở dạng tinh thể, muối
Nguyên lý hóa sinh của Lehninger, tái bản lần vẫn được biểu hiện thích hợp hơn ở dạng ion Na+Cl−. Muối làm tan liên
thứ 5. (W. h. Freeman và Company, 2008), tr. kết ion giữa Na+và Cl−bị phá hủy—bởi vì các ion riêng lẻ bây giờ liên kết
47.] với các phân tử nước chứ không phải với nhau (Hình 2.3). Nước
2.3 Tương tác yếu là đặc tính sinh hóa quan trọng21
có thể hòa tan hầu như bất kỳ phân tử nào có đủ điện tích một phần hoặc toàn bộ trên
Liên kết hydro Liên kết hydro
phân tử để tương tác với nước. Sức mạnh để giải thể này là rất quan trọng. Chuyển động nhà tài trợ người chấp nhận
Brown tạo ra những va chạm giữa các phân tử hòa tan, và nhiều va chạm trong số này 0,9 Å 2,0 Å
dẫn đến những tương tác thoáng qua nhưng hiệu quả. N H ồ
180°
Liên kết hydro hình thành giữa nguyên tử có độ âm điện và hydro
Liên kết hydro không chỉ có ở các phân tử nước; sự phân bố điện tích không
đồng đều cho phép hình thành liên kết hydro có thể phát sinh bất cứ khi nào
hydro liên kết cộng hóa trị với một nguyên tử có độ âm điện. Trong hóa sinh,
Liên kết hydro Liên kết hydro
hai nguyên tử có độ âm điện phổ biến nhất có trong liên kết hydro là oxy và nhà tài trợ người chấp nhận
nitơ. Liên kết hydro điển hình bao gồm các nguyên tử này được thể hiện trong NH N−
− +
Hình 2.4. Liên kết hydro yếu hơn nhiều so với liên kết cộng hóa trị. Chúng có
năng lượng từ 8 đến 20 kJ mol−1(từ 2 đến 5 kcal mol−1) so với khoảng 418 kJ mol N H ồ
−1(100 kcal mol−1) tạo thành liên kết cộng hóa trị cacbon-hydro. Liên kết hydro
ồ H N
cũng dài hơn liên kết cộng hóa trị một chút; khoảng cách liên kết của chúng
(được đo từ nguyên tử hydro) nằm trong khoảng từ 1,5 đến 2,6 Å; do đó, ồ H ồ
khoảng cách từ 2,4 đến 3,5 Å tách hai nguyên tử không phải hydro trong liên
Hình 2.4Liên kết hydro bao gồm các
kết hydro. Liên kết hydro giữa hai phân tử sẽ bị phá vỡ bởi nước, vì nước tự nguyên tử nitơ và oxy.các
hình thành liên kết hydro với các phân tử (Hình 2.5). Ngược lại, liên kết hydro vị trí của các điện tích từng phần (d+Vàd−) được
giữa hai phân tử mạnh hơn khi không có nước. thể hiện.
C C
H H
ồ ồ ồ
ồ H H
H H ồ Và
H H H
N ồ H N
Hình 2.5Phá vỡ liên kết hydro.Sự cạnh tranh giữa các phân tử nước làm gián đoạn liên kết
hydro trong các phân tử khác.
Tương tác van der Waals phụ thuộc vào sự bất đối xứng nhất thời
của điện tích
Nhiều phân tử sinh học quan trọng không phân cực cũng không tích điện. Tuy
nhiên, các phân tử như vậy có thể tương tác với nhau bằng tĩnh điện.tương tác van
der Waals.Cơ sở của tương tác van der Waals là sự phân bố điện tích xung quanh
nguyên tử thay đổi theo thời gian và tại bất kỳ thời điểm nào, sự phân bố điện tích
không hoàn toàn đối xứng: sẽ có các vùng mang điện tích dương một phần và một
phần điện tích âm. Sự bất đối xứng nhất thời này trong điện tích xung quanh
Repulsion
nguyên tử tác động thông qua các tương tác tĩnh điện để tạo ra sự bất đối xứng bổ van der Waals
sung trong sự phân bố electron xung quanh các nguyên tử lân cận của nó. Lực hút khoảng cách liên lạc
Energy
giữa hai nguyên tử tăng lên khi chúng đến gần nhau hơn cho đến khi chúng bị tách 0
Khoảng cách
ra bởikhoảng cách liên lạc van der Waals,tương ứng với 3 đến 4 Å, tùy thuộc vào các
nguyên tử tham gia (Hình 2.6). Ở khoảng cách ngắn hơn, lực đẩy rất mạnh trở nên
Attraction
chiếm ưu thế do các đám mây điện tử bên ngoài chồng lên nhau. Năng lượng liên
quan đến tương tác van der Waals khá nhỏ; tương tác điển hình đóng góp từ 2 đến 4
kJ mol−1(từ 0,5 đến 1,0 kcal mol−1) trên mỗi cặp nguyên tử. Tuy nhiên, khi bề mặt của
hai phân tử lớn có hình dạng bổ sung kết hợp với nhau, một số lượng lớn nguyên tử
tiếp xúc với van der Waals, và hiệu ứng tổng cộng, được tổng hợp trên nhiều cặp Hình 2.6Năng lượng của tương tác van
der Waals khi hai nguyên tử tiến lại gần
nguyên tử, có thể rất đáng kể. Mặc dù phương châm của mọi tương tác tĩnh điện
nhau.năng lượng là nhiều nhất
yếu có thể là “sự ổn định về số lượng”, nhưng phương châm này đặc biệt áp dụng
thuận lợi ở khoảng cách tiếp xúc van der
cho các tương tác van der Waals. Waals. năng lượng tăng nhanh do lực đẩy
Một ví dụ đáng chú ý về sức mạnh của tương tác van der Waals được cung cấp electron-electron khi các nguyên tử di
bởi tắc kè (Hình 2.7). Những sinh vật này có thể đi lên tường và xuyên trần nhà, chuyển gần nhau hơn khoảng cách này.
222 Nước, Liên kết yếu và Tạo lập Trật tự
thách thức trọng lực do tương tác van der Waals giữa bàn chân của họ và
bề mặt tường hoặc trần nhà.
Liên kết yếu cho phép tương tác lặp đi lặp lại
Một đặc điểm quan trọng của liên kết yếu là chúng có thể dễ dàng bị phá vỡ. DNA
cung cấp một ví dụ tuyệt vời về lý do tại sao việc phá vỡ các liên kết yếu là điều cần
thiết. Liên kết hydro giữa các cặp bazơ giúp ổn định chuỗi xoắn kép và giữ cho thông
tin mã hóa—trình tự bazơ—bên trong chuỗi xoắn tránh khỏi các phản ứng có hại
tiềm tàng (Hình 2.8; cũng như Hình 1.3). Tuy nhiên, như đã nêu trong Chương 1,
nếu muốn thông tin trở nên hữu ích thì nó phải có thể truy cập được. Do đó, chuỗi
xoắn kép có thể được mở ra—các sợi được tách ra—để DNA có thể được sao chép
?
Câu đố nhanh 1tất cả các tương
tác yếu có thể nói là tương tác hoặc để các gen trên DNA có thể được biểu hiện. Các tương tác yếu đủ mạnh để ổn
tĩnh điện. giải thích. định và bảo vệ DNA nhưng cũng đủ yếu để cho phép truy cập thông tin về trình tự
bazơ trong những trường hợp thích hợp.
H
H CH3
ồ H N
N H ồ
N N
HN N
N N N N H N
N
phân tử
phân tử
nước, tạo thành hai lớp riêng biệt. Ngay cả sau khi lắc, các lớp sẽ nhanh chóng hình
thành lại. Cơ sở của tổ chức này là gì?
Để hiểu cách thức tổ chức này diễn ra, chúng ta cần tham khảo Định luật
Nhiệt động lực học thứ hai:
Tổng entropy của một hệ và môi trường xung quanh nó luôn tăng trong một
quá trình tự phát.
Sự hỗn loạnlà thước đo của sự ngẫu nhiên. Hệ thống này có thể là một phản ứng hóa học,
một tế bào hoặc một chai nước trộn salad. Hãy xem xét việc đưa một phân tử không phân
cực, chẳng hạn như benzen, vào một số nước (Hình 2.9). Benzen
Một khoang trong nước được tạo ra do benzen không có phương tiện hóa
học nào để tương tác với phân tử nước. Khoang này tạm thời phá vỡ một số liên
kết hydro giữa các phân tử nước. Các phân tử nước bị dịch chuyển sau đó tự
định hướng lại để tạo thành số lượng liên kết hydro mới tối đa. Tuy nhiên, có ít
cách hình thành liên kết hydro xung quanh phân tử benzen hơn so với trong
nước tinh khiết.Các phân tử nước xung quanh phân tử benzen có trật tự hơn
nhiều so với những nơi khác trong dung dịch.Việc đưa phân tử không phân cực
vào nước đã dẫn đếnentropy của nước giảm. Bây giờ hãy xem xét sự sắp xếp
của hai phân tử benzen trong nước. Chúng không cư trú trong các hốc nhỏ
riêng biệt (Hình 2.9A); thay vào đó, chúng hợp lại thành một cái lớn hơn (Hình
2.9B). Họ trở nên có tổ chức. Cơ sở năng lượng cho sự hình thành trật tự này là
sự liên kết của các phân tử benzen giải phóng một số phân tử nước có trật tự
xung quanh các benzen bị tách ra, làm tăng entropy của hệ.Các phân tử chất
tan không phân cực được liên kết với nhau trong nước không phải chủ yếu vì
chúng có ái lực cao với nhau mà bởi vì khi chúng liên kết với nhau, chúng sẽ giải
phóng các phân tử nước.Sự liên kết theo hướng entropy này được gọi làtác
dụng kỵ nước,và các tương tác kết quả được gọi làtương tác kỵ nước. Tương tác
kỵ nước hình thành một cách tự nhiên—không cần cung cấp năng lượng—vì khi
chúng hình thành, entropy của nước tăng lên.
hợp không có trật tự của các phân tử chưa được gấp lại
Làm thế nào chúng ta có thể dung hòa sự mâu thuẫn rõ ràng rằng protein
thành một giải pháp tương đối đồng nhất gồm các phân tử
CH3
Alanine
Phenylalanin
Ethanol
Alđehit Aldehyt ồ ồ
R CH H 3C C H
Acetaldehyde
Keto xeton ồ ồ
R C R H 3C C CH3
Aceton
CH3
Alanine
ồ– HC Ồ
ồ
H2COPO–
ồ–
Axit 3-Phosphoglyceric
Sulfhydryl Thiol R SH ồ
H2N CH C OH
CH2
SH
Cysteine
Lưu ý: Có nhiều nhóm béo (chuỗi hydrocarbon) và nhóm thơm. Nhóm methyl và nhóm benzyl được hiển thị làm ví dụ. Cũng lưu ý rằng nhiều ví dụ có nhiều hơn một
nhóm chức năng. Chữ R là viết tắt của phần còn lại của phân tử. Cuối cùng, lưu ý rằng mộtnguyên tử cacbon liên kết đôi với nguyên tử oxi, C=O, được gọi là nhóm
cacbonyl, có trong aldehyd, xeton và axit cacboxylic, bao gồm cả axit amin. Các nhóm cacbonyl thường gặp trong các chất sinh hóa.
262 Nước, mối liên kết yếu và sự hình thành trật tự từ sự hỗn loạn
các nhóm kỵ nước khác có thể tương tác với các nhóm kỵ nước khác thông qua
tương tác van der Waals. Về cơ bản, mọi phân tử sinh học mà chúng ta gặp trong
nghiên cứu hóa sinh sẽ có một hoặc nhiều nhóm chức năng này.
- 6 Xác định độ pH và giải thích tại sao sự thay 2,5 pH là một thông số quan trọng của hệ thống sinh hóa
đổi độ pH có thể ảnh hưởng đến hệ thống sinh
hóa. Những ví dụ đặc biệt quan trọng của phản ứng thuận nghịch là những phản ứng bao
gồm sự giải phóng hoặc liên kết ion hydro, H+, còn gọi là proton. CácpHcủa dung dịch là
thước đo nồng độ ion hydro, với các giá trị nằm trong khoảng từ 0 đến 14. Số nhỏ hơn
Bạn có biết không?
biểu thị môi trường axit và số lớn hơn biểu thị môi trường cơ bản. Thật vậy, pH là một
một ví dụ phổ biến về sự thay đổi bệnh lý
thông số quan trọng của hệ thống sống. Ví dụ, độ pH của máu người là khoảng 7,4 và độ
của độ pH môi trường là bệnh trào ngược
dạ dày thực quản, hay GerD. một bệnh tiêu lệch +/− 0,5 đơn vị có thể dẫn đến hôn mê hoặc tử vong. Tại sao việc duy trì độ pH thích
hóa mãn tính, GerD hợp lại quan trọng đến vậy? Sự thay đổi độ pH có thể ảnh hưởng mạnh mẽ đến môi
phát triển khi axit dạ dày trào ngược lên trường tĩnh điện bên trong của sinh vật, điều này có thể làm thay đổi các liên kết yếu duy
thực quản. sự trào ngược của axit, trì cấu trúc của các phân tử sinh học. Cấu trúc bị thay đổi thường có nghĩa là mất chức
thường gây ra chứng ợ nóng, kích thích năng. Ví dụ, liên kết ion có thể yếu đi hoặc biến mất khi thay đổi độ pH và liên kết hydro
niêm mạc thực quản bằng cách để mô
có thể hình thành hoặc không hình thành, tùy thuộc vào độ pH. Do tầm quan trọng của
tiếp xúc với axit rất cao.
việc duy trì độ pH thích hợp đối với hoạt động chính xác của các hệ thống sinh hóa, điều
điều kiện (ph 1 đến 2). GerD có thể gây
viêm mãn tính ở thực quản, dẫn đến các quan trọng là phải có phương tiện mô tả độ pH. Bây giờ chúng ta sẽ nghiên cứu bản chất
biến chứng, bao gồm loét thực quản và ung định lượng của pH, ảnh hưởng của axit và bazơ lên pH và phương tiện giúp tế bào duy
thư thực quản. các yếu tố nguy cơ đối với trì độ pH gần như không đổi.
GerD bao gồm hút thuốc và béo phì.
Kw=Keq× [H2ồ]
sau đó đơn giản hóa thành
Kw 1.0×10−14M 2
[Ồ−] = = =4×10−9M
[H+] 2,5×10−4M
Do đó, nếu biết nồng độ của proton hoặc ion hydroxyl thì có thể xác
định được nồng độ của ion chưa biết.
AxittôiH++căn cứ
Chất được hình thành do sự ion hóa axit là chất của nóbazơ liên hợpvà được
phân biệt với axit bị ion hóa bằng hậu tố “ate”. Ngược lại, sự proton hóa của
một bazơ mang lạiAxit liên hợp. Hãy xem xét axit axetic, một axit cacboxylic.
Axit cacboxylic là các nhóm chức năng chính được tìm thấy trong nhiều chất
sinh hóa (Bảng 2.1). Axit axetic và ion axetat là cặp axit-bazơ liên hợp:
CH3COOHtôiH++CH3COOH−
A-xít a-xê-tíc Acetate
HàtôiH++MỘT−
Hằng số cân bằngKMộtcho sự ion hóa này là
[H+][MỘT−]
KMột= (4)
[HA]
Giá trị của càng lớnKMộtnghĩa là axit càng mạnh (Hình 2.11).
Mối quan hệ giữa pH và tỷ lệ axit và bazơ là gì? Nói cách khác, một axit sẽ
phân ly như thế nào ở độ pH cụ thể? Một biểu thức hữu ích thiết lập mối quan
hệ giữa pH và tỷ lệ axit/bazơ có thể thu được bằng cách sắp xếp lại phương
trình 4:
1 1 [A−]
= (5)
[H+] KMột[HA]
nhật ký(
1
[H+] ) =nhật ký (
1
)
K Một
+ ([HA])
nhật ký
[MỘT−]
(6)
Axit ba chiều
Axit photphoric
(KMột= 7,25 10 3 M)
Dihydro photphat H3PO4 H2PO4 H H2PO4 HPO42 H HPO42 PO43 H
(KMột= 1,38 107 M)
PKMột 2.14 6,86 PKMột 12,4
Monohydro photphat PKMột
1 2 3 4 5 6 7 số 8 9 10 11 12 13
pH
Hình 2.11Một số cặp axit-bazơ liên hợp.Nhiều cặp axit-bazơ liên hợp được
quan trọng trong sinh hóa. Một mẫu của các cặp như vậy được hiển thị. Lưu ý rằng một số axit có thể giải
phóng nhiều hơn một proton. Phản ứng phân ly và pKMộtđối với mỗi cặp được hiển thị nơi chúng nằm dọc
theo độ pH. Hằng số cân bằng của các axit được cho ở bên trái hình minh họa. *Lưu ý pKMột
của axit cacbonic. Do lượng carbon dioxide dự trữ trong máu lớn và sự cân bằng nhanh chóng của nó với
axit carbonic, pKMộtlượng axit cacbonic trong máu được lấy là 6,1. [Dữ liệu từ DL Nelson và MM Cox,Nguyên
lý hóa sinh của Lehninger, tái bản lần thứ 5. (WH Freeman và Company, 2008), Hình 2.15.]
Thay thế pH cho log 1/[H+] và PKMộtcho nhật ký 1/KMộttrong phương trình 6 mang lại
9
CH3COO– pH = pKMột+ nhật ký ( [MỘT−]
[HA] ) (7)
số 8
vùng đất
4
pH 3,76
pH = pKMột= 4,76
Trên pKMột, [MỘT−] chiếm ưu thế, trong khi dưới pKMột, [HA] chiếm ưu
3
thế. Để tham khảo độ mạnh của axit, pKMộthữu ích hơn hằng số ion hóa (K
2 Một) bởi vì pKMộtkhông yêu cầu sử dụng các ký hiệu khoa học đôi khi rườm
CH3COOH
1 rà. Lưu ý trong Hình 2.11 rằng các axit sinh hóa quan trọng nhất sẽ bị phân
0 ly chủ yếu ở pH sinh lý (∼7.4) Do đó, các phân tử này thường được gọi là
0 0,1 0,3 0,5 0,7 0,9 1,0
bazơ liên hợp (ví dụ: pyruvate) chứ không phải là axit (ví dụ: axit pyruvic).
Ồ−đã thêm (tương đương)
0 50 100
Bộ đệm chống lại sự thay đổi độ pH
Phần trăm chuẩn độ
Cặp liên hợp axit-bazơ (như axit axetic và ion axetat) có một đặc tính quan trọng: nó
Hình 2.12Đường cong chuẩn độ cho
chống lại sự thay đổi độ pH của dung dịch. Nói cách khác, nó hoạt động như một
A-xít a-xê-tíc.Chú ý rằng, gần pKMộtcủa axit
axetic, độ pH không thay đổi nhiều khi thêm đệm. Hãy xem xét việc bổ sung OH−dung dịch axit axetic (HA):
nhiều bazơ. [Dữ liệu từ DL HA + OH−tôiMỘT−+H2ồ
Nelson và MM Cox,Nguyên lý hóa sinh của
Lehninger, tái bản lần thứ 5. (WH Freeman và Sơ đồ cho thấy độ pH của dung dịch này thay đổi như thế nào theo lượng OH−được thêm vào
Company, 2008), tr. 58.] được gọi là mộtđường cong chuẩn độ(Hình 2.12). Lưu ý rằng có một điểm uốn trong
2.5 pH là thông số quan trọng của hệ thống sinh hóa 29
12 14
Điểm giữa của phép chuẩn độ
13 NH3
10
12 Đang đệm
0,1 mM Na+CH3COO−
11
PKMột= 9,25 vùng:
số 8
[NH4+] = [NH3] 10:25
10
Thay đổi độ pH dần dần
6 HPO2− NH3
pH
9 4
8,25
số 8 [H2PO4 − ] = [HPO2−
4]
4 7,86
pH
7 NH4+ photphat
Nước
2 6 5,86
PKMột= 6,86
5,76
5 H2PO−4 Acetate
0 CH3COO−
0 10 20 30 40 50 60 4
3,76
Thêm axit (giọt) [CH3COOH] = [CH3COO−]
3
PKMột= 4,76
Hình 2.13Hành động đệm.Phép cộng 2
của axit mạnh—chẳng hạn như HCl 1 M—vào nước CH3COOH
1
tinh khiết sẽ dẫn đến độ pH giảm ngay lập tức xuống
0 Hình 2.14Đường cong chuẩn độ của ba
gần 2, như đường màu xanh lam cho thấy. Ngược lại, 0 0,1 0,3 0,5 0,7 0,9 1,0 axit yếu quan trọng.Thông báo rằng
việc bổ sung axit vào natri axetat 0,1 mM (Na+CH3
Ồ−đã thêm (tương đương) các vùng có khả năng đệm khác nhau. [Dữ liệu từ
COO−) dẫn đến sự thay đổi độ pH dần dần cho đến
DL Nelson và MM Cox,Nguyên lý hóa sinh của
khi độ pH giảm xuống dưới 3,5, như được thể hiện 0 50 100 Lehninger, tái bản lần thứ 5.
bằng đường màu đỏ.
Phần trăm chuẩn độ (WH Freeman và Company, 2008), tr. 59.]
đường cong ở pH 4,8, là pKMộtcủa axit axetic. Trong vùng lân cận độ pH này,
việc bổ sung một lượng tương đối lớn OH−vào đệm tạo ra ít thay đổi về độ
pH của dung dịch. Nói cách khác, bộ đệm duy trì giá trị pH gần điểm p.KMột
thành phần axit của dung dịch đệm, mặc dù có thêm proton hoặc ion
hydroxit.Hình 2.13so sánh sự thay đổi độ pH khi thêm một axit mạnh vào
nước tinh khiết với sự thay đổi độ pH khi thêm axit mạnh đó vào dung dịch
đệm. Độ pH của dung dịch đệm không thay đổi nhanh như nước tinh khiết.
Nói chung, một axit yếu có hiệu quả nhất trong việc đệm chống lại sự thay
đổi pH ở vùng lân cận của nó.KMộtgiá trị.Hình 2.14cho thấy phạm vi đệm
của ba axit yếu khác nhau.
Kiến thức về hoạt động của bộ đệm rất quan trọng vì hai lý do. Đầu tiên, phần lớn hoạt động hóa sinh
được nghiên cứu thực nghiệm trong ống nghiệm (trong thủy tinh, hoặc trên thực tế là trong ống
nghiệm). Bởi vì các phân tử sinh học đang được nghiên cứu rất nhạy cảm với độ pH nên các nhà hóa
sinh phải sử dụng chất đệm để duy trì độ pH thích hợp trong suốt quá trình thí nghiệm. Việc lựa chọn
bộ đệm thích hợp thường rất quan trọng để thiết kế một thử nghiệm thành công.
Thứ hai, chúng ta cần hiểu các chất đệm để hiểu cách một sinh vật kiểm
soát độ pH của môi trường bên trong nó trong cơ thể sống - tức là trong cơ thể
sống. Như đã đề cập trước đó, nhiều quá trình sinh hóa tạo ra axit. Độ pH của
sinh vật được duy trì như thế nào để đáp ứng với việc sản xuất axit? Các chất
đệm quan trọng về mặt sinh lý là gì?
Chúng ta sẽ xem xét khả năng đệm pH của máu như một ví dụ về hệ thống
sinh lý. Trong quá trình tiêu thụ nhiên liệu sinh hóa hiếu khí, carbon dioxide (CO
2) được tạo ra (Chương 19). Khí cacbonic phản ứng với nước tạo ra axit yếu là
axit cacbonic:
bởi một axit được thêm vào sẽ kết hợp với ion bicarbonate, do đó ít ảnh hưởng đến
302 Nước, mối liên kết yếu và sự hình thành trật tự từ sự hỗn loạn
độ pH. Hiệu quả của H2CO3/HCO− 3 hệ thống đệm được tăng cường bởi
thực tế là số lượng chất đệm trong máu có thể được điều chỉnh nhanh chóng. Ví
dụ, nếu có một dòng axit chảy vào máu, phản ứng 9 sẽ diễn ra ở bên trái, dẫn
đến phản ứng 8 ở bên trái. CO mới được tạo ra2sau đó có thể hết hạn
từ phổi. Về bản chất, tỷ lệ H2CO3/HCO− 3được duy trì, mà
giữ cho độ pH không đổi. Cơ chế kiểm soát pH máu này được gọi lànhiễm
kiềm hô hấp bù trừ.
Tạo bộ đệm là một thực hành phổ biến trong phòng thí nghiệm
Hãy xem xét một bài tập thường gặp trong các phòng thí nghiệm sinh học: tạo
chất đệm. Hãy tưởng tượng rằng chúng ta có một loại protein và muốn xem
hoạt động thay đổi như thế nào theo hàm số của pH. Để làm như vậy, chúng tôi
cần các bộ đệm bao gồm một loạt các giá trị pH và chúng tôi kiểm tra hoạt
động của protein ở mỗi giá trị. Ví dụ: hãy xem xét cách tạo 1 lít dung dịch đệm
axetat 0,3 M, pH 4,46. Ta có sẵn dung dịch axit axetic 2M (axit yếu pKMột= 4,76)
và dung dịch kali hydroxit 2,5 M (KOH; bazơ mạnh). Những giải pháp này được
gọi là giải pháp gốc. Hãy nhớ rằng dung dịch đệm axetat sẽ bao gồm hỗn hợp
ion axetat và axit axetic; vì vậy trước tiên chúng ta phải xác định tỷ lệ giữa
axetat và axit axetic sẽ mang lại pH 4,46 và sau đó tính lượng từng thành phần
cần thiết để mang lại tổng nồng độ mol (nồng độ axit cộng với nồng độ bazơ)
bằng 0,3 M.
Về cơ bản, tất cả các vấn đề về đệm đều có thể được giải quyết bằng một chút kiến thức cơ bản
về hóa học và phương trình Henderson–Hasselbalch:
( [axetat]
4,46 = 4,76 + log [A-xít a-xê-tíc] )
hoặc
( [axetat]
− 0,3 = log [A-xít a-xê-tíc] )
Tìm antilog của 0,3 mang lại
[axetat]
=0,5
[A-xít a-xê-tíc]
Phương trình này cho chúng ta biết rằng, để thu được pH = 4,46 với dung dịch đệm
axetat, hai phần ba axetat sẽ được đóng góp bởi axit và một phần ba bởi bazơ. Vì chúng
ta cần tổng nồng độ mol là 0,3 M nên chúng ta sẽ cần 0,2 M axit axetic và 0,1 M axetat.
Bây giờ cho hóa học đơn giản.
Trước hết, chúng tôi không có bất kỳ dung dịch axetat nào; chúng ta chỉ có
axit axetic và kali hydroxit. Do đó, tất cả axetat trong dung dịch đệm sẽ đến từ
axit axetic và sau đó chúng tôi sẽ chuyển đổi một phần ba axit axetic thành
axetat. Vậy chúng ta cần thêm bao nhiêu dung dịch gốc axit axetic 2 M để thu
được axit axetic 0,3 M? Hãy nhớ rằng theo định nghĩa, dung dịch 0,3 M chứa 0,3
mol mỗi lít. Bây giờ chúng ta phải xác định thể tích của dung dịch gốc axit axetic
2 M chứa 0,3 mol. Nếu dung dịch 2 M chứa 2 mol/l thì 0,15 lít, hay 150 ml dung
dịch gốc sẽ chứa 0,3 mol axit axetic. Chúng tôi đổ lượng này vào chai có nhãn
dung dịch đệm axetat 0,3 M, pH 4,46. Còn axetat thì sao? Nguồn duy nhất của
ion axetat là axit axetic, và do đó chúng ta phải tạo ra axetat bằng cách thêm
KOH vào 150 ml axit axetic mà chúng ta đã tạo ra.
Bản tóm tắt31
đã đặt sang một bên. Kali hydroxit là một bazơ mạnh: khi trộn với axit axetic, nó
sẽ chuyển một lượng axit axetic tương đương thành axetat, hay chính xác hơn
là kali axetat. Chúng ta cần tạo ra ion axetat 0,1 M từ 0,3 mol axit axetic mà
chúng ta đã có trong chai. Bằng cách sử dụng lý luận trước đó, chúng ta biết
rằng 0,04 lít, hay 40 ml KOH sẽ chuyển 40 ml axit axetic thành axetat. Dung dịch
đệm axetat 0,3 M hoàn chỉnh, pH 4,46, được tạo ra bằng cách thêm 150 ml axit
axetic 2 M, 40 ml KOH 2,5 M và 810 ml nước để tạo thành thể tích cuối cùng là 1
lít. Một lưu ý cần thận trọng: sẽ an toàn hơn khi thêm axit và bazơ vào nước. Vì
vậy, sau khi tính toán xong, hãy thêm nước trước, sau đó mới thêm axit và bazơ.
Đừng quên trộn đều. Thêm tên viết tắt của bạn vào nhãn để chúng tôi biết ai sẽ
chịu trách nhiệm nếu thử nghiệm không thành công.
2.2 Tương tác sinh hóa diễn ra trong dung dịch nước
Hầu hết các tương tác sinh hóa diễn ra trong dung dịch nước. Nước là một phân tử
phân cực, trong đó nguyên tử oxy mang điện tích âm một phần và nguyên tử hydro
mang điện tích dương một phần. Các điện tích trên các phân tử nước tương tác với
các điện tích trái dấu trên các phân tử nước khác để tạo thành liên kết hydro.
2.3 Tương tác yếu là đặc tính sinh hóa quan trọng
Có ba loại tương tác yếu phổ biến được tìm thấy trong các hệ thống sinh
hóa. Tương tác tĩnh điện xảy ra giữa các ion có điện tích trái dấu. Độ mạnh
của tương tác tĩnh điện phụ thuộc vào bản chất của môi trường. Cơ sở của
liên kết hydro là sự phân bố điện tích không đồng đều xảy ra bất cứ khi
nào nguyên tử hydro liên kết cộng hóa trị với một nguyên tử có độ âm
điện, chẳng hạn như oxy hoặc nitơ. Liên kết hydro trong phân tử sinh học
bị suy yếu khi có nước vì nước dễ dàng hình thành liên kết hydro. Tương
tác tĩnh điện thoáng qua, gọi là tương tác van der Waals, diễn ra khi sự
bất đối xứng nhất thời của điện tích trên một phân tử không phân cực gây
ra sự bất đối xứng bổ sung trong các phân tử không phân cực gần đó.
Chuyển động Brown (tr. 18) tương tác van der Waals (tr. 21) pH (tr. 26)
liên kết hydro (tr. 19) tương tác entropy (tr. 23) bộ đệm (tr. 28)
tĩnh điện (ion hiệu ứng kỵ nước (tr. 23)
trái phiếu) (tr. 20)
CÁC VẤN ĐỀ
1.Bước đi ngẫu nhiên. Định nghĩa chuyển động Brown. 0,7. Tính hằng số phân ly của mỗi axit. Axit nào
mạnh hơn?-6
2.Bất bình đẳng. Nước được cho là có cực nhưng không tích điện. Làm
thế nào là nó có thể?-4 15.Axit từ cửa hàng thực phẩm sức khỏe?Nhiều chất
sinh hóa quan trọng là các axit hữu cơ, chẳng hạn như
3.Đoàn kết chúng ta đứng vững. Tại sao liên kết yếu lại quan
axit pyruvic (pKMột= 2,50) và axit lactic (pKMột= 3,86). Các
trọng trong hóa sinh?-4
bazơ liên hợp lần lượt là pyruvate và lactate. Xác định
4.Các loại trái phiếu. Các loại liên kết yếu phổ biến quan trọng từng axit tạo thành - axit hoặc bazơ liên hợp chiếm ưu
trong hóa sinh là gì? Nước ảnh hưởng đến các liên kết này như thế ở pH 7,4.-6
thế nào?-4
6.Vấn đề bối cảnh. Tác dụng của dung môi hữu cơ CH3 CH3
đối với tương tác tĩnh điện là gì?-5 Axit pyruvic Axit lactic