Professional Documents
Culture Documents
1 - Hücre Zarının Yapısı. Hücre Zarında Taşınma Mekanizmaları 2019
1 - Hücre Zarının Yapısı. Hücre Zarında Taşınma Mekanizmaları 2019
Transport
Mekanizmaları
• Konsantrasyon gradiyenti kavramını açıklar
• Basit difüzyonu tanımlar
• Hücre zarından serbestçe geçebilen molekül gruplarını sayar
• Osmozu tanımlar
• İzotonik, hipertonik ve hipotonik çözeltilerin hücreye olan etkilerini
açıklar
• Kolaylaştırılmış difüzyonu tanımlar
• Taşıyıcı proteinler ile kanal proteinlerinin farkını kavrar
• Basit difüzyon ile kolaylaştırılmış difüzyonu ayırt eder
• Kanal proteinlerinin tiplerini sayar
• Kanal proteinlerinin çalışma mekanizmasını açıklar
• Primer aktif taşımayı tanımlar
• Sekonder aktif taşımayı tanımlar
• Büyük moleküllerin hücre zarından taşınma şekillerini sayar
• Endositoz ve reseptör aracılı endositozun farkını açıklar
• Fagositoz ve Pinositoz farkını açıklar
• Reseptör aracılı endositozun moleküler mekanizmasını kavrar
• Ekzositozun tanımlar
Hücre membranı (zarı)
Hücre membranı, hücreyi ve hücre organellerini sararak dış
ortamlarından ayıran, hücreye yapısal ve mekanik bütünlük
sağlayan seçici geçirgen bir yapıdır.
Hüce zarının başlıca görevleri
RESEPTÖR
AC
sitozol
Hücre cevabı
Fosfolipid tabaka
G.L. Nicolson
S.J. Singer
Protein
Sıvı mozaik modeli
Dış taraf
OUTSIDE Periferal veya ekstrensek
Karbohidrat Peripheral or protein
Carbohydrat e Extrinsic Protein
Integral
İntegral
or
protein
Intrinsic
Protein
Integral
İntegral
or
Intrinsic
protein Lipit
Lipid çift tabaka
Protein Bilayer
INSIDE
İç taraf
HÜCRE ZARI TAŞIMA SİSTEMLERİ
ENERJİ GEREKSİNİMİ
Enerji
Enerji
gerektiren
gerektirmeyen Büyük moleküllerin
membranı geçme hareketi
Küçük moleküllerin
Difüzyon membranı geçme hareketi Endositoz
Ekzositoz
Basit Kolaylaştırılmış Sekonder Primer Fagositoz
difüzyon difüzyon aktif taşıma aktif taşıma
Fiziksel gereksinim
Taşıma Modelleri
Pasif ve Aktif Transport
Taşıyıcı proteinler: pasif ve aktif transport
Kanallar: sadece pasif transport
Taşınan molekül
su
denge
Hücre gibi yarı geçirgen bir zarla bölünmüş bir sistemde, çözünmüş
partiküllerin yüksek konsantrasyonda bulundukları ortamdan, düşük
konsantrasyonda bulundukları ortama doğru kendi kinetik enerjileri ile
yayılır.
•N2, O2, CO2 ve NO gibi
non polar, küçük ve yüksüz gazlar
kolayca difüze olur.
Su
Üre
İYONLAR
Suyun
difüzyonu
osmoz
Tonisite
izotonik
Hipotonik Hipertonik
in out
Kolaylaştırılmış diffüzyon
Kanallar veya taşıyıcı proteinler aracılığıyla, konsantrasyon gradiyenti
yönünde, enerji harcanmadan gerçekleşir.
düşük
İyon kanalları – çok seçicidir
Kanal proteinleri hareketsizdir. İyonların çok hızlı geçişine izin verir:
+ saniyede 100 milyon iyon!
Na Cl- K+
K
K
Konsantrasyon
gradiyentlerine
ve elektriksel
yüklerine göre
akış
Kapılı kanallar
Bu proteinler:
- Ligand kapılı (asetilkolin
gibi bir ligandın reseptörüne
bağlanması sonucu açılmakta
veya kapanmaktadır)
- Voltaj kapılı (membran
potansiyelindeki değişime
bağlı olarak açılmakta veya
kapanmaktadır)
- Mekanik kapılı – gerilim ve
basınca duyarlıdırlar, hücre
iskeletinin gerilemesi ile
açılırlar
• Voltaj kapılı-membran • Ligand kapılı-
potansiyelinin değişmesiyle nörotransmitterin reseptöre
kapı açılır bağlanmasıyla kapı açılır.
Asetilkolinin bağlanması sinir
hücrelerinde Na+ kanallarının
açılmasını ve sinir iletinin
başlamasını sağlar
Voltaj kapılı kanallar
Voltaj kapısı hücre membranındaki elektriksel voltaj değisikliklerine
duyarlı olan kapılardır.
Sodyum kanalları
Potasyum kanalları
Kalsiyum kanalları
İstirahat halindeki nöron
Plazma membranı
Aksiyon potansiyeli
Uyarı stimulusu
Sodyum kanalları açılır
Na+ hücre içine
Na+ nöronun içine girer
Aktivasyon İnaktivasyo n
kapısı kapısı
inaktivasyon
Hızlı voltaj kapılı sodyum kanallarının çalışma prensibi.
A.Hücre zarında bulunan bu kanalların iki kapısı vardır: Kanal içinde yer alan
aktivasyon kapısı; hücre içine bakan inaktivasyon kapısı. Hücre dinlenme durumunda
iken aktivasyon kapağı kapalı, inaktivasyon kapağı açıktır.
B.Zar voltajı değişerek eşik değerine ulaşırsa, kanalın içindeki aktivasyon kapısı açılır;
çünkü bu kapı, bu voltaj değerinde açılmaya uygun bir moleküler yapıdadır.
C. Açılan kanal boşluğundan sodyum hızla içeri akar ve artık hücrenin içi dışarıya göre
pozitif yüklenmeye başlar.
D.Hücre içi voltaj değeri dışarıya göre +35 mV düzeylerine geldiğinde ise bu kez
inaktivasyon kapısı kapanır. Dolayısıyla bu noktada artık bu hücreyi bir daha uyarmak
mümkün değildir. Sodyum girişi durur ve potansiyel değişimi sona erer.
E.Ardından, K iyonlarının çıkışıyla normale dönen zar potansiyeli dinlenme voltajına
ulaştığında kanal tekrar dinlenme durumundaki haline döner: aktivasyon kapısı kapanır;
inaktivasyon kapısı açılır ve hücre yeni bir uyaran için hazır hale gelir.
Voltaj kapılı K kanalları ise sadece tek bir kapıya sahiptir ve dinlenme durumunda bu
kanallar kapalıdır. Depolarizasyon veya aksiyon potansiyeli sırasında geniş bir voltaj
aralığında yavaşça açılıp kapanırlar ve böylece repolarizasyonu sağlarlar.
K+ kanalı
aktivasyon
Membran
polarizasyonu
Kapalı
Membran
depolarizasyonu
inaktivasyon
İnaktive Açık
Ligand (Transmitter)-kapılı iyon kanalları
Asetilkolinesteraz
Na+
ACH
Aksiyon Potansiyeli
Nikotinik
Reseptör
Na+
Nörotransmitter Reseptör
Postsinaptik kanalı
potansiyel
Eşik değeri Post
sinaptik
sinir
ucu
Asetilkolin-kapılı katyon kanalı (uyarıcı): Her bir Ask reseptörü 2 alfa, 1 beta, 1 epsilon ve 1
delta olmak üzere 5 alt birim içerir. Silindir şeklinde düzenlenmiş olan bu altbirimlerin ortası
normalde kapalı duran bir kanal gibidir (iyonofor). Her bir alfa alt biriminin ekstraselüler
yüzeyinde tek bir Ask bağlanma bölgesi vardır. Bu alt birime aynı zamanda nöromüsküler blok
yapan ilaçlar da bağlanırlar.
Asetilkolin
bağlama yeri
kanal
por
Sterosilya
membranı
Kıl
hücresi
Sterosilya:
İnsan vücudunda, iç kulakta bulunan uzun ve hareketsiz uzantılardır. Ses
titreşimlerine cevap olarak elektriksel sinyal oluşur. Bu sinyal
sterosilyaların eğilmesine neden olur.
Membran Taşıma (Transporterler) Proteinleri
ATPaz:
P-tipi, F-tipi and ABC-tipi ATPazlar Glut1-5 Pept1 NHE
(ABC transporterler)
Kolaylaştırılmış difüzyonda, membranda yerleşik taşıyıcı proteinler
(transmembran proteinler), kanal proteinlerinden farklı olarak
1. Taşınan bileşiği özgül olarak bağlamakta ve bağlanma sonrası
proteinde konformasyon değişikliği meydana getirmektedirler.
2. Bu değişiklikle bağlanma sırasında hücre dışına yönelmiş protein
bağlanma sonrası hücre içine (sitozole) yönelmekte
3. Bağladığı bileşiği sitozole bırakmaktadır
Kolaylaştırılmış difüzyondaki taşıma proteinleri hareketlidirler.
Taşıyıcı (Permeaz)
Dış membran
İç membran
Bağlanma
Dşissosiasyon
simport
Kapilerler
Karbonik
anhidraz
Kana diffüze eder
Alveoller
antiport
ışık
Elektrokimyasal
gradienti
Hücre dışı
Hücre içi
Primer aktif taşıma
Na+K+ ATP az: Na+K+ transportu
Ekstrasellüler sıvı
Sodyum Potasyum
ATP ADP Pi
Potasyum
İntrasellüler sıvı K+
Adenozin trifosfat
Adenozin difosfat
Adenozin monofosfat
Adenozin
Adenin
Fosfodiester bağı
Fosfat grupları
Riboz
Fosfat gruplarının bir molekülden diğer bir moleküle aktarılmasında önemli
Primer aktif transport sistemlerinin çoğu hücre içi ve dışı arasındaki iyon
dengesinin korunmasını sağlayan iyon pompalarıdır. Primer aktif
transporta katılan transporterler yapısal benzerliklerine göre P-tipi, V-
tipi, F-tipi ve ABC transporterler olarak sınıflandırılır.
Hücre dışı
Sitozol
ATP bağlama
ATP bağlama
yeri
yeri
P tipi
F ve V tipi ABC superailesi
V tipi ATP pompası: Lizozomlar, endozomlar ve salgı granüllerin
sitoplazmik membranında bulunur.
K
Yaklaşık 104 kadar olan hücre dışı / hücre içi kalsiyum oranı Ca2+-
ATPaz iyon pompası ile düzenlenmektedir.
CaM 10 mM Ca2+
Fizyolojik etki
1mikromol
Ca + + 3 Na+
+
Ca++
ATP
2 H+
Ca++
ADP + Pi
Mitokondri ER
Dinlenme halindeki bir hücrede sitozolik kalsiyum miktarı çok düşüktür ve kalsiyumun çoğu
mitokondri, endoplazmik retikulum gibi organellerde bulunur. Hücre içi Ca2+’un uzun süre
yüksek kalması çok toksiktir.
H+- K+ - ATPaz
H+- K+-ATPaz, mide asidi sekresyonunda bir antiport pompası olarak görev alır. Bu aktif
transport olayı sonucu H+ gastrik parietal hücrelerinden mide lumenine salgılanırken K+
hücre içine girmektedir.
Basolateral membran
ATP bağlayıcı kaset taşıyıcıları (ATP-Binding Cassette transporters)
Sitozol
Na+ Na+
Na+ Na+
K+
Apikal
K+
H2O H2O
Basolateral
Cl-
Cl-
ER
Na+ Na+
Na+ Na+
K+
Apical
K+
H2O H2O
Sekonder aktif taşıma
Na+/amino asid simportu
Na+/glukoz simportu
Ca2+/ Na+ antiportu
Ekstrasellüler sıvı
İntrasellüler sıvı
Amino asid
Bu tip taşımada enerji kaynağı olarak ATP direkt kullanılmaz. Şekerlerin,
amino asitlerin ve kalsiyumun hücre içine taşınmasında, membranın iki
yüzü arasındaki Na+ veya H+ iyonları konsantrasyon gradiyentinden
kaynaklanan enerji (iyon hareketinin kinetik enerjisi) kullanılır. Bu tip
transportta Na+ veya H+ iyonları hücre içine konsantrasyon gradiyenti
yönünde geçerken, hücreye girmesi istenilen diğer bileşik konsantrasyon
gradiyentine karşı taşınır. Daha sonra Na+ iyonları, ATP harcanarak Na+-
K+-ATPaz tarafından hücre dışına çıkartılır. Sekonder aktif transportta
ATP hidrolizi dolaylıdır.
Kotrasporterlar
SEKONDER AKTİF TRANSPORT
(proton pompası ile birlikte)
Hücre dışı
Yüksek proton konsantrasyonu Düşük glukoz konsantrasyonu
sakkaroz
sakkaroz
primer sekonder
aktif transport Aktif transport
SEKONDER AKTİF TRANSPORT
(Na+-K+ ATPaz pompası ile birlikte)
- Glukoz konsantrasyon gradientine karşı taşınmaktadır
Glukoz
Hücre dışı
Plazma membranı
Endositoz Ekzositoz
İntrasellüler sıvı
• Büyük moleküller hücre içine ve dışına membrandan
tomurcuklanan veya membranla kaynaşan veziküllerle
(kesiciklerle) taşınır
– endositoz
– ekzositoz
Füzyon
Hedef membran
Tomurcuklanma
Taşıyıcı veziküllerin oluşumu ve kaynaşması:
Kargo seçimi, Kaplayıcı proteinler ve Vesikül Tomurcuklanması
1. Bir vezikül içerisinde kargo olarak 2. Tomurcuk, taşıyıcı
taşınacak olan zar proteinleri (kırmızı ve vezikülü oluşturmak
gri) diğer proteinlerden ayrılarak bir üzere kopar
tomurcuk içerisinde toplanır.
3. Vezikül hedef
organelin zarıyla
kaynaşır.
1. Vezikülüntomurcuklanması
Hemen hemen incelenen bütün durumlarda vezikülün
tomurcuklanmasında kılıf proteinlerinin varlığı gösterilmiştir. Kılıf
protein alt birimleri biraraya gelerek 50-100 nm çapındaki genellikle
küre biçimini alan kılıfı oluşturur. Kılıf protein alt birimleri sitozolde
çözünmüş olarak bulunur. Vezikül oluşacağı zaman bu proteinler kaynak
membrana bağlanır ve membranın o bölgedeki yapısını değiştirerek
vezikülün tomurcuklanmaya başlamasını sağlar.
klatrin
membran
adaptin
Klatrin alt birimlerinin oluşturduğu sepet içinde, klatrini membrana bağlayan
bir adaptör protein de (AP-2) bulunur. Bu adaptör, klatrini membrana sıkıca
bağlar. AP-2’nin ayrıca, membran üstündeki sepete alınacak reseptörleri
biraraya toplama gibi bir görevinin olduğu gösterilmiştir.
Dinamin GTPaz’dır
GTP
dinamin
GDP
Endositoz ve egzositoz için ortak olan mekanizmayı ana hatları ile
şöyle özetleyebiliriz:
a. Kaynak membranı üzerinde yerleşmiş bir “GEF proteini” (guanin-
nükleotid değiştirme faktörü), sitoplazmada bulunan kılıf oluşturucu
bir proteinin üzerindeki GDP’yi GTP’ye çevirir. Klatrin kılıfı için
ARF (ADP-ribosylation factor); COP II kılıfı için ise Sar 1
proteinidir.
b. Kılıf oluşturucu protein (ARF veya Sar 1), GTP bağladığı anda,
içindeki bir hidrofob yağ asidini açığa çıkarır ve bu yağ asidi
aracılığı ile membrana bağlanır. Bir GTPaz olan kılıf oluşturucu
protein, sitozolde alt birimler halinde bulunan kılıf proteinini,
membranın kendi bağlandığı bölgesine toplar. Membrana bağlanan
kılıf proteinleri biraraya toplanarak sepet gibi bir yapı oluşturur ve
membranın bu bölgedeki yapısını bozar. Böylece membranda bir
tomurcuklanma oluşur. Tomurcuklanma, vezikül oluşumuna yol açar
ve bazı proteinlerin vezikülü boyun bölgesinden koparması ile kılıflı
bir vezikül oluşur.
Kılıf oluşturucu GTP-bağlayan proteinler (GTPaz)
Klatrin kılıfı için ARF (ADP-ribosylation factor);
COP II kılıfı için ise Sar 1 (Secretion-Associated RAS super family)
proteinidir.
- kılıflı vezikül
İnaktif çözünen
Sar 1-GDP
aktif membrana –
bağlı Sar 1-GTP
Hidrofobik kuyruk
Kaynak
altbirimleri
(donor)
membran
GEF = Guanine Nucleotide Exchange Factor
- GTPaz aktivasyonu
Membran Donor membran
proteinleri
Vezikülün kılıfından sıyrılması
Kılıflı vezikülün sitozole salınmasından hemen sonra kılıf sıyrılır. Bu
işlem de yine kılıf oluşturucu GTPaz’lar (ARF ve Sar 1) tarafından
başarılır. Bunlar, GTP’nin hidrolizi ile konformasyon değiştirirler,
kendilerini vezikül membranına bağlayan yağ asidini geri çekerler ve
vezikülden ayrılırlar. Bu proteinlerin vezikülden ayrılmasının hemen
ardından kılıf depolimerize olur ve vezikül kılıfından sıyrılır.
Kaplanmış vezikül
Sitozol
Klatrin kaplama
Sıyrılma
Vezikül
oluşumu
adaptin
Kaplanmamış
dinamin transport vezikülü
Hücre membranı
Kaplanmış oyuk Tomurcuklanma “Membrandan Soyunma
ayrılma”
(dinamin)
Dinamin
“Klatrin kaplı oyuk”
Adaptin
Klatrin
“ATP-bağımlı soyucu enzim” HSP70 şaperon GTP
ailesine aittir; ATP hidrolizi gerekmektedir GDP + Pi
Kılıfı uzaklaştırılmış
transport veziküller
Endozomlara doğru…
Klatrin kaplı vezikülün plazma membranından oluşumu
Vezikülün hedef membranı bulması
Zar sistemlerinin farklı olmasından dolayı, bir vezikül kendisi için doğru
olan bir zarı buluncaya kadar, muhtemel birçok hedef zarla karşılaşması
olasıdır. Hedefin bulunmasındaki spesifite yüzey markerleri ile
sağlanmaktadır. Özellikle, iki protein grubu rol oynar: SNARE ve Rab
diye adlandırılan hedef belirleyen GTPazlar.
Bu konuda Rothman tarafından ileri sürülen “SNARE hipotezi” uzun
süre kabul görmüştür ve halen bazı değişmelerle kullanılmaktadır .
SNARE: Soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor (NSF)
attachment protein receptor.
Bu hipoteze göre; vezikül içindeki bir integral protein (v-
SNARE=synaptobrevin) ile, onunla özgül olarak etkileşebilen bir hedef
membran integral proteini (t-SNARE = syntaxin) arasındaki yüksek
afinite ve özgül etkileşim, veziküllerin hedeflerini bulmasını
sağlamaktadır. SNARE’ler sitoplazma içine sarkan ve reseptör olarak
görev yapan integral proteinlerdir. SNARE’ler en çok sinir hücrelerinde
çalışılmışlardır.
SNARE: Soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor (NSF) attachment protein receptor.
v-SNARE t-SNARE
(synaptobrevin) (syntaxin)
vezikül
organel
hedef membran
coiled coil
Sinir hücresi plazma membranı
Coiled-coil üçü t-SNARE, biri ise v-SNARE’den oluşan, birbirine sıkıca bağlanmış 4
α-helix’den oluşan bir settir. Kaynaşma sırasında GTP hidrolizi gerekir. Bu işlem Rab
proteinleri tarafından gerçekleştirilir.
Membran kaynaşması
Vezikül, hedef membranını, Rab proteini, Rab
efektörü, SNARE ve bağlayıcı proteinlerin ortak
hareketi ile tanır ve membrana yanaşır. Membrana
yanaşma sırasında, vezikül ve hedef membranın
molekülleri, birbirleri ile etkileşebilecek kadar
yakındır. Membran kaynaşması için ise,
membranların 1.5 nm kadar yakınlaşmaları ve
aradaki su moleküllerinin atılması gerekir. Bu
işlemin SNARE’ler tarafından başarıldığı
zannedilmektedir.
Birbirine bağlanacak membranlar üzerinde
karşılıklı yerleşmiş bulunan, birbirlerine yüksek
afiniteleri olan SNARE’ler sarmal oluşturacak
şekilde bağlanırken, membranları çekerek
yakınlaştırır ve kaynaşmayı sağlarlar.
Veziküllerin “doğru hedefi”
bulmalarında etkin olduğu düşünülen
diğer bir protein grubu Rab
proteinleridir (GTP bağlayan
protein).
• Monomerik GTPaz'lardır ve 30 dan
fazla üyesi vardır. SNARE’lerde
olduğu gibi, her Rab proteini hücre
zarlarında karakteristik bir dağılıma
sahiptir ve organeller sitosolik
yüzeylerinde bir Rab proteini taşırlar.
• Rab proteinleri veziküle tutunur ve
GDP dissociation
hedef membran üzerindeki bir efektör
inhibitor)
proteinle ve v-SNARE’lerle özgül
olarak etkileşerek SNARE
kompleksinin (v-SNARE/t-SNARE
kompleksi) oluşmasını sağlar. Böylece
vezikül doğru hedefi bulur.
çözünen
transport
vezikülü Yağ asidi
hidrolizi
Membran füzyonu
Hedef membran
SNARE’lerin ayrılması
Bir ATP az olan NSF SNARE çiftini hidroliz etmektedir
ENDOSİTOZ
Endositozda, hücreye alınacak maddeyle birlikte hücre membranının bir
kısmı hücre içine doğru tomurcuklanır ve hücreye girmesi istenilen
madde hücre içine vezikül içinde girer. Oluşan küçük vezikül endozom
olarak adlandırılır.
PLAZMA MEMBRANI
Hücre dışından içine madde alımı pinositoz, reseptör-aracılı endositoz
ve fagositoz olmak üzere üç değişik yolla olmaktadır. Her üç yol hücre
gereksinimlerinin karşılanmasında veya korunmasında kullanılmaktadır.
fagositoz
Endositoz
pinositoz
receptör-aracılı
endositoz
Reseptör –aracılı endositoz
Transport sistemlerinin taşıyamayacağı boyuttaki moleküller ve diğer
bazı maddelerin hücre içine alımı reseptör-aracılı endositoz adı verilen
bir mekanizma ile olmaktadır.
LDL-R
dinamin GTP
GDP+Pi
Erken endozom
pH ~6 pH ~7.2
ATP ADP+Pi ADP+Pi
Soyunma Füzyon H+
Kaplanmış (HSP70 ailesi) (SNARE) ATP
vezikül Endozomlardaki proton
pompası endozom
lumenindeki pH nın asit tarafa
kaymasını sağlayarak LDL
Serbest kolesterol reseptöründen dissosiye
olmaktadır
Lizozom
GTP ~ 1’: erken endozom
GDP+Pi (pH~6)…
ATP
H+
ADP+Pi
ATP ADP+Pi
ATP
Kaplanmış Kılıfın sıyrılması H+
vezikül ADP+Pi
~ 5’: geç endozom
(pH 5.5~6)…
ATP
H+
ADP+Pi
(pH<5)…
Fagozom
veziküller
1. “Fagositoz” Bakteri
Fagozom
veziküller
Yıpranmış
mitokondri Otofagozom
2. “Otofaji”
Bakteri
1. “Fagositoz”
Fagozom
Erken Geç
endozom endozom
3. “Endositoz” Lizozomal
enzimler
Endositolik veziküller
Endoplasmic
reticulum Lizozom
Worn out
mitochondrion
Otofagozom
2. “Otofaji”
EKZOSİTOZ
Hücre membranına ve dışına yönlendirilen keseciklerin membranlarında
hücre membranı proteinleri ve içlerinde ise salgılanacak proteinler
bulunmaktadır. Keseciğin hücre membranı ile kaynaşması ve içeriğini
boşaltılması ekzositoz olarak adlandırılmaktadır.
Ekzositoz