Machine Translated by Google

HOOFDSTUK VIJF
5

DNA en chromosomen
Het leven hangt af van het vermogen van cellen om de genetische instructies die nodig zijn DE STRUCTUUR VAN DNA
om een levend organisme te maken en te behouden, op te slaan, op te halen en te vertalen.
Deze instructies worden in elke levende cel opgeslagen in zijn genen – de informatiedragende
elementen die de kenmerken bepalen van een soort als geheel en van de individuen daarin.
DE STRUCTUUR VAN
EUKARYOTISCHE CHROMOSOMEEN

Aan het begin van de twintigste eeuw, toen genetica opkwam als een wetenschap, raakten
wetenschappers geïntrigeerd door de chemische aard van genen. DE VERORDENING VAN
De informatie in genen wordt miljoenen keren gekopieerd en overgedragen van een cel CHROMOSOOMSTRUCTUUR
naar zijn dochtercellen tijdens het leven van een meercellig organisme, en van generatie
op generatie doorgegeven via de voortplantingscellen – eieren en sperma. Genen overleven
dit proces van replicatie en overdracht in wezen onveranderd. Welk soort molecuul zou in
staat zijn tot zo’n nauwkeurige en vrijwel onbeperkte replicatie, en ook in staat zijn om de
ontwikkeling van een organisme en het dagelijks leven van een cel te sturen?

Wat voor soort instructies bevat de genetische informatie? Hoe zijn deze instructies fysiek
georganiseerd, zodat de enorme hoeveelheid informatie die nodig is voor de ontwikkeling
en het onderhoud van zelfs het eenvoudigste organisme binnen de kleine ruimte van een
cel kan worden gehouden?

De antwoorden op sommige van deze vragen begonnen in de jaren veertig naar voren te
komen, toen uit onderzoek bij eenvoudige schimmels werd ontdekt dat genetische
informatie voornamelijk bestaat uit instructies voor het maken van eiwitten. Zoals beschreven
in het vorige hoofdstuk vervullen eiwitten de meeste functies van de cel: ze dienen als
bouwstenen voor celstructuren; ze vormen de enzymen die de chemische reacties van de
cel katalyseren; ze reguleren de activiteit van genen; en ze zorgen ervoor dat cellen kunnen
bewegen en met elkaar kunnen communiceren.
Achteraf gezien is het moeilijk voor te stellen welke andere soorten instructies de genetische
informatie zou kunnen bevatten.
Machine Translated by Google
174 HOOFDSTUK 5 DNA en chromosomen

De andere cruciale vooruitgang die in de jaren veertig werd geboekt, was de erkenning dat
deoxyribonucleïnezuur (DNA) de drager is van de genetische informatie van de cel. Maar
het mechanisme waarmee de informatie kon worden gekopieerd voor overdracht van de ene
generatie cellen naar de volgende, en hoe eiwitten konden worden gespecificeerd door
instructies in DNA, bleef volkomen mysterieus tot 1953, toen de structuur van DNA werd
bepaald door James Watson en Franciscus Krik. De structuur onthulde onmiddellijk hoe
DNA gekopieerd of gerepliceerd kon worden, en het leverde de eerste aanwijzingen op over
hoe een DNA-molecuul de instructies voor het maken van eiwitten zou kunnen coderen.

Tegenwoordig is het feit dat DNA het genetische materiaal is zo fundamenteel voor ons
begrip van het leven dat het moeilijk kan zijn om te begrijpen welk enorm intellectueel gat
deze ontdekking heeft opgevuld.

In dit hoofdstuk beginnen we met het beschrijven van de structuur van DNA. We zien hoe,
ondanks zijn chemische eenvoud, de structuur en chemische eigenschappen van DNA het
bij uitstek geschikt maken voor het overdragen van genetische informatie. Vervolgens
bekijken we hoe genen en andere belangrijke DNA-segmenten zijn gerangschikt in het
enkele, lange DNA-molecuul dat elk chromosoom in de cel vormt.
Ten slotte bespreken we hoe eukaryotische cellen deze lange DNA-moleculen in de kern tot
compacte chromosomen vouwen. Dit inpakken moet op een ordelijke manier gebeuren,
zodat de chromosomen bij elke celdeling correct over de twee dochtercellen kunnen worden
enkel chromosoom
verdeeld. Tegelijkertijd moet de chromosomale verpakking ervoor zorgen dat DNA
toegankelijk is voor het grote aantal eiwitten die het repliceren en repareren, en die de
activiteit van de vele genen van de cel bepalen.

Dit is het eerste van vijf hoofdstukken die gaan over fundamentele genetische mechanismen:
de manieren waarop de cel de genetische informatie in zijn DNA bewaart en gebruikt. In
Hoofdstuk 6 bespreken we de mechanismen waarmee de cel zijn DNA nauwkeurig repliceert
en repareert. In hoofdstuk 7 beschouwen we genexpressie – hoe genen worden gebruikt om
RNA- en eiwitmoleculen te produceren. In Hoofdstuk 8 beschrijven we hoe een cel de
(A)
niet-delende cel
genexpressie controleert om ervoor te zorgen dat elk van de vele duizenden eiwitten die in
delende cel
het DNA gecodeerd zijn, op de juiste tijd en plaats wordt geproduceerd. In Hoofdstuk 9
bespreken we hoe de hedendaagse genen evolueerden, en in Hoofdstuk 10 beschouwen
we enkele manieren waarop DNA experimenteel kan worden gemanipuleerd om fundamentele
celprocessen te bestuderen.

Over deze onderwerpen is de afgelopen zestig jaar enorm veel geleerd. Veel minder voor
de hand liggend, maar net zo belangrijk, is het feit dat onze kennis zeer onvolledig is; er
moet dus nog veel ontdekt worden over de manier waarop DNA de instructies geeft om
(B) levende wezens te bouwen.
10 ÿm

Figuur 5–1 Chromosomen worden zichtbaar terwijl

eukaryotische cellen zich voorbereiden om te delen. DE STRUCTUUR VAN DNA
(A) Twee aangrenzende plantencellen gefotografeerd
met behulp van een fluorescentiemicroscoop.
Lang voordat biologen de structuur van DNA begrepen, hadden ze erkend dat erfelijke
Het DNA, dat is gelabeld met een fluorescerende eigenschappen en de genen die deze bepalen, verband hielden met chromosomen.
kleurstof (DAPI), is verpakt in meerdere Chromosomen (genoemd naar het Griekse chroma, ‘kleur’, vanwege hun kleureigenschappen)
chromosomen; deze worden pas zichtbaar als
werden in de negentiende eeuw ontdekt als draadachtige structuren in de kern van eukary-
afzonderlijke structuren
condenseren
wanneer ze ECB5 e5.01/5.01
ter voorbereiding op de celdeling, zoals je kunt otische cellen die zichtbaar worden als de cellen zich beginnen te delen (Figuur 5–1) .
zien in de cel links. Voor de duidelijkheid is een Toen biochemische analyses mogelijk werden, ontdekten onderzoekers dat chromosomen
enkel chromosoom in de delende cel gearceerd zowel DNA als eiwitten bevatten. Maar welke van deze componenten codeerden voor de
(bruin). De cel aan de rechterkant, die niet deelt, genetische informatie van het organisme was niet meteen duidelijk.
bevat de identieke chromosomen, maar ze
kunnen niet als individuele entiteiten worden
onderscheiden, omdat het DNA zich in deze We weten nu dat het DNA de genetische informatie van de cel draagt en dat de
fase van de delingscyclus van de cel in een
eiwitcomponenten van chromosomen grotendeels functioneren om de enorm lange DNA-
veel uitgebreidere conformatie bevindt. (B)
moleculen te verpakken en te controleren. Maar biologen hadden in de jaren veertig moeite
Schematisch diagram van de contouren van de twee
cellen en hun chromosomen. (A, met dank aan om DNA als genetisch materiaal te accepteren vanwege de ogenschijnlijke eenvoud van de
Peter Shaw.) chemie ervan (zie How We Know, pp. 193-195).
Machine Translated by Google
De structuur van DNA 175

DNA is tenslotte eenvoudigweg een lang polymeer dat bestaat uit slechts vier soorten
nucleotide-subeenheden, die chemisch sterk op elkaar lijken.

Toen, begin jaren vijftig, onderzochten Maurice Wilkins en Rosalind Franklin DNA met
behulp van röntgendiffractieanalyse, een techniek voor het bepalen van de
driedimensionale atomaire structuur van een molecuul (zie Paneel 4-6, pp. 168-169).
Hun resultaten vormden een van de cruciale bewijsstukken die in 1953 leidden tot het
model van Watson en Crick van de dubbele helixstructuur van DNA. Deze structuur –
waarin twee DNA-strengen om elkaar heen zijn gewikkeld om een helix te vormen –
suggereerde meteen hoe DNA de instructies kon coderen die nodig zijn voor het leven,
en hoe deze instructies konden worden gekopieerd en doorgegeven als cellen zich
delen. In deze paragraaf onderzoeken we de structuur van DNA en leggen we in
algemene termen uit hoe het erfelijke informatie kan opslaan.

Een DNA-molecuul bestaat uit twee complementaire

Ketens van nucleotiden
Een molecuul deoxyribonucleïnezuur (DNA) bestaat uit twee lange
polynucleotideketens. Elke keten, of streng, bestaat uit vier soorten
nucleotidesubeenheden, en de twee strengen worden bij elkaar gehouden door
waterstofbruggen tussen de basisgedeelten van de nucleotiden (Figuur 5–2).

Zoals we in Hoofdstuk 2 (Panel 2–7, pp. 78–79) hebben gezien, bestaan nucleotiden
uit een stikstofhoudende base en een suiker met vijf koolstofatomen, waaraan een
fosfaatgroep is gehecht. Voor de nucleotiden in DNA is de suiker deoxyribose (vandaar
de naam deoxyribonucleïnezuur) en de base kan adenine (A), cytosine (C), guanine
(G) of thymine (T) zijn. De

(A) bouwstenen van DNA (B) DNA-streng

suiker

fosfaat

+ G
5ÿ 3ÿ

G KAT
suiker baseren G
fosfaat (guanine)
nucleotide

(C) dubbelstrengig DNA (D) Dubbele DNA-helix

3ÿ 3ÿ
5ÿ
5ÿ

C G G C

A T 0,34 nm T A

T A A T
Figuur 5–2 DNA bestaat uit vier
nucleotide-bouwstenen. (A) Elk
T A A nucleotide is samengesteld uit een
suikerfosfaat dat covalent is
G C suiker-fosfaat G C gekoppeld aan een base: guanine (G) in deze figuur.
ruggengraat (B) De nucleotiden zijn covalent met elkaar
C G C G verbonden tot polynucleotideketens, met een
suiker-fosfaat-skelet waaruit de basen -
C G adenine, cytosine, guanine en thymine (A, C,
C G
G en T) - zich uitstrekken.
A (C) Een DNA-molecuul bestaat uit twee
A T
polynucleotideketens (DNA-strengen) die bij
G C C G
elkaar worden gehouden door
waterstofbruggen tussen de gepaarde basen.
TA A T De pijlen op de DNA-strengen geven de
polariteiten aan van de twee strengen, die
5ÿ
5ÿ antiparallel aan elkaar lopen (met tegengestelde
3ÿ
3ÿ chemische polariteiten) in het DNA-molecuul.
(D) Hoewel het DNA in (C) recht wordt
waterstofgebonden
basenparen
weergegeven, is het in werkelijkheid in een dubbele helix gewikk
Machine Translated by Google
176 HOOFDSTUK 5 DNA en chromosomen

5'-uiteinde van de ketting Figuur 5–3 De nucleotidesubeenheden binnen een DNA-streng worden bij
elkaar gehouden door fosfodiësterbindingen. Deze bindingen verbinden de ene
suiker met de volgende. De chemische verschillen in de esterbindingen – tussen het
O
5ÿ koolstofatoom van de ene suiker en het 3ÿ koolstofatoom van de andere –
geven aanleiding tot de polariteit van de resulterende DNA-streng. Voor de
P –O
eenvoud worden hier slechts twee nucleotiden weergegeven.
O baseren

CH2 nucleotiden zijn covalent met elkaar verbonden in een keten via de suikers en fosfaten, die een
O
ruggengraat vormen van afwisselend suiker-fosfaat-
suiker
suiker-fosfaat (zie figuur 5–2B). Omdat bij elk van de vier soorten subeenheden alleen de basis
3' verschilt, lijkt elke polynucleotideketen op een halsketting: een suiker-fosfaat-skelet waaraan vier
O fosfodiester
band soorten kleine kralen zijn vastgemaakt (de vier basen A, C, G en T). Deze zelfde symbolen (A, C,
-O P O G en T) worden ook vaak gebruikt om de vier verschillende nucleotiden aan te duiden, dat wil
zeggen de basen met de daaraan verbonden suikerfosfaten.
O baseren

5' CH2
O De nucleotide-subeenheden binnen een DNA-streng worden bij elkaar gehouden door
4' suiker 1' fosfodiesterbindingen die het 5ÿ-uiteinde van de ene suiker verbinden met het 3ÿ-uiteinde van de
volgende (Figuur 5-3). Omdat de esterbindingen met de suikermoleculen aan weerszijden van
3' 2' de binding verschillend zijn, heeft elke DNA-streng een chemische polariteit. Als we ons
O
voorstellen dat elk nucleotide een fosfaatknop en een hydroxylgat heeft (zie figuur 5–2A), zullen
bij elke streng, gevormd door in elkaar grijpende knoppen met gaten, alle subeenheden in
3'-uiteinde van de ketting
dezelfde richting zijn opgesteld. . Bovendien kunnen de twee uiteinden van de streng gemakkelijk
worden onderscheiden, omdat het ene een gat heeft (de 3ÿ-hydroxyl) en het andere een knop
(het 5ÿ-fosfaat). Deze polariteit in een DNA-streng wordt aangegeven door naar het ene uiteinde
te verwijzen als het 3ÿ- uiteinde en het andere als het 5ÿ- uiteinde (zie figuur 5-3).
ECB5 n5.200/5.06

De twee polynucleotideketens in de dubbele DNA-helix worden bij elkaar gehouden door

waterstofbinding tussen de basen op de verschillende strengen. Alle basen bevinden zich daarom
aan de binnenkant van de dubbele helix, met de suiker–
fosfaatskeletten aan de buitenkant (zie figuur 5–2D). De basen paren echter niet willekeurig; A
koppelt altijd aan T, en G koppelt altijd aan C (Figuur 5–4). In elk geval wordt een omvangrijkere
basis met twee ringen (een purine, zie Paneel 2-7, pp. 78-79) gecombineerd met een basis met
één ring (een pyrimidine).
Elk purine-pyrimidinepaar wordt een basenpaar genoemd, en deze complementaire basenparen
maken het mogelijk dat de basenparen in de energetisch meest gunstige opstelling langs de
binnenkant van de dubbele helix worden gepakt. In deze opstelling heeft elk basenpaar dezelfde
breedte, waardoor de suiker wordt vastgehouden.
fosfaatskeletten op gelijke afstand van elkaar langs het DNA-molecuul.
Om de leden van elk basenpaar binnen de dubbele helix bij elkaar te laten passen, moeten de
twee strengen van de helix antiparallel ten opzichte van elkaar lopen, dat wil zeggen dat ze met
tegengestelde polariteiten zijn georiënteerd (zie figuur 5–2C en D). De antiparallelle suiker-
fosfaatstrengen draaien vervolgens om elkaar heen en vormen een dubbele helix met tien
basenparen per spiraalvormige winding (Figuur 5–5). Deze verdraaiing draagt ook bij aan de
energetisch gunstige conformatie van de dubbele DNA-helix.

Als gevolg van de baseparing die in figuur 5–4 wordt weergegeven, bevat elke streng van een
dubbele DNA-helix een reeks nucleotiden die precies complementair is aan de nucleotidesequentie
van de partnerstreng: een A komt altijd overeen met een T op de tegenovergestelde streng, en
VRAAG 5–1 een C komt altijd overeen met een G. Deze complementariteit is van cruciaal belang als het gaat
om zowel het kopiëren als het behouden van de DNA-structuur, zoals we in hoofdstuk 6
Welke van de volgende uitspraken zijn bespreken. Er is een geanimeerde versie van de dubbele DNA-helix te zien in film 5.1.
juist? Leg je antwoorden uit.
A. Een DNA-streng heeft een polariteit
omdat de twee uiteinden
verschillende basen bevatten.
De structuur van DNA biedt een mechanisme voor erfelijkheid
B. GC-basenparen zijn stabieler dan AT-
basenparen. Het feit dat genen coderen voor informatie die nauwkeurig moet worden gekopieerd en
verzonden wanneer een cel zich deelt, bracht twee fundamentele problemen met zich mee: hoe
Machine Translated by Google
De structuur van DNA 177

waterstof 3ÿ
band 5'- einde
5ÿ
cytosine H guanine _O O_
P
H N H O H
N OO
C
CC CC
basen
C O
O
H C C N H N G C N
3'- einde P O
N O_
N C C HO O
0,34 nm
G
O H N suiker- O_
O O G O
fosfaat P O
H ruggengraat O O
O_ C
O P
H P O O O _ O
thymine adenine O O O
H O
O H P T
CH3 N N suiker
C _O O O A
CC C C G O
O O O P O_
H C T N H N A C N
O O
C fosfodiester
O P O_ OH
N C C N obligaties
O_
O H waterstofbinding
5'- einde
3'- einde
5ÿ
3ÿ

1 nm
(A) (B)

Figuur 5–4 De twee strengen van de dubbele DNA-helix worden bij elkaar gehouden door waterstofbruggen
tussen complementaire basenparen. (A) Schematische illustratie die laat zien hoe de vormen en chemische structuren van
de basen ervoor zorgen dat waterstofbruggen alleen efficiënt kunnen worden gevormd tussen A en T en tussen G en C. De atomen
die de waterstofbruggen tussen deze nucleotiden vormen (zie Paneel 2–3, pp 70–71) kunnen dicht bij elkaar worden gebracht
zonder de dubbele helix te verstoren. Zoals getoond vormen zich twee waterstofbruggen tussen A en T, terwijl er drie ontstaan
tussen G en C. De basen kunnen op deze manier alleen paren als de twee polynucleotideketens die ze bevatten antiparallel zijn, dat
wil zeggen in tegengestelde richtingen georiënteerd. (B) Een kort gedeelte van de dubbele helix, gezien vanaf de zijkant. Er worden
vier basenparen geïllustreerd; merk op dat in (A).
ze loodrecht
Zoals weergegeven
op de as van
in ECB5
de helix
e5.06/5.07
liggen, in tegenstelling tot het schema weergegeven
In figuur 5-3 zijn de nucleotiden covalent met elkaar verbonden door fosfodiësterbindingen die de 3ÿ-hydroxylgroep (–OH) van de
ene suiker verbinden met het 5ÿ-fosfaat (–PO3) dat aan de volgende is bevestigd (zie Paneel 2-7, pp. 78 –79, om te bekijken hoe de
koolstofatomen in de suikerring zijn genummerd). Deze koppeling geeft elke polynucleotidestreng een chemische polariteit; dat wil
zeggen, de twee uiteinden zijn chemisch verschillend. Het 3ÿ-uiteinde draagt een niet-gekoppelde –OH-groep bevestigd aan de 3ÿ-
positie op de suikerring; het 5'-uiteinde draagt een vrije fosfaatgroep bevestigd aan de 5'-positie op de suikerring.

Kan de informatie voor het specificeren van een organisme in chemische vorm worden
overgedragen, en hoe kan de informatie nauwkeurig worden gekopieerd? De structuur
van DNA geeft het antwoord op beide vragen.

Informatie wordt gecodeerd in de volgorde of sequentie van de nucleotiden langs elke

DNA-streng. Elke grondtal – A, C, T of G – kan worden beschouwd als een letter in een
vierletteralfabet dat wordt gebruikt om biologische boodschappen te spellen (Figuur 5–
6). Organismen verschillen van elkaar omdat hun respectievelijke DNA-moleculen
verschillende nucleotidesequenties hebben en bijgevolg verschillende biologische
belangrijk
boodschappen overbrengen. Maar hoe wordt het nucleotide-alfabet gebruikt om berichten groef

te verzinnen, en wat spellen ze?

Voordat de structuur van DNA werd bepaald, hadden onderzoekers vastgesteld dat
genen de instructies bevatten voor de productie van eiwitten. Het was dus duidelijk dat
minderjarige
DNA-berichten op de een of andere manier voor eiwitten moesten kunnen coderen. groef
Het in beschouwing nemen van het chemische karakter van eiwitten maakt het probleem

Figuur 5–5 Een ruimtevullend model toont de conformatie van de

dubbele DNA-helix. De twee DNA-strengen wikkelen zich om elkaar heen en
vormen een rechtsdraaiende helix (zie figuur 4–14) met 10 basen per winding.
Hier worden 1,5 windingen van de dubbele DNA-helix weergegeven. Door de
twee strengen om elkaar heen te wikkelen ontstaan er twee groeven in de
dubbele helix. De bredere groef wordt de grote groef genoemd en de kleinere de
kleine groef. De kleuren van de atomen zijn: N, blauw; O, rood; P, geel;
H, wit; en C, zwart. (Zie film 5.1.) 2 nm
Machine Translated by Google
178 HOOFDSTUK 5 DNA en chromosomen
(A) moleculaire biologie is...
(B)
(C)
(D)
(E) TTCGACGACCTAACCTATAG
Figuur 5–6 Lineaire berichten zijn er in
vele vormen. De getoonde talen zijn (A)
Engels, (B) een partituur, (C) Morsecode, (D)
Japans en (E) DNA.
ECB5 e5,08/5,09
Figuur 5–7 De meeste genen
bevatten informatie om eiwitten te
maken. Zoals we in hoofdstuk 7 bespreken,
produceren eiwitcoderende genen elk een
reeks RNA-moleculen, die vervolgens de
productie van een specifiek eiwitmolecuul
aansturen. Merk op dat voor een minderheid
van de genen het eindproduct het RNA-
molecuul zelf is, zoals hier weergegeven voor
gen C. In deze gevallen is de genexpressie
voltooid zodra de nucleotidesequentie van het
DNA is getranscribeerd in de nucleotidesequentie van zijn RNA.
gemakkelijker te definiëren. Zoals besproken in Hoofdstuk 4 wordt de functie van een eiwit
bepaald door zijn driedimensionale structuur, die op zijn beurt wordt bepaald door de
volgorde van de aminozuren in zijn polypeptideketen. De lineaire sequentie van nucleotiden
in een gen moet daarom op de een of andere manier de lineaire sequentie van aminozuren
in een eiwit weergeven.
De exacte overeenkomst tussen het vierletterige nucleotidealfabet van DNA en het
twintigletterige aminozuuralfabet van eiwitten – de genetische code – blijkt helemaal niet
duidelijk uit de structuur van het DNA-molecuul. Na de ontdekking van de dubbele helix
duurde het meer dan een decennium aan slimme experimenten om deze code uit te werken.
In hoofdstuk 7 beschrijven we de genetische code in detail wanneer we genexpressie
bespreken – het proces waarbij de nucleotidesequentie van een gen wordt getranscribeerd
in de nucleotidesequentie van een RNA-molecuul – en vervolgens, in de meeste gevallen,
vertaald in het aminozuur sequentie van een eiwit (Figuur 5–7).
De hoeveelheid informatie in het DNA van een organisme is duizelingwekkend: geschreven
in het vierletterige nucleotide-alfabet beslaat de nucleotidesequentie van een heel klein
eiwitcoderend gen van de mens een kwart pagina tekst, terwijl het volledige menselijke DNA
Deze reeks zou meer dan 1000 boeken ter grootte van dit boek vullen. Hierin ligt een
probleem dat de architectuur van alle eukaryote chromosomen beïnvloedt: hoe kan al deze
informatie netjes in de celkern worden verpakt? In de rest van dit hoofdstuk bespreken we
het antwoord op deze vraag.
DE STRUCTUUR VAN EUKARYOT
CHROMOSOMEEN
Er zijn grote hoeveelheden DNA nodig om alle informatie te coderen die nodig is om een
eencellige bacterie te maken, en er is veel meer DNA nodig om de informatie te coderen om
een meercellig organisme zoals jij te maken. Elke menselijke cel bevat ongeveer 2 meter (m)
DNA; toch heeft de celkern een diameter van slechts 5–8 ÿm. Al dit materiaal in zo’n kleine
ruimte stoppen, komt overeen met het proberen om 40 km extreem fijn draad tot een tennisbal
te vouwen.
In eukaryote cellen worden zeer lange, dubbelstrengige DNA-moleculen verpakt in
chromosomen. Deze chromosomen passen niet alleen handig in de kern, maar kunnen,
nadat ze zijn gedupliceerd, bij elke celdeling nauwkeurig worden verdeeld over de twee
dochtercellen. De complexe taak van het verpakken van DNA wordt volbracht door
gespecialiseerde eiwitten die zich binden aan het DNA en het vouwen, waardoor een reeks
kronkels en lussen ontstaat die steeds hogere organisatieniveaus bieden en voorkomen dat
het DNA een verwarde, onbeheersbare puinhoop wordt. Verbazingwekkend genoeg is dit
DNA zo gevouwen dat het toegankelijk blijft voor alle enzymen en andere eiwitten die het
repliceren en repareren, en die de expressie van zijn genen veroorzaken.
gen A gen B gen C gen D
DNA-dubbel
helix
RNA A RNA B RNA C RNA D
eiwit A eiwit B eiwit D
Machine Translated by Google
De structuur van eukaryote chromosomen 179

Bacteriën dragen hun genen doorgaans op één enkel, circulair DNA-molecuul.

Dit molecuul wordt ook geassocieerd met eiwitten die het DNA condenseren, maar
deze bacteriële eiwitten verschillen van degenen die eukaryotisch DNA verpakken.
Hoewel dit prokaryotische DNA een bacterieel ‘chromosoom’ wordt genoemd, heeft
het niet dezelfde structuur als eukaryotische chromosomen, en er is minder bekend
over hoe het is verpakt. Onze discussie over de chromosoomstructuur in dit hoofdstuk
zal zich daarom volledig richten op eukaryotische chromosomen.

Eukaryotisch DNA is verpakt in meerdere

Chromosomen
In eukaryoten, zoals wij, is nucleair DNA verdeeld over een reeks verschillende
chromosomen. Het DNA in een menselijke kern is bijvoorbeeld verdeeld in 23 of 24
verschillende soorten chromosomen, afhankelijk van het geslacht van een individu
(mannen hebben met hun Y-chromosoom een extra type chromosoom dat vrouwen
niet hebben). Elk van deze chromosomen bestaat uit een enkel, enorm lang, lineair
DNA-molecuul geassocieerd met eiwitten die de fijne draad van DNA in een compactere
structuur vouwen en verpakken. Dit complex van DNA en eiwit wordt chromatine
genoemd . Naast de eiwitten die betrokken zijn bij het verpakken van het DNA,
associëren chromosomen ook met vele andere eiwitten die betrokken zijn bij DNA-
replicatie, DNA-reparatie en genexpressie.

Met uitzondering van de gameten (sperma en eieren) en zeer gespecialiseerde cellen

waarbij DNA volledig ontbreekt (zoals volwassen rode bloedcellen), bevatten menselijke
cellen elk twee exemplaren van elk chromosoom, één geërfd van de moeder en één
van de vader. . De moederlijke en vaderlijke versies van elk chromosoom worden
homologe chromosomen (homologen) genoemd .
De enige niet-homologe chromosoomparen bij mensen zijn de geslachtschromosomen
bij mannen, waarbij een Y-chromosoom wordt geërfd van de vader en een X-
chromosoom van de moeder. (Vrouwtjes erven één X-chromosoom van elke ouder Figuur 5–8 Elk menselijk chromosoom kan
in een andere kleur worden 'geverfd' om
en hebben geen Y-chromosoom.) Elke volledige set menselijke chromosomen bevat
een ondubbelzinnige identificatie mogelijk te
in totaal ongeveer 3,2 x 109 nucleotide-paren van DNA - die samen het menselijk maken. De hier getoonde chromosomen zijn
genoom vormen. geïsoleerd uit een cel die een kerndeling
ondergaat (mitose) en bevinden zich daarom
Naast dat ze verschillende afmetingen hebben, kunnen de verschillende menselijke in een zeer compacte (gecondenseerde) toestand.
chromosomen door een verscheidenheid aan technieken van elkaar worden Chromosoomschilderen wordt uitgevoerd door
onderscheiden. Elk chromosoom kan in een andere kleur worden 'geschilderd' met de chromosomen bloot te stellen aan een
verzameling enkelstrengige DNA-moleculen die
behulp van sets chromosoomspecifieke DNA-moleculen gekoppeld aan verschillende
zijn gekoppeld aan een combinatie van
fluorescerende kleurstoffen (Figuur 5–8A). Een eerdere en meer traditionele manier
fluorescerende kleurstoffen. Enkelstrengige
om het ene chromosoom van het andere te onderscheiden, is het kleuren van de DNA-moleculen die overeenkomen met
chromosomen met kleurstoffen die zich binden aan bepaalde soorten DNA-sequenties. sequenties op chromosoom 1 worden
Deze kleurstoffen maken voornamelijk onderscheid tussen DNA dat rijk is aan AT- bijvoorbeeld gelabeld met één specifieke
nucleotideparen en DNA dat rijk is aan GC, en ze produceren een voorspelbaar kleurstofcombinatie, moleculen die sequenties op
chromosoom 2 matchen met een andere,
patroon van banden langs elk type chromosoom. Dankzij de resulterende patronen
enzovoort. Omdat het gelabelde DNA alleen
kan elk chromosoom worden geïdentificeerd en genummerd.
basenparen kan vormen (hybridiseren) met zijn
specifieke chromosoom (besproken in hoofdstuk 10), heeft elk chrom
Voor dergelijke experimenten worden de
chromosomen zo behandeld dat de individuele
strengen van het dubbelhelix-DNA gedeeltelijk
1 2 3 45 scheiden om basenparing met het gelabelde,
enkelstrengige DNA mogelijk te maken.
(A) Deze coupe toont de reeks chromosomen
zoals ze oorspronkelijk uit de gelyseerde cel kwamen.
6 78 9 110 12 1
(B) Dezelfde chromosomen kunstmatig op een rij
in hun numerieke volgorde.
13 14 15 16 17 18 Deze opstelling van de volledige chromosoomset
wordt een karyotype genoemd. (Aangepast
19 20 21 22 naar N. McNeil en T. Ried, deskundige ds. Mol.
XX
Med. 2:1–14, 2000. Met toestemming van
(A) (B)
10 ÿm Cambridge University Press.)
Machine Translated by Google
180 HOOFDSTUK 5 DNA en chromosomen

Figuur 5–9 Abnormale chromosomen worden in verband gebracht

met een aantal erfelijke genetische aandoeningen. (A) Twee normale
menselijke chromosomen, chromosoom 6 en chromosoom 4, zijn
onderworpen aan chromosoomschildering zoals beschreven in figuur 5ÿ8.
(B) Bij een individu met een wederzijdse chromosomale translocatie
is een segment van het ene chromosoom verwisseld met een segment van het andere.
Dergelijke chromosomale translocaties komen vaak voor in kankercellen.
(Met dank aan Zhenya Tang en de NIGMS Human Genetic Cell Repository
van het Coriell Institute for Medical Research.)

(A) chromosoom 6 chromosoom 4

Een geordende weergave van de volledige set van 46 menselijke chromosomen wordt het
menselijke karyotype genoemd (Figuur 5–8B). Als delen van een chromosoom verloren
gaan of tussen chromosomen worden verwisseld, kunnen deze veranderingen worden gedetecteerd.
Cytogenetici analyseren karyotypen om chromosomale afwijkingen op te sporen die
geassocieerd zijn met sommige erfelijke aandoeningen (Figuur 5–9) en met bepaalde soorten
kanker (zoals we zien in Hoofdstuk 20).

Chromosomen organiseren en dragen genetische informatie

(B) wederzijdse chromosomale translocatie
De belangrijkste functie van chromosomen is het dragen van genen – de functionele eenheden
van erfelijkheid. Een gen wordt vaak gedefinieerd als een stukje DNA dat de instructies bevat
voor het maken van een bepaald eiwit- of RNA-molecuul. De meeste RNA-moleculen die
ECB5m4.12/5.12 door genen worden gecodeerd, worden vervolgens gebruikt om een eiwit te produceren. In
sommige gevallen is het RNA-molecuul echter het eindproduct (zie figuur 5–7). Net als
eiwitten hebben deze RNA-moleculen diverse functies in de cel, waaronder structurele,
katalytische en genregulerende rollen, zoals we in latere hoofdstukken bespreken.

Samen vormt de totale genetische informatie die wordt gedragen door een complete set
chromosomen die in een cel of organisme aanwezig zijn, het genoom ervan.
Van duizenden organismen, van E. coli tot mensen, zijn complete genoomsequenties
bepaald . Zoals te verwachten is, bestaat er enige correlatie tussen de complexiteit van een
organisme en het aantal genen in zijn genoom. Het totale aantal genen bedraagt bijvoorbeeld
ongeveer 500 voor de eenvoudigste bacterie en ongeveer 24.000 voor mensen. Bacteriën en
sommige eencellige eukaryoten, waaronder de ontluikende gist S. cerevi-siae, hebben
bijzonder compacte genomen: de DNA-moleculen waaruit hun chromosomen bestaan, zijn
weinig meer dan een reeks dicht opeengepakte genen (Figuur 5–10). Chromosomen van
veel eukaryoten, waaronder mensen, bevatten echter, naast genen en de specifieke
nucleotidesequenties die nodig zijn voor normale genexpressie, een grote overmaat aan
onderling verspreid DNA (Figuur 5–11). Dit extra DNA wordt soms ten onrechte ‘junk-DNA’
genoemd, omdat het nut ervan voor de cel nog niet is aangetoond. Hoewel dit reserve-DNA
niet codeert voor eiwitten, kan een groot deel ervan een andere biologische functie vervullen.
Vergelijkingen van de genoomsequenties van veel verschillende soorten laten zien dat
kleine delen van dit extra DNA in hoge mate geconserveerd zijn onder verwante soorten, wat
hun belang voor deze organismen suggereert.

segment van dubbelstrengs DNA dat 0,5% van het DNA van het gistgenoom omvat
5ÿ 3ÿ

3ÿ 5ÿ

genen
10.000 nucleotideparen

Figuur 5–10 In gist liggen de genen dicht op elkaar gepakt langs de chromosomen. Deze figuur toont een klein deel van de dubbele DNA-
helix in één chromosoom van de ontluikende gist S. cerevisiae. Het genoom van S. cerevisiae bevat ongeveer 12,5 miljoen nucleotideparen en 6600
genen, verspreid over 16 chromosomen. Merk op dat voor elk gen slechts één van de twee DNA-strengen feitelijk codeert voor de informatie om een
RNA-molecuul te maken. Dit coderende gebied kan op beide strengen vallen, zoals aangegeven door de lichtrode balken. Er wordt echter
aangenomen dat elk ‘gen’ zowel de ‘coderende streng’ als het complement ervan omvat. De hoge genendichtheid is kenmerkend voor S. cerevisiae.
ECB5 e5,12/5,13
Machine Translated by Google
De structuur van eukaryote chromosomen 181

Figuur 5–11 In veel eukaryoten bevatten genen een overmaat aan

verspreid, niet-coderend DNA. Hier wordt de nucleotidesequentie van
het menselijke ÿ-globine-gen weergegeven. Dit gen bevat de
informatie die de aminozuursequentie specificeert van een van de twee
soorten subeenheden die worden aangetroffen in hemoglobine, een eiwit dat
zuurstof in het bloed transporteert. Alleen de sequentie van de coderende
streng wordt hier getoond; de niet-coderende streng van de dubbele helix
draagt de complementaire sequentie. Vanaf het 5'- uiteinde wordt zo'n reeks
van links naar rechts gelezen, zoals elk stukje Engelse tekst. De
segmenten van de DNA-sequentie die coderen voor de
aminozuursequentie van ÿ-globine zijn geel gemarkeerd. We zullen in
Hoofdstuk 7 zien hoe deze informatie wordt getranscribeerd en vertaald om een ÿ-globine-eiwit met de volledige lengte te produceren .

Over het algemeen geldt dat hoe complexer een organisme is, des te groter is zijn genoom.
Maar deze relatie geldt niet altijd. Het menselijke genoom is bijvoorbeeld 200 keer groter
dan dat van de gist S. cerevisiae, maar 30 keer kleiner dan dat van sommige planten en
minstens 60 keer kleiner dan die van sommige soorten amoeben (zie figuur 1-41).
Bovendien verschilt de manier waarop het DNA over de chromosomen is verdeeld ook van
soort tot soort.
Mensen hebben in totaal 46 chromosomen (inclusief zowel moeder- als vaderlijke sets),
maar een soort kleine herten heeft er slechts 7, terwijl sommige karpersoorten er meer dan
100 hebben. Zelfs nauw verwante soorten met vergelijkbare genoomgroottes kunnen zeer
verschillende chromosoomaantallen hebben en maten (Figuur 5–12). Hoewel het
gennummer grofweg gecorreleerd is met de complexiteit van de soort, bestaat er dus geen
eenvoudige relatie tussen gennummer, chromosoomnummer en totale genoomgrootte. De
genomen en chromosomen van moderne soorten zijn elk gevormd door een unieke
geschiedenis van schijnbaar willekeurige genetische gebeurtenissen, waarop specifieke
selectiedruk inwerkt, zoals we in hoofdstuk 9 bespreken.

Voor DNA zijn gespecialiseerde DNA-sequenties vereist

Replicatie en chromosoomsegregatie
Om een functioneel chromosoom te vormen, moet een DNA-molecuul meer doen dan
alleen maar genen dragen: het moet in staat zijn te worden gerepliceerd, en de gerepliceerde
kopieën moeten bij elke celdeling op gelijke en betrouwbare wijze worden gescheiden en
verdeeld in de twee dochtercellen. Deze processen vinden plaats via een geordende reeks
gebeurtenissen, gezamenlijk bekend als de celcyclus. Deze cyclus van celgroei en
celdeling is – heel kort – samengevat in figuur 5–13 en zal in detail worden besproken in
hoofdstuk 18. In dit hoofdstuk hoeven we ons in dit hoofdstuk slechts bezig te houden met
twee grote stadia van de celcyclus: interfase, wanneer chromosomen worden gedupliceerd,
en mitose, het veel kortere stadium waarin de gedupliceerde chromosomen worden
gedistribueerd of gescheiden naar de twee dochterkernen.

Tijdens de interfase worden de chromosomen uitgestrekt als lange, dunne, verwarde DNA-
draden in de kern en kunnen ze niet gemakkelijk worden onderscheiden met de
lichtmicroscoop (zie figuur 5–1). We noemen chromosomen in deze uitgebreide toestand
interfase-chromosomen. Het is tijdens de interfase dat DNA-replicatie plaatsvindt. Zoals we
in hoofdstuk 6 bespreken, zorgen twee gespecialiseerde DNA-sequenties, die in alle
eukaryoten voorkomen, ervoor dat dit proces efficiënt plaatsvindt. Eén type
nucleotidesequentie, een replicatieoorsprong genoemd, is waar de DNA-replicatie begint;
Eukaryotische chromosomen bevatten veel replicatieoorsprongen, waardoor de lange DNA-
moleculen snel kunnen worden gerepliceerd (Figuur 5–14). Een andere DNA-sequentie
vormt de telomeren die de uiteinden van elk chromosoom markeren. Telomeren bevatten
herhaalde nucleotidesequenties die nodig zijn om de uiteinden van chromosomen volledig
te kunnen repliceren. Ze dienen ook als beschermkap die ervoor zorgt dat de
chromosoomuiteinden niet door de cel worden aangezien als gebroken DNA dat gerepareerd
moet worden.
Machine Translated by Google
182 HOOFDSTUK 5 DNA en chromosomen

Y2 X Y1

XY
Chinese muntjak Indiase muntjak

Figuur 5–12 Twee nauw verwante soorten kunnen vergelijkbare genoomgroottes hebben, maar zeer verschillende
chromosoomnummers. In de evolutie van het Indiase muntjac-hert zijn chromosomen die aanvankelijk gescheiden waren, en die
bij de Chinese soort gescheiden blijven, gefuseerd zonder een groot effect te hebben op het aantal genen – of op het dier.
(Afbeelding links, met dank aan Deborah Carreno, Natural Wonders Photography; afbeelding rechts, met dank aan Beatrice Bourgery.)

Eukaryotische chromosomen bevatten ook een derde type gespecialiseerde DNA-sequentie,

ECB5de centromeer
e5,13/5,15 genaamd, die gedupliceerde chromosomen mogelijk maakt.
te scheiden tijdens de M-fase (zie figuur 5–14). Tijdens deze fase van de celcyclus rolt het
DNA zich op, neemt een steeds compactere structuur aan en vormt uiteindelijk zeer compacte
of gecondenseerde mitotische chromosomen (Figuur 5–15). Dit is de toestand waarin de
gedupliceerde chromosomen het gemakkelijkst kunnen worden gevisualiseerd (zie figuur 5–
1). Zodra de chromosomen zijn gecondenseerd, zorgt het centromeer ervoor dat de mitotische
spindel zich aan elk gedupliceerd chromosoom kan hechten op een manier die ervoor zorgt
dat één kopie van elk chromosoom wordt gescheiden naar elk van de twee dochtercellen (zie
figuur 5–13). We beschrijven de centrale rol die centromeren spelen bij de celdeling in
hoofdstuk 18.

Interfase-chromosomen zijn niet willekeurig

Verdeeld binnen de kern
Interfase-chromosomen zijn veel langer en fijner dan mitotische chromosomen. Niettemin
zijn ze op verschillende manieren binnen de kern georganiseerd. Ten eerste: hoewel
interfasechromosomen voortdurend dynamische herschikkingen ondergaan, heeft elk ervan
de neiging een bepaald gebied of territorium van de interfasekern te bezetten (Figuur 5–16).
Deze losse organisatie voorkomt dat interfase-chromosomen uitgebreid worden

mitotisch
nucleaire envelop spindel
rondom de kern

GENEXPRESSIE MITOSE CEL

EN CHROMOSOM BEGINT DIVISIE
DUPLICATIE

interfase mitotisch
chromosoom chromosoom

INTERFASE M FASE INTERFASE

Figuur 5–13 De duplicatie en segregatie van chromosomen vindt plaats via een geordende celcyclus in prolifererende cellen. Tijdens de interfase
brengt de cel veel van zijn genen tot expressie, en tijdens een deel van deze fase dupliceert hij zijn chromosomen. Zodra de chromosoomduplicatie voltooid
is, kan de cel de M-fase ingaan, waarin nucleaire deling of mitose plaatsvindt. Bij mitose condenseren de gedupliceerde chromosomen, stopt de
genexpressie grotendeels, wordt de nucleaire envelop afgebroken en wordt de mitotische spoel gevormd uit microtubuli en andere eiwitten. De
gecondenseerde chromosomen worden vervolgens opgevangen door de mitotische spil, een complete set wordt naar elk uiteinde van de cel getrokken en
er vormt zich een nucleaire envelop rond elke set chromosomen. In de laatste stap van de M-fase deelt de cel zich om twee dochtercellen te produceren.
Voor de eenvoud worden hier slechts twee verschillende chromosomen weergegeven.

ECB5 e5,14/5,16
Machine Translated by Google
De structuur van eukaryote chromosomen 183

INTERFASE M FASE INTERFASE

telomeer

replicatie
oorsprong
CEL
DIVISIE
+

centromeer

deel van
gedupliceerde mitotische spil chromosoom
chromosomen kopieën binnen
aparte cellen

Figuur 5–14 Er zijn drie DNA-sequentie-elementen nodig om een eukaryotisch chromosoom

te produceren dat kan worden gedupliceerd en vervolgens kan worden gescheiden
bij mitose. Elk chromosoom heeft meerdere replicatieoorsprongen: één centromeer en twee telomeren.
Schematisch wordt de volgorde van gebeurtenissen weergegeven die een typisch
chromosoom volgt tijdens de celcyclus. Het DNA repliceertvan
oorsprong in interfase, beginnend bij de
ECB5 e5.15/5.17
replicatie en verloopt bidirectioneel vanaf elke oorsprong langs het chromosoom.
In de M-fase bevestigt de centromeer de compacte, gedupliceerde chromosomen aan de
mitotische spil, zodat één kopie naar elke dochtercel wordt gedistribueerd wanneer de cel zich
deelt. Voorafgaand aan de celdeling helpt het centromeer ook om de gedupliceerde
chromosomen bij elkaar te houden totdat ze klaar zijn om uit elkaar te worden getrokken.
Telomeren bevatten DNA-sequenties die de volledige replicatie van chromosoomuiteinden mogelijk maken.

gedupliceerd
chromosoom

verstrikt, als spaghetti in een kom. Bovendien zijn sommige chromosomale gebieden
fysiek verbonden met bepaalde plaatsen op de nucleaire envelop – het paar
concentrische membranen die de kern omringen – of met de onderliggende nucleaire
lamina, het eiwitnetwerk dat de envelop ondersteunt (besproken in hoofdstuk 17).
centromeer
Deze bijlagen helpen ook dat interfase-chromosomen binnen hun verschillende
territoria blijven.

Het meest voor de hand liggende voorbeeld van chromosomale organisatie in de

interfasekern is de nucleolus – een structuur die groot genoeg is om zichtbaar te zijn
in de lichtmicroscoop (Figuur 5ÿ17A). Tijdens de interfase komen de delen van
verschillende chromosomen die genen dragen die coderen voor ribosomale RNA's chromatide
samen om de nucleolus te vormen. In menselijke cellen zijn honderden kopieën van 1 µm
(A) (B)
deze genen verdeeld in tien clusters, gelegen nabij de toppen van vijf verschillende
chromosoomparen (Figuur 5ÿ17B). In de nucleolus worden ribosomale RNA's Figuur 5–15 Een typisch gedupliceerd
gesynthetiseerd en gecombineerd met eiwitten om ribosomen te vormen, de mitotisch chromosoom is zeer compact.
ECB5 e5,16-5,18
eiwitsynthetiserende machines van de cel. Zoals we in Hoofdstuk 7 bespreken, Omdat DNA tijdens de interfase wordt
gerepliceerd, bevat elk mitotisch chromosoom
spelen riboso-mal RNA's zowel structurele als katalytische rollen in het ribosoom.
twee identieke gedupliceerde DNA-
moleculen (zie figuur 5–14). Elk van deze
Het DNA in chromosomen is altijd sterk gecondenseerd zeer lange DNA-moleculen, met de
bijbehorende eiwitten, wordt een chromatide
Zoals we hebben gezien, verpakken alle eukaryote cellen, of ze zich nu in de interfase genoemd; zodra de twee zusterchromatiden
of in de mitose bevinden, hun DNA stevig in chromosomen. Menselijk chromosoom scheiden, worden ze als individuele chromosomen beschouwd.
22 bevat bijvoorbeeld ongeveer 48 miljoen nucleotideparen; Als het van begin tot (A) Een scanning-elektronenmicrofoto van
een mitotisch chromosoom. De twee
eind wordt uitgestrekt, zou het DNA zich ongeveer 1,5 cm uitstrekken. Toch is
chromatiden zijn stevig met elkaar verbonden.
chromosoom 22 tijdens de mitose slechts ongeveer 2 ÿm lang, dat wil zeggen bijna
Het vernauwde gebied onthult de
10.000 keer compacter dan het DNA zou zijn als het tot zijn volledige lengte zou positie van het centromeer. (B) Een
worden uitgebreid. Deze opmerkelijke prestatie van compressie wordt uitgevoerd cartoonweergave van een mitotisch
door eiwitten die het DNA oprollen en vouwen naar steeds hogere organisatieniveaus. chromosoom. (A, met dank aan Terry D. Allen.)
Machine Translated by Google
184 HOOFDSTUK 5 DNA en chromosomen

Figuur 5–16 Interfase-chromosomen bezetten interfase cel

hun eigen afzonderlijke territoria binnen 5
de kern. DNA-sondes gekoppeld aan verschillende 3
fluorescerende markers worden gebruikt om
individuele interfase-chromosomen in een menselijke
cel te schilderen. (A) Gezien in een
11
fluorescentiemicroscoop blijkt de kern gevuld 5 11
te zijn met een lappendeken van discrete kleuren.
(B) Om hun verschillende locaties te 3
benadrukken, worden drie sets chromosomen
uitgekozen: chromosomen 3, 5 en 11. Merk op dat nucleair kern
paren homologe chromosomen, zoals de twee envelop 10 µm
kopieën van chromosoom 3, zich doorgaans (A) (B)
niet op dezelfde positie bevinden.
(Aangepast overgenomen van MR
Hübner en DL Spector, Annu. Rev. Biophys.
39: 471-489, 2010.)
Hoewel het DNA van interfase-chromosomen stevig in de kern is opeengepakt, is
het ongeveer twintig keer minder gecondenseerd dan dat van mitotische
chromosomen (Figuur 5–18).
ECB5 n5.102/5.19
In de volgende paragrafen introduceren we de gespecialiseerde eiwitten die deze
compressie mogelijk maken. Houd er echter rekening mee dat de
chromosoomstructuur dynamisch is. Chromosomen condenseren en decondenseren
niet alleen tijdens de celcyclus, maar de verpakking van chromosomen moet flexibel
genoeg zijn om snelle, on-demand toegang tot verschillende regio's van het interfase-
chromosoom mogelijk te maken, en voldoende uit te pakken om eiwitcomplexen
toegang te geven tot specifieke, gelokaliseerde nucleotidesequenties. voor DNA-
replicatie, DNA-reparatie of genexpressie.

Nucleosomen zijn de basiseenheden van eukaryoot

Figuur 5–17 De nucleolus is de meest
prominente structuur in de interfasekern. (A)
Elektronenmicrofoto van een dun gedeelte door
de kern van een menselijke fibroblast. De kern
is omgeven door de nucleaire envelop. In de kern
verschijnt het chromatine als een diffuse
gespikkelde massa; gebieden die bijzonder dicht
zijn, worden heterochromatine genoemd
(donkere kleuring).
Heterochromatine bevat weinig genen en bevindt
zich voornamelijk rond de periferie van de kern,
direct onder de nucleaire envelop. Het grote, donkere
gebied in de kern is de nucleolus, die de genen voor
ribosomale RNA's bevat. (B) Schematische illustratie
die laat zien hoe ribosomale RNA-genen, die
geclusterd zijn nabij de toppen van vijf
verschillende menselijke chromosomen (13, 14,
15, 21 en 22), samenkomen om de nucleolus
te vormen, een biochemisch subcompartiment
geproduceerd door de aggregatie
van een reeks macromoleculen: DNA,
RNA's en eiwitten (zie figuur 4–54). (A, met dank
aan EG Jordan en J. McGovern.)
Chromosoomstructuur
De eiwitten die aan DNA binden om eukaryote chromosomen te vormen, worden
traditioneel verdeeld in twee algemene klassen: de histonen en de niet-histone-
chromosomale eiwitten. Histonen zijn in enorme hoeveelheden aanwezig (meer dan
60 miljoen moleculen van verschillende typen in elke menselijke cel) en hun totale
massa in chromosomen is ongeveer gelijk aan die van het DNA zelf. Niet-histone-
chromosomale eiwitten zijn ook in grote aantallen aanwezig; ze omvatten honderden
verschillende met chromatine geassocieerde eiwitten. Daarentegen zijn slechts
een handvol verschillende histoneiwitten aanwezig in eukaryote cellen. Het complex
van beide klassen eiwitten met nucleair DNA wordt chromatine genoemd.
Histonen zijn verantwoordelijk voor het eerste en meest fundamentele niveau van
chromatinepakking: de vorming van het nucleosoom. Nucleosomen zetten de DNA-
moleculen in een interfasekern om in een chromatinevezel
chromatine 10 chromosomen dragen elk bij
een lus die rRNA-genen bevat
de nucleolus
nucleair
envelop
heterochromatine
kern
nucleolair
RNA's en
eiwitten

(A) (B)
2 µm
Machine Translated by Google
De structuur van eukaryote chromosomen 185

Figuur 5–18 DNA in interfase-chromosomen is minder compact dan

in mitotische chromosomen. (A) Een elektronenmicrofoto waarop een
enorme kluwen van chromatine (DNA met de bijbehorende eiwitten) te zien
is die uit een gelyseerde interfasekern stroomt. (B) Ter vergelijking
wordt een compact, menselijk mitotisch chromosoom op dezelfde schaal weergegeven.
(A, met dank aan Victoria Foe; B, met dank aan Terry D. Allen.)

is ongeveer een derde van de lengte van het initiële DNA. Deze chroma-tinvezels
bevatten, wanneer ze met een elektronenmicroscoop worden onderzocht, clusters
van dicht opeengepakte nucleosomen (Figuur 5–19A). Als dit chromatine vervolgens
wordt onderworpen aan behandelingen waardoor het zich gedeeltelijk ontvouwt, kan
het in de elektronenmicroscoop worden gezien als een reeks ‘kralen aan een
touwtje’ (Figuur 5–19B). De draad is DNA en elke kraal is een nucleosoomkerndeeltje,
dat bestaat uit DNA dat rond een kern van histoneiwitten is gewikkeld.

Om de structuur van het kerndeeltje van het nucleosoom te bepalen, behandelden

onderzoekers chromatine in zijn ongevouwen, ‘kralen-aan-een-snoer’-vorm met (A)
interfase
enzymen die nucleasen worden genoemd en die het DNA doorknippen door de chromatine
fosfodiësterbindingen tussen nucleotiden te verbreken. Wanneer deze nucleasedigestie 5 µm
gedurende een korte tijd wordt uitgevoerd, wordt alleen het blootgestelde DNA tussen
de kerndeeltjes – het linker- DNA – gesplitst, waardoor de kerndeeltjes kunnen worden geïsoleerd.
mitotisch chromosoom
Een individueel nucleosoomkerndeeltje bestaat uit een complex van acht histoneiwitten
– elk twee moleculen van de histonen H2A, H2B, H3 en H4 – samen met een segment
dubbelstrengs DNA, 147 nucleotideparen lang, dat rond dit histonoctameer slingert .
Figuur 5–20). De structuur met hoge resolutie van het kerndeeltje van het nucleosoom (B)

werd in 1997 opgelost, waardoor in atomair detail het schijfvormige histon-octameer

werd onthuld waarrond het DNA strak is gewikkeld, wat 1,7 windingen maakt in een
linkshandige spoel (Figuur 5–21). Het linker-DNA tussen elk nucleosoomkerndeeltje ECB5 e5,19/5,21
kan in lengte variëren van enkele nucleotideparen tot ongeveer 80. Technisch
gesproken bestaat een ‘nucleosoom’ uit een nucleosoomkerndeeltje plus een van de
aangrenzende DNA-linkers, zoals weergegeven in Figuur 5. –20; de term wordt echter
vaak gebruikt om te verwijzen naar het nucleosoomkerndeeltje zelf.

(A)

(B)

50 nm

Figuur 5–19 Nucleosomen zijn te zien in de elektronenmicroscoop. (A) Chromatine dat

rechtstreeks uit een interfasekern wordt geïsoleerd, kan in de elektronenmicroscoop
verschijnen als een chromatinevezel, samengesteld uit opeengepakte nucleosomen.
(B) Een andere elektronenmicrofoto toont een stuk chromatinevezel dat experimenteel
is uitgepakt of gedecondenseerd na isolatie om het 'kralen-aan-een-snoer'-uiterlijk
van de nucleosomen te laten zien. (A, met dank aan Barbara Hamkalo; B, met dank
aan Victoria Foe.) ECB5 e5,20/5,22
Machine Translated by Google
186 HOOFDSTUK 5 DNA en chromosomen

kern histonen Figuur 5–20 Nucleosomen bevatten DNA dat rond een eiwitkern van
linker-DNA van nucleosoom acht histonmoleculen is gewikkeld. In een reageerbuis kan het
nucleosoomkerndeeltje worden vrijgemaakt van chromatine door
vertering van het linker-DNA met een nuclease, dat het blootgestelde
linker-DNA splitst, maar niet het DNA dat strak rond de nucleosoomkern is
“kralen aan een touwtje” nucleosoom omvat gewonden. Wanneer het DNA rond elk geïsoleerd nucleosoomkerndeeltje
vorm van chromatine ~200 nucleotiden
wordt vrijgegeven, blijkt de lengte ervan 147 nucleotideparen te zijn; dit
paren DNA
DNA wikkelt zich bijna tweemaal rond het histone-octameer dat de nucleosoomkern vormt.
NUCLEASE
VERTERINGEN

LINKER-DNA

Alle vier de histonen waaruit het octameer bestaat, zijn relatief kleine eiwitten met
een hoog aandeel positief geladen aminozuren (lysine en arginine). De positieve
ladingen helpen de histonen stevig te binden aan de negatief geladen suiker-
fosfaatruggengraat van DNA. Deze talrijke elektrostatische interacties verklaren
gedeeltelijk waarom DNA van vrijwel elke sequentie aan een histon-octameer kan
uitgegeven
11 nm
binden. Elk van de histonen in het octameer heeft ook een lange, ongestructureerde
nucleosoom
kerndeeltje N-terminale aminozuurstaart die zich uitstrekt vanaf het kerndeeltje van het
nucleosoom (zie de H3-staart in figuur 5–21). Deze histonstaarten zijn onderhevig
DISSOCIATIE aan verschillende soorten omkeerbare, covalente chemische modificaties die vele
MET HOOG aspecten van de chromatinestructuur beheersen.
CONCENTRATIE
VAN ZOUT

De histonen die de nucleosoomkern vormen behoren tot de hoogst geconserveerde

van alle bekende eukaryote eiwitten: er zijn slechts twee verschillen tussen de
aminozuursequenties van histon H4 van bijvoorbeeld erwten en koeien. Deze
histon 147-nucleotide-paar
octameer Dubbele DNA-helix extreme evolutionaire instandhouding weerspiegelt de vitale rol van histonen bij het
beheersen van de eukaryotische chromosoomstructuur.

DISSOCIATIE Chromosoompakking vindt plaats op meerdere niveaus

Hoewel zich op het meeste chromosomale DNA lange reeksen nucleosomen
vormen, neemt chromatine in de levende cel zelden de verlengde vorm van kralen
aan een touw aan, zoals te zien is in figuur 5–19B. In plaats daarvan worden de
H2A H2B H3 H4 nucleosomen verder op elkaar gepakt om een compactere structuur te genereren,
zoals de chromatinevezel die wordt weergegeven in figuur 5–19A en film 5.2. Deze
extra pakking van nucleosomen in een chromatinevezel is afhankelijk van een vijfde

ECB5 e5,21/5,23
een H3-histonstaart

bekeken
gezicht-op

bekeken
van de
rand

Dubbele DNA-helix

histon H2A histon H2B histon H3 histon H4

Figuur 5–21 De structuur van het kerndeeltje van het nucleosoom, zoals bepaald door röntgendiffractieanalyse, laat zien hoe DNA
strak rond een schijfvormig histon-octameer is gewikkeld. Hier worden twee weergaven van een nucleosoomkerndeeltje getoond. De twee
strengen van de dubbele DNA-helix zijn grijs weergegeven. Er is een deel van een H3-histonestaart (groen) te zien die zich uitstrekt vanaf het
kerndeeltje van het nucleosoom, maar de staarten van de andere histonen zijn afgeknot. (Uit K. Luger et al., Nature 389:251–260, 1997.)

ECB5 e5,22/5,24
Machine Translated by Google
De structuur van eukaryote chromosomen 187

Figuur 5ÿ22 Het chromatine in menselijke

chromosomen is opgevouwen in
lusdomein lusvormige domeinen. Deze lussen worden tot
stand gebracht door speciale niet-histone-
chromosomale eiwitten die zich binden aan
specifieke DNA-sequenties, waardoor een klem ontstaat aan de basi

overeenkomend specifiek chromosoom

DNA-sequenties lusvorming
eiwitten vastklemmen

histon genaamd histon H1, waarvan wordt gedacht dat het aangrenzende nucleosomen
samentrekt in een regelmatig herhalende reeks. Deze ‘linker’-histone verandert het pad dat het
DNA volgt als het de nucleosoomkern verlaat, waardoor het een meer gecondenseerde
chromatinevezel kan vormen.
ECB5 n5.201/5.24.5

We hebben eerder gezien dat chromatine tijdens de mitose zo sterk gecondenseerd raakt dat
individuele chromosomen zichtbaar zijn in de lichtmicroscoop. VRAAG 5–2
Hoe wordt een chromatinevezel gevouwen om mitotische chromosomen te produceren?
Hoewel het antwoord nog niet in detail bekend is, is het wel bekend dat gespecialiseerde niet- Ervan uitgaande dat het histone-
histone-chromosomale eiwitten het chromatine in een reeks lussen vouwen (Figuur 5-22). octameer (weergegeven in figuur 5–
Deze lussen worden verder gecondenseerd om het interfase-chromosoom te produceren. Ten 20) een cilinder vormt met een diameter
van 9 nm en een hoogte van 5 nm en
slotte wordt aangenomen dat deze compacte reeks lussen nog minstens één pakkingsniveau
dat het menselijk genoom 32 miljoen
ondergaat om het mitotische chromosoom te vormen (Figuur 5-23).
nucleosomen vormt, welk volume
van de kern (6 ÿm in diameter) wordt
dan ingenomen door histon? octameren?
(Het volume van een cilinder is ÿr 2h; het
volume van een bol is 4/3 ÿr 3.) Welke fractie
korte regio van 2 nm
Dubbele DNA-helix van het totale volume van de kern
nemen de histone-octameren in beslag?
Hoe verhoudt dit zich tot het volume
van de kern dat wordt ingenomen door
11 nm menselijk DNA?
“kralen aan een touwtje”
vorm van chromatine

chromatine vezels
van gepakte 30 nm
nucleosomen

chromatine vezels
700 nm
in lussen gevouwen Figuur 5ÿ23 DNA-pakking komt op
verschillende niveaus in chromosomen
voor. Deze schematische tekening toont enkele van
centromeer
de niveaus waarvan men denkt dat ze aanleiding
geven tot het sterk gecondenseerde mitotische
geheel chromosoom. Het is bekend dat zowel histone H1
mitotisch 1400 nm
als een reeks gespecialiseerde niet-histone-
chromosoom
chromosomale eiwitten deze condensaties helpen
NETTO RESULTAAT: ELKE DNA-MOLECULE IS GEWEEST aandrijven, waaronder de
VERPAKT IN EEN MITOTISCH CHROMOSOOM DAT chromosoomlusvormende klemeiwitten en het
IS 10.000-VOUDIG KORTER DAN ZIJN VOLLEDIG overvloedige niet-histone-eiwitcondensine (zie
VERLENGDE LENGTE figuur 18–18). De feitelijke structuren zijn echter nog steeds onzeker.
Machine Translated by Google
188 HOOFDSTUK 5 DNA en chromosomen

DE REGELING VAN CHROMOSOM

STRUCTUUR
Tot nu toe hebben we besproken hoe DNA stevig in chromatine is verpakt. We gaan
nu in op de vraag hoe deze verpakking kan worden aangepast om snelle toegang
tot het onderliggende DNA mogelijk te maken. Het DNA in cellen bevat enorme
hoeveelheden gecodeerde informatie, en cellen moeten deze informatie indien nodig
kunnen ophalen.

In deze sectie bespreken we hoe een cel zijn chromatinestructuur kan veranderen
om gelokaliseerde DNA-gebieden bloot te leggen en toegang te geven tot specifieke
eiwitten en eiwitcomplexen, met name die welke betrokken zijn bij genexpressie en
bij DNA-replicatie en -reparatie. Vervolgens bespreken we hoe de chromatinestructuur
tot stand komt en wordt onderhouden – en hoe een cel sommige vormen van deze
structuur kan doorgeven aan zijn nakomelingen, waardoor verschillende celtypen
hun identiteit kunnen behouden. Hoewel veel van de details nog moeten worden
ontcijferd, spelen de regulatie en overerving van de chromatinestructuur een cruciale
rol in de ontwikkeling van eukaryotische organismen.

Veranderingen in de nucleosoomstructuur maken toegang tot DNA mogelijk

Eukaryote cellen hebben verschillende manieren om de lokale structuur van hun

chromatine snel aan te passen. Eén manier maakt gebruik van een reeks ATP-
afhankelijke chromatine-remodellerende complexen. Deze eiwitmachines
gebruiken de energie van ATP-hydrolyse om de positie van het DNA dat rond
nucleosomen is gewikkeld te veranderen (Figuur 5ÿ24). Door interactie met zowel
het histone-octameer als het DNA dat eromheen is gewikkeld, kunnen chromatine-
remodellerende complexen lokaal de rangschikking van de nucleosomen veranderen,
waardoor het DNA toegankelijker (of minder toegankelijk) wordt voor andere eiwitten in de cel.
Tijdens de mitose worden veel van deze complexen geïnactiveerd, waardoor
mitotische chromosomen hun dicht opeengepakte structuur kunnen behouden.
Een andere manier om de chromatinestructuur te veranderen is gebaseerd op de
omkeerbare chemische modificatie van histonen, gekatalyseerd door een groot
aantal verschillende histon-modificerende enzymen. De staarten van alle vier de
kernhistonen zijn in het bijzonder onderhevig aan deze covalente modificaties,
waaronder de toevoeging (en verwijdering) van acetyl-, fosfaat- of methylgroepen.

ATP-afhankelijk
chromatine-remodellering
complex

ATP ADP

BEWEGING
VAN DNA

10 nm
(A) (B)

Figuur 5ÿ24 Complexen die chromatine hermodelleren, herpositioneren lokaal het DNA dat rond nucleosomen is gewikkeld. (A) De complexen gebruiken energie
afkomstig van ATP-hydrolyse om het nucleosomale DNA los te maken en het langs het histon-octameer te duwen. Op deze manier kan het enzym een DNA-sequentie
blootleggen of verbergen, waardoor de beschikbaarheid ervan voor andere DNA-bindende eiwitten wordt gecontroleerd. De blauwe strepen zijn toegevoegd om te laten
zien hoe het DNA van positie verschuift. Er zijn veel cycli van ATP-hydrolyse nodig om een dergelijke verschuiving teweeg te brengen. (B) De structuur van een
chromatine-hermodellerend complex, dat laat zien hoe het enzym een kerndeeltje van het nucleosoom omhult, inclusief een histon-octameer (oranje) en het DNA dat
eromheen is gewikkeld (lichtgroen). Dit grote complex, gezuiverd uit gist, bevat 15 subeenheden, waaronder één die ATP hydrolyseert en vier die specifieke covalent
gemodificeerde histonen herkennen. (B, overgenomen van AE Leschziner et al., Proc. Natl. Acad.
Wetenschap VS 104: 4913-4918, 2007.)

ECB5 e5,26-5,26
Machine Translated by Google
De regulatie van de chromosoomstructuur 189

(A) H4 staart
(B)
H2B-staart
histon H3 staartmodificatie functionele uitkomst
H2A-staart H3 staart

trimethyl

H2A-staart
M
H4 staart M
M heterochromatine
vorming,
H2B-staart
K gen-uitschakeling
9
H3 staart

Ac Ac trimethyl
of Ac Ac of M
M of Ac of M M
MM P MM MM P M histon M Ac
A R T K QTA R KS TGG K AP RK QLA T K AA RKS APATGGV K H3
genexpressie
24 9 10 14 1718 36 23 262728 K
K4 _ 9

(Figuur 5ÿ25A). Deze en andere modificaties kunnen belangrijke gevolgen hebben Figuur 5ÿ25 Het modificatiepatroon van
histonstaarten kan bepalen hoe een stuk chromatine
voor de pakking van de chromatinevezel. Acetylering van lysines kan bijvoorbeeld de
door de cel wordt verwerkt.
affiniteit van de staarten voor aangrenzende nucleosomen verminderen, waardoor de
(A) Schematische tekening die de posities toont van
chromatinestructuur losser wordt en toegang tot bepaalde nucleaire eiwitten mogelijk de histonstaarten die zich uitstrekken vanaf elk
wordt. nucleosoomkerndeeltje. Elke histon kan worden
gemodificeerd door de covalente hechting van een
Het allerbelangrijkste is echter dat deze wijzigingen over het algemeen dienen als dock- ECB5 e5.27/5.27 aantal verschillende chemische groepen, voornamelijk
plaatsen op de histonstaarten voor een verscheidenheid aan regulerende eiwitten. aan de staarten. De staart van histon H3 kan bijvoorbeeld
Verschillende modificatiepatronen trekken specifieke sets van niet-histon- acetylgroepen (Ac), methylgroepen (M) of fosfaatgroepen
chromosomale eiwitten naar een bepaald stuk chromatine. Sommige van deze eiwitten (P) ontvangen. De cijfers geven de posities aan van
de gemodificeerde aminozuren in de histonstaart,
bevorderen de condensatie van chromatine, terwijl andere de expansie van chromatine
waarbij elk aminozuur wordt aangeduid met zijn
bevorderen en zo de toegang tot het DNA vergemakkelijken. Specifieke combinaties eenlettercode. Merk op dat sommige aminozuren,
van staartmodificaties, en de eiwitten die eraan binden, hebben verschillende zoals de lysine (K) op posities 9, 14, 23 en 27,
functionele uitkomsten voor de cel: één patroon kan bijvoorbeeld een bepaald stuk kunnen worden gemodificeerd door acetylering of
chromatine markeren als nieuw gerepliceerd; een ander zou erop kunnen wijzen dat methylering (maar niet door beide tegelijk).
Lysinen kunnen bovendien worden gemodificeerd
de genen in dat stuk chromatine actief tot expressie worden gebracht; weer andere
met één, twee of drie methylgroepen; trimethylering
worden geassocieerd met genen die tot zwijgen zijn gebracht (Figuur 5ÿ25B). wordt bijvoorbeeld getoond in (B). Merk op dat histon
H3 135 aminozuren bevat, waarvan de meeste
zich in het bolvormige gedeelte bevinden (weergegeven
Zowel ATP-afhankelijke chromatine-remodellerende complexen als histon-
door de wig); de meeste modificaties vinden plaats
modificerende enzymen worden strak gereguleerd. Deze enzymen worden vaak naar op de N-terminale staart, waarvoor 36 aminozuren
bepaalde chromatinegebieden gebracht door interacties met eiwitten die binden aan worden getoond. (B) Verschillende combinaties van
een specifieke nucleotidesequentie in het DNA – of in een RNA dat uit dit DNA wordt histonstaartmodificaties kunnen een specifieke betekenis

getranscribeerd (een onderwerp waar we in hoofdstuk 8 op terugkomen). Histone- geven aan het stuk chromatine waarop ze voorkomen,
zoals aangegeven.
modificerende enzymen werken samen met de chromatine-remodellerende complexen
Er zijn slechts enkele van deze functionele uitkomsten
om stukken chromatine te condenseren en te ontspannen, waardoor de lokale bekend.
chromatinestructuur snel kan veranderen afhankelijk van de behoeften van de cel.

Interfase-chromosomen bevatten beide sterk VRAAG 5–3

Gecondenseerde en meer uitgebreide vormen van chromatine
De gelokaliseerde verandering van de chromatinepakking door het hermodelleren van Histone-eiwitten behoren tot de
complexen en histon-modificatie heeft belangrijke effecten op de grootschalige meest geconserveerde eiwitten in
eukaryoten. Histone H4-eiwitten uit
structuur van interfase-chromosomen. Interfasechromatine is niet uniform verpakt. In
een erwt en een koe verschillen
plaats daarvan zijn de gebieden van het chromosoom die genen bevatten die actief tot
bijvoorbeeld in slechts 2 van de 102 aminozuren.
expressie worden gebracht over het algemeen meer uitgebreid, terwijl de gebieden die Vergelijking van de gensequenties laat
stille genen bevatten meer gecondenseerd zijn. De gedetailleerde structuur van een nog veel meer verschillen zien, maar
interfase-chromosoom kan dus verschillen van het ene celtype tot het andere, wat slechts twee veranderen de
helpt bepalen welke genen zijn ingeschakeld en welke zijn uitgeschakeld. De meeste aminozuursequentie. Deze
celtypen brengen slechts ongeveer de helft van de genen die ze bevatten tot waarnemingen geven aan dat er tijdens
expressie, en veel daarvan zijn slechts op zeer lage niveaus actief. de evolutie tegen mutaties die
aminozuren veranderen moet zijn geselecteerd.
De meest gecondenseerde vorm van interfase-chromatine wordt heterochromatine Waarom veronderstel je dat
genoemd (van het Griekse heteros, 'anders', chromatine). Deze zeer compacte vorm aminozuurveranderende mutaties in
van chromatine werd voor het eerst waargenomen in de lichtmicroscoop in de jaren histongenen schadelijk zijn?
dertig van de vorige eeuw als afzonderlijke, sterk kleurende gebieden binnen de totale
Machine Translated by Google
190 HOOFDSTUK 5 DNA en chromosomen
heterochromatine euchromatine heterochromatine
telomeer
Figuur 5ÿ26 De structuur van chromatine
varieert langs een enkel interfase-
chromosoom. Zoals schematisch aangegeven
door het pad van het DNA-molecuul (weergegeven
door de centrale zwarte lijn) en de verschillende
willekeurig toegewezen kleuren, vertegenwoordigen
heterochromatine en euchromatine elk een
reeks verschillende chromatinestructuren
met verschillende mate van condensatie. Over
het algemeen is heterochromatine meer
gecondenseerd dan euchromatine.
Figuur 5ÿ27 Heterochromatine-
specifieke histonmodificaties zorgen
ervoor dat heterochromatine zich
kan vormen en verspreiden. Deze
modificaties trekken heterochromatine-
specifieke eiwitten aan die dezelfde histon-
modificaties op aangrenzende
nucleosomen reproduceren. Op deze manier
kan heterochromatine zich verspreiden totdat het
een barrière-DNA-sequentie tegenkomt die
verdere voortplanting naar gebieden van euchromatine blokkeert.
hetero-
euchromatine chromatine euchromatine heterochromatine
centromeer telomeer
chromatine massa. Heterochromatine maakt doorgaans ongeveer 10% uit van een
interfase-chromosoom, en bij zoogdierchromosomen is het geconcentreerd rond
het centromeergebied en in het telomere DNA aan de chromosoomuiteinden (zie
figuur 5–14).
De rest van het interfase-chromatine wordt euchromatine genoemd (van het
Griekse eu, ‘waar’ of ‘normaal’, chromatine). Hoewel we de term euchromatine
gebruiken om te verwijzen naar chromatine dat in een minder gecondenseerde
ECB5 e5,28/5,28
toestand voorkomt dan heterochromatine, is het nu duidelijk dat zowel euchromatine
als heterochromatine zijn samengesteld uit mengsels van verschillende
chromatinestructuren (Figuur 5-26).
Elk type chromatinestructuur wordt tot stand gebracht en onderhouden door
verschillende sets histonstaartmodificaties, die verschillende sets niet-histone-
chromosomale eiwitten aantrekken. De modificaties die de vorming van het meest
voorkomende type heterochromatine aansturen, omvatten bijvoorbeeld de
methylering van lysine 9 in de staart van histon H3 (zie figuur 5-25B). Zodra
heterochromatine is vastgesteld, kan het zich verspreiden naar aangrenzende
gebieden van het DNA, omdat de histonstaartmodificaties een reeks heterochromatine-
specifieke eiwitten aantrekken, waaronder histonmodificerende enzymen, die
vervolgens dezelfde histonstaartmodificaties toevoegen aan aangrenzende
nucleosomen. Deze modificaties rekruteren op hun beurt meer van de
heterochromatine-specifieke eiwitten, waardoor een golf van gecondenseerd
chromatine zich langs het chromosoom voortplant. Dit uitgebreide gebied van
heterochromatine zal zich blijven verspreiden totdat het een barrière-DNA-sequentie
tegenkomt die de voortplanting stopt (Figuur 5-27). Sommige barrièresequenties
bevatten bijvoorbeeld bindingsplaatsen voor histon-modificerende enzymen die toevoegen
heterochromatine-specifiek
histon staartmodificaties
barrière-DNA
reeks
heterochromatine euchromatine
HISTONE-WIJZIGINGEN TREKKEN AAN
HETEROCHROMATINE-SPECIFIEKE EIWITTEN,
INCLUSIEF HISTONE-MODIFERENDE ENZYMEN
HETEROCHROMATINE-SPECIFIEKE EIWITTEN
WIJZIG HISTONES IN DE BUURT
HETEROCHROMATINE VERSPREIDT
TOT HET ONTMOETT A
BARRIÈRE DNA-SEQUENTIE
Machine Translated by Google
De regulatie van de chromosoomstructuur 191

een acetylgroep op lysine 9 van de histon H3-staart; deze modificatie blokkeert de

methylering van dat lysine, waardoor elke verdere verspreiding van heterochromatine
wordt voorkomen (zie figuur 5ÿ25B).
Een groot deel van het DNA dat tot heterochromatine is gevouwen, bevat geen genen.
Omdat heterochromatine zo compact is, kunnen genen die per ongeluk in heterochromatine
worden verpakt, meestal niet tot expressie worden gebracht. Een dergelijke ongepaste
Figuur 5ÿ28 Eén van de twee X-chromosomen wordt
verpakking van genen in heterochromatine kan ziekten veroorzaken: bij mensen bevindt in de cellen van vrouwelijke zoogdieren
het gen dat codeert voor ÿ-globine – een eiwit dat deel uitmaakt van het zuurstofdragende geïnactiveerd door heterochromatinevorming.
hemoglobinemolecuul – zich in de buurt van een gebied met heterochromatine. Bij een (A) Elke vrouwelijke cel bevat twee X-
individu met een erfelijke deletie van zijn barrière-DNA verspreidt dat heterochromatine chromosomen, één van de moeder (Xm) en één van

zich en deactiveert het het ÿ-globine-gen, waardoor ernstige bloedarmoede ontstaat. de vader (Xp). In een vroeg stadium van de
embryonale ontwikkeling wordt één van deze twee
chromosomen in elke cel schijnbaar willekeurig

Misschien wel het meest opvallende voorbeeld van het gebruik van heterochromatine om gecondenseerd tot heterochromatine. Bij elke
celdeling wordt hetzelfde X-chromosoom
genen stil te leggen of tot zwijgen te brengen, wordt gevonden in de interfase X-
gecondenseerd (en geïnactiveerd) in alle
chromosomen van vrouwelijke zoogdieren. Bij zoogdieren bevatten vrouwelijke cellen nakomelingen van die oorspronkelijke cel. Alle
twee X-chromosomen, terwijl mannelijke cellen één X en één Y bevatten. Een dubbele vrouwtjes van zoogdieren eindigen dus als mengsels
dosis X-chromosoomproducten zou dodelijk kunnen zijn, en vrouwelijke zoogdieren (mozaïeken) van cellen die ofwel geïnactiveerde X-
hebben een mechanisme ontwikkeld om één van de twee X-chromosomen in elke cel chromosomen van de moeder ofwel de
geïnactiveerde X-chromosomen van de vader
permanent te inactiveren. cel. Willekeurig wordt een van de twee X-chromosomen in elke
dragen. In de meeste van hun weefsels en
kern al vroeg in de embryonale ontwikkeling sterk gecondenseerd tot heterochromatine. organen zal ongeveer de helft van de cellen van
Daarna wordt de gecondenseerde en inactieve toestand van dat X-chromosoom overgeërfd het ene type zijn, en de rest van het andere type. (B)
in alle vele nakomelingen van die cellen (Figuur 5-28). Dit proces van X-inactivatie is In de kern van een vrouwelijke cel kan het
verantwoordelijk voor de lappendekenkleuring van lapjeskatten (Figuur 5ÿ29). geïnactiveerde X-chromosoom worden gezien als
een kleine, discrete massa chromatine, een Barr-
lichaampje genoemd, genoemd naar de arts die
X-inactivatie is een extreem voorbeeld van een proces dat plaatsvindt in alle eukaryote het voor het eerst observeerde. In deze microfoto's
van de kernen van menselijke fibroblasten is het
cellen – een proces dat op een veel fijnere schaal werkt om de genexpressie te helpen
geïnactiveerde X-chromosoom in de vrouwelijke
controleren. Wanneer een cel zich deelt, kan deze zijn histonmodificaties,
kern (onderste microfoto) zichtbaar gemaakt door
chromatinestructuur en genexpressiepatronen doorgeven aan de twee dochtercellen. Een gebruik te maken van een antilichaam dat eiwitten
dergelijk ‘celgeheugen’ verzendt informatie waarover herkent die geassocieerd zijn met het Barr-lichaampje.
De mannelijke kern (boven) bevat slechts één X-chromosoom, dat
cel in het vroege embryo Onder de microfoto's toont een cartoon de locaties
van zowel de actieve als de inactieve X-
XP Xm
chromosomen in de vrouwelijke kern.
(B, aangepast van B. Hong et al. Proc. Natl Acad.
Sci. USA 98:8703-8708, 2001.)

mannelijke kern
INACTIVERING VAN EEN WILLEKEURIG
GESELECTEERD X CHROMOSOM

XP Xm XP Xm

vrouwelijke kern

DIRECTE OVERHEVING VAN HET PATROON VAN X-CHROMOSOM INACTIVATIE

geïnactiveerde X
chromosoom (Barr-lichaam)

regio met actieve

alleen Xm actief in deze celafstammelingen alleen Xp actief in deze celafstammelingen
X-chromosoom (niet zichtbaar)
(A) (B)
Machine Translated by Google
192 HOOFDSTUK 5 DNA en chromosomen

genen zijn actief en welke niet: een proces dat cruciaal is voor het ontstaan en in stand
houden van verschillende celtypen tijdens de ontwikkeling van een complex meercellig
organisme. We bespreken enkele van de mechanismen die betrokken zijn bij het
celgeheugen in Hoofdstuk 8, waarbij we bekijken hoe cellen de genexpressie controleren.

ESSENTIËLE CONCEPTEN
• Het leven hangt af van de stabiele opslag, het onderhoud en de overerving van genetische
informatie. • Genetische

informatie wordt gedragen door zeer lange DNA-moleculen en wordt gecodeerd in de

lineaire sequentie van vier nucleotiden: A, T, G en C.

• Elk DNA-molecuul is een dubbele helix die bestaat uit een paar antiparallelle,
Figuur 5ÿ29 De vachtkleur van een complementaire DNA-strengen, die bij elkaar worden gehouden door waterstofbruggen
lapjeskat wordt voor een groot deel bepaald tussen GC- en AT-basenparen.
door patronen van X-inactivatie. Bij katten
bevindt een van de genen die de vachtkleur • Het genetische materiaal van een eukaryotische cel – het genoom – is vervat in een reeks
bepalen zich op het X-chromosoom. Bij chromosomen, elk gevormd uit een enkel, enorm lang DNA-molecuul dat vele genen
vrouwelijke calicos draagt één X-chromosoom de bevat.
vorm van het gen dat zwarte vacht specificeert, het
• Wanneer een gen tot expressie komt, wordt een deel van de nucleotidesequentie ervan
andere draagt de vorm van het gen dat oranje vacht
getranscribeerd in RNA-moleculen, waarvan de meeste worden vertaald om een eiwit te
specificeert. Huidcellen waarin het X-chromosoom
dat het gen voor zwarte vacht draagt, is produceren.
geïnactiveerd, zullen oranje vacht produceren; • Het DNA dat elk eukaryotisch chromosoom vormt, bevat naast genen ook veel
degenen waarbij het X-chromosoom dat het gen
replicatieoorsprongen, één centromeer en twee telomeren. Deze speciale DNA-
voor oranje vacht draagt, is geïnactiveerd, zullen
zwarte vacht produceren. De grootte van elke sequenties zorgen ervoor dat elk chromosoom vóór de celdeling efficiënt kan worden
gedupliceerd en dat de resulterende dochterchromosomen gelijkmatig over de twee
pleister zal afhangen van het aantal huidcellen
dat afstamt van een embryonale cel waarin het dochtercellen kunnen worden verdeeld.
ene of het andere X-chromosoom tijdens de
ontwikkeling willekeurig werd geïnactiveerd (zie figuur 5-28). (blauwcaterpillar/Depositphotos.)
• In eukaryote chromosomen wordt het DNA stevig opgevouwen door te binden aan een
reeks histon- en niet-histone-chromosomale eiwitten. Dit complex van DNA en eiwit
wordt chromatine genoemd.
VRAAG 5–4
• Histonen bundelen het DNA in een zich herhalende reeks DNA-eiwitdeeltjes, nucleosomen
Mutaties in een bepaald gen op het X- genaamd, die zich verder opvouwen tot nog compactere chromatinestructuren.
chromosoom resulteren in
kleurenblindheid bij mannen. Daarentegen
• Een cel kan zijn chromatinestructuur reguleren – door bepaalde gebieden van zijn
hebben de meeste vrouwen die de
chromosomen tijdelijk te decondenseren of te condenseren – met behulp van chromatine-
mutatie dragen een goed kleurenzicht,
hermodellerende complexen en enzymen die histonstaarten op verschillende manieren
maar zien ze gekleurde objecten met
covalent modificeren.
een lagere resolutie, alsof functionele
kegelcellen (de fotoreceptorcellen die • Door het loskomen van chromatine tot een meer gedecondenseerde toestand kunnen
verantwoordelijk zijn voor het kleurenzien) eiwitten die betrokken zijn bij genexpressie, DNA-replicatie en DNA-reparatie toegang
verder uit elkaar staan dan normaal in krijgen tot de noodzakelijke DNA-sequenties.
het netvlies. Kunt u een plausibele
• Sommige vormen van chromatine hebben een patroon van histonstaartmodificatie
verklaring geven voor deze
waardoor het DNA zo sterk gecondenseerd raakt dat de genen ervan niet tot expressie
observatie? Als een vrouw kleurenblind
kunnen worden gebracht om RNA te produceren; er vindt een hoge mate van
is, wat kun je dan over haar vader zeggen? Over haar moeder? Uitleggen
condensatie plaats op alle chromosomen tijdens mitose en in het heterochroma-tin
jouw antwoorden.
van interfase-chromosomen.

SLEUTELVOORWAARDEN

basenpaar dubbele helix histon

celcyclus euchromatine histon-modificerend enzym
centromeer karyotype
chromatine genexpressie kern
chromatine-remodellerend complex genetische nucleosoom
chromosoom code replicatie oorsprong
complementair genoom heterochromatine telomeer
deoxyribonucleïnezuur (DNA)