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Esther R
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La santé est un état de bien-être physique, social et mental complet. Une meilleure
santé procure du bonheur et de la joie de vivre. Elle parait alors comme une
nécessité ou une vitalité pour tout être humain. Néanmoins face à des agents
pathogènes externes et internes, il est difficile de la préserver. En cas de défaillance,
de menace de l’intégrité de l’organisme ou encore pour des raisons quelconques,
l’homme se retrouve dans l’obligation de se rapprocher d’un spécialiste dans la
plupart des cas un médecin. Ce dernier du point de vue éthique, aura pour rôle de
répondre au mieux aux exigences du patient. Pour une meilleure prise en charge, il
devra se rapprocher d’un professionnel de santé à savoir le biologiste médical,
spécialisé dans les analyses médicales effectuées sur des éléments issus du corps
humain, le plus souvent des liquides biologiques. Le biologiste médicale exerce au
sein d’un laboratoire d’analyses médicale. Il est titulaire d’une licence, master ou
doctorat en biologie médicale. De ce fait qu’est-ce qu’un laboratoire d’analyses
médicales ? Quelles dont les activités qui y sont liées ? A l’aide des acquis appris en
stage nous tenterons de répondre à ces questions.
I. LE LABORATOIRE ET SON SECTEUR D’ACTIVITE
1. Le laboratoire
Afin d’apporter et de garantir des meilleurs soins de santé ainsi qu’une meilleure prise en
charge des patients, le CHUMEFJE est doté d’un laboratoire de Biologie médicale. Le service
du laboratoire du CHUMEFJE est engagé aujourd’hui dans une démarche de management de
qualité, ayant pour objectif de fournir des analyses médicales qui répondent aux besoins du
patient en fournissant un panel d’examens. Le laboratoire fonctionne 24H/24 afin d’assurer
une continuité dans la prise en charge des patients. Il est doté d’un équipement robotisé,
analytiques modernes et performants. Aussi le service dispose d’une formation de qualité
pour les professionnels de santé et les futurs professionnels, et un cadre de recherche
scientifique. Le laboratoire du centre hospitalier universitaire mère-enfant Jeanne Ebori est
situé à Libreville, au bord de mer après l’ancien Bâtiment du ministère des affaires
étrangères à la monté de louis.
2. Organigramme
Chef de service Laboratoire
Manager du Laboratoire
Biologie référents
3. Historique
C’est dans les années 1970 que l’hôpital Jeanne Ebori, structure de la caisse national et de
sécurité social a été, avec en son sein un laboratoire d’analyses biomédicales utilisant des
moyens restreints et des analyses manuelles. En 2013, il a été détruit pour être reconstruit
en un établissement hospitalier Universitaire plus moderne, pour donner naissance en 2017
au CHUMEFJE composé d’un laboratoire dont la capacité en terme d’analyses médicales
journalières est bien plus importante.
Notre stage se déroule dans le cadre de notre formation de cycle de licence en Biologie
médicale. Le laboratoire du CHUMEFJE a plusieurs missions telles que :
- Accueil
- Enregistrement
- Prélèvement
Phase analytique
2- PRESENTATION DU LABORATOIRE
Les analyses médicales sont réparties comme suit : l’hématologie, biochimie, sérologie,
bactériologie et parasitologie ou j’ai eu l’occasion d’exercer. Pour chaque domaine nous
donnerons le mode de fonctionnement et les techniques utilisées.
Le mode de fonctionnement :
L’hématologie est la science qui étudie le sang et ses maladies (ou hémopathies). Elle étudie
plus particulièrement les cellules sanguines dont l’origine est hématopoïétique (synthèse de
ces cellules dans la moelle osseuse) et qui ont un rôle pour l’oxygénation, l’immunité et la
coagulation, et étudie également certaines molécules plasmatiques que sont les facteurs de
coagulation.
Intérêt : La NFS est utilisée comme test général de dépistage d’anémie, infection, ou
de nombreuses autres maladies.
2- Frottis sanguin
Principe : il s’agit de préparer un étalement mince d’une goutte de sang sur une
lame verre ; après une coloration appropriée le Frottis est observé avec l’objectif à
immersion.
Technique : Il s’agira de mettre une petite quantité de sang soit de 10ul sur la lame
et ensuite tirer avec une autre lame, laisser sécher, pour ensuite colorer au MGG
pendant 3 min, après rincez, colorer 15 min au giemsa et rincez, laisser sécher et lire
au microscope.
3- Réticulocytes
Technique : Pour les compter, le pourcentage des réticulocytes est égal aux
nombres de réticulocytes multiplié par 100 sur le nombre total de globules rouges
multiplié par le nombre de champs. La valeur absolue quant à elle est égale aux
nombre globules rouges multiplié par le pourcentage, divisé par 100. Pour la
réalisation on prend 200ul de sang + 200ul de bleu de crésyl brillant en solution,
homogénéiser et mettre à l’étuve pendant 15 min tirer la lame et lire au microscope.
%Ret = Nt de ret × 100 /nbre T de GR× nbre de champs. |R| = GR × %Ret / 100 .
4- Vitesse de sédimentation
Principe : il s’agit de remplir du sang dans des tubes de diamètre calibré, disposé
verticalement et de laisser reposer le mélange.
5- TP et TCA
Fig
En biochimie
Le corps humain sécrète via les glandes, des hormones ou des substances
contribuant au bien-être du vivant. Mais lorsqu’elles sont en quantité basse ou
élevée par rapport à la moyenne, elles deviennent des pathologies pour l’être
humain. Mais dans certains cas, la présence ou absence de certaines hormones
n’est pas forcément pathologique mais révélatrice d’une situation, par exemple les
betas HCG chez la femme enceinte.
1- Urée, créatinine
Technique : Le sérum est déposé dans la cupule pour ensuite être placé dans le
cobas. Les informations personnelles du patient sont rentrées, on choisit l’examen
demandé, et placer la cupule dans la bonne position. Le cobas c111 (voir en
annexe) est un automate qui permet de réaliser tous les examens de biochimie. Les
examens peuvent se faire à partir du sérum, plasma, urine, sang total.
2- Bilirubine Totale
Technique : Le sérum est déposé dans la cupule pour ensuite être placé dans le
cobas. Les informations personnelles du patient sont rentrées, on choisit l’examen
demandé, et placer la cupule dans la bonne position. Le cobas c111 (voir en
annexe) est un automate qui permet de réaliser tous les examens de biochimie. Les
examens peuvent se faire à partir du sérum, plasma, urine, sang total.
3- Transaminases
Technique : Le sérum est déposé dans la cupule pour ensuite être placé dans le
cobas. Les informations personnelles du patient sont rentrées, on choisit l’examen
demandé, et placer la cupule dans la bonne position. Le cobas c111 (voir en
annexe) est un automate qui permet de réaliser tous les examens de biochimie. Les
examens peuvent se faire à partir du sérum, plasma, urine, sang total.
Technique : Le sérum est déposé dans la cupule pour ensuite être placé dans le
cobas. Les informations personnelles du patient sont rentrées, on choisit l’examen
demandé, et placer la cupule dans la bonne position. Le cobas c111 (voir en
annexe) est un automate qui permet de réaliser tous les examens de biochimie. Les
examens peuvent se faire à partir du sérum, plasma, urine, sang total.
Technique : Le sérum est déposé dans la cupule pour ensuite être placé dans le
cobas. Les informations personnelles du patient sont rentrées, on choisit l’examen
demandé, et placer la cupule dans la bonne position. Le cobas c111 (voir en
annexe) est un automate qui permet de réaliser tous les examens de biochimie. Les
examens peuvent se faire à partir du sérum, plasma, urine, sang total.
6- Glycémie à jeun
Technique : Le sérum est déposé dans la cupule pour ensuite être placé dans le
cobas. Les informations personnelles du patient sont rentrées, on choisit l’examen
demandé, et placer la cupule dans la bonne position. Le cobas c111 (voir en
annexe) est un automate qui permet de réaliser tous les examens de biochimie. Les
examens peuvent se faire à partir du sérum, plasma, urine, sang total.
7- phosphatases alcalines
Technique : Le sérum est déposé dans la cupule pour ensuite être placé dans le
cobas. Les informations personnelles du patient sont rentrées, on choisit l’examen
demandé, et placer la cupule dans la bonne position. Le cobas c111 (voir en
annexe) est un automate qui permet de réaliser tous les examens de biochimie. Les
examens peuvent se faire à partir du sérum, plasma, urine, sang total.
8- Ionogramme
9 - CRP
Technique : Prendre 50ul de sérum sur la plaque de CRP, ajouter une goutte de
CRP latex et bien homogénéiser. En cas de résultats positifs le quantifier comme
suit :
➡
100ul
➡
100ul 100ul
➡ ➡
10 - Béta HCG
Intérêt : Savoir si la patiente est enceinte ou non. Mais également le nombre de mois
de grossesse.
12 -Électrophorèse
Pour la migration :
Pour la coloration :
1. Goutte épaisse
Principe : L’observation au microscope du sang, dont on étale une grosse goutte sur
une lame de verre. Le principe du test rapide utilise le principe de
l’immunochromatographie dans lequel la membrane de nitrocellulose est pré-enduite
d’un anticorps monoclonal (ligne de test Pf) spécifique à la protéine 2 riche en
histidine (Pf-PHRP2) de Plasmodium falciparum et d’un anticorps monoclonal.
Anticorps (lignée test Pan) spécifique du lactate déshydrogénase de l’espèce
Plasmodium (Pan – pLDH). Ainsi, les antigènes de Plasmodium suivants sont
détectés dans ce test : La cassette contient une bandelette de test pré-enduite
d’anticorps de capture. La séquence des événements est la suivante : Histidine
Rich Protein 2 spécifique de P. falciparum ( Pf – HRP2 ) Plasmodium lactate
déshydrogénase commune à toutes les espèces humaines de Plasmodium ( P.
falciparum , P. vivax , P. malariae , P. ovale ) ( Pan – pLDH ).
Technique : Après avoir fait le test rapide en mettant 5ul de sang total+ le diluant.
On réalise une goutte épaisse, elle consiste à mettre 10ul de sang total, et l’étaler
sur la surface d’un rectangle, 1,8 cm de longueur et 1 cm de largeur (méthode de
Lambaréné). Laisser sécher, coloré au giemsa pendant 15 min, rincé, laisser sécher
et aller lire au microscope. Le nombre de trophozoïdes est égal au nombre de
trophozoïdes par champ multiplier par le facteur correcteur soit 770, divisé par le
nombre de champ.
Technique : Tout d’abord : monter le sang entre lame et lamelles, pour la recherche
qualitative. Ensuite : prendre 1 ml de sang total+ 8 ml d’eau
physiologique+ 2 ml de saponine dans un tube pour la centrifugeuse. Qu’on prendra
le culot pour monter entre lame et lamelles.
Source : https://www.google.com/
En Sérologie
La sérologie est un examen de biologie médicale utilisant le sérum pour établir des
diagnostics médicaux. La sérologie consistera à rechercher l’agent pathogène
responsable de la pathologie infectieuse, dans le cas des diagnostics directs, soit à
rechercher la réponse immunitaire spécifique de l’organisme à l’agent pathogène, ce
qui sera un diagnostic indirect.
Principe : Les tests de diagnostic utilisés en sérologie sont pour la plupart les tests
de diagnostic rapide (TDR). Le test de diagnostic rapide est composé d’une
membrane de nitrocellulose fixée sur un support plastique ou carton. Si l’antigène est
présent, il se lie avec un anticorps marqué le plus souvent de l’or colloïdal. Sous
l’effet d’un tampon lyse-migration, les complexes Antigène-anticorps migrent par
capillarité et sont arrêtées par des anticorps de capture fixés sur la membrane.
Le test Élisa est également utilisé en sérologie. Le test d’Élisa consiste à piéger,
entre un « anticorps de capture » et un « anticorps de détection », les antigènes
d'intérêt. Ces deux anticorps sont généralement spécifiques de l'antigène d'intérêt
(parfois l'anticorps secondaire réagit aux complexes antigène-anticorps).
Le Mini vidas est un automate de paillasse utilisé pour quantifier les hormones,
évaluer l’évolution de la maladie chez le patient. Le principe du minis vidas repose
sur la technique ELFA (méthode Élisa avec une lecture finale en fluorescence) et
permet l’obtention de résultats quantitatifs.
1. Widal et Félix
Principe : Les antigènes fébriles sont adaptés aux tests rapides sur lame et aux
méthodes d’agglutination en tube sur sérum humain pour la détection des agglutines.
Les suspensions d’antigènes réalisées à partir de bactéries détruites et colorées,
créent une agglutination avec les anticorps homologues présents en quantité
suffisante dans l’échantillon. Les antigènes colorés en bleu sont spécifiques des
antigènes somatiques de paroi cellulaire (O) alors que les antigènes colorés en
rouge sont spécifiques des antigènes flagellaires (H).
2. Antigène HBS
3. Hépatite C
4. SRV 1 et 2
Technique : Mettre 50ul de sang total sur la cassette, ensuite mettre le diluant et
attendre 15 min, ou prendre 50ul de sérum ou plasma et mettre sur le test sans
diluant attendre 15min. Pour le diagnostic du HIV on n’utilise 2 tests rapides
différents et un 3ème test, test d’ÉLISA pour la confirmation.
5. Syphilis
Principe : Le test Wondfo One Step Syphilis Whole Blood, Sérum ou Plasma est
basé sur le principe de l'immunochromatographie dosage sandwich à double
antigène pour la détermination des anticorps TP dans le sang total sérum ou plasma.
Les antigènes recombinants TPN15, TpN17 et TPN47 sont déposés sur la
membrane solide. Il y a deux lignes enduites dans la fenêtre de résultat. L’une est
la ligne de test (T), recouverte d’antigènes recombinants, l’autre est la ligne de
contrôle ©, recouverte d’anticorps polyclonaux. Lorsque l’échantillon est ajouté dans
le dispositif de test, l’échantillon est absorbé dans le dispositif par action capillaire,
puis se mélange avec le conjugué antigène-colorant et s’écoule à travers la
membrane pré-enduite. Lorsque les niveaux d’anticorps TP dans l’échantillon sont
égaux ou supérieurs au seuil cible (la limite de détection du test), les anticorps TP se
lient au conjugué antigène-colorant et sont capturés par des antigènes recombinants
immobilisés dans la région de test (T) du dispositif et forme des précipités Ag-Ab-Ag-
Au. Cela produit une bande de test colorée et indique un résultat positif. Lorsque les
niveaux d’anticorps TP dans l’échantillon sont nuls ou inférieurs au seuil cible, il n’y a
pas de bande colorée visible dans la région de test (T) de l’appareil, et cela indique
un résultat négatif. Pour servir de contrôle de procédure, une ligne colorée apparaîtra
au niveau de la région de contrôle ©, si le test a été effectué correctement.
En Bactériologie
Mode de fonctionnement
La particularité de la bactériologie, est que 2 des examens sont faits par des
patients externes à savoir l’examen cytobactériologique des urines et le
prélèvement vaginal. Ces examens se font sous rendez-vous, le lundi et mardi pour
le PV et de lundi à mercredi pour l’ECBU. Le patient arrive à l’accueil et se fait
enregistré, on lui remet une fiche dans le cas de l’ECBU qu’il doit copieusement lire
et mettre en pratique. En cas de non-respect des conditions le patient est renvoyé le
jour du prélèvement. Une fois les échantillons arrivés dans la salle de microbiologie,
ils sont enregistrés dans le registre à la partie correspondante à l’examen, après, ils
sont examinés pendant plusieurs jours. Les résultats sont rendus généralement une
semaine après le prélèvement. Ils sont déposés à l’accueil où les patients viendront
les récupérer. Pour les patients hospitalisés, il peut y avoir ces examens, mais
d’autres également comme le LCR. Une fois arrivé, sont enregistrés dans le registre,
à la partie indiquée à l’examen, après leur réalisation, ils sont rangés dans la
chemise du service correspondant et signaler dans le registre des entrées.
Le patient doit respecter les conditions : pas de rapports sexuels avant 3 jours, pas
de prise d'antibiotiques, l’urine doit séjourner 4heures minimum dans la vessie, la
femme ne doit pas être en période mensuelle, doit faire sa toilette intime. Le
prélèvement doit venir au laboratoire au plus tard 2 heures après avoir effectué. Et
doit être fait dans un flacon stérile.
Passe analytique :
2- PV
Principe :consiste à introduire un écouvillon au niveau du vagin pour y prélever un
peu de sécrétions vaginales qui seront ensuite analysées pour détecter la présence
ou non de bactéries et/ou virus.
4- LCR
Si le LCR est très trouble ou contient des hématies, le centrifuger pendant 5 minutes
à 350 g et recueillir le Surnageant. Chauffer tous les échantillons de LCR pendant 3
minutes à 100°C. S’assurer que la température des échantillons soit revenue à
température ambiante (18-25°C), puis centrifuger pendant 5 minutes à 3 000 g.
Le test Pastorex™ Strep est un test d’agglutination rapide pour le groupage des
streptocoques selon la classification de Lancefield. Le test comporte des
suspensions de latex spécifiques permettant d’identifier les groupes A, B, C, D, F et
G. L’identification des antigènes spécifiques de groupe par des antisérums
homologues nécessite une extraction enzymatique préalable. L’identification des
streptocoques repose sur la nature de l’hémolyse autour des colonies isolées sur
gélose Columbia au Sang (ß) et sur la détection des antigènes polyosidiques
présents dans la paroi cellulaire et spécifiques du groupe Streptococcique
(classification de Lancefield [1]). Selon cette classification de Lancefield, les
principaux sérogroupes sont A, B, C, D, F, G.
7- Coproculture
Principe : Cet examen consiste à cultiver sur des milieux sélectifs les matières
fécales, afin d'isoler des germes pathogènes, responsables de diarrhées
infectieuses.
Milieu sélectif, pour les entérobactéries, inhibe la croissance des bactéries à gram
positifs pour ne laisser pousser que les bactéries à gram négatifs. En cas de pousse
nous procédons à l'identification des bactéries par l’ Api 10s, Api 20e et anti G- pour
l’antibiogramme.
Est une gélose au sang frais sélectif pour les bactéries à gram négatif. En cas de
pousse, on fait le gram. Si ce sont des BG+ on n’écarte parce qu’ils font parties de la
flore vaginale pour le cas du PV. Si ce sont les CG +on fait la catalase. Si elle est
positive on n’oriente vers les mycococacae. On fait l'oxydase, si c’est positif ce sont
les mycococacaes et négative les staphylocoques dans ce cas Api staph pour
l'identification et ATB staph pour l’antibiogramme. Par contre si la catalase est
négative on s'oriente vers les streptocoques on fait l'identification par Api strep et
l'antibiogramme par ATB strep.
Uriline
Dispose de 2 milieux cled et Mac conkey. Le cled milieu non sélectif permet la
détermination du nombre total de bactéries présentes dans l’urine. Il permet
également de différencier les germes fermentant le lactose des germes non
fermentatifs. Sa faible teneur en électrolytes a pour objectif de limiter
l’envahissement de la surface du milieu par les Proteus. Néanmoins les cultures de
Vocabulaire
Source :https://www.google.com/search?q=crp+realisation+
Pour faire la mise au point : à l'examen direct on utilise l’objectif 10 et 40. Avec
l'objectif 10 on explore une plus grande distance, on n'utilise la vis macrometrique
pour trouver l’échantillon. On cherche et on repère, avec la vis micrométrique on
rend l'image plus nette et on met la lumière à 10. Avec l'objectif 40 on balaie une plus
petite distance, on n'apprécie la forme, la taille, aspect.
Figure 5 : microscope optique
Source : https://www.google.com/imgres?imgurl=https%3A%2F%2Fmairie- 3A%2F
%2Fmairie-
Prendre la lame, stériliser mettre de l'eau physiologique (pour que le germe reste
viable), mettre la colonie et ensuite mettre la lamelle.
Décolorant
Colorant
Mettre l'oxydase sur du papier paillasse ensuite, mettre le germe et bien frotter.
L'effet est instantané, si la couleur est bleue c'est positif et si ce n’est pas le cas c'est
négatif.
Prendre la lame, stériliser mettre une goutte de catalase, prendre le germe avec la
pipette pasteur, et tapoter, si ça mousse, c’est que c’est positive le cas contraire c’est
négative.
Cellules de Kova
Mettre l'urine dans une cellule jusqu'à remplir et ensuite faire la mise en point.
Bandelettes urinaires
On trompe la bandelette urinaire dans l’urine, attendre une minute. Lire les résultats
en fonction de la couleur sur la boîte des bandelettes.
Blastèses
III- Description des stages exécutées pour le rapport de stage les rapports et
les apports du stage.
Parmi les tâches que nous avons effectuées il y’avait le groupage des streptocoques
réalisé en bactériologie.
Mode opératoire :
1. Réaction positive
Une réaction positive est indiquée par des agglutinats rouges sur fond vert visibles à
l’œil nu. L’intensité et la vitesse d'apparition des agglutinats dépendent de la souche
testée. Seule une agglutination franche et rapide avec une seule des six suspensions
de latex permet d’identifier le groupe de la souche testée.
2. Réaction négative
Les résultats sont validés grâce aux contrôles positifs et négatifs. Et sont présentés
sous forme de littérature exemple : infection à streptocoques de souche A.
Limites du test :
f) Le diagnostic final, comme tous les diagnostics de laboratoire, ne peut pas être
basé sur les résultats d’un seul test, mais sur l’ensemble des données cliniques et
des résultats biochimiques, cytologiques et immunologiques.
Apport de stage
Notions acquises
Bénéfices
Au sortir de ce stage, ma vision à énormément changé que ce soit dans le domaine
professionnel que personnel. J’ai maintenant une notion plus large en ce qui
concerne le métier du biologiste. J’ai pu mettre en pratique mes enseignements
théoriques et je suis dorénavant plus apte à exercer dans un laboratoire d’analyses
médicales. De ce stage, de nouveaux objectifs sont nés ainsi que de nouvelles
inspirations.
Contraintes du stage
Le temps nous a manqué pour approfondir les notions, je n’ai pu faire qu’une
semaine sur certaines paillasses. Sans compter que dans une des paillasses, il
y’avait un manque de réactifs, ce qui fait qu’en biochimie, je n’ai pratiquement pas pu
travailler.
Conclusion
Toute une équipe est mise en place pour la prise en charge optimal du patient à
savoir le médecin, biologiste, pharmacien, infirmière, sage-femme. Le biologiste
contrôle des données biologiques (taux de sucre, de cholestérol, numération
globulaire...), ou dépiste des virus ou des bactéries via des prélèvements (sang,
urine, tissus...). La rigueur et une bonne organisation est nécessaire au sein du
laboratoire dans lequel il travaille, et est organisé en plusieurs unités à savoir
l’hématologie, biochimie, sérologie, parasitologie, bactériologie, anatomopathologie.
Ces activités sont accentuées autour de trois grands axes, à savoir la phase pré
analytique, phase analytique et post analytique. La phase pré analytique consiste à
l’enregistrement, prélèvement, une phase non négligeable dans la suite des
évènements. Car la qualité et la fiabilité des résultats dépendent en grande partie de
la phase analytique. Quant à la phase analytique, elle consiste à l’analyse des
échantillons recueillies à la phase pré analytique pour la bactériologie on n’a
l’isolement, l’identification et l’antibiogramme, biochimie les dosages, hématologie les
descriptions, sérologie basé de façon générale sur les tests immunochromatographie
et Élisa, enfin la parasitologie consiste à l’identification du parasite et sa
quantification. Pour terminer la phase post analytique, dernière phase dédiée aux
rendus et à l’interprétation des résultats. Les techniques utilisées présentent de
multiples avantages, moins coûteux, plus fiables, plus simple et plus rapide tout
ceux-ci permet au biologiste d’être performant, néanmoins ces techniques présentent
certaines inconvénients comme le risque d’infection, souvent très longue mettant en
danger le pronostic vital. Le métier du biologiste est très intéressant, passionnant et
important elle concoure au bien-être du patient autant que le médecin.
REFERENCES
ANNEXES