Obecná

genetika
 Co je genetika?

Objev principů dědičnosti - 3 hlavní směry

1. Cytologická pozorování
2. Matematické modelování
3. Výzkum DNA
Základní pojmy
obecné genetiky
 Základní pojmy obecné genetiky
Gen
- základní jednotka dědičnosti předávaná z generace na generaci
 Základní pojmy obecné genetiky

Vývoj obsahu pojmu gen

- pro každý znak existuje samostatný faktor (Mendel)

- název gen = jednotka pro analýzu, ne hmotná částice (Bateson)

- genetická informace dána sekvencí nukleotidů (J.D.Waston, F.Crick)

- hypotéza 1 gen - 1 enzym (Beadle, Tatum)

- hypotéza 1 gen - 1 protein (Pauling a spol.)

 Základní pojmy obecné genetiky

Vývoj obsahu pojmu gen

- dnes ne konkrétní definice

gen obsahuje kódující i regulační sekvence (v eukaryotických

genech obsaženy introny, geny uvnitř genů, alternativní sestřih
jeden funkční protein může kódovat i více genů atd.)
 Základní pojmy obecné genetiky

Genová terminologie

- původně (Mendel) A/a, B/b

- podle mutantního fenotypu (Bateson) W/w (white)
- více písmen:
a) podle znaku Bw/ bw (brown)
b) podle produktu (proteinu) PAL (phenylalanin amoniak lyasa)
dnes nejběžnější značení
- různé geny - jeden fenotyp Sh1,Sh2.. (číslicí)

Geny psány kurzívou PAL, proteiny normálním písmem PAL

(převážně)
 Základní pojmy obecné genetiky
Gen
- základní jednotka dědičnosti předávaná z generace na generaci

Alela
- určitá forma genu
 Základní pojmy obecné genetiky

Alela
- určitá konkrétní forma genu
- jedna (vzácně)
- dvě: C/c černá - standardní (semena cibule)
 Základní pojmy obecné genetiky

Alela
- určitá konkrétní forma genu
- jedna (vzácně)
- dvě: Cu (curl) - dominantní alela
 Základní pojmy obecné genetiky

Alela
- určitá konkrétní forma genu
- jedna (vzácně)
- dvě: polydaktylie - dominantní alela
 Základní pojmy obecné genetiky

Alela
- určitá konkrétní forma genu
- jedna (vzácně)
- dvě: černé zbarvení jaguára - dominantní alela
 Základní pojmy obecné genetiky

Alela

- určitá konkrétní forma genu

- jedna (vzácně)
- dvě
- více - alelická série
 Základní pojmy obecné genetiky

Alela

- více - alelická série

 Základní pojmy obecné genetiky

Alela

- více - alelická série

 Základní pojmy obecné genetiky

Terminologie

Alely

- DOMINANTNÍ / recesivní - A/a, +/a, PAL/pal, a+/a

- standardní / mutovaná - A/a, +/a

- více alel jednoho genu:

a) indexy IA, IB, IO, w, wa,wbf
b) čísla za pomlčkou Sh2-6081
 Základní pojmy obecné genetiky
Gen
- základní jednotka dědičnosti předávaná z generace na generaci

Alela
- určitá forma genu

Genotyp
- soubor všech alel jedince

Haplotyp
- soubor alel na jednom chromozomu

Fenotyp
- vyjádření genotypu ve vlastnostech jedince
 Základní pojmy obecné genetiky
Lokus
- místo lokalizace genu na DNA (chromozomu)
 Základní pojmy obecné genetiky
Lokus
- místo lokalizace genu na DNA (chromozomu)
 Základní pojmy obecné genetiky
Lokus
- místo lokalizace genu na chromozomu

Znak
- určitá forma projevu genotypu ve fenotypu (vlastnost jedince)
 Základní pojmy obecné genetiky
Znak

- určitá forma projevu genotypu ve fenotypu

(děděná vlastnost jedince)
 Základní pojmy obecné genetiky
Znak

- určitá forma projevu genotypu

ve fenotypu
(děděná vlastnost jedince)
 Základní pojmy obecné genetiky
Znak

- určitá forma projevu genotypu ve fenotypu

(děděná vlastnost jedince)
 Základní pojmy obecné genetiky
Lokus
- místo lokalizace genu na chromozomu

Znak
- určitá forma projevu genotypu ve fenotypu (vlastnost jedince)

Homozygot
- diploidní jedinec nesoucí dvě stejné alely téhož genu

Heterozygot
- diploidní jedinec nesoucí dvě různé alely téhož genu

Genom
- soubor celkové genetické informace organizmu
(celková sekvence NA daného organizmu)
 Základní pojmy obecné genetiky
Genom

- dynamičnost genomu
- skupiny v populaci (odrůdy…), jedinci (přestavby,
mutace…), buňky (transponovatelné elementy, viry…)

- struktura a velikost
- prokaryota - kružnicová DNA, plastidy

- eukaryota - lineární jaderná DNA x mimojaderná

(mitochondrie, chloroplasty, plazmidy)
- menší genová denzita
- více repetitivních a regulačních sekvencí
 Základní pojmy obecné genetiky
Genom
- menší genová denzita eukaryotního genomu
 Základní pojmy obecné genetiky
Genom - struktura a velikost
- repetitivní sekvence u eukaryot

Vysoce repetitivní : více jak 100 tisíc kopií

Středně repetitivní: 10 - 100 tisíc kopií

Funkce repetitivních sekvencí:

- tvorba struktury a organizace chromozomu

- účastní se při párování chromozomů v meioze
- ochrana chromozomu před degradací
- ochrana důležitých genů
- účast při crossing-overu během rekombinací
- evoluční význam - uchování sekvencí
- některé sekvence bez známého významu
 Základní pojmy obecné genetiky
Genom

- struktura a velikost

- eukaryota:
lineární jaderná DNA

c - hodnota (obsah DNA v haploidním stavu)

paradox c - hodnoty (nekoreluje s počtem genů)

 Základní pojmy obecné genetiky
Genom
- srovnání c - hodnoty u různých organizmů
 Základní pojmy obecné genetiky
Genom
velikost genomu a počet genů u vybraných eukaryot
paradox c - hodnoty

velikost počet
organizmus genomu (Mb) genů

(kvasinka)

(huseníček)
(octomilka)
(rýže)
! (kukuřice)
(člověk)
! (ječmen)
 Základní pojmy obecné genetiky
Genom

!
 Obecná
(mendelistická)
genetika
 Mendelizmus
Historie - před Mendelem
- většinou křížili rostliny

homogenita F1 generace
identita reciprokých křížení
nehomogenita F2 generace
- Carl Friedrich von Gärtner (1772 - 1850)
- Charles Naudin (1815 - 1899)

intermedialita F1 generace
- Max Ernest Wichura (1817 - 1866)
 Mendelizmus
Johann Gregor Mendel (20.7.1822 - 6.1.1884)
profesor (bez zkoušek),
opat augustiniánského kláštera v Brně
zájmy: biologie, matematika

- modelová rostlina - hrách

používal čisté linie - vznik samoopylením

(znak se po mnoho generací nemění)

sledoval vždy jen jeden (málo) znaků najednou

psal přesné numerické záznamy !

 Mendelizmus
Johann Gregor Mendel
- 1866 - publikace výsledků
Versuche über Pflanzen-Hybriden,
sborník Brněnské společnosti pro historii přírody
- jeho objevy zapomenuty
- 1881 - citace v přehledu o křížení rostlin
Wilhelm Olbers Focke
-1900 - ke stejným výsledkům dospěli
Hugo de Vries, Carl Correns,
Erich von Tschermak-Seysenneg
- William Bateson (1861 - 1926)
- pojmy gen, genetika, zygota,
homozygot, heterozygot, alela
- platí i u zvířat
 Mendelizmus
Jaké znaky studoval?

- barva květu a osemení

fialová x bílá
šedá x bílá
- semena
zelená x žlutá
hladká x svraskalá
- barva lusku
zelená x žlutá
- tvar lusku
hladký x zprohýbaný
- výška rostliny
vysoká x nízká
- květenství
postranní x vrcholové
 Mendelizmus
Monohybridní křížení

P - rodičovská (parentální)
generace
F1 - 1. dceřiná (filiální)
generace
Kříženci F1 generace jsou vždy
stejní, mají fenotyp jako jeden
z rodičů
Princip identity reciprokých
křížení a uniformity F1 generace
dominantní alela
recesivní alela
 Mendelizmus
Segregace vloh
Rodiče vytvářejí haploidní gamety, které se rozcházejí nezávisle na sobě
 Mendelizmus
Segregace vloh
Rodiče vytvářejí haploidní gamety, které se rozcházejí nezávisle na sobě

kombinační
čtverec
 Mendelizmus
Monohybridní křížení
- ve 2. dceřiné generaci (F2)
se objevují oba rodičovské znaky

- Princip segregace vloh

- homozygot, heterozygot
- dominantní, recesivní alely
Mendelizmus
Výsledky křížení
 Mendelizmus

Výsledky křížení - ověření hypotézy

- výsledky křížení - přibližně 3 : 1

- nutno statisticky ověřit - χ2 test
- test, kterým ověřujeme, zda naše hypotéza s předem
zadanou pravděpodobností odpovídá experimentálním
datům

- χ2 Σ (e - t)2
DF = t
e = empirická četnost, t = teoretická četnost, DF = stupně volnosti
 Mendelizmus
Výsledky křížení - ověření hypotézy
 Mendelizmus
Dihybridní křížení
Současně se sledují dva znaky
současně se sledují dva znaky

- F1 generace - heterozygoti
- F2 generace - štěpení
- geny štěpí nezávisle na sobě

- Princip nezávislé
kombinovatelnosti alel
 Mendelizmus
Dihybridní křížení
Současně se sledují dva znaky
 Mendelizmus
Dihybridní křížení
Úhlopříčka homozygotů
 Mendelizmus
Dihybridní křížení
Úhlopříčka heterozygotů
 Mendelizmus
Dihybridní křížení
Rozvětvovací metoda
 Mendelizmus
Trihybridní křížení

Rozvětvovací metoda
 Mendelizmus
Trihybridní křížení

Rozvětvovací metoda
- určení fenotypů i genotypů
- snadné vyčíslení
- možno jakékoli množství genů
 Mendelizmus
Kolik bude fenotypů v F2 generaci?
 Mendelizmus
Testovací zpětné (analytické) křížení
 Mendelizmus
Testovací zpětné (analytické) křížení

Křížení heterozygota
s recesivním homozygotem

Yy x yy → 1 Yy : 1 yy
 Mendelizmus
Mendelovy závěry:

- pro každý znak je přítomen právě jeden gen (faktor)

- gen se předává z generace na generaci
- potomek získá od každého z rodičů vždy právě jednu alelu (formu)
genu, celkem má dvě, je diploidní
- možné kombinace jsou: AA, 2 x Aa, aa (homozygoti a heterozygoti)
- dominantní a recesivní alela,
recesivní se projeví jen v nepřítomnosti dominantní
- pohlavní buňky jsou haploidní
- rozchod alel do pohlavních buněk je náhodný
- první dceřiná generace má fenotyp shodný s rodičem
nesoucím dominantní alelu
- ve druhé dceřiné generaci každý pár alel štěpí v poměru 3 : 1
- každý pár alel se rozchází nezávisle na ostatních
 Mendelizmus
Mendelovy zákony:

1. Mendelův zákon - zákon o identitě reciprokých křížení a

o uniformitě F1generace
křížení 2 homozygotů - potomci genotypově i fenotypově jednotní.
potomek získá od každého z rodičů vždy právě jednu alelu (formu)

- 2. Mendelův zákon - zákon o náhodné segregaci alel genů do gamet.

křížení 2 heterozygotů - potomkovi předána každá ze dvou alel se stejnou
pravděpodobností
genotypové i fenotypové štěpení - segregace.
genotypový štěpný poměr - 1:2:1, fenotypový štěpný poměr - 3:1

- 3. Mendelův zákon - zákon o nezávislé kombinovatelnosti alel.

alely dvou genů - 4 různé typy gamet (AB, Ab, aB, ab).
9 různých genotypů (poměr 1:2:1:2:4:2:1:2:1).
4 možné fenotypové projevy - 9:3:3:1.
 Mendelizmus
Interalelické interakce
vztahy mezi alelami jednoho genu
- neúplná dominance
- intermedialita, bez dominance
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
Neúplná dominance
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

Recesivní alely
- často ztráta funkce (nulová mutace)
- snížená (zbytková) funkce
- projeví se u homozygotů
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

Recesivní alely
- často ztráta funkce (nulová mutace)
- snížená (zbytková) funkce
- projeví se u homozygotů
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
Dominantní alely
- u heterozygota se projeví
mutantní fenotyp
- často nová funkce
(zisková mutace)
- někdy exprese tam,
kde nebyla (místo, čas)
- někdy ztáta funkce genu
(u esenciálních se neudrží)
- někdy odstranění či inhibice
standardní alely
rex
(negativní dominantní mutace )
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
Superdominance
- kříženec převyšuje oba rodiče
- hybridní zdatnost - heteroze
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

Letální alely
- recesivní letální alely
- esenciální gen
- recesivní homozygoti
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
Letální alely
recesivní letální alely Tt-manx-tailless
- činčily - barva srsti (velvet, Wilsonova bílá)
- manx alela u potkana
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

Letální alely
recesivní letální alely Tt-manx-tailless
- Manské kočky
- heterozygot - zkrácený ocas
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

Letální alely
- dominantní letální alely
- esenciální gen
- často opožděná penetrace
(Huntingtonova choroba - 40 let)
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

Teplotně senzitivní alely

- vliv prostředí
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

Nutriční mutace
- neschopnost metabolizovat některé látky
- k přežití nutno dodávat
- vliv prostředí
- často mikroorganizmy
- fenylketonurie
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

Penetrance alel
- frekvence projevu dané alely
- úplná x neúplná
- často časově posunutý projev
- často i vatiabilní expresivita
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

Expresivita
- stupeň projevu alely ve znaku
- variabilní x konstantní
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

Expresivita
- stupeň projevu alely ve znaku
- variabilní x konstantní
- závisí na
a) genotypu (modifikace, vliv dalších genů)
b) prostředí (výživa, stresy,..)

- často i neúplná penetrance

 Mendelizmus
Intraalelické interakce

Penetrance a expresivita genů

Variabilní penetrance

Variabilní expresivita

Variabilní penetrance a expresivita

 Mendelizmus
Intraalelické interakce

Penetrance a expresivita genů

 Mendelizmus
Intraalelické interakce

kodominance
- krevní skupiny
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

různé úrovně pohledu (alely HbA, HbS)

- úplná dominance (hemofilie) HbA
- úplná dominance (odolnost k malárii) HbS
- neúplná dominance (tvar erytrocytů)
- kodominance (hemoglobin)
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

alelická série
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
alelická série (příklady)
- amorfní alely
- hypomorfní alely
- kresba na listu
- zbarvení koček gen B/b BB
černé
čokoládová bb
skořicová

blbl
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
alelická série (příklady)
alely genu c u králíka a jejich kombinace c+ › cch - ch › c

albín standardní

himalájský světlá činčila

neúplná dominance

světlá činčila s černými

činčila koncovými částmi
kodominance

standardní himalájský
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
alelická série (příklady)
alely genu c u králíka a jejich kombinace

albín standardní

himalájský

světlá činčila s černými

koncovými částmi

činčila
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

alelická série (příklady)

 Mendelizmus
Intraalelické interakce

test na alelizmus
- křížení mutant mezi sebou
F1 generace
- mutantní = alelická série
- standardní = 2 geny
F2 generace
- 3 : 1 (1:2:1) = alelická série
- 9:3:3:1 (nebo odvozené) = 2 geny
 Mendelizmus
Intraalelické interakce

test na alelizmus
- cis trans test
- pouze recesivní mutace
- potomci - recesivní fenotyp
mutace ve stejném genu (cis)

- potomci - standardní fenotyp

2 různé geny (trans)
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
Pleiotropie - jeden gen - více znaků
- hemoglobin a/s
- tvar buněk
- blokují vlásečnice - omezují průtok krve
- ucpávání cév vedoucích do orgánů - oběhová příhoda
- často poškození orgánů
- až k místnímu rozpadu kostí, plic a jater.
- rozpad sleziny
- selhávání kostní dřeně a oběhu.
- červené krvinky se zkrácenou délkou života
- akutní zhoršení základní anémie - bledost a únava
- vzácně se objevuje akutní, bolestivé zvětšení sleziny
a náhlé snížení hladiny hemoglobinu.
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
Pleiotropie
Jeden gen - více znaků
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
Pleiotropie
Jeden gen - více znaků
- letalita, v heterozygotním stavu jiný znak
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
Genokopie
Jeden znak - více genů

- mnoho chorob u člověka hluchota,

poruchy vidění...
- často ztrátové mutace přerušení
biosyntetické dráhy na více
místech
- potomci zdraví
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
Genokopie
Jeden znak - více genů

- rexovitost u koček
- mohou způsobit
recesivní i dominantní mutace
- potomci u recesivních mutací
standardní
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
Genokopie
Jeden znak - více genů
 Mendelizmus
Intraalelické interakce
Fenokopie
Vnějšími vlivy utvářený znak (nedědičně), který vypadá jak dědičný
- odbarvená blondýna
- získaná hluchota
- rozštěp rtu plodu (kortizon)

způsobují:
- chemikálie (drogy, alkohol
léky, ropné látky, prostředí..)
- záření a) evropská forma

- stresy (teplota, chlad, nemoc) b) teplotní šok

c) sardinská forma