Konsep Dasar Biologi Sel & Molekuler:

DNA -> GEN -> Kromosom

D r . r e r . n a t . K a r t i k a S e n j ar i n i

INDONESIAN-GERMAN-NETWORK
for TEACHING, TRAINING & RESEARCH
COLLABORATIONS
Molecular Biology → the study
of gene structure and function at
the molecular level.

Reference: Textbooks
Molecular Biology, Weaver, 5thedition-2012, Molecular
Biology of The Cell, Bruce Alberts, 6thedition-2015

Kartika Senjarini – BioMol S1

Classic Genetics

they do not tell us what genes

are made of or how they work??

MOLECULAR GENETICS

Kartika Senjarini – BioMol S1

“Classic” Genetic Molecular Genetic

Fenotip → Gen DNA (Gen) → Protein

(Fenotip)

Berikut ini yang ingin kita eksplorasi:

Bagaimana pengaturannya sehingga gen itu bisa

diturunkan dan diekspresikan dalam bentuk karakter?
Bagaimana gen itu bisa dikombinasikan sehingga bisa
menghasilkan sesuatu (fenotip) yang baru?
 Molecular Genetics
The chemistry of genes began in T übingen, Germany, in 1869. Friedrich Miescher
→ isolated nuclei from pus cells (white blood cells) in waste surgical bandages. He
found that these nuclei contained a novel phosphorus-bearing substance that he
named nuclein. Nuclein is mostly chromatin, which is a complex of
deoxyribonucleic acid (DNA) and chromosomal proteins.

Kartika Senjarini – BioMol S1

Molecular Genetics

Kartika Senjarini – BioMol S1

CENTAL DOGMA OF GENETICS

Kartika Senjarini – BioMol S1

HOW ARE TRAITS PASSED ON AND
HOW ARE THEY CONNECTED TO DNA?
 Who does control these characteristics??

GEN

DNA (Deoxyribo nucleic Acid)

DNA adalah molekul asam nukleat yang mengandung instruksi genetik
(genetic codes) yang digunakan untuk perkembangan dan fungsi pada
semua MH
Ekspresi Gen =
penterjemahan
kode genetik
Ekspresi gen =
penterjemahan gen
(sekuen DNA)
menjadi molekul
yang berfungsi
secara fisik dan
biologis
menghasilkan
produk gen berupa
RNA atau protein
 Ekspresi Gen = penterjemahan kode genetik

 Sebagian non coding region: diterjemahkan menjadi

t-RNA dan r-RNA, tanpa ditranslasi
 Coding region melalui Sintesa Protein
1. Transkripsi
2. Translasi
Sekuen Nukleotida → Sekuen Asam Amino → Protein

UUU UCA CGA AGU GGG ACC

 Genom
 Genom: sekuen komplet dari nuklear DNA (coding dan
non-coding region dalam satu set kromosom) maupun
organel DNA pada organisme atau virus
 Example: The Human Genome is Like a Book: • The book is
over one billion words long. • The book is bound in a
5,000,300 page volume (the equivalent to 800 x Al-Qur’an)
• The book fits into a cell nucleus the size of a pinpoint • A
copy of the book (all 5000 volumes) is contained in every
cell (except red blood cells, sperms and eggs_ as a strand of
DNA over two miles in length. • The book can read itself
(translation) and copy itself (replication)
Genom
Kromosom dan Gen
GEN EUKARIOT

G = Guanine
C = Cytosin
A = Adenine
T = Tymine
JUMLAH KROMOSOM ORGANISME
Species Jml Species Jml
Common fruit fly 8 Guinea Pig[29] 64
Dove[citation needed] 16 Garden snail[30] 54
Earthworm Octodrilus complanatus[31] 36 Tibetan fox 36
Domestic cat[32] 38 Domestic pig 38
Lab mouse 40 Lab rat 42
Rabbit[citation needed] 44 Syrian hamster 44
Hare[citation needed] 46 Human[33] 46
Gorillas, Chimpanzees[33] 48 Domestic sheep 54
Elephants[34] 56 Cow 60
Donkey 62 Horse 64
Dog[35] 78 Kingfisher[36] 132
Goldfish[37] 100-104 Silkworm[38] 56
 Genetika itu penting dipelajari karena

 Untuk menentukan fungsi fisiologis organisme pada

ilmu Fisiologi
 Untuk menentukan derajat kekerabatan pada ilmu
Sistematik
 Untuk menentukan diversitas dan arus gen pada
ilmu Ekologi
 Untuk menentukan hubungan gen dan karakter yang
dikendalikan pada ilmu Etologi
 Biologi molekuler merupakan dasar bagi
perkembangan ilmu Nano-bioteknologi dst
 Milestone perkembangan Genetika

 1860 Hukum Mendel

 1940 Beadle und Tatum „hipotesis dari 1 Gen ke 1 Enzym“Hypothese„
 1944 Avery: DNA adalah materi genetik
 1953 Watson und Crick: struktur DNA Doublehelix
 1961-1966 Nierenberg, Ochoa, Kunci Khorana untuk kode genetik
 1973 Perkembangan Teknologi DNA Rekombinan (Cohen & Boyer)
 1975 Asilomar Conference, Pengaturan tentang Perlindungan terhadap
bahaya karena adanya pemanfaatan dan rekombinasi asam nukleat in
vitro
 1976 Maxam& Gilbert, Perkembangan metode untuk mensekuensing
DNA
 1978 Insulin sebagai produk protein rekombinan pertama yang
dihasilkan oleh Genentech
 1985 Mencit transgenik yang pertama (Brinster& Palmiter)
 1989 Percobaan pertama transfer gen pada manusia
 1992 terapi gen pertama pada manusia (in vivo)
 1995 Genom lengkap ragi telah berhasil dipetakan
 2001 Pemetaan Genom lengkap manusia telah selesai
Asam Nukleat: Molekul Dasar Penyusun Informasi Genetik

Asam Nukleat:
RNA (Ribo Nucleic Acid)
DNA (Deoxyribo Nucleic Acid)

cari perbedaannya di pengetahuan sebelumnya

STRUKTUR DASAR ASAM NUKLEAT
STRUKTUR DASAR ASAM NUKLEAT

Ikatan
Fosfodiester
STRUKTUR DASAR ASAM NUKLEAT

Ikatan
Fosfodiester
STRUKTUR DASAR ASAM NUKLEAT
Basa-basa DNA dan RNA

Basa Purin

Basa Pirimidin
Basa Nukleotida Purin
Basa Nukleotida Pirimidin
 MODIFIKASI
BASA
NUKLEOTIDA

DEAMINASI

Adenosin deaminase men-deaminasi Adenin menjadi

Hypoxanthin (Inosin). Inosin kemudian akan dibaca
seperti Guanosin (Mutasi)
 MODIFIKASI
BASA
NUKLEOTIDA

METILASI

Lihat pada basa ke 5

Methyltransferase memetilasi Cytosin menjadi 5-

methyl-Cytosin. Berakibat pada restriksi enzim di
prokariota, dan pada packing DNA (Chromatin) pada
eukariota
 DNA terdiri dari 2 rantai antiparalel, yang
membentuk rantai doublehelix dengan
orientasi yang satunya dari kanan ke kiri
(„kiri“ didefinisikan sebagai ujung 5‘-
Phosphat, „kanan“ sebagai ujung 3‘ OH)

 Komplementer dari kedua rantai yang

ditunjukkan oleh struktur yang disusun oleh
Watson & Crick memungkinkan terjadinya
teori replikasi DNA
Beberapa macam RNA
Ribosomal RNA ( rRNA), bagian integral dari
ribosom dan jumlahnya 80% dari total RNA
Transfer RNA (tRNA), pembawa asam amino
dalam proses sintesis protein
Messenger RNA (mRNA) pembawa kode
genetik dalam proses sintesis protein
Single strand RNA dapat membentuk double
strand misalnya struktur hairpin (tusuk
konde)
Next: To the Chromosome
structure & Function
Kromosom & Organisasinya pada @ organisme