Tema 9.

ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DE NUCLEÓTIDOS Y

ÁCIDOS NUCLEICOS
v Nucleósidos y nucleótidos.
v Estructura del DNA.
v Conformaciones A y Z. Propiedades fisico-químicas del
DNA.
v Tipos, estructura y función de los RNA.

1
 EL GEN
FRAGMENTO DE DNA QUE CONTIENE INFORMACIÓN GENÉTICA PARA LA
SÍNTESIS DE UN PRODUCTO GÉNICO

+1
Hebra codificante, no molde
Hebra molde
RNA polimerasa

TRANSCRIPCIÓN
Idéntica a la secuencia de la hebra que no hace
de molde (codificante)

+1
EUCARIOTAS: Modificaciones post-transcripcionales

RNA PROTEÍNA
TRADUCCIÓN

3
COMPONENTES DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS

Nucleótido

Fosfato(s) Nucleósido

Azúcar Base nitrogenada

Ácido

Neutro

Básico
4
 Nucleótidos
• Nucleótidos son los constituyentes de los ácidos
nucleicos (RNA, DNA)
• Participan en multitud de funciones celulares
(oxidorreducción, transferencia de energía,
señales intracelulares y reacciones de
biosíntesis
• Desempeñan papeles estructurales y catalíticos
en la célula
• Ningún otro tipo de biomolécula participa en
functiones tan variadas o en tantas funciones
esenciales para la vida
ESTRUCTURA GENERAL DE LOS NUCLEÓTIDOS

Base nitrogenada

Pentosa 7
COMPONENTES DE LOS NUCLEÓTIDOS
Componente Ácido – Fosfatos

H3PO4 PO43-

Enlaces pirofosfato o fosfoanhídrido:

enlaces de alta energía cuya hidrólisis es
exergónica.

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COMPONENTES DE LOS NUCLEÓTIDOS
Componente Neutro – Azúcar

9
COMPONENTES DE LOS NUCLEÓTIDOS
Componente Neutro – Azúcar

ß –D-
ribofuranosa

Aldopentosas (RNA)

ß - furanosa
ß –2 – desoxi
- D-
ribofuranosa

(DNA)

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 COMPONENTES DE LOS NUCLEÓTIDOS
Componente Neutro – Azúcar

ENVELOPE (E) TWIST (T)

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 COMPONENTES DE LOS NUCLEÓTIDOS
Componente Básico – Bases Nitrogenadas: ESTRUCTURA

PIRIMIDINA PURINA

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 COMPONENTES DE LOS NUCLEÓTIDOS
Componente Básico – Bases Nitrogenadas: BASES MAYORITARIAS DNA/RNA

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 COMPONENTES DE LOS NUCLEÓTIDOS
Componente Básico – Bases Nitrogenadas: BASES MINORITARIAS DNA/RNA

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OTRAS BASES NITROGENADAS DE INTERÉS BIOLÓGICO Y
CLÍNICO
Ácido úrico Cafeína Teofilina

Aciclovir Ganciclovir 5-fluorouracilo

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 NUCLEÓSIDOS
Los nucleósidos derivados de las purinas se designan con el sufijo -osina
(adenosina, guanosina, 2'-desoxiadenosina...) y los derivados de las
bases pirimidínicas añadiendo el sufijo -idina (citidina, timidina, uridina, 2’
desoxicitidina…).

Enlace N-glucosídico: con N1

de pirimidinas o N9 de purinas

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 NUCLEÓSIDOS: ESTRUCTURA

Nucleósidos púricos Nucleósidos pirimidínicos

Ribonucleósidos Desoxirribonucleósidos Ribonucleósidos Desoxirribonucleósidos

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 NUCLEÓTIDOS
Unión de una molécula de ácido fosfórico y un nucleósido mediante un enlace
éster entre un –OH del fosfato y el –OH del C5 de la pentosa. Pueden tener
uno, dos o tres grupos fosfato.
Los nucleótidos con bases púricas se designan con el sufijo -OSIN y los que
tienen bases pirimidínicas conel sufijo -IDIN. Se añade 5’ monofosfato.

Enlace éster

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 NUCLEÓTIDOS
Nucleótidos monofosfato: NMP Nucleótidos difosfato: NDP

Nucleótidos trifosfato: NTP

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NUCLEÓTIDOS MONOFOSFATO: ESTRUCTURA

DESOXYRIBONUCLEOTIDES
RIBONUCLEOTIDES
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 NUCLEÓTIDOS: FUNCIÓN
Compuestos ricos en energía que Compuestos que actúan
participan en intercambios energéticos como señales químicas

Componentes de coenzimas

En el NADP+, este grupo hidroxilo

está esterificado con fosfato

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NOMENCLATURA

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 ESTRUCTURA PRIMARIA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS
Polímero lineal formado por la unión de numerosos nucleótidos
mediante enlaces fosfodiéster 3’à5’

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 ESTRUCTURA PRIMARIA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS

• Ribosa (RNA) o desoxirribosa (DNA)

• U (RNA)/T (DNA)

• Enlaces 3’-5’ fosfodiester

5’ • Lectura desde el extremo 5’ al 3’

3’

AUCG
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 ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL DNA
Watson y
Crick

• Descubrimiento por la difracción de rayos X.

• Estructura regular y estable de los nucleótidos
• Reglas de Chargaff (A=T y C=G/ A+G = C+T)
Rosalind
Franklin • Formas del DNA: B-DNA, A-DNA yZ-DNA
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Rosalind Franklin
1920-1958
DOBLE HÉLICE DE DNA: B-DNA

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ANTIPARALELISMO DE LA DOBLE HÉLICE DE DNA

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COMPLEMENTARIEDAD DEL DNA: PUENTES DE HIDRÓGENO

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FUERZAS QUE ESTABILIZAN LA ESTRUCTURA DEL DNA
• Puentes de hidrógeno • Fuerzas de apilamiento
• Interacciones hidrófobas • Fuerzas iónicas

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 FUERZAS QUE ESTABILIZAN LA ESTRUCTURA DEL DNA
Puentes de hidrógeno: Un puente de H consiste en la interacción entre
un átomo de H unido covalentemente a un grupo donador y un par de
electrones libres en un mismo orbital de un grupo aceptor.

Interacciones hidrófobas: bases nitrogenadas están formadas por

anillos orgánicos planos, su carácter es marcadamente hidrófobo. El
DNA puede mantenerse soluble gracias a las cargas de los fosfatos,
pero las bases nitrogenadas son «expulsadas» hacia el interior de la
doble hélice, lo que permite alejarlas del solvente acuoso (bolsillo
hidrófobo).
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 FUERZAS QUE ESTABILIZAN LA ESTRUCTURA DEL DNA
Fuerzas de apilamiento: la manera más eficaz de mantener las bases
nitrogenadas en el bolsillo hidrófobo es permitir que los anillos entren en
contacto. La separación entre ellas es
igual a su tamaño, por lo que quedan
perfectamente apiladas unas sobre otras.

El apilamiento entre las bases es

inespecífico, ya que no dependen de la
base implicada, si bien la energía de
apilamiento de cada par de bases es
distinta.

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 FUERZAS QUE ESTABILIZAN LA ESTRUCTURA DEL DNA
Fuerzas iónicas: En el DNA sólo interviene la repulsión que se
establece entre los grupos fosfato de los esqueletos, En condiciones
fisiológicas, la repulsión es mínima gracias a las interacciones
electrostáticas que se establecen con los cationes divalentes
(principalmente Mg2+) o las proteínas (histonas).

33
TIPOS DE ESTRUCTURA DE DOBLE HÉLICE DE DNA

34
TIPOS DE ESTRUCTURA DE DOBLE HÉLICE DE DNA

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ESTRUCTURAS INUSUALES DEL DNA

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La unidad de transcripción de un gen consta de tres regiones:
1. Un promotor
2. Una secuencia codificante
3. Una señal de terminación
DNA – ácido desoxirribonucleico
RNA – ácido ribonucleico

Lasts for a long time Lasts for a short time

 Tipos de RNA

ü RNA heterogéneo nuclear (hnRNA): de alto peso molecular, es el

transcrito primario del RNA. En células eucariotas es el precursor de los RNA
presentes en el citoplasma.
ü RNA ribosómico (rRNA): forman parte de los ribosomas.
ü RNA transferente (tRNA): 75-90 nucleótidos. Transportan los
aminoácidos para la síntesis de proteínas.
ü RNA mensajero (mRNA): sirven de pauta para la síntesis de proteínas
ü RNA pequeño nuclear (snRNA): en el núcleo, interviene en los
procesos de maduración del RNAhn.
ü RNA interferente (iRNA): moléculas de 20-25 nucleótidos que se unen
por complementariedad de bases a mRNA y no dejan que se traduzca la
información. Actúan bloqueando la expresión de genes.
ü RNA vírico (vRNA): material genético de los retrovirus.
ü RNA no codificante (ncRNA): interactúa con factores de transcripción
RNA mensajero
RNA mensajero (mRNA) EUCARIOTA

ESTRUCTURA DEL CAP

CAP : 7-metilguanosina
-5’PPP5’-RNA (CAP mínimo).
GpppX

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 RNA mensajero (mRNA) PROCARIOTA
• Los genes están agrupados en el cromosoma y se transcriben juntos
(operón).
• Muchos RNAm procariotas son policistrónicos (múltiples genes en un
mismo transcrito) y el promotor único inicia la transcripción.
• El grupo de genes y el promotor, más secuencias adicionales que
funcionan conjuntamente en la regulación se denomina operón.
Habitualmente incluye de 2-6 genes.

44
RNA ribosomal
 RNA DE TRANSFERENCIA (tRNA)
Nucleótidos específicos tanto en el
brazo del anticodón como en el brazo
aceptor de aa permiten que la
sintetasa pueda reconocer el RNAt
correcto

Relativamente pequeños
Una sola hebra
Estructura 3D precisa
Al menos un RNAt para cada AA.
Se requieren al menos 61 RNAt para
reconocer todos los codones (algunos
reconocen más de uno). 46