Kurbagalar Neden V1raklar?: Kurbagalar Ciddi Sorunlarla Karl? - Karl? - Ya

You might also like

Download as pdf or txt
Download as pdf or txt
You are on page 1of 36

Kurbagalar neden v1raklar?

A mfibiler-sukurbagalan, kara kurbagalan ve semen-


derler- <;:ok uzun zamandan beri yeryuzundeler.
Dinozorlann gelip, gittigini gorduler. Ancak bug On
dunyadaki amfibi populasyonu ciddi ol<;:Ode azalmakta ve
Hayes ve arkada?lan, sukurbagas1 larvalann1 laboratu-
varda atrazin i<;:ermeyen ve milyarda 0.01- 25 pay (ppb)
aras1nda degi?en konsantrasyonlarda atrazin i<;:eren su i<;:in-
de yeti?tirdiler. Amerika Birle?ik Devletleri, <;:evre Koruma
yeryuzundeki amfibi tOrlerinin O<;:te biri yok olma tehlikesi ile Ajans1 <;:evredeki 10 ile 20 ppb arasindaki atrazin duzeylerini
kar?I kar?1ya bulunmaktad1r. Ni<;:in? onemsememekte ve i<;:me sulanndaki 3 ppb atrazin duze-
Biyologlar gozlemler ve deneyler yaparak bu soruyu yini guvenli kabul etmektedir. lowa'daki yagmur suyunda
cevaplamaya <;:ali?1yorlar. <;:ok say1da etmen bunun nedeni ol<;:Olen atrazin miktan 40 ppb olarak bulunmu?tur. Atrazin
olabilir. Muhtemel nedenlerden biri de tanmda kullanilan kullaniminin yasak oldugu isvi<;:re'de bu kimyasalin yagmur
pestisitler ve herbisitler olabilir. Bu kimyasallann <;:ogunun suyundaki miktan yakla?1k 1 ppb olarak ol<;:OlmO?tOr.
test edildigi <;:e?itli <;:ah?malar, gen;:ekte kullanilan konsant- Hayes'in laboratuvannda, 0.1 ppb gibi <;:ok d0?0k kon-
rasyonlann amfibileri oldurmedigini gosterdi. Ancak, Ber- santrasyonlann bile iriba? larvalannin geli?imi Ozerinde <;:ok
keley'deki Kaliforniya Oniversitesi'nde biyolog olan Tyrone ciddi etkisi olmu? ve bu miktardaki atrazin erkekleri di?ile?ti1
Hayes ara?t1rmay1 derinle?tirdi. mi?tir. Bu larvalardan geli?en baz1 ergin erkeklerde <;:iftle?mE
Hayes, yeryuzunde en yaygin olarak kullanilan herbisit <;:agnlarinda kullanilan ses organlarinin normalden daha ku-
ve temiz sulardaki en yayg1n kirletici olan atrazin Ozerinde <;:Ok oldugu, di?i e?ey organlannin geli?tigi ve testisler i<;:indE
yogunla?tl. Amerika Birle?ik Devletleri'ndeki tarlalara her yil yumurtalann olgunla?t1g1 bulunmu?tur. Diger <;:ah?malarda
140 milyon kilogramdan fazla atrazin uygulanmakta ve bu 25 ppb atrazin ile muamele edilen normal erg in erkek sukur
herbisit en az 20 Olkede daha kullanilmaktad1r. Atrazin bir- bagalannda testosteron Oretimi on misli azalm1? ve sperm
<;:ok amfibinin <;:iftle?tigi ve binlerce iriba?in tarlalardan gelen Oretimi durmu?tur. Geli?imsel ve hormonal bu degi?imlerin
sulann kan?t1g1 kanallarda, goletlerde ve akarsularda yuzdu- sukurbagalannin <;:iftle?me ve Oreme kapasiteleri Ozerindeki
gu mevsim olan baharda uygulanir. y1k1c1 etkilerini tahmin edebilirsiniz.
Ancak Hayes'in deneyleri, laboratuvarda
kullanilmak Ozere Oretilmi? sukurbagas1 tOrO ile
yine laboratuvarda ger<;:ekle?tirilmi?ti. Ayni
sonu<;:lar dogada da olacak m1yd1? Bu nu an-
lamak i<;:in Hayes ve ogrencileri su ornekleri
alarak ve sukurbagas1 toplayarak Utah'dan
lowa'ya kadar seyahat ettiler. Su orneklerini
atrazin a<;:1sindan analiz ettiler ve sukurbagalanni
incelediler. Sukurbagalan sadece tek bir bolgede,
yani atrazin saptanmayan su i<;:inde normaldi; diger

Kurbagalar Ciddi Sorunlarla Karl?•


Karl?•Ya Ekvator'da ya9ayan bu minik yaprakkurbagas1
(/1.galychnis calcarifer) gibi t;;ok say1da kurbaga tliru
yok olma tehlikesi ile karn;; kan;;1ya bulunmaktadir.
Yeryuzundeki amfibi populasyonlannin azalmas1na
yol at;;an muhtemel nedenler geni9 t;;apl1 bilimsel
ara9t1rmalara konu olmaktadir.
BOLUM ANA BA LIKLARI
1. 1 Biyoloji Nedir?
1.2 DOnya Ozerindeki Ti.im Canhlar Birbirleriyle Nas1I
Akrabadir?
1.3 Biyologlar Canhlan Nas1I inceler?
1.4 Biyoloji Toplumsal Politikalan Nas1I Etkiler?

1.1 Biyoloji Nedir?


Biyoloji, canh organizmalan inceleyen bilimdir. Biyologlar
"canh varhklan", yakla§Ik 4 milyar yil once evrimle§mi§ bir-
hiicreli bir atadan tiiremi§ olan c;ok c;e§itli organizmalar olarak
tammlarlar. Canh organizmalar ortak ataya sahip olmalan
nedeniyle, cans1z diinyada bulunmayan birc;ok ortak ozelligi
payla§Irlar. Canh organizmalar;
• bir ya da c;ok hiicreden olu§urlar
• genetik bilgi ta§Irlar
• kendilerini c;ogaltmak ic;in genetik bilgiyi kullamrlar
• genetiksel olarak akrabad1rlar ve evrimle§mi§lerdir
• c;evrelerinden ald1klan molekiilleri yeni biyolojik molekiil-
Bir Biyolog I~ ba~mda Tyrone Hayes South Carolina'daki lere donii§tiirebilirler
buyuk Congaree Batakl1g1 yak1ninda kaplumbagalar, yllanlar, • c;evrelerinden enerji oziitley~bilir ve bu enerjiyi biyolojik
sukurbagalan ve karakurbagalan toplayarak buyudu. $imdi i§leri yapmak ic;in kullanabilirler
Berkeley'deki California Oniversitesi'nde biyoloji profesoru olan • kendi ic; ortamlanm diizenleyebilirler
Hayes'in laboratuvannda 3,000'den fazla kurbaga var; bu
Bununla birlikte bu basit liste, canhhgm olaganiistii karma-
kurbagalann hormonal geli9imi uzerin~ 9all9malar yap1l1yor.
§Ikhk ve c;e§itliligini tam olarak yans1tmamaktadir. Ba21 canh
formlan, bu ozelliklerin tiimiinii ya§amlan boyunca sergile-
meyebilir. Ornegin, bir "61 bitkisinin tohumu y1llarca "evre-
bOtOn bolgelerdeki erkek sukurbagalannm e?ey organla-
den enerji oziitlemedigi, molekiilleri donii§tiirmedigi, ic; or-
rmda anomaliler vard1. tamm1 denetlemedigi ya da iiremedigi halde yine de canhdlf.
Dig er biyologlar gibi Hayes de gozlemler yapt1. Bu Peki viriislerin durumu nedir? Viriisler hiicre yap1smda
gozlem lere dayanarak tahminlerde bulundu ve tahmin- degildir ve kendilerine ait fizyolojik i§levler yapmazlar; ken-
lerini test etmek i<;:in deneyler tasarlayarak, bu deneyleri dileri adma bu i§leri yapmalan ic;in konak.:;1 hiicreleri kullan-
malan gerekir. Ancak viriisler genetik bilgi ic;erir, mutasyona
gen;:ekle?tirdi. Hayes'in deney sonuc;:lanndan bazilan
ugrar ve evrimle§irler (bilindigi gibi, evrimle§en grip viriisleri
bu bo lOmOn sonunda ac;:1klanm1?t1r. Bu sonuc;:lar sadece onlarla sava§abilmek ic;in geli§tirilen a§Ilann da siirekli olarak
amfibi ler Ozerinde degil, insanlann da dahil oldugu diger degi§tirilmesini gerektirmektedir.) Viriislerin var olabilmesi
hayva nlar Ozerinde de dikkate deger etkiler ortaya c;:1kara- hiicrelere baghdir ve biiyiik bir ihtimalle viriisler, hiicresel
bilece k niteliktedir. canh formlardan evrimle§mi§lerdir. 0 halde viriisler canh rm-
dir? Bu konuda ne dii§iiniiyorsunuz?
Bu kitap canhlarm ozelliklerini, bu ozelliklerin organiz-
malar arasmda nas1l degi§tigini, nasil evrimle§tiklerini ve or-
ganizmalann hayatta kalmasm1 ve iiremesini saglamak ic;in
nasil i§birligi ic;inde c;ah§hklanm ortaya koymaktadir. Evrim
BU BOLUMDE canh organizmalann en yayg1n ozel- biyolojinin ve dolay1s1yla bu kitabm temel konusudur. Canh
liklerini tan1mlayarak inceleyecek ve bu ozellikleri tum bi- sistemler, hayatta kah§ ve iiremedeki farkhhklar arac1hg1 ile
evrimle§mi§ ve Diinya iizerindeki c;ok farkh ortamlara uyum
yolojiyi belirleyen temel ilkeler kapsam1 ic;:ine yerle?tirece-
saglam1§lardlf. Evrim siireci bugiin yeryiiziinde gordiigiimiiz
giz. Daha sonra canlil1gm nasil evrimle?tiginin k1sa ozetini muazzam c;e§itliligi yaratmI§hr.
verecek ve yeryOzOndeki farkl1 organizmalann birbirleri ile
nas1I akraba olduklanni gorecegiz. Bundan sonra da biyo- Hucreler canllllgm temel birimleridir
lojik sorulann konulan ve bilimsel yontem Ozerinde dura- Bundan sonraki ii<; boliimde canhhk ogretisinin kimyasal te-
cag1z. En sonunda da biyologlar taraf1ndan ke?fedilen bil- mellerini ortaya koyacak, daha sonraki boliimlerde ise hiicre-
gilerin toplumsal politikalan nasil etkiledigini ele alacag1z. lere geri donerek onlarm ya§ama, iireme, ya§lanma ve oliim
siirec;lerini inceleyecegiz. Baz1 organizmalar birhiicrelidir ve
4 BOLUM 1 i YA$AMIN C::ALl$1LMASI (C) Coccolithophore

(B) Escherichia coli

4µm

(D) Banksia coccinea (E) Pec;:eli mantar

Dev kaplumbaga

1.1 Canhlarm c;e~itliligi Evrim sureci bugun yeryuzunde ya:;;ayan milyonlarca farkl1 orga-
nizmanin ortaya 91kmas1na yol ai;;m19t1r. Archaea (A) ve Ba.cteria (B) Bolum 26'da anlat1lan
birhucreli prokaryotik organizmalard1r. (C) Birc;;ok protista uyesi, birhucrelidir; ancak, bunlann
hucre yap1lan, Bolum 27'de anlat1ld1g1 gibi, prokaryotlardan daha komplekstir. Buradaki pro-
tista, mevcut olan tek bir hucresini i;;evreleyen ve onu koruyan kalsiyum karbonat "plaklar"
uretir. (D-G) Dunya uzerinde gozlenen canl1lann i;;ogu i;;ok hucrelidir. Bolum 28 ve 29 ye:;;il
bitkileri ele almaktad1r (D). Diger i;;ok hucreli organizma gruplan Bolum 30'da tart191lan man-
tarlar (E) ve 31-33. Bolumlerde tart191lan hayvanlard1r (F,G).

canhhgm tum i§levlerini gen;:ekle§tiren tek bir hucreden olu- Bu basit gozlem, bakterilerin ke§fini temsil eder -ve bilim in-
§urlar (~ekil 1.1A-C). Diger canhlar ise fOk hucrelidir ve farkh sanlannm baz1 §eyleri nic;in yaphklan konusunda diger insan-
i§levler ic;in ozelle§mi§ c;ok say1da hucreden olu§urlar (~ekil lan hayrete du§urur.
1.1 D-G). Virusler ise hucresel organizmalara bag1mh olmala- Hucre ara§hrmalarmm onemli Olc;ude geli§mesinden once,
nna ragmen, hucre yapzsznda degildir. yuz y1ldan fazla bir zaman gec;ti. Alman biyolog Matthias
Hucrelerin ke§fi, Hollandah gozliik yap1mc1s1 Hans ve Schleiden ve Belc;ika'h Theodor Schwarm, 1838' de bir ak§am
Zaccharias Janssen (baba ve ogul) tarafmdan 1590'larda mik- yemegi s1rasmda bitki ve hayvan dokulan uzerinde kendi
roskobun icad1 ile mumkun olmu§tur. Hollandah Antony yaphklan c;ah§malar hakkmda sohbet ederken, gozlemlerin-
van Leeuwenhoek ve ingiliz Robert Hooke 1600'lerin orta- deki benzerlikleri fark ettiler ve bitki ve hayvanlardaki temel
s1 ve sonlarmda, Janssen'in buldugu teknolojiyi geli§tirerek yap1sal elemanlarm aym oldugu sonucuna vard1lar. Ula§hk-
bunu canh organizmalan incelemek ic;in kullanml§hr. Van lan sonucu hi.icre teorisi olarak formule ettiler. Hucre teorisi
Leeuwenhoek, bir damla havuz suyunun birhucreli orga- §Unlan onerir:
nizmalar ic;erdigini ke§fetmi§, uzun ya§am1 boyunca yaphg1
• Tum canh organizmalarm temel yap1sal ve fizyolojik bi-
ara§hrmalarla mikroskobunu surekli olarak geli§tirmi§ ve c;ok
rimleri hucrelerdir.
say1da ba§ka bulu§ yapml§hr. Hooke, bitki parc;alarm1 mik-
• Hucreler hem tek ba§larma var olan birimler, hem de daha
roskobuna yerle§tirmi§ ve bunlann tekrarlanan birimlerden
kompleks organizmalarm yap1sal birimleridir.
olu§tugunu gozlemleyerek bu birimlere hucre adinl vermi§tir
(~ekil 1.2). Hooke 1676'da van Leeuwenhoek'un "ishal §ika- Ancak Schleiden ve Schwarm, aym zamanda (yanl1§ olarak)
yeti oldugunda d1§kismda c;ok say1da kuc;uk hayvan gordugu hucrelerin, bir tuz c;ozeltisindeki kristal olu§umuna benzer §e-
halde, iyile§tiginde bunlarm hic;birini g0rmedigini" yazml§h. kilde, cans1z materyallerin kendiliginden bir araya gelmesiyle
1. 1 i BiYOLOJi NEDiR? 5

1.2 Hiicreler Canhlann Yap1ta~1d1r (A) (B) (C)


Mikroskoplann geli9tirilmesi, gozlem-
lerine dayanarak hucre kavram1n1 one
suren Robert Hooke gibi on yedinci
yuzy1I bilim adamlannin onune mikrobi-
yal dunyay1 ai;:m19t1r. (A) Hooke, bir bitki
dokusu (mantar) kesitindeki hucreleri,
optik mikroskobu ile gbrdugu $ekilde
i;:izdi. (B) Modern optik ya da "191k" mik-
roskobu, bir yapraktaki hucrelerin aynn-
t1lann1 ortaya i;:1kanr. (C) Tansmisyon
elektron mikroskoplar (TEMler) bilim
insanlannin daha da kui;:uk objeleri
gormelerine izin verir. TEM gorun!Uleri
renkli degildir; buradaki renkli sumerci-
megi hucreleri siyah-beyaz mikrograf1n
daha sonra renklendirilmesiyle elde
edilmi9tir. '-------'
30 µm 5µm

ortaya <;1khklanna inamyordu. Bu sonu<;, o donemdeki yaygm Origin of Species (Tiirlerin Kokeni) adh kitabmda 1859'da orta-
gorii§ olan ve canhlarm cans1zlardan -yani farelerin kirli giy- ya koydu. 0 giinden bu yana biyologlar Darwin'in tiim canh
silerden, kurt<;uklarm olii hayvan etlerinden ya da sineklerin organizmalarm ortak bir atadan tiiredigini oneren teorisini
havuz suyundan- kendiliginden ortaya <;1khgm1 oneren kendi- destekleyen biiyiik miktarda veri topladilar. Darwin evrimsel
liginden olu§ma (spontan generasyon) gorii§ii ile uyumluydu. degi§iklik olu§turan en onemli siire<;lerden birini onerdi. Bir
Bu tarh§ma, Frans1z Bilimler Akademisi'nin spontan gene- populasyondaki bireylerin hayatta kah§ ve iireme a<;1Smdan
rasyonun dogru mu yoksa yanh§ rm oldugunu karntlayacak farkhhklar ta§1mas1Illn, canh evriminin en biiyiik sorumlusu
en iyi deney i<;in bir yan§maya sponsor oldugu 1859 yilma oldugunu ileri siirdii ve bu olgu i<;in dogal seleksiyon terimi-
kadar devam etti. Odiilii kazanan ki§i, biiyiik Frans1z bilim ni kullandi.
adarm Louis Pasteur oldu. Pasteur, havadaki kir ve toza ma- Darwin canh organizmalarm ortak atalardan tiiredigini ve
ruz b1rakilan steril besiyeri i<;inde mikroorganizma kiiltiirii dolay1s1yla birbirleri ile akraba olduklarm1 one siirmii§ olsa
olu§tugu halde, dogrudan hava ile temas etmeyen benzer bir da, genetik kahhmm mekanizmalanrn bilme avantajma sahip
kap i<;indeki steril besiyerinin steril kald1gm1 gosterdi (bakm1z degildi. Buna ragmen, yavrulann ebeveynlerine benzedigini
$ekil 4.7). Pasteur'iin deneyi, besiyerinin enfekte olma nede- gozlemledi ve dolay1s1yla bu gibi mekanizmalarm olmas1 ge-
ninin havadaki mikroorganizmalar oldugunu karntlamasa da, rektigini tahmin etti. Bu basit ger<;ek ti.ir kavram1 i<;in temel
yeni canhlarm ancak daha onceki canhlardan yarahlabilecegi olu§turur. Tiiriin kesin tarnm1 karma§Ik bir konu olmakla bir-
sonucunu destekledi. likte, en yaygm kullarnm1yla tiir, <;iftle§tiklerinde canh ve iiret-
Bugiin bilim insanlan, hiicrelerin daha once var olan hiic- ken yavrular olu§turabilen organizma grubu anlamma gelir.
relerden geldigi ve organizmalarm i§levsel ozelliklerinin on- Ancak yavrular, ebeveynlerinden farkhd1r. Bir bitki ya da
larm hiicresel ozelliklerinden kaynakland1g1 ger<;egini kabul hayvan tiiriiniin herhangi bir populasyonu varyasyon goste-
ederler. Her <;e§it hiicre hem temel mekanizmalan payla§hg1, rir ve eger belirli bir ozellige sahip bireyleri <;iftle§tirmek i<;in
hem de milyarlarca y1l oncesinde ortak ataya sahip olduklan se<;erseniz, bu ozelligin bu <;iftin yavrularmda bulunma ihti-
i<;in modern hiicre teorisine baz1 eklemeler yapilmI§hr: mali, genel populasyonyondan fazla olacaktir. Darwin de biz-
• Tiim hiicreler, daha once var olan hiicrelerden gelir. zat giivercinleri <;iftle§tiriyordu ve giivercin tutkunlanrnn <;ok
• Tiim hiicreler, kimyasal bile§im a<;1smdan benzerdir. farkh tiiylere, gaga bi<;imlerine ya da viicut boyutlarma sahip
• Canhlardaki kimyasal tepkimelerin <;ogu, hiicrelerdeki yavrular iiretmek i<;in dam1zhk <;iftleri nasil se<;tiklerini bili-
sulu <;ozelti i<;inde ger<;ekle§ir. yordu (bakrmz $ekil 21.2). Eger insanlar hayvanlan evcille§-
• Hiicre boliinmesi s1rasmda genetik bilginin tiimii replike tirirken belirli ozellikleri se<;ebiliyorlarsa, benzer bir siirecin
edilir ve aktanhr. dogada da i§levsel olabilecegini dii§iindii; dolay1s1yla dogal
• Viriisler hiicresel yap1dan yoksun olmakla birlikte, hiicre- ser;ilim terimi, yapay (insan eliyle yap1lan) se<;ilimin kar§1hdir.
sel organizmalara bag1mhd1rlar. Dogal seleksiyon nas1l i§ g6riir? Darwin, hayatta kah§ ve
Schleiden ve Schwann'm hiicre teorisinin temellerini athg1 iireme ba§anlarmdaki farkh ihtimallerin ·bu i§i ba§ard1gm1
donemde Charles Darwin de organizmalarm nas1l evrimsel onerdi. Onun dii§iincesine g6re, bitki ve hayvanlarm iireme
degi§iklik ge<;irdiklerini anlamaya ba§hyordu. kapasiteleri, eger kis1tlanmam1§sa, populasyonlarm smirs1z
ol<;iide biiyiimesiyle sonu<;lanacakhr; oysa dogada boyle s1-
rnrs1z bir biiyiime gozlemlemeyiz; pek <;ok tiirde yavrularm
Tum canhlar ortak bir evrimsel tarihi payla!11r sadece kii<;iik bir orarn hayatta kalabilir ve iirer. Dolay1s1yla,
Evrim -biyolojik populasyonlarm genetik yap1smda zaman sahibinin hayatta kah§ ve iiremesinde <;ok kii<;iik bile olsa bir
ir;inde ortaya <;1kan degi§im-biyolojideki temel birle§tirici il- arh§ saglayabilen herhangi bir ozellik, populasyonda yay-
kedir. Charles Darwin evrime ili§kin ger<;ek karntlan On the gmla§acakhr.
Biri;;ok yaprak, gune9e maksimum Herdem ye9il koniferlerin
fotosentetik yuzey sunan geni9 ve i;:ogunun yapraklan su
yass1 bii;;imlere sahiptir. Buradaki kayb1na kar91 koymak ii;:in
- - ·- .. Japon ak9aagac1 gibi baz1agai;;lar 1 mumsu bir tabaka ile kapl1
soguk ve kurak hava ko9ullanna I igne 9eklinde olup, y1ll1k
cevap olamk yap!ak dokerler. _J olarak dokulmez.

r;;-radaki nilUferle;;kokleri - 1 ~ bitkisinin yapraklar~


iiiji~!!!!'1 havuzun dibinde ise, geni9 ve I I biriktiren kap bii;;imini ahr: lbrigin i
yass1yapraklan yuzeyde yer al1r. i I ii;;ine i;:ekilen boceklerin l
par9alanmas1 sonucu bitki, ~
~------ __)
J

l:kst~~esinsa_9_
_ 1a_r._ _____ __ _. "'~

-
1- - -
T1rmanma yetenegine sahip olan bir bitki daha
fazla gune9 191g1 saglamak ii;:in digerlerinden
--, I
I
daha yuksege ula9arak avantajl1 duruma geli r. j
'------- -

1.3 ~evreye Uyum ButUn b itkilerin yapraklan fotosen -


tez ic;;in ozel le$mi$t ir. Fotosentez, SU ve karbon dioksiti,
karbonhidrat ad1 verilen daha buyuk yap1sal molekullere
donl.i$tUrmek ic;;in gune$ l$1g1ndan gug sag layan surec;;t ir.
Farkl1 bitkilerin yapraklan kendi c;;evrelerine uygun fark l1
adaptasyon lara sahiptir .

Belirli baz1 6zelliklere sahip organizmalar, 6zel baz1 ko;;ul- hi.icrenin i§levsel olabilmesi ve diger hi.icrelerle etkile§ebilme-
lar altmda en iyi §ekilde hayatta kahp, i.ireyebilmeleri nede- si ic;;in gerekli bilgi, hi.icrenin ic;;erdigi DNA moleki.illerinin ti.i-
niyle, dogal sec;;me adaptasyonlara yol ac;;ar. Adaptasyonlar, mi.ini.in toplam1 olan genomda yer ahr. DNA (deoksiriboni.ik-
bir organizmanm ya§ad1g1 c;;evredeki hayatta kah§ ve i.ireme leik asit) moleki.illeri, ni.ikleotidler ad1 verilen dort farkh alt bi-
§ansm1 arhran yap1sal, fizyolojik ya da davrarn§sal 6zellikler- rimin uzun dizilerinden olU§IDU§tur. Ni.ikleotidlerin dizilimi
dir (~ekil 1.3). Dogal sec;;ilime ek olarak, e§eysel sec;;ilim (e§ genetik bilgi ic;;erir. Genier, hi.icrenin proteinlerini yapmak ic;;in
sec;;imine bagh seleksiyon) ve genetik si.iri.iklenme (bir popu- kulland1g1 bilgiyi kodlayan ozgi.il DNA parc;;alandir (~ekil
lasyondaki gen frekanslannm §ansa bagh olarak rasgele dal- 1.4). Protein moleki.illeri hi.icre ic;;indeki kimyasal tepkimeleri
galanmas1) gibi evrimsel si.irec;;ler de c;;e§itli adaptasyonlann yonetir ve organizma yap1smm bi.iyi.ik kismm1 olu§turur.
ortaya c;;1kmasma katk1 yapar. Bir kitap ile analoji yapmak gerekirse, DNA'nm ni.ikleotid-
Eger tum hi.icreler, daha once var olan hi.icrelerden geliyor- leri alfabenin harfleri gibidir. Protein moleki.illeri kitabm ci.im-
sa ve Di.inya i.izerindeki farkh organizma ti.irlerinin ti.imi.i or- lelerine benzer. Yap1lan olu§turan ve biyokimyasal si.irec;;leri
tak bir atadan ti.iremi§ farkh modifikasyonlar arac1hg1 ile bir- kontrol eden protein kombinasyonlan ise, kitaptaki paragraf-
birleri ile akraba ise, ebeveynden yavru hi.icrelere ve ebeveyn larm yerini tutar. Ozgi.il i§levlere (omegin sindirim ya da ta§I-
organizmalardan yavrularma gec;;en bilginin kaynag1 nedir? ma gibi) sahip farkh sistemler halinde organize olmu§ yap1lar
ve si.irec;;ler kitabm boli.imlerini, kitabm ti.imi.i ise organizmay1
temsil eder. Eger dort ni.ikleotidi temsil eden dort harfi kulla-
Biyolojik bilgi Wm organizmalarm ortak genetik dilinde
narak kendi genomunuzu yazmak isteseniz, 3 milyardan fazla
mevcuttur
harf kullarnrsm1z. $imdi okudugunuz yaz1 tipini kullanirsarnz,
Hi.icreler organizmalarm temel yap1sal birimleridir, ama tek genomunuz, bu kitabm boyutlarma sahip bin adet kitab1 kapsa-
bir hi.icre bile, birc;;ok hi.icre-ic;;i yap1ya ve bilgiye dayanan c;;ok yacakhr. Dogal sec;;ilimi de ic;;eren evrim mekanizmalan, ya§am
say1da i§leve sahip oldugu ic;;in, kompleks bir birimdir. Bir ki.iti.iphanesindeki ti.im kitaplarm yazarlan ve edit6rleridir.
1. l BiYOLOJi NEDiR? 7
Bir nukleotid - -
-- - - - - - --·-- --
OOrt niikleotid (C, G, T ve A) mesi i<;in hammadde saglar. Ya§am, hiicre i<;inde cereyan eden
binlerce biyokimyasal tepkimeye baghdir. Bu tepkimelerin
baz1lan besin molekiillerini daha kii<;iik kimyasal birimlere
y1kar ve bu siire<; s1rasmda, besinlerdeki kimyasal baglarm
DNA birbirine bagl1
i<;erdigi enerjinin bir k1sm1 <;e§itli hiicresel i§lerin yap1lmas1
,_
zincir ic;:erir. ____,r
nukleotidlerden olu:;;an iki
~ i<;in kullamlan yiiksek-enerjili molekiiller tarafmdan saklamr.
En goze <;arpan hiicresel i§lerden biri, mekanik i§tir -mole-
kiillerin hiicre i<;inde bir yerden ba§ka bir yere hareketi, hiic-
relerin ya da dokularm bir biitiin halinde hareketi, ya da kas-
larm yaphg1 gibi, organizmanm biitiiniiniin hareketi ($ekil
1.5A). En temel hiicresel i§, yeni kompleks molekiillerin ve ya-
p1larm daha kii<;iik kimyasal birimlerden olu§turulmas1 yani
sentezdir. Ornegin, bugiin yedigimiz karbohidratlarm yann

Bir gen bzgul bir nukleotid


dizisi ic;:erir.
- - · - - -·-- --
l i<;in yag olarak viicutta depoland1gm1 biliyoruz ($ekil 1.5B).
Bir ba§ka i§ <;e§idi, sinir sistemlerindeki bilgi i§leme siirecinin
temeli olan elektriksel i§tir. Bir organizmamn tiim hiicrelerin-
de yapilan tiim kimyasal donii§iimlerin toplam1 metabolizma
ya da metabolik h1zdir.
ONA Hiicrelerde ger<;ekle§en biyokimyasal tepkimelerin <;ok
biiyiik bir klsm1, bir tepkimenin iiriinleri bir sonrakinin ham-
_ . Pro~
ein madeleri olacak §ekilde birbirine baglamr. Bu kompleks tep-
Bir genin nukleotid dizisi I kime aglan, entegre olmak ve kontrol edilmek zorundadir.
ozgul bir protein yapmak ic;:inj l Bunun olmamas1 hastahkla sonu<;lamr.
gerekli bilgiyi ic;:erir.

Canh organizmalar ic; ortamlanm di.izenlerler


1.4 DNA Canhlarm Belirleyicisidir Canl1y1 beiirleyen talimatlar, DNA <;:ok hiicreli organizmalar, hiicresel olmayan bir i(: 9evreye
molekullerinin nukleotid dizisinde kodlanm19t1r. DNA'daki ozgul nukleotid sahiptir. Diger bir deyi§le, bu organizmalarm hiicreleri, hiic-
dizileri genleri olu:;;turur. insanlardaki ortalama bir gen I 6.000 nukleotid re-d1§l s1vilar i<;inde yer ahrlar. Hiicreler, besinlerini bu <;evre-
uzunlugundad1r. Her bir gendeki bilgi, hucrenin ozgul bir proteini uretmesi
i<;in gerekli olan bilgiyi saglar. den ahr ve metabolizma ahklarm1 buraya verirler. <;:ok hiicreli

(A)
<;:ok hiicreli bir organizmamn hiicreleri aym genoma sa-
hip olmakla birlikte, farkh hiicreler farkh i§levlere sahiptir ve
farkh yap1lar olu§tururlar -kas1lma proteinleri kas hiicreleri,
hemoglobin kirm1z1 kan hiicreleri, sindirim enzimleri sin-
dirim kanah hiicreleri i<;inde olu§Uf vs gibi. Dolay1s1yla, bir
organizma i<;indeki farkh hiicre tipleri genomun farkh k1s1m-
lanm ifade etmek zorundadir. Hiicrelerin kompleks bir orga-
nizmamn geli§erek i§lev gormesini miimkiin kilacak §ekilde,
gen ifadesini nas1l kontrol ettikleri, giiniimiizdeki biyoloji
ara§hrmalanmn odakland1g1 temel konudur.
Bir organizmamn genomu, binlerce genden olu§ur. Eger
bir genin niikleotid dizisi degi§irse, bu genin kodlad1g1 prote-
in de muhtemelen degi§ecektir. Genomdaki degi§iklikler, mu-
tasyonlar olarak adlandmhr. Mutasyonlar kendiliginden orta-
ya <;lkabildigi gibi, <;e§itli kimyasallar ve radyasyon gibi di§
fakt6rler tarafmdan da indiiklenebilir. Mutasyonlarm <;ogu ya
zararh ya da etkisiz olmakla birlikte, bir mutasyon ara sira
organizmanm i<;inde yer ald1g1 <;evresel ko§ullar altmdaki i§le-
yi§ini geli§tirir. Bu gibi yararh mutasyonlar, evrimin hammad-
desidir ve adaptasyonlara yol a<;ar. 1 .
1.5 Enerji Hemen Kullamhr ya da Depolanabilir (A) Hayvan hucreleri,
mekanik i:;; yapmak -ornegin buradaki kangurunun z1plamas1- i<;in , besin
Hi.icreler enerji saglamak ve yeni yap1lan kurmak ic;in molekullerinin kimyasal baglannda mevcut enerjiyi a<;1ga 91karmak uzere
besinleri kullamr bu baglan par9alarlar. (B) Buradaki Arktik yer sincab1nin hucreleri, bitkiler-
Canh organizmalar, besin maddelerini <;evreden ahrlar. Besinler deki kompleks karbonhidratlan par9alayarak bu molekulleri yaga 9evirir ve
bu yag, soguk aylarda enerji deposu saglamak uzere hayvanin vucudunda
organizmaya enerji ve biyokimyasal tepkimelerin siirdiiriil- depolanir.
8 BOLUM l I YA$AMIN <.;ALl$1LMASI

organizmalann hiicreleri ozelle§mi§ yanifarklzla~mz~tzr; boyle- Atomlar


ce i<;: ortamm devamhhgma bir bi<;:imde katk1 yaparlar. Ozel- Molekuller atomlardan
le§menin evrimle§mesiyle, farkhla§IDl§ hiicreler birhiicreli or- olu:;;ur. Molekuller hucre
yap1s1ni kurar.
ganizmalarm ger<;:ekle§tirdigi i§levlerin bir<;:ogunu kaybetmi§-
ler ve zorunlu gereksinimlerinin kar§1lanmas1 i<;:in i<;: <;:evreye
Moleklil
bag1mh hale gelmi§lerdir.
Ozelle§mi§ i§lerin ba§anlabilmesi i<;:in, farkhla§IDl§ hiicre l~ok farkl1 hucre t~pleri ~~;;1
birlikleri dokular halirtde organize olurlar. Ornegin, tek bir kas organizmalann 19 yapan
bile:;;enleridir.
hiicresi <;:ok fazla gii<;: yaratamaz; ama bir<;:ok kas hiicresi bir "----- - - - -- ·- ·j
araya geldiginde, biiyilk bir gii<;: ve hareket olu§turulabilir
(bakm1z $ekil l.SA). Farkh doku tipleri, ozgiil i§levler yapan
organlarz olu§turacak §ekilde organize olurlar. Ornegin kalp,
'~- ------
l:;;birligi ic;:inde ·-1
c;:al19an benzer

beyin ve mide, <;:e§itli doku tiplerinden yapilm1§hr. i§levleri


I alg1layan hlicreler) bir dokuyu
hlicreler grubu (brnegin koku
I
birbiriyle ili§kili olan organlar, organ sistemleri i<;:inde grupla- \__ olu9turur. __ _ )
mr. Ornegin mide, bagirsak ve yutak, sindirim sisteminin ki- Sinir dokusu
simlandir. Hiicreler, dokular, organlar ve organ sistemlerinin
tiimii <;:ok hiicreli organizmalarm par<;:alandir. Organizmala- 1 Organlar birlikte c;:al19an c;:e9itli dokulan l
rm biyolojisi, bu kitabm Sekizinci ve Dokuzuncu Dnitelerinde [ bir araya getirir. Organlar, brnegin sinir !
ele almacakhr.
Organ (beyin)
I sistemi gibi, sistemleri olu9tururlar. j
~), Organizma (bal1k)

Canh organizmalar birbirleriyle etkile~irler

Tek tek organizmalarm i<;: hiyerar§isi, biyolojik diin-


yanm di§ hiyerar§isine uygundur (~ekil 1.6). Orga-
nizmalar, izole halde ya§amazlar. Birbirleriyle etki-
le§en ve aym tiiriin bireylerinden olu§an grup bir
populasyondur. Aym alanda ya§ayan ve birbirleriyle
etkile§en populasyonlar, komiinite olarak adlandm-
hr. Komiiniteler ve bunlarm cans1z <;:evresi ekosiste- Bir organizma kendi ba91na bir
bireydir. Kornpleks c;:ok hucreli
mi olu§turur. organizmalar organlar ve organ
Bir populasyondaki bireyler, <;:ok farkh yollar- sistemlerinden olu9ur.
dan birbirleriyle etkile§irler. Hayvanlar, bitkileri ve
diger hayvanlan (genellikle diger tiirlerin iiyele- ~pulasyon ayni tlire ait c;:ok say1da J

rini) yerler ve besin ve diger kaynaklar i<;:in ba§ka I bireyden olu:;;ur. j


tiirlerle rekabet ederler. Baz1 hayvanlar, kendi tiirle- ~-------------
rindeki diger bireylerin besin, yuvalama yerleri ya
da e§ bulma gibi kaynaklardan yararlanmasm1 en-
gellerler. Hayvanlar aym zamanda, kendi tiirlerinin
diger liyeleri ile sosyal birimler olu§turarak-orne-
gin termit kolonileri ya da ku§ siiriileri gibi- i~birligi
de yaparlar. Bu gibi etkile§imler, ornegin ileti§im
gibi sosyal davram§larm evrimle§mesi ile sonu<;:-
lanrm§hr.
Bitkiler de diger bitkileri, hayvanlan ve mikro-
organizmalan i<;:eren kendi di§ cevreleri ile etkile-
§irler. Tum karasal bitkiler <;:evrelerindeki fungus-
lar, bakteriler ve hayvanlarla kurduklan karma§Ik
ortakhklara bag1mhd1rlar. Bu ortakhklann baz1lan
besin saglamak, baz1lan iiretken tohumlar olugtur-
mak ve baz1lan da tohumlarm yayilmas1 i<;:in zo-
runludur. Bitkiler l§Ik ve su i<;:in birbirleriyle reka-

1.6 Biyoloji Birc;;ok Organizasyon Duzeyini inceler DNA

,.-------------------'-.. .
ve diger molekullerin hucrede organ ize olmas1, canlll1k i:izel-

l
liklerini ortaya i;:1kanr. Enerji, burada gi:isterilen tlim biyolojik
duzeylerde akar.
-"""'=""-·~~~
Ayni cografi bblgedeki biyolojik komuniteler
yourBioPortal.com - - - - - ekosistemleri olu:;;turur. Ekosistemler enerji
al19veri9i ya~~r ve Dlinya'nin biyosferini yaratir. Biyosfer
ZIYARET EDINIZ Web Aktivitesi 1.1 •
Canhlardaki Hiyerar~ii
1.2 , DONYA UZERiNDEKi TUM CANLILAR BiRBiRLERiYLE NASIL AKRABADIR? 9

bet ederler, kendilerini yiyen hayvanlarla siiregiden evrimsel


etkile§imlere sahiptirler ve predasyona kar§I adaptasyonlar
ya da iiremelerine yard1mc1 olan hayvanlan cezbedici yollar
1. Dunya Ozerindeki Tum Canhlar
bi ler'yle Nas1I A rabad1r?
Biyologlar, "tiim organizmalar genetiksel olarak akrabadzr" de-
evrimle§tirirler. Bir komiinitedeki farkh bitki ve hayvan tiirle-
mekle neyi kastederler? Biyologlarm bu ifadeyle demek iste-
rine ait populasyonlarm etkile§imleri, ozelle§mi§ adaptasyon-
digi, Diinya iizerindeki tiirlerin ortak bir atayz payla§malan-
lar olu§turan en temel evrimsel giic;lerdir.
dir. Eger iki tiir -ornegin kopekler ve kurtlar gibi- birbirine
Farkh fiziksel ozelliklere sahip geni§ cografi alanlarda et-
benziyorsa, bunlar muhtemelen oldukc;a yakm bir gec;mi§te
kile§im ic;inde olan komiiniteler, ekosistemleri olu§turur. Bun-
ortak bir ataya sahiptir. Daha farkh iki tiiriin -soz geli§i kopek
lara ait ornekler arasmda Arktik tundralar, mercan resifleri ya
ve geyik- ortak atas1 ise, muhtemelen daha uzak bir gec;mi§te
da tropikal yagmur ormanlan saydabilir. Tiirlerin birbirleriyle
ya§amI§hr. Ve eger iki organizma -ornegin kopek ve midye
ve komiiniteler ve ekosisteml~r ic;indeki c;evreleriyle etkile§im
gibi- c;ok farkh ise, bu durumda onlarm ortak atas1m bulmak
yollan ekolojinin ve bu kitabm Onuncu Onitesinin konusudur.
ic;in r;;ok daha uzak gec;mi§e gitmemiz gerekir. Herhangi iki or-
Biyolojideki bulu~lar genellenebilir ganizmanm ortak atasmm ne kadar uzak gec;mi§te ya§ad1gm1
nas1l soyleyebiliriz? Diger bir deyi§le, organizmalar arasmda-
Canhlar ortak bir atadan tiiremi§ olmalan, ortak bir genetik ki evrimsel akrabahklan nas1l bulabiliriz?
kodu payla§malan ve benzer yap1sal birimlerden -hiicreler-
Biyologlar canhhk tarihini ortaya c;1karmak ic;in, uzun y1l-
olu§malan nedeniyle, belirli bir organizma tiirii iizerindeki
ara§hrmalardan elde edilen bilgiler -ihtiyath bic;imde- diger lar boyunca fosil kayztlarzm -uzak gec;mi§te ya§ailll§ organiz-
organizmalar ic;in de genellenebilir. Biyologlar bulgulanm malarm korunmu§ kalmhlan- incelediler ( ~ekil 1.7). Jeologlar
insanlar da dahil diger organizmalan kapsayacak §ekilde ge- fosillerin ya§I ve ya§ad1klan ortamlarm niteligi hakkmda bilgi
ni§letebileceklerini bilerek, ara§hrmalarmda model sistemleri saglad1lar. Daha soma biyologlar giiniimiizde ya§ayanlarla
kullamrlar. Ornegin, hiicrelerdeki kimyasal tepkimeler hak- fosil organizmalarm anatomik benzerliklerini ve farkhhkla-
kmdaki temel bilgilerimiz bakteriler iizerinde yapdan ara§hr- rm1 kar§1la§hrarak, bunlar arasmdaki evrimsel akrabahklan
malardan elde edilmi§ olsa da, bu bilgiler insan hiicreleri de ortaya c;1karmaya c;ah§hlar. C::ogunlukla gozlenen durum, fo-
dahil tiim hiicreler ic;in gec;erlidir. Benzer §ekilde, fotosente- sil kay1tlan arasmda biiyiik bo§luklar oldugu idi. Bu durum
zin-bitkilerin biyolojik molekiilleri sentezlemek ic;in giine§ I§I- biyologlann iki organizma hath arasmdaki "kay1p halkalan"
g1m kulland1g1 siirec; -biyokimyas1 birhiicreli bir alg olan Ch-
tahmin etmelerini giic;le§tirdi. Fosil kay1tlarmdaki eksiklikler
iarella iizerinde yap1lan deneylerle c;ah§1lm1§hr (bakm1z $ekil
tamamland1kc;a, bu bo§luklar dolduruldu.
10.13). Bitki geli§imini kontrol eden genler hakkmda bildik-
lerimizin c;ogu, hardal bitkisinin bir akrabas1 olan Arabidopsis Boliim 24' de apklanan ve genom kar§ila§hrmalan ic;in
thaliana iizerindeki ara§hrmalarm sonucudur. Hayvanlarm kullamlan molekiiler yontemler, biyologlarm canh organiz-
nasd geli§tigi konusundaki bilgilerimiz denizkestaneleri, kur- malar arasmdaki akrabahk derecelerini daha dogru bic;imde
bagalar, tavuklar, yuvarlak solucanlar ve meyve sinegi iize- saptamalanm ve bu bilgiyi fosil kay1tlanm ac;1klamada kul-
rindeki ara§hrmalardan elde edilmi§tir. C::ok yakm zamanda lanmalarm1 sagladi. Fosil orneklerinden elde edilen molekii-
insanlarm deri rengini kontrol eden asal genin ke§fi, zebra- ler bilgilerden bir tanesi, yakm zamanda Neandertallerin fosil
bahg1 iizerindeki c;ah§malarla ba§anldi. Model sistemlerden kemiklerinden elde edilen genetik materyalden saglanmI§hr.
genelleme yapma olanag1, biyolojinin giic;lii bir arac1dir.

Canh organizmalar, hucrelerden yap1lm1~trr (ya da


hucrelere bag1mhdrr), ortak atadan tliredikleri ve
evri mle~tikleri i9in akrabadrrlar, genetik bilgi i9e-
rir ve bunu uremek i9in kullamrlar, 9evrelerinden
enerji ozutler ve bu nu biyolojik i~leri yapmak i9in
kullamrlar, biyolojik yap1lan kurmak i9in kompleks
molekuller sentezlerler, i9 ortamlanm duzenlerler
ve birbirleriyle etkile~irler.
Dogal seleksiyon arac11ig1 ile evrim ve genetik kod
arasrndaki ili?kiyi a~1klayrn1z. Bakm1z s. 6-7
• Ni~in bir tOr Ozerinde yaprlan biyolojik ara?trrmalarrn
sonu~larr ~ok farklr ba?ka tUrler i~in genellenebilir?
Bakmrz s. 9

Buraya kadar canlmm temel ozelliklerini genel olarak gozden


gec;irdiniz. Bu kitapta bu ozellikleri derinlemesine ke§fedecek ve
canlillgm ilk kez nasil ve ne zaman ortaya c;Ikhgffil sorgulayabi- 1.7 Fosiller Bize Ge~miljteki Canhlar Hakkmda Bir Fikir Verir
leceksiniz. Bundan sonraki kisrmda, ilk ortaya c;Ikan basit canh Yakla91k 150 milyon y1I once olu:;;mu:;; olan bu fosil, ku:;;lann bilinen en eski
formlanndan ba§layarak, bugiin gezegende ya§ayan kompleks temsilcisi olan Archaeopteryx'e aittir. Ku:;;lar, gunumuzdeki timsahlarla ayni
ve farkh organizmalarm tarihini kisaca ozetleyecegiz. surungen grubundan evrimle:;;mi:;;tir.
10 BOLUM 1 I YA$AMIN <;ALl$1LMASI

Buna gore, Neandertallerle modern insanlar birlikte ym;;aml§ minin bugiinkiinden c;ok farkh olan ozelliklerini dikkate ahnak
olsalar da, bunlar birbirleri ile c;iftle§memi§lerdir. zorunday1z. Biyologlar, kompleks biyolojik molekiillerin ilk
Genel olarak, iki tiiriin genomlan arasmdaki fark ne ka- ortaya c;lki§mm bu ortamdaki kimyasallarm fiziksel olarak_ ras-
dar biiyiikse, bunlarm ortak atalan o kadar uzaktir. Molekiiler gele bir araya gehneleriyle oldugunu varsaymaktad1rlar. Ilkin
tekniklerin kullamlmas1, biyologlarm canhlar hakkmdaki te- Diinya'daki ko§ullan taklit eden deneyler, kompleks molekiil-
mel sorular hakkmda bilgi edinmesini miimkiin kilmaktadir. lerin bu ko§ullar altinda ortaya c;1kmasmm miimkiin oldugu-
ilk canh formlan hangileriydi? Basit organizmalar bugiin ya- nu gostermi§tir. Bununla birlikte canl1larm evrimindeki kritik
§ayan biiyiik canh c;e§itliligini nasil ortaya c;1kardilar? Canhla- basamak, kendilerini c;ogaltabilen ve kompleks ama kararh bi-
rm soyagacm1 olu§turabilir miyiz? c;imlere sahip biiyiik molekiillerin sentezi ic;in kahp olarak i§
Canhlar cans1z materyalden kimyasal evrim ile ortaya garebilecek molekiillerin ortaya c;lkmas1dir. Biiyiik ve kararh
~1km1!lit1r .
olan bu molekiillerin bic;imlerindeki c;e§itlilik (Boliim 3 ve 4' de
tarh§ilan), bunlarm diger molekiillerle artan say1 ve c;e§itlilikte
Jeologlar Diinya'nm 4.6 ile 4.5 milyar y1l once olu§tugunu tah- tepkimede yer almalanm miimkiin kililll§hr.
min etmektedir. Ba§lang1c;ta gezegenimiz ya§am ic;in uygun
degildi. ilk canhlarm evrimle§mesi ic;in 600 milyon yil ya da
daha fazla bir zaman gec;mesi gerekti. Eger Diinya tarihini 30 Hiicresel yap1, canlllarm ortak atasmda evrimle!lmi!ltir
giinliik bir ay gibi resmedersek, ilk canlilar ilk haftanm sonu- Canhhgm ba§lang1cmdaki ikinci kritik basamak, kompleks
na dogru ortaya pkilll§hr ( ~ekil 1.8). biyolojik molekiillerin kendilerini di§ ortamdan ayiran ve bir
Canhlarm cans1z maddeden nas1l olu§tugunu dii§iindiigii- ic; c;evrede bir arada tutan zarlarla c;evrilmesidir. Yag-benzeri
miizde, gene; Diinya'nm atmosferinin, okyanuslarmm ve ikli- molekiiller bu noktada kritik rol oynam1§hr; c;iinkii bunlar
, - - -- - suda c;oziinmez ve zars1 filmler olu§tururlar. Eger bu filmler
I Her "gun" yakla:;;1k 150
milyon y1h temsil etmektedir.
Canl1l1k 5. gun civannda, 4 milyardan
biraz daha az y1I once ortaya 91kt1.
c;alkalamaya tabi tutulursa, biyolojik molekiil birliklerini c;ev-
releyen kiiresel vezikiiller olu§turabilirler. Kimyasal tepkimele-
rin reaktant ve iiriinlerini konsantre eden boyle bir ic; ortamm
yarahlmas1, bu tepkimelerin e§giidiimlii hale getirilebilmesini
2
ve kontrol edilebilmesini olas1 kilar. Kis1m 4.4' de ac;ikland1g1
gibi, bilim insanlan zar olu§umundaki dogal siirecin, ilk hiic-
relerin kendilerini replike edebilme yetenegi -ilk hiicresel or-
ganizmalarm evrimi- ile sonuc;land1gm1 varsaymaktadir.
ilk hiicrelerin ortaya c;1k1§mdan sonraki 2 milyardan fazla
13 14 yil ic;inde, tiim organizmalar sadece tek bir hiicreden ibaret-
FotoseHtezl ti. Birhiicreli bu ilk organizmalar (ve onlardan tiiremi§ olan
evri111l<J111esi
giiniimiizde ya§ayan c;ok say1daki benzer formlan) prokar-
20 21 22 23 24 25 26 yorlardir. Prokaryotik hiicreler, DNA ve diger biyokimyasal
Okaryotik
hllcrelerlM Cok hucrell bile§ikleri c;evreleyen bir zara sahiptir.
evrl111l<J111esi rgaHiz111alar Bu ilk prokaryotlar, okyanuslarda ya§ailll§lardir; c;iinkii
27 28 29 30 hammadde ve enerji kaynag1 olarak kullanabilecekleri komp-
leks molekiiller bu ortamda bol miktarda bulunuyordu. 0
donemde atmosferde c;ok az oksijen (0 2 ) bulundugu ve dola-
/
/
---- y1s1yla koruyucu bir ozon (03) tabakas1 mevcut olmad1g1 ic;in,
/
/
-- okyanus ortaffil bu organizmalan yogun ultraviyole l§mlan-
27 Ilk kara
bltkllerl
28 K61110r-olu~uraM
or111aHlar
29 Ilk kuJlar 30 mn zararh etkisinden korumu§tur.
Sucul YllJalMa
altpok JOceklerlH Ilk plpekll bltkller
sayida fosll yayg1Mi11J111as1
ilk karasal
hayvaMlar Ilk 111e111elller Me111elllerlM ortaya
Fotosentez evrimin yoniinu
VIMozorlanM basklM piic111asi degi!ltirmi!ltir
olduiju evre
ilk prokaryotlar, hiicre metabolizmasma
Homo sapiens (modern insanlar) yakit saglamak iizere dogrudan c;evre-
30. gunun son 5 dakikas1nda ortaya
gunun son birka9 lerindeki molekiilleri alm1§ ve bunlarm
91kt1lar (yakla:;;1k 500.000 y1I once)
saniyesini kapsar. kimyasal baglarmda mevcut enerjiyi kul-
lanmak ic;in bu molekiilleri y1killl§lardir.
Modern prokaryotik tiirlerin birc;ogu
c;ok ba§anh bic;imde halen bu yolu kul-
lanmaktadir. Diinya' daki canhhgm ilk
donemlerinde atmosferde oksijen yoktu.
1.8 Canhlann Takvimi Yeryuzu tarihini 30 Aslma bak1hrsa, oksijen o donemde varo-
gunluk bir ay iili;;eginde giistermek, evrimsel lan canlilar ic;in toksikti.
zamani daha iyi anlamaya olanak verir.
1.2 DUNYA UZERiNDEKi TUM CANLILAR BiRBiRLERiYLE NASIL AKRABADIR? 11

Okaryotik hucreler prokaryotlardan evrimle1?m i1?tir


Canhhk tarihindeki bir diger onemli basamak, ozelle§mi§
hiicresel i§levleri gerc;ekle§tirme yetenegine sahip organel ad1
verilen hiicre-ic;i boliimlerin evrimle§mesidir. Bu olay Diinya
tarihini gosteren takvimimizde (bak1mz $ekil 1.8) yakla§ik
iic;iincii haftada gerc;ekle§mi§tir. Bu organellerden biri, yo-
gun-goriiniimlii 9ekirdektir (=nucleus sozciigii Latince' de "c;e-
kirdek" anlamma gelen nux sozciigiinden tiiretilmi§tir). Bu
yap1 hiicrenin genetik bilgisini ic;erir ve okaryotlarm ( =eukar-
yotes) ad1 buradan kaynaklamr (Yunanca eu "gerc;ek"; karyon
"kernel" ya da "c;ekirdek" demektir) . Okaryotik hiicre, c;ekir-
dek ve ic; bolmeler ic;ermeyen prokaryotik (pro, "once" demek-
tir) hiicrelerden tamamiyle farkhdir.
Baz1 organellerin endosimbiyozis ile ortaya c;1khg1 varsa-
yilmaktadir. Endosimbiyozis hiicrelerin daha kiic;iik hiicre-
leri ic;ine almas1 demektir. Hiicreye enerji iireten mitokondri
muhtemelen daha biiyiik hiicre ic;ine hapsedilen prokaryo-
350 µm tik organizmalardan evrimle§mi§tir. Kloroplastlar -fotosentezi
gerc;ekle§tirmek ic;in ozelle§mi§ organeller- ise, daha biiyiik
1.9 Fotosentetik Organizmalar Dunya'mn Atmosferini Degi~tirdiler
Buradaki ipliksi yap1 lar, gok say1da siyanobakteri hucresinden olu9ur. okaryotlann fotosentetik prokaryotlan ic;ine almasmdan kay-
Gunumuzde ya9amakta olan bu tUr (Oscillatoria tenuis) Dunya'nin atmos- naklanm1§ olabilir. Eger biiyiik hiicre besin olarak ic;ine ald1g1
ferinde oksijen birikiminden sorumlu olan ilk fotosentetik prokaryotlara gok bu objeyi y1kmay1 ba§aramarm§sa, hiicre ic;ine alman prokar-
benzer olabilir. yotun fotosentez iiriinlerini saglad1g1, konakc;1 hiicrenin ise
kiic;iik partneri ic;in iyi bir ortam saglad1g1 bir ortakhk evrim-
le§mi§ olabilir.
Yakla§ik 2,7 milyar y1l once fotosentezin evrimi Diinya iize-
rindeki ya§amm niteligini degi§tirdi. Fotosentez siirecindeki
kimyasal tepkimeler, giine§ l§lgllln enerjisini biiyiik molekiil- <;ok hucrelilik ortaya 91km11? ve hucreler ozelle1?mi1?tir
lerin sentezine giic; saglayan biyolojik enerjiye c;evirir (bakimz Yakla§ik olarak bir milyar y1ldan daha oncesine kadar, mevcut
Boliim 10). Bu biiyiik molekiiller, hiicrelerin yap1ta§landir ve organizmalann tiimii -prokaryotik ya da okaryotik- birhiicre-
metabolik enerji saglamak iizere y1kilabilirler. Fotosentezin liydi. Baz1 okaryotlarm hiicre boliinmesinden soma aynlama-
enerji-yakalama siirec;leri diger organizmalar ic;in besin sagla- y1p, bir arada kalmas1yla onemli bir evrimsel basamak gerc;ek-
d1g1 ic;in, bu siirec; bugiin de yeryiiziindeki ya§amm temelini le§ti. Kahci hiicre birlikleri, baz1 hiicrelerin belirli i§levler ic;in
olu§turur. 1 ozelle§mesini olas1 kilm1§hr. Bu hiicrelerden bazilan iiremek,
ilk fotosentetik hiicreler muhtemelen giiniimiizde ya§ayan digerleri ise ornegin besinleri absorbe ederek kom§U hiicrelere
prokaryotlar olan siyonobakterilere benziyorlard1 ( ~ekil 1.9). dag1tmak iizere ozelle§mi§tir. Hi.icre ozelle!?mesi c;ok hiicreli
Zaman ic;inde fotosentetik prokaryotlann say1s1 artml§ ve fo- okaryotlarm boyutlarmm artmasma, kaynaklan daha etkin
tosentezin yan-iiriinii olarak bol miktarda iiretilen 0 2 yava§ elde etmelerine ve ozel c;evrelere adapte olmalarma olanak
yava§ atmosferde birikmeye ba§laml§hr. 0 donemde ya§ayan vermi§tir.
birc;ok prokaryot ic;in oksijen zehir etkisi yap1yordu. Ancak
oksijenin varhg1 evrim siirecinde c;ok yeni yollar ac;hg1 ic;in,
oksijeni tolere edebilen organizmalar c;ogalabildiler. Aerobik Biyologlar canhlann evrimsel agac1m izleyebi lirler
metabolizma (0 2 'nin donii§tiiriilmesine dayanan enerji iireti- Eger bugiin Diinya iizerinde varolan tum organizma tiirleri,
mi) anaerobik (0 2 kullanmayan) metabolizmadan daha etkindir yakla§1k olarak 4 milyar once ya§am1§ tek tip birhiicreli bir
ve giiniimiizde Di.inya' da mevcut organizmalann c;ogunlugu organizmanm soylan ise, nas1l bu kadar farkh olabilmi§lerdir?
tarafmdan kullamlmaktadir. Aerobik metabolizma hiicrelerin Bu soruya verilecek basitle§tirilmi§ cev ap §Udur: Bir populas-
daha fazla biiyiimesine olanak verir. yondaki bireyler birbirleriyle c;iftle§tikleri siirece, populasyon
Atmosferde oksijen bulunmas1, canhlarm karalara yerle§- ic;inde yap1sal ve i§levsel degi§iklikler evrimle§ebilir; ancak
mesine de olanak vermi§tir. Canhhk tarihinin c;ok biiyiik bir bu populasyon tek bir tiir olarak kahr. Buna kar§1hk eger po-
kismmda Diinya iizerine dii§en ultraviyole (UV) radyasyonu, pulasyonun baz1 iiyelerini digerlerinden izole edecek bir olay
canhlarm suyun koruyucu kalkam di§mda ya§amalarma izin gerc;ekle§irse, iki grup arasmdaki yap1sal ve i§levsel farkhhk-
vermeyecek kadar yogundu. Fotosentetik olarak iiretilen ok- lar zaman ic;inde birikir. Bu iki grubun iiyeleri birbirleri ile
sijenin 2 milyar y1ldan fazla siiren bir donem ic;inde atmosfer- c;iftle§emeyecekleri bir noktaya kadar farkhla§abilir ve arhk
de birikmesi, list atmosferde a§amah olarak bir ozon tabakas1 iki ayn tiir haline gelirler. Tiirle~me ad1 verilen bu evrimsel sii-
olu§turdu. Yakla§ik 500 milyon yil once, ozon tabakas1 UV reci, Boliim 23' de tarh§acag1z.
radyasyonunu yeteri kadar emebilecek yogunluga ula§ml§ ve Biyologlar her ti.ire Latince iki kelimeden olu§an (binomi-
boylece organizmalarm suyun koruyucu ortamm1 terk ederek al) bilimsel adlar verirler. ilk kelime tiiriin dahil oldugu cinsi
karalar iizerinde ya§amalan miimkiin olmu§tur. -en yakm ortak atay1 payla§an tiirlerin olu§turdugu grubu-
12 BOLUM 1 I YA$AMIN <.;ALl$1LMASI

tammlar. ikinci kelime ise tiir ad1dir. Ornegin insan tiiriiniin davran1§ ve genomlarm molekiiler analizlerinden elde edilen
bilimsel ad1 Homo sapiens' dir. Homo bizim cinsimiz, sapiens ise c;:ok geni§ bir veri tabanma dayanmaktadir. Molekiiler veriler,
tiiriimiizdiir. Homo Latince "adam"; sapiens ise Latince "akilh" agac1 Archaea, Bacteria ve Eukarya olmak iizere iic;: ana doma-
ya da "mantikh" anlammdaki sozciiktiir. ine (domain sozciigii domeyn olarak okunur) ayirmak iizere
Bugiin Diinya iizerinde on milyonlarca tiir ya~;amaktadir. kullanilmi§hr. Her domeyndeki organizmalar diger domeyn-
Bu saymm birkac;: kah kadar tiir, gec;:mi§te ya§am1§ ve soylan dekilerden bir milyardan fazla yildan beri ayn olarak evrim-
tiikenmi§tir. Milyonlarca tiirle§me olay1, bu biiyiik c;:e§itliligi le§mektedirler.
yaratm1§hr. Bu olaylarm ac;:1klamas1 evrimsel "agac;:" halinde Archaea ve Bacteria domeynlerindeki organizmalar, bir-
c;:izilebilir. Bu agacm dallan, Boliim 22' de ac;:1klanacag1 gibi, hiicreli prokaryotlardir. Bununla birlikte, bu iki grubun iiyele-
populasyonlann birbirlerinden aynlarak yeni tiirlere evrim- ri metabolik siirec;:leri ac;:1smdan c;:ok temel farkhhklar ta§1rlar
le§me s1rasm1 belirtmektedir. Biyolojinin biiyiik bir kism1, ve bunlarm c;:ok erken donemde ayn evrimsel hatlar halinde
tiirler arasmda kar§1la§hrmalar yapma temeline dayamr. Bu farkhla§hklanna inamlmaktadir. Oc;:iincii domeyne -Eukarya-
kar§1la§hrmalar c;:ok kullam§hdir; c;:iinkii tiirleri evrimsel bag- ait olan tiirler okaryotik hiicrelere sahiptir ve bu hiicrelerin
lamda birbirlerine gore yerle§tirmemizi saglar. Bunu yapabil- mitokondri ve kloroplastlan sayfa ll'de ac;:1kland1g1 gibi, pro-
me yetenegimiz, son on y1llarda dizi analizi yaparak, farkh karyotik hiicrelerden kaynaklanmaktadir.
tiirlerin genomlanm kar§lla§hrmay1 ba§armam1z ile biiyiik <:;ok hiicreli okaryotlarm ii<; temel grubunun -bitkiler,
olc;:iide artml§hr. mantarlar ve hayvanlar- her biri, genellikle Protista olarak ifa-
Genom dizisini saptama ve diger molekiiler teknikler, sis- de edilen farkh bir okaryot grubundan evrimle§mi§tir. Bitki-
tematik9ilerin -farkh organizmalann evrimini ve sm1flandir- lerin atas1 olan kloroplast-ic;:eren fotosentetik birhiicreli, hem
masm1 c;:ah§an bilim insanlan-evrim hakkmda fosil kay1tlan- hayvanlann hem de mantarlarm atas1 olan birhiicrelilerden
na dayanan bilgilerini c;:ok say1da molekiiler kamtla giic;:len- tamamen farkhdir. $ekil l.lO'daki §ema bu durumu goster-
dirmelerine olanak saglarm§hr. Bunun ortaya c;:1kard1g1 sonuc;:, mektedir. Protista iiyelerinin c;:ogu birhiicreli olmasma (ve bu
giderek dallanan canhlann soyagacmm bir parc;:as1 olan ve nedenle zaman zaman mikrobiyal okaryotlar olarak adlandml-
evrimsel akrabahklan diyagram halinde gosteren jilogenetik malarma) kar§m, c;:ok hiicrelilik c;:e§itli protista soy hatlan ic;:e-
aga9larm yeni bilgilerle siirekli olarak geni§letilmesi olmu§tur. risinde ortaya c;:1km1§hr.
~ekil 1.10 canhlann soyagacmm en geni§ kategorilerini gos-
termektedir. (Bu agac;: kitabm Ek kismmda geni§letilmi§ ola- Canhlarm soyagac1, tahmin yapmaya elveri§lidir
rak verilmi§tir; agac1 aym zamanda interaktif olarak http:/ I
tolweb.org/tree adresinde bulabilirsiniz.) Diinya iizerinde ya§ayan tiirler, biyologlarm bugiine kadar
Halen birc;:ok ayrmh ortaya c;:1kanlmay1 bekliyor olsa da, ke§fedip tammlad1klanndan c;:ok daha fazladir. Gerc;:ekten de,
canhlann soyagacmm ana hatlan saptanmi§hr. Agacm dal- Diinya iizerindeki tiirlerin pek c;:ogu heniiz insanlar tarafm-
lanma §ekli fosillerden, yap1lardan, metabolik siirec;:lerden, dan ke§fedilmemi§tir (bunu nereden bildigimiz konusundaki

r-End~~im-biyotik b~~erile;-J r~Endosimbiyotik fotosen- J Bilinen (tanim-


lanm19) tUrlerin
Ya:;;ayan turlerin
tahmini
1 bkaryotlann mitokondrileri bakteriler kloraplastlar j'
~~~-~ .~eldiler. ____ _ __
I tetik
haline geldiler
say1s1 toplam say1s1
'-~ -- -- -- - -- -

10,000 Milyon

1,000-
260
1 milyon
Canhl1k
400,000-
270,000
Bitkiler 500,000

Protista

Protista
1.10 Canhlarm Soyagac1 Bu kitapta kullanilan
s1nifland1rma sistemi , Dunya'daki organizmalan
Protista 500,000-
Lie;: domaine ay1nr: Bacteria, Archaea ve Eukarya. 80,000
Eukarya ic;:indeki en koyu mavi renkte gosterilen dal-
1 milyon
lar, yayg1n adlanyla "protista" olarak bilinen mikro- Protista
biyal okaryot gruplanni temsil etmektedir. Herhangi
bir daldaki organizmalar, ortak bir atay1 payla91rlar.
Bu kitapta zamani soldan saga dogru akan :;;ekilde Protista
gostermeyi benimsedik. Dolay1s1yla bu agac;: (ve
kitaptaki diger agac;:lar), koku -ortak ata- solda yer Protista
alacak :;;ekilde yerle:;;tirilmi:;;tir.
10 milyon-
1,300,000 100 milyon
- - - - yourBioPortal.com - - - - EUKARYA
ZiYARET EDiNIZ Web Aktivitesi 1.2 • Temel 98,000 1-2 milyon
Organizma Gruplan Funguslar
1.3 i BiYOLOGLAR CANLILARI NASIL ARA$TIRIR? 13

bir tarh§ma ic;in Kls1m 32.4'e bakimz). Yeni bir tilr ile kar§1- biraz daha uzag1 gorebildiysem, bunu ancak devlerin omuzla-
la§hg1m1zda, onun canhlann soyagac1 ilzerine yerle§tirilmesi n ilzerinde durarak yapabildim." Bizler de devlerin omuzlan
bize onun biyolojisi hakkmda c;ok §ey anlahr. Buna ek olarak, ilzerinde duruyor ve daha onceki bilim insanlannm ara§hr-
turler arasmdaki ili§kilerin anla§1lmas1, biyologlarm henilz malan ilzerine yenilerini ekliyoruz. Bu ders kurunun sonun-
uzerinde c;ah§ma yap1lmaml§ tilrler hakkmda tahminler yap- da, evrim hakkmda Darwin' in bildiginden, hilcreler hakkmda
masma izin verir; bu tahminler daha once c;ah§ilm1§ tilrler da Schleiden ve Schwann'm bildiginden bile fazla §ey biliyor
hakkmda edinilen bilgilere dayamr. olacaksm1z. $imdi biyologlann canhhk hakkmdaki bilgileri
brnegin, filogenetik yontemler geli§tirilmeden once, yeni geni§letmek ic;in kulland1klan yontemlere bakahm.
kar§ila§Ilan insan patojenlerini izole etmek ve tammlamak,
yillar silren ara§hrmay1 gerektiriyordu. Bunlarm insan popu-
lasyonlarma nas1l katild1g1m bulmak ise daha da uzun zaman
ahyordu. Gunumuzde, ornegin grip gibi hastahklara neden
1.3 1yologlar Canhlar as1I Ara~
Ara§hrmalarda kullamlan farkh birc;ok arac; ve yontem bir
rr
olan patojenlerin evrimsel akrabahklan temel almarak ko-
yana, tum bilimsel c;ah§malar gozlem ve deneye dayamr. Her
layca tammlanmas1 milmkiln olmaktad1r. Hastahk etmeninin
ikisinde de bilim insanlanna kilavuzluk eden §ey, modern bi-
evrimsel agac; ilzerindeki yeri, bize hastahgm biyolojisi, milm-
limin en guc;lil arac;lanndan biri olan bilimsel yontemdir.
kiln olan etkin tedaviler ve patojenin orijini hakkmda da bilgi
vermektedir (bakm1z Bolilm 21 ve 22).
Gozlem onemli bir yetenektir
Biyologlar daima c;evrelerindeki dunyay1 gozlemlerler; an-
Dunya uzerindeki ilk hucreler olan prokaryotlar, cak gunilmilzdeki gozlem olanaklan, elektron mikroskoplar,
yakla:?1k olarak 4 milyar y1I once ortaya 91km1:?tir. DNA c;ipleri, manyetik rezonans gCirilntilleme ve global ko-
Bugun ya:?ayan organizmalarm kompleksligi foto- num saptamaya yarayan uydular gibi teknolojilerle bilyilk
sentezin, okaryotik hucrelerin ve 9ok hucrelilerin olc;ude artm1§hr. Bu teknolojiler molekilllerin vilcut ic;indeki
evrimle:?mesini de i9eren bir dizi onemli evrimsel dag1hmmdan bahklarm okyanustaki dag1hmlanna kadar her
olaym sonucudur. Tum organizmalann genetik duzeydeki dag1hmlan gozlemleme olanagm1 geli§tirmi§tir.
akrabahg1, dallanan bir hayat agac1 :?eklinde gos- Ornegin, yakm gec;mi§te deniz biyologlarmm okyanus ic;inde-
terilebilir. ki bahk hareketini gozlemlemesi, sadece fiziksel olarak mar-
Fot osentezin evrimsel onemini tart1?m1z. Bakm1z s. 10- kalama, serbest birakma ve bir bahkc;mm bu bahg1 yakalad1k-
11 tan soma markay1 geri gondermesini -ki bu sadece bahgm son
Canlllarm dahil oldugu domeynler neyi temsil eder? olarak nerede oldugunu ac;1klayabilir- limit etmek §eklindey-
Temel okaryot gruplan, hangileridir? Bakm1z s. 12 ve di. Bugiln bahga elektronik kay1t cihaz1 takabiliyor ve bahgm
sadece nerede oldugunu degil, ne kadar derinde yuzdilgilnil,
~ekil 1.10
c;evresindeki suyun s1cakhgm1 ve tuzululugunu silrekli olarak
Robert Hooke, $ubat 1676'da, fizikc;i Sir Isaac Newton'dan bir kaydedebiliyoruz ($ekil 1.11 ). Bu kay1t cihaz1 elde ettigi bilgi-
mektup aldi. Bu mektupta Newton §Unu soylilyordu: "Eger yi uyduya gondermekte, uydudan da bilim insanlanna ula§h-
nlmaktadir. c;:ok k1sa zamanda okyanuslardaki can-
hlarm dag1hm1 hakkmda bilgi ediniyoruz -bu bilgi,
iklim degi§ikligi c;ah§malan ile ilgili de olabiliyor.
Gozlemleri niceliksel olarak analiz edebilen tek-
nolojiler, bilim ac;1smdan c;ok onemlidir. Ornegin,
canh tilrleri yuzy1llar boyunca genellikle aralarmda-
ki fiziksel farkhhklarm niteliksel betimlemeleri ara-
c1hg1 ile sm1flandmldilar. Organizmalar arasmdaki
evrimsel uzakhklan objektif olarak hesaplayabile-
cek bir yol olmad1g1 ic;in, biyologlar fosil kay1tlanna
ba§vurmak zorundaydi. Bugiln DNA dizilerini h1zla
analiz edebilmemiz sayesinde, bu kitabm Be§inci ve
Altmc1 Onitelerinde ac;1klanan evrimsel uzakhklar
hakkmda niceliksel tahminler yapabiliyoruz. Ni-
celiksel gozlemler yapabilme olanag1, biyologlarm
guc;lu sonuc;lar c;1karabilmesine bilyilk katk1lar yap-
mi§hr.

1.11 Tonbahgmm izlenmesi Deniz biyologu Barbara Block,


bilgisayar verilerini kaydeden etiketleri can l1 bir maviyuzgec;li
tonbal1 g1na takt1ktan sonra bal1g1okyanusa geri b1rakacak. Bu
gibi etiketler, o birey dunyadaki okyanuslarda nereye giderse
gitsin, izlenmesine olanak saglar.
14 BOLUM 1 ' YA$AMIN QALl$1LMASI

Bilimsel yontem gozlem ile mant1g1 birle~tirir azald1gm1 gozlemlediklerini ve bunun nedenini sorduklarm1
ogrendiniz. Baz1 bilim insanlan nedenin fungal bir hastahk,
Gozlemler yeni sorulara yol ac,;ar; bilim insanlan da bu sorula-
digerleri ise ultraviyole radyasyonuna maruz kalmadaki ar-
n cevaplayabilmek ic,;in yeni gozlemler ve deneyler yaparlar.
h§ oldugu hipotezini ileri surdu. Tyrone Hayes'in hipotezine
Modern bilimsel ara§hrmalarm temelini olu§turan kavramsal
gore neden, tanmsal kimyasallara maruz kalmaydi. Hayes en
yakla§1m bilimsel yontemdir. Hipotez-tahmin yontemi olarak da
yaygm olarak kullamlan kimyasal herbisitin atrazin oldugu-
adlandmlan bu guc,;lu arac,;, be§ basamak ic,;erir: (1) gozlemler
nu, bunun en c,;ok amfibilerin c,;iftle§me mevsimi olan ilkbahar-
yapmak; (2) sorular sormak; (3) hipotezler olu§turmak ya da
da uyguland1gm1 ve atrazinin amfibilerin ya§ad1g1 ve ergin
sorulara gec,;ici cevaplar vermek; (4) hipotezlere dayanarak
hale geldigi sulardaki en yaygm kirletici oldugunu biliyordu.
tahminler yapmak ve (5) ek gozlemler yaparak ya da deneyler
Bilimsel yontemdeki bir sonraki basamak, hipoteze daya-
tasarlayarak tahminleri test etmek ($ekil 1.12).
nan tahminler yapmak ic,;in farkh bir manhk §ekli-tiimevarzmcz
Bilim insanlan bir soru sorduktan sonra, gec,;ici bir cevap
mantzk- uygulamakhr. Tumevanmc1 manhk, gerc,;ek olduguna
onermek i.c,;in tiimdengelimci mantzgz kullamr. Tumdengelimci
inamlan bir kararla ba§lar ve bu kararla uyumlu ba§ka hangi
manhk, gozlemleri ya da gerc,;ekleri dikkate almay1 ve bu goz-
gerc,;ekler oldugunu tahmin etmekle surer. Bu hipotezine da-
lemler ya da gerc,;eklerle uyumlu yeni bir oneri olu§turmay1
yanarak, Tyrone Hayes atrazine maruz kalan kurbaga iriba§
ic,;erir. Bu gec,;ici oneri hipotez olarak adlandmhr. Bilim insan-
larvalannm erginlige eri§tiklerinde bu kimyasalm olumsuz
lan hipotez olu§tururken, sorduklan soruya bir ya da birkac,;
etkilerini sergileyecegini tahmin etti.
muhtemel cevap fomule etmek ic,;in halihazirda bildikleri ger-
c,;ekleri bir araya getirirler. Ornegin, bu bolumiin ba§mda bilim
insanlannm tum Dunya' daki amfibi populasyonlannm hizla iyi deneyler hipotezlerin yanh~llg1m ortaya 91karma
potansiyeline sahiptir
Bir hipotezden yola c,;1karak tahminler yap1ld1gmda, bu tah-
1. Gozlemler yapmak. minleri test edecek deneyler tasarlanabilir. En fazla bilgi veren
deneyler, tahminin yanh§ oldugunu gosterme yeteneginde
l
2. Spekulasyon yapmak ve
olanlardir. Eger tahmin yanlI§Sa, hipotez sorgulamr, degi§ti-
rilir ya da reddedilir.
bir soru sormak. iki genel deney tipi vardir ve bunlarm her ikisi de farkh
omeklerden ya da gruplardan elde edilen verileri kar§ila§hnr.
Kontrollu deneyde, test edilen fakti:irlerden biri ya da daha c,;ogu
Yeni sorular
sormak
--+ 3. Soruyu cevaplamak
ir;;in bir hipotez olu:;;turmak.
+-- Hipotezi gozden
ger;;irmek
degi§tirilir; kar§zla§tzrmalz deneylerde ise, farkh kaynaklardan
toplanan degi§tirilmemi§ veriler kar§ila§tmlir. Bu bolumun ba-

l
4 . Bir tahmin yapmak : Eger hipoteziniz
§mda ac,;1kland1g1 gibi, Tyrone Hayes ve arkada§lan, bir herbisit
olan atrazinin tiim Diinya' daki gol ve akarsulardaki kirletici ol-
duguna ve kurbagalann geli§imini etkiledigine ait tahminlerini
dogru ise, ba:;;ka hangi dogrular olmal1d1r? test etmek ic,;in, her iki tip deneyi de kulland1lar.
Bir kontrollu deneyde, mumkun oldugu kadar benzer olan
l Kontrol
gruplar ya da omeklerle i§e ba§lanz. Hipotezimizi temel ala-
rak, kritik bir faktoriin ya da degi!ikenin ara§hrd1g1rmz olay
5. Tahmininiz1 test etmek edilmeyen
ir;;in , olr;;ule.bilen verileri ... degi:;;kenler ir;;in uzerinde bir etkisi olup olmad1gma ili§kin bir tahmin yapanz.
kullanan b1r deney deneyi yeniden "Deney" grubundaki sadece bir degi§keni degi§iklige ugratacak
tasarlamak ve uygulamak. gozden ger;;irmek
bir yontem geli§tiririz ve bunun sonucunda elde edilen ve-

l
Sonur;;lann 6nemini degerlendirmek
rileri, degi§tirilmemi§ degi§ken ile "kontrol" grubundan elde
edilen verilerle kar§ila§hnnz. Eger tahmin edilen farkhhk ger-
c,;ekle§irse, bu fark1 yaratan etmenin degi§ken oldugu (§ansa
i9in istatistiksel testier kul lanmak.
bagh rasgele bir fark olmad1g1) ihtimalini dogrulamak ic,;in,

l l istatistiksel testler uygulanz. $ekil 1.13 Hayes'in laboratuva-


rmda atrazinin erkek kurbagalar uzerindeki etkilerini nicelik-
Onemli sonu9lar Sonur;;lar hipotezi sel olarak ortaya c,;1karmak ic,;in gerc,;ekle§tirilen c,;ok say1daki
hipotezi destekler. desteklemez. kontrollu deneyden birinin sonuc,;larm1 gostermektedir.
Kontrollu deneylerin temeli, degi§kenlerden biri haric,; di-
l
Deney tekrarlanir ve sonu9lar
gerlerinin sabit tutulmasma dayarur. Degi§tirilen degi§ken ba-
gzmszz degi§ken olarak adlandirilir, buna cevap olarak olc,;illen
ba:;;ka ara:;;t1nc1lar taraf1ndan nicelik ise bagzmlz degi§kendir. iyi bir kontrollu deney tasarlamak
dogrulanir.
kolay degildir; c,;iinku biyolojik degi§kenler birbirleri ile c,;ok ic,;
ic,;e olduklarmdan, bunlardan sadece birini degi§tirmek zordur.
1.12 Bilimsel Yontem Gozlem, spekulasyon, hipotez, tahmin ve deney Kar!illa!it1rmah deney, hipoteze dayanarak omekler ya da
sureci modem bi limin temel ta91d1r. Deney ile elde edilen cevaplar yeni gruplar arasmda bir fark olacag1 tahmini ile ba§lar. Bununla
sorulara, ba:;;ka hipotezlere, daha ileri deneylere yol a9ar ve bilgiyi geni:;;-
birlikte, kar§Ila§hrmah deneylerde degi§kenleri kontrol ede-
letir.
meyiz, hatta s1khkla mevcut degi§kenlerin tiimiinu tamm-
1.3 • BiYOLOGLAR CANLILARI NASIL ARA$TIRIR? 15

layamay1z. Yaphg1rmz :;;ey basit<;:e farkh ornek gruplanndan


YA$AMI ARA$TIRMAK veri toplamak ve kar:;;1la:;;brmakhr.
Hayes ve arkada:;;larmm yapbg1 kontrollu deneyler atra-
1. 13 Kontrollu Deneylerde Degi§ken Degi§tirilir zinin gen;:ekten kurbagalarm i.ireme geli:;;imlerini etkiledigini
Hayes ve ara:;;t1rma grubu laboratuvarda sadece sudaki gosterdiginde, bu ara:;;tmc1lar bir kar:;;ila:;;tirmah deney yaph-
atrazin konsantrasyonlan ai;;1s1ndan farkl1l1k ta:;;1yan kontrollu lar. Bunun i<;in Amerika Birle:;;ik Devletleri'ndeki birbirinden
ortamlar olu:;;turdu. Ozel olarak laboratuvarda kullanilmak
uzere yeti:;;tirilen leopar kurbagas1 ((Rana pipiens) yumurtalannin uzak sekiz bolgeden kurbaga ve su ornekleri topladilar ve <;ok
ai;;1lmas1na izin verildi ve iriba:;;lar farkl1 konsantrasyonlarda farkh atrazin di.izeylerine sahip <;evrelerden gelen anormal
atrazin ii;;eren deney tanklanna konulmak uzere aynld1. kurbagalan kar:;;1la:;;tird1lar ($ekil 1.14). Hi<; ku:;;kusuz, ornek-
------- leme bolgeleri hem atrazin miktarlan hem de diger bir<;ok a<;1~
dan fark1hhklar ta:;;1yordu.
Larva geli~imi sirasmda atrazine maruz kalmak,
Deneylerin bulgulan s1khkla hipotezin onerisinden daha
kurbagalann ureme sistemlerinde anomalilere
neden olur.
karma:;;1k bir durum ortaya <;1kanr ve dolay1s1yla yeni sorula-
ra neden olur. Ornegin, Hayes'in deneylerinde mevcut atra-
zin miktarz ile anormal kurbagalann oram arasmda dogrudan
1. Sudaki atrazin konsantrasyonu harii;; diger butUn bir ili:;;ki olduguna ili:;;kin kesinlik yoktu: en yuksek atrazin
ko:;;ullann sabit tutuldugu 9 tank kullanild1. 3 farkl1 konsantrasyonlarmdaki anormal kurbagalarm oram, du:;;uk
atrazin ko:;;ulu olu:;;turuldu (her bir ko:;;ul ii;;in ui;;
tark kullanild1): 0 ppb (kontrol ko:;;ulu), 0.1 ppb atrazin konsantrasyonlarmdakinden daha azdi. Bilimde "ni-
ve 25 ppb . hai cevaplar" yoktur. Ara:;;hrmalar daima bekledigimizden
2. Laboratuvarda ai;;1lan yumurtalardan i;;1kan daha karma:;;1k bir durum oldugunu ortaya <;1kanr. Bilimsel
Rana pipiens larvalan 9 ayn tanka konuldu (ui;; yontem, bu kompleksligi tammlamak, degerlendirmek ve an-
tekrann her biri ii;;in 30 iriba:;;) lamak i<;in bir ara<;hr.
3. iriba:;;lar, ergin hale geldiginde hayvanlar
oldurulerek, ureme dokulan incelendi. - - - - - - - yourBioPortal.com - - - - - - -
4. Erkek kurbagalann ureme sistemlerinde saptanan ZIYARET EDINIZ Animasyonla Ogrenme 1.1 • Bilimsel Yontem
anomalilerle, atrazine maruz kalma derecesi
aras1ndaki korelasyon ii;;in test yap1ld1.
istatistiksel yontemler gok gerekli bilimsel ara9lard1r
ister kar:;;ila:;;tumah ister kontrollu deney yapahm, sonunda
Normal boyutlardaki ornekler, bireyler, gruplar ya da populasyonlar arasmda bir
1:11J ©llb1iJ Anormal testis
' testis ir;:inde oosit (yumurta) fark olup olmad1gma karar vermek zorunda kalmz. Ol<;i.ilen
olu:;;umu (cinsiyet degi:;;ikligi) bir farkm hipotezi destekleyip desteklemedigine nas1l karar
geli:;;imi
veririz? Diger bir deyi:;;le, ol<;i.ilen farkm onemli olduguna ob-
jektif olarak nasil karar veririz?
Farkm onemli olup olmad1g1, istatistiksel yontemlerle 61-
<;illebilir. Bilim insanlan istatistigi kullamr; <;ilnki.i herhangi
bir i:il<;ilm setinde daima degi:;;kenlik oldugunu bilirler. istatis-
tiksel testler, bir deneyde gozlenen farkm rasgele degi:;;iklik-
ten kaynaklanma ihtimalini hesaplar. Dolay1s1yla, istatistiksel
testlerin sonu<;lan ihtimallerdir. Bir istatistiksel test, bir s1f1r
Hatal1 gonad geli:;;imi I

hipotez ile ba:;;lar. S1fir hipotezi, herhangi bir fark olmad1g1
~ •
Testiklerde yumurta
~ geli:;;imi hakkmda bir onkabuldi.ir. Niceliksel gozlemler yani veriler
'§5 ~ 40 C,,--~'---'~-----' ( Kontrol ko:;;ulunda
:::= >O)
l topland1gmda, istatistiksel yontemler sifu hipotezinin dogru
ro ro sadece bir erkek
E -2 anomali ta:;;1yordu. olma ihtimalini hesaplamak i<;in uygulanu.
0 :J
ffi ~ 20 istatistiksel yontem bize, hi.iki.imsi.iz hipotez dogru olsa
u <D bile, aym sonu<;lan :;;ans eseri elde etme ihtimalinin ne oldu-
ro .Ye
§ CB gunu soyler. Verilerde gori.ilen farkhhklarm test edilen ornek-
(') c
~ 0 lerdeki rasgele varyasyonun sonucu olma :;;ansrm mfunki.in
0.1 25 0.0
E ~ Kontrol oldugunca elimine etmemiz gerekir. Eger istatistiksel testler
Atrazin (ppb) hata olaszlzgznm (yani aym sonucun :;;ans eseri elde edilebilme
ihtimalinin) yi.izde 5 ya da altmda oldugunu gosteriyorsa, bi-
0.1 ppb gibi i;ok du~uk atrazin konsantrasyonlanna lim insanlan genellikle ol<;ti.ikleri farkm onernli oldugu sonu-
maruz kalmak bile kurbagalarm erkek ureme cuna vanrlar.
sistemlerinde anomalileri indukler. Bu etki atrazine
maruz kalma duzeyi ile orant1h degildir. Sorgulama bi9imlerinin hepsi bilimsel degildir
Bilim, belirli uygulama standartlan ile sm1rlandmlm1:;; olan
Orijinal almt1lar, tarh~malar ve YASAMI ARASTIRMA
biricik insan faaliyetidir. Ba:;;ka baz1 alanlar da gozlem yapma
~ekilleri ile ilgili baglanhlar i<;in
ve soru sorma gibi uygulamalan bilimle payla:;;makla birlik-
yourBioPortal.com sitesini ziyaret ediniz. te, bilim insanlan, gozlemleri ile ne yapacaklan ve sorduklan
16 BOLUM 1 YA$AMIN QAL1$1LMASI

dan gozlemler ve deneylerle reddedil-


YA$AMI ARA$TIRMAK me potansiyeline sahip olmak zorundadzr.
Bilim insanlan, hipotezleri test etmek
1.14 Kar§lla§t1rmah Deneyler Gruplar Arasmdaki Farklan Ara§tmr i<;in kulland1klan yontemleri a<;1k<;a
Hayes ve arkada9lan, atrazin varl1g1 ile erkek kurbagalann ureme sistemlerindeki tammlamak zorundad1rlar. Boylece, di-
anomaliler aras1nda bir korelasyon olup olmad1g1n1 anlamak igin, Amerika Birle9ik ger bilim insanlan da onlarm bulduk-
Devletleri'ndeki degi9ik bolgelerden kurbaga ve SU omekleri toplad1lar. Bunu izleyen lan sonu<;lan tekrarlayabilirler. Tiim
analizler s1ras1nda, kurbagalar ve su omekleri kodlanm19 oldugu igin, ara9tmc1lar analiz deneyler her zaman tekrarlanmaya
ettikleri omegin hangi bolgeden geldigini bilmeksizin 9al19t1lar.
uygun olmayabilir, ancak §a§irhc1 ya
da tarh§mah sonu<;lar daima bag1ms1z
Su ortamlannda atrazin herbisitinin varhg1 ile kurbaga populasyonlanrnn dogrulanmaya tabi tutulabilir. Biitiin
i.ireme sistemlerindeki anomaliler arasmda korelasyon vard1r. bilim insanlan, hipotezleri test etmek
ve reddetmek i<;in uygulanan bu siire<;-
1 . Ticari olarak atrazin sat19lan goz onune al1narak, bu herbisit ile en az leri kullamr ve bilimsel bilgiye bu yolla
kontamine olma ihtimali olan 4 bolge (1-4 no'lu bolgeler) ve en fazla katk1 saglarlar.
kontamine olma ihtimali olan 4 bolge (5-8 no'lu bolgeler) segildi.
Eger bilimsel yontemleri ogrenir-
2. TUm bolgeler ilkbaharda ziyaret edildi (kurbagalann iriba9 evresinden ergin
forma d6nu91Ugu donem); kurbaga ve su omekleri topland1. seniz, bilimi bilim olmayandan ayirt
3. Kurbagalar laboratuvarda olduruldu ve ureme dokulanndaki anomaliler edebilirsiniz. Sanat, miizik ve edebiyat,
gozlemlenerek kaydedildi. insanlarm ya§am kalitesine <;ok §ey ka-
4. Su omeklerindeki atrazin konsantrasyonu analiz edildi ( 7. bolgeye ait su tar; ancak bunlar bilim degildir. Bunlar
omegi test edilmedi) ger<;egin ne oldugunu ortaya <;1karmak
5. Ureme anomalileri ile gevresel atrazin konsantrasyonlan niceliksel olarak i<;in bilimsel yontemi kullanmaz. Ah-
saptand1 ve aradaki korelasyona bak1ld1.
§Ilmad1k iklimsel olaylar, iiriin kay1p-
lan ya da insan hastahklan gibi dogal
01J@im1;j • Hatall, gonad geli9imi ~--~~~~~~~- olaylan apklamada dinler de tarihsel
! Atrazin bulunan yedi

r
• Testislerde yumurta geli9imi olarak rol alrm§ olsalar da, din de bi-
• Atrazin duzeyi i bi:ilgede testislerde oosit lim degildir. Bir zamanlar insanlar i<;in
100 I ;;;i§imi ve atrofik testisler 1
6.8 gizemli olan olaylann pek <;ogu, §imdi
c
(\)
• L i anomaliler gi:izlendi .
arhk bilimsel ilkelerin terimleri ile ac;1k-
>--
Wo'# 80 6.6
lanabihnektedir.
i9 ::- 1.0 ;!:;:
· c~ Bilimin giicii, tarh§ma gotiirmeyen
Q) (\)
::::= >O) 60
iil
N
(\) (\)

E -e • 0.8 s·
D'
objektifliginden ve tekrarlanabilen ve ol-
0 ::::l
C.Y 0.6 Q D r;iilebilen gozlemlerden elde edilen kesin
(\) _y_ 40
D OJ
(\) _y_
• 0.4
kamtlara dayanmasmdan gelir. Dogal
c ~
0 Q) bir olaym dlni ya da spritiiel ac;1klama-
20
('.) 0.2 s1, bu fikre inanan ki§i i<;in manhkh ve
0.0 tatminkar olabilir; ancak bu apklama,
7 8 test edilemez ve dolay1s1yla bilim de-
L Bolge gildir. "Yarahc1" ya da "akilh tasanm-
c1" gibi dogaiistii bir a<;1klamaya ba§-
Sudaki atrazin konsantrasyonunun 0.2 ppb ya da i.isti.inde oldugu vurmak, bilim diinyasmdan aynhnak
ortamlardan ahnan kurbagalarda i.ireme anomalileri vardir. Erginlige anlamma gelir.
ge9i~ donemindeki anomali vakalan atrazin konsantrasyonu ile Bilim, diinyanm "nas1l olmas1 ge-
orant1h gori.inmemektedir. rektigi" hakkmdaki degil, nas1l oldugu
EK ARA~TIRMA: Kurbagalardaki en yuksek anomali orani, Wyoming 'teki yaban hayat1 hakkmdaki gerc;ekleri a<;1klar. insanla-
koruma alaninda yer alan 3 no'lu bolgede bulundu. Anormal vaka rm refah1m arhran birc;ok bilimsel iler-
say1s1ndaki bu a91r1 yuksekligi ag1klamak igin ne tip veri ve gozlemlere leme, bir tak1m temel etik tarh§malar
gereksinim duyard1niz? da dogurmu§tur. Ornegin, genetik ve
geli§im biyolojisindeki son geli§meler,
Orijinal alint1lar, tart1~malar ve YA~AMI ARA~TIRMA c;ocuklanm1zm cinsiyetini sec;meye, be-
~ekillerinin tumuyle ilgili baglantilar i<;in denlerimizi tamir etmek i<;in kok hiic-
yourBioPortal.com sitesini ziyaret ediniz. releri kullanmaya ve insan genomunu
degi§tirmeye olanak vermektedir. Bi-
sorulan nasil cevaplayacaklan konusunda digerlerinden ayn- limsel bilgi, bu gibi §eyleri yapmam1za
hrlar. Dogru istatistiksel analize tabi tutulmu§ veriler, hipotez- olanak verse de, bilim bunlan yap1p yapamayacaglffilz ko-
lerin test edilmesinde kritik 6neme sahiptir. Bilimsel yontem nusunda bize bir §ey soylemez. Eger bunlan yapmay1 tercih
diinyay1 ve onun i§leyi§ini anlamak i<;in insanlarm geli§tirdigi edersek, bunu nasil denetlememiz gerekir?
en gii<;lii yoldur. Toplumsal politikalar konusunda akilh tercihler yapmak
Dogal olaylarm bilimsel a<;1klamalan objektif ve giiveni- i<;in, hangi sonuc;lar ic;in ugra§hg1rmza karar vermede miim-
lirdir; c;iinkii 6nerilen hipotezler test edilebilir olmak ve dogru- kiin olan en etik manhg1 kullanmarmz gerekir.
1.4 BiYOLOJi TOPLUMSAL POLiTiKALARI NASIL ETKiLER? 17

ki§ilerin izole edildigine ili§kin uygulamalara ait yaz1h kay1t-


1.3 OZET lar bulunmu§tur.
Bugiin arhk genomlarm §ifresinin <;oziilmesi ve bunlan
Sorgulamadaki bilimsel yontem, gozlem ve veri-
degi§tirmek i<;in yeni bulunan yollar sayesinde, insan hasta-
lere dayanarak hipotezler formUle etmekle ba~lar.
hklarmm kontrolii ve tanmsal iiretimin artmlmas1 konusun-
Hipotezleri test etmek i9in kar~1la~t1rmah ve kont-
da <;ok say1da yeni olanak vardir. Ancak biitiin bu olanaklar
rollu deneyler yap1hr. etik ve politik tarh§malara yol a<;maktadir. insanlarm ve diger
Bir hipotez ile bir deney arasmdaki ili~kiyi a~1klaym1z. tiirlerin genlerini ne ol<;iide ve hangi yollarla tamir edebil-
Bakm1z s. 14 ve Seki! 1.12 meliyiz? Tanm bitkilerinin ve evcil hayvanlann genomlanru
• Kontrollu bir deneyde kontrol edilen ~ey nedir? kontrollii <;iftle§tirme ve <;aprazlama gibi geleneksel yontem-
Bakm1z s. 14 ve Seki I 1.13 lerle mi yoksa gen aktanm1 biyoteknolojisi ile mi degi§tirmek
Sadece kar~1la~t1rmah yakl a~1m1 kullanarak dogrudur? Genetigi degi§tirilmi§ organizmalarm <;evreye ka-
cevaplanabi lecek sorulan karakterize eden ozellikler hlmas1 hangi kurallara bagh olmahdir? Bilim, biitiin bu soru-
lara tek ba§ma cevap veremez ama, akilc1 politik kararlarm
nelerdir? Bakm1z ss. 14-15 ve Seki! 1.14
dogru bilimsel bilgiye dayanmas1 gerekir.
• Tartt ~malarm bilimsel olabilmesi i~in, ni~in ol~Ulebilen K1smen de olsa biyolojik temeli olan ve say1lan giderek
ve tekrarlanabil en verilerle desteklenmeleri gerekir? artan toplumsal meselelerle ilgili yasalar ve kurallar koyan
Bakm1z ss. 15-16 ya da diizenlemeler yapan yonetici kurumlar, biyologlann
tavsiyelerine giderek daha fazla ba§vurmaktadir. Toplumsal
politika belirlemek ve formiile etmek i<;in bilimsel bilginin
insan uygarhgmm yiizy1llardir biriktirdigi <;ok biiyiik bilimsel degerine ili§kin bir ornek olan ve K1s1m 1.3' de sozii edilen
bilgi, dogal diinyay1 anlamak ve degi§tirmek i<;in ba§ka hi<;- maviyiizge<;li tonbahg1ru izleme <;ah§malanna geri donelim.
bir canh tiiriiniin yapamad1gm1 yapmam1za olanak verir. Bu Bu <;ah§madan once, hem bilim insanlan hem de bahk<;ilar bu
yetenekler bize miicadele etme giicii ve firsatlar sunar, ancak bahklarm biri bahda Meksika Korfezi'nde, digeri ise doguda
bunlardan daha onemlisi sorumluluklar yiikler. Akdeniz' de olmak iizere iki iireme alaru oldugunu dii§iinii-
yorlard1 (~ekil 1.15). A§m avlanma, bahda <;iftle§en populas-

14 •
Biyoloji Toplumsal Politikalan Nas1I
Etkiler?
yonlann say1smm azalmasma ve bu populasyonlarm tehlike
altma girmesine yol a<;ml§h.

Tanm ve hp, biyolojik bilgiye dayanan iki onemli insan ak-


1.15 Maviyuzge~li Tonbahg1 Smir Tammaz Bat1da 9iftle9en tonba-
tivitesidir. Atalanm1z, bitkileri ve hayvanlan evcille§tirirken
l1g1populasyonlan ile doguda 9ifte9en tonbal1g1 populasyonlannin Atlas
farkmda olmadan evrimsel biyoloji ilkelerini uygulam1§, eski Okyanusunda kendi bolgeleri i9inde beslendikleri du:;;unuluyordu. Bu
<;aglardan beri hastahklann nedenlerini ara§hfffil§ ve bunlarla nedenle tehlike alt1ndaki bat1 populasyonlannin tekrar toparlanabilmesine
ba§ etmek i<;in yontemler ararm§lardir. Mikroplarm hastahk olanak saglamak i<;:in, 45° Bat1 boylam1nin (kesikli 9izgi) her iki taraf1nda
etkeni oldugunun ogrenilmesinden \Ok once, insanlar enfek- ayn avlanma kotalan getirildi. Bununla birlikte, izleme sonucunda elde edi-
siyonlann bireyden bireye bula§abildigini fark etmi§ ve hasta len veriler, iki populasyonun yumurtlad1ktan sonra ayn kalmad1g1n1 goster-
di. Dolay1s1yla saptanan bu politika, bat1 populasyonunu korumad1.
18 BOLUM 1 ! YA$AMIN QALl$1LMASI

Ba;;lang1<;ta bilim insanlan, bahk<;1lar ve bu konuda karar Biyoloji ogrenmenin bir ba;;ka nedeni, h1zla artan insan
veren yetkililer dogu ve bah populasyonlarmm cografi ola- niifusunun <;evre iizerindeki etkilerini anlamakhr. Dogal
rak ayn beslenme ve <;iftle;;me alanlanna sahip olduklarm1 kaynaklan kullanmam1z, Diinya' daki ekosistemlerin top-
dii;;iiniiyorlardi. Bu varsay1mdan yola <;1kan uluslararas1 bir lurnlann ihtiyac1 olan mal ve hizmetleri iiretmeye devam
komisyon, Atlas Okyanusunun ortasmdan ge<;en bir hat <;izdi etme kapasitesi iizerinde bask1 olu;;turmaktadir. insan akti-
ve bahdaki populasyonlann yenilenebilmesine izni vermek viteleri yeryiiziiniin iklimini degi;;tirmekte ve bu boliimde
niyetiyle, bu hattm bahsmdaki avlanmaya kah kotalar koydu. konu ettigimiz amfibiler gibi <;ok say1da tiiriin yok olmasma,
Bununla birlikte, izleme sonucunda elde edilen yeni veriler eski hastahklarm yeniden ortaya <;1kmasma, yenilerinin ise
bah ve dogu maviyiizge<;li tonbahg1 populasyonlarmm tiim yayilmasma neden olmaktadir. Grip viriislerinin h1zla yay1l-
Kuzey Atlantik' deki beslenme alanlarmda serbest<;e kan;;hk- mas1 modern seyahat bi<;imleri ile kolayla;;irken, antibiyo-
lan ger<;egini ortaya pkardi. Bu hattm dogusunda yakalanan tiklere diren<;li bakterilerin evrirnle;;mesinin sonucu olarak
bir tonbahg1 bahdaki <;iftle;;me populasyonuna ait olabilecegi son zamanlarda verem hastahg1 yeniden ortaya <;1kmaktadir.
gibi, dogu populasyonuna da ait olabiliyordu. Dolay1s1yla, be- Biyolojik bilgi, bu degi;;ikliklerin nedenlerini saptamak ve
lirlenen politika istenen amaca ula;;marm;; oldu. bunlarla ilgili ak1lh politikalar iiretmek i<;in hayati oneme
Politika geli;;tirenler bilimsel bilgi ve tavsiyeleri daha fazla sahiptir.
dikkate almaktadir. Ornegin, atrazinin amfibiler iizerindeki et- insanlarm "bilme ihtiyac1" politika ve pragmatizm ko-
kilerine ili;;kin ara;;tirmalar, Amerika Birle;;ik Devletleri'ndeki nularmm otesindedir. insanlar canlilann <;e;;itliligindeki zen-
kurulu;;lardan biri olan Dogal Kaynaklan Koruma Kurulu'nun ginlige hayran kahr ve <;ogu insan, organizmalar ve bunlarm
(Natural Resources Defense Counsil) Tehlike Altmdaki Tiirler nasil etkile;;tikleri konusunda daha fazla ;;ey bilmek ister. in-
Yasasma dayanarak atrazinin yasaklanmas1 i<;in giri;;im ba;;lat- sanoglunun meraki, adaptif bir ozellik olarak bile goriilebi-
masma yol a<;h. Bununla birlikte, A.B.D ~evre Koruma Ajans1 lir. ;>oyle ki, eger <;evreleri hakkmda bilgi edinme egiliminde
(The U.S. Environmental Protection Agency) bu yasaklamanm olan bireyler, daha az merakl1 akrabalarmdan hayatta kah;; ve
yaratacag1 potansiyel tanmsal kay1plan dikkate alarak, <;evre- iireme a<;ISmdan daha ba;;anh olabilmi;; ise, bu ozelligin se-
sel diizeyleri 30-40 ppb'yi ge<;meyecek ;;ekilde atrazin kulla- <;ilmi;; olma ihtimali vardir. Yeni ke;;ifler ve daha fazla bilgi,
rurmnm devam etmesine izin verdi. Kabul edilen bu diizeyler, daha once kimsenin sormay1 dii;;iinmedigi sorulan dogurur.
Hayes'in <;ah;;malan ile anomalilere neden oldugu gosterilen Heniiz cevaplanru bilmedigimiz <;ok say1da soru vardir, ancak
atrazin diizeylerinin 300-400 misli kadardir. Bilimsel bulgular, bilim insanlarm1 motive eden en onemli ;;ey merakhr.
her zaman politika diinyasllli ikna edememektedir.

BOLOM OZETi
1.1 Biyoloji Nedir? Canhlar ilk olarak kimyasal evrim ile ortaya c;1km1?lard1r.
Hucreler, canl1lann evriminde erken di:inemde ortaya c;1km1?t1r.
Biyoloji canl1 organizmalan, bunlann i:izelliklerini, i?levlerini ve
etkile?imlerini bilimsel orarak inceleyen bilim dahd1r. Hucreler Fotosentez Dunya'nm atmosferini degi?tirdigi ve gune?
canhlann temel yap1sal ve fizyolojik birimleridir. Hucre teorisi l?1gmdan enerji yakalayacak bir yol saglad1g1 ic;in i:inemli bir
tUm canhlarm hucrelerden olu?ugunu ve tUm hucrelerin daha evrimsel basamakt1r.
once varolan hucrelerden geldig ini si:iyler. ilk organizmalar prokaryotlard1. Daha kompleks hucrelere
TUm canh organizmalar, ortak bir atadan gelen degi?iklige sahip olan ve okaryotlar olarak adland1nlan organizmalar daha
ugram1? soylar olduklan ic;in birbirleri ile akrabad1r. Dogal sonra ortaya c;1ktilar. Okaryotik hucreler organel ad1 verilen
se~ilim arac1hg1 ile evrim canl1 organizmalarda bulunan hucre bi:ilmelerine sahiptir. Bu organellerden birisi olan c;ekirdek
adaptasyonlarm c;e?itliliginden sorumludur. hucrenin genetik maddesini ic;erir.
Hucrenin bilgi ic;erigi DNA'dan olu?an genomda bulunur. Turlerin genetik akrabahklan bir evrimsel agac; olarak temsil
DNA molekulleri, nukleotid dizilerinden yapilm1?t1r. Gen olarak edilebilir. TUrler, uc; domain ic;inde grupland1nl1rlar: Archaea,
adland1nlan i:izel DNA k1s1mlan, hucrenin proteinleri yapmak Bacteria ve Eukarya. Archaea ve Bacteria birhucreli prokayotla-
ic;in kulland1g1 bilgiyi ic;erir. nn dahil oldugu domainlerdir. Eukarya domaini, c;ok c;e?itlik gi:is-
Canl1 organizmalar, ic; ortamlanni denetlerler. Ayni ya da farkl1 teren protistleri (tUmu olmasa da c;ogu birhucrelidir), c;ok hucreli
tUrlere ait diger organizmalarla etkile?irler. Biyologlar tUm or- bitki, mantar ve hayvan gruplanni ic;erir. inceleyiniz $ekil 1.10,
ganizasyon duzeylerindeki canhl1g1 incelerler. inceleyiniz $ekil
WEB AKTiViTESi 1.2
1.6, WEB AKTiViTESi 1.1
Bir model sistemden\elde edilen biyolojik bilgi, diger tUrler ic;ih
de genellenebilir. 1.3 Biyologlar Canhlan Nas1I Ara~tmr?
Biyolojik ara?t1rmalann c;ogunda kullanllan bilimsel yontem,
be? basamak ic;erir: gi:izlemler yapmak, sorular sormak, hipo-
1.2 Dunya Ozerindeki TUm Canhlar Birbirleriyle Nas1I
tezler kurmak, tahminler yapmak ve bu tahminleri test etmek.
Akrabad1r?
inceleyiniz $ekil 1.12
Biyologlar canl1hk tarihini olu?turabilmek ic;in, fos illeri, anatomik
Hipotezler sorulara verilen gec;ici cevaplard1r. Hipotezleri te-
benzerlik ve farklil1klan kullanir ve molekUler olarak genomlan
mel alarak yapilan tahminler ek gi:izlemler ve iki tip deney ile
kar?ila?t1nrlar. inceleyiniz $ekil 1.8
test edilirler ki bunlar kar~1la~t1rmah deneyler ve kontrollu
BOLUM OZETi 19

deneylerdir. inceleyiniz ~ekil 1.13 ve 1.14, ANiMASYONLA Bilim, bize dunyan1n i:;leyi:;i hakkmda bilgi verir ancak, neyi
0 GRENME1.1 yapmam1z ya da neyi yapmamam1z konusunda bir :;ey
Gozlenen farkhl1klarm onemli olup olmad1gm1 ya da bu soylemez.
farkl1hklarm :;ansa bagh sonu<;lar m1 oldugunu saptamak i<;in,
elde edilen verilere istatistiksel ybntemler uygulanir.
1.4 Biyoloji Toplumsal Politikalan Nas1I Etkiler?
Devlet kurumlan, biyolojik konulan i<;eren onemli problemlerin
<;bzumunde s1khkla biyologlann tavsiyesine ba:;vururlar.

TARTl$MA
1. Birhiicreli bir organizmarnn tiim genlerinin dizilerini 2. Bilimde hipotezlerin yanl1§hgm1 ortaya c;:ikarma yeteneginde
bilsek ve bu genlerin test tiipii ic;:inde ifade edilmesini olan testler tasarlamak ve uygulamak nic;:in c;:ok onemlidir?
ba§arabilsek bile, i§levsel bir organizma yaratabilmek 3. Sadece kar§ila§hrmah yakla§iml kullanarak cevaplanabilecek
inarnlmaz olc;:iide zordur. Bunun neden boyle oldugu sorulan karakterize eden ozellikler nelerdir?
hakmda ne dii§iiniiriirsiiniiz? Bu gerc;:ek l§1gmda, bir tiire 4. Giinliik hayatinlZdaki problemleri c;:ozmek i<;:in bilimsel
ait tiim bilginin genomda ta§md1g1 ifadesi hakkmda ne yontemi nasil uygulad1P;=a ili§kin bir omek veriniz.
d ii§iiniirsiiniiz?

EK ARA TIRMA
1. Tyrone Hayes'in c;:ah§malarmdaki kurbaga anomalileri 2. Tiim hiicrelerin daha once varolan hiicrelerden olu§masma
c;:evrede bir herbisitin bulunmas1 ile ilgiliydi. Bu herbisit, benzer §ekilde, tiim mitokondriler de -besinlerdeki enerjiyi
kurbagalan oldiirmemekle birlikte, erkekleri di§ile§tiriyordu. biyolojik i§ yapabilecek enerji formuna donii§tiiren hiicre
Bu etkinin dogadaki kurbaga populasyonlarmm iireme organelleri- daha once varolan mitokondrilerden olu§ur.
kapasitelerinin azalmasma yol ac;:1p ac;:mayacagm1 nas1l Hiicreler mitokondrilerini, c;:ekirdeklerindeki genetik bilgiyi
kullanarak sentezlemezler. Mitokondrilerin niteligini
ara§hnrdllliz?
anlamak ic;:in nas1l ara§hrmalar yapardllliz?

- -- - VERiLERLE <;ALl$MA (yourBioPortal.com ZiYARET EDiNiZl-----


Kurbagalann Di~ile~mesi ;>ekil 1.13'de gosterilen deneye dozlarma maruz birakilm1§ kurbagalardan elde edilen verileri
analog olan bu egzersiz sizden Xenopus laevis kurbagalarmm grafikledikten sonra, atrazinin bu fiziksel davrarn§ iizerindeki
erkeklerinde c;:iftle§me c;:agnlan olu§turmak ic;:in gerekli larinks etkilerine ili§kin sonuc;:lan formille edecek ve bu etkilerin ne
(girtlak) kaslarmm boyutlan hakkmdaki verileri grafiklemeni- anlama geldigi hakkmda fikir yiiriiteceksiniz.
zi istemektedir. Geli§imleri s1rasmda atrazin herbisitinin farkl1
Sa~h bir hikaye
1/ N e yersen osun -ve bu sen in sa~mda kayde-
dilir." VOcut kimyas1 hakkmdaki OnlO deyi~in
sonuna eklenen bu ifadenin sorumlulan Utah
Oniversitesi'nden iki bilim insarnd1r. Ekolog Jim Ehleringer
ozelliklere sahip oldugu halde, ~ekirdeklerinde bulunan ve
notron ad1 verilen partikOI say1lanndaki farkhhktan dolay1
farkh ag1rhktad1r.
Su okyanustan buharla~t1gmda, karalann i~ine dogru
ve kimyac1 Thu re Cerling, insan sa~1rnn o ki~inin hangi
hareket ederek oralara yagmur b1rakan bulutlar olu~turur.
bolgede ya~ad1gm1 yans1tt1g1rn gosterdi.
Daha agir H ve 0 izotoplanndan olu~an su, hafif izotoplar-
Bal Om 1'de i~aret edildigi gibi, canh varhklarla cans1z
dan olu~an sudan daha ag1r oldugundan, yere daha h1zh
evreni olu~turan atomlar birbirinin ayrns1d1r. Bu atomlar-
dO~me egilimindedir. ll1k yagmurlar sogukta yogunla~anlar­
dan ikisi hidrojen (H) ve oksijendir (0). Bu iki atom su (Hp)
dan daha ag1rdir. K1yilarda ya da 1hk yagmurlarm s1k yagd1g1
olu~turmak Ozere birle~ir. Her iki atom da izotop ad1 verilen
bolgelerde ya~ayan insanlann tOkettikleri su ve yiyecekler,
~e~itler halinde dogal olarak bulunur. izotoplar ayrn kimyasal
daha soguk i~ bolgelerde ya~ayan insanlarm kulland1g1 su-
dan daha ag1rd1r (ku~kusuz buradaki insanlann tOkettikleri
i~ecek ve OrOnlerin ya~ad1klan yerden geldigi varsay1lmakta-
d1r). Ne yersek o oldugumuzdan dolay1, agir H ve O atom Ian
bu insanlann vOcudunun bir par~as1 haline gelir.
Sa~1m1z ~ok miktarda H ve 0 i~erir ve bunlann ~ogu ye-
rel sulardan kaynaklarnr. Ehleringer ve Cerling, sa~taki ag1r
ve hafif H ve 0 oranlannm yerel sulardaki ag1r ve hafif Hp
oranlanrn yans1t1p yans1tmad1g1rn merak ettiler. Bu soruya
cevap aramak Ozere Ehleringer'in e~i, Cerling'in ~ocuklan
ve her ikisinin arkada~lan Birle~ik Devletler'de sa~ toplamak
Ozere bir yolculuga ~1karak, hem berber dOkkanlanndan
kesilmi~ sa~lan, hem de yerel su orneklerini topladilar. Topla-
d1klan ornekleri laboratuvarda test eden bilim insanlan, sa~­
taki ag1r ve hafif izotop oranlanrnn yerel sulardaki oranlarla
ayrn oldugunu buldular.
Bu bilgi, kendi ba~1na hayranhk uyand1r1c1 olmas1nm yarn
sira, uygulamaya don Ok bir deger de ta~1maktad1r. Ornegin,
polis ~Opheli ki~inin ifadesini degerlendirirken sa~ analizini
kullanabilir ve "Ge~en ay Montana'da oldugunu soylO-
yorsun. Oysa sa~ ornegin senin sicak bir sahil bolgesinde
oldugunu gosteriyor" diyebilir. Bu ornekteki gibi tart1~mah
karntlar daha ileri ara~t1rmalara temel olu~turabilir. brnegin,

Sac; Bir Hikaye Anlat1r Sa<;: proteinindeki ag1r 1so izotopunun


hafif 160 izotopuna orani yerel sulardaki oranlan yans1t1r.
SOLUM ANA BA LIKLARI
2.1 Atomik Yap1 Maddenin Ozelliklerini Nas1I Ac;:1klar?
2.2 Atomlar Molekulleri Olu~turmak ic;:in Nas1I Baglarnr?
2.3 Kimyasal Tepkimeler S1rasmda Atomlar Partnerlerini
Nas1I Degi~tirir?
2.4 Suyu Canhlar ic;:in bnemli Yapan Nedir?

21 •
Atomik Yap1 Maddenin Ozelliklerini
Nas1I A~1klar?
Butiin maddeler atomlardan olu§ur. Atomlar <;ok ku<;uktur
-bu paragrafm ba§mdan bu cumlenin sonuna kadar olan kis-
ma bir tirilyondan (10 12 ) fazla atom s1gar. Her atom, arh yuklu
yogun bir 9ekirdek ile bunun <;evresinde hareket eden bir ya
da daha fazla say1daki eksi yuklii elektronlardan olu§ur (~e­
kil 2.1 ). C::ekirdekte arh yuklu bir ya da daha fazla proton ve
elektrik yuku ta§tmayan bir ya da birden fazla say1da notron
yer ahr. Atomlar ve bunlan olu§turan par<;ac1klar, karakteris-
tik olarak tiim maddelerde bulunan hacim ve kutleye sahiptir.
Mevcut maddenin miktan, kutlenin 6l<;usudur; kutle ne kadar
buyukse, madde miktan da o kadar buyuktur.
Bir protonun kutlesi, standart bir 6l<;u birimi olarak kulla-
Haz1r Ornekler Bir ara9t1rma projesi ic;:in sac;: orneklerine ruhr ve bu birim ingiliz kimyac1 John Dalton'un adma izafeten
ihtiyac1niz m1 var? Yak1n1nizdaki berber dukkanlanna ba9 vurun. dalton ya da atomik kutle birimi (amu) olarak adlandmhr. Tek
bir protonun ya da notronun kutlesi yakla§lk 1 dalton (Da) olup I

bu kutle 1.7 X 10-24 gramdir (0.0000000000000000000000017 g).


Bu olduk<;a ku<;uk bir kutle olmakla birlikte, daha da ku<;uk
insan gru pl annin goc; yollan Uzerinde c;all~an antropolog- olan elektronlarm kutlesi 9 X 10-28 gramdir (0.0005 Da). Pro-
lar, mezarlardan elde edilen sac; orneklerini analiz edebilir. ton ya da notronun kutlesi ile kar§1la§hnld1gmda, elektronun
kutlesi ihmal edilebilecek duzeyde oldugundan, 6l<;umler ve
Canllllg in kimya temeline dayand1g1nin ve evrensel
hesaplamalar yap1hrken, elektronlarm atomun kutlesine yap-
ki mya ve fi zik yasalanna tabi oldugunun anla~1lmas1, in- hg1 katk1 genellikle ihmal edilir. Ancak, kararh birliktelikler
sa nllk tari hi nde oldukc;a yeni bir durumdur. On dokuzuncu olu§turmak uzere atomlarm diger atomlarla nasd bir araya
yOzyila kadar canliliktan sorumlu olan ~eyin bir "vital guc;" gelecegini elektronlar belirler.
Her proton, + 1 yuk birimi olarak tarumlanan arh elekt-
oldugu varsay11iyordu (vital sozcOgO Latince "canllya ait"
rik yuku ta§ir. Bir elektron ise, protonun yiikiine e§it ancak
an lamin a gelen vita/is sozcOgOndenden tOretilmi~tir). Bu onun z1dd1 olan eksi (-1) yuk ta§ir. Admdan da anla§dacag1
vital guc;, fi zik ve kimyay1 yoneten mekanik guc;lerden ayn gibi, notron elektriksel olarak notrdur ve yuku O' dir. Farkh
tutuluyord u. Birc;ok insan, halen vital bir gOcUn var oldugu- yukler (+ /-) birbirini <;ekerken, aym yukler (+I+,-/-) birbirini
iter. Atomlar elektriksel olarak notrdur; <;iinku bir atomdaki
nu kabul et mektedir. Ancak, canllllga fiziko-kimyasal ac;1dan
elektrolarm say1s1 protonlarm say1sma e§ittir.
ba k1lmas1, biyolojik bilimlerde c;ok bOyOk ilerlemelere yol
ac;t1 ve bu bak1~ ac;1s1 modern tip ve tan min temelta~1 haline Bir element sadece tek tip atomdan olul?ur
geldi.
Element, sadece tek tip atom i<;eren saf bile§iktir. Hidrojen
BU BOLUMDE maddeyi olu!?turan atomlan tanita- elementi sadece hidrojen atomlarmdan olu§ur. Her elementin
atomlan onlan diger elementlerin atomlarmdan farkh kdan
rak, bunlann c;:e!?it lerini, ozelliklerini ve diger atomlarla
belirli karakteristik ozelliklere sahiptir. Kutle ve diger atom-
bir araya gelme yeteneklerini gozden gec;:irecegiz. Kati larla nasd etkile§tikleri bu ozellikler arasmdadir.
haldeki madden in nas1I s1v1 ve gaz haline doni.i!?tOgi.ini.i Evrende bulunan 100' den fazla element periyodik tabloya
ve maddede kimyasal tepkimelerle ortaya c;:1kan de- (~ekil 2.2) yerle§tirilmi§tir. Her element, kendine ait bir ya da
iki harfli sembol ile gosterilir. Ornegin, H hidrojeni, C karbo-
Qi!?iklikleri ele alacag1z. Suyun yap1s1n1, ozelliklerini ve
nu ve 0 oksijeni simgeler. Baz1 semboller diger lisanlardan ge-
kimyasal asit ve bazlarla etkile!?imlerini inceleyecegiz. lir: Fe (Latince, ferrum) demir, Na (Latince, natrium) sodyum
ve W (Almanca, wolfram) tungten i<;in kullamlir.
22 BOLUM 2 ' KO<;OK MOLEKULLER VE CANU KiMYASI

rojen, azot, oksijen, fosfor ve ktiktirt. Bu boltimtin esas konusu


~rotonun kut~ bu alb elementin kimyas1 olmakla birlikte, canh organizma-
I ol~p·pozitif yuk ta1?1r.
r.::::..-:::._
~-- --_____/ [ ~ lardaki diger elementler de aym olc;ude onemlidir. brnegin,

Ii!_Heruk ta1?1maz.
notronun kutlesi 1 OIUPL--:;::._~-
,--
sodyum ve potasyum sinir fonksiyonu ic;in zorunlu iken, kal-
siyum biyolojik sinyal olarak i§ gortir, iyot c;ok onemli bir hor-
monun bile9enidir, magnezyum ise bitkilerdeki klorofil ic;in

~tronlann kUtl~si ihmal L gereklidir. Atomlarm fiziksel ve kimyasal (reaktif) ozellikleri,


edilecek kadar azd1r ve ,====- ic;erdikleri atomalb parc;ac1klarm say1sma baghdir.
negatif yuk la$1rlar. _ _ _j
Her element farkh say1da proton ic;erir
2.1 Helyum Atomu Helyum atomunun bu 9ekilde temsil edilmesi, Bohr
modeli olarak adland1n l1r. Bu model <;;ekirdegin kaplad1g1 mekarn abart1l1 bir Bir element atom c;ekirdegindeki proton say1s1 ac;ismdan diger
bi<;;imde gosterir. Ger<;;ek1e ise, <;;ekirdek atomik klltlenin hemen hemen elementlerden farkhdir. Protonlarm say1s1 atom say1s1 olarak
tamam1rn olu:;;tursa da, atom hacminin sadece 1/1 O.OOO'inini i:;;gal eder. tammlamr. Her elementin atom say1s1 kendine ozgtidtir ve de-
Bohr model i ayni zamanda, elektronu <;;ekirdek etraf1ndaki munferit bir gi9mez. Helyumun atom say1s1 2' dir ve her helyum atomu da-
partikOI olarak temsil etmesinden oti.lru de yanl19 bir gosterimdir.

Periyodik tablodaki elementler, e§it miktarlarda bulun-


maz. Yild1zlarda bol miktarda hidrojen ve helyum vardir. _...--t-""'Atom say1s1
Dtinya'mn kabugu ve kom9u gezegenlerin ytizeyleri hemen 2 .------- I (protonlann say1s1)
hemen yan yanya oksijen, %28 silisyum, %8 altiminyum ve He ::=:------.l
her biri %2-5 arasmda olmak tizere sodyum, magnezyum, po- Kimyasal sembol
(helyum i<;;in)
tasyum, kalsiyum ve demir ic;ermekte olup, diger elementler
c;ok daha az miktarlardadir.
Her canh organizmanm (bakteri, 9algam ya da insan) yak-
la91k olarak %98'i sadece alb elementten olu9ur: karbon, hid-
~ __......yAtomik kutle
003 ~ I (proton ve notron lann
4· toplam say1s1)

2.2 Periyodik Tablo Periyodik tablo, elementleri fiziksel


- ve kimyasal 6zelliklerine gore gruplar. 1-92 aras1n da k'1e Ie- ---
1 I i;;ogu canl1 organizmarnn 2
H mentler dogada bulunur; atom say1lan 92'nin usti.lnde olan
elementler ise laboratuvarda yarat1lm19t1r.
l % 98~1ni olw;:turur He
1.0079 4.003
\\
3 4 5 ' 6 7 8 9 10
Li Be Ayrn dlkey kolood' voe"" elem~~ B c N 0 F Ne
6.941 9.012 en di$ elektron kabuklannda ayrn Turuncu ile gbsterilen 10.81 12.011 14.007 15.999 18.998 20.179
say1da elektron ii;;erdikleri ii;;in benzer elementler biri;;ok organizmada
11 12 bzelliklere sahiptir. az miktarlarda bulunur. 13 14 15 16 17 18
p s
Na Mg
22.990 24.305 I
I
I
I
'--·
71- Al Si
26.982 28.086 30.974 32.06
Cl Ar
35.453 39.948
I I
19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36
K Ca Sc Ti
I
I v II Cr Mn Fe Co Ni Cu Zn Ga Ge As Se Br Kr
39.098 40.08 44.956 47.88 I 50.942 I 51.996 54.938 55.847 58.933 58.69 63.546 65.38 69.72 72.59 74.922 78.96 79.909 83.80
37 38 39 40 I 41 I 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54
Rb Sr y Zr I Nb I Mo Tc Ru Rh Pd Ag Cd In Sn Sb Te I Xe
85.4778 87.62 88.906 91.22 I 92.906 I 95.94 (99) 101.07 102.906 106.4 107.870 112.41 114.82 118.69 121.75 127.60 126.904 131.30
I I

55 56 71 72 I 73 II 74 I
75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86
Cs Ba Lu Hf I Ta I w Re Os Ir Pt Au Hg Tl Pb Bi Po At Rn
132.905 137.34 174.97 178.49 1180.9481 183.85 186.207 190.2 192.2 195.08 196.967 200.59 204.37 207.19 208.980 (209) (210) (222)
87 88 103 104 I 105 I 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118
Fr Ra Lr Rf I
Db I
Sg Bh Hs Mt
I I
(223) 226.02E (260) (261) I
(262) I (266) (264) (269) (268) (269) (272) (277) (285) (289) (293)
I
I
I
I
l II
Parantez ii;;indeki kutleler ba9ka elementler olu$1uracakJ
:;;ekilde pari;;alanan karars1z elementleri gbsterir.
~--·/L_____
l
Kimyasal sembolu olmayan elementlj
henuz adland1nlmam1$l1r.
. · -- - -

57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70
Lantanid serileri La Ce Pr Nd Pm Sm Eu Gd Tb Dy Ho Er Tm Yb
138.906 140.12 140.9077 144.24 (145) 150.36 151.96 157.25 158.924 162.50 164.930 167.26 168.934 173.04
89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102
Akdinid serileri Ac Th Pa u Np Pu Am Cm Bk Cf Es Fm Md No
227.028 232.038 231.0359 238.02 237.0482 (244) (243) (247) (247) (251) (252) (257) (258) (259)
2. 1 ATOMiK YAPI MADDENiN OZELLiKLERiNi NASIL AC::IKLAR? 23

ima iki protona sahiptir; oksijenin atom say1s1 8' dir ve oksijen
atomu daima sekiz proton ic;:erir.
Belirli say1daki protonlann yam s1ra, hidrojen haric;: diger
elementlerin c;:ekirdeginde bir ya da daha fazla say1da ni.itron
bulunur. Bir atomun kutle numaras1 c;:ekirdegindeki proton
ve ni.itron say1lannm toplamma e9ittir. Karbon atomunun c;:e-
kirdeginde altI proton, alh ni.itron vardir ve karbonun kiitle
numaras1 12' dir. Oksijen sekiz proton, sekiz ni.itron ic;:erir ve
kiitle numaras1 16' dir. Herhangi bir atomun kiitle numaras1
onun dalton cinsinden kiitlesini ifade eder (a9ag1ya bakm1z).
Bir elementin simgesinin sol alt tarafma onun atom say1s1,
sol list tarafma ise kiitle numaras1 yaz1hr. Dolay1s1yla hidro-
jen, karbon ve oksijen siras1yla §i.iyle yaz1hr:
}H, 1 ~C ve 1 ~0. 2.3 Beynin Gori.intUlenmesi Canl1 bir insandan elde edilen bu goruntU-
lerde sag l1 kl1 bir birey ile metamfetamin bag1ml1s1 bir bireyin beyin aktiviteleri
aras1ndaki farklan saptamak igin radyoaktif i:;;aretli :;;eker kullarnlm19t1r. Daha
aktif olan beyin bolgesi daha fazla :;;eker kullarnr. Sagl1kl1 beynin (solda)
izotoplarm notron say1lan birbirinden farkhd1r haf1za ile ilgili k1sm1 (k1rm1z1 bolge) ilag bagiml1s1olan beyne oranla daha
fazla aktivite gostermektedir.
Baz1 elementlerin atom c;:ekirdegindeki nOtron sayilan her za-
man aym degildir. Aym elementin farkh izotoplan aym say1da §iimiin tipi radyoizotopa bagh olarak degi9ir, ancak baz1 di.i-
proton ic;:ermekle birlikte, ni.itron say1lan birbirinden farkhdir. nii9iimler proton say1s1m degi9tirebilir; bi.iylece ba9lang1c;:taki
Birc;:ok elementin c;:e9itli izotoplan vardir. A9ag1da gosterilen atom farkh bir element haline gelir.
hidrojen izotoplan i.izel isimlere sahip olmakla birlikte, c;:ok Bilim insanlan hassas aletler kullanarak, yayilan radyas-
say1da elementin izotoplan farkh isimler ta91maz. yonu radyoizotoplann varhgm1 saptamak ic;:in kullanabilir.
Ornegin, eger bir toprak solucanma radyoizotop ic;:eren besin
verilirse, bu solucanm toprakta izledigi patika Geiger sayac1
ad1 verilen basit bir dedekti.ir kullamlarak saptanabilir. Canh
organizmalardaki atomlann c;:ogu molekul ad1 verilen kararh
birlikler halinde organize olmu9tur. Eger bir molekiile bir rad-
yoizotop kahhrsa, bu radyoizotop bir etiket gibi i9 gi.iriir ve
~H ~H ~H ara9hncmm ya da fizyologun bu molekiilii deney s1rasmda ya
da viicut ic;:inda izlemesi miimkiin olur ($ekil 2.3). Radyoizo-
Hidrojen Doteryum Tritiyum
toplar fosillerin tarihlendirilmesinde de kullamhr. Bu uygula-
1 proton 1 proton 1 proton ma, K1s1m 25.l'de ac;:1klanm19hr.
0 nbtron 1 notron 2 nbtron Radyoizotoplar, ara9tirma ve hp alanlannda yararh ol-
makla birlikte, yayd1klan radyasyonun c;:ok kiic;:iik dozlan bile
Ornegin karbonun dogal izotoplan, 12C (c;:ekirdeginde altI molekiil ve hiicrelerde hasar olu9turma potansiyelindedir.
ni.itron), 13C (c;:ekirdeginde yedi ni.itron) ve 14C (c;:ekirdeginde Ancak bu zararh etkiler baz1 durumlarda bize yarar saglar;
sekiz ni.itron)'diir. S1rayla "karbon 12", "karbon 13" ve "kar- i.irnegin, 6°Co' dan (kobalt-60) yay1lan radyasyon hpta kanser
bon 14" olarak adlandmlan bu izotoplann iic;:ii de alh proton hiicrelerini i.ildiirmek ic;:in kullamhr.
ic;:erir, dolay1s1yla bunlarm hepsi karbondur. Karbon atomlan-
nm c;:ogu 12C, yakla91k %1.l'i 13C, c;:ok az bir kism1 da 14C'diir.
Ancak bunlann tiimii temel olarak aym kimyasal reaktivite- Elektronlann davram~1 kimyasal baglanma ve
ye sahiptir. Bu i.izellik deneysel biyoloji ve hp uygulamalan geometriyi belirler
ac;:1smdan i.inemlidir. Bir elementin atom ag1rl@ (ya da atom Bir atomdaki elektron say1s1 bu atomun diger atomlarla na-
kiitlesi) tiim izotoplannm normal olarak bulunduklan oranlar sil bir araya gelecegini belirler. Biyologlar, canh hiicrelerdeki
dikkate almarak ve bu izotoplann kiitle numaralanmn orta- kimyasal degi9ikliklerin nas1l cereyan ettigi ile ilgilenir. Atom-
lamas1 almarak hesaplamr. Ornegin, tum izotoplan ve bun- lan elektronlarla birlikte dii9iinmek gerekir; c;:iinkii elektron-
larm dogal olarak hangi oranlarda bulundugu dikkate alma- larm davram91 kimyasal tepkimelerin nasil gerc;:ekle9tigini
rak, karbonun atom agirhg1 hesapland1gmda, bu deger 12.011 ac;:1klar. Kimyasal tepkimeler, bile9iklerin atomik bile9imlerini
olarak bulunur. Atom agirhklanndaki ondahk say1 kis1mlan, ve dolay1s1yla i.izelliklerini degi9tirir. Tepkimeler, genellikle
tiim izotoplann agirhklarmm ortalamasmm almmasmdan atomlar arasmdaki elektron dag1hm1 degi9imini ic;:erir.
kaynaklanmaktadir. Bir atomdaki belirli bir elektronun herhangi bir andaki bu-
izotoplarm c;:ogu kararhdir. Ancak radyoizotoplar ad1 lundugu yeri saptamak olanaksizdir. Yapabildigirniz §ey sadece
verilen baz1lan karars1z olup, atom c;:ekirdeginden a (alfa), elektronun atom ic;:inde bulunma ihtimali olan uzaym hacmi-
~ (beta), ya da y (gama) radyasyonu §eklinde kendiliginden ni tarumlamaktir. Elektronun vaktinin en az %90'rm gec;:irdigi
enerji yayar. Radyoaktif par~alanma ad1 verilen bu enerji sah- uzay bi.ilgesi onun yorungesidir. Yi.iriingeler karakteristik bi-
mm1, orijinal atomu ba9ka bir forma di.inii9tiiriir. Bu di.inti- c;:im ve yerle9imlere sahiptir ve belirli bir yoriingede en fazla iki
24 BOLUM 2 1KU<;UK MOLEKULLER VE CANLI KiMYASI

Birinci kabuk:
Qekirdege en yak1n iki ikinci kabuk: 2.4 Elektron Kabuklan ve Yorungeleri Her yorunge en fazla iki elekt-
elektron kuresel s ikinic elektron kabugundaki dart yiirungeden biri ron igerir. s yorungeleri daha du:;;uk enerji duzeyine sahip olup, elektron-
yiirungesinde hareket eder olan 2s yiirungesinde iki elektron bulunur. ikinci lar taraf1ndan p yorungelerinden once doldurulur.
kabukta toplam olarak sekiz elektron bulunabilir.

y
t

-- /z

~x
0 0 0
..._,__x
1s Yiirungesi /
t t
2s Yiirungesi Px Yiirungesi Py Yorungesi Pz Yiirungesi Tum p yorungeleri dolu

(iki elektron lobut ... iki elektron '1 ... digeriki ) elektron uc;: adet
- - - - yourBioPortal.com - - - - [ :;;eklindeki x ekseni daha Py ybrungesini J elektron Pz 1
ybrungesini doldurur.
ZIYARET EDINIZ Web Aktivitesi 2.1 • l (Pxl yiirungesini olu:;;turur. doldurur... ) yiirungesini
doldurur.
Elektron Yi:irungeleri

• jkinci kabuk: ikinci kabuk dort tane yoriinge ic;erir (bir tane
elektron bulunabilir (!?ekil 2.4). Dolay151yla, helyumdan (atom
s yoriingesi ve iic; tane p yoriingesi) ve dolay1s1yla en faz-
sayis1 2) daha biiyilk herhangi bir atomun elektronlan iki ya da
la sekiz elektron ta:;;1yabilir. $ekil 2.4' de gosterildigi gibi, s
daha fazla yoriingede yer ahr. Periyodik tabloda hafif atmnlar-
y6riingeleri kiire :;;eklinde iken, p yoriingeleri birbirleri ile
dan agrr atomlara dogru gidildikc;e, yoriingeler ozgill bir srra ile
dik ac;1 yapacak :;;ekilde yerle:;;mi:;;lerdir. Bu y6riingelerin
doldurulur. <;ekirdek etrafmdaki bu yoriinge serileri elektron
uzaydaki yerle:;;imleri molekiillerin iic; boyutlu bic;imini
kabuklan ya da enerji diizeyleri olarak bilinir.
belirler.
• Birinci kabuk: Sadece bir tane yoriingeden olu:;;an, en ic;teki
elektron kabugu s yoriingesi olarak adlandmhr. Hidrojen
atomu (1H) ilk kabugunda bir elektrona sahip iken, hel-
2.5 Elektron Kabuklan Atomlarm Reaktivitesini Belirler Her kabuk-
yum (2He) bu kabukta iki elektron ic;erir. Geri kalan biitiin daki maksimum elektron say1s1 belirlidir. Her kabuk elektronlar bir sonraki
elementlerin atomlan ek elektronlannm yer alacag1 yoriin- kabugu i:;;gal etmeden once doldurulmak zorundad1r. <;:ekirdekten daha
geler ic;in iki ya da daha fazla kabuga sahiptir. uzaktaki kabukta bulunan bir elektronun enerji duzeyi daha yuksektir. En
d19 kabugunda e:;;le:;;memi:;; elektronlar igeren bir atom diger atomlarla
tepkimeye girebilir (bag yapar).

®
© Qek;cdek
Birinci kabuk
Ayni yiirungedeki elektronlar
c;:iftler halinde gbsterilmi:;;tir.
Hidrojen (H) Helyum (He)

ikinci kabuk

Lityum (Li) Karbon (C) Azot (N) Oksijen (0) Flor (F) Neon (Ne)

09uncO kabuk

Sodyum (Na) Fosfor (P) Kukurt (S) Klor (Cl) Argon (Ar)

~------ __..JL . ------- - --- ---~-__JL~---~


En d19 kabuklan tamamlanmam1:;; ybrungele~ En d19 kabugundaki ybrungeleri dolu olan
_____
(e:;;le:;;memi:;; elektronlar) ic;:eren atomlar reaktiftir.
_/
[ atom kararhdir.
~--------------~------~
2.2 ATOMLAR MOLEKULLERi OLU$TURMAK iC::iN NASIL BAGLANIR? 25

• Ek kabuklar: On taneden fazla elektrona sahip elementler Atomlar Moleki.illeri Olu~turmak i9in
ii<; ya da daha fazla elektron kabuguna sahiptir. Bir kabuk
c;ekirdekten ne kadar uzakta ise, bu kabugu i§gal eden
2.2 Nas1I Baglamr?
Kimyasal bag, bir molekiil ic;indeki iki atomu birbirine bagla-
elektronun enerji diizeyi o kadar yiiksektir.
yan c;ekim giiciidiir. C::e§itli kimyasal bag tipleri vardir (Tablo
ilk once s yoriingeleri elektron ile doldurulur ve bu
2.1 ). Bu kisimda once elektron payla§irm ile kurulan kuvvetli
elektronlar en dii§iik enerji diizeyine sahiptir. Daha somaki ka-
buklar, farkh sayida y0riinge ic;erir; ancak en di§taki kabuklar baglar olan kovalent baglan, daha soma da bir atomun kararh
genellikle sadece sekiz elektron ta§ir. Herhangi bir atomun en hale gelmek ic;in bir ya da daha fazla elektron kazanmasi veya
di§taki elektron kabugu (valans kabugu) bu atomun diger atom- kaybetrnesi ile olu§an iyonik baglan inceleyecegiz. En soma da,
larla ne §ekilde birle§ecegini -yani bu atomun kimyasal olarak biyolojide c;ok onemli olan hidrojen baglarmm da dahil oldu-
nasil davranacagrm- belirler. Dort y0riingeye sahip bir valans gu diger zayif etkile§im tiplerini gozden gec;irecegiz.
kabugu, sekiz elektron ic;eriyorsa, e§le§memi§ elektronu yoktur
- - - - - - - yourBioPortal.com - - - - - - -
ve bu atom kararlzdir -diger atomlarla tepkimeye girmez (l?ekil
ziYARET EDiNiZ Animasyonla Ogrenme 2.1 • Kimyasal Bag
2.5). Helyum, neon ve argon kimyasal olarak kararh elementle- Olu~umu
re ornektir. Diger taraftan, en di§ kabuklannda bir ya da daha
fazla e§le§memi§ elektron ta§iyan atomlar diger atomlarla tep-
Kovalent baglar elektron <;iftlerinin paylal}tlmas1 ile
kimeye girme yetenegindedir.
kurulur
En di§taki elektron kabuklannda e§le§memi§ elektron ta-
§iyan (yani kismen dolu y0riingelere sahip) atomlar kararsiz Kovalent bag, iki atomun en di§ kabuklarmdaki bir ya da
olup, en di§ kabuklarrm doldurmak ic;in tepkimeye girerler. Re- daha fazla e§le§memi§ elektron c;iftini payla~arak kararh
aktif atomlar ya diger atomlarla elektron payla§arak veya bir elektron sayisma ula§masiyla olu§ur. Her birinin tek kabu-
ya da daha fazla elektron kazanarak veya kaybederek kararh gunda bir elektron bulunan iki hidrojen atomunun birbirine
hale gelirler. Her iki durumda da bu etkile§ime kahlan atomlar yakla§hgmi dii§iinelim (l?ekil 2.6). Elektronlar e§le§tiginde,
kararh birliktelikler, yani molekiiller olu§turmak iizere birbi- kararh bir birliktelik olu§ur ve iki hidrojen atomu H 2 olu§tu-
rine baglanzr. Atomlann kararh molekiiller olu§turmak ic;in en racak §ekilde bir kovalent bag ile baglarnr.
di§ y0riingelerindeki elektron sayisrm sekize tamamlama egi- Bir ya da daha fazla elementin belirli oranda birbirine
limleri oktet kuralz olarak bilinir. Biyolojik olarak onemli mole- baglanmasiyla olu§an molekiiller bilel?ik olarak adlandmhr.
kiillerdeki atomlann c;ogu -ornegin karbon (C) ve azot (N)- bu
Metan gazi (CH4 ), su (H20) ve c;ay §ekeri (siikroz, C 12H 220n)
kurala uyar. Bu kurala uymayan onemli bir ornek hidrojendir.
bile§ik ornekleridir. Kimyasal simgeler, bir bile§ikteki farkh
Hidrojen (H), sadece bir tane s yoriingesi ic;erdiginden, tek ka-
elementleri, elementin simgesi altmdaki sayilar da bu bile§ik-
bugunda iki elektron ta§idigi zaman kararh hale gelir.
te her elementin kac; tane atomu bulundugunu gosterir. Her
bile§igin molekiil ag1rhg1 (molekiiler kiitle), bu molekiildeki
2.1 OZET
Canhlar dCmyas1 ile evrenin geri kalarn, ayrn kim- Hidrojen atomlan (2 H)
yasal element setlerinden olu!?ur. Atom, proton
ve notronlar i<;eren bir 9ekirdek ile 9ekirdek etra-
fmdaki yorungelerde karakteristik konfigurasyona
sahip elektronlardan olu!?ur. Bu yapt atomun kim-
yasal ozelliklerini belirler. [,.-Her ele~~;~---1
I diger atomun ,
Bir atom ic;:indeki protonlann, notronlann ve elektron-
larm duzenleni~ini ac;:1klaym1z? Bakm1z ~ekil 2.1 l yekirdegine
dogru 9ekilir...
- -
~
J~
~

'
• Farkh elementlerin (ornegin oksijen, karbon ve hel- 1--- ---- -~

yum) atomik yap1lanndaki benzerlikleri ve farkhhklan I~· ancak


tanimlamak ic;:in periyodik tabloyu kullanm1z. Bir 9ekirdek kendi I
I elektronunu da ~
elementin valans kabugunun konfigurasyonu, onun ; 9eker. i
periyodik tablodaki yerini nasll etkiler? Bakmtz s.25,


~ekil 2.2 ve 2.5

Reaktif bir atom, bag kurdugunda nasil kararli hale


I Atomlar birbirin~
yakla91r ve r-=~
elektron 9iftini
gelir? Bakm1z s. 25 ve ~ekil 2.5
--------- bir kovalent bag J
halinde payla91r.
Biyo k imy a sayesindeki bireysel oyuncular olan atomlan ta-
mthk. Elektronlarm enerji diizeylerinin bir atomu nasil kararh Hidrojen
hale getirdigini gosterdik Bir somaki kisimda farkh ozellikle- molekulu (H 2 )

ri barmdiran molekiiler yapilar ic;inde atomlan birle§tirerek, 2.6 Kovalent Baglar Elektron Payla!i1m1 ile Kurulur iki tane hidrojen
kararhhga yol ac;an degi§ik kimyasal bag tiplerini ac;iklayaca- atomu bir hidrojen molekulu olu9turmak uzere bir araya gelebilir. iki ato-
mun elektron ybrungeleri elektriksel olarak kararl1 bir 9ekilde List lisle 9ak19-
giz.
t1g1nda, bir kovalent bag kurulur.
26 BOLUM 2 1KUC::UK MOLEKULLER VE CANLI KiMYASI

TABLO 2. l
Kimyasal Baglar ve Etkile~imler
iSiM ETKILE:;liMiN TEMELI YAPI BAG ENERJisi• (KCAL/MOL)
~~~~~~~~~~~~~.:_~~~~~~~~~~~~-·

H 0
Kovalent bag Elektron 9ifti payla~1m1 I II 50-110
- N- C-
H 0
I o c0-C-11
iyonik bag Zit yuklerin 9ekimi -N-H 3-7
I
H
H
I 0+ 0- I
Hidrojen bag1 H atomu payla~1m1 -N-H ····· O=C - 3-7
....................H··
: H H H
Hidrofobik etkile~im Polar bile~iklerin (ozellikle su) :: -C-C-H
I I ""' C-CI :: 1-2
varllg1nda polar olmayan : I I /I I:
bile~iklerin etkile~imi :
.....................
H H H H H:

van der Waals Polar olmayan bile~iklerin


elektronlannin etkile~imi

aBag enerjisi, bagh ya da etkile~im ic:;indeki iki atomu fizyolojik ko~ullar altmda ayumak ic:;in gereken enerji miktandu.

atomlann atom ag1rhklanmn toplarruna e§ittir. $ekil 2.2' deki lan dort c;ift elektron- metam bir arada tutar. ~ekil 2.78 metan
periyodik tabloya bakarak, bir onceki sayfada sozii edilen ii<; molekiiliinii temsil etmek ic;in kullamlan c;e§itli yollan goster-
bile§igin molekiil agirhklanmn s1rayla 16.04, 18.01 ve 342.29 mektedir. Tablo 2.2 biyolojik olarak onemli baz1 elementlerin
oldugunu hesaplayabilirsiniz. Canh organizmalan olu§turan kovalent bag yapma kapasitelerini gostermektedir.
molekiillerin molekiil agirhklan, iki ile yanm mil yon arahgm-
dadir ve tiimiinde kovalent baglar bulunur. DAYANIKLILIK VE KARARLILIK Kovalent baglar c;ok giic;liidiir;
Metan gaz1 (CH4 ) molekiiliindeki kovalent baglar nas1l ku- bunlan kirmak ic;in c;ok fazla enerji gerekir. Canhlarm ya§aya-
rulur? Bu bile§ikteki karbon atomu, alb elektrona sahiptir: iki bildigi s1cakhklarda biyolojik molekiillerin baglan ve iic;-bo-
elektron ic;teki kabugu doldurur, dort tane e§le§memi§ elekt- yutlu yapilan oldukc;a kararhdir. Ancak bu kararhhk, degi§ik-
ron ise di§taki kabukta hareket eder. Di§ kabuk sekiz elektron likler ic;in engel olu§turmaz.
ta§1yabildigi ic;in, karbon diger dort atom ile elektron payla-
§Irru yapabilir -dart tane kovalent bag kurabilir ( ~ekil 2.7A). Bir ORYANTASYON Belirli bir element c;ifti ic;in -ornegin hidroje-
karbon atomu dort hidrojen atomu ile tepkimeye girdiginde, ne bagh karbon- kovalent bagm uzunlugu daima aymdir. Bir
metan olu§ur. Elektron payla§IIlli arac1hg1 ile metanm karbo- molekiil ic;indeki belirli bir atom ic;in, her kovalent bagm diger
nu §imdi sekiz elektronu tamamlayarak, kararh konfigiiras- baglarla yaphg1 ac;1 da genellikle aymdir. Bu durum, bu atomu
yona ula§Illi§ olur. Dort hidrojen atomunun herbirinin di§ ka- ic;eren daha biiyiik molekiiliin tipine bagh olmaks1zm gec;erli-
buklan da doldurulmu§ olur. Dort adet kovalent bag -payla§1- dir. Onegin, metanm karbon atomu etrafmdaki dort adet dolu
yoriingesindeki bagh hidrojenler, uzayda daima bir diizgiin
dortyiizliiniin (tetrahedron) ko§elerine dogru yonelecek §e-
kilde dag1hrlar. Bu diizgiin dortyiizliiniin merkezinde karbon
TABLO 2.2 yer ahr (bakm1z $ekil 2.7B). Bu karbon, hidrojen di§mdaki
dort atomla bag yaprru§ olsa da, bu iic;-boyutlu oryantasyon
Biyolojik Olarak Onemli Baz1 Elementlerin korunur. Kovalent baglarm uzaydaki oryantasyonu molekiil-
Kovalent Bag Yapma Kapasiteleri lerin ii~-boyutlu geometrisini belirler. Molekiillerin bi~imi ise,
ELEMENT KOVALENT BAGLARIN SAYISI Kis1m 3.l'de gorecegimiz gibi, onlarm biyolojik i§levleri ac;1-
Hidrojen (H)
smdan onemlidir.
Oksijen (0) 2
c;OKLU KOVALENT BAGLAR Bir kovalent bag, bagh atomlann
Kukurt (S) 2 kimyasal sembolleri arasma c;izilen bir c;izgi ile temsil edile-
Azot (N) 3 bilir:
Karbon (C) 4
Fosfor (P) 5 • Tekli kovalent bag payla§ilan bir c;ift elektron ic;erir (ornegin,
H-H ya da C-H).
2.2 ATOMLAR MOLEKULLERi OLU$TURMAK iCiN NASIL BAGLANIR? 27

(A) 1 Cve4 H 2.7 Kovalent Baglanma ile Bile~ikler Olu~abilir (A) Molekul
formUlu CH 4 olan metanin olu9umundaki kovalent baglan gosteren
Bohr modeli. Elektronlar c;:ekirdek etraf1ndaki kabuklarda g6steril-
mi9tir. (B) Metanin yap1s1ni temsil eden ek gosterimler. Top-ve-c;:u-
buk modeli ve uzay modeli baglann uzaydaki konumlanni goster-
mektedir. Uzay modeli molekUlun genel bic;:imini ve yuzeyini ortaya
koymaktad1r. ilerideki bolumlerde molekUlleri gostermek ic;:in farkl1
yollar kullanilacakt1r. Bu modellerin gerc;:ek portreyi degil, belirli ozel -
likleri gosterdigini ak1lda tutunuz.

~;;;;-~·~ dart hidrojen atomununun


elektorununu payla:;;arak d1:;; I
J
Bohr modelleri kabugunu tamamlayabilir ve metan j
olu:;;ur. ____ __j

(B)
Tek bir c;:izgi ya da bir <;ift nokta
payla:;;1lan elektron c;:iftini temsil eder.

-]!~\
---,
Hidrojen atomlan duzgun
dort-yuzlunun ko:;;elerini olu:;;turur.
( Bu model metanin
! uzaydaki bi<;imini
l~~~
l
I

H-l-H
H' or
\H
H :c: H
I ••
H H

Yap1sal formuller Top-ve-c;:ubuk modeli Uzay modeli

e9it olmayabilir. C::ekirdeklerden biri elektron c;ifti iizerine di-


• <;ift bag payla;nlan dort (iki c;ift) elektron ic;erir (C = C) ger c;ekirdekten daha fazla c;ekim giicii uygulayabilir ve boy-
• l1(:ZU baglar -payla91lan alh elektron- seyrek olmakla birlik- lece bu elektron c;ifti bu atoma daha yakm olur.
te, soludugumuz havanm temel bile9eni olan azot gazmda Bir kovalent bagdaki elektronlar iizerine bir atom c;ekirde-
(N = N) bu bagdan bulunur. gi tarafmdan uygulanan c;ekim giicii elektronegativite olarak
adlandmhr. Bir c;ekirdegin elektronegativitesi kac; tane pozi-
E~iT OLMAYAN ELEKTRON PAYLA~IMI Eger aym elementin iki tif yiik ta91d1gma (daha fazla proton ic;eren c;ekirdekler daha
atomu kovalent olarak baghysa, bunlann en d19 kabuklarm- fazla pozitif yiik ta91yacagmdan, elektronlan daha c;ok c;eker)
daki elektron c;ifti(-leri) e9it olarak payla91hr. Buna kar91hk, iki ve bagdaki elektronlarla c;ekirdek arasmdaki uzakhga (c;ekir-
farkh elementin atomlan soz konusu ise, elektron payla9rm1 dege daha yakm elektronlar daha fazla elektronegatif c;ekime
tabidir) baghd1r. Tablo 2.3, biyolojik sistemlerdeki onemli bazi
elementlerin elektronegativitelerini gostermektedir.
Bohr modeli Uzay modeli
Eger iki atomun elektronegativitesi birbirine yakmsa, bun-
lar elektronlan e9it olarak payla9ir. Bu baga, polar olmayan
(nonpolar) kovalent bag ad1 verilir. Ornegin, her birinin elektro-
negativitesi 3.5 olan iki oksijen atomu elektronlan e9it olarak
payla91r. Benzer bir durum (her birinin elektronegativitesi 2.1
olan) iki hidrojen atomu ic;in de soz konusudur. Ancak hid-

kovalent
baglar
_j_
rSu molekulu_n_u_
s•
n -b-ag- la-r-1n-d-ak_1_e_
le-kt-ro_n_la_r __
rojen su olu9turmak iizere oksijene bagland1gmda, bag elekt-
ronlan e9it olarak payla§ilmaz: elektronlar oksijen c;ekirdegine
daha yakm olma egilimindedir; c;iinkii bu atom daha elektro-
negatiftir. Elektronlar c;ekirdeklerden birine daha fazla c;ekil-
Top-ve-c;:ubuk
I~:;;1t olarak payla:;;1lamaz, c;:unku bu elektronlar diginde, polar kovalent bag ortaya c;ikar (~ekil 2.8).
modeli oksijen atomunun c;:ekirdegine daha guc;:lu
bic;:imde 9ekilirler.
2.8 Suyun Kovalent Baglan Polard1r Buradaki uc;: temsili gosterim su-
daki (H 2 0) polar kovalent baglan ortaya koymaktad1r. Oksijen ve hidrojen
gibi farkl1 elektronegativitelere sahip atomlar kovalent bag kurdugunda,
elektronlar c;:ekirdeklerden birine dogru daha fazla c;:ekilirler. Bu tip bir polar
kovalent bag ile bir arada tutulan bir molekul farkl1 yuzeylerinde k1smi yukler
(8+ ve s-) ta91r. Su molekulunde payla91lan elektronlar oksijen atomunun
c;:ekirdegine yak1n konumda bulunurlar.
28 SOLUM 2 KU<;;UK MOLEKULLER VE CANU KiMYASI
I

TABLE 2.3 Ca2 + (kalsiyum iyonu, iki elektron kaybetmi§ kalsiyum ato-
mudur) ve Mg 2+ (magnezyum iyonu) boyledir. Biyolojik ola-
Baz1 Elektronegativiteler rak onemli iki element birden fazla kararh iyon olu§turabilir.
ELEMENT ELEKTRONEGATIVITE
Bunlar demir ve bakrrdrr. Dernir Fe 2 + (ferrus iyonu) ve Fe 3 +
(ferrik iyonu), bakrr ise Cu+ (kuproz iyonu) ve Cu 2 + (kuprik
Oksijen (0) 3.5
iyonu) olu§turur. Elektrik yiikii ta§iyan kovalent bagh atom
Klor(CI) 3.1
gruplan kompleks iyonlar olarak adlandmhr. Bunlar arasm-
Azot (N) 3.0 da NHt (amonyum iyonu), soi- (siilfat iyonu) ve PO,i- (fosfat
Karbon (C) 2.5 iyonu) vardrr. iyonlar genellikle kararh yapdardrr ve daha faz-
Fosfor (P) 2.1 la elektron kaybetmez ya da kazanmazlar.
Hidrojen (H) 2.1 iyonik baglar, zit yiikler ta§iyan iyonlar arasmdaki elektrik-
sel c;:ekim sonucunda kurulurlar. iyonlar kararh kah bile§ikler
Sodyum (Na) 0.9
olu§turan baglar kurarlar ki, bu bile§ikler ic;:in tuz terirni kulla-
Potasyum (K) 0.8 nilrr. Sodyum kl6riir (NaCl) ve potasyum fosfat (K3P04) tuzlara
ait orneklerdir. Sofra tuzu olarak tarud1gnruz sodyum kloriirde
(NaCl) katyon ve anyonlar iyonik baglarla bir arada tutulur.
Elektronlann bu §ekilde e§it olmayan payla§nm nedeniyle,
Katdar ic;:indeki iyonik baglar giic;:liidiir; c;:iinkii bunlar birbi-
hidrojen-oksijen bagllllll oksijen olan ucu kismi negatif yiik ta-
rine yakmdrr. Buna kar§ihk, iyonlar su ic;:inde dag1ld1gmda,
§Ir (o- ile sembolize edilir, "delta negatif" diye okunur, anlarru
aralanndaki uzakhk arthgmdan, iyonik c;:ekim biiyiik olc;:iide
kismi yiik birimidir), hidrojen ucu ise kismi pozitif yiik ta§rr
azalrr. Can11 hiicreler ic;:indeki ko§ullarda, iyonik c;:ekim kuvveti
(o+). Zit yiikler bagm iki ucuna ya da kutbuna aynlrru§ oldugu
nonpolar kovalent bagdan daha azdrr (bakrmz Tablo 2.1).
ic;:in, bu bag polardrr. Polar kovalent baglarm sonucu olan kismi
iyonlarm polar molekiillerle etkile§meleri siirpriz say1l-
yiikler, polar molekiiller ya da biiyiik molekiiller iizerinde po-
maz; c;:iinkii her ikisi de elektrik yiikii ta§rr. Bu tip bir etkile§im,
lar bolgeler yarahr. Molekiiller ic;:indeki polar baglar, bunlarm
NaCl gibi kah bir tuz su ic;:inde c;:ozlindiiglinde ortaya c;:1kar.
diger polar molekiillerle etkile§imini biiyiik olc;:iide etkiler. Su
Her bir iyonu c;:evreleyen su molekiilleri bunlan birbirinden
(H20) polar bir molekiildiir ve bu polarite onun fiziksel ozellik-
aymr ( ~ekil 2.10). Negatif yiiklii klor iyonlan su molekiilleri-
leri ve kimyasal reaktivitesi iizerinde, daha sonraki boliimlerde
goreceginiz gibi, onemli etkilere sahiptir.

iyonik baglar elektriksel c;ekim ile olu~ur Klar sodyumdan


bir elektron "<;alar".
Etkile§en atomlardan biri digerinden c;:ok daha elektronega-
tif oldugunda, bir ya da daha fazla elektron aktanm1 soz ko-
nusu olabilir. Sodyum (elektronegativitesi 0.9) ile kloru (3 .1)
ele alahm. Sodyum atomunun en di§ kabugunda sadece bir
elektron vardrr ve bu karars1z bir durumdur. Klor atomu ise
en di§ kabugunda yedi elektron ic;:erir ve bu da karars1z bir
durumdur. Klorun elektronegativitesi sodyumunkinden c;:ok
daha biiyiik oldugundan, baglanmada i§e kan§an herhangi Sodyum atomu (Na) Klor atomu (Cl)
bir elektron, sodyumun di§ kabugundan klorun di§ kabu- (11 proton, 11 elektron) (17 proton, 17 elektron)
guna transfer olma egiliminde olacakhr (~ekil 2.9). Sodyum
ile klor arasmdaki bu tepkime, sonuc;:ta ortaya c;:1kan atomlan
c;:ok daha kararh hale getirir; c;:iinkii sonuc;:ta her ikisi de en di§
l
kabuklarmda tamamen e§le§rni§ sekizer elektrona sahip olur.
Boylece iki iyon ortaya c;:1kar.
iyonlar atomlarm bir ya da daha fazla elektron kaybetmesi 0
ya da kazanmas1 ile olu§an ve elektriksel yiik ta§1yan partikiil-
lerdir: /
• Ornegirnizdeki sodyum iyonu (Na+) +1 yiik ta§1maktadrr; Sodyum iyonu (Na+) Klor iyonu (Cl-)
c;:iinku proton say1smdan bir eksik elektrona sahiptir. Sod- (11 proton, 10 elektron) (17 proton, 18 elektron)
yum iyonunun en di§ kabugu sekiz elektron ile dolu oldu-
gu ic;:in bu iyon kararhdrr. Pozitif yiiklii iyonlara katyon [ Bu durumdaki atomlar elektriksel
ad1 verilir. 1
olarak yuklu iyonlard1r. Her ikisi de

• Klor iyonu (Cl-) ise proton say1smdan bir fazla elektrona I elektron kabuklanni doldurdugu i<;in
kararl1d1r.
sahip oldugu ic;:in, -1 yiik ta§rr. Bu ilave elektron en di§ ka- '--------------------~

buktaki elektronlan sekize tamamlad1g1 ic;:in, Cl iyonunu


2.9 Sodyum ve Klor iyonlannm Olu~umu Bir sodyum atomu bir klor
kararh hale getirir. Negatif yiiklii iyonlar anyon olarak ad- atomu ile tepkimeye girdiginde, daha elektronegatif olan klor sodyumdan
landmhr. bir elektron "9alarak" en d19 kabugunu doldurur. Boylece klor ato mu eksi
Baz1 elementler birden fazla elektron kaybederek ya da kaza- yuklu klor iyonu (Cl-) haline, bir elektronu eksilen sodyum atomu ise art1
narak c;:oklu yiikler ta§1yan iyonlar olu§turabilirler. Ornegin yuklu sodyum iyonu (Na+) hal ine gelir.
2.2 ATOMLAR MOLEKULLERi OLU$TURMAK iC::iN NASIL BAGLANIR? 29

(A)
Na+ ve c 1- aras1ndaki I
iyonik baglar bu iyonlan kat1 i
, kristal ic;:inde bir arada tutar. J
- ----- ---~---- - ----___/

<;ozunmemi:;;
sodyum klorur =------------ Hidrojen
bag Ian

~- --~ --:- --- -

1 NaCl su 1c;:1nde
- -- -.
Su
molekulleri l
~+~+
1

ozundugunde, klor j iki tane su molekUlu Buyuk bir molekulun iki k1sm1
Ll nyonu (-) suyun 0+ · 't/' .., ~
(ya da iki buyuk molekUI)

------ v---
+
utbunu c;:eker... _j ~ + v ..-
2.11 Hidrojen Baglan Molekiiller Arasrnda veya i~inde Kurulur (A) iki
molekUI aras1ndaki hidrojen bag1, molekullerden biri uzerindeki eksi yuk ile
g . \-x )( ikinci molekulun bir hidrojen atomunun art1 yuku aras1ndaki <;ekimdir. (B)
A!;_ + Hidrojen baglan buyuk bir molekUlun farkl1 k1s1mlan aras1nda da kurulabilir.
~ - ~
~x .\-~ Ok
+~ x

IJ"'"'
·c;/,,~ + +
6zelliklerini biiyiik 6lc_;iide etkiler. Bu boliimiin sonraki kisimla-
! __ ___}__ - - - - .\ + rmda su molekiilleri arasmdaki hidrojen baglarmm, bu bile;;igi
I ... sodyum katyonu I canh sistemler ic_;in c_;ok 6nemli ktlan birc_;ok 6zelligine nastl katki
1 (+)ise suyun I yaphglnl gorecegiz. Hidrojen baglan, DNA ve proteinler gibi
0- kutbunu c;:eker.
devasa molekiillerin iic_;-boyutlu bic_;irnlerini kazanmas1 ve siir-
diirmesinde de 6nemli bir rol oynarlar (bakiniz Kisrm 3.2).

2.10 Su Molekiilleri iyonlan yevreler iyonik bir kat1 su i<;inde <;6zundu-


gunde, polar su molekulleri katyon ve anyonlann <;evresinde kumelenir ve Polar olan ve polar oymayan bile~ikler: Her biri en iyi
onlann bir araya gelmesini engeller. kendi tipindeki bile~iklerle etkile~ir
Su molekiillerinin birbirleri ile hidrojen baglan arac1hg1 ile
etkile;;mesine benzer ;;ekilde, polar molekiiller de diger po-
nin pozitif kutbunu c_;ekerken, pozitif yiiklii sodyum iyonlan lar molekiillerle hidrojen baglanmn zay1f c_;ekirnleri (o+ ve o-)
su molekiillerinin negatif kutuplanm c_;eker. Bu durum sumo- arac1hg1 ile etkile;;irler. Eger polar bir molekiil su ile bu yolla
lekiillerinin polaritesinden kaynaklanan 6zelliklerden biridir. etkile;;irse, buna hidrofilik (su-seven) denir ($ekil 2.12A).

Hidrojen baglan polar kovalent baglar ta~1yan Polar molekuller Nonpolar molekuller
moleki.iller arasmda ya da ic:;:inde kurulabilir suya dogru degil,
birbirlerine dogru c;:ekilir.
S1v1su ic_;inde, bir su molekiiliiniin negatif yiiklii oksijen atomu
(()-), bir ba;;ka su molekiiliiniin pozitif yiiklii hidrojen atomlan
(()+) tarafmdan c_;ekilir ($ekil 2.11A). Bu c_;ekim sonucunda olu-
;;an baga hidrojen bag1 denir. Hidrojen baglan sadece su mo-
lekiilleri arasmda kurulmaz. Bu baglar kuvvetli elektronegatif
bir atom ile bir ba;;ka elektronegatif atoma kovalent bagh bir
hidrojen atomu arasmda da kurulabilir ($ekil 2.118).
Hidrojen baglan kismi yiikler arasmda (()+ ve <'>-) kuruldugu
ic_;in, iyonik baglarm c_;ogundan daha zay1fhr. Bu bag bir hidro- (A) Hidrofilik (B) Hidrofobik
jen atomu ile bir oksijen atomu arasmdaki kovalent bagdan c_;ok
daha zayifhr (bakmiz Tablo 2.1). Tek tek hidrojen baglan zay1f 2.12 Hidrofilik ve Hidrofobik (A) Polar kovalent baglara sahip molekuller
olmakla birlikte, bir molekiil ic_;inde ya da iki molekiil arasm- polar su taraf1ndan <;ekilirler {bunlar hidrofiliktir) . (B) Polar olmayan kovalent
da c_;ok say1da hidrojen bag1 kurulabilir. <:;:ok say1daki bu gibi baglara sahip molekuller suya degil, birbirlerine kar91 daha fazla <;ekim
g6sterirler {bunlar hidrofobiktir).
hidrojen baglan oldukc_;a giic_;liidiir ve bile;;iklerin yap1slnl ve
30 BOLUM 2 KOc;OK MOLEKOLLER VE CANLI KiMYASI

Polar olmayan moleki.iller diger polar olmayan moleki.il-


lerle etkile§me egilimindedir. Ornegin, karbon (elektronegati-
vitesi 2.5) ve hidrojen (elektronegativitesi 2.1) nonpolar baglar
kurarak sadece hidrojen ve karbon atomlan i<;eren moleki.iller
olu§turursa -bunlara hidrokarbonlar denir- bu gibi molekiiller
polar degildir. Bu molekiiller su i<;indeyken polar su molekiil-
leri ile etkile§mek yerine, kendi aralannda bir araya gelme
egiliminde olurlar. Dolay1s1yla, polar olmayan molekiillere
hidrofobik (su-sevmeyen) denir ve bunlar arasmdaki etkile-
§imler hidrofobik etkile~imler olarak adlandmhr ($ekil 2.128).
+ -- + +
~
Aslma bak1hrsa, hidrofobik bile§ikler ger<;ekte sudan "nefret
etmezler". Bunlar su ile zay1f etkile§imler olu§turabilirler;
<;iinkii karbon ve hidrojenin elektronegativiteleri aym degil-
C3H8 + 5 02
-- 3 C0 2 + 4 H20 + ls1ve191k

dir. Ancak bu etkile§imler, su molekiilleri arasmdaki hidrojen Pro pan + Oksijen Karban - + Su + Enerji
baglarmdan <;ok daha zay1fhr. Bu nedenle polar olmayan bile- gaz1 dioksit
§ikler agregat olu§turma egilimindedir.
Reaktantlar Oriinler
Polar olmayan bile§ikler arasmdaki etkile§imler, van der
Waals kuvvetleri tarafmdan gii<;lendirilir. Bu gii<;ler, polar ol- 2.13 Kimyasal Tepkimede Bag Yapllan Partnerler ve Enerji
mayan iki molekiiliin birbirlerine yakm mesafeye gelen atom- Degi~ebilir Bu ocaktaki bir propan molekulu ui;: molekUI karbon dioksit
lan arasmda ortaya <;ikar. .Kisa siireli olan bu etkile§imler, bir ve dbrt molekUI su verecek :;;ekilde be:;; molekul oksijen gaz1ile tepkimeye
girer. Bu tepkime 1s1 ve 191k :;;eklinde enerji salar.
molekiiliin elektron dag1hmmdaki rasgele degi§ikliklerin so-
nucudur ve bu degi§iklik kom§u molekiilde zit elektrik yiikii
dag1hm1 yarahr. Her ne kadar tek bir van der Waals etkile§imi gaz1 (0 2 ) ile tepkimeye girdiginde, karbon atomlan hidrojen
kisa siireli ve zayif olsa da, biiyiik bir nonpolar molekiiliin ta- atomlan yerine oksijen atomlan ile bagh hale gelirken, hidro-
mammda yer alan bu tip etkile§imlerin toplami i::inemli bir <;e- jen atomlan da karbon yerine oksijene bagh hale gelirler ($ekil
kim giicii yaratrr. Bu durum nonpolar molekiilleri organizma 2.13). Kovalent olarak bagh atomlar partnerlerini degi§tirdigi
i<;indeki polar (sulu) ortamda birbirlerine yapl§hnr. Buna ait i::ir- zaman, maddenin bile§imi degi§ir; propan ve oksijen gaz1 kar-
nekleri i::irnegin biyolojik zarlarm yap1sim incelerken gorecegiz. bon dioksit ve su haline gelir. Bu kimyasal tepkime a§ag1daki
e§itlik ile temsil edilir:
2.2 OZET C 3H 8 + 502 ---+ 3C02 + 4H 20 + Enerji
Baz1 atomlar diger atomlarla bir ya da daha fazla Reaktantlar---+ Uriinler
elektron 9iftini payla~arak, gu9lu kovalent baglar Bu e§itlikte, propan ve oksijen reaktantlar, karbon dioksit ve
kurarlar. E~it olmayan elektron payla~1m1 polarite- su ise i.iri.inlerdir. Bu tepkime oksidasyon-rediiksiyon ad1 ve-
ye neden olur. Ba~ka baz1 atomlar elektron kaybe- rilen ozel bir tepkime tipidir. Elektronlar ve protonlar su olu§-
derek ya da kazanarak iyonlar haline gelir ve diger turmak iizere, propandan (rediikleyici ajan) oksijene (oksitle-
iyonlarla ya da polar molekullerle etkile~irler. yici ajan) aktanhr. Daha sonraki boliimlerde elektron/proton
aktanmm1 i<;eren bu tip tepkimeleri bir<;ok kez goreceksin iz.
• Kovalent bag, iyonik bagdan nic;:in daha guc;:ludur?
Bir kimyasal tepkimenin iiriinleri reaktantlara gore <;ok
Bakm1z ss. 26-28 ve Tablo 2.1
farkh ozelliklere sahiptir. $ekil 2.13'de gosterilen durumda,
• Elektronegativitedeki degi~iklikler polar molekuller- tepkime tamamlanmz~tzr : propan ve oksijenin tiimii iki iiriin
deki e~it olmayan elektron dag11imina nasil neden olu§turmak iizere tamamen kullamlm1§hr. Ok, kimyasal tep-
olur? Bakm1z ss. 27-28 ve ~ekil 2.8 kimenin yoniinii temsil eder. Molekiil formiillerinin oniindeki
• Hidrojen bag1 nedir ve biyolojik sistemler ic;:in neden sayilar ka<; tane molekiiliin kullamld1gm1 ve olu§turuldugunu
onemlidir? Bakm1z s. 29 ve ~ekil 2.11 gosterir.
Bu ornekte ve diger biitiin kimyasal tepkimelerde madde
Atomlarm molekiiller i<;indeki baglan mutlaka kahc1 olmak ne yeniden yaratzlzr, ne de yok olur. Soldaki karbon atomlarmm
zorunda degildir. Canhhgm dinarnigi, molekiiler diizeyde toplam say1s1 (3) sagdaki karbon atomlannm say1sma (3) e§it-
bile siirekli bir degi§imi i<;erir. $imdi molekiillerin birbirleriyle tir. Diger bir deyi§le, e§itlik denktir. Bununla birlikte, bu tep-
nas1l etkile§tiklerine-nas1l y1kild1klarma, nasil yeni partnerler kimede bir ba§ka olgu daha vardir: ocakdaki ate§in is1s1 ve l§l-
bulduklarma ve bu degi§ikliklerin ne gibi sonu<;lan oldugu- g1, propan ile oksijen arasmdaki tepkimenin biiyiik miktarda
na- bakahm. enerji a<;1ga <;1kard1gm1 da gosterir.
Enerji i§ yapabilme kapasitesi olarak tammlamr; ancak
23 •
Kimyasal Tepkimeler S1rasmda Atomlar
Partnerlerini Nas1I Degil?tirir?
kimyasal tepkimeler i<;in bu kavram degi§ebilme kapasitesi
olarak dii§iiniilebilir. Kimyasal tepkimeler, enerji yaratmaz ya
Bir kimyasal tepkime, hareketli atomlar birle§melerine ya da da yok etmez; buna kar§1hk genellikle enerji formundaki degi-
bag partnerlerini degi§tirmelerine yetecek enerji ile <;arpl§hk- ~iklikler kimyasal tepkimeye e§lik eder.
lan zaman ger<;ekle§ir. Bir propan ocagmdaki yanma sirasm- Propan ile oksijen arasmdaki tepkimede, biiyiik miktarda
da ger<;ekle§en tepkimeyi dii§iinelim. Propan (C 3H 8), oksijen is1 a<;1ga <;1kar. Bu enerji potansiyel enerji ad1 verilen bir ba§ka
formda, propan ve oksijen gaz1 molekiillerinin kovalent bag-
2.4 SUYU CANLILAR ic;;iN ONEMLi YAPAN NEDiR? 31

lannda bulunuyordu. Turn tepkimeler enerji ac;1ga c;1karmaz; Su ~ok ozel yap1 ve ozelliklere sahip bir bilel?iktir
gerc;ekten de birc;ok kimyasal tepkime c;evreden enerji eklen-
mesini gerektirir. Bu enerjinin bir k1sm1 daha sonra, iiriinlerde H 20 molekiilii, kendine ozgii kimyasal ozellikler ta§ir. Suyun
kurulan baglarda potansiyel kimyasal enerji halinde depola- hidrojen baglan kurabilen polar bir molekiil oldugunu ogren-
mr. ilerideki boliimlerde enerji salan ve enerji gereksinen tep- dik. Oksijen atomunun di§ kabugundaki dort c;ift elektron bir-
kimelerin birbirine nas1l bagland1gm1 gorecegiz. birini iterek, su molekiiliine tetrahedral bir bic;im kazandmr:
Canh hiicrelerde birc;ok kimyasal tepkime gerc;ekle§ir ve
bunlarm bir kism1 propanm yanmasmda gerc;ekle§en oksi-
dasyon-rediiksiyon tepkimesi ile pek c;ok ortak ozellik ta§ir.
Hiicrelerdeki reaktantlar farkhdir (§ekerler ya da yaglar ola-
bilir) ve tepkimeler birc;ok ara basamakta cereyan eder. Buba-
samaklar ac;iga c;1kanlan enerjinin korunarak, hiicreler tarafm-
dan kullamlmasma olanak saglar. Ancak ortaya c;1kan iiriinler
Payla:;;1lan
aymdir: karbon dioksit ve su. Bu kitabm Uc;iincii K1smmda, elektron 9iftleri
canh sistemlerde yaygm olarak cereyan eden enerji degi§ik-
liklerini, oksidasyon-rediiksiyon tepkimelerini ve diger kim-
yasal tepkime tiplerini ele alacag1z. Bu kimyasal karakterler, buzun su iizerinde yiizmesi,
suyun erime ve donma noktalan, suyun 1s1y1 depolama ye-
tenegi, su damlac1klarmm olu§umu ve suyun birc;ok bile§igi
c;ozebilme -ve c;ozememe-yetenegi gibi ilginc; ozellikleri ac;1k-
Bir kimyasal tepkimede, bir grup reaktant farkh
lamaktadir.
ki myasal bile~imlerdeki urunlere donu~tUrulur.
Bunun ba~anlabilmesi i9in, baglar kinhr ve baglar
BUZ SU 0ZERiNDE YUZER Kah haldeki suda (buz), her bir su
kurulur. Tepkimelerde enerji a<;rga 91kanhr ya da
molekiilii hidrojen baglan ile yerinde tutulur. Her molekiil,
enerji girdisi gerekir.
dort tane kom§u molekiile kah kristal yap1 ic;inde baglanm1§
Kimyasal e~itlikte denkligin nasil sagland1gin1 a<;:1kla- haldedir (~ekil 2.14). Bu molekiiller kuvvetli bir bic;imde yer-
yin1z. Bakm1z s. 30 ve ~ekil 2.13 lerinde tutuluyor olsalar da, s1v1 su ic;indeki gibi s1ki bir paket-
Bir kimyasal tepkime s1rasinda enerjinin formu nasil lenme sergilemezler. Diger bir deyi§le, katz su s1v1 sudan daha az
yogundur. Buz bu nedenle su iizerinde yiizer.
degi~iklige ugrar? Bak1mz s. 30
Gaz hal indeki su (su buhan)

Bu kitabm ikinci iinitesinde yer alan canh sistemle-


Kati haldeki su (buz)
rinde yaygm olarak goriilen diger kimyasal reaksi-
yonlan, indirgenme-yiikseltgenme reaksiyonlanm
ve enerji degi§ikliklerini §imdi gorecegiz.

Suyu Canhlar i~in 6nemli Yapan


Ned ?
Su ayncahkh ozelliklere sahip, ayncahkh bir bile§ik-
tir. Diinya iizerinde var olan ko§ullada su kah, s1v1
ve gaz formlannda bulunur ve bunlann hepsi canh
sistemleri ilgilendirir. Su, canh organizmalar ic;indeki
kim yasal tepkimelerin gerc;ekle§mesine olanak sag-
lar ve c;e§itli biyolojik yap1lann olu§turulmas1 ic;in
zorunludur. Bu kis1mda, suyu canhlar ic;in vazgec;il-
mez yapan molekiiler yap1sm1 ve etkile§imlerini ele
alacag1z.

2. 14 Hidrojen Bagi ve Suyun Ozellikleri Hidrojen baglan


hem s1v1 hem de kat1 formdaki su molekulleri aras1nda yer al1r. : Su moleki.llleri hareket ettik9e,1/ / '
Buz s1v1 sudan daha hafif oldugu ii;;in, su uzennde yuzer. Su ! hidrojen baglan surekli 1, /
molekulleri aras1ndaki hidrojen baglan k1nld1g1nda, gaz formuna 1olarak k1nl1r ve kurulur. '
donu:;;en molekuller birbinnden uzakla:;;1r. "'----- ___ / S1v1su
32 BOLUM 2 i KU<:;:OK MOLEKULLER VE CANLI KiMYASI

Eger buz suyun dibine i;okiiyor olsayd1, bunun biyolojik


sonui;lanm dii§iinelim. Bir havuz tabandan yukanya dogru
donacak ve kl§ mevsiminde kah bir buz blogu haline gelerek,
oradaki canhlann <;ogunu oldiirecekti. Donmu§ havuzdaki Sl-
cakhk suyun donma noktasllllll <;ok alhna dii§ebilecekti. Ger-
<;ek durumda buz yiizer ve yiizeyde yahho bir tabaka olu§tU-
rarak, lsmm iistteki soguk havaya kai;masm1 azalhr. Boylece,
havuzda ya§ayan bahklar, bitkiler ve diger organizmalar saf
suyun donma noktas1 olan 0°C'nin altmdaki s1cakhklara ma-
ruz kalmazlar.

ERiME, DONMA VE ISi KAPASiTESi Benzer molekiil biiyiikliigii-


ne sahip diger biri;ok bile§ige oranla, buzun erimesi i;ok daha
fazla lSl enerjisi gerektirir. Bunun nedeni, suyu kah formdan
s1v1 forma donii§tiirmek i<;in i;ok sayida hidrojen bagmm ki-
nlmasmm gerekmesidir. Bunun tersine geri;ekle§en siire<;te -
donma- <;evreye <;ok miktarda enerji salmir.
2.15 Yuzey Gerilimi Su molekullerini bir arada tutan hidrojen baglanndan
Suyun bu ozelligi, okyanuslardaki ve diger biiyiik su kiit-
otLJr(j bir yaprag1n uzerindeki SU damlac1g1 'boncuk" bic;:imini alir.
lelerindeki s1cakhklarm y1l ii;inde olduk<;a sabit tutulmasma
katki yapar. K1yilardaki kara kiitlelerinin s1cakhk degi§iklik-
leri de biiyiik miktarlardaki su tarafmdan lhmh smirlarda tu-
tulur. Tiim gezegenin atmosferik s1cakhk degi§ikliklerinin mi-
nimize edilmesi su sayesinde miimkiin olur. Bu yetenek s1v1
suyun zsz kapasitesinin bir sonucudur. Is1 kapasitesi ise onun S1v1 suyun hava ile temasta olan yiizeyini kirmak zordur;
yiiksek ozgiil lSlSmdan kaynaklanir. <;iinkii, yiizeydeki su molekiilleri altlarmdaki diger su mole-
OzgUI 1s1 herhangi bir bile§igin 1 grammm s1cakhgllll 1°C kiillerine hidrojen baglan ile baghdir ( ~ekil 2.15). Suyun yiizey
arhrmak i<;in gereken lSl enerjisi miktandir. S1v1 suyun s1cakh- gerilimi, agzma kadar dolu bir kabm ta§mamasma ve bocekle-
gllll arhrmak i<;in olduki;a biiyiik miktarda lSl enerjisi gerekir; rin su birikintisinin iizerinde yiiriimesine izin verir.
<;iinkii s1v1 suyu bir arada tutan hidrojen baglarm1 kirmak i<;in
<;ok miktarda lSl enerjisi kullamhr. Kii<;iik molekiillii diger s1-
Su mukemmel bir ~ozucudur-yal?am ortam1
v1lara gore SU daha yiiksek ozgiil lSlya sahiptir.
Suyun buharla!lma 1s1s1 da yiiksektir; bu durum, suyu s1v1 Kemiklerdeki mineraller hari<;, insan viicudunun agirhk ola-
halden gaz haline degi§tirmek i<;in i;ok miktarda lSl gerektigi rak yiizde 70' den fazlas1 sudur. Tiim organizmalarda en i;ok
anlamma gelir. Bu durumda da lSl enerjisinin biiyiik k1sm1 su bulunan bile§en sudur ve biyokimyasal tepkimelerin <;ogu bu
molekiilleri arasmdaki <;ok say1da hidrojen bagm1 kirmak i<;in su ortammda geri;ekle§ir.
kullamhr. Bu lSl, su ile temas halinde olan ortamdan absorb- Bir madde (9oziinen) bir s1v1 (9oziicii) i<;inde i;oziindii-
lanmak zorundadir. Dolay1s1yla, buharla§ma i;evrenin -ister giinde, 9ozelti olu§ur. Eger i;oziicii su ise, bu durumda i;ozelti
bir yaprak, ister bir orman ya da tiim karalar olsun- soguma- sulu r,;ozelti olarak adlandmhr. Biyolojik sistemlerdeki onem-
sma neden olur. Bu etki, terlemenin insan viicudunu neden li molekiillerin <;ogu polar olduklan i<;in suda i;oziiniirler.
serinlettigini ai;1klar: ter deriden buharla§hk<;a, o kis1mdaki Onemli biyokimyasal tepkimelerin bir<;ogu hiicre i<;indeki
lsmm bir k1sm1 kullamhr. sulu i;ozeltilerde cereyan eder. Biyologlar reaktant ve iiriinleri
tammlamak ve bunlann miktarlanm saptamak i<;in bu tepki-
KOHEZYON VE Y0ZEY GERiLiMi SlVl haldeki su molekiilleri ha- meleri incelerler:
reket edebilirler. Bu molekiiller arasmdaki hidrojen baglan
• Niteliksel (kalitatifJ analizler kimyasal tepkimelerde yer alan
siirekli olarak kurulur ve kmhr (bakm1z $ekil 2.14). Kimya-
bile§ikleri tammlamak i<;in kullamhr. Ornegin, canh doku-
cilar geri;ek bir dinamik yap1 olan su molekiiliiniin dakikada
larda glukozun yakilmas1 sirasmda yer alan basamaklan
trilyon kez bu olay1 geri;ekle§tirdigini hesaplam1§hr.
ve olu§an iiriinleri bulmak i<;in niteliksel analizler yap1hr.
Herhangi bir anda bir su molekiilii diger su molekiilleri
• Niceliksel (kantitatifJ analizler, bile§iklerin konsantrasyon-
ile ortalama 3.4 tane hidrojen bag1 kurar. Bu hidrojen baglan,
lanm yani miktarlanrn oli;er. brnegin, bir biyokimyac1
s1v1 suyun kohezyon giiciinii ai;1klar. Kohezyon su molekiille-
belirli miktarda glukozun yakilmas1 s1rasmda belirli bir
rinin gerilime tabi tutulduklarmda, birbirlerinden aynlmaya
iiriiniin ne kadar olu§tugunu bulmak i<;in niceliksel analizi
kar§1 gosterdikleri diren<; kapasitesi olarak tammlamr. Suyun
kullamr.
kohesiv giicii, s1v1 suyun yiiksek aga<;larm koklerinden yap-
raklanna ince kolonlar halinde hareket etmesine izin verir.
Kimya ve biyolojideki niceliksel dii§iincenin temelinde mol
Su yapraklardan buharla§hgmda, tiim su kolonu en tepedeki
molekiillerin i;ekimine cevap olarak yukanya dogru hareket kavram1 yer ahr. Bir bile§igin niimerik olarak gram cinsinden
eder. molekiil agirhgma e§it olan miktan bir mol' diir. Dolay1s1yla,
2.4 SUYU CANLILAR i<;;iN ONEMLi YAPAN NEDiR? 33

bir mol c;ay §ekeri (C 12H 22 0 11 ) yakla§1k 342 gram, bir mol sod- Asitler c;ozeltiye H+ iyonlan veren bile§iklerdir. H 2S04 (siil-
yum iyonu (Na+) 23 gram, bir mol hidrojen gaz1 (H 2 ) 2 gram firik asit) ve HCl, asittir. Bir molekiil siilfirik asit iki tane H+,
agirhgmdadir. bir tane SO~- iyonu vererek iyonize olur. -COOH (karboksil)
Niceliksel analizler molekiillerin dogrudan say1sm1 ver- grubu ic;eren biyolojik bile§ikler de asittir, c;iinkii c;oziindiikle-
m ez. C::iinkii, bir moldeki madde miktan dogrudan dogruya rinde a§ag1daki gibi ortama H+ iyonu verir.
onun molekiil say1s1 ile ili§kilidir ve 1 moldeki molekiil say1s1 -COOH ~ -eoo- + H+
tiim maddeler ic;in sabittir. Dolay1s1yla, bir mol tuzdaki mole-
C::ozelti ic;inde HCl ve H 2S04 gibi tiimiiyle iyonize olan asitler
kiil say1s1 ile bir mol c;ay §ekerindeki molekiil say1s1 ayrndir.
kuvvetli asittir. Ancak, biitiin asitler su ic;inde tiimiiyle iyonize
Bir moldeki sabit molekiil say1s1 Avogadro say1s1 olarak ad- olmaz. Ornegin, asetik asit (CH3COOH) suya eklendiginde,
landmhr ve bu say1 6,02 X 1023 ' diir. Kimyacilar bile§iklerin bir kism1 iki iyona (CH3COO- ve H+) disosiye olur, ama geri
say1lamayacak kadar c;ok olan gerc;ek molekiil say1lanrn degil, kalarn asetik asit olarak kahr. Bu tepkime tamamlanmarm§ ol-
laboratuvarda tarthklan mollerini hesaplarlar. Ornegin, 34,2 dugundan, asetik asit bir zayif asittir.
gram c;ay §ekerini (C 12 H 22 0 11 ) dii§iinelim. Bu miktar, bir mo-
liin onda biridir ve 6,02 X 1022 tane molekiil ic;erir. BAZLAR W ALIR Bazlar c;ozeltiden H+ alan bile§iklerdir. Asit-
Eger mol kavramm1 anlamakta zorlarnrsarnz, bunu diizi- lerde oldugu gibi, kuvvetli ve zay1f bazlar vardir. Eger NaOH
ne kavram1 ile kar§lla§hrabilirsiniz. Bir diizine yumurta ya da (sodyum hidroksit) suya eklenirse, OH- ve Na+ iyonlan vere-
bir diizine simit ald1g1m1zda, bunlarm agirhklan ve uzayda cek §ekilde c;oziiniir:
kaplad1klan yer ayrn olmasa da, ikisinden de 12 adet alml§
NaOH ~Na++ OR
oluruz.
Bir kimyac1 1 litre c;ozelti haz1rlamak ic;in bir mol §ekeri OH- konsantrasyonu arthg1 ve OH- sudan H+ absorblad1g1
(342 g) su ic;inde c;ozer ve bir mol §ekerde 6,02 x 1023 molekiil ic;in, bu c;ozelti baziktir. Tepkime tamamland1gmdan dolay1,
oldugunu bilir. 1 litre su ic;inde 1 mol bile§igi c;ozerek hazirla- NaOH kuvvetli bazdir.
nan c;ozelti 1 molar (lM) c;ozelti olarak adlandmhr. Bir hekim Zay1f bazlar arasmda, H+ iyonu alarak karbonik asit
hastasmm kan dola§imma belirli bir molar konsantrasyonda (H2C03) haline gelen bikarbonat iyonu (HC03) ve H+ alarak
ilac; enjekte ettiginde, hastanm hiicreleri ile etkile§ecek gerc;ek amonyum iyonu (NH.t) haline gelen amonyak (NH3) vardir.
-NH 2 (amino grubu) ic;eren biyolojik bile§ikler de bazdir, c;iin-
ilac; molekiilii say1sm1 yakla§1k olarak hesaplayabilir.
kii a§ag1daki reaksiyondaki gibi ortamdan H+ iyonu ahr.
Canh dokularmdaki su ic;inde c;oziinmii§ olan molekiille-
rin c;ogu 1 molara yakm konsantrasyonlarda degildir. Bunla- -NH 2 + H+ ~ NH3
rm birc;ogu mikromolar (c;ozeltinin her litresinde milyonda bir ASiT-BAZ TEPKiMELERi GERi DON0~0ML0D0R Asetik asit suda
mol; µM) ya da milimolar (c;ozeltinin her litresinde binde bir c;oziindiigiinde, iki tepkime gerc;ekle§ir. ilk olarak, asetik asit
mol; mM) arahgmdadir. Hormon molekiilleri gibi baz1 c;ozii- iyonlarma ayn§ir:
nenler ise bundan da az konsantrasyondadir. Bu molariteler
CH3COOH ~ CH3Coo- + H+
c;ok dii§iik konsantrasyonlan belirtse de, lµM c;ozeltinin bir
litresinde yine de 6,02 x 1017 c;oziinen molekiilii oldugunu ak- Daha sonra, olu§an iyonlardan bir k1sm1 yeniden asetik asit
hmzda tutunuz. olu§turur:
CH3Coo- + H+ ~ CH3COOH
Sulu ~ozeltiler asidik ya da bazik olabilir
Bu iki tepkime geri donii§iimliidiir. Geri doni.i!ii.imli.i tepkime
Baz1 bile§ikler su ic;inde c;oziindiigiinde, pozitif yiiklii pro- reaktant ve iiriinlerin bag1l ba§lang1c; konsantrasyonlarma
tonlar halinde hidrojen iyonlarz (H+) verir. Hidrojen iyonlan bagh olarak iki yonden birine -soldan saga ya da sagdan sola-
diger molekiillere tutunabilir ve onlarm ozelliklerini degi§ti- dogru ilerleyebilir. Geri donii§iirnlii bir tepkimenin fomiilii
rir. Orne gin, "asit yagmurlarmdaki" protonlar bitkilere zarar c;ift yonlii ok kullarnlarak yazilabilir:
verir.
Burada asit (H+ veren bile§ikler) ve bazlann (H+ alan bile-
§ikler) ozelliklerini gozden gec;irecegiz. Kuvvetli ve zay1f asit Asit ve bazlar ic;in geri donii§iimiin kapsamma bagh olarak iki
ve bazlar arasmda aynm yapacak ve c;ozeltilerdeki H+ kon- tip tepkime soz konusudur:
santrasyonunu saptamak ic;in niceliksel bir yol olan pH olc;egi • Kuvvetli asit ve bazlann su ic;indeki iyonizasyonu geri do-
nii§iimsiizdiir.
iizerinde duracag1z.
• Zay1f asit ve bazlarm SU ic;indeki iyonizasyonu belirli olc;ii-
de geri donii§iimliidiir.
ASiTLER W VERiR Hidroklorik asit (HCl) suya eklendiginde,
H+ ve c1- iyonlan verecek §ekilde c;oziiniir:
SU ZAYIF ASiT VE ZAYIF BAZDIR Su molekiiliiniin hidroksit
HCl~H+ +CI- (OR) ve hidrojen iyonuna (H+) iyonize olma egilimi zay1f
olmakla birlikte oldukc;a onemlidir. Bu tepkimeye iki su mo-
H+ konsantrasyonu artan bunun gibi bir c;ozelti asidiktir.
lekiilii kahhr. iki molekiilden biri digerinden bir hidrojen iyo-
34 BOLUM 2 . KO<:;OK MOLEKULLER VE CANU KiMYASI

nu "yakalar" ve bir hidroksit iyonu bir de hidronyum iyonu H+ konsantrasyonu


pH degeri (litrede mol)
olu§turur.
0 1

Su molekUlu
(H 2 0 ) Pil asidi 10-1
Mide asidi
+ Limon suyu 10-2
2
Su molekulu Hidroksit iyonu Hidronyum iyonu
(H 20) OH- . baz H30+, asit Sirke, kola 3 10-3
bira
Dom ates 4 10-4
ow +
Ozum
Hidronyum iyonu, bir su molekiilune bagh bir hidrojen Sade kahve 5 10-5
iyonundan olu§ur. Kolayhk olmas1 apsmdan, biyokimyacilar Yagmur suyu
suyun iyonizasyonunu modifiye ederek a§ag1daki §ekilde ifa- TUkuruk 6 10-6
insan idran
de ederler:
H 20----? H+ + OH-
Distile SU 7 1 o-7 - Nbtral pH
insan kani

Suyun iyonizasyonu tiim canhlar ii;in onem ta§ir. Bu durum Denizsuyu 8


surpriz gibi gorunebilir; <;iinku, herhangi bir anda her 500 mil-
Sod yum 9
yon su molekiilunden sadece bir tanesi iyonize olmu§ halde- bikarbonat
dir. Ancak suyun canh sistemlerdeki bollugu ve iyonizasyonu
10
sonucu olu§an H+ iyonlanrun reaktif dogas1 du§iiniildugun-
de, bunun bir surpriz olmad1g1 goriilur.
Amonyakl1 11
temizleyici
pH: HiDROJEN iYONU KONSANTRASYONU Bile§ikler ya da 12 10-12
iyonlar asit ya da baz olabildigi ii;in, i;ozeltiler de asidik ya
da bazik olabilirler. Bir i;ozeltinin ne kadar asidik ya da bazik Finn temizleyici 13
oldugunu, H+ iyonu konsantrasyonunu litredeki mol olarak
(molarite i<;in sayfa 33'e bakm1z) oli;erek saptayabiliriz. Buna 14
ait bir ka<; ornek verelim:
• Saf suyun H+ konsantrasyonu 10-7M'du.
• 1 M HCl i;ozeltisinin H+ konsantrasyonu 1 M'du (tum 2.16 Baz1 Yaygm Bile~iklerin pH Degerleri
HCl'in iyonlarma disosiye oldugunu hahrlaym1z).
• 1 M NaOH i;ozeltisinin H+ konsantrasyonu 10-14 M'du
(ornegin -COO-) ta§H ve yapilarm1 kazanmak ii;in suyun po-
Burada gordugumuz rakamlar olduki;a geni§ bir skalada yer lar k1s1mlan ile etkile§irler. Ancak bu gruplar, i;evrelerindeki
almaktadu. Bu nedenle H+ konsantrasyonunu logaritmik ola- H+ ya da diger iyonlarla birle§erek yuksuz gruplar (ornegin -
rak hesaplamak daha kolay olacakhr; i;iinku logaritma bu ge- COOH) olu§turabilirler. Bu yuksuz gruplar su ile daha az etki-
ni§ arahg1 daralhr: ornegin, 100 rakam1 ii;in log 10 2; 0.01 ii;in le§me egilimindedirler. Eger boy le bir grup bu yuk bir moleku-
ise -2' dir. Canh sistemlerdeki H+ konsantrasyonlarmm i;ogu liin pari;as1 ise, hidorofobik olmas1 nedeniyle kendisini sudan
lM' dan az oldugu ii;in, bunlarm log 10 degerleri negatiftir. Ko- uzak tutacak §ekilde, molekulu katlanmaya yoneltebilir. Daha
layhk olmas1 ai;1smdan bu negatif sayilan pozitife i;eviririz. asidik bir ortamda, -Coo- gibi negatif yuklu gruplar H+ ile
Bunun i<;in H+ molar konsantrasyonunun negatif Iogaritmas1- birle§meye daha yatkmdu. Dolay1s1yla biyolojik bir dokunun
m kullarunz (molar konsantrasyonlar k6§eli parantezler ii;in- pH's1, onun bile§eni olan biri;ok molekiilun ui;-boyutlu yap1s1
de gosterilir: [H+]). Bu say1 i;ozeltinin pH's1 olarak adlandmhr. ii;in kritik oneme sahiptir. Organizmalar sulu ortamlanndaki
Saf suyun H+ konsantrasyonu 10-7 M oldugu i<;in, pH's1-log pH degi§ikliklerini en aza indirmek ic;in ne gerekiyorsa yapar-
(l0- 7) = -(-7) ya da 7' dir. Daha kui;uk negatif logaritma daha bu- lar. Bunu yapmak ic;in onemli arai;lardan biri tamponlardu.
yiik say1 anlamma gelir. Pratik terimlerle ifade etmek gerekirse,
pH'nm du§uk ohnas1, H+ konsantrasyonunun ya da asiditenin TAMPONLAR Tum canhlann i<; ortamlannm sabit tutulmas1
yiiksek olmas1 anlamma gelir. 1 M HCl' de H+ konsantrasyonu -homeostasis- hayati onem ta§H ve pH da bu kapsama dahil-
1 M, dolay1s1yla l'in negatiflogaritmas1(-log10°) O'du. 1 M Na- dir. Daha once de degindigimiz gibi, biyolojik molekuller H+
OH'm pH's110-wiin negatif logaritmas1yani14'dur. iyonlan kaybeder ya da kazarurlarsa, ozellikleri degi§ebilir ve
pH's1 7'den az olan bir i;ozelti asidiktir -H+ iyonlannm bu durum homeostasisi bozabilir. ii; ortamm sabit tutulmas1
miktan OR iyonlanndan fazladu. pH's1 7 olan bir i;ozelti not- tamponlar arac1hg1 ile saglarur. Tamponlar, onemli oli;ude asit
raldir (net yuk ta§1maz), pH's1 7'den fazla olan bir i;ozelti ise ya da baz eklenmesi durumunda dahi pH'y1 olduki;a degi§-
baziktir. ~ekil 2.16 yaygm olarak bulunan baz1 bile§iklerin pH mez tutan i;ozeltilerdir. Bu nas1l saglarur?
degerlerini gostermektedir. Tampon, zay1f bir asit ile bunun e§lenigi bazdan -ornegin,
pH ile ilgili bu tarh§ma biyolojide neden i;ok onemlidir? karbonik asit (H2C03) ve bikarbonat iyonlan (HC03-)- olu§an
Biyolojik olarak onemli molekullerin bin;ogu yuklu gruplar bir c;ozeltidir. Bu tamponu ii;eren bir i;ozeltiye asit eklenirse,
2.4 SUYU CANLILAR i<;iN ONEMLi YAPAN NEDiR? 35

2.17 Tamponlar pH'daki Degii;iklikleri Minimuma indirir ilave edilen


Asidik
bazlann miktanndaki art1:;;la birlikte pH grafiginin genel egimi a:;;ag1ya dog-
(H+ yuksek)
rudur. Tamponun yoklugunda, egim dikt ir. Ancak, ilave edilen tamponun
tamponlama aral1g1 ii;:erisinde egim , duzle:;;ir. Tamponun etkisiz oldugu
yerler olan pH'nin i;:ok yuksek ve i;:ok du:;;uk oldugu degerlerde, egimler
2
i;:ok diktir.
asitten gelen iyonlann tiimii c;:ozeltide kalmaz. Bunun yerine, 3
bu iyonlann c;:ogu daha fazla karbonik asit olu:;;turmak iizere
bikarbonat iyonlan ile birle:;;ir: 4
pH
HC0 3- + H+--+ H 2C03 5
Bu tepkime c;:ozeltideki H+ iyonlanmn bir kismm1 kullamr ve
6
eklenen asidin asitle:;;tirici etkisini azalhr. Eger bir baz eklenir-
-·- - ----·-
se, tepkime ters yonde gerc;:ekle:;;ir. Karbonik asidin bir kism1 ' Tamponlama kapas1tesi !
!
bikarbonat iyonlan ve eklenen bazm etkisini ortadan kald1- a:;;1ld1g1nda. eklenen baz -"- o-.._
racak daha fazla H+ olu:;;turmak iizere iyonize olur. Bu yolla 8 - pH'y1QOk yukseltir.
tampon, eklenen asit ya da bazm pH iizerindeki etkisini en aza Bazik
indirir. Bu tamponlama sistemi kanda bulunur. Kan pH'sm- (W du9uk)
0 2 3 4 5
daki degi:;;ikliklerin onlenmesi onemlidir; c;:iinkii, pH' daki de- Eklenen baz miktan (yapay birimler)
gi:;;iklik kanm dokular ic;:in hayati oneme sahip olan oksijen ,;
ta:;;1ma yetenegini ortadan kaldirabilir. Belirli miktarda asit ya ' Tamp~~~~sa, baz eklenmesi pH'y1 ·1.I
h1zla artinr.
da baz, tamponlanm1:;; bir c;:ozeltideki pH'y1 tamponlanmam1:;;
bir c;:ozeltiye oranla daha az degi:;;tirir ($ekil 2.17).
Tamponlar, geri donii:;;iimlii tepkimeler ic;:in onemli olan
ve kiitle etkisi yasasz denilen kimyasal prensibe uyarlar. Geri
donii:;;iimlii sistemin bir tarafma eklenen reaktant, tepkimeyi a 1 I!:? T k
bu bile:;;igi kullanan yone dogru c;:eker. Tamponlar soz konusu Buraya kadar atom ve molekiillerin temel ozelliklerini incele-
oldugunda, asit eklenmesi tepkimeyi bir yone dogru c;:eker- dik. $imdi bu ozelliklerin biyolojik sistemlerdeki molekiillerle
ken, baz eklenmesi tepkimeyi diger yone dogru c;:eker. nas1l ili:;;kili olduklanm tekrar gozden gec;:irelim.
Yaygm bir sorun olan haz1ms1zhg1 ortadan kaldirmak ic;:in • Molekiiller farklz biiyiikliiklerdedir. Hidrojen gaz1 (H 2 ) ve
bir tampon kullamnz. Midenin ic;:ini do:;;eyen hiicreler siirekli metan (CH4 ) gibi baz1 molekiiller kiic;:iiktiir. Kirk be:;; atom
olarak hidroklorik asit salg1lar ve mide ic;:erigini asidik hale ic;:eren c;:ay :;;ekeri (C 12H 22 0 11 ) gibi baz1 molekiiller daha bii-
getirir. A:;;m mide asidi sindirimi engeller ve rahats1zhk ya- yiiktiir. Ozellikle niikleik asitler ve proteinler gibi on bin-
rahr. Bu rahats1zhg1 gidermek ic;:in, tampon gibi davranan lerce ve hatta milyonlarca atom ic;:eren baz1 molekiiller ise
NaHC0 3 (sodyum bikarbonat) gibi bir tuz kullamnz. devasa biiyiikliiktedir.
• Tiim molekiiller ozgiil ii9-boyutlu bi9ime sahiptir. Ornegin,
.~· 2.4 OZET karbon atomu etrafmdaki bag yoriingelerinin yerle:;;imi
Canh kimyas1rnn buyuk k1sm1 su i9inde ger9ekle- metan molekiiliine (CH4 ) diizgiin dortyiizlii bir bic;:im
~ir. Suyun molekuler ozellikleri, onun onemli bi- kazandmr (bakm1z $ekil 2.7B). Daha biiyiik molekiillerin
yokimyasal rolleri i9in uygundur. Suyun ayncahkh kompleks bic;:imleri, ic;:erdikleri atomlann c;:e:;;idi ve bunla-
ozelliklerinden biri, iyonize olma {hidrojen iyonlan rm birbirlerine baglanma tarzlannm bir sonucudur. Orne-
verme) yetenegidir. <;ozelti i9inde hidrojen iyonla- gin, hemoglobin proteini (alyuvarlardaki oksijen ta:;;1y1c1
nrnn bulunmas1, biyolojik molekullerin ozelliklerini protein) gibi baz1 biiyiik molekiiller topa benzer kompakt
bic;:imdedir. Sac;:m yap1sm1 kuran keratin proteini gibi baz1-
d egi~tirebilir.
lan ise ince, uzun iplik benzeri yap1dadir. Bu molekiillerin
Suyun molekul yap1smdan ileri gelen ve biyolojik bic;:imleri canh hiicrelerde oynad1klan rollerle ili:;;kilidir.
olarak onemli olan baz1 ozelliklerini tanimlaym1z. • Molekiiller belirli kimyasal ozellikleri ile karakterize edilir ve bu
Bakm1z ss. 31-32 ve ~ekil 2.14 ozellikler onlann biyolojik rollerini belirler. Kimyac1lar saf
<;:ozelti nedir ve suyu nic;in "ya?am ortami" olarak bir molekiil ornegini farkh bir molekiil orneginden ayirt
etmek ic;:in, bile:;;im, yap1 (iic;:-boyutlu bic;:im), reaktivite ve
adland1nyoruz? Bakm1z ss. 32-33
c;:oziiniirliik gibi ozellikleri kullamrlar. Belirli atom grup-
• Hidrojen iyonlan ile asit ve bazlar arasmda nas1I bir larmm varhg1, bir molekiile belirgin kimyasal ozellikler
ili~ki vard1r? pH ol<;:eginin neyi olc;tUgunu ac;1klaym1z. kazand1nr.
Bakm1z ss. 33-34 ve ~ekil 2.16
Bu boliimde iizerinde durdugumuz kiic;:iik molekiillerle canh
Bir tampon nasil c;ali?ir ve can Ii sistemler ic;in tam-
hiicreler diinyas1 arasmda makromolekiiller yer ahr. Bu bii-
pon lama neden onemlidir? Bakm1z ss. 34-35 ve yiik molekiilleri -proteinler, lipidler, karbohidratlar ve niikle-
~ekil 2.17 ik asitler- bundan sonraki iki boliimde ele alacag1z .
36 BOLUM 2 i KUC::UK MOLEKULLER VE CAN U Ki MYAS I

BOLUM OZETI
2.1 Atomik Yap1 Maddenin Ozelliklerini Nas1I A1t1klar? Polar oymayan molekUller, hem su ile, hem de polar molekUllerle
Madde atomlardan yap1lm1?t1r. Her atom proton ve notronlar1 i;:ok az etkile?irler. Polar olmayan molekUller, van der Waals gii~ ­
leri denilen i;:ok zay1f baglar aracll1g1 ile birbirlerine i;:ekilirler.
ii;:eren pozitif yUklU bir ~ekirdek ile bunun i;:evresindeki negatif
yUklU elektronlardan olu?ur. lnceleyiniz $ekil 2.1 2.3 Kimyasal Tepkimeler S1rasmda Atomlar Partnerlerini
<;:ekirdekteki protonlann say1s1 bir elementi tan1mlar. Evrende Nas1I Degi§tirir?
biri;:ok element bulunmakla birlikte, bunlann sadece birkai;:1 yani Kimyasal tepkimeler s1rasinda atomlar ya bir araya gelir ya da
C, H, 0, P, N ve S canl1 organizmalann bUyUk k1smin1 olu?turur. . bag yapt1klan partnerlerini degi?tirirler. Reaktantlar iiriinlere
lnceleyiniz $ekil 2.2 donLi?tLirUIUr.
Bir elementin izotoplan notron say1lan ai;:1s1ndan birbirinden Baz1 kimyasal tepkimeler UrUnlerden biri olarak enerji salar; baz1
farkl1d1r. Radyoizotoplar radyoaktiftir ve y1klld1ki;:a radyasyon tepkimeler ise sadece reaktantlara enerji sagland1ginda geri;:ek-
yayarlar. le?ebilir.
Bir kimyasal tepkimede ne madde ne de enerji yeniden yarat1-
Elektronlar kabuklara dag1lm1?t1r. Kabuklar ozgUI say1da yorUn-
labilir ya da yok edilebilir; her ikisi de form degi?tirir. inceleyiniz
geler taraf1ndan belirlenen uzay pari;:aland1r. Her yoriinge en
$ekil 2.13
fazla iki elektron ii;:erir. lnceleyiniz $ekil 2.4 ve 2.5, WEB AKTiVl -
bzellikle biyolojideki baz1 kimyasal tepkimeler geri donU?LimlU-
TESI 2.1
dUr. Yani UrUnler reaktantlara i;:evrilebilir.
Bir atom daha kararl1 hale gelmek ii;:in elektron kaybeder, elekt-
Canl1 hUcrelerdeki tepkimeler i;:oklu basamaklarda geri;:ekle?ir.
ron kazanir ya da elektronlann1 payla?1r ve bu yolla diger atom- Boylece ai;:1ga i;:1kan enerji hUcresel aktiviteler ii;:in kullan1?l1 form-
larla birle?erek bir molekiil olu?turur. da elde edilir.

2.2 Atomlar Molekulleri Olu§turmak i9in Nas1I Baglamr? 2.4 Suyu Canhlar i9in Onemli Yapan Nedir?
BAKINIZ ANiMASYONLA OGRENME 2.1 Suyun molekUler yap1s1 ve hidrojen bag1 kurabilme yetenegi ona
Kimyasal bag bir molekUI ii;:indeki atomlan birbirine baglayan canhlar ai;:1s1ndan onemli ozellikler kazand1m. inceleyiniz $ekil
i;:ekim gUcUdUr. lnceleyinizTablo 2.1 2.14
Bile~ik, birbirine bagl1 iki ya da daha fazla elementi sabit bir oran- Suyun yUksek ozgiil 1s1s1 durum degi?tiren suyun i;:ok miktarda
da ii;:erir. brnegin su (Hp) ve glukoz (C 6 H12 0 6) birer bile?iktir. 1s1 kazanmas1 ya da kaybetmesi an lamina gelir. Suyun yUksek bu-
Kovalent baglar, iki atomun bir ya daha fazla elektron i;:iftini harla~ma 1s1s1 sayesinde buharla?an su etkili bir sogutma saglar.
payla?mas1yla kurulan gUi;:IU baglard1r. inceleyiniz $ekil 2.6 Su molekUllerinin kohezyonu, birbirlerinden aynlmaya kar?I di-
E?it olmayan elektronegativiteye sahip iki atom birbirine baglan- renme yeteneginde olduklan an lamina gelir. Bu ozelliklerin orta-
d1g1nda, polar kovalent bag olu?ur. Bagin iki ucu yani kutuplan ya i;:1k1?1nda su molekUlleri arasindaki hidrojen baglan asal bir rol
k1sm1 (8+ ya da 8-) yUkler ta?1r. inceleyiniz $ekil 2.8 oynar.
iyonlar, bir atomun daha kararh bir elektron konfigUrasyonuna Kati bir bile?ik (~oziinen) bir s1v1 (~oziicii) ii;:inde i;:ozUndUgUnde
sahip olmak ii;:in, bir ya da daha fazla elektron kazanmas1 ya da i;:ozelti olu?ur. Su canl1l1k ii;:in hayat1 oneme sahip bir i;:ozUcUdUr.
kaybetmesi ile olu?urlar. Anyonlar negatif, katyonlar ise pozitif Asitler sulu i;:ozeltilerde hidrojen iyonlan veren i;:ozUnenlerdir.
elektrik yUklU iyonlard1r. Zit yUkler birbirini i;:ekerken, ayni yUkler Bazlar ise hidrojen iyonlan al1r.
birbirini iter. Bir i;:ozeltinin pH's1 onun hidrojen iyonu konsantrasyonunun
iyonik baglar, zit yUklU iyonlar aras1ndaki elektriksel i;:ekim gU- negatif logaritmas1d1r. pH's1 7'den az olan i;:ozeltiler asidik, 7'den
cUdUr. Kati maddeler (ornegin tuzlar) ii;:indeki iyonik baglar gUi;:IU bUyUk olan i;:ozeltiler ise baziktir. lnceleyiniz $ekil 2.16
oldugu halde, i;:ozelti ii;:inde birbirinden aynlm1? iyonlar aras1nda- Asit ya da baz eklendiginde i;:ozelti pH' smdaki degi§iklikleri
ki iyonik gUi;:ler zay1ft1r. inceleyiniz $ekil 2.9 smirlayan tamponlar, zay1f bir asit ile bazdan olu§an kan-
Hidrojen bag1, bir molekUI ii;:indeki 8+ hidrojen atomu ile bir §lmlardir.
ba?ka molekUI ii;:indeki (ya da bUyUk bir molekUIUn bir ba?ka k1s-
m1ndaki) 0- atom aras1nda olu?an zay1f elektriksel i;:ekimdir. Hid-
rojen baglan su ii;:inde olduki;:a fazlad1r.

DENEME TESTI
1. Bir elementin atom say1s1, d. notron say1s1 ile proton say1smm toplamma e§ittir.
a. atomdaki notronlarm say1sma e§ittir. e. elektronlarmm ve notronlarmm bag1! i;:okluguna baghdir.
b. atomdaki protonlarm say1sma e§ittir.
c. notron say1smm proton say1smdan i;:1kanlmas1yl a elde 3. Bir elementin izotoplan ile ilgili olarak a§ag1daki ifadelerden
edilen say1ya e§ittir. hangisi dogru degildir?
d. notron say1s1 ile proton say1smm toplamma e§i ttir. a. Hepsinin atomik say1s1 aymdir.
e. izotopun tipine baghdir. b. Hepsi aym say1da proton ii;:erir.
c. Hepsi aym say1da notron ii;:erir.
2. Bir elementin atom agirhg1 (atomik kutlesi), d. Hepsi aym say1da elektron ii;:erir.
a. atomdaki notronlarm say1sma e§ittir. e. Hepsinin kimyasal ozellikleri aymdir.
b. atomdaki protonlarm say1sma e§ittir.
c. atomdaki elektronlann say1sma e§ittir.
BOLUM OZETi 37

4. Kovalent baglarla ilgili olarak a;;ag1daki ifadelerden hangisi 7. insan midesindeki HCl ~ H+ + c1- tepkimesi a;;ag1dakiler-
dogru degildir? den hangisine ornek olu;;turur?
a. Kovalent bag hidrojen bagmdan daha gii<;liidiir. a. Hidrofobik bag kmlmas1
b. Kovalent bag ayrn elementin atomlan arasmda kurulabilir. b. Hidrojen bag1 kurulmas1
c. iki atom arasmda sadece tek bir kovalent bag kurulabilir. c. Mide pH'smm artmas1
d. Kovalent bag iki atom arasmda elektron payla;;1mmm · d. Bir asit disosiyasyonu ile iyonlar olu;;mas1
sonucudur. e. Polar kovalent bag kurulmas1
e. Kovalent bag farkh elementlerin atomlan arasmda kurula-
8. iki su molekiilii arasmda hidrojen bag1 kurulur; <;iinkii su,
bilir.
a. polardu.
5. Hidrofobik etkile;;imler b. polar degildir.
a. hidrojen baglarmdan daha gii<;liidiir. c. s1v1du.
b. kovalent baglardan daha gii<;liidiir. d. molekiilleri kii<;iiktiir.
c. iki iyonu bir arada tutabilir. e. hidrofobiktir.
d. polar olmayan iki molekiilii bir arada tutabilir.
9. Sofra tuzu (NaCl) suya eklendiginde,
e. suyun yiizey geriliminden sorumludur.
a. bir kovalent bag kmhr.
6. Su ile ilgili olarak a;;ag1daki ifadelerden hangisi dogru degil- b. asidik bir <;6zelti olu;;turulur.
dir? c. Na+ ve c1- iyonlan birbirinden aynhr.
a. S1v1 halden buhar haline ge<;erken <;ok miktarda lSl verir. d. Na+ iyonlan suyun hidrojen atomlan tarafmdan <;ekilir.
b. Kah hali s1v1 halinden daha az yogundur. e. su molekiilleri Na+ iyonlan tarafmdan <;evrelendigi halde,
c. Polar molekiiller i<;in en etkili <;6ziiciidiir. c1- iyonlan tarafmdan <;evrelenmez.
d. Canh organizmalarda en <;ok bulunan bile;;iktir.
10. insarnn bir deri hiicresinde en bol bulunan ii<; element
e. Baz1 onemli kimyasal tepkimelerde gorev ahr.
a. kalsiyum, karbon ve oksijendir.
b. karbon, hidrojen ve oksijendir.
c. karbon, hidrojen ve sodyumdur.
d. karbon, azot ve potasyumdur.
e. azot, hidrojen ve argondur.

Ii. TARTI MA
1. Periyodik tablodaki ($ekil 2.2) bilgiyi kullanarak silisyum di- 3. Glukozun (C 6H 120 6) karbon dioksit ve su olu;;turacak ;;ekilde
oksit i<;in bir Bohr modeli (bakm1z $ekil 2.5 ve 2.7) <;iziniz ve yanmasm1 tarnmlayan e;;itligi yazm1z.
kovalent baglarda payla;;1lan elektronlan gosteriniz. 4. insanm mide pH's1yakla;;1k2.0 iken, ince bagusak pH's1 yak-
2. iki hidrojen atomu arasmdaki kovalent bag ile bir hidrojen ve la§1k olarak 10.0'dur. Bu iki organm i<;indeki hidrojen iyonu
bir oksijen atomu arasmdaki hidrojen bagm1 kar;;1la;;t11:m1z. konsantrasyonlan [H+] nedir?
Bu kar;;1la;;hrmay1 yaparken, baglara kahlan elektronlan, po-
laritenin roliinii ve bagm gii<;iinii dikkate alm1z.

EK ARA TIRMA
1. Diinya kabugundaki element bile;;iminin insan viicudu ile ayrn oldugunu dii;;iiniir miisiiniiz? Bunu nas1l saptarsm1z?

You might also like