Professional Documents
Culture Documents
Sejtbiokémia
Sejtbiokémia
1.
A kromatin szerkezetét befolyásoló tényezők két fő osztályba sorolhatóak. Vagy a
hiszonton történik módosítás vagy konkrétan a DNS-en.
1. Hiszton módosítások:
3. DNS metiláció:
A transzkripció elindításának feltétele, hogy az iniciációs START hely nukleoszóma
mentes legyen. A gátlás egyik módja, hogy a start hely nukleoszómákat tartalmaz szoros
pakolásban. Ezeket valamilyen mechanizmus távolítja vagy csúsztatja el. Ez a
nukleoszóma elimináció lényege.
2.
csoport a DNS nagy árkában helyezkedik el, ezzel gátolja bizonyos transzkripciós
faktorok kapcsolódását a DNS-hez.
A DNS metilációs profil fontos a különböző sejtekben, ugyanis egy egyén minden
sejtjében ugyan az a DNS található meg, legyen szó idegsejtről, májsejtről stb. Azonban a
különböző típusú sejtek különböző feladatkat látnak el, különböző anyagokat termelnek
és más az aktivitásuk. Ezeket a különbségeket ezen transzkripciós különbségek teszik
lehetővé, egyes sejtekben egy adott DNS szakasz aktívan átíródik más sejtekben éppen
represszált. Ennek a szabályozásnak fontos eleme a DNS metilációs profil, amely pl.
daganat sejtekben is eltérő lehet.
A metiláció, repressziós tulajdonsága révén, két úton befolyásolhatja egy sejt
daganatsejtté történő alakulását. Az egyik, hogy a tumorszupresszor génekben
hipermetiláció lép fel, így az adott tumorszupresszor nem képes átíródni és a feladatát
betölteni. A másik lehetőség a DNS imsétlődések hipometiláltsága, amely túl sok fehérje
terméket eredményez. Ha ez olyan fehérjék esetében történik amelyek a sejtosztódásért
felenek, akkor túlosztódó sejtek jöhetnek létre.
3.
2. A génexpresszió szabályozásának szintjei: A transzkripció
szabályozása (promóterek és enchancerek), transzkripciós faktorok
1. Cisz-regulátor elemek:
- Fogalmuk: Olyan nem kódoló DNS-szakaszok, melyek részt vesznek a
transzkripció szabályozásában.
- Promóter:
• szükséges, de nem elégséges feltétele a génátíródásnak
• egy génnek legalább egy, de számos esetben több (alternatív) promótere is
lehet, amik hozzájárulnak a szövetspecifikus génkifejeződéshez
• a Start-helytől 5’ irányban van
• a tőle 3’ irányban közvetlenül mellette lévő génre hat
• 200-1000 bázispár hosszú
• transzkripciós faktorok (represszor/aktivátor) kötődhetnek hozzá
- Enchancer/silencer:
• a promóterrel együttműködve szabályoz: a DNS-hurok (loop) teszi lehetővé a
távoli promóterekkel való kölcsönhatásokat
• a Start-helytől 5’ és 3’ irányban is elhelyezkedhetnek
• nagy távolságon keresztül is hat (>10000 bp)
• transzkripciós faktorok (represszor/aktivátor) kötődhetnek hozzá
2. Transz-regulátor elemek:
- Fogalmuk: Olyan fehérjék, amelyek közvetlenül és specifikusan kötődnek a DNS-
hez, ez a kötés a promoterhez vagy enchancerhez/silencerhez történik, ugyanakkor
nem a hatás helyén, hanem attól távol lévő géneken szintetizálódnak és oda
diffúzióval jutnak el.
- Transzkripciós faktorok:
• kb. 8-20 bp hosszú DNS-szakaszhoz kötődnek szekvencia specifikusan
• a GTFII/RNS-polimeráz II komplex működését szabályozzák
(GTFII=general transcription factor)
• transzkripciós kofaktorok (korepresszorok/koaktivárok) kötődhetnek hozzájuk
• a transzkripció iniciációját serkentik vagy gátolják
4.
• heterokromatin→eukromatin átalakulást okozhatnak
• sokféleképp aktiválódhatnak (lásd a következő oldal táblázatán)
3. Transzkripciós kofaktorok:
- Fogalmuk: Olyan fehérjék, melyek közvetlenül kapcsolódnak az RNS-polimerázhoz
vagy az ahhoz kapcsolt transzkripciós faktorokhoz, de nem kötődik közvetlenül a
DNS-hez.
1. Iniciáció I.: TFIID protein komplex a TBP proteinen keresztül kötődik a TATA-
boxhoz
2. Iniciáció II.: TFIIA, TFIIB is kapcsolódnak a TFIID komplexhez
3. Iniciáció III.: TFIIE,F,H és J is kapcsolódnak és az RNS-polimeráz II. köt a
promoterhez
4. Iniciáció IV.: egyéb transzkripciós faktorok kötődnek a DNS-hez és stabilizálják
az RNS-polimeráz II. kapcsolódását
5. Iniciáció V.: mediátor komplex is kötődik, kialakul a stabil preiniciációs komplex
6. Iniciáció VI.: az RNS-polimeráz II. foszforilálódik, elhagyja a promotert és
megkezdődik az RNS-szintézis (elongáció)
7. Pre-elongáció: 25 nukleotid után az RNS-polimeráz II. elakad
8. Elongáció: új transzkripciós faktor kötődik be, folytatódik a szintézis
9. Termináció: poliA-farok (kb. 250 adenozin az mRNS 3’ végén)
5.
3. Az RNS világ. mRNS stabilitás, nem-kódoló RNS-ek, mikro RNS-ek.
a) siRNS-ek:
Az siRNS-k rövid, duplaszálú RNS molekulák, amelyek működésük során a guide
szál beépül az RNS-indukált slicing komplex-be (RISC). Ezzel párhuzamosan a másik
szál degradálódik. Ezt követően a RISC-siRNS komplex hozzákötődik a target mRNS
komplementer szálához és hasítja azt, így gátolja a génexpressziót.
Ezt a kutatásban fel tudják használni, mégpedig úgy, hogy adott mRNS-re szintetikus
siRNS-t terveznek és ezzel géneket üthetnek le kísérleti modellekben.
b) miRNS:
7.
Az miRNS dependens géncsendesítés előnye, hogy részleges
szekvenciaazonosság elegendő a taget RNS kötéséhez, a szabályozás útvonal specifikus,
egy adott útvonal számos RNS-hez tud kötődni. Ez lehetővé teszi a fehérje termelés vagy
az mRNS stabilitás finom szabályozása.
8.
4. A glükokortikoid (GR) és a retinsav receptorok (RARs) szerepe és
aktiválásuk biokémiai értelmezése.
Adoptált árva
Endokrin receptorok Árva receptorok
receptorok
alacsony affinitású
LIGAND nagy affinitású hormon ismeretlen
metabolit
ER (ösztrogén)
PR (progeszteron) RAR (retinsav) TLX
PÉLDÁK RXR (9-cisz-retinsav)
AR (tesztoszteron) TR (T3, T4) HNF-4
(ligandjaikkal) PPAR
GR (kortizol) VDR (D3-vitamin) COUP-TF
MR (aldoszteron)
HOMODIMER HETERODIMER
9.
A glükokortikoid receptor (GR) tehát egy endokrin, homodimer természetű
szteroid magreceptor. Az inaktív magreceptor a citoplazmában van, hősokkfehérjékkel
(hsp90) komplexben. A ligand bekötődésére konformációváltozást eredményez, a GR
leválik a hsp90-ről, GR-dimer képződik, mely a sejtmagba transzlokálódik.
A sejtmagban a GR-dimer kötődik válaszadó eleméhez, és célgének aktiválását idézi elő.
A GR nem csak hormonokat köt, hanem gyógyszerként előállított, szintetikus agonistákat
is, amelyek gyors hatású gyulladásellenes szerek. A glükokortikoidok gyulladásgátló
hatásának lehetséges mechanizmusai:
1. prosztaglandinok termelődésének gátlása
2. lipocortin/annexin I indukciója, ami gátolja a foszfolipáz A2-t
3. COX-2 expressziójának gátlása
4. NF-κB szignálútvonal gátlása
11.
A jeleket csoportosítani lehet amelyet az ábra szemléltet:
12.
A jelátvitel végcélja, a biológiai válaszban résztvevő fehérjék(enzimek,
transzporterek, transzkripciós faktorok) működésének szabályozására vezethető vissza.
Ez két úton történhet:
13.
A receptorok háromféle DNS károsodási jelet érzékelnek:
14.
6. A G fehérjék és egyéb GTP-ázok szerepe a jelátviteli folyamatokban.
1. Heterotrimer:
α, β, γ alegységekből álló fehérjék, amelyeket lipidmolekulák kötnek a
plazmamembránhoz az intracelluláris oldalon. 7-transzmembrán-receptorokkal
állnak kapcsolatban.
Inaktív, GDP-kötött formában a három alegység együtt van. Aktiválódásuk
mechanizmusa:
1. A 7-TM-receptorhoz bekötődik annak ligandja, a receptor szerkezete meg-
változik.
2. Ekkor a G-fehérje GDP-jét GTP-re cseréli. (tehát itt maga a receptor a GEF)
3. A GTP-t kötő α-alegység disszociál a βγ-alegységről és további fehérjéket
aktivál. (pl. adenilát cikláz, PLC, stb…)
A βγ-alegység is aktiválhat további fehérjéket, de az α-alegység szerepe az
elsődleges a jelátvitelben.
4. Ezek másodlagos messengerek (pl. cAMP, DAG, IP3, stb…) keletkezését
stimulálják vagy gátolják.
5. Az α-alegység GTP-áz aktivitása révén a foszfátcsoport hidrolizál, a létre-
jövő α-GDP asszociál a βγ-alegységgel, visszaáll a kiindulási inaktív állapot.
- Adenilát cikláz:
• a katalizált reakció: ATP → cAMP
• szerepet játszik a szénhidrát és lipid anyagcsere meghatározó
folyamataiban, az immunsejtek osztódásának gátlásában, szaglásban, a
simaizom-kontrakció gátlásában, stb… (részletesen lásd: Sejtbiokémia/7.
tétel)
- Foszfolipáz A2:
• arachidonsavat szabadít fel, melyből prosztaglandinok, prosztaciklinek,
tromboxánok, leukotriének képződnek (gyulladásos folyamatok)
• az útvonal gátlója a glükokortikoid hormon (lipocortin felszabadulást indukál,
mely hatására a PLA2 gátolt)
15.
- Foszfolipáz C:
• a katalizált reakció: foszfatidilinozitol-biszfoszfát → DAG + IP3
• aktiválódhat G-fehérjén (PLC α,β,δ) és foszforiláción (PLCγ) keresztül is
• az IP3 Ca2+-csatornát nyit az ER-en és a citoszólikus Ca2+-szint
emelkedéséhez vezet
- a Ca2+ jó másodlagos hírvivő, mert koncentrációja eredendően alacsony a
sejtben, erősen és szelektíven kötődik; részt vesz pl. a szöveti transz-
glutaminázok (véralvadás) és a PKC aktiválásában, kalmodulinnal alkotott
komplexével pedig az izomösszehúzódásban
• a DAG közvetlenül aktiválja a PKC-t
• részt vesz a véralvadásban, inzulin-, adrenalin- és aldoszteron szekrécióban,
simaizom kontrakcióban, differenciálódásban
2. Monomer:
Kis molekulatömegű, egyetlen polipeptidláncból álló fehérjék. Ide sorolandó
a Ras szuperfehérjecsalád, melyen belül Ras, Rho, Rab, Ran és Arf alcsaládokat
ismerünk. Csak alacsony GTPáz aktivitással rendelkeznek, így hosszú idő áll ren-
delkezésre ahhoz, hogy targetjeikkel kapcsolatba lépjenek.
Részt vesznek például a mitogén kaszkádban (Ras), és mint motorfehérjék-
hez kötődő molekuláris kapcsolók szerepet játszanak egyes vezikulák kompart-
mentek közti vezikuláris transzportjában (Rab).
I. cAMP útvonal
A cAMP, szolubilis másodlagos messenger, amely ATP-ből keletkezik az adenilát-
cikláz hatására, elbontása AMP-vé pedig a ciklikusnukleotid-foszfodiészteráz hatására
történik. Az intracelluláris cAMP-szint változása nagyon sok hormonnak és
neurotranszmitternek a sejtek metabolizmusára, ioncsatornák funkciójára vagy a
génexpresszióra kifejtett hatását közvetíti.
17.
protein-kinázok családjába tartozik, azaz fehérjéket foszforilál meghatározott szerin/
treonin oldalláncokon.
2. Érfali simaizmokon:
Az érfali simaizmok szintén expresszálnak ANF receptort, a PKG több fehérjét is
foszforilál ami csökkenti a Ca2+ szintet. A cGMP gátolja mind az IP3 receptoron történő
Ca2+ felszabadulást az ER-ből, illetve a plazmamembránon keresztül beáramló Ca+
mennyiségét is csökkenti az L-típusú csatornák gátlásával. Ellenben a
plazmamembránban található Ca2+-ATPáz foszforilációjával az aktivitást növeli, ezzel a a
Ca2+ kiáramlást serkenti a sejtekből. Ezeknek eredményeként a simaizmok elernyednek,
vasodilatatio és vérnyomás esés következik be.
3. Zona glomerulosan:
Az aldoszteron szekréciót az ACTH hormon, Gs fehérjén történő cAMP szint
növelése váltja ki.
4. Bélben:
A bélben a guanilin és uroguanilin peptidek receptorai rendelkeznek guanilát-
cikláz-aktivitással. Sóban gazdag étkezés után az ileum, jejunum és proximális colon
epitélsejtjei szekretálják a guanilint és az uroguanilint a béllumenbe, ahol parakrin módon
a közeli epitélsejtekben a luminális oldalon lévő receptoraikat aktiválják.
19.
III. NO útvonal
NO szintézise az endothél sejtjeiben, az idegsejtekben és a makrofágokban
történhet. A nitrogén-monoxid, nitrogén-oxid-szintáz(NOS) hatására keletkezik, argininből.
A NOS konstitutív enzim, tehát állandóan expresszálódik a sejtekben, de szabályozásával
az expresszió szinjte változhat és aktivitását csak az intracelluláris Ca2+ szint
megemelkedésével nyeri el.
20.
8. A foszfolipáz C rendszer és egyéb foszfolipázok szignálútvonala.
22.
9. A tirozin kináz útvonal, stabil ciklin D keletkezés, inzulin szignál-
útvonalak
A tirozin kináz receptor által indított 3 fő szignálútvonal: PLC gamma, Ras és PI (3)
kináz útvonal együttes aktiválódása kell ahhoz, hogy az osztódás S fázisába történő
átmenetet szabályozó ciklin D megjelenjen.
1. Ras útvonal
A tirozin kináz receptor Tyr foszfátját SH2 domén tartalmú GRB2 (dokkoló fehérje)
ismeri fel. Két SH3 doménjén keresztül kötődik a SOS fehérje Pro gazdag szakaszaihoz
és azt aktiválja. A SOS (GEF)a membránhoz kötött Ras fehérjén kicseréli a GDP-t GTP-re.
A GTP-Ras(aktív) magához köti az addig citoszólban lévő Raf (Ser/Thr protein kináz)-t és
aktiválja. A Raf további protein kinázok kaszkádját indítja el (MAP kinázkaszkád), amelyek
végül is MAP= mitogén aktivált proteinek sokaságának szabályozását eredményezik.
2. PI3K útvonal
A PI3K foszforilálja a membrán inozitideket a 3-as helyzetben. Ez PH (plesctrin
homology) domén tartalmú fehérjék kapcsolódását és a receptor fehérje komplexben való
megjelenését eredményezi. Az egyik ilyen fehérje az akt (PKB) protein kináz (Ser/Thr
kináz).
23.
Az akt egyik szubsztrátja a glikogén szintetáz kináz-3 (GSK-3). GSK-3 a ciklin D-t
(és a c-myc transzkripciós faktort, egy másik osztódásban részvevő transzkripciós faktort)
foszforilálja és ez proteoszomális degradációjukhoz vezet. A GSK-3 akt általi
foszforilációja inaktiválja az enzimet. Ha a GSK-3 inaktiválódik, a MAP kináz és PKC úton
keletkezett ciklin D nem bomlik le, elindul a sejtciklus.
Inzulin-receptor szubsztrát IRS SH2 doménjével kötődik a receptorhoz, ami azt tirozinjain
foszforilálja. További SH2 doménű fehérjék kötődését segíti elő. Az egyik ilyen fehérje a
Foszfatidilinozitol-3-kináz (PI(3)K), amely foszforilálja a sejtmembrán lipidjét. Ehhez a
módosított lipidhez kötődik ki két PH doménű protein kináz, az Akt és az atípikus protein
kináz C (aPKC), amelyek így aktiválódnak és további fehérjéket foszforilálnak. Ezek közül
a Riboszomális S6 kináz (p70rsk) a fehérjeszintézist fokozza.
Emellett a protein foszfatáz 1 PP1 (aktív lesz) és a glikogén szintetáz kináz-3 GSK-3
(inaktív lesz) az anyagcsere enzimeinek foszforiláltsági állapotát befolyásolva.
A PP1 leszedi a PKA által létrehozott foszfátokat (ezzel kikapcsolja az adenilát
cikláz úttal aktivált fehérjéket).
24.
Ezen kívül az inzulin szabályozza a SREBP (lásd koleszterol anyagcsere) magi
szintjét is, fokozva ezzel a koleszterol, zsírsav, triacil-glicerol szintézis és a pentózfoszfát
út enzimeinek szintézisét. Ezen utak szinte mindegyik enzimének promótere tartalmazza
az SRE-t.
3. PLCγ
Csak a gamma izoforma aktiválódhat ezen az úton. A PLC gamma SH2 doménjé-
vel kapcsolódik, majd a receptor tirozinin foszforilálja. Aktiválódása után hasítja a
foszfatidilinozitol diszfoszfátot(PI-4,5-diszfoszfát) és IP3-t valamint diacilglicerolt alakít ki.
25.
10. Interleukinok, TGFβ és sejthalál receptorok által mediált jelátviteli
útvonalak
I. Interleukinok (→ JAK/STAT):
Az interleukinok a citokinek családjába tartoznak, mely a sejt-sejt kommuniká-
cióban szereplő, szekretált kis fehérjék, peptidek. A különböző citokinek jelpályájának
váza megegyezik:
1. A citokinek specifikus transzmembrán receptorokhoz kötődnek. A citokin-
receptoroknak nincs tirozin kináz aktivitása, intracelluláris részük szoros fizikai
kapcsolatban van az alapállapotban inaktív JAK tirozin-kinázokkal.
2. A ligand megkötése a receptorok dimerizációját eredményezi és
konformációjukat is megváltozatja, ez a konformáció-változás áttevődik a JAK
tirozin-kinázokra, amelyek ebben az új konformációban autofoszforilációval
aktiválódnak.
3. A JAK tirozin-kinázok szubsztrátjai a transzkripciós faktorokként működő,
különböző STAT fehérjék. A STAT fehérjék a JAK által katalizált tirozin-
foszforiláció nyomán az SH2 doménjeik segítségével dimerizálódnak.
4. A STAT-dimerek a sejtmagba jutva a DNS-en célgénjeik promótereihez kö-
tődnek és elősegítik a transzkripció elindulását.
26.
4. A foszforilált Smad-Smad4 dimer bekerül a sejtmagba és transzkripciós faktor
feladatot lát el. (a Smad4 toborozza a promóterhez a koaktivátorokat, míg a
foszforilált Smad komponens felelős a megfelelő gén kiválasztásáért)
ligand
f APOPTÓZIS
íDNS-hasítás
-t
CAD
sejtsejtmag
ÚDNS-károsodás
27.
19-6. ábra. Az ap opt ózis jelát vit eli út vonalai és ef f ekt or m echanizm usai. TNF, tum or nekrózis fakt or; Fás, first apoptosis signal;
FADD, Fás associated death domain; DISC, death induced signalling com plex; Apaf-1, ap optotic protease activating factor 1; CAD,
caspase activated DNase; ICÁD, Inhibitor of caspase activated DNase; XIAP, X-linked inhibitor of apoptosis protein; AIF, apoptosis-
inducing factor; endoG, endonuclease G; Bid, BH3-interacting domain death agonist; Bad, Bcl-2-associated agonist of cell death; Bax,
Bcl-2-associated x protein; Bak, Bcl-2 antagonist killer 1; ER, endoplazmás retikulum ; Bcl-2, B cell CLL/ lym phoma- 2; Diablo/ SM AC, direct
lAP-binding protein with low pl / second mitochondria- derived activator of caspases). A zöld nyilak az apoptózist kiváltó, a piros nyilak
az apoptózist gátló útvonalakat/ hatásokat mutatják. Az ábra m egértéséhez lásd a szöveges leírást
nyeként alakulhatnak ki. A Fás, TNF és az e családba prokaszpáz-8-at) kötnek, és együttesen a DISC (death
11. A sejtciklus biológiai értelmezése. A G2-M fázis kináz működése.
A sejtekre általánosan jellemző, legyen szó eukarióta vagy prokarióta sejtről, hogy
előbb utóbb osztódniuk kell. Osztódáskor két működőképes sejtet kell létrehozniuk, azaz
a lényeges sejtalkotókat egyenlően kell a két utódsejt között szétosztani. Az osztódás
előfeltétele a növekedés. A sejt növekedéséhez a citoplazma és a membránok koordinált
növekedésére van szükség. Könnyű belátni, hogy az állandó sejtméret azt kívánja, hogy
osztódás előtt a sejt mérete megduplázódjon, továbbá a genetikai információ
megduplázódásának is meg kell történnie, hiszen az is csak egy példányban van jelen a
sejtekben (DNS duplikáció).
28.
Az eukarióta sejtek osztódását nem lehet a dominóelv alapján biztosítani. Ez több
okból fakad. Egyrészt az eukarióta sejteknek több tucat kromoszómája lehet. Ezen túl a
kromoszómák osztódását a belső membránok, a Golgi-komplex, a mitokondriumok
osztódásával is koordinálni kell. E koordinációértt egy fehérjékből álló független
szabályozási rendszer, az eukarióta sejtciklus gépezet a felelős.
A sejtciklus gépezetére általánosan jellemző, hogy a ciklus lépései között van egy
ellenőrző pont, ami megvizsgálja, hogy az addigi folyamatok hiánytalanul végbementek e,
és minden készen áll e a következő fázishoz.
A gépezet más eukarióta fiziológiai folyamatok szabályozásához hasonlóan elsősorban
fehérje foszforiláción és ubikvitináción alapszik. A két legfontosabb komponense a:
1. Prereplikációs fázis
Alacsony Cdk és nagy APC aktivitás jellemzi. Ez a sejtciklus G1 fázisának tekinthető.
2. Replikációs fázis
Növekvő Cdk és alacsony APC aktivitás a jellemző. Ez az állapot három fázisra osztható,
ezek a S, G2 és M.
A két állapot között két irreverzibilis átmenet figyelhető meg. Az egyik a DNS-
replikáció inciálásakor, amikor az APC kikapcsol és a Cdk-ciklin komplex elkezdi a
replikációt. A másik átmenete a kromoszóma szegregációnál következik be, amikor az
APC aktiválódik a kromoszómák szétválnak és a ciklinlebomlás miatt pedgi a rendszer
visszakerül a prereplikációs fázisba.
29.
Az M fázis kináz működése (CDK1)
Az S-fázis meghatározó biokémiai történései után(többek között a DNS-állomány
megkettőződése, hisztonok szintézise) a sejt a G2-állapotba kerül, melynek során
felkészül a mitózisra és ellenőrzi, hogy az S fázis eseményei rendben lezajlottak e. Addig
nem megy tovább a sejtciklus, amíg minden folyamatról nem kap „pozitív visszajelzést” a
sejt.
30.
12. Foszforilációs és proteolitikus szabályozás a sejtciklus
működésében.
Konstitutív
CKI-k
6-12 óra
1. CDK-aktiválás ciklinkötődéssel:
A szabályozás transzkripciós szinten, a megfelelő ciklinek adott időpontban
indukált szintézisével történik.
2. CDK-gátlás foszforilációval:
A CDK-ciklin komplex aktivitását gátolja két, az N-terminális vég közelében
elhelyezkedő oldallánc foszforilációja. (Thr 160/161)
A defoszforilációt (= újraaktivációt) a cdc25 foszfatáz katalizálja.
31.
• a CDK-inhibitorok (CKI) eltávolításával (bekapcsolás)
• az aktivátor ciklinek lebontásával (kikapcsolás)
A proteolízist ubikvitin ligázok által katalizált ubikvitiánció indítja el. Fontos
ubikvitin-ligáz az APC, (anafázist elősegítő protein komplex) melynek proteáz
komponense a szeparáz. Működése:
• a ciklin-B lebontásával segít a sejtnek belépni az anafázisba
• elősegíti a a kohezin lebontásával a kromoszómaszegregációt és az
anafázisból való továbblépést, melynek lépései:
→ a szekurin (szeparin inhibitora) defoszforilálódik
→ az APC így lebontja
→ a szekurin nélküli szeparáz működésképes
→ kohezin lebomlik
• nélküle a sejt nem képes elhagyni az M-fázist
6. Szabályozás kompartmentalizációval:
A ciklin és a CDK egyazon sejtkompartmentben kell, hogy elhelyezkedjen.
32.
13. A p53 fehérje jelentősége és funkciója.
33.
14. A Ras mitogén szignálútvonal.
A Ras egy kis molekulatömegű, egyetlen polipeptidláncból álló, monomer G-
fehérje, mely a mitogén kaszkád eleme.
34.
A mitogén kaszkád lépései:
1. A növekedési faktor kötődik a receptorhoz.
2. A tirozin kináz receptor autofoszforilálja specifikus tirozinját.
3. A foszforilált tirozin lehetővé teszi a GRB2 SH2 doménen keresztüli
kötődését a receptorhoz.
4. A GRB2-höz SOS kötődik és aktiválódik.
5. A SOS kicseréli a Ras GDP-jét GTP-re. (tehát az SOS a GEF=guanin exchange factor)
6. A GTP-Ras aktiválja a Raf-ot, egy másik monomer G-fehérjét.
7. A Raf köti és foszforilálással aktiválja a MEK-et. (= MAPKK)
8. A MEK foszforilálja az ERK-et. (=MAPK)
9. Az ERK bemegy a sejtmagba és foszforilálja a jun-t és a fos-t.
10. A foszforilált jun-fos dimer elindítja számos gén, köztük a D1 ciklin
indukcióját. (fokozott transzkripció)
11. A D1 ciklin megnövekedett szintje lehetővé teszi a CDK4 aktivitást.
12. A CDK4 foszforilálja a retinoblasztóma fehérjét. (pRb)
13. A foszforilált retinoblasztóma elengedi az E2F-et.
14. Az E2F újabb ciklineket (A és E) indukál és azok a CDK-2 aktiválással
elindítják a DNS replikációt.
Fokozódik a sejtproliferáció.
35.
15. Protoonkogén termékek biokémiai funkciói.
36.
A másik lehetőség, hogy a termékek mennyisége nem változik, azonban a
protoonkogénben bekövetkező pontmutáció vagy deléció miatt, a termék hibás lesz és
az kulcshelyzetben nem a megfelő módon fog szabályozni, a szerkezeti abnormalitása
miatt.
2. Receptor elváltozás
Ebben az esetben az onkogén hibás receptort kódol, amely akkor is stimulálva van,
és működteti a jelátviteli folymatot, amikor az extracelluláris térből jel nem érkezett.
Például a tirozin-kináz receptorok(pl. insulin) ilyen hibája is sejtburjánzáshoz vezethet.
Ezen elváltozások által kialakult rák típusokra haszálnak tirozin kináz gátlókat amelyek
gátolják az abl, kit onkogéneket, a PDGFR aktivitással kialakuló tumorokat.
Monoklonális antitestekkel is lehet gátolni a receptro tirozin kinázokat(pl. HER-2 receptor
gátlás emlőrákban)
A Ras fehérjén egy típikus pontmutáció ezred részére lassíthatja a normális GTP-áz
aktivitását, ezzel hosszab ideig képes a fehérje a Raf aktiválására és a MAPK útvonal
fenntartására. A Ras farnezilálás gátlásával hatékony tumor terápia érhető el.
38.
16. Tumorgátló géntermékek biokémiai funkciói.
1. Retinoblasztóma (pRb):
Normál esetben hypofoszforilált formája köti az E2F transzkripciós faktort.
Hyperfoszforilált állapotban elengedi az E2F-t, mely újabb ciklineket (A és E) indukál és
azok a CDK-2 aktiválással elindítják a DNS replikációt.
2. p53:
A sejtmagi DNS-ben történt sérülések indukálják, sejtciklus gátlása (CDK-inhibitor)
ill. apoptózis kiváltása révén hat. (lásd: Sejtbiokémia/13. tétel)
39.
4. VHL (von Hippel-Lindau):
Normál működés esetén a HIF-1 (hypoxia-inducible factor-1) hidroxilálódik prolil-
hidroxiláz enzim hatására. Ily formában a VHL képes felismerni, ubikvitin-ligáz aktivitása
révén ubikvitinálja, ezáltal elrendeli proteaszomális degradációját. Hypoxiás körülmények
között ez a folyamat gátolt, fokozódik a vaszkularizáció, nő a vér O2-szállítási kapacitása,
fokozódik a glikolízis, illetve gátlódik a citrátkör és az oxidatív foszforiláció.
5. p16 melanoma:
Normál működés esetén a sejtciklust gátolja a CDK-4 gátlásán keresztül. Kiesése
esetén ez az inhibíció kiesik.
7. BRCA1 és BRCA2:
Funkciójuk a DNS károsodása esetén a sejtciklus leállítása és a hibajavítás
elindítása. Kiesésük esetén a hibás DNS is tovább replikálódhat, mely kontrollálatlan sejt-
proliferációhoz vezethet.
40.
17. Az apoptózis biokémiai értelmezése.
Programozott sejthalál
- Embriogenezis funkcionális, fejlődéstani forma.
- Időben és térben megjósolható, aktív fehérjeszintézist igényel
Specializált sejthalálformák
- Szövetspecifikus terminális differenciálódás
- A sejthalál programja egy adott ponton felfüggesztődik, és a részleges sejthalál
specifikus szöveti funkciót szolgál
- Aktív fehérjeszintézist igényel
- Ez a fajta sejtprogram jellemző a vvt-re, kornea hámsejtjeire
Apoptózis
- Ez eredetileg egy morfológiai definíció
- Nem fiziológiás ágensek is kiválthatják
- Nem mindig igényel aktív fehérjeszintézist
Egy különleges sejthalál forma a netózis sejthalál, amely neutrofil granulociták egy
immunfolyamata, amely során a megkötött antigén vagy antitest hatására a
granulocitában Ca2+ felszabadulás, PKC aktiválás, reaktív oxigéngyök képződés, hiszton
deiminálás, kromatin dekondenzáció és végül a DNS háló szerű kiszabadulása megy
végbe. Ez a háló azt a célt szolgálja, hogy a baktériumokat, kórokozókat megköti,
„behálózza” és ezzel fogvatartja.
A három sejthalálforma eltérő funkcionálisan, ugyanis az első kettő célja nem a sejt
eliminálás és a sejt épség védelme, hanem az adott szövet helyét jelöli ki a szervezetben,
a funkció a szervezet egészét szolgálja. Az apoptózis azonban a sérült és veszélyes sejtek
eltávolítására szolgál legfőképpen. Ezen tétel keretei között az apoptózisra térünk ki.
41.
Apoptózis
Az apoptózison keresztül menő sejtek alaki változásokat szenvednek el. A haldokló
sejt leválik a környezetéteől, összezsugorodik, feldaraolódik majd bekebelezésre kerül.
42.
1. Halál receptoron keresztül (Fas)
Ez az útvonal balfelül látható. A halál receptor útvonalat sejtfelszíni receptorok (pl.
TNF receptor, Fas) ligandjainak megkötődése aktiválja. A folyamat során adapter
proteinek (pl. FADD, Fas associated death domain) közvetítésével kaszpáz-8 kötődik a
receptorokhoz ún. homofil interakciós domének (DD, death domain; DED, death effector
domain) révén. Ez a ligand indukált komplexképződés vezet a kaszpáz-8 aktiválódásához,
mely azután proteolitikusan aktiválja a kaszpáz-3-at ill. hasíthatja a Bcl-2 fehérje család
egyik proapoptotikus tagját a Bid-et, mely a mitokondriumokba transzlokálódva, a
citokróm c kiáramlásának facilitálásával bekapcsolja a sejthalál mitokondriális útvonalát.
2. Mitokondriális útvonal
A mitokondriális útvonal (az ábra jobb oldalán) során citokróm c és más
mitokondriális polipeptidek jutnak ki a citoplazmába. A citokróm c a citoszólba jutva –
ATP ill. dATP jelenlétében – Apaf-1 (apoptosis activating factor) és a kaszpáz-9
molekulákkal képez komplexet (apoptoszóma), melynek során a kaszpáz-9 aktiválódik. Az
aktivált kaszpáz-9 ezt követően aktiválja a kaszpáz-3-at ill. a többi effektor kaszpázokat.
A szintén a mitokondriumokból kiszabaduló AIF (apoptosis inducing factor) és
endonukleáz G (Endo G) a magban fejti ki hatását, a SMAC/Diablo pedig kaszpáz
inhibitorok (IAP, inhibitor of apoptosis proteins) szekvesztrálásával segíti elő a sejthalál
lezajlását.
43.
18. Stressz fehérjék keletkezése; biológiai jelentőségük.
I. Mi is a stressz?
Minden inger egyfajta megterhelést jelent a szervezet számára, ami fajlagos
hatásán kívül nem fajlagos válaszreakciót is kivált. Ez az inger jellegétől független, azonos
lefolyású és mechanizmusú sztereotíp válasz a stressz, melynek célja a homeosztázis
fenntartása.
II. Mi a stresszválasz?
Az adott inger hatására a sejt biokémiai útvonalai átalakulnak:
1. Anaerob irányba tolódik el az anyagcsere, így a glükóz (glikolízis) válik az
elsődleges energiaforrássá.
2. A mitokondriumok aktivitása lecsökken, ATP szint is csökken.
3. A citoplazmatikus Ca2+-szint megnő.
4. A szintetikus folyamatok aktivitása lecsökken. (még a DNS-, RNS-szintézisé is)
5. Stresszfehérjék szintézise aktiválódik.
A stresszhatás és stresszfehérjék
kapcsolatát Selye János írta le, az általános
adaptációs szindróma három fázisával:
44.
Levinthal paradoxon Anfinsen-kísérlet
A stresszfehérjék jelenlétének bizonyítéka. Azt bizonyította, hogy a fehérjék aminosav
Leírja, hogy a fehérjék lehetetlen hogy úgy szekvenciájában kódolva van a másodlagos és
vennék fel végleges térszerkezetüket hogy harmadlagos szerkezetük is, amelyet
az összes lehetséges variációt széttekerés után vagy hibás rendezést követően
végigpróbálnák, mivel ez elképzelhetetlen a is újra spontán felvesznek. (a ribonukleázon
biológiai időskálán. (1081 s lenne, míg az tanulmányozta)
univerzum kora kb. 6x1017 s) Ebből
következik, hogy valami segíti őket a
foldingban.
folding segítése;
hsp70 fehérjetranszport (klatrinburkos endocytosis);
dönt a fehérje lebontásáról
fehérjeaggregáció gátlása;
helytelen szerkezetű fehérjék javítása;
hsp90 immunválasz;
jelátviteli folyamatokban enzimeket (pl. CDK) és
receptorokat (pl. Ah) stabilizál
MOLEKULÁRIS
CHAPERONOK hsp100 “szétcincálók”: az aggreszómák szétszedése
(enzimatikus aktivitásuk
nincs) kalnexin ER-ben szintetizálódó GP-k foldingját segítik;
minőségi kontroll: a helyes szerkezetű
kalretikulin fehérjéket a Golgiba, a helyteleneket lebontásra
irányítják
1. Funkcióvesztés
2. Aggregátumok képződése (amyloidózisok)
3. Lebontásra kerülés: proteolízis
4. Fehérjekészlet kimerülés
Érdekesség, hogy in vitro végzett kísérletekkel csak nagyon szigorú feltételek mellett lehet a foldin-
got tanulmányozni, mivel sokkal érzékenyebbek a körülményekre, így a fent leírt 4 pont sokkal könnyebben
bekövetkezhet. Ez is arra utal, hogy in vivo valamely mechanizmusok segédkeznek a foldingban.
45.
19. Hősokk fehérjék keletkezésének regulációja
I. Mi is a stressz?
A szervezet számára minden inger megterhelést jelent, ami fajlagos hatásán
kívül(az inger által kiváltott jelátvitel, az ingerre adott reakció kialakításához), nem fajlagos
válaszreakciót is kivált. Ez a válaszreakció az inger jellegétől független, azonos lefolyású
és mechanizmusú válasz amit stressznek nevezünk! Tehát fontos, hogy a stressz az nem
az inger(pl. hő) vagyis a „fenyegető hatás”, hanem a megterhelésre adott válasz!!!
(Azonban megjegyzendő, hogy a tételen belül beszélünk a stresszről ebben a formában.
Ugyanis szokták például a magas hőmérsékletű kezelést „hő stressznek” nevezni, de
lényegében abban az esetben is csak a kiváltó a hő).
A stressz, mint válasz, a szervezet egyensúlyának fenntartására törekszik a
különféle ingerek hatásával szemben. A stresszhatás ugyanis(a hőhatás példánál
maradva) a fehérjék szerkezetében képes kárt tenni, azok denaturációjához és
aggregációjához vezethet. Azonban a sejtnek ezt mindenképpen meg kell akadályoznia,
tudniillik a fehérjék funkciójukat a szerkezetükkel nyerik el!
47.
20. Trombocyták felépítése, szerepe a véralvadásban, adhéziójuk és
aggregációjuk mechanizmusa.
4 zónára oszthatók:
1. Perifériás zóna:
Tartalmazza az aszimmetrikus sejtmámbránt, (foszfatidil-szerin csak
belül) melyet egy vastag glycocalyx köpeny borít.
3. Organellum zóna:
• mitokondriumok, peroxisomák, glikogén
• granulumok:
- α-granulumok: koagulációs faktorok (I.,IV.,V.), mitogén fehérjék (PDGF,
IGF-1), adhezív fehérjék (von-Willebrand faktor, trombospondin,
fibronektin)
- δ-granulumok/denz testek: ADP, ATP, serotonin, histamin
- λ-granulumok/lizoszómák: savi hidrolázok—> véralvadék felszívódása
4. Membrán zóna:
Nyitott- és denz csatorna rendszer található benne, melynek fontos
szerepe van a trombocytán belüli Ca2+-koncentráció szabályozásában.
48.
A trombocyták feladata érfali sérülés esetén az ún. hemosztatikus dugó kiala-
kítása. Ennek 4 állomása van:
Szekunder/stabil hemosztatikus
dugónak akkor nevezzük, ha már a
granulumok tartalma is felszabadult.