Professional Documents
Culture Documents
Jakie Czynniki Wplywaja Na Denaturacje Struktur Bialkowych
Jakie Czynniki Wplywaja Na Denaturacje Struktur Bialkowych
Jakie Czynniki Wplywaja Na Denaturacje Struktur Bialkowych
białkowych?
Wprowadzenie
Przeczytaj
Wirtualne laboratorium – I
Sprawdź się
Dla nauczyciela
Jakie czynniki wpływają na denaturację struktur
białkowych?
Smażenie jajek to łatwy i prosty sposób na śniadanie. Podczas robienia jajecznicy jesteśmy
świadkami pewnych widocznych zmian, ale czy kiedykolwiek zastanawiało Cię, co tak
naprawdę dzieje się wówczas na patelni? Dlaczego jajko się ścina? I czy można z jajecznicy
zrobić kogel–mogel? Na te wszystkie pytania jest tylko jedna odpowiedź i brzmi ona:
denaturacja. To właśnie o tym procesie zaraz dowiesz się więcej.
Twoje cele
Proces ten polega na utracie aktywności biologicznej oraz zniszczeniu struktur białek:
drugo-, trzecio- i czwartorzędowych. Nie zostaje zmieniona jedynie struktura
pierwszorzędowa, ponieważ wiązania peptydowe są wystarczająco silne, żeby pozostać
nierozerwane. Podczas denaturacji zostają jednak zerwane wiązania stabilizujące pozostałe
struktury białka, przez co dochodzi do zmian we właściwościach fizycznych i chemicznych
protein. Ogólny schemat denaturacji przedstawiono poniżej.
Sole …
Promie- …
Tempera-…
Mocne …
Wytrząsa-…
Niektóre …
Ultradźwięki
Detergenty
Etanol Promie- …
Czynniki denaturujące
Temperatura
Wysoka temperatura (dla niektórych białek wystarczy 40°C) powoduje rozerwanie wiązań
wodorowych i oddziaływań hydrofobowych. Dzieje się tak, ponieważ podwyższając
temperaturę, dostarczamy do układu dodatkową energię, która zwiększa energię
kinetyczną układu. Powoduje to zwiększony ruch cząsteczek. W ten sposób dochodzi do
zerwania wiązań. W życiu codziennym takie zjawisko zachodzi podczas gotowania
produktów żywnościowych. Zdenaturowane białka są bardziej podatne na działanie
licznych enzymów, co ułatwia nam trawienie pożywienia i wchłanianie potrzebnych
substancji odżywczych. Również podczas sterylizacji narzędzi czy opatrunków
medycznych zwiększa się temperaturę. Tak niszczone są białka, które występują
w patogenach, a tym samym zostają unieszkodliwione potencjalne mikroorganizmy,
wywołujące choroby.
Może także dojść do tzw. zimnej denaturacji, z którą mamy do czynienia przy niskiej
temperaturze i wysokim ciśnieniu (powyżej 0,2 GPa). Takie warunki sprzyjają zmniejszeniu
oddziaływań hydrofobowych, wówczas struktura białka ulega rozwinięciu. Na poniższym
wykresie zaprezentowano rodzaje denaturacji i jej zależność od temperatury i ciśnienia.
Wykres przedstawiający wpływ temperatury i ciśnienia na strukturę białek
Źródło: GroMar Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
Promieniowanie UV
Promieniowanie UV, nazywane również promieniowaniem nadfioletowym, to
promieniowanie elektromagnetyczne o długości około 300 – 400 nm. W zależności od
długości fali, wyróżnia się promieniowanie UVA, UVB i UVC. Słońce emituje fale we
wszystkich trzech zakresach, natomiast na Ziemię dociera tylko część promieniowania
UVB i całe UVA, które jest mniej szkodliwe dla człowieka niż pozostałe rodzaje.
Promieniowanie UV w dużych dawkach powoduje rozerwanie wiązań wodorowych
w białkach, co prowadzi do zniszczenia struktur drugo-, trzecio-, i czwartorzędowych.
Dlatego długotrwałe narażanie się na promienie słoneczne nie jest wskazane ze względu na
zwiększenie ryzyka zachorowań na nowotwory skóry. Jednak minimalna dawka
promieniowania jest potrzebna dla organizmu do produkcji witaminy D3 .
Wytrząsanie
Gwałtowne mieszanie czy ubijanie białka powoduje zerwanie wiązań wodorowych. To
właśnie dzieje się w momencie ubijania piany z białek. Dochodzi wtedy do zerwania wiązań
i wprowadzenia pęcherzyków gazów do układu. Następnie cząsteczki białek tworzą nowe
wiązania, które oplatają cząsteczki gazów, tworząc tym samym strukturę piany. Schemat
reakcji zamieszczono poniżej. Proces tworzenia nowych wiązań w białku nosi nazwę
koagulacji.
Białko jaja kurzego składa się w <math aria-label="dziewięćdziesięciu procentach">90% z wody, pozostałe
<math aria-label="dziesięć procent">10% stanowią różnego rodzaju białka.
Źródło: GroMar Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
Po krótkim ubijaniu białka ulegają denaturacji, dochodzi do zerwania wiązań wodorowych, a w roztworze
pojawiają się pęcherzyki powietrza.
Źródło: GroMar Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
Po ubiciu piany zdenaturowane cząsteczki białek układają się wokół pęcherzyków powietrza i tworzą
charakterystyczną strukturę siatki.
Źródło: GroMar Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
Etanol
Ten związek chemiczny zrywa wiązania wodorowe w białkach i wiążę się z grupami
chemicznymi białek. Dla przykładu: etanol 70%
ma zdolność do przenikania przez ściany
komórkowe bakterii i denaturacji obecnych w mikroorganizmach białek i enzymów, co
prowadzi do śmierci komórki. Taka właściwość alkoholu, nazywana bakteriobójczą, jest
wykorzystywana do dezynfekcji. Spożywanie etanolu sprawia, że białka, które budują nasz
organizm, ulegają denaturacji i przez to nie mogą pełnić swoich funkcji. Etanol znajduje się
w piwie, winie czy innych wyrobach alkoholowych.
Wpływ etanolu na strukturę czwartorzędową białek
Źródło: GroMar Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
Sole metali ciężkich to związki chemiczne zawierające jony:Hg Pb2+ Ag+ Tl+ Cd2+
2+ , , , ,
i jony innych metali o gęstości większej niż
g 4,5
cm3 . Niszczą one wiązania jonowe w białku
i prowadzą do zniszczenia mostków solnych i mostków disiarczkowych. Produktem takiej
reakcji jest sól białka i metalu ciężkiego. Taką właściwość wykorzystuje się w przypadku
zatrucia organizmu związkami metali ciężkich. Pacjentowi podaje się białko, które wytrąca
sól, a następnie wywołuje się wymioty, usuwające z organizmu toksyny. Na przykład osobie
zatrutej solami rtęci należy podać do wypicia mleko z białkiem kurzym, by doprowadzić do
mdłości. W tym przypadku białka, zawarte w mleku i białku kurzym, wychwytują jony rtęci
i są usuwane z organizmu.
Mocznik
Guanidyna
Słownik
promieniowanie jonizujące
każdy rodzaj promieniowania, który wywołuje powstanie jonu z danego atomu lub
cząsteczki; do takiego promieniowania zalicza się promieniowanie alfa, beta i gamma
energia kinetyczna
zbyt wysokie fale dźwiękowe, aby usłyszał je człowiek; znalazły zastosowanie m. in.:
w medycynie – dzięki nim można uzyskać obraz narządów wewnętrznych
dysocjacja elektrolityczna
połączenia utworzone przez dwa atomy siarki, które są częścią tego samego związku
chemicznego
koagulacja
Bibliografia
Ban‐Oganowska H. i in. Ćwiczenia laboratoryjne z biochemii i chemii żywności, Wrocław
2006.
Doonan S., Zawadzki Z., Białka i peptydy, tłum. Z. Zawadzki, Warszawa 2008.
Stryer L., Berg J. M., Tymoczko J. L., Biochemia. Część 1. Molekularny wzór życia, Warszawa
2009, wyd. 4.
Wirtualne laboratorium – I
Laboratorium 1
Przebieg doświadczenia:
Wyniki:
Wnioski:
Wirtualne laboratorium pt. „Badanie wpływu wybranych czynników fizycznych i chemicznych na struktury
białkowe”
Źródło: GroMar Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
Sprawdź się
struktura czwartorzędowa
struktura trzeciorzędowa
struktura drugorzędowa
struktura pierwszorzędowa
Ćwiczenie 2 輸
Zaznacz prawidłowe odpowiedzi. Jakie wiązania NIE zostaną zerwane w trakcie denaturacji?
wiązania jonowe
oddziaływania hydrofobowe
wiązania peptydowe
wiązania wodorowe
Ćwiczenie 3 輸
wysoka temperatura
Ćwiczenie 4 輸
Czynniki fizyczne
detergenty wytrząsanie
temperatura alkohole
Czynniki chemiczne
niektóre kwasy organiczne
promieniowanie UV i RTG
promieniowanie jonizujące
Ćwiczenie 5 醙
Na podstawie schematu doświadczenia napisz obserwacje i wnioski.
Obserwacje:
Wnioski:
Rysunek łaźni wodnej, w której zanurzona została probówka wypełniona białkiem jaja kurzego
Źródło: GroMar Sp. z o. o., licencja: CC BY-SA 3.0.
Ćwiczenie 6 醙
Denaturacja białek to proces, który polega na zmianie przestrzennej struktury białek pod
wpływem czynników fizycznych i chemicznych. Może być procesem odwracalnym
(renaturacja) lub nieodwracalnym. Do czynników fizycznych, przyczyniających się do
denaturacji nieodwracalnej, zaliczamy: ogrzewanie, silnie mieszanie, wytrząsanie, naświetlanie
promieniowaniem nadfioletowym, rentgenowskimi i jonizującym lub działanie ultradźwiękami.
Natomiast denaturacja chemiczna zachodzi w obecności mocznika, chlorku guanidyny, na
skutek działania kwasów i zasad, soli metali ciężkich, alkoholi. Wszystkie te czynniki powodują
rozerwanie wiązań wodorowych, jonowych, mostków disiarczkowych, czyli niszczą wiązania,
które stabilizują strukturę łańcuchów polipeptydowych. Jeżeli wartość krytyczna pH białka nie
zostanie przekroczona, można zastosować proces renaturacji.
Rysunek do zadania
Źródło: GroMar Sp. z o.o., licencja: CC BY-SA 3.0.
Ćwiczenie 7 難
Na zdjęciu poniżej zaprezentowano działanie pewnego czynnika na strukturę białka. Na
podstawie swojej wiedzy odpowiedz na pytania.
B. Nazwij proces, jaki zaszedł podczas tego doświadczenia i wyjaśnij, na czym polega.
E. Zaproponuj hipotezę.
Przed:
Źródło: dostępny w internecie: www.pixabay.com, domena publiczna.
Po:
W wyniku działania SDS białko zyskuje duży ładunek ujemny – na każde dwa aminokwasy
białka przypada jeden anion SDS. Następnie próbkę nakłada się na żel poliakrylamidowy, który
umieszcza się w buforze. Białka po nałożeniu na żel poruszają się w stronę dodatnio
naładowanej anody. Odpowiedz na poniższe pytania:
Grupa docelowa:
Podstawa programowa:
Zakres podstawowy
Zakres rozszerzony
kompetencje cyfrowe;
kompetencje osobiste, społeczne i w zakresie umiejętności uczenia się;
kompetencje matematyczne oraz kompetencje w zakresie nauk przyrodniczych,
technologii i inżynierii;
kompetencje w zakresie rozumienia i tworzenia informacji.
Cele operacyjne
Uczeń:
Strategie nauczania:
strategia asocjacyjna;
strategia problemowa.
Formy pracy:
praca indywidualna;
praca w parach;
praca w grupach;
praca całego zespołu klasowego.
Środki dydaktyczne:
Przebieg lekcji
Faza wstępna:
Faza realizacyjna:
1. Nauczyciel dzieli losowo uczniów na grupy i zadaje pytania: Czym jest proces
denaturacji? Czy jest to odwracalny proces? Jakie czynniki na niego wpływają?
Uczniowie mogą korzystać z dostępnych źródeł informacji. Po zastanowieniu
uczniowie zapisują odpowiedzi na kartkach. Każdy lider prezentuje odpowiedź na
forum klasy. Nauczyciel weryfikuje poprawność odpowiedzi.
2. Eksperyment chemiczny – „Badanie wpływu stężonego etanolu i azotanu(V) ołowiu(II)
na białko jaja kurzego”. Nauczyciel poprzez losowanie dzieli klasę na grupy. Uczniowie
otrzymują od nauczyciela odpowiednie szkło, sprzęt laboratoryjny i odczynniki
chemiczne, a następnie przeprowadzają eksperyment. Nauczyciel rozdaje karty pracy
ucznia. Uczniowie samodzielnie stawiają pytanie badawcze i hipotezę, rysują schemat
doświadczenia, obserwują zmiany podczas eksperymentu, wyciągają wnioski (wszystko
zapisują w kartach pracy). Następnie na forum całej klasy następuje weryfikacja pod
względem merytorycznym. Nauczyciel wyjaśnia niezrozumiałe kwestie.
3. Wirtualne laboratorium – „Badanie wpływu wybranych czynników fizycznych
i chemicznych na struktury białkowe”. Uczniowie pozostają w tych samych grupach
i będą przeprowadzali eksperyment wg instrukcji załączonej do medium bazowego –
wirtualne laboratorium – w którym zbadają, jakie czynniki wpływają na denaturację
struktur białkowych?. Nauczyciel monitoruje przebieg pracy i wspiera uczniów. Po
zakończeniu liderzy prezentują efekty pracy grupowej. Nauczyciel weryfikuje
poprawność merytoryczną wypowiedzi.
4. Uczniowie w parach pracują z wykorzystaniem wirtualnego laboratorium – uzupełniają
wirtualny dzienniczek: obserwacje, wyniki i wnioski. Nauczyciel monitoruje pracę
uczniów, wspiera ich, wyjaśnia niezrozumiałe kwestie. Chętne osoby na forum
przedstawiają wyniki pracy, a nauczyciel weryfikuje je pod kątem poprawności.
5. Przedstawienie wniosków. Chętne lub wybrane przez prowadzącego osoby
przedstawiają efekty swojej pracy na forum klasy i zapisują poprawne odpowiedzi na
tablicy. Nauczyciel uzupełnia oraz wyjaśnia niezrozumiałe kwestie.
6. Uczniowie samodzielnie sprawdzają swoją wiedzę, wykonując ćwiczenia zawarte
w e‐materiale – sprawdź się.
Faza podsumowująca:
Praca domowa:
Materiały pomocnicze: