Professional Documents
Culture Documents
2018 Skrypt Mikologia
2018 Skrypt Mikologia
2018 Skrypt Mikologia
1
Na kolejne zajęcia proszę o przyniesienie 2 ziemniaków/grupę
Ćwiczenie 2
I. Przygotować płytki z podłożem hodowlanym dla grzybów:
- rozpuścić podłoże Sabourauda (300 ml) i wylać 15 płytek o 60mm (do wysokości 2/3 płytki). Płytki
pozostawić do zastygnięcia agaru.
Hodowla, ocena morfologii grzybów drożdżopodobnych i strzępkowych, inicjacja sporulacji u drożdży, zwykle
stymuluje produkcję pigmentu przez T. rubrum. Rekomendowane podłoże do oznaczania liczby grzybów w
napojach mlecznych, środkach spożywczych mrożonych i innych. Umożliwia częściową identyfikację wyrosłych
drożdży i pleśni na podstawie morfologii kolonii.
b) CZAPEK-DOX AGAR:
(G/L):
- FeSO4x7(H2O) 0.01
- MgSO4 0.5
- KCl 0.5
- K2HPO4 1.0
- NaNO3 3.0
- Sacharoza 30.0
- AGAR 15.0
pH 6.8 ± 0.2.
(121 °C, 15 psi, 15 minutes).
d) Podłoże Sabourauda:
2
Wykonać zgodnie z instrukcją producenta
- ezą haczykową pobrać ok. 1-2mm2 kawałki agaru z grzybnią i zaszczepić centralnie lub w 3 miejscach płytkę z
podłożem Sabourauda
http://ammaterialy.w.interiowo.pl/mikrob/praktycz.pdf
Na kolejne ćwiczenia przynieść po 3 kawałki (z różnych źródeł) sera białego
Ćwiczenie 3
I. Badanie czystości mikologicznej różnych powierzchni laboratoryjnych:
1. Przygotować płytki ( 60mm )z podłożem Sabourauda (po jednej dla każdego studenta)
2. Jałową wymazówką wykonać posiew z wybranej przez studenta powierzchni
3. Płytki (opisane miejscem pobranej próby) inkubować w temperaturze pokojowej 7-21 dni
3
Hodowle płytkowe : Aspergillus clavatus, Penicillium spp., Scopulariopsis brevicaulis, Fusarium spp., Rhizopus spp.,
Alternaria spp.
- przygotować zestaw 4 podłóż na płytkach Petriego ( 60mm ) (Potato-dextrose agar (PDA), CZAPEK-DOX AGAR,
agar owsiany (CBS) oraz Sabourauda) dla każdego badanego grzyba
- ezą hakową pobrać grzybnię i przeszczepić centralnie (tylko w 1 miejscu) na dane podłoże
- hodowlę inkubować 7- 21 dni prowadząc cotygodniowe obserwacje makroskopowe grzybów (wygląd, średnica
kolonii) oraz ich zarodnikowanie (obserwacje pod binokularem). Wyniki zapisać w postaci tabeli.
Ćwiczenie 4
I. Mikrohodowle wybranych grzybów pleśniowych:
- Mikrohodowle wykonać jak opisano w ćwiczeniu 3 (wersja z wycinanymi bloczkami – wylać płytki 2 ( 90mm) na
grupę z agarem Sabourauda do wysokości ½ płytki)
- Wykonać opis makroskopowy wysiewanych grzybów
- Przeprowadzić obserwacje mikroskopowe wyrosłych grzybów pleśniowych przy powiększeniu obiektywu (5-40x)
III. Przynieść na kolejne zajęcia: 1/2l wody pobranej z naturalnego zbiornika, kałuży lub roztopionego śniegu (w
zależności od warunków atmosferycznych)
4
IV. Na kolejne zajęcia przynieść: ok. 50ml ziemi (zabezpieczonej przed wyschnięciem np. w woreczku
foliowym) pobranej z różnych stanowisk (min. 5 prób/ grupę) (semestr zimowy!!)
Ćwiczenie 5
I. Badanie czystości mikologicznej różnych powierzchni laboratoryjnych(2):
- Wykonać obserwacje pod binokularem wyrosłych grzybów pleśniowych
pH 7.2 ± 0.2
( streptomycynę dodać do rozpuszczonego i ostudzonego do 50oC podłoża, tuż przed wylaniem płytek)
Agar Róż Bengalski – podłoże z różem bengalskim służy do izolacji i różnicowania drożdży i pleśni z próbek
środowiskowych. Stosowane do oznaczania liczby drożdży i pleśni z zastosowaniem metody zalewowej lub posiewu
powierzchniowego. Róż bengalski opóźnia rozrost kolonii pleśni, zabarwia strzępki grzybni co ułatwia odróżnianie
kolonii drożdży od pleśni i liczenie kolonii.
5
Skład pożywki: pepton 10 g, NaCl 5 g, CaCl2.2H20 0,1 g, purpura bromokrezolu 25 mg, agar 15 g /l wody, pH
5.4.
Pożywkę sterylizować w autoklawie pod ciśnieniem 15 psi przez 20 min.
(10%) wodnego roztworu Tween 80 - 10 ml Tween 80 rozpuścić w 90 ml ciepłej destylowanej wodzie (65-70°C) i
oddzielnie sterylizować.
Po ochłodzeniu do 65-70°C, 10 ml roztworu Tween zmieszać z 90 ml podstawowego medium i wylać płytki 60mm
Płytki szczepić punktowo testowym grzybem (Rhizopus, Fusarium) i inkubowano przez 8-10 dni.
https://www.ajol.info/index.php/ajb/article/viewFile/132773/122385
Ćwiczenie 6
I. Izolacja Geotrichum candidum z produktów mlecznych(2):
- przygotować płytki z agarem Sabourauda (3/ grupę) ( 90mm)
- ezą (okrągłą)pobrać grzybnię (żółtawy nalot na serze) i wysiać, posiewem redukcyjnym, na podłoże Sabourada.
Inkubację prowadzić w temperaturze 23-27°C (25°C) przez maksymalnie 4 dni kontrolując co 24 godz.
pojawianie się chlamydospor. Chlamydospory nie rozwijają się w 37°C
1. Agar Adamsa:
g/ 1l:
0,4g glukoza
2,3g octan sodu
20g agar
108-112°C / 15 minut
Hodować Saccharomyces cerevisiae 48 godzinach w 30oC.
3. „Podłoże do sporulacji”:
YE (wyciąg drożdżowy) 1,5g
Glukoza 1g
Bezwodny octan K 9,8g
Agar 20g
Woda do 1000ml
7
Materiał: hodowle płytkowe przedstawiciel rodzaju Candida, Bacillus, Escherichia
- wykonać 4 preparaty: 1 z mieszaniny 3 ww. mikroorganizmów oraz po 1 preparacie z czystych kultur.
1. Barwienie podstawowe roztworem fioletu krystalicznego. Wszystkie bakterie zostają wybarwione na fioletowo
pod wpływem tego barwnika zasadowego.
2. Utrwalenie płynem Lugola (roztwór jodu w jodku potasu). Jodyna w połączeniu z fioletem krystalicznym tworzy
w komórkach kompleksy krystaliczne fiolet-jodyna.
3. Odbarwienie (alkohol etylowy, lub mieszanina alkohol etylowy-aceton). Pierwotne barwienie fioletem
krystalicznym zostaje wymyte u niektórych bakterii, inne pozostają zabarwione.
4. Dobarwienie barwnikiem kontrastowym (fuksyna karbolowa, safranina). Ten barwnik zasadowy powoduje
ponowne wybarwienie na czerwono (safranina) lub na różowo (fuksyna) bakterii pozbawionych koloru podczas
odbarwiania.
Ćwiczenie 7
I. Izolacja Geotrichum candidum z produktów mlecznych(3):
- z wyrosłych kolonii założyć hodowlę stacjonarną w 5ml płynnego podłoża Sabourada
- hodowlę prowadź do 4 tygodni prowadząc cotygodniowe obserwacje
* Tween 80 jest powierzchniowo aktywnym środkiem, który stymuluje produkcję chlamydospory Candida albicans i
czasami Candida tropicalis
8
V. Wymaz z jamy ustnej w kierunku izolacji grzybów drożdżopodobnych (1):
- przygotować odpowiednią ilość płytek ( 60mm)z agarem Sabourauda streptomycyny (40ug/ml) (gentamycyny lub
chloramfenikolu),
-Wymaz pobierać z grzbietowej powierzchni języka, policzka i zmian patologicznych,
- pobrany materiał wysiać na gotowe podłoże
- wyniki posiewu oceniać po 24 i 72 godzinach oraz po 7 dniach (temperatura 37oC).
Ćwiczenie 8
I. Ocena wzrostu Malassezia spp. (M. furfur i M. pachydermatis) na modyfikowanych podłożach
Sabourauda:
- przygotować 1 płytkę ( 90mm) z agarem Sabourauda oraz 3 płytki z podłożem Sabourauta wzbogacone jednym z
podanych poniżej składników:
- oliwą z oliwek (końcowe stężenie1%)
- Tween 80 (1% )
-Tween 40 (1%)
- wykonać zawiesinę grzybów w 1ml płynu fizjologicznego (OD550nm=0,3)
- płytki podzielić na sektory i podpisać
- nakroplić, centralnie na odpowiednim sektorze, po 30 ul zawiesiny odpowiedniego grzyba
- inkubować w temperaturze 37oC przez 72-96godz.
Po rozpuszczeniu podłoża do badania asymilacji lipidów schłodzić je do ok. 50oC i wymieszać z 200ul (na 1 płytkę)
wystandaryzowanej (do 105/ml) zawiesiny komórek badanego grzyba. Po zastygnięciu w podłożu wyciąć, jałowym
kokroborem, studzienki o średnicy 8mm. Do tak uzyskanych studzienek dodać różne źródła tłuszczu (np.: oliwa z
oliwek, oliwa z pestek winogron, olej rzepakowy, Tween 20 (roztwór zawierający ester kwasu laurynowego), Tween
40 (roztwór zawierający ester kwasu palmitynowego), Tween 60 (roztwór zawierający ester kwasu stearynowego),
Tween 80 (roztwór zawierający ester kwasu oleinowego).
9
Wykonać doświadczenie na 3 płytkach ( 90mm) zgodnie ze schematem (maksymalnie 3 źródła/płytkę) Hodowle
inkubować 7 dni w temperaturze 37oC . Zmierzyć strefę wzrostu grzybów wokół studzienek.
III. Ocena zdolności produkcji enzymów (katalazy oraz ureazy) przez Malassezia spp.:
1. Reakcja na obecność katalazy:
Katalaza, enzym zawierający hem, dysproporcjonuje dwie cząsteczki H2O2 do H2O i O2 zgodnie z równaniem:
2 H2O2 2H2O + O2
- Na szkiełko podstawowe pobrać ezą grzybnię (grzybów z rodzaju Malassezia, Saccharomyces oraz Candida), a
następnie dodać ok. 3 krople wody utlenionej
- Szczepy Malassezia spp. oraz wybrane Candida, Geotrichum i Rhodotorula wysiać liniowo na płytki/skosy z podłożem
Christensena (z dodatkiem Tween 80 (0,1%) oraz Tween 40 (0,5%))
- hodowle prowadzić w temperaturze pokojowej lub do 32oC
Ćwiczenie 9
I. Produkcja askospor przez Saccharomyces cerevisiae (drożdże właściwe) (2):
a) Obserwacja zarodników workowych (askospor) drożdży Saccharomyces cerevisiae oraz
Saccharomycodes ludwigii w preparacie przyżyciowym
1. Umieścić kroplę wody na szkiełku podstawowym (po 1 preparacie z podłoża Adamsa, Gorodkowej oraz „Podłoża
do sporulacji”)
2. Pobrać ezą niewielką ilość hodowli drożdży z pożywek sporulacyjnych i zawiesić w wodzie
3. Przykryć szkiełkiem nakrywkowym i obserwować pod mikroskopem stosując początkowo obiektyw 10x, a
następnie 40x.
b) Barwienie zarodników u drożdży metodą Schaeffera-Fultona
10
- Wykonać rozmaz drożdży na szkiełku podstawowym, (po 1 preparacie z podłoża Adamsa, Gorodkowej oraz „Podłoża
do sporulacji”)
- utrwalić (2-3 minuty) 70% alkoholem metylowym (dodać 2-3 krople alkoholu i wysuszyć preparat suszarką).
Barwić:
-5 min. 1% roztworór zieleni malachitowej w 0,5% fenolu (podgrzewać na palnikiem lub suszarką)
- płukać woda bieżącą
- 1min. 1% wodny roztwór safraniny
Worki – zielone, komórki wegetatywne –czerwone
Gatunek zymogram
grzyba
glukoza galaktoza laktoza maltoza sacharoza rafinoza
11
c) Podłoża chromogenne:
Hodowla na agarach selektywnych ID albicans, CHROMagar Candida (identyfikacja C. tropicalis, C.
krusei, C. glabrata, C. albicans), ID albicans, CandiSelect (C. albicans niebieskie chromogenny substrat
rozkładany przez N-acetylo-beta-D-galaktozamidazę).
- Wykonać wysiew redukcyjny dla wybranych grzybów z rodzaju Candida oraz z pojedynczych kolonii
grzybów wyizolowanych z jamy ustnej
- inkubację prowadzić zgodnie z wytycznymi producenta podłoża
Ćwiczenie 10
I. Izolacja Geotrichum candidum z produktów mlecznych (4):
Obserwacja artrokonidiów oraz strzępek dichotomicznie rozgałęzionych Geotrichum candidum:
-wykonaj preparat przyżyciowy z hodowli płynnej oraz stałej na szkiełku podstawowym
III. Testy asymilacyjne (auksamogramy węglowodanowe i azotowe) – badają zdolność grzyba do asymilacji
(przyswajania) różnych cukrów i związków azotowych jako jedynych źródeł węgla i azotu
- na krążki dodać po 15ul badanego 10% roztworu źródła N (1-KNO3, 2-(NH4)2SO4, 3-asparagina, 4-mocznik, 5-
pepton) lub C (6-mannoza, 7-glukoza, 8-sacharoza, 9-mannitol, 10-galaktoza) (w zależności od użytego podłoża)
- inkubować 48-96h w 28-37oC
- wyniki przedstawić w postaci tabeli z podanymi średnicami wzrostu (zmętnienia) wokół miejsca nakroplenia
12
IV. Synteza enzymów hydrolitycznych:
Jednym z mechanizmów umożliwiającym kolonizację tkanek gospodarza jest zdolność wydzielania enzymów
hydrolitycznych, w tym proteaz i lipaz, które przez oddziaływanie na środowisko grzyba warunkują pozyskiwanie
substancji odżywczych oraz rozprzestrzenianie się grzybów w obrębie skóry i błon śluzowych.
14
15
16
17
V. Test perforacji włosa
18
- Przygotować 2 płytki ( 90mm) z podłożem Sabourauda i zaszczepić je (jak pokazano): T mentagrophytes
oraz M. canis
- płytki inkubować 7 dni w temp. pokojowej
VI.Na kolejne zajęcia przynieść próbki/eppendorfy z szamponami (preferowane szmpony przeciwłupieżowe)
VII.Na kolejne zajęcia przynieść ok. 50ml ziemi (zabezpieczonej przed wyschnięciem np. w woreczku
foliowym) pobranej z różnych stanowisk (min. 5 prób/ grupę) (semestr letni!!)
Ćwiczenie 11
I. Ocena skuteczności działania szamponów przeciwłupieżowych na wzrost grzybów z rodzaju
Malassezia:
Ćwiczenie 12
I. Wykrywanie ureazy - podłoże Christensena (z dodatkiem mocznika i czerwieni fenolowej) (patrz
ćwiczenie 8):
Różnicowanie typowych gatunków Trichophyton rubrum (wynik ujemny) i Trichophyton mentagrophytes (wynik
dodatni)
Na czyste i wysuszone szkiełko podstawowe należy nanieść kroplę płynu Lugola i kroplę błękitu metylenowego oraz
rozprowadzić w nich badane drożdże. Po 5 minutach wykonany preparat oglądać pod mikroskopem.
Wyniki barwienia:
protoplazma komórki barwi się na kolor żółto-brunatny, ziarna wolutyny zaś na kolor ciemnogranatowy.
Ćwiczenie 13
I. Ocena makroskopowa i mikroskopowa grzybów należących do dermatofitów (1):
a) opisać makroskopowo wygląd kolonii dermatofitów
b) wykonać preparaty mikroskopowe z wybranych grzybów należących do dermatofitów:
- podpisać szkiełko nazwą danego grzyba
- na szkiełko podstawowe nanieść kroplę barwnika Lactophenol Cotton Blue
Lactophenol Cotton Blue - roztwór błękitu laktofenolowego z bawełny, składający się z 40% glicerolu, 20% fenolu, 20%
kwasu mlekowego, 0,05% niebieskiego barwnika z bawełny (błękit Poirriera) oraz wody. Błękit laktofenolowy z bawełny
jest niebieskim barwnikiem używanym dobezpośredniego badania próbek pochodzenia klinicznego w kierunku
21
obecności elementów grzybów. Po dodaniu błękitu laktofenolowego z bawełny grzyby ulegają wybarwieniu na
niebiesko, co umożliwia ich łatwiejsze uwidocznienie i badanie.
- ezą hakową pobrać fragment grzybni (starając się nie naruszyć struktury grzybni) i umieścić w kropli
barwnika
- przykryć preparat szkiełkiem nakrywkowym
- oglądać preparat pod powiększeniem obiektywu 10-40x
Ćwiczenie 14
I. Odczyt testów perforacji włosów (patrz ćwiczenie 11)
Ćwiczenie 15
I. Ocena obecności elementów grzybów w preparatach dermatologicznych
22
Nr1 (C +): kontrola pozytywna zawierające glukozę i purpurę bromokrezolową
nr 2 (β-NAG): zawiera chromogenny-substrat dla beta-D-glukozaminidazy;
nr 3 (pro): zawiera chromogenny substrat dla aminopeptydazy L- proliny;
nr 4 (TRE): zawiera trehalozę i purpurę bromokrezolową
nr 5 (EVIL): zawiera maltoza i purpurę bromokrezolową
nr 6 (CEL): zawiera celobiozę i purpurę bromokrezolową
nr 7 (RAF): zawiera rafinozę i purpurę bromokrezolową
Nr 8 (LAC): zawiera laktozę i purpurę bromokrezolową
nr 9 (POX) zawiera podłoże dla oksydazy fenolowej;
nr 10 (URE): zawiera mocznik
nr 11: pozytywna kontrola wzrostu
nr 12 (AB): amfoterycyna B 0,5 mg / ml;
nr 13 (AB): amfoterycyna B 2mg/ml;
nr 14 (5FC): 5-flucytozyna 4μg/ml;
nr 15 (5FC): 5-flucytozyna 16μg/ml;
nr 16 (ITZ): itrakonazol 0,125 g / ml;
23
nr 17 (ITZ): itrakonazol 0,5 mg / ml;
nr 18 (WSC): flukonazol 8mg/mL;
nr 19 (WSC): flukonazol 32μg/ml;
nr 20 (VRZ): worikonazol 1μg/ml;
Wyniki odczytuje się trójkami:
ELIchrom FUNGI:
24
• Hydroliza 7 chromogennych substratów:
Oksydazy i peptydazy drożdży hydrolizują substraty chromogenne prowadzące do uwolnienia p-nitroaniliny, p-
nitrofenol lub orto-nitrofenolu, które mają żółte zabarwienie (ß-NAG, PRO, ONPG SGL, GLY) lub niebie skie(A-
GLU, PHOS).
• Asymilacja 10 substatów:
- Wykorzystanie cukrów ujawnia się przez zmianę koloru czerwieni bromokrezolowej (BCP) od fioletu do
żółtego, a nawet do braku koloru (MCR, TRE, GAL-SAC, MAL, LRP, RAF, LAC)
- Odporność na aktidion - podobna zasada (ACT)
-hydroliza mocznika uwalnia amoniak, który alkalizuje podłoże– czerwień fenolowa (PR) zmienia kolor na
fuksjowo-różowy (URE).
- hydroliza eskuliny do glukozy i eskuletyny. W obecności jonów Fe3+ (cytrynianu żelazowego) powstająca
eskuletyna tworzy kompleks o barwie brązowo-czarnej (ESC)
• Utlenianie 1 syntetycznego substratu
- aktywność okydazy fenolowej w obecności kwasu kofeinowego daje brązowe zabarwienie
(POX).
Każdy test zawiera kontrolę pozytywną (T +) – asymilacja glukozy oraz negatywną kontrolę (C-)
Opis:
C +: kontrola pozytywna zawierająca glukozę i BCP.
ß-NAG: zawiera substrat chromogenny na-D-glukozaminidazy
PRO: zawiera chromogenny substrat dla L-proliny-amidaza
ACT: zawiera aktidion, glukozę i BCP
MDG: zawiera metylo-a-D-glukopiranozyd
ESC: zawiera eskulinę
alfa-GLU: zawiera substrat chromogenny dla D-glucopyranosidase
PHOS: zawiera chromogenny substratu dla fosfatazy
TRE: zawiera trehalozę i BCP
ONPG: zawiera substrat chromogenny dla ß-D-galaktozydazy
C -: kontrola negatywna dla czytania SGL i GLY
SGL: zawiera chromogenny substratu dla peptydazy
GLY: zawiera chromogeny substratu dla amidazy glicyny
URE: zawiera mocznik i PR
POX: zawiera podłoże dla fenylooksydazy
SAC / GAL: zawiera galaktozę, sacharozę i BCP
MAL: zawiera maltozę i BCP
CEL: zawiera celobiozę i BCP
RAF: zawiera rafinozę i BCP
LAC: zawiera laktozę i BCP
25
matrix.ur.krakow.pl/~aduda-chodak/dydaktyka/materialy/MZ.../cwiczenie_1.doc
26