KOENZIMI

građa i uloga

podjela prema tipu katalizirane reakcije

doc.dr.sc. Sunčica Buljević

suncica.buljevic@uniri.hr
(holo)enzim = enzim (proteinski dio) + neproteinski dio

Kofaktor + apoenzim(holo)enzim
kofaktor katalitičko mjesto koenzim

apoenzim

holoenzim
 Kofaktori
Kofaktor – mala molekula o kojoj ovisi enzimska aktivnost:
•metali
•organski kofaktori – male organske molekule
➢ prostetska skupina - čvrsto vezana na enzim
➢ koenzim (kosupstrat) – slabo vezan na enzim

mnogi enzimi koriste iste koenzime

Djelovanje koenzima

L- LAKTAT

GLICERALDEHID-3-FOSFAT

GLICERALDEHID-3-FOSFAT DEHIDROGENAZA LAKTAT-DEHIDROGENAZA

PIRUVAT

1,3-BISFOSFOGLICERAT
 Koenzim (kosupstrat)
• ulazi u nekatalitičku, ali stehiometrijsku reakciju sa supstratom
• dva različita enzima; recikliranje

fosfataza
Djelovanje prostetske skupine

OKSIDAZA AK

OKSIDAZA AK
 Građa koenzima
Purinske i
pirimidinske
baze
 Građa koenzima
• gotovo svi sadrže fosfat (nukleozid-fosfat ili nukleotid)

• nukleotid = baza (purin ili pirimidin) + monosaharid (riboza) + fosfat

 Vitamini
• organske molekule potrebne u malim količinama, unose se hranom
Topljivi u vodi: vitamin C, vitamini B kompleksa
Topljivi u mastima: vitamini A, D, E i K

Većina vitamina topljivih u vodi su komponente koenzima!

VITAMIN KOENZIMSKI DERIVAT
TIAMIN (B1) tiamin pirofosfat
RIBOFLAVIN (B2) flavin adenin dinukleotid i flavin mononukleotid
PIRIDOKSIN, PIRIDOKSAL
I PIRIDOKSAMIN (B6) piridoksal fosfat
PANTOTENAT koenzim A
BIOTIN kovalentno pričvršćen na karboksilaze
FOLAT tetrahidrofolat
KOBALAMIN (B12) kobalaminski koenzimi
 I.Koenzimi prijenosnici vodika

Pripadni
Koenzim Kratica Prenosi
vitamin
Nikotinamid-adenin-dinukleotid NAD vodik B3
Nikotinamid-adenin-dinukleotid-
NADP vodik B3
fosfat
Flavin-mononukleotid FMN vodik B2

Flavin-adenin-dinukleotid FAD vodik B2

Ubikinon Q vodik i elektroni

Stanični hemini elektroni

Liponska kiselina Lip vodik, acil

Nikotinamid adenin dinukleotid
NIKOTINAMID

RIBOZA

ADENOZIN
ADENIN

PO32- u NADP+
Građa NAD+

Optički test

REDUCIRANI
(NADH + H+)

Pri oksidaciji supstrata, nikotinamidni

prsten NAD+ prihvaća H+ i 2e- (ekvivalentno
hidridnom ionu :H–), dok se drugi H+
otpušta u otopinu:

OKSIDIRANI
(NAD+)
 GLIKOLIZA
glukoza

glukoza 6-fosfat

NAD+/NADH:
- glikoliza 2 gliceraldehid 3-fosfata

gliceraldehid 3-fosfat
- ciklus limunske kiseline dehidrogenaza

- β-oksidacija 2 1,3-difosfoglicerata

- oksidativna fosforilacija
2 piruvata

piruvat
dehidrogenaza

NADP+/NADPH: 2 Acetil CoA

- nastaje u reakcijama fotosinteze 2 oksalacetata

malat 2 citrata
dehidrogenaza
- ciklus pentoza fosfata 2 L-malata
CIKLUS
2 izocitrata
- sudjeluje u anaboličkim reakcijama 2 fumarata
LIMUNSKE
KISELINE izocitrat
sukcinat
dehidrogenaza
dehidrogenaza

2 sukcinata 2 -ketoglutarata
-ketoglutarat
2 sukcinil CoA dehidrogenaza
 Reakcije NADP+
• mehanizam otpuštanja elektrona isti je kao kod NADH
• dodatna fosfatna grupa omogućuje prepoznavanje biosintetskim enzimima
• NADPH je glavni elektron donor u reduktivnim biosintezama (npr. MK)

NADPH

Oksidacijska obrana Nastanak ROS

(GSH, katalaza) Reduktivne Detoksifikacija
(NADPH oksidaza)
biosinteze (CYT P450)

Oksidacijski Oksidacijski
prasak stres

Stanična
signalizacija

Primjer: neutrofilna NADPH oksidaza; borba protiv mikroorganizama

Flavinski nukleotidi
• aerobne dehidrogenaze (prenose vodik na O2 uz nastanak H2O2)

• veću važnost imaju anaerobne dehidrogenaze koje prenose vodik i

elektrone na druge prostetske skupine (NADH-dehidrogenaza u RL)

• izoaloksazinski sustav djeluje kao reverzibilni redoks sustav

izoaloksazin
Riboflavin

RIBITOL

DIMETIL
IZOALOKSAZIN

7,8-dimetil-10-ribitil-izoaloksazin
Flavin mononukleotid (FMN)

RIBITOL

DIMETIL
IZOALOKSAZIN

RIBOFLAVIN (B2)

FLAVIN MONONUKLEOTID (FMN)

Flavin adenin dinukleotid

ribitol adenozin

OKSIDIRANI
(FAD)

REDUCIRANI
(FADH2)
Tip kemijske reakcije u kojoj sudjeluje FAD

• anaerobne dehidrogenaze koje prenose vodik i

elektrone na druge prostetske skupine (RL)

sukcinat
dehidrogenaza
sukcinat fumarat

• integralni je dio mitohondrijske membrane i

direktno povezana s
prijenosnim lancem elektrona
• FADH2 ostaje na enzimu
Koenzim Q10 (ubikinon)

Izoprenoidna jedinica
Oksidirani (kinonski) oblik -
ubikinon (CoQ)

Međuprodukt rekcije je
slobodni radikal
ubisemikinon –
CoQH• ili Q•)

Reducirani (hidrokinonski) oblik -

ubikinol (CoQH2)
 E1 Katalitički mehanizam
PIRUVAT

1
piruvat dehidrogenaze
TPP

AKTIVIRANI
ACETALDEHID

Koenzimi :
2 2e E2
TPP TIAMIN PIROFOSFAT
Lip

AKTIVIRANI 2e Lip LIPONSKA KISELINA

ACETIL
E3
FADH2
FADH2 REDUCIRANI OBLIK FAD
(flavin adenin dinukleotid)
3 4 2e

NADH REDUCIRANI OBLIK NAD+

NADH (nikotinamid adenin dinukleotid)

CH3–C– CoA CoA KOENZIM A


O
AKTIVIRANI
ACETIL

Acetil-CoA
 II. Koenzimi prijenosnici grupa

Pripadni
Koenzim Kratica Prenosi
vitamin
Adenozin-trifosfat ATP Fosfat

Sulfat fosfoadenilne kiseline PAPS Sulfat

Piridoksal-fosfat PLP Amino-grupa B6

Fosforil-kolin i
Citidin-difosfat CDP
slične grupe
Uridin-difosfat UDP Šećeri, uronati
Adenozin 5´- trifosfat (ATP)

Fosfodiesterska
veza
Fosfoanhidridna
ADENIN veza

Adenozin
riboza AMP
ADP

ATP
 Hidroliza fosfatne veze
G = - 30,5 kJ mol-1
~ oznaka
visoko energetske (- 7,3 kCal mol-1)
veze

ATP ADP

ATP + H2O ADP + Pi +H+ G = - 30,5 kJ mol-1 Pi = ORTOFOSFAT

ATP + H2O AMP + PPi +H+ G = - 30,5 kJ mol-1 PPi = PIROFOSFAT
ADP + H2O AMP + Pi +H+ G = - 30,5 kJ mol-1

• G ovisi o ionskoj jakosti medija i koncentraciji Mg2+ i Ca2+

• G pri staničnim uvjetima je približno – 50 kJ/mol
 ATP je glavni brzi donor slobodne energije

PROIZVODNJA ENERGIJE TROŠENJE ENERGIJE NA:

RAZGRADNJOM: biosintezu makromolekula
ugljikohidrata mišićnu kontrakciju
masti aktivni transport iona
katabolizam
proteina termogenezu
FOTOSINTEZOM prijenos signala

ATP se kontinuirano stvara i troši!

• odmaranje 40 kg ATP/24h; normalna aktivnost 65 kg ATP/24h; naporno vježbanje 0,5kg
ATP/min
• novonastala molekula ATP-a potroši se unutar 1 min od nastanka
• svaka molekula ATP-a reciklira se gotovo 1300 puta dnevno
Energijom bogati spojevi u metabolizmu
fosfoenolpiruvat

1,3-difosfoglicerat

fosfokreatin
G hidrolize (kJ • mol-1)

“Visoko-energetski”
fosfatni spojevi

“Nisko-energetski”
fosfatni spojevi

glukoza-6-fosfat

glicerol-3-fosfat
Fosforilacija glukoze pomoću ATP-a

Adenozin trifosfat -D-glukopiranoza

(ATP)

Glukoza-6-fosfat Adenozin difosfat

(ADP)
Analozi ATP-a

gvanin uracil citozin

GTP UTP CTP

(gvanozin trifosfat) (uridin trifosfat) (citidin trifosfat)
SINTEZA GLIKOGENA SINTEZA MASTI
GLUKONEOGENEZA
SINTEZA PROTEINA

R = riboza + fosfati
Piridoksal-fosfat (PLP)
• kofaktor metabolizma aminokiselina (transaminaze, dekarboksilaze)
• povezuje aminokiseline u Schiffovu bazu
• biosinteza sfingolipida
• biosinteza neurotransmitera (dopamin, serotonin, GABA, epinefrin)

Piridoksal Piridoksin Piridoksamin

Piridoksal 5’-fosfat
 Koenzimi prijenosnici C1-jedinica

Pripadni
Koenzim Kratica Prenosi
vitamin
Adenozil-metionin SAM Metilna grupa metionin

Tetrahidrofolna kiselina H4-folat Formilna grupa Folna kiselina

Biotin Karboksilna grupa Vitamin H

S-adenozil-metionin (SAM)

• najvažniji donor –CH3

Biotin (B7, vitamin H)
• ciklički derivat mokraćevine s tiofanskim prstenom
• prostetska skupina karboksil-transferaza
• služi u reakcijama karboksilacije i dekarboksilacije
• sinteza masnih kiselina i aminokiselina; CLK, glikoliza
• prenosi karboksilnu –COOH (CO2) skupinu
1. reakcija glukoneogeneze
bikarbonat piruvat

piruvat
karboksilaza
BIOTIN

oksalacetat

Piruvat se karboksilira bikarbonatnim ionom iz otopine

 Koenzimi prijenosnici C2-jedinica
Pripadni
Koenzim Kratica Prenosi
vitamin
Pantotenska
Koenzim A CoA Acetil (acil)
kiselina
C2-aldehidne
Tiamin-difosfat TPP B1 (tiamin)
grupe
 Koenzim A
• koenzim A veže acetat ili druge karboksilatne anione

• najvažniji spoj je acetil-CoA

• biosinteza masnih kiselina

•  - oksidacija
• oksidativna dekarboksilacija
Koenzim A (CoA, CoASH, HSCoA)
 Koenzim A acetilna grupa

• univerzalni nosač acilnih grupa -merkaptoetilamin

• reaktivno mjesto:
terminalna –SH grupa
• veza acilne grupe i CoA je
tioesterska
adenin
• vrlo visok prijenosni potencijal
za acetilnu grupu
pantotenska
• reakcije na karbonilnoj grupi -
kiselina
dobivanje estera i amida
(npr. acetil kolin)
• reakcije na metilnoj grupi -
eliminacijom protona s –CH3
grupe nastaje karbanion koji s
karbonilnim grupama stvara
D-riboza
C-C veze (npr. u CLK
acetil-CoA + oksalacetat citrat)
 III. Koenzimi izomeraza i liaza
Pripadni
Koenzim Vrsta reakcije
vitamin
Uridin-difosfat Izomerizacija šećera

Piridoksal-fosfat Dekarboksilacija B6

Tiamin-difosfat Dekarboksilacija B1
Premještanje karboksilne
B12-koenzim B12
skupine
Tiamin-difosfat (TPP)
• najvažnija uloga: dekarboksilacija 2-oksokiselina
• aldehidne skupine s tri glavna supstrata: piruvat, α-ketoglutarat i ksiluloza-5-
fosfat
• piruvat-dehidrogenaza
• α-ketoglutarat-dehidrogenaza
• piruvat-dekarboksilaza
• transketolaze
• TPP uvijek je čvrsto vezan za navedene apoenzime s kojima funkcionira kao
prostetska skupina

 pirimidinski i tiazolni prsten

 reaktivni centar TPP-a je kiseli C-2 ugljik tiazolnog prstena