Professional Documents
Culture Documents
Klug Lecture
Klug Lecture
by
AARON KLUG
Intra cellam vivam incedunt multae processus et variae processus biochemicae, fere
omnes quae involvunt vel reguntur moleculis magnis, quorum praecipua exempla sunt
servo et acida nucleica. Hae macromoleculae non quidem seiunctim agunt, sed saepe
inter se occurrunt ut aggregata vel complexiones macromoleculares ordinata, interdum
tam forma et functione distinctiva, ut organelle nomen mereantur. In tam biologicis
conventibus proprietates singulorum macromoleculorum saepe in cellula exprimuntur.
Est in aliquibus ex illis conventibus, in quibus per XXV annos laboravi, et quae hodie in
praelectionibus meis agitur.
78 Chemishy 1982
06
Fig . Non est hoc schema conventionale: terminus trahitur ubi species maior detectabilis fit
nec implicat species minores acriter evanescere. Quod "cincinno washer" indicavit in
terminus inter 20S orbis et
Helix non bene definitum gerit metastable transitorium statum cum orbis sunt
conversus ad helices per abrupta demissione pH.
Machine Translated by Google
A. Klug 79
a Bernal anno 1936. Rosalind Franklin fuit qui me exemplum posuit problematum
magnarum et difficilium armamentorum. Nisi tragice vita defecisset, antea hoc loco stare
posset.
Virus musivum tabaci (TMV) simplex est virus tantum constans ex uno genere moleculi
dapibus et RNA, tabellarius notitiae geneticae. Figura simplex virgae ex consilio suo
consequitur, nimirum regularis helicarum harum dapibus moleculis, vel subunitis, in
quibus unum moleculum RNA immergitur. Haec imago generalis iam ab anno 1958
completa erat cum Rosalind Franklin mortuus est (fig. 1). Patet interdum dapibus ultimo
architecturam viri determinare, ordinationem subunitatum per vices Helix magis planae
cum vicinis vicibus in contactu. RNA inter has vices intercalata est cum 3 nucleotide
residua per interdum subunita et sita est ad radialem distantiam 40Å ab axe centrali
ideoque ab exteriori mundo a dapibus tunicae semotus est. Geometria interdum
dispositionis RNA narum in modum configura- tionis unicae extensae cogit. Accurrens
axis virii centralis particula cylindrica foraminis diametri 40 est, quod tunc leve consecutio
dapibus sarcinarum putabatur, sed postea evasit ad instar prominenter in historia
conventus.
In primo aspectu, incrementum helicae structurae sicut TMV talis, nullum problema
comprehensionis exhibet. Unaquaeque interdum subunitas parium contactuum cum
proximis efficit ut compages inter eos iterum atque iterum repetatur.
Subunitates certas in geometria aedificatas habere possunt ut se veluti gradus in spirali
gradibus singulari modo convenire possint. Subunitas simpliciter unum vel paucos ad
tempus adderet super gradum in fine helix crescentis, RNA capiens quae ibi promineret
et novum gradum generaret, et sic porro. Retrospectum sic non nimis admirandum fuit
cum experimenta classica Fraenkel-Conrat et Williams anno 1955 (6) demonstravit TMV
ex interdum solitariis et acidi nuclei componi posse. Virum infectiosum simplicis remixing
particulas formatas esse demonstraverunt quae structuram ab originali viro discerni non
posse demonstraverunt. Ita omnes informationes necessariae ad congregandum
particulam in suis componentibus contineri debent, id est, virus "seipsum congregat".
Postea experimenta ('7) manifestaverunt coagulum satis specificum pro RNA virali, quae
facillime cum RNA homologa ad tunicam interdum occurrens.
Haec omnia satis placebant, sed quaedam adhuc erant quae dubitandi causam
reddebant. Primum, alia experimenta (8) demonstraverunt RNAs alienas in virgas virus
incorporari posse, et hae dubitationem reiciebant ex opinione quod proprietas vivorum in
ipsa ecclesia effecta erat. Alia notatio de coeundi, quod suadet adhuc elementa desunt
in historia, rate sua tarda erat. Tempora 8 ad 24 horas requirebantur ut maximae fruges
particulorum conglobatorum dare debebant. Hoc lentius nobis visum est pro congregatione
virus in vivo, cum acidum nucleicum solum plene munitur
Machine Translated by Google
80 Chemiae 1982
Hae difficultates in analysi X-radii viri praevisae sunt, et a primis annis 1960
animadverti veniebam circa hanc difficultatem tentare solutionem dapibus
subunitis viri solitariam crystallificare, structuram suam solvere per diffractionem
X-radii. ac deinde hoc referre conantur ut structuram virus solutionis humilis
solvitur. Conamur ergo nos interdum monomer crystallize. Ut frustraretur inclinatio
naturalis interdum in helice aggregata, Leberman varias modificationes chemicas
in spem induxit ad locorum normalium contactum claudendi, sed nullae ex his
servo- rum cristallo mutatis. Secundus modus erat ut aggregarent parva
aggregata ex dapibus subunitis immodificatis. Aliquandiu notum erat, praesertim
ex opere Schramm et Zillig (11), interdum in RNA, sine RNA, in plures formas
distinctas, praeterquam helix, aggregare posse. Conditiones elegi, quibus
dapibus apparebat maxime aggregatus in forma cum sedimentatione constanti
circiter 4S, quae a Casparo tanquam trimer notata (12). Crystalla fere statim
consecuti sumus, sed invenimus (13) eas continere non parvum aggregatum
speratum, sed magnum, aggregato respondente sedimentatione constanti 20S.
Analysis X-radius demonstravit hoc ex duobus laminis appositis, seu circulis XVII
subunitis singulis constructum esse, et hanc formam discorum duorum iacorum
nominavimus (Fig. 3 et 4). Nostra perturbatio initialis in tanta structura,
molecularium pondere 600,000, temperabatur eo quod geometria disci ad
particulam virus evidenter relata est. Annuli cylindrici 17 subunits continebant
inter se comparati cum unitatibus per vicem viri helix, ita ut ligatio lateralis intra
discos propterea in viro propinquam esse verisimile esset. Nos quoque
Machine Translated by Google
A. Klug 81
Fig. 3. Discus a gradibus resolutionis desuper spectatus. A centro exteriori sequitur imago microscopii electronici
circulariter eliquata circiter 25Å solutionis (72); (ii) frustum per 5Å electronici tabulae densitatis orbis ab analysi X-ray
consecuti, ostendens helices virgas (26) et (iii) partem exemplaris atomici ex 2.8 tabula (Bloomer et al. 15).
Machine Translated by Google
82 Chemiae 1982
Fig. 4. Sectio per orbem per axem suum ab analysi X-radii proventuum ad solutionem 2.8 (15). Vittae viam
monstrant catenae polypeptidis subunitum subunitatum.
Subunitates duorum annulorum super parvam aream attingere videri possunt ad extra orbis, sed aperientes
usque in "molares" versus centrum. Lineae elisae sub radio humili indicant schematical tionem mobilem dapibus
in disco, ex prope RYA ad locum ligaminis protensum.
ore media foraminis
Interdum
polymorphismus Hi eventus in structura disci qui monstravit satis arcte
coniunctum esse ad virus Helix, miratus sum an discus aggregatus non posset
munus aliquod biologicum vitale implere. Facile erat dimittendum ut forte
adventitio aggregatum dapibus viscum vel forma repono. Polymorphismus
dapibus TMV primo in nonnullis speciebus a Casparo 1963 consideratus est
(12), qui praevidit aliquos status aggregationis perspicientiam modo functionum
interdum dare. Studia quantitatis aggregationis a Lauffer in anno 1950
inceperunt (16) in angustiis condicionum amplis contractis, praecipuum studium
ad intelligendas vires aggregationem impellentium (haec sunt late entropica).
Propter naturas dispersas observationum priorum, Dunelmensem, Finch et
percontationem systematicam incepit aggregationis statuum ex quibus lata
forma claruit (17, 18).
Eventus ut phase (Fig. 2) compendiari possunt.
Machine Translated by Google
A. Klug 83
Partes disci
Discus aggregati intermedii propterea numerum proprietatum significantium
habet. Non solum coniunctim ad virus helix, sed etiam forma dominans interdum
sub condicionibus "physiologicis" est; praeterea formae discus etiam in aliis
virus helicis observatae sunt. Hi persuaserunt mihi formam discorum adventitiae
non fuisse, sed munus significantem in coetu viri agere posse. Quid hoc munus
esse potest?
Coetus cuiusvis amplae aggregati identitatis unitatibus sicut crystallus
considerari potest ex parte corporis in duobus gradibus: primum nucleatio et
postea incrementum sequentis, vel, in lingua magis biochemica, sicut initiatio
et elongatio subsequentis. Processus nucleationis vel ruditer initii — saepe
difficilior est quam incrementum. Sic simplex modus initiationis quo liberum RNA
cum singulis dapibus subunitis interactibus problemata in initii poseit. Saltem
17 subunitates separatae ad moleculum RNA flexibile ligare debebunt antequam
compages linearis aggregata circum se claudere posset ut primum virus helix
formaret. Haec difficultas evitari posset, si discus praeformatus quasi figura
esset in quo paucae primae viralis helix vices convenire possent ad sufficientem
magnitudinem stabilis. Hoc
modus nucleationis helix conventus potest etiam mechanismum agnitionis
praebere per dapibus RNA homologorum eius. Superficies discus constituit
copiam 51 (= 17 × 3) nucleotide ligaturae sitae quae inter se occurrunt cum
speciali detegere basium, inde in ampliato discrimine, quod cum paucis
nucleotidis fieri non potest. Ita visum est ut discus tam physicas quam biologicas
necessitates solvere posset ad incrementum virus promovendum et
specificitatem in commercio conferendam. Haec hypothesis illustratur in Fig.
Versa sunt omnia quae in hoc schemate falluntur, sed tamen animus recte est.
Ut AN Whitehead semel observavit, magis interest ut idea fructuosa sit quam
vera sit.
Haec proposita machina nucleationis requiritur ut discus possit
Machine Translated by Google
84 Chemiae 1982
Fig. 5. Munus orbis sicut primitus concepti: specifica cognitio sequentis specialis (terminalis)
in TMV-RNA conversionem disci formae dapibus in duas vices helicis inchoat;
(Vide Fig. 7, pro mechanismo tandem stabilito).
A. Klug 85
Fig, 6. Postulata structura secundaria ofthr RNA in regione nucleationis (24). Hoc debiliter connexum est caulem duplicem
helicum et aspectum in summitate verisimiliter actualem originem conventus. Sequentia in et prope summam continet
repetita ratio trium basum habentium G in medio situ et A, seu U in exterioribus positionibus.
86 Chemiae 1982
Fig. 7. Nucleatio virii conventus fit per insertionem capillorum RNA (Fig. 6) in medium
foveam disci dapibus et inter duas subunitatum ordines. Fascias in summitate dereptionis
alligat ad partem primi vicem pertinens, caulem basi-jugis aperiens et facit ut in brevem
Helixem detrudat. Hoc nimirum « fauces claudit », captans
RNA inter vices subunitatum intermediarum et initium dat nucleoprotein helix (quod tunc celeriter elongare
potest ad magnitudinem aliquam minimam stabilem).
Etsi disci structura anno 1977 singillatim soluta est, antecedens in analysi X-
ray dedit sensum quomodo posset cum RNA inter se cohaerere. In solutione
5Å (26) curriculum catenae polypeptidis investigari potuit et ratio fundamentalis
disci constitutae (cf. Fig. 4). Disci annuli superioris subunitae in plano
perpendiculo ad axem disci iacent, inferiores vero anuli deorsum versus
centrum iugo, ita ut duo anuli tantum versus extra discum attingant. In vicinia
foraminis centralis hucusque absunt, sicut patens fauces quae in faucibus RNA
per foramen medium ingredi potuit quasi "mordere" tractum. Ingressus autem
per centrum facilior est quia interior regio interdum, a circum RNA ligamen
interiorem, inordinata inventa est et in structuram regularem non referta.
A. Klug 87
Nucleatio et
incrementum. Hypothesis nucleationis (27) tunc est quod speciale RNA derepta
per medium foraminis disci in fauces insereret a duobus strati subunitis dapibus
(Fig. 7). Dimensiones satis aptae sunt ad hoc evenire et ansam apertam tunc
ligare ad RNA sites ligaturae in interdum.
Plures de instabili duplici caule helico colliquefacti et aperiendi , sicut plus RNA
intra fauces discus nucleandi ligatus est. Nonnulli, adhuc incogniti, notam huius
commercii discus in brevem helicam segmentum dislocare causaret, RNA
capiens et, post celeri additione paucorum plurium discorum (23), primam
particulam nucleoprotein stabilis praeberet.
Posteriores eventus post nucleationem incrementum vocari possunt et, ut
supra dictum est, controversia est de certo modo quo hoc procedit.
Propositum nostrum est elongationem in maiori incrementi directione
verisimillimum esse per accessionem discum ulteriorum, quod quidem
experimenta prima restitutionis nos ad concludendum compulerunt. Configuratio
specialis generata per ansam in medium disci insertionem perpetuari debet ut
virga crescat, RNA per foramen medium sursum trahendo. Ita, elongatio fieri
potuit per similem mechanismum nucleationi substantialiter, nunc tantum, potius
quam postulans speciem nucleationis ansae RNA, occurrit per "panni iter itineris"
quae inseri potest in centrum discus proximi advenientis . . Haec mechanismus
igitur praecipuam difficultatem superat ad cogitandum quomodo totus discus
subunitatum intermediarum cum RNA in Helix crescenti se cohaerere possit.
Exstant nunc plura documenta incrementi per incorporationem caudices
subunitatum rudium discorum magnitudine (22), sed subiectum adhuc
controversiae est et propterea ulterius cum eo non procedo.
Contra, nunc patet experimentalis nostrae hypothesis confirmatio pro
mechanismo nucleationis. Hoc praedicit (1) duas caudas RNA remanere in uno
fine virgae nucleoprotein crescentis formatae, et (2) unam harum caudarum
directe ab uno fine proiicere, altera vero duplicari ab omni via. activum increscens
punctum ad extremam virgae medium foramen crescentis baculi descendit.
Haec utraque nunc confirmata sunt. Circulus Hirth in Argentorati obtinuit
micrographas electronicorum virgarum crescentium in quibus RNA per denatur
ationem partialem diffusa est, et multae particulae duas caudas ab eodem fine
prominentes demonstrant (28). In Cantabrigia collegae mei microscopio
electronico magno resolutioni usi sunt, in qua duo virgarum extremitates a suis
formis cognosci possunt, ut ostendant caudam quidem longiorem esse quae
rursus per virgam crescentem duplicatur (29).
Alia experimenta ostendunt RNA configurationem effectum substantialem in
ratam habere conventus (29).
Machine Translated by Google
88 Chemiae 1982
Morum plures sunt e historia TMV collectae desumptae (1). Primum est quod
distinguendum est inter consilium structurae et processus constructionis usus ad eam
consequendam. Hoc est, dum TMV quasi crystallum helicum spectat et eius consilium se
praebet ad processum simplicium subunitatum accessionis, eius constructio viam implicatam
valde moderatam sequitur. Illustrat punctum quod munus inextricabiliter cum structura
connexum est et quantum uno interdum fieri potest. Intricatissima mechanismus structuralis
evoluta est ad efficiendum et propositum, cuius fundamentum nunc intellegimus. Moralis
generalis omnium haec est, quod non solum natura nostras obvios praeceptiones iterum
confundit, sed satis reliquit nobis clues ut tandem id quod eveniunt perplexe possit. Ut
Einstein olim posuit, “Raffmiert ist der Herr Gott, aber bösartig ist er nicht: Subtiliter Dominus,
sed malignus non est”.
A. Klug 89
90 Chemiae 1982
per X-radii studia in materia humida, integra materia, quae nunc generaliter recepta
sunt exempla ordinationis structurarum permulta systematum biologicorum,
qualia sunt in tabula recensita. In hac lectione paucas exempla describam quae
ad demonstrandam vim variorum technicorum et indolem eventus quos possunt
demonstrare. Pleniores rationes methodorum ac theoriae alibi traduntur (II, 3),
sed hic illustrare volumus has methodos ortos esse e practicis curis et in
progressu problematum concretarum crescentium; nervorum vero late patet.
A. Klug 91
Essentia imaginis huius generis est processus, quod est processus duplex
post primam imaginem consecutus est. Primum Fourieriani transformationis rudis
Machine Translated by Google
92 Chemiae 1982
A. Klug 93
Fig
prominentia (36).
Chemiae 1982
Fig. 10. (a) Micrographae electronicae eiusdem campi de particulis verruci humani virii (HWV) ante (i) et post (ii) speciminis
eiectis per angulum prope inclinatis.
to (73). x 100,000.
b) Tria dimensiva imago virus verruci humani restitutum (38, 39). Prope est ostensum
subest cancelli superficiei icosaedralis (30) verticibus 5-plicaribus et 6-plicabilibus notatis.
distributio cum proiectionibus notis in varias partes (37), sed re vera nulla alia methodus certa
superior esse monstrata est et in CAT Scanner adhibita est. Modus autem Fourieriani
commodum habet quod quia in gradibus exercetur, id est formatio duarum dimensivarum
mutationum, et tunc recombinatio in tribus dimensionibus, fieri potest, ut supra dictum est,
perpendere, eligere, et corrigere notitias ire. ad ultimam refectionem.
Multae applicationes factae sunt. Prima applicatio erat quidem ad caudam T4 phage, in qua
quaestio orta erat. Particulae symmetriae helicae rectissimae sunt ad reficiendum, quia
reconstru- tio potest fieri ex unico totius particulae intuitu, ad determinatam resolutionem, quae
helix symmetria posuit. In physicis verbis, hoc est quod una imago particulae helicae multas
diversas opiniones repetendi praebet
Machine Translated by Google
95
A. Klug
subunita, et haec simplicitas erat quae nos caudam phage uti primum specimen pro
3-D imaginis reconstructione duxi. Fere plures quam una sententia necessaria est,
sed quaelibet symmetria praesens numerum requisitum reducet. Typi tico ad virus
icosaedral minutum, tres vel quattuor sententiae sufficiunt, sed plura specimina
investiganda sunt antequam numerus conveniens inveniatur et fere peractus sit (38).
Exemplum ex Crowther et Amos (39), in fig.
Phase discrepantia
microscopia microscopia electronica, cum aliqua methodo analyseos imaginis
coniuncta, speciminibus maculatis negative applicata, specimen probavit ad
determinandum dispositionem et figuram parvarum subunitarum in vestimentis
naturalibus vel artificialibus, inter duo crystalla dimensiva et coetus macromoleculares
sicut virus. et microtubules (2). Informatio structilis obtinebilis probavit valde locuples
quoad singula usque ad 20Å15 circiter gradu. Patuit tamen, granularitatem maculaeor *
negativae et fidelitatem cum qua superficiem speciminis consequitur, gradum
revelatum limitatum esse (40). T o multo altioris solutionis informationes obtinere,
melius quam circa 10 , quis cum labe et dapibus ipsum dapibus considerare debet. In
summo proposito secunda quaestio est: damnum irradiatio. Hoc minui potest per
excisionem trabem illuminantis, sed statistica vox augetur, et imago rudis minus et
minus certa fit. Sed haec difficultas satis superari potest per imaginando ordinatas
molecularum vestes, ut informationes e diversis culculis moleculae aestimari possint,
ut supra dictum est, ad imaginem peraeque signantem reddendam. Prima quaestio
de reponendo labem negativam, vitando tamen siccitatem drationis, duobus modis
solvi potest. Una, nunc intensive pervestigata est, speciminibus hydratis congelatis
utatur (41). Secunda methodus probata est Unwin et Henderson, qui, radicali accessu
ad determinandum structuram speciminum biologicorum immaculatam per microscopia
electronica (42, 43) solutione glucosi siccatae ad conservandam materiam usus est.
96 Chemiae 1982
DE STRUCTURA CHROMATIN
Opus de virus eventus dedit non solum interest intrinsecae, sed, ut supra demonstravimus,
difficultates occupandi magnas aggregationes hypotheticas ad progressionem
methodorum et technicarum, quae aliis systematibus applicari possent. Recens
accessionis exemplum, et quod non sine priore usu venisse puto, chromatinorum est.
Chroma-
Machine Translated by Google
A. Klug 97
Hoc loco non est singillatim exponere quomodo haec imago fundamentalis
ordinationem chromatin emersit (4), sed idea nucleosomi orta est ex conversione
plurium diversarum operis. Primae notae ad structuram regularem accesserunt ex
diffractione studiorum X-radii in chromatin, quibus monstraverunt debere esse aliquam
iterationem unitatis, licet non bene ordinatam, in libra circiter 100 Å (46, 47). Primum
documenta biochemica regularitatis ex opere Hewish et Burgoyne (48) orta sunt, qui
ostenderunt DNA nucleases in rat iecore secare posse DNA in multiplices magnitudinis
unitatis, quod postea Noll, diverso enzyme, micrococcali utens, monstravit. nuclasc,
ad 200 circiter basin paria (49). Quod nuclcascus DNA chromatis stagni secat locis
regulariter distantibus, actioni suae gratis DNA satis dissimilis, tribuitur eo quod DNA
ita complicatum est, ut solum breves liberae DNA spatia inter haec complicata faciat.
unitates in enzyme. Tertium testimonium, quod ad notionem nucleosomi perduxit,
observatio fuit Kornberg et Thomas (50) duas histonas valde conservatas, H3 et H4,
in solutione exstitisse ut certae oligomrr, tetramerus (H3)2( H4 ) 4, qui magis factitavit
sicut dapibus globosis multi- gregariis subunitis. Ratione habita harum variarum
testimoniorum, Kornbrrg anno 1974 (51) definitum exemplar proposuit chromatin basic
unitas quasi capita circiter 100 diametri;
Machine Translated by Google
98 Chemiae 1982
continens tractus DNA 200 basium jugorum longorum condensatorum circa nucleum
interdum e moleculis histonum 8 factis, nempe (H3) 2(H4) 2 tetramer et II "
singulae H2A et H2B. Quintus histonus, H1, extrinsecus cuiusque nucleosomi
quodammodo fuit coniunctus. Prorsus inopinatum exemplar erat quod DNA
"histonum" "linivit" potius quam e contrario.
Autem, anno 1972, cum Kornberg Cantabrigiam venit, haec omnia in futuro
iacuerunt. Disfractionem X-ray incepimus sequi restitutionem histonum et DNA,
quia exemplar X-radii a nucleis datum, vel chromatin ab eis segregatum, prout erat
limitatum, solum tentare tunc praesto erat ut sarcinam ordinatam sequerentur. ad
DNA. Haec studia X-radii demonstraverunt fere 90% restitutionem fieri posse cum
DNA simpliciter mixta cum praeparatione totali histonis non fracto, sed omnes
conatus chro matin noviter permixti DNA cum statuto omnium quattuor purificatorum
unius speciei histonis defecerunt; quasi processus quo separabantur histones
denatur. Lenioribus igitur methodis extractionis histonicae quaesivimus, et nativam
structuram facile emendari posse comperimus, si quatuor histonae simul in duobus
binis, H3 et H4 simul, et H2A et H2B simul, sed non semel distincti fuissent. Hoc
opus erat quod Kornberg perduxit ad investigandas ulteriores proprietates
physicochemicae histonum et ad inventionem (50) tetramerorum histoni (H3)
2(H4)2, quae vicissim eum ad exemplar nucleosimi de quo supra. .
Constructio nucleosomi
Accedit ut digestio nucleasi et X-radii dispersa in specimina chromatinorum vel
nucleosomm non orientea in solutione aliquas notas nucleosomi revelare potuit,
sed plena descriptio structurae nonnisi ex analysi crystallographica provenire
potest, quae completa tria dat. -dimensional structural notitia. Aestate anni
MCMLXXV collegae mei sunt et idcirco aggressus sum nucleosomos praeparare in
formis crystallisationi congruentibus. Nucleus quidam e nucleis micrococcalis
nuclease purgatus mediocris circiter 200 paria nucleotide DNA continent, sed latior
est distributio circa medium, et haec praeparatio non satis est ad crystallizandum
homogenea. Attamen haec variabilitas quantitatis per ulteriorem digestionem cum
nucleaso micrococcali eliminari potest. Cum actio nucleasi micrococcalis in
chromatin inter nucleosomatos primum inhaereat, deinde ut exonuclease in
nucleosoma exciso agit, primum DNA usque ad circiter 166 basium paria brevians,
ubi in digestione brevis est mora (52), et dein circa 146 basin binae, ubi in
concoctionibus patet planities, antequam plus degradationis fiat. In hoc ultimo
gradu histonus Hl solutus est (52), relicto ut intermedio majore mestabili particulam
continens basim 146 paria DNA cum moleculis histonis statuto 8 implicatam.
A. Klug 99
Prima crystalla consecuta inventa sunt habere in iis renes histonicos partim proteolysos, at
eorum proprietates physicochemicae simillimae manserunt illis particulae integrae. Crystalla iam
adulta habemus ab nucleis integris nucleosomm, quae ad resolutionem circiter 5Å distrahunt et
in progressu accurata analysi sunt (56). Annis Daniela Rhodes, Ray Brown et Barbara Rushton
creverunt crystallis nucleorum particulis septem diversis organismis praeparatis: omnes
exemplaria essentialiter identica X-ray praebent universalitate nucleosomm testificata. Axis
symmetriae est dyas intra particulam, quod mirum non est, cum 8 histonae in binis occurrunt et
DNA cum axibus localibus dualitatem obstringitur. Princeps angulus diffusus X-radius e crystallis
dispersus ostendit DNA particulam cori esse in forma B-.
Electron density map unius e praecipuorum proiectionum crystalli in Fig. Haec tabula totam
densitatem dat in nucleosome, densitatem DNA ab illa dapibus non distincta. Conlationes
interdum et DNA distingui possunt utendo neutroni dispergendo cum methodo variationis
antithesis et tali studio incohatum est a John Finch et coetus in Instituto Laue Langevin, Grenoble,
cum satis magna crystalla suppeterent (57). .
100
Fig. II. Fourieriani proiectionis mappis nucleosomi particulae nuclei. (a) Tabula ex X-ray data (56); (b) et (c) ex
neutrorum notitia dispersa utens variatione antithesi (57): (b) DNA component cum
semita superhelix densitatis superimposita; (c) the dapibus core component.
A. Klug 101
(Nota quod ad claritatem, diameter fistulae plasticae minor quam scala vera pro DNA electa est.) Distantiae per DNA indicantur numeris -7
ad +7, axi dyad originis sumendo, ad notandum XIV. repetit duplicem helicem, quae in 146 basi nuclei nucleosmi continetur. Singulorum
histonum variis locis ad exemplar adsignatio est
de quo in textu.
A. Klug 103
Fig . _ _
vertit, dein 166 basin particula respondet circa 2 vices superhelicae plenae. Cum autem 166 basis coniugationis
particula sit terminus punctus pro retentione H1 (52), collocari debet ut ostensum est. (Bottom)
Schematica schematis de filamentis nucleosomi humilis viribus ionicis, originem obliquam ostendens
compages (fig. 14). In iure extractionis variatio obliqua structurae quae saepe observatur ostenditur: hoc formatur
nucleosomo per 180° circa axem filamentum.
binas vices DNA continet (53). Hoc duos fines DNA in nucleosomo inter se
coniungit ut utrumque cum eodem moleculo H 1 coniungi possit (Fig. 13).
Particula constans ex histono octameris et 166 binis basinensibus
chromatosome (65) appellata est et a nobis et aliis indita est ad constituendum
chromatin elementum fundamentale structurae. In hac particula, H 1 igitur
esset ex parte nucleosomi in regione introitus et exitus DNA superhelix.
Sequitur hic locus in logica: sed fuitne histone H 1 vere ibi? Tametsi H 1
nimis parvum est moleculum ut microscopio electronico directe conspiciatur,
eius positio in nucleosomate colligi potest ex effectu ex specie chromatin, in
media latitudine inter C nucleosmum filamentum et 300 Å solenoidale. fibra.
Hae periodi intermediae in processu systematicae studii a Thoma et Koller
detectae sunt (66), valvae chromatinae cum ionicis viribus auctae. salibus
monovalentibus magis quam divalentibus adhibendo, varias structuras
demonstrabant compactionis gradus auctos sicut vires ionicae levatae erant.
Ita, ex filamento nucleosomm circa 1 mM, amplitudo structurae augetur per
familiam structurarum intermediarum helicarum, donec, per 60 mM, compages
compacta 300 fibrarum formata est, in omnibus identicis cum Finch et ipse
primitus observatus. .
A. Klug
Fig, 15. "Explicatae" sententiae nucleosae, partes histonorum constituentium ostendentes. Resarcio in nucleo
histonis locos singularum moleculis histonum indicant, sed limites
inter eos noti sunt et sic signata sunt. (a) (H3) 2( H 4 ) 2 tetramerus formam claui fullonis habet et ut FUSUS
70-80 bp of DNA agere potest, circa unum vice superhelicum efformans. (b) H2A.H2B dimer socii una facie
tetrameri. (c) H2A.H2B dimersae facies oppositas singulas ligant 30-40 bp DNA, vel dimidia vice superhelicam,
ut particulam integram reddat. histon HI correspondent cum unica DNA in the . conformatione
propinqui aut tactus. Nos igitur suggesimus, crescentibus ionicis viribus magis
regionum Hl inter se mutuo se cohaerentium, tandem in polymerum helicum per
centrum solinoidi aggregatum, et sic eius geometricae formae rationem.
Polymerus H1 quidem demonstratum est experimentis chemicis transversis in
vi tam humilis quam alte ionica (61), sed restat demonstrandum ea in centro
libri locata esse.
Praecipuum autem punctum est, quod videtur esse aggregatio H1, quae
comitatur, et quidem moderari potest, formationem 300 fibrarum.
Partes histonarum
Ex dispositionibus moleculis pro histono octamerorum et ex loco deductis pro
histono H1 propositis, videre potest (59) partes singulorum histonarum in
plicandis DNA in nucleosmo (fig. 15) . The (H3) 2(H4) 2 tetramerus figuram fere
unius helicoidis vertentis habet et haec media vice DNA superhelix definit. H2A,
H2B addunt heterodimeros duos, H2A.H2B, H3-H4 tetrameros unum in utraque
facie, ligans quodlibet DNA dimidia vice extrahens, perficiens utrumque
superhelix. Denique H1 tunc ligat ad singularem regionem ad latus duarum
vicissim particulae, ubi tria DNA segmenta conveniunt, stabiliens et "obsignatio"
nucleosomatum, ac etiam medians plicatilem ad gradum organationis proximum.
Talis rerum in tempore ordo praeberet sistens rationem structuralem ordini
temporali coetuum historiarum in DNA nuper replicata (68, 69, 70).
In primis volui ad opus chromatin delineatum quod inservire potest pro hodierno
paradigma studiorum structurarum quae cellulosa et hypothetica conantur
coniungere. Unius systematis complexi studet ly, chemica vel enzymatice
physice eam dissecare, et deinde per X-radii analysin et chemicam studia
partium accuratam imaginem obtinere, ac altiore picturae integrae congregationis
ab electronico. microscopii. Sensus tamen est, quo virus et chromatin, quos in
hac lectione descripsimus, adhuc systemata simplicia relative dicuntur. Multo
magis implicatae disciplinae, ribosomes, apparatus mitotici, coram nobis
mentiuntur et posteritati agnoscent eorum studium grave esse negotium, in
nonnullis tantum inchoatum. Libenter manum habuisse in initiis fundationis
biologiae structuralis hypotheticae.
agnitiones
A. Klug 107
et adiutores. Post Rosalind Franklin mortem, virus opus continuare et extendere potui
cum John Finch et Kenneth Holmes, qui tunc discipuli erant, et qui collegae facti sunt.
Per annos mihi cum Donaldo Casparo societatem transatlanam habui et eius consiliis,
criticis et perceptis profuit. Hic tantum commemorare possum nonnulla nomina aliorum
adiutorum meorum in singulis calamis in quibus versatus sum: in.
REFERENCES
Recognitiones
alii
(6) Fraenkel-Conrat, H. and Williams, RC Proc. Natl. Acad. Sci. USA 41, 690-698 (1955).
(7) Fraenkel-Conrat, H. et Cantor, B. Biochim. Biophys. Acta. 33,359-370 (1959).
(8) Matthews, REF (1966) Virology 30,82-96 (1966).
(9) Strbbs, G., Warren, S., and Holmes, K. Nature (London) 267, 216-221 (1977).
(10) Holmes, KCJ Supramolec. Structura 12, 305-320 (1979).
(11) Schramm, G., and Zillig, WZ Naturforsch. Ser. b. 10, 493-498 (1955).
(12) Caspar, DLD Adv. Dapibus Chem. 18, 37- 121 (1963).
(13) Finch, JT, Leberman, R., Chang, Y.-S., and Klug, A. Nature (London), 212, 349-350.
(1966).
(14) Bricogne, G. Acta Crystallogr. Sect. A32,832-847 (1976).
(15) Bloomer, AC, Champness, JN, Bricogne, G., Staden, R., Klug, A. Nature (London)
276, 362-368 (1978).
(16) Lauffer, MA, et Stevens, CL Adv. Virus Res. 13, l-6 (1968).
(17) Durham, ACH, Finch, JT, Klug. A. Nature (London) New Biol. 299, 37-42 (1971).
Machine Translated by Google
(18) Durham, ACH and Klug, A. Nature (London), New Biol. 299, 42-46 (1971).
(19) Klug, A., Durham, ACH Frigidus Spring Harbour Symp. Quant. Biol. XXXVI, 449-460
(1971).
(20) Butler, PJG, et Klug, A. Nature (London), New Biol. 229, 47-50 (1971).
(21) Fukuda, M., Ohno, T., Okada, Y., Otsuki, Y., et Takebe, I. Proc. Natl. Acad, Sci. USA
75, 1727-1730 (1978).
(22) Butler, PJG, Lomonossoff, GP Biophys. J. 32, 295-312 (1980).
(23) Zimmern, D., et Butler, PJG Cell II, 455-462 (1977).
(24) Zimmern, D. Cell II, 463-482.
(25) Zimmern, D., Wilson, TMA FEBS, Litt. 71, 294-298 (1976).
(26) Champness, JN, Bloomer, AC, Bricogne, G., Butler, PJG, et Klug, A. Nature
(London) 259, 20-24 (1976).
(27) Butler, PJG, Bloomer, AC, Bricogne, G., Champness, JN, Graham, J., Guiley, H.
Klug, A. et Zimmern, D. In "structuris functionibus relationum dapibus" (R. Markham et RW Home, eds.),
3rd John Innes Symp. pp. 101-l 10. North-Holland/Elsevier, Amsterdam. (1976).
(28) Lebeurier, G. (1976), Nicolaieff, A., and Richards, KE Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74,
149-153 (1977).
(29) Butler, PJG, Finch, JT, Zimmern, D. Natura (London) 265, 217-219 (1977).
(30) Caspar, DLD, et Klug, A. Frigidi Spring Harbour Symp. Quant. Biol. 27, l-24 (1962).
(31) Brenner, S., Home RW Biochim. Biphys. Acta. 34, 103- 110 (1959).
(32) Klug, A., et Finch, JTJ .Mol. Biol. 11, 403-423 (1965).
(33) Klug, A., and Berger, JEJ Mol. Biol. 10, 565-569 (1964).
(34) Klug, A. and DeRosier, DJ Nature (London). 212, 29-32 (1966).
(35) DeRosier, DJ et Klug, AJ Mol. Biol. 65, 469-488 (1972).
(36) DeRosier, DJ, Klug, A. Nature (London), 217, 130- 134 (1968).
(37) Crowther, RA, DeRosier, DJ et Klug, 4. Proc. Roy. Soc. Lond. A. 317, 319-340
(1970).
(38) Crowther, RA, Amos, LA, Finch, JT, DeRosier, DJ, et Klug, A. Nature (London)
226, 421-425 (1970).
(39) Crowther, RA, Amos, LA Fons Frigidus Harbour Symp. Quant. Biol. XXXVI, 489-494
(1971).
(40) Unwin, PNTJ Mol. Biol. 87, 657-670 (1974).
(41) Taylor, KA et Glaeser, RMJ Res Ultrastructure. 55, 448-456 (1976).
(42) Unwin, PNT, and Henderson, RJ Mol. Biol. 94, 425-440 (1975).
(43) Henderson, R., and Unwin, PNT Naturae 257, 28-32 (1975).
(44) Unwin, PNT Proc. Roy. Soc. Land. A. 329, 327-359 (1972).
(45) Erickson, HP, and Klug, A. Ber. Bunsenges, Phys. Chem. 74, 1129-1137 (1970); Phil.
Trans. Roy. Soc. ser B. 261, 105-118 (1971).
(46) Wilkins, MHF, Zubay, G., Wilson, HRJ Mol. Biol. I, 179-185 (1959).
(47) Luzzati, V., et Nicolaieff, AJ Mol. Biol. I, 127-133 (1959).
(48) Hewish, DR, Burgoyne, I. A. Biochem. Biophys. Res. Communi. 52, 504-510 (1973).
(49) Noll, M. Nature (London) 251, 249-251 (1974) ;
(50) Kornberg, RD, Thomas, JO Scientiarum 184, 865-868 (1974).
(51) Kornberg, RD Science 184, 868-871 (1974).
(52) Noll, M., Kornberg, RDJ Mol. Biol. 109, 393-404 (1977).
(53) Finch, JT, Lutter, LC, Rh o es, D. Brown,
d* RS, Rushton, B. Levitt, M., Klug, A.
Naturae (London) 269, 29-36 (1977).
(54) Finch, JT, Klug, A. Frigidi Spring Harbour Symp. Quant. Biol. 42, I- 15 (1978).
(55) Lutter, LCJ Mol. Biol. 124, 391-420 (1978).
(56) Finch, JT, Brown, RS, Rhodes, D., Richmond, T., Rushton, B., Lutter, I,. C., and Klug, AJ Mol. Biol. 14.5,
757-769 (1981).
(57) Finch, JT, Lewit-Bentley, A., Bentley, GA, Roth, M., et Timmins, PA Phil. Trans.
Roy. Soc. Lond. B. 2901,635-638 (1980).
(58) THOMAS, JO, Kornberg, RD Proc. Natl. Acad. Sci. USA 72, 2626-2630 (1975).
Machine Translated by Google
A. Klug 109
(59) Klug, A., Rhodes, D., Smith, J., Finch, JT, Thomas, J. 0. Nature (London) 287,509-
516 (1980).
(60) Mirzabekov, AD, Shick, VV, Belyavsky, AV, Bavykin, SG Proc. Natl. Acad. Sci.
USA 75, 4184-4188 (1978).
(61) Camerini-Otero, RD, Felsenfeld, G. Acids Nucleic Res. 4, 1159-1181 (1977a).
(62) Thomas, JO, Kornberg, RD FEBS, Litt. 58, 353-358 (1975).
(63) Finch, JT, Klug, A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 73, 1897- 1901 (1976).
(64) Sperling, L., et Klug, AJ Mol. Biol. 112, 253-263 (1977).
(65) Simpson, RT Biochemistry 27, 5524-5531 (1978).
(66) Thomas, F., Keller, Th., et Klug, AJ Cell Biol. 83, 403-427 (1979).
(67) Thomas, JO, Khabaza, AJA Eur. J. Biochem. 112, 501-511 (1980).
(68) Worcel, A., Han, S., Wong, ML Cell 15, 969-977 (1978).
(69) Senshu, T., Fukuda, M., Ohashi, MJ Biochem. (Japan) 84,985-988 (1978).
(70) Cremisi, C., Yaniv, M. Biochem. Biophys. Res. Communi. 92, 1 1117-1123 (1980).
(71) Klug, A., Caspar, DLD Adv. Virus Res. 7, 225-325 (1960).
(72) Crowther, RC, Amos, LAJ Mol. Biol. 60, 123-130 (1971).
(73) Klug, A., et Finch, JTJ Mol. Biol. 31, 1-12 (1968).