19.

L'estabilitat d'una hèlix  està determinada no només per la formació d'enllaços d'H interpeptídics
sinó també per la naturalesa de les cadenes laterals dels seus residus d'aminoàcids.
a. Predir quins dels següents poliaminoàcids formaran hèlixs , quins formaran altres estructures
ordenades, i quins formaran estructures enrotllades a l'atzar, en dissolució i a temperatura ambient:
1- Poli-Leu, pH = 7.0 2- Poli-Ile, pH = 7.0 3- Poli-Arg, pH = 7.0 4-Poli-Arg, pH = 13.0
5- Poli-Glu, pH = 1.5 6- Poli-Thr, pH = 7.0 7- Poli-hidroxyPro, pH = 7.0

1) La leucina no presenta grups ionitzables a la cadena lateral, de manera que a pH=7 no

presentarà càrregues. A més a més, a nivell bibliogràfic, se sap que la leucina afavoreix la
formació d’hèlixs alfa ja que no presenta ramificacions en el carboni beta. És probable que
formi una hèlix alfa.

2) No formarà una hèlix alfa. Malgrat no presentar grups ionitzables, els impediments estèrics
produïts per la presència de ramificacions en el carboni beta no permeten la formació d’una
hèlix alfa. No s’espera que es formi una estructura ordenada en general.

3) A pH=7 l’arginina es troba carregada positivament, i la repulsió electroestàtica entre els residus
impossibilita la formació no només d’una hèlix alfa, sinó de qualsevol estructura ordenada.

4) A pH=13 la cadena lateral de l’arginina està desprotonada, i per tant no presenta càrrega. Com
que a més a més no presenta ramificacions al carboni beta, és esperable que formi una hèlix
alfa. Malgrat tenir grups que podrien formar ponts d’hidrogen a la cadena lateral que
competissin amb els ponts que estabilitzen les hèlixs, la cadena és prou llarga com perquè
aquests estiguin suficientment apartats de l’eix principal com per no interferir en l’estabilització.

5) A pH=1.5 el glutàmic es troba protonat i sense càrrega, i sumat amb l’absència de ramificacions
que generin impediments estèrics, se sap que el glutàmic té tendència a formar hèlixs alfa.

6) Tot i que la treonina no té grups funcionals ionitzables, la presència d’un grup -OH, que
competeix amb els ponts d’hidrogen que estabilitzen l’estructura, la fan poc propensa a formar
ponts d’hidrogen.

7) Tot i que la hidroxiprolina no presenta grups carregats a pH=7, se sap que aquest aminoàcid
és disruptor respecte la formació d’hèlixs alfa, ja que el fet que el grup alfa amino formi part de
l’heterocicle impedeix la formació de ponts d’hidrogen estabilitzadors amb el residu i+3. No
obstant, al ser un grup voluminós que genera impediments estèrics al seu entorn, provocant
doblecs de 30º en l’eix d’una hipotètica hèlix. És per això que aquest aminoàcid talla l’hèlix alfa
i provoca un colze.

b. Termodinàmicament, és més favorable que es formi una hèlix  en solució aquosa o a l'interior no
polar d'una proteïna?

Tal i com hem vist en exercicis anteriors, la presència de dissolvents polars amb capacitat de formar
ponts d’hidrogen interfereixen amb els enllaços que estabilitzen les hèlixs alfa. En l’interior no polar
d’una proteïna, en canvi, l’absència o presència reduïda de grups polars (i per tant, amb capacitat de
formar ponts d’hidrogen) fan més probable l’estabilització d’una hèlix alfa.
 20. El cabell creix uns 15-20 cm per any. Les -queratines se sintetitzen a les cèl·lules epidèrmiques,
on es construeix l’estructura súper helicoïdal. Fent l’aproximació que l’estructura és sempre una
hèlix  amb els seus paràmetres normals i que el factor limitant del creixement del cabell és la
biosíntesi de l’-queratina, calculeu la velocitat de síntesi expressada com nombre d’enllaços
peptídics sintetitzats per segon. (Problema resolt per Anna López).

21. A quina d'aquestes dues proteïnes correspon al gràfic de Ramachandran que es mostra?

(Problema Resolt per Yolanda Soriano)