Professional Documents
Culture Documents
MOLEKÜLER BİYOLOJİDE KULLANILAN TEMEL TEKNİK
MOLEKÜLER BİYOLOJİDE KULLANILAN TEMEL TEKNİK
(Ar.Gör.Nagihan AKBULUT)
Sodyum Dodesil Sülfat Poliakrilamit Gel Elektroforezi
SDS ile çözülmüş proteinlerden meydana gelen bir karışım poliakrilamit jelde yürütülünce ne
olur?
Her protein molekülü çok sayıda eksi yüklü deterjan molekülü bağlar. Bunlar deterjanın
gerçek yükünü örterek voltaj uygulandığında artı elektroda doğru ilerlemesine neden olur.
Aynı büyüklükteki proteinler jel içinde aynı hızla hareket ederler çünkü;
1) doğal yapıları SDS yüzünden bozulup açıldığından hepsi aynı şekildedir,
SDS poliakrilamit jel elektroforezi protein analizi açısından güçlü bir yöntemdir çünkü
prensip olarak suda çözülmeyenler dahil, bütün proteinlerin ayırımı için kullanılabilir. Zar
proteinleri, hücre iskeletinin protein bileşenleri ve daha büyük hücresel topakların
bileşenlerini oluşturan proteinlerin hepsi bu yöntemle ayrılabilir. Yöntem polipeptitleri
büyüklüklerine göre ayırdığından molekül ağırlıkları ve protein kompleksindeki altbirimlerin
bileşimi hakkında bilgi verir.
Düşük derişimde hazırlanan jellerin gözenekleri daha büyük olup, daha büyük moleküler
ağırlıklı biyomoleküllerin ayrılmasında kullanılır. Örneğin;
% 5’lik jel için 60-212 kDa (kiloDalton)
% 10’luk jel için 18-78 kDa
Kaynaklar:
Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J., Raff , M., Roberts, K., Walter, P., Molecular
Biology of the Cell, Fourth Edition, Garland Science, 2002.
Cooper, G.M., Hausman, R.E., The cell: A Molecular Approach, Third Edition, ASM
Press, 2004.
Yıldırım, A., Bardakçı, F., Karataş, M., Tanyolaç, B., Moleküler Biyoloji, 1. baskı,
Nobel basımevi, 2007.
http://en.wikipedia.org/wiki/SDS-PAGE