Download as pdf or txt
Download as pdf or txt
You are on page 1of 44

Biotransformation of Agricultural waste

and by-products : the food, feed, fibre,


Fuel (4F) economy 1st Edition D'Urso
Visit to download the full and correct content document:
https://ebookmass.com/product/biotransformation-of-agricultural-waste-and-by-produ
cts-the-food-feed-fibre-fuel-4f-economy-1st-edition-durso/
More products digital (pdf, epub, mobi) instant
download maybe you interests ...

The Political Economy of Agricultural and Food Policies


Johan Swinnen

https://ebookmass.com/product/the-political-economy-of-
agricultural-and-food-policies-johan-swinnen/

Food wastes and by-products : nutraceutical and health


potential First Edition Campos Vega

https://ebookmass.com/product/food-wastes-and-by-products-
nutraceutical-and-health-potential-first-edition-campos-vega/

Saving Food : Production, Supply Chain, Food Waste, and


Food Consumption Galanakis

https://ebookmass.com/product/saving-food-production-supply-
chain-food-waste-and-food-consumption-galanakis/

Valorization of Agri-Food Wastes and By-Products:


Recent Trends, Innovations and Sustainability
Challenges Rajeev Bhat

https://ebookmass.com/product/valorization-of-agri-food-wastes-
and-by-products-recent-trends-innovations-and-sustainability-
challenges-rajeev-bhat/
Imides : medicinal, agricultural, synthetic
applications and natural products chemistry Luzzio

https://ebookmass.com/product/imides-medicinal-agricultural-
synthetic-applications-and-natural-products-chemistry-luzzio/

Food Waste Management: Solving the Wicked Problem 1st


ed. 2020 Edition Elina Närvänen

https://ebookmass.com/product/food-waste-management-solving-the-
wicked-problem-1st-ed-2020-edition-elina-narvanen/

Handbook of Grape Processing By-Products: Sustainable


Solutions 1st Edition Galanakis

https://ebookmass.com/product/handbook-of-grape-processing-by-
products-sustainable-solutions-1st-edition-galanakis/

Sustainable food waste-to-energy systems Babbitt

https://ebookmass.com/product/sustainable-food-waste-to-energy-
systems-babbitt/

Sustainability of the Food System: Sovereignty, Waste,


and Nutrients Bioavailability Noelia Betoret & Ester
Betoret

https://ebookmass.com/product/sustainability-of-the-food-system-
sovereignty-waste-and-nutrients-bioavailability-noelia-betoret-
ester-betoret/
Biotransformation of Agricultural
Waste and By-Products
This page intentionally left blank

     
Biotransformation of Agricultural
Waste and By-Products
The Food, Feed, Fibre, Fuel (4F) Economy

Edited by
Palmiro Poltronieri
CNR-ISPA, Lecce, Italy
Oscar Fernando D’Urso
Bioesplora srl, San Michele Salentino, Brindisi, Italy

AMSTERDAM • BOSTON • HEIDELBERG • LONDON • NEW YORK • OXFORD


PARIS • SAN DIEGO • SAN FRANCISCO • SINGAPORE • SYDNEY • TOKYO
Elsevier
Radarweg 29, PO Box 211, 1000 AE Amsterdam, Netherlands
The Boulevard, Langford Lane, Kidlington, Oxford OX5 1GB, UK
50 Hampshire Street, 5th Floor, Cambridge, MA 02139, USA
Copyright © 2016 Elsevier Inc. All rights reserved.
No part of this publication may be reproduced or transmitted in any form or by any means, electronic or
­mechanical, including photocopying, recording, or any information storage and retrieval system, without
permission in writing from the publisher. Details on how to seek permission, further information about the
Publisher’s permissions policies and our arrangements with organizations such as the Copyright Clearance
Center and the Copyright Licensing Agency, can be found at our website: www.elsevier.com/permissions.
This book and the individual contributions contained in it are protected under copyright by the Publisher
(other than as may be noted herein).
Notices
Knowledge and best practice in this field are constantly changing. As new research and experience broaden our
understanding, changes in research methods, professional practices, or medical treatment may become necessary.
Practitioners and researchers must always rely on their own experience and knowledge in evaluating and using any
information, methods, compounds, or experiments described herein. In using such information or methods they
should be mindful of their own safety and the safety of others, including parties for whom they have a professional
responsibility.
To the fullest extent of the law, neither the Publisher nor the authors, contributors, or editors, assume any liability
for any injury and/or damage to persons or property as a matter of products liability, negligence or otherwise, or
from any use or operation of any methods, products, instructions, or ideas contained in the material herein.
British Library Cataloguing-in-Publication Data
A catalogue record for this book is available from the British Library
Library of Congress Cataloging-in-Publication Data
A catalog record for this book is available from the Library of Congress
ISBN: 978-0-12-803622-8

For information on all Elsevier publications


visit our website at https://www.elsevier.com/

Publisher: John Fedor


Acquisition Editor: Kostas Marinakis
Editorial Project Manager: Sarah Jane Watson
Production Project Manager: Paul Prasad Chandramohan
Designer: Greg Harris
Typeset by TNQ Books and Journals
Contents
List of Figures�������������������������������������������������������������������������������������������������� xiii
List of Tables����������������������������������������������������������������������������������������������������xvii
List of Abbreviations������������������������������������������������������������������������������������������xix
About the Editors�������������������������������������������������������������������������������������������� xxiii
About the Contributors������������������������������������������������������������������������������������� xxv
Introduction����������������������������������������������������������������������������������������������������xxxv
Chapter 1: Crop and Plant Biomass as Valuable Material for BBB. Alternatives
for Valorization of Green Wastes��������������������������������������������������������1
T. Dietrich, M.C. Villaran Velasco, P.J. Echeverría, B. Pop and A. Rusu
Abbreviations����������������������������������������������������������������������������������������������������������1
1.1 Introduction�������������������������������������������������������������������������������������������������������������1
1.2 Plant Biomass as Feedstock for Industrial Applications: General Considerations����3
1.2.1 Temporal Availability and Compositions of Biomass���������������������������������������� 5
1.2.2 Logistic Requirements of Biomass�������������������������������������������������������������������� 6
1.3 Plant Biomass: A Sustainable Feedstock for Industrial Applications���������������������8
1.3.1 Current Applications������������������������������������������������������������������������������������������ 8
1.3.2 Resource for Value-Added Compounds������������������������������������������������������������� 9
1.3.3 Feedstock for the Fermentation Industry��������������������������������������������������������� 14
1.4 Conclusion������������������������������������������������������������������������������������������������������������15
Acknowledgment���������������������������������������������������������������������������������������������������������16
References�������������������������������������������������������������������������������������������������������������������16
Chapter 2: Fruit Processing in Central America and Mexico���������������������������������21
C. Velázquez, A.M. Pérez Carvajal and L.A. Prado Barragán
2.1 Introduction�����������������������������������������������������������������������������������������������������������21
2.2 Fruit Production in the Region�����������������������������������������������������������������������������22
2.2.1 Costa Rica�������������������������������������������������������������������������������������������������������� 22
2.2.2 Other Central American Countries������������������������������������������������������������������� 25
2.2.3 Mexico�������������������������������������������������������������������������������������������������������������� 27
2.3 Fruit Industrialization in the Region���������������������������������������������������������������������27
2.3.1 Costa Rica�������������������������������������������������������������������������������������������������������� 27
2.3.2 Central America����������������������������������������������������������������������������������������������� 28

v
Contents

2.4 Physicochemical Composition and Biological Activity of Fruits of the Region�����30


2.4.1 Physicochemical Composition of Fruits of Costa Rica����������������������������������� 30
2.4.2 Physicochemical Composition of Fruits Produced in Mexico������������������������� 35
2.5 Biological Activities of Fruits From Costa Rica and the Central
America Region����������������������������������������������������������������������������������������������������39
2.5.1 Banana�������������������������������������������������������������������������������������������������������������� 39
2.5.2 Mango�������������������������������������������������������������������������������������������������������������� 39
2.5.3 Pineapple���������������������������������������������������������������������������������������������������������� 40
2.5.4 Watermelon������������������������������������������������������������������������������������������������������ 41
2.6 Agro–Industrial Fruit Wastes and Its Potential as Biomass����������������������������������41
2.7 Conclusions�����������������������������������������������������������������������������������������������������������42
References�������������������������������������������������������������������������������������������������������������������43
Chapter 3: Plants By-Products and Fibers’ Industrial Exploitation������������������������49
S. Narasimhan, B.S. Srikanth and P. Poltronieri
3.1 Introduction�����������������������������������������������������������������������������������������������������������49
3.2 India Food Industry Wastes: Mango Case Study��������������������������������������������������50
3.2.1 Processed Mango��������������������������������������������������������������������������������������������� 50
3.2.2 Barriers������������������������������������������������������������������������������������������������������������� 50
3.2.3 Opportunities���������������������������������������������������������������������������������������������������� 53
3.3 Market Making in the Bioeconomy of Plants’ By-Products in Europe
and in the World����������������������������������������������������������������������������������������������������53
3.3.1 Feedstock Biomasses��������������������������������������������������������������������������������������� 55
3.3.2 Cellulose����������������������������������������������������������������������������������������������������������� 55
3.3.3 EU Textile Industries and Vegetal Fibers��������������������������������������������������������� 57
3.3.4 Innovative Companies Involved in Recycling of Plant Residues, Transforming
Them in Textiles, Biobased Biochemicals, and Fiber Applications����������������� 57
3.3.5 EU Business Analysis of Case Studies������������������������������������������������������������ 60
3.3.6 Cargill Starches������������������������������������������������������������������������������������������������ 63
3.3.7 Tomatoes Plant Waste Recycling Industrial Group������������������������������������������ 63
3.3.8 Novamont Case Study on Bioplastics�������������������������������������������������������������� 64
3.3.9 Wheatoleo�������������������������������������������������������������������������������������������������������� 65
3.4 Conclusion������������������������������������������������������������������������������������������������������������65
References�������������������������������������������������������������������������������������������������������������������66
Chapter 4: Organic Recycling of Agricultural Waste Today: Composting
and Anaerobic Digestion������������������������������������������������������������������69
N. Mortier, F. Velghe and S. Verstichel
Abbreviations��������������������������������������������������������������������������������������������������������69
4.1 Introduction�����������������������������������������������������������������������������������������������������������69
4.2 EU & American Policy on Organic Waste������������������������������������������������������������69
4.2.1 Europe�������������������������������������������������������������������������������������������������������������� 70
4.2.2 South and Central America������������������������������������������������������������������������������ 73
4.2.3 North America�������������������������������������������������������������������������������������������������� 74

vi
Contents

4.3 Industrial Composting������������������������������������������������������������������������������������������78


4.3.1 Principle��������������������������������������������������������������������������������������������������������� 78
4.3.2 Input��������������������������������������������������������������������������������������������������������������� 79
4.3.3 Pretreatment Steps������������������������������������������������������������������������������������������ 80
4.3.4 Composting Process��������������������������������������������������������������������������������������� 80
4.3.5 Composting Methods������������������������������������������������������������������������������������� 83
4.3.6 Posttreatment Steps���������������������������������������������������������������������������������������� 88
4.3.7 SWOT Analysis���������������������������������������������������������������������������������������������� 88
4.3.8 Composting Within the TRANSBIO Project������������������������������������������������� 89
4.4 Anaerobic Digestion���������������������������������������������������������������������������������������������90
4.4.1 Principle��������������������������������������������������������������������������������������������������������� 90
4.4.2 Input��������������������������������������������������������������������������������������������������������������� 90
4.4.3 Pretreatment Steps������������������������������������������������������������������������������������������ 91
4.4.4 Anaerobic Digestion Process������������������������������������������������������������������������� 92
4.4.5 Digestion Methods����������������������������������������������������������������������������������������� 95
4.4.6 Posttreatment Steps�������������������������������������������������������������������������������������� 100
4.4.7 Biogas Treatment����������������������������������������������������������������������������������������� 100
4.4.8 Biogas Valorization�������������������������������������������������������������������������������������� 105
4.4.9 SWOT Analysis�������������������������������������������������������������������������������������������� 106
4.4.10 Anaerobic Digestion Within the TRANSBIO Project��������������������������������� 116
4.5 Conclusions���������������������������������������������������������������������������������������������������������121
References�����������������������������������������������������������������������������������������������������������������122
Chapter 5: Biomass Pretreatment Strategies (Technologies, Environmental
Performance, Economic Considerations, Industrial Implementation)����125
C. Peral
5.1 Introduction���������������������������������������������������������������������������������������������������������125
5.2 Physical and Chemical Characteristic of Lignocellulosic Biomass�������������������126
5.2.1 Cellulose������������������������������������������������������������������������������������������������������� 127
5.2.2 Hemicellulose����������������������������������������������������������������������������������������������� 128
5.2.3 Lignin����������������������������������������������������������������������������������������������������������� 130
5.3 Pretreatments������������������������������������������������������������������������������������������������������131
5.4 Physical Pretreatments����������������������������������������������������������������������������������������131
5.4.1 Mechanical Comminution���������������������������������������������������������������������������� 131
5.4.2 Extrusion Pretreatment��������������������������������������������������������������������������������� 133
5.4.3 Liquid Hot Water Pretreatment�������������������������������������������������������������������� 133
5.4.4 Pyrolysis and Torrefaction��������������������������������������������������������������������������� 134
5.4.5 Freeze Pretreatment�������������������������������������������������������������������������������������� 135
5.4.6 Irradiation����������������������������������������������������������������������������������������������������� 135
5.4.7 Pulsed Electric Field Pretreatment��������������������������������������������������������������� 136
5.4.8 Ultrasonic Pretreatment�������������������������������������������������������������������������������� 136
5.5 Chemical Pretreatments��������������������������������������������������������������������������������������137
5.5.1 Acid Hydrolysis������������������������������������������������������������������������������������������� 137
5.5.2 Alkaline Hydrolysis������������������������������������������������������������������������������������� 138

vii
Contents

5.5.3 Organosolv Pretreatment�������������������������������������������������������������������������������� 139


5.5.4 Peroxide Pretreatment������������������������������������������������������������������������������������ 140
5.5.5 Ozonolysis������������������������������������������������������������������������������������������������������ 140
5.5.6 Peroxyformic Acid����������������������������������������������������������������������������������������� 141
5.6 Physicochemical Pretreatments��������������������������������������������������������������������������141
5.6.1 Steam Explosion�������������������������������������������������������������������������������������������� 141
5.6.2 Ammonia Fiber Explosion and Ammonia Pretreatment�������������������������������� 142
5.6.3 Carbon Dioxide Explosion Pretreatment������������������������������������������������������� 143
5.6.4 Wet Oxidation Pretreatment��������������������������������������������������������������������������� 144
5.6.5 Ionic Liquid Pretreatment������������������������������������������������������������������������������ 145
5.7 Biological Pretreatment��������������������������������������������������������������������������������������145
5.7.1 Pretreatment With Fungal Species����������������������������������������������������������������� 146
5.7.2 Enzymatic Pretreatment��������������������������������������������������������������������������������� 147
5.8 Combined Methods���������������������������������������������������������������������������������������������147
5.8.1 Alkaline Pretreatment and Gamma Irradiation���������������������������������������������� 147
5.8.2 Alkaline and Mechanical Pretreatment���������������������������������������������������������� 147
5.8.3 Alkaline Pretreatment and Wet Oxidative Pretreatment�������������������������������� 148
5.8.4 Combinatorial Biological Pretreatment��������������������������������������������������������� 148
5.9 Industrial Implementation of Lignocellulosic Biomass Pretreatments���������������148
5.10 Conclusions���������������������������������������������������������������������������������������������������������155
References��������������������������������������������������������������������������������������������������������������������155
Chapter 6: Tobacco Seed Oil for Biofuels���������������������������������������������������������161
P. Poltronieri
6.1 Introduction���������������������������������������������������������������������������������������������������������161
6.1.1 Feedstock Biomasses������������������������������������������������������������������������������������� 163
6.1.2 Tobacco Mutagenesis and Genetic Studies���������������������������������������������������� 164
6.1.3 Selection of Tobacco Varieties for Biotic Stress, Pathogen, and
Nematode Resistance������������������������������������������������������������������������������������� 166
6.1.4 Bioeconomy of Biofuels�������������������������������������������������������������������������������� 167
6.1.5 Biokerosene Deployment and Sustainability Issues�������������������������������������� 173
6.1.6 Bioeconomics of Tobacco Seeds Oil for Aircraft Fuel: Energy
Tobacco Variety Solaris���������������������������������������������������������������������������������� 178
6.1.7 Sustainability of Production and Exploitation of Solaris Tobacco;
Protein Cake as Feed�������������������������������������������������������������������������������������� 181
6.2 Conclusion����������������������������������������������������������������������������������������������������������185
References�����������������������������������������������������������������������������������������������������������������185
Chapter 7: Fermentative Production Methods���������������������������������������������������189
L.A. Prado Barragán, J.J.B. Figueroa, L.V. Rodríguez Durán, C.N. Aguilar González and C. Hennigs
7.1 Introduction���������������������������������������������������������������������������������������������������������189
7.2 Submerged Fermentation������������������������������������������������������������������������������������189
7.2.1 Biotechnological Potential����������������������������������������������������������������������������� 190
7.2.2 Types of Bioreactors�������������������������������������������������������������������������������������� 191
7.2.3 Process Control���������������������������������������������������������������������������������������������� 196
7.2.4 Microorganisms���������������������������������������������������������������������������������������������� 200
viii
Contents

7.2.5 Substrates������������������������������������������������������������������������������������������������������� 200


7.2.6 Biomolecules Production������������������������������������������������������������������������������� 201
7.3 Solid-State Fermentation������������������������������������������������������������������������������������202
7.3.1 Biotechnological Potential����������������������������������������������������������������������������� 202
7.3.2 Types of Bioreactors�������������������������������������������������������������������������������������� 202
7.3.3 Process Control���������������������������������������������������������������������������������������������� 206
7.3.4 Microorganisms���������������������������������������������������������������������������������������������� 210
7.3.5 Substrates������������������������������������������������������������������������������������������������������� 211
7.3.6 Biomolecules Produced by Solid-State Fermentation����������������������������������� 213
7.4 Solid-State Fermentation Versus Submerged Fermentation:
General Considerations���������������������������������������������������������������������������������������213
7.5 Perspectives and Conclusions�����������������������������������������������������������������������������215
References�����������������������������������������������������������������������������������������������������������������215
Chapter 8: Composition of Plant Biomass Biotech Engineering of Cell
Wall to Optimize Biofuel Production�����������������������������������������������219
F. Francocci and I.B. Reca
8.1 Introduction���������������������������������������������������������������������������������������������������������219
8.2 The Plant Cell Wall: An Overview���������������������������������������������������������������������219
8.3 Organization and Biosynthesis of Wall Components�����������������������������������������220
8.3.1 Cellulose��������������������������������������������������������������������������������������������������������� 220
8.3.2 Hemicellulose������������������������������������������������������������������������������������������������� 221
8.3.3 Pectins������������������������������������������������������������������������������������������������������������ 222
8.3.4 Lignin������������������������������������������������������������������������������������������������������������� 222
8.4 Enzymes and Their Role in Cell Wall Modification (and Deconstruction)��������223
8.4.1 Cell Wall Modification/Deconstruction: Learning From the Plant���������������� 223
8.4.2 Cell Wall Deconstruction/Modification: Learning From the Microbes��������� 225
8.5 Manipulating Polysaccharides and Lignin Content or Composition
to Optimize Biofuel Production��������������������������������������������������������������������������226
8.5.1 Plants Cell Wall as Source of Energy������������������������������������������������������������� 226
8.5.2 Cell Wall Recalcitrance, the Major Obstacle to Bioconversion��������������������� 227
8.5.3 Modification of the Cell Wall Structure to Improve the
Saccharification Process��������������������������������������������������������������������������������� 228
8.5.4 Lignin Modification to Improve Cellulose Accessibility������������������������������� 229
8.5.5 Hemicellulose and Pectin Modification to Overcome Cell
Wall Recalcitrance����������������������������������������������������������������������������������������� 229
8.6 Conclusions and Outlook������������������������������������������������������������������������������������230
References�����������������������������������������������������������������������������������������������������������������231
Chapter 9: Production of Dicarboxylic Acid Platform Chemicals Using Yeasts:
Focus on Succinic Acid�������������������������������������������������������������������237
C. Pais, R. Franco-Duarte, P. Sampaio, J. Wildner, A. Carolas, D. Figueira and B.S. Ferreira
9.1 Markets and Applications�����������������������������������������������������������������������������������237
9.1.1 Drivers for Biobased Chemicals�������������������������������������������������������������������� 237
9.1.2 Current Uses and Production of Dicarboxylic Acids������������������������������������� 239

ix
Contents

9.2 Selection and Improvement of Yeast Strains������������������������������������������������������243


9.2.1 Yeasts as Platform Organisms for Dicarboxylic
Acid Production������������������������������������������������������������������������������������������ 244
9.2.2 Microorganisms Producing Succinic Acid: Natural Producers Versus
Metabolic Engineered Strains��������������������������������������������������������������������� 245
9.2.3 Succinate Formation Pathways������������������������������������������������������������������� 245
9.2.4 Metabolic Engineering Strategies for Biotechnological
Production of Succinic Acid����������������������������������������������������������������������� 248
9.3 Production of Biobased Dicarboxylic Acids�������������������������������������������������������251
9.3.1 From Strain Isolation to Initial Physiological Studies�������������������������������� 251
9.3.2 Linking Strain Physiology to Bioreaction Conditions�������������������������������� 252
9.3.3 Requirements for Scale-Up Toward Commercial Operation���������������������� 254
9.4 Downstream Processing of Biobased Dicarboxylic Acids���������������������������������255
9.4.1 General Steps in Downstream Processing�������������������������������������������������� 255
9.4.2 Factors Influencing Downstream Processing���������������������������������������������� 257
9.4.3 State of the Art DSP for Dicarboxylic Acids and New Trends������������������� 258
9.4.4 Designing an Effective Downstream Process��������������������������������������������� 263
9.5 Challenges for Sustainable Microbial Production of Dicarboxylic
Acids Platform Chemicals����������������������������������������������������������������������������������264
9.6 Conclusion����������������������������������������������������������������������������������������������������������265
References�����������������������������������������������������������������������������������������������������������������265
Chapter 10: Production, Stabilization, and Uses of Enzymes From Fruit
and Vegetable Byproducts������������������������������������������������������������271
L.A. Prado Barragán, J.J. Buenrostro-Figueroa, C.N. Aguilar González and I. Marañon
10.1 Introduction���������������������������������������������������������������������������������������������������������271
10.2 Markets for Microbial Enzymes��������������������������������������������������������������������������272
10.3 Enzymes in Technical Applications��������������������������������������������������������������������272
10.4 Encapsulation of Enzymes and Use in the Industry��������������������������������������������273
10.4.1 Immobilization������������������������������������������������������������������������������������������� 274
10.4.2 Encapsulation��������������������������������������������������������������������������������������������� 276
10.5 Uses of Immobilized Enzymes����������������������������������������������������������������������������282
10.5.1 Laundry and Dish Applications������������������������������������������������������������������ 283
10.6 Conclusion and Perspectives�������������������������������������������������������������������������������284
References��������������������������������������������������������������������������������������������������������������������284
Chapter 11: Sustainability Considerations on the Valorization
of Organic Waste������������������������������������������������������������������������287
L. Six, F. Velghe, S. Verstichel and S. De Meester
Abbreviations���������������������������������������������������������������������������������������������������������������287
11.1 Introduction���������������������������������������������������������������������������������������������������������287
11.2 Valorization Pathways for Organic Waste and the Waste Hierarchy�������������������288
11.3 Sustainability�������������������������������������������������������������������������������������������������������290
11.3.1 The Concept of Sustainability�������������������������������������������������������������������� 290
11.3.2 Sustainability Assessment�������������������������������������������������������������������������� 291

x
Contents

11.4 Case Studies: Environmental Sustainability of Organic Waste


Valorization Pathways�����������������������������������������������������������������������������������������296
11.4.1 Reuse as Feed��������������������������������������������������������������������������������������������� 296
11.4.2 Recycling by Conversion to Higher Value Chemicals�������������������������������� 297
11.4.3 Recycling by Composting�������������������������������������������������������������������������� 298
11.4.4 Energy Recovery and Recycling by Anaerobic
Digestion With Composting����������������������������������������������������������������������� 299
11.4.5 Energy Recovery by Conversion to Biodiesel�������������������������������������������� 302
11.4.6 Energy Recovery by Incineration��������������������������������������������������������������� 303
11.5 Conclusions���������������������������������������������������������������������������������������������������������304
References��������������������������������������������������������������������������������������������������������������������305
Chapter 12: GMO Acceptance in the World and Issues for the Overcoming
of Restrictions: Cisgenesis, RNA Transfer, Rootstock to Shoot
Delivery, Novel Methods of Transformation�����������������������������������309
P. Poltronieri
12.1 Introduction���������������������������������������������������������������������������������������������������������309
12.1.1 Genetically Modified Plants and Their Regulation Process in Different
Countries����������������������������������������������������������������������������������������������������� 309
12.1.2 Novel Plant Products���������������������������������������������������������������������������������� 317
12.1.3 Gene Modification Using TALEN and Zinc-finger Nucleases,
CRISPR/Cas9 Nuclease System����������������������������������������������������������������� 322
12.1.4 Cisgenesis and Intragenesis������������������������������������������������������������������������ 324
12.1.5 Genetically Modified Rootstock Grafting�������������������������������������������������� 325
12.1.6 Other Plant Improvement Techniques�������������������������������������������������������� 327
12.1.7 Accelerated Transformation of Woody Plants and Early Flowering���������� 328
12.2 Non-GMO Methods for Plants Improvement: Mutagenesis�������������������������������329
12.2.1 Insertional Mutagenesis������������������������������������������������������������������������������ 330
12.2.2 Chemical Mutagenesis�������������������������������������������������������������������������������� 331
12.2.3 Mutagenesis by Physical Agents���������������������������������������������������������������� 333
12.3 Regulation Harmonization����������������������������������������������������������������������������������333
12.4 Conclusion�����������������������������������������������������������������������������������������������������������338
References��������������������������������������������������������������������������������������������������������������������338
Index��������������������������������������������������������������������������������������������������������������343

xi
This page intentionally left blank

     
List of Figures
Figure 1.1 World production and world price indices (value 2000=100)
(Database FAO/OECD Agricultural Outlook 2014–2023). 2
Figure 1.2 Asparagus waste. 3
Figure 1.3 Garlic residues. 3
Figure 1.4 Green bean by-products. 4
Figure 1.5 By-product calendar of subproducts available in the Ebro valley (Spain)
(Personal communication with TRASA S.L.). 5
Figure 1.6 Transport costs of waste and by-products versus transport distance
(AWARENET).7
Figure 2.1 Central American major crops produced in the period 2009–2013.
Sugar cane data reported against secondary axis. 26
Figure 2.2 Flow diagram of the preparation of bananas to be used as carbon
source in lactic acid fermentation process. 42
Figure 4.1 Organic matter transformation into humus, biomass, and minerals. 78
Figure 4.2 Example of composting process (AP Business Technology Consultancy). 81
Figure 4.3 Typical temperature and acidity profile during composting. 82
Figure 4.4 Open air windrow system. 85
Figure 4.5 A fully automated turning machine. 86
Figure 4.6 Schematic overview of turning of table composting piles. 86
Figure 4.7 Drum composting reactor (DTEnvironmental). 87
Figure 4.8 The four steps in the anaerobic digestion process. 92
Figure 4.9 Evolution of biogas production on byproducts before bioproduct
extraction.118
Figure 4.10 Evolution of the biogas production of sweet corn before and after
bioproduct extraction. 119
Figure 4.11 Evolution of the biogas production of potato waste before and after
bioproduct extraction. 120
Figure 5.1 Structure of cellulose molecule. 127
Figure 5.2 Hydrogen bonds between cellulose polymer chains. 128
Figure 5.3 Structure of hemicellulose. 129
Figure 5.4 p-coumaryl-, coniferyl-, and sinapyl alcohol, building blocks of lignin. 130
Figure 6.1 Feedstock biomass options for production of ethanol, fuels,
and valuable chemicals. 164
Figure 6.2 Prospects of transformation of municipal solid wastes in Europe
into ethanol and fuels. 171

xiii
List of Figures

Figure 6.3 Scheme of production of biofuels and chemicals starting from


municipal solid wastes. 172
Figure 6.4 Diagram of CO2 emissions between 2005 and 2050. The graphic shows
the evolution of GHG emission under two contrasting economic
measures and policies: no action, and carbon neutral growth: by 2050
a net aviation carbon emission trajectory will reach a −50% reduction. 174
Figure 6.5 Comparison of Solaris variety (left) inflorescence size with that of
control tobacco (right). The differences in size of inflorescences and
seed content establish Solaris as a variety producing a high quantity
of tobacco seed oil. 182
Figure 6.6 Solaris plants from genetics to market (G2M) flow. From research to
agronomy studies, to process management, added value services, to
market.183
Figure 6.7 Tobacco seed oil from Solaris plants. Supply chain overview and
flow chart of processes to obtain biofuel. 184
Figure 7.1 Principle of a batch stirred tank reactor. 191
Figure 7.2 Principle of a continuous stirred tank reactor. 192
Figure 7.3 Principle of a fed-batch stirred tank reactor. 193
Figure 7.4 Principle of a bubble column reactor. 194
Figure 7.5 Principle of an airlift bioreactor. 195
Figure 7.6 Principle of a fluidized bed bioreactor. 196
Figure 7.7 Principle of a trickle bed bioreactor. 197
Figure 7.8 Microbial growth dynamics. 198
Figure 7.9 Column reactor. 204
Figure 7.10 Tray reactor. 205
Figure 7.11 Rotary drum reactor. 206
Figure 7.12 Continuous screw reactor. 207
Figure 9.1 Main succinate production metabolic pathways in Saccharomyces
cerevisiae: (A) oxidative branch of TCA cycle; (B) reductive branch of
TCA cycle; (C) glyoxylate pathway. Not all enzymatic steps are shown. 246
Figure 9.2 Schematic principle and processing steps during (A) reactive extraction
and (B) back extraction system with displacer as back extraction
compound.260
Figure 9.3 Schematic principle of electrodialysis. 262
Figure 10.1 Main methods of enzyme immobilization: (A) electrostatic adsorption,
(B) covalent binding, (C) cross-linking, (D) entrapment, and
(E) encapsulation. 275
Figure 10.2 Schematic diagram of a spray drying encapsulation process. 278
Figure 10.3 Schematic diagram of a bottom spray fluid bed coating process
(Wurster process) to obtain enzymes with a double layer coating,
changing the shell formulation atomized at the appropriated time. 279
Figure 10.4 Schema of a process combining spray drying and a fluid bed. 280
Figure 10.5 Schematic diagram of a top spray fluid bed agglomerating process. 280
Figure 10.6 Classification of methods to make and solidify drops. 281
Figure 11.1 The waste hierarchy. 289
Figure 11.2 Life cycle phases of a product (dotted line = recycling). 291
Figure 11.3 Life cycle assessment phases and their interactions. 292

xiv
 List of Figures

Figure 11.4 Relationship between life cycle inventory, midpoint indicators,


endpoint indicators, and single endpoint score in ReCiPe 2008
(from left to right). 295
Figure 11.5 Climate change impact of food waste valorization routes: dry feed
production, wet feed production, composting, and landfilling. 297
Figure 11.6 Environmental impact of different composting technologies. 299
Figure 11.7 Landfilling everything or separating for 65% composting and 35%
landfilling.299
Figure 11.8 Climate change impact of composting, anaerobic digestion, and
incineration technologies (over 100 years). 300
Figure 11.9 Endpoint impact of composting, anaerobic digestion, and incineration
technologies (Eco-indicator 95+). 301
Figure 11.10 Environmental impact of municipal waste treatment with increasing
diversion of food waste from incineration to anaerobic digestion with
composting and small-scale composting. 301
Figure 11.11 Life cycle climate change impact of fuels derived from food waste,
agricultural products, and fossil resources (per MJ energy). 303
Figure 11.12 Climate change impact ranges of electricity generation by renewable
and nonrenewable sources. 303
Figure 11.13 Climate change impact ranges of heat production by renewable
and nonrenewable sources. 304

xv
This page intentionally left blank

     
List of Tables
Table 1.1 Vegetable Waste Amount in 2012. 4
Table 1.2 Valuable Compounds From Fruit and Vegetable Biomass. 12
Table 1.3 Currently Used Carbohydrate Carbon Sources in Industrial Fermentation. 15
Table 2.1 Main Seven Exported Fruits Form Costa Rica for the Year 2014, Expressed
in Thousands of US Dollars and in Tons. 23
Table 2.2 Agricultural Production in Tons for Central American Countries
in the Year 2013. 26
Table 2.3 Physicochemical Composition of Cultivated and Exported Fruits
From Costa Rica and Central America. 31
Table 2.4 Vitamin C Content (mg/100 g) of the Main Cultivated Fruits in Costa Rica
and Central America. 32
Table 2.5 Phenolic Compounds Content (mg GAE/100 g) of the Main Cultivated Fruits. 34
Table 2.6 Antioxidant Capacity Assessed by ORAC Method (TE Micromol/g) of the
Traditional Tropical Fruits. 35
Table 2.7 Composition of Green Coffee of Varieties Arabica and Robusta, Produced
in Mexico. 36
Table 2.8 Physicochemical Characterization of Pomegranate Seeds and Husk
in g/100 g of Fruit Produced in Mexico. 38
Table 3.1 Potential of Mango Waste Components. 51
Table 4.1 Recycling Targets for Biodegradable Waste as Prescribed by the Landfill
Directive.71
Table 4.2 Main Characteristics of Some Biodegradable Materials. 79
Table 4.3 Duration of Some Industrial Composting Processes (Large-scale Compost;
Deyerling & Fuchs; Productie Van Compost; Offaly). 82
Table 4.4 Levels of Rottegrad Based on the Potential Heating Ability of Compost. 83
Table 4.5 Overview Baumuster Composting Categories. 84
Table 4.6 Theoretical Amounts of Methane in Biogas. 93
Table 4.7 Analysis Results of Biogas Potential Tests on Byproducts Before Bioproduct
Extraction.117
Table 4.8 Analysis Results of Sweet Corn Products. 118
Table 4.9 Analysis Results of Potato Products. 119
Table 5.1 Effect of Various Pretreatments Methods on Composition of Lignocellulosic
Biomass.132
Table 5.2 List of Main Biorefinery Facilities, Status and Pretreatment Strategies. 150
Table 6.1 Content in Fatty Acids of Some Tobacco Varieties Selected. 180

xvii
List of Tables

Table 6.2 Characteristics of the Tobacco Oil Obtained by Pressing the Seed and
Filtering.181
Table 7.1 Main Characteristics of SSF Bioreactors. 203
Table 7.2 Differences Between Solid-State (SSF) and Submerged Liquid Fermentation
(SmF).214
Table 8.1 Worldwide Production of Bioethanol. 226
Table 9.1 Demonstration-Scale Facilities for the Production of Biobased Succinic Acid. 240
Table 9.2 Main Metabolic Engineering Strategies to Improve Succinate Production
in Different Yeast Species. 249
Table 9.3 General Steps in Downstream Processing, Highlighting Common
Principles and Unit Operations as well as the Respective Desired
Outcome of Each Step. 256
Table 11.1 Impact Assessment Methods Used in the International Life Cycle
Data System Midpoint Method. 293
Table 12.1 List of Genetically Modified Crops Cultivated Around the World. 311
Table 12.2 Genetically Modified Crops Approved in European Union. 312

xviii
List of Abbreviations

A4A Airlines for America


AFEX Ammonia fiber explosion
AG Agronomic trait
AHAS Acetohydroxy acid synthetase
ALH Acetolactate synthetase
AM Association mapping
AMIMCl 1-allyl-3-methylimidazonium chloride
APHIS Animal and Plant Health Inspection Service
ASTM American Society for Testing and Materials
ATP Adenine trinucleotide phosphate
BDO 1,4-butanediol
BMIMCl 1-butyl-3-methylimidazonium chloride
Bt Bacillus thuringensis
BTG Biomass Technology Group
C4H Cinnamate 4-hydroxylase
CAGR Compound annual growth rate
CCoAOMT CoA O-methyltransferase
CCR Cinnamoyl CoA reductase
CDE Carbon dioxide explosion
CesA Cellulose synthase A
CESA Cellulose synthase catalytic subunit
cgRNA Chimeric guide RNAs
CHP Combined heat and power
CRISPR Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats
DM Dry Matter
DME Dimethyl ether
DP Degree of polymerization
DSBs DNA double-strand breaks
DSP Downstream processing
EBFPI European Biofuels FlightPath Initiative
EBTP European Biofuel Technology Platform
ECHA European Chemical Agency
EDTA Ethylene diamine tetracetic acid
EFSA European Food Safety Agency
E-LCA Environmental life cycle assessment
ELISA Enzyme-linked immunosorbent assays
EMS Ethyl Methane Sulphonate
ENI Ente Nazionale Idrocarburi

xix
Another random document with
no related content on Scribd:
back
back
back
back
back
back
back
back
back
back
back

You might also like