Professional Documents
Culture Documents
Full download Covid-19: Biomedical Perspectives Charles S. Pavia file pdf all chapter on 2024
Full download Covid-19: Biomedical Perspectives Charles S. Pavia file pdf all chapter on 2024
Charles S. Pavia
Visit to download the full and correct content document:
https://ebookmass.com/product/covid-19-biomedical-perspectives-charles-s-pavia/
More products digital (pdf, epub, mobi) instant
download maybe you interests ...
https://ebookmass.com/product/covid-19-epidemiology-evolution-
and-cross-disciplinary-perspectives-jiumeng-sun/
https://ebookmass.com/product/the-environmental-impact-of-
covid-19-deepak-rawtani/
https://ebookmass.com/product/virtual-management-and-the-new-
normal-new-perspectives-on-hrm-and-leadership-since-the-
covid-19-pandemic-svein-bergum/
https://ebookmass.com/product/organising-care-in-a-time-of-
covid-19-palgrave/
Transportation Amid Pandemics: Lessons Learned from
COVID-19 Junyi Zhang
https://ebookmass.com/product/transportation-amid-pandemics-
lessons-learned-from-covid-19-junyi-zhang/
https://ebookmass.com/product/humanistic-crisis-management-
lessons-learned-from-covid-19-wolfgang-amann/
https://ebookmass.com/product/coronavirus-
disease-2019-covid-19-pandemic-and-pregnancy-pradip-dashraath/
https://ebookmass.com/product/mental-health-effects-of-
covid-19-ahmed-a-moustafa-editor/
https://ebookmass.com/product/pandemic-ethics-from-covid-19-to-
disease-x-julian-savulescu/
Covid-19: Biomedical
Perspectives
FIRST EDITION
Charles S. Pavia
Department of Biomedical Sciences, NYIT College of Osteopathic Medicine,
New York Institute of Technology, Old Westbury; Division of Infectious
Diseases, New York Medical College, Valhalla, NY, United States
Volker Gurtler
College of Science Engineering and Health, RMIT University, Bundoora,
VIC, Australia
Table of Contents
Cover
Title page
Copyright
Dedication
Contributors
Preface
Abstract
1: Introduction
7: Methods section
12: Summary
Acknowledgement
References
Abstract
1: Introduction
References
Further reading
Abstract
1: Introduction
3: COVID-19 diagnostics
5: Conclusion
References
Further reading
Abstract
1: Introduction
3: CRISPR/Cas systems
References
Abstract
1: Introduction
References
Abstract
1: Historical perspective
2: General overview, classification and description of
hypersensitivity reactions
Acknowledgements
References
Abstract
References
Abstract
1: Introduction
2: Methods
3: VOCs in Australia
7: Discussion
References
Abstract
1: Introduction
References
Copyright
Dedication
Abstract
The occurrence of the COVID-19 pandemic caused by the SARS-CoV-2 virus since the end of 2019
has significantly affected the entire world. Now SARS-CoV-2 diagnostic tests are not only required
for screening of suspected infected people for their medical treatment, but have also become a
routine diagnosis for all people at a place where new cases have emerged in order to control spread
of the disease from that region. For these reasons, sensitive methods for detection of SARS-CoV-2
are highly needed in order to avoid undetected infections. In addition, sample pooling that uses
pooled specimens has been routinely employed as a time- and cost-effective strategy for
community monitoring of SARS-CoV-2. In this regard, the content of each viral RNA sample of an
individual will be further diluted in detection; therefore, higher detection sensitivity would be
rather preferred. Among nucleic acid-based detection methods, isothermal nucleic acid
amplifications are considered quite promising because they typically take less time to complete the
test (even less than 20 min) without the need of thermal cycles. Hence, it does not necessitate the
use of highly costly real-time PCR machines. According to recently published isothermal nucleic
acid amplification methods, the reverse transcription recombinase polymerase amplification (RT-
RPA) approach shows outstanding sensitivity with up to single-copy sensitivity in a test reaction.
This chapter will mainly focus on how to employ RT-RPA technology to sensitively detect SARS-
CoV-2 RNA. Besides, recently published RT-RPA based detection methods will be summarized and
compared regarding their detection parameters and the primers and probes being used. In
addition, we will also highlight the key considerations on how to design an ultrasensitive RT-RPA
assay and the precautions needed to conduct the assay. Moreover, based on our recent report, we
will also detail the methods we developed to detect SARS-CoV-2 RNA using modified RT-RPA, or
RT-ERA, with single-copy sensitivity and the possible extensions beyond this method.
Keywords
RT-RPA; SARS-CoV-2 RNA; Exo probe; Nfo probe; Lateral flow; Single-copy sensitivity
1: Introduction
Since December 2019, an outbreak of COVID-19 caused by severe acute respiratory syndrome
coronavirus 2 (SARS-CoV-2) virus occurred and soon spread to the entire world (Wang, Horby,
Hayden, & Gao, 2020). The COVID-19 pandemic has led to a dramatic loss of human life worldwide and
presents an unprecedented challenge to publish health and food systems; the global economic growth
was largely slowed down and social activities were greatly disrupted. As of July 1, 2021, COVID-19 has
infected over 182 million people worldwide with over 3.9 million reported casualties. COVID-19 is
caused by an RNA virus named severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (Chen et al., 2020).
SARS-CoV-2 virus is a coronavirus belonging to the beta family of coronaviruses that also includes
SARS-CoV, Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV), human coronavirus OC43
(HCoV-OC3), and human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1). These beta-viruses are enveloped,
positive-sense, single-stranded RNA viruses of zoonotic origin. As for SARS-CoV-2, this virus contains
four structural proteins, namely the envelope protein (E), spike protein (S), membrane protein (M), and
the nucleocapsid (N) protein (Fig. 1). The S, M, and E proteins form the envelope of the virus while the
N protein is associated with the single-stranded RNA genome forming nucleocapsid inside the
envelope.
According to initial studies, this disease caused by SARS-CoV-2 showed a high transmissibility with a
basic reproduction number R0 = 1.4–5.5 (WHO, 2020; Zhao et al., 2020), likely to be below 5 and above 3
(Chen, 2020) and therefore it is highly desired to perform early testing of SARS-CoV-2 for timely
screening of infected individuals and to stop the spread of this disease from a location to its
surroundings. Because detection sensitivity is the key to reduce false negative results, a detection
method with a high level of sensitivity can minimize non-diagnosed infected individuals and reduce the
chance of further cross transmission (Fig. 2).
Another random document with
no related content on Scribd:
joyeux compagnon plein de franchise et d’entrain, d’un de ces
viveurs incorrigibles qui s’écrient encore à quarante ans : Il faut bien
que jeunesse se passe !
En général, les chevaliers d’industrie se connaissent d’instinct,
sinon de réputation. D’ailleurs, Cinqpoints et Blewitt, bien que volant
chacun dans une sphère différente, s’étaient rencontrés aux courses
et dans quelques réunions de joueurs. Jusqu’à ce jour, mon noble
maître, qui savait ce qu’il se devait à lui-même, n’avait point voulu se
compromettre en fréquentant un escroc de bas étage ; mais, peu de
temps après l’installation de Dakins, il commença à se montrer fort
affable envers son voisin. Le motif de ce changement de conduite
saute aux yeux : ayant deviné les intentions de Blewitt à l’égard du
nouveau locataire, Cinqpoints voulait avoir sa part du butin.
— John, quel est donc ce voisin qui a une passion si
malheureuse pour le flageolet ? me demanda-t-il un matin.
— Il se nomme Dakins, monsieur : c’est un jeune homme fort
riche et un ami intime de M. Blewitt.
Cinqpoints ne poussa pas plus loin cet interrogatoire ; il en savait
déjà assez. Un sourire diabolique dérida son visage, où je pus lire le
raisonnement que voici :
No I
(Note du traducteur.)
No II
Situation financière de l’Honorable Percy Cinqpoints, au mois d’août
18…
Fr. C.
Compte à notre débit au club de Crockford 68,775 »
Billets et lettres de change en circulation (nous ne les 124,075
en retirions presque jamais) »
Notes de vingt et un tailleurs 26,172 90
Item de trois marchands de chevaux 10,050 »
Item de deux carrossiers 7,836 75
Dettes oubliées à Cambridge 34,832 80
Mémoires de divers fournisseurs 12,675 35
Total 298,417
80
I. O. U.
Quatre mille sept cents livres sterling.
Thomas Dakins.
Vendredi, 13 janvier.
Cela voulait dire : « Je vous dois cent dix-sept mille cinq cents
francs. »
Ce chiffon sans prétention était aussi valable qu’un billet de
banque, car Blewitt avait eu soin de prévenir Dakins que Cinqpoints,
fort chatouilleux sur le point d’honneur, avait tué en duel deux
joueurs assez malhonnêtes pour refuser de payer une dette de jeu.
Je trouvai un autre papier du même genre signé Richard Blewitt,
pour une somme de dix mille francs ; mais je savais que celui-là ne
signifiait rien.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Le lendemain matin, l’Honorable Percy Cinqpoints se trouva
debout dès neuf heures, aussi sobre qu’un juge. Il s’habilla et se
rendit chez Dakins. Environ une heure après, il demanda son
cabriolet, dans lequel il monta avec sa dupe.
Pauvre Dakins ! Les yeux rouges, la poitrine gonflée de sanglots
comprimés, il se laissa tomber à côté de mon maître sans prononcer
une parole, avec ce frisson fiévreux que donne une nuit d’insomnie
et de remords.
Sa fortune consistait en rentes sur l’État. Ce jour-là, il vendit tout,
à l’exception d’un capital d’une dizaine de mille francs.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Vers deux heures, Cinqpoints était de retour. Son ami Blewitt se
présenta pour la troisième fois.
— Votre maître est rentré ? demanda-t-il.
Je répondis affirmativement.
J’annonçai sa visite ; puis, dès que j’eus refermé la porte du
salon, je regardai par le trou de la serrure, et j’ouvris l’oreille.
— Eh bien, dit Blewitt, nous avons fait un assez joli coup de filet,
mon cher Cinqpoints… Il paraît que vous avez déjà réglé avec
Dakins ?
— En effet, monsieur.
— Cent dix-sept mille cinq cents francs, je crois ?
— Mais oui… A peu près.
— Cela fait, pour ma part… voyons un peu… oui, cela fait
cinquante trois mille sept cent cinquante francs, que vous avez à me
remettre, mon cher.
— Vraiment, monsieur Blewitt, je ne vous comprends pas du tout.
— Vous ne me comprenez pas ! s’écria l’autre d’un ton de voix
impossible à décrire. N’est-il pas convenu que nous devons partager
les bénéfices ? Ne vous ai-je pas prêté de quoi payer vos pertes des
deux premières soirées ? Ne m’avez-vous pas donné votre parole
d’honneur que vous me remettriez la moitié de ce que je vous
aiderais à gagner ?
— Tout cela est parfaitement exact.
— Alors, que diable avez-vous à objecter à ma réclamation ?
— Rien… si ce n’est que je n’ai jamais eu la moindre intention de
tenir ma promesse… Ah çà, vous êtes-vous vraiment imaginé que
j’allais travailler pour vous ? Avez-vous été assez idiot pour vous
figurer que j’avais donné à dîner à ce nigaud, afin de mettre de
l’argent dans votre poche ?… Ce serait trop drôle, et j’ai meilleure
opinion de vous… Allons, monsieur, cessons cette plaisanterie. Vous
savez où est la porte… Mais attendez un instant. Je serai généreux ;
je vous donnerai dix mille francs pour la part que vous réclamez
dans cette affaire… Tenez, voici votre propre billet pour cette
somme ; je vous le rends, à condition que vous oublierez avoir
jamais connu l’Honorable Percy Cinqpoints.
Blewitt gronda, cria, gémit, pria, menaça, frappa du pied. Tantôt il
jurait et grinçait des dents ; tantôt il suppliait son cher M. Cinqpoints
d’avoir pitié de lui. Finalement, il se mit à pleurnicher comme un
enfant.
Mon maître, impatienté, ouvrit la porte du salon, où je manquai
de tomber la tête la première.
— Reconduisez monsieur, me dit Cinqpoints en regardant Blewitt
dans le blanc des yeux.
Ce dernier quitta le canapé sur lequel il s’était jeté avec un geste
de désespoir, et sortit, faisant une mine aussi piteuse qu’un chien
qu’on menace du fouet. Quelques années plus tard, il eut
l’imprudence de commettre un faux, et fut transporté à Botany-Bay.
Quant à Dakins, Dieu sait ce qu’il est devenu ; moi, je l’ignore.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
— John, dit mon maître, lorsque j’eus reconduit le visiteur, John,
je vais à Paris. Vous pouvez m’accompagner si cela vous convient.
II
IMPRESSIONS DE VOYAGE