Graa i organizacija NK biljnih

virusa

1. Jedna NK: ili DNA ili RNA

2. Veina biljnih virusa su RNA virusi
3. Biljni virusi sadre razliite koliine NK
a) Izdueni: oko 5% od mase
b) Izometrijski: 15-45% od mase
c) Baciloformni: veoma malo, svega 1%
4. MM 1x106-3x106
5.Reovirusi: 16x106(virus tumora deteline)

 ta je NK?
Polinukleotidni lanac koji se sastoji iz
mononukleotida u iji sastav ulaze
Purinska (A,G)
Pirimidinska (T-U, C)
eeri (riboza, dezoksiriboza)
Fosforna kiselina

Skelet molekula NK:

pentoze i fosforna kiselina povezane
3-5 fosfodiestarskim vezama

Linearne NK imaju 2 kraja:

5-kraj:fosfatna grupa na 5C atomu pentoze
3-kraj: OH grupa na 3C atomu pentoze

Skelet molekula NK

 Broj nukleotida stalan za 1 vrstu virus:

TMV: 6340 nukleotida
Variranja broja nukleotida postoje kod
razliitih sojeva i izolata BNYVV:
RNK Francuski izolati Nemaki izolati
1
7100
7100
2
4800
4800
3
1800
1400
4
1500
1150

Tipovi nukleinskih kiselina kod biljnih virusa

1. RNA ili DNA; ss ili ds
2. Ako je NK ss moe da bude (-) ili (+) ili ambisense (+/-)
I.
(+)-pozitivna, infektivna = je u stvari iRNA, moe da prevede
proteine translacijom na ribozomima
II.
(-) negativna, neinfektivna = nije iRNA, nije sposobna da kodira
proteine, ve mora da se prepie u komplementarnu sekvencu,
da bi bila infektivna
III.
(+/-) ambisense = za neke proteine je iRNA, za neke nije
(Tospovirus)
3. Linearna ili kruna
I.
RNA, bilo da je ss ili ds je LINEARNA
II.
DNA, bilo da je ss ili ds je KRUNA
III.
Jedino VIROIDI imaju krunu RNA
4. Genom moe da bude:
a) iz jednog dela (fragmenta)
b) iz vie delova (fragmenata) u 1 ili vie estica

Postoji 6 tipova nukleinske kiseline kod biljnih virusa

1. Linearna ssRNA u 1 fragmentu u 1 estici
TMV
2. Linearna ssRNA u vie fragmenata u posebnim esticama
Alfalfa mosaic virus, AMV
3 Linearna ssRNA u vie fragmenata u 1 estici
Carnation ringspot virus
4. Linerana dsRNA u vie fragmenata u 1 estici
Reoviridae
5. Kruna ssDNA
Geminiviridae
6. Kruna dsDNA
Caulimoviridae
VIRUSNI GENOM sadri sve informacije neophodne za replikaciju
kompletne V. Da li je NK infektivna zavisi od 2 faktora:

Tipa NK

Fizikog integriteta (intaktna NK)

Strukture na krajevima RNA virusa sa (+) ss

1. 5-metiliran kraj eiri, cap

iRNA sisara imaju 5-metiliran u formi:
m7G5 ppp5 X(m) p Y(m) p...
2. 5-VPgs
kovalntno povezan protein relativno male
veliine 3500-24000
V-virus; P-protein; G-genome linked; s-short

3. 3-aminoacetiliran kraj
sposobnost vezivanja AK, tako da grade strukture koje lie na
aminoacil-transportne RNA (strukture sline listu deteline)

4. 3-PolyA
(vie adenina; 25-400A)


1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.

Metiliran kraj imaju:

Tobamovirus
Tobravirus
Tymovirus
Bromovirus
Cucumovirus
Carmovirus
Furovirus
Potexvirus
Alfamovirus
Hordeivirus

1.
2.
3.
4.
5.

VPgs imaju:
Potyvirus
Comovirus
Nepovirus
Sobemovirus
Luteovirus


1.
2.
3.
4.
5.
6.

3 Poly A imaju:
Potyvirus
Potexvirus
Capillovirus
Comovirus
Nepovirus
Furovirus

1.
2.
3.
4.
5.
6.

3-t-RNA sline
strukture imaju:
Tobamovirus
Tymovirus
Hordeivirus
Bromovirus
Cucumovirus
Alfamovirus

Uloga terminalnih sekvenci

1. Za neke viruse eiri je
neophodan za infektivnost
2. U in vitro uslovima eiri titi
RNK od nukleaza, a mogue da je
tako i in vitro
stabilnost
3. Imaju ulogu u iniciranju transkripcije i
translacije

Informacioni sadraj virusnih NK

Virusi imaju mali genom: 1-12 gena

1 gen, 1 protein Satelitni virus
12 gena, 12 proteina Reoviridae
Veina ss (+)RNA virusa ima 4-7 gena
Osim gena (cistroni)kodirajui regioni
nukleotidne sekvence na virusnoj NK se
nalaze nukleotidne sekvence :
-sa ulogom u KONTROLI
-sa ulogom u PREPOZNAVANJU
u toku replikacije

Informacioni sadraj nukleinskih kiselina

Veliina genoma

Primer

Broj proteina

Vie biljke

U proseku

50-100 000

Bakterije

E. coli

4100

Virusi kimenjaka

Vaccinia
(kravlje boginje)

260

Veliki biljni virusi

Virus tumora deteline

12

Mali biljni virusi

TMV

4 (5)

Najmanji poznati virusi

Satelitni virus nekroze

duvana

Elektronska mikrofotografija NK
virusa mozaika karfiola

Geminiviridae-kruna
jednolanana DNA

Elektronski snimak jednog

Geminivirus-a